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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 1461 - 1480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2025-03-01 |
Single-cell RNA sequencing data identify a conserved population of metallothionein-expressing macrophages that may be ubiquitous in vital human organs
2024-Oct, Clinical and translational discovery
DOI:10.1002/ctd2.348
PMID:40018369
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1462 | 2026-03-06 |
Spatial multi-omics reveal intratumoral humoral immunity niches associated with tertiary lymphoid structures in pancreatic cancer immunotherapy pathologic responders
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.22.613714
PMID:39386736
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了胰腺癌免疫治疗病理应答者中三级淋巴结构相关的瘤内体液免疫微环境 | 首次结合机器学习H&E图像分类模型和无监督基因表达矩阵分解方法，系统表征了三级淋巴结构微环境中的细胞状态，并发现了与PDAC患者生存改善显著相关的TLS特异性空间基因表达特征 | 样本量相对较小（仅26个PDAC肿瘤），且研究局限于接受联合免疫治疗的患者群体 | 探究胰腺癌中三级淋巴结构在肿瘤微环境中的空间关系及其在免疫治疗中的作用机制 | 接受联合免疫治疗的胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、BCR测序 | 机器学习图像分类模型、无监督基因表达矩阵分解方法 | H&E图像、空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | 26个PDAC肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, BCR测序 | NA | NA |
| 1463 | 2026-03-06 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCIG的机器学习方法，用于在单细胞水平上识别细胞身份基因 | SCIG方法无需与其他细胞进行比较，仅利用基因序列特征和单细胞RNA-seq表达信息即可识别细胞身份基因，并发现组织微环境对细胞身份精细化至关重要 | NA | 开发一种识别细胞身份基因的计算方法，以促进对细胞分化、发育和再生医学的理解 | 血管内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据、遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1464 | 2026-03-06 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01831-y
PMID:38698087
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了抗原特异性浆细胞前体的发育动态和基因组编程，特别是长寿命骨髓浆细胞的生成机制 | 发现了浆细胞前体的双相生成模式，并识别出一个新的浆细胞过渡状态，该状态依赖于TIGIT的可诱导表达进行克隆扩增 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且样本规模可能有限 | 阐明浆细胞前体的发育动力学和基因组编程，特别是长寿命浆细胞的生成机制 | 小鼠模型中的抗原特异性浆细胞前体，包括脾脏和骨髓中的B细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，B细胞抗原受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，B细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1465 | 2026-03-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨了强效芳烃受体激动剂FICZ在刀豆蛋白A诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术，系统揭示了FICZ通过限制CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人体中验证；机制研究主要聚焦于免疫细胞亚群，对肝实质细胞的直接作用未充分探讨 | 阐明芳烃受体激活在自身免疫性肝炎中的保护作用机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 1466 | 2026-03-06 |
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae316
PMID:38960406
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研究论文 | 本研究提出了一种名为STGAT的新方法，利用图注意力网络从全切片图像和批量RNA-seq数据中预测基因表达，以提高空间分辨率 | STGAT首次结合图注意力网络来推断空间转录组学中的点级基因表达，并在乳腺癌数据中展示了优于现有方法的性能 | 方法依赖于可用的空间转录组学数据进行训练，在数据有限的情况下可能影响泛化能力 | 开发从WSI和批量RNA-seq数据中预测点级基因表达的方法，以重新分析大规模队列研究并发现新的生物标志物 | 乳腺癌组织样本，包括空间转录组学数据和TCGA数据集 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 空间转录组学，批量RNA-seq | 图注意力网络 | 图像，文本 | 两个乳腺癌空间转录组学数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1467 | 2026-03-06 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 本文介绍了一种基于人IL-6转基因NSG小鼠的异种移植模型，用于支持患者来源的多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的长期植入和研究 | 开发了人IL-6转基因NSG小鼠模型，首次可靠地支持恶性及癌前人类浆细胞的植入，包括从多种浆细胞疾病患者中获取的细胞 | 模型依赖于免疫缺陷小鼠，可能无法完全模拟人类免疫系统与骨髓瘤的相互作用，且样本来源和规模可能有限 | 建立一种有效的患者来源异种移植模型，用于多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的研究和临床前药物开发 | 患者来源的恶性及癌前人类浆细胞，包括来自未确定意义的单克隆丙种球蛋白病、复发前后多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和淀粉样轻链淀粉样变性患者的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 异种移植模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1468 | 2026-03-06 |
Technical optimization of spatially resolved single-cell transcriptomic datasets to study clinical liver disease
2024-02-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53993-2
PMID:38351241
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，优化了临床肝病样本的处理和分析流程，生成了空间分辨的单细胞数据集 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序，在肝纤维化样本中建立了组织处理、数据分析和细胞互作评估的优化框架 | 样本量有限，空间转录组学尚未达到单细胞分辨率，且组织保存技术对数据有影响 | 优化空间分辨单细胞转录组数据集的技术流程，以研究临床肝病 | 来自组织学正常或晚期纤维化患者的匹配肝样本 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 匹配的肝样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1469 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202095
PMID:38063857
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研究论文 | 本文探讨了TFAP2同源基因通过调控ALX基因表达在小鼠和斑马鱼中面部发育中的作用 | 揭示了TFAP2家族成员通过直接激活ALX转录因子基因表达来调控脊椎动物中面部发育的保守遗传通路 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，人类中面部发育的保守性需进一步验证 | 探究中面部发育中基因调控网络的连接与激活机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞 | 发育生物学 | 面部发育异常 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1470 | 2026-03-06 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究通过高脂饮食诱导肥胖，利用单细胞RNA测序分析前垂体转录组变化，探讨肥胖相关氧化应激对垂体细胞代谢的影响 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞RNA测序技术，系统比较雄性和雌性小鼠垂体细胞对肥胖应激的差异反应，并识别出雌性中最易受影响的垂体细胞群体 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景；实验周期最长15周，未能评估长期效应；未深入探讨分子机制 | 探究肥胖引起的氧化应激如何影响前垂体细胞功能，并比较性别差异 | 雄性和雌性FVB.129P小鼠的前垂体细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖相关代谢紊乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | FVB.129P小鼠，高脂饮食组10-15周，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1471 | 2026-03-06 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
|
研究论文 | 本研究通过耗竭猕猴的CD8+淋巴细胞，揭示了其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在非人灵长类动物模型中系统性地证明了CD8+淋巴细胞（包括先天性和适应性亚群）对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了肉芽肿中多功能的细胞毒性CD8+淋巴细胞特征 | 研究仅在猕猴模型中进行，结果向人类直接外推需谨慎；CD8耗竭的长期效应和具体分子机制有待进一步阐明 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 猕猴（非人灵长类动物） | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 猕猴感染模型（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1472 | 2026-03-06 |
Inflammatory Activity of Epithelial Stem Cell Variants from Cystic Fibrosis Lungs Is Not Resolved by CFTR Modulators
2023-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202305-0818OC
PMID:37695863
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研究论文 | 本研究揭示了囊性纤维化（CF）晚期肺中存在三种促炎性干细胞变异体，且这些变异体的促炎功能无法通过CFTR基因补偿或CFTR调节剂药物恢复CFTR活性而缓解 | 首次在CF晚期肺中鉴定出三种促炎性干细胞变异体，并证明其促炎功能不受CFTR功能恢复的影响，这为解释CF患者在接受CFTR调节剂治疗后肺部炎症持续存在提供了新机制 | 研究样本量较小（仅4例终末期CF患者），且均为晚期疾病患者，可能无法完全代表早期或轻度CF患者的干细胞异质性 | 确定CF肺中是否存在类似COPD的致病性干细胞变异体，识别可能促进CF肺部炎症状态的特定变异体，并评估CFTR基因补偿或CFTR调节剂对这些炎症变异体的影响 | 终末期囊性纤维化（CF）患者的肺组织 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、干细胞克隆技术、异种移植、RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | 4例终末期CF患者（3例CFTR:F508D纯合子，1例CFTR F508D/L1254X杂合子）的肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1473 | 2026-03-06 |
Molecular signature incorporating the immune microenvironment enhances thyroid cancer outcome prediction
2023-Oct-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100409
PMID:37868034
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研究论文 | 本研究通过整合基因组、转录组和空间转录组数据，开发了一个名为MAP评分的分子特征，用于增强甲状腺癌的预后预测 | 首次结合DNA/RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光技术，从大型患者队列中识别出甲状腺癌的侵袭性分子特征，并开发了MAP评分，该评分超越了传统高风险突变的预后能力，特别关注了肿瘤微环境中的淋巴细胞富集基质 | 研究基于两个三级医疗中心的251名患者样本，样本来源可能有限，且未来需要更多临床验证来确认MAP评分在广泛人群中的适用性 | 改善甲状腺癌的预后预测和免疫治疗指导 | 251名甲状腺癌患者的312个样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | DNA测序, RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 251名患者的312个样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1474 | 2026-03-06 |
Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq) Identifies L1CAM as a Key Mediator between Epithelial Tuft Cell and Innate Lymphoid Cell in the Colon of Hnrnp I Knockout Mice
2023-Oct-09, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102734
PMID:37893107
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Hnrnp I敲除小鼠结肠中，上皮簇细胞通过L1CAM-整合素相互作用与第2组固有淋巴细胞（ILC2s）进行关键通讯，从而促进2型免疫反应和炎症的机制 | 首次在Hnrnp I敲除小鼠模型中，利用单细胞RNA测序技术揭示了结肠上皮簇细胞通过L1CAM-整合素相互作用与ILC2s建立特异性细胞通讯，驱动2型免疫反应的新机制 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类样本或临床环境中验证；机制研究主要基于相关性分析，缺乏直接的因果验证实验 | 探究Hnrnp I敲除导致结肠炎症和增生过程中，上皮细胞谱系动态变化和细胞间通讯的分子机制 | 野生型和Hnrnp I敲除小鼠的结肠组织及分离的单个细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，蛋白质表达数据 | 野生型和Hnrnp I敲除小鼠的结肠组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1475 | 2026-03-06 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
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研究论文 | 本研究利用STARmap PLUS原位测序技术，在三维空间中以单细胞分辨率绘制了小鼠中枢神经系统的分子细胞类型图谱 | 开发了STARmap PLUS原位测序方法，首次在三维尺度上以高分辨率（194×194×345 nm体素）同时分析1,022个基因，实现了对小鼠全脑和脊髓的全面空间转录组分析 | NA | 绘制小鼠中枢神经系统在分子分辨率下的空间图谱，以揭示大脑解剖结构和功能的分子基础 | 成年小鼠的大脑和脊髓组织 | 数字病理学 | NA | 原位测序 | NA | 空间转录组数据 | 109万个高质量细胞 | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS | STARmap PLUS原位测序技术，体素尺寸为194×194×345 nm |
| 1476 | 2026-03-06 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01218-y
PMID:37723590
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析肝细胞癌新辅助卡博替尼和纳武利尤单抗治疗后的肿瘤微环境，揭示了响应与非响应肿瘤的异质性机制 | 首次应用空间转录组学技术系统性描绘肝细胞癌新辅助联合治疗下的肿瘤微环境异质性，识别出PAX5模块激活和B细胞成熟在治疗响应中的关键作用，以及癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑机制 | 样本量较小（仅15例患者），且仅基于单中心前瞻性试验数据，需要更大规模验证 | 探究肝细胞癌对现代系统性治疗（卡博替尼联合纳武利尤单抗）响应差异的分子和细胞机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 15例肝细胞癌患者（其中5例有病理响应） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1477 | 2026-03-06 |
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad038
PMID:37492374
|
研究论文 | 本文通过整合基因组学方法，识别了头颈鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体致癌网络的关键靶点卵泡抑素 | 首次将卵泡抑素确定为p63的直接转录靶点，并揭示了其在连接TGF-β和EGFR通路中的功能作用，同时通过单细胞RNA测序数据明确了癌细胞是肿瘤微环境中卵泡抑素的主要来源 | 未详细探讨卵泡抑素在肿瘤微环境中与免疫细胞相互作用的分子机制 | 阐明头颈鳞状细胞癌中致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和代表性细胞系模型 | 基因组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 整合基因组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自头颈鳞状细胞癌患者和细胞系模型的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1478 | 2026-03-06 |
Transcriptomic forecasting with neural ordinary differential equations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100793
PMID:37602211
|
研究论文 | 本文开发了一种基于神经常微分方程的方法RNAForecaster，用于预测单细胞中多个未来时间步的基因表达状态 | 提出了一种嵌入无关的方法，能够从具有时间信息的高通量数据集中短期预测未来表达状态 | NA | 解决从细胞状态快照推断轨迹到估计细胞基因表达时间变化的挑战 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1479 | 2026-03-06 |
Cellular barcoding tracks heterogeneous clones through selective pressures and phenotypic transitions
2023-07, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.03.008
PMID:37105856
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综述 | 本文综述了细胞条形码技术在追踪异质性癌症克隆亚群命运中的应用，特别是与单细胞转录组学结合，以克隆级分辨率分析分子机制 | 结合细胞条形码与单细胞转录组学，实现克隆水平的高分辨率纵向分析，为研究肿瘤异质性起源和贡献提供了新工具 | NA | 探讨肿瘤细胞异质性的起源和贡献，以及选择和表型可塑性在疾病进展和治疗中的作用 | 异质性癌症细胞群体中的克隆亚群 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1480 | 2026-03-06 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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综述 | 本文总结了空间单细胞转录组技术在探索胃肠道组织转录组方面的最新进展及其对理解胃肠道生理学的促进作用 | 系统综述了新兴的空间单细胞技术如何通过提供全基因组水平的基因表达空间信息，弥补传统方法在解析胃肠道组织结构和细胞异质性方面的不足 | 作为一篇小型综述，未涉及具体实验数据或技术细节的深入分析，主要聚焦于技术概述和应用前景讨论 | 探讨空间单细胞转录组技术在胃肠道组织研究中的应用价值和发展前景 | 胃肠道组织及其多层次结构和异质性细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |