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当前共找到 37637 篇文献,本页显示第 1441 - 1460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1441 2026-03-06
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺炎期间肺间充质细胞的转录组响应,揭示了其多样化和特异性的免疫活动 首次系统性地鉴定了肺炎期间肺间充质细胞的五种亚型及其转录组动态变化,并发现了跨细胞类型的核心响应和亚型特异性响应 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且时间点有限(仅24小时和6周),可能未覆盖所有疾病阶段 探究肺间充质细胞在肺炎期间的转录组响应及其免疫功能 小鼠肺组织中的间充质细胞 单细胞转录组学 肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自小鼠肺单细胞悬液的间充质细胞,包括初始组、肺炎组和感染恢复组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1442 2026-03-06
Ag-driven CD8 + T cell clonal expansion is a prominent feature of MASH in humans and mice
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过单细胞测序和流式细胞术,揭示了MASH(代谢功能障碍相关脂肪性肝炎)中肝脏T细胞的表型、T细胞受体多样性及抗原驱动的克隆扩增现象 首次在人类和小鼠模型中证实MASH诱导的肝硬化导致肝脏中T细胞发生抗原依赖性克隆扩增和功能分化,并识别了PD1、TIGIT和TOX等慢性抗原刺激标志物 研究未明确驱动T细胞激活的具体抗原靶点,且样本来源限于人类肝硬化和小鼠饮食诱导MASH模型,可能无法完全代表所有MASH亚型 旨在解析MASH进展中T细胞在肝脏积累的表型、T细胞受体多样性及其功能作用 人类肝硬化患者和小鼠饮食诱导MASH模型的肝脏驻留T细胞 免疫学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 5'单细胞测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 人类肝硬化患者和小鼠MASH模型的肝脏T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1443 2026-03-06
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为ClonMapper Duo(CMDuo)的分子工具包,用于在单细胞分辨率下映射肿瘤细胞群体中的细胞-细胞融合事件 通过结合报告基因表达和工程化的荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码,CMDuo能够识别并追踪单个细胞融合事件的起源和结果,这是首次在单细胞水平上实现此类映射 由于依赖于特定的实验系统和条形码技术,CMDuo可能不适用于所有细胞类型或疾病模型,且需要单细胞RNA-seq数据支持 研究细胞-细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用,开发一种高通量单细胞数据平台来映射融合事件 三阴性乳腺癌细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1444 2026-03-06
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-Jan-17, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文通过整合分析小鼠和人类前列腺的单细胞转录组数据,揭示了前列腺组织在稳态、退行、再生和癌症过程中上皮细胞状态的广泛可塑性 利用随机矩阵理论去噪和最优传输方法,首次系统比较了跨物种前列腺上皮细胞转录组相似性,并整合单细胞转录组与拷贝数变异分析,阐明了前列腺癌进展中的转录程序 研究主要基于已发表和新生成的scRNA-seq数据,可能受限于样本数量和技术平台的异质性,且功能验证实验较少 探究前列腺上皮细胞在组织稳态、退行、再生和癌症过程中的动态变化和可塑性 小鼠和人类前列腺组织,包括正常、雄激素剥夺后退行、良性前列腺增生和未经治疗的前列腺癌样本 单细胞转录组学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 随机矩阵理论、最优传输 单细胞转录组数据、拷贝数变异数据 整合了多个已发表和新生成的小鼠和人类前列腺scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1445 2026-03-06
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文开发了一种名为SpaSNE的空间解析t-SNE方法,用于整合空间和分子信息,以更准确地可视化空间解析分析数据 SpaSNE是首个针对空间解析分析数据定制的降维方法,整合了空间和分子信息,相比传统方法如t-SNE和UMAP能提供更准确和有意义的数据可视化 NA 开发一种针对空间解析分析数据的降维和可视化方法,以更好地解释细胞类型和分子结构 空间解析分析数据集,包括来自不同疾病、组织和细胞类型的细胞 空间转录组学 NA 空间解析分析技术 t-SNE, UMAP, SpaSNE 空间解析分析数据 多个公共数据集,涵盖3个实验平台和不同疾病、组织及细胞类型 10x Genomics, 其他 空间转录组学, 空间解析分析 Visium, STARmap, MERFISH Visium, STARmap, MERFISH平台生成的空间解析分析数据
1446 2026-03-06
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为自动投影追踪(APP)的无监督聚类方法,通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒,并在多种生物数据模态上验证其有效性 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法,通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响,从而更有效地揭示生物数据中的模式 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性,以及计算效率的详细评估 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法,以改善高维生物数据的分析 高维生物数据,包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 机器学习 NA 自动投影追踪(APP) 无监督聚类算法 高维生物数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 NA NA
1447 2026-03-06
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议,并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 NA 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 小鼠角膜缘上皮干细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1448 2026-03-06
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征,并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术,系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络,并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织,可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞(PBMCs)、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 数字病理学 梅毒 免疫组化(IHC)、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 二期梅毒患者的皮肤活检样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1449 2026-03-06
Modeling reproductive and pregnancy-associated tissues using organ-on-chip platforms: challenges, limitations, and the high throughput data frontier
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
综述 本文综述了使用器官芯片平台模拟生殖和妊娠相关组织的现状,包括现有平台、方法学、局限性以及高通量数据前沿技术 系统总结了器官芯片在生殖和妊娠研究中的应用,并提出了通过空间转录组学、成像质谱流式细胞术和外泌体分析等新技术来克服现有挑战 设备限制(如细胞数量少、上清液体积低)、制造材料限制以及分子和生化检测方法的不足 评估器官芯片技术在生殖和妊娠相关组织建模、药物发现和毒理学风险评估中的应用潜力和挑战 生殖和妊娠相关组织 生物医学工程 NA 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术, 外泌体分析, 显微成像, 免疫细胞化学, 实时聚合酶链反应, 细胞因子多重分析 器官芯片(微生理系统或组织芯片) 图像, 分子数据, 生化数据 NA NA NA NA NA
1450 2026-03-06
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中,通过多组学分析和单细胞RNA测序,揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制,并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证;干预时间点和剂量方案有待优化;对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 数字病理学 视网膜病变 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 动物模型 多组学数据, 图像, 文本 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1451 2026-03-06
Single cell atlas of canine natural killer cells identifies distinct circulating and tissue resident gene profiles
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,构建了犬类自然杀伤细胞在不同组织中的单细胞图谱,并与人类自然杀伤细胞进行比较,揭示了跨物种的基因表达同源性 首次在犬类中系统性地绘制了自然杀伤细胞在血液、肺、肝、脾和胎盘等组织中的单细胞基因表达图谱,并进行了跨物种比较分析 研究主要基于基因表达数据,缺乏功能验证实验;样本来源可能有限,未涵盖所有犬类品种或疾病状态 旨在表征犬类自然杀伤细胞的异质性、组织特异性基因表达模式,并与人类自然杀伤细胞进行比较,以优化跨物种的自然杀伤细胞免疫治疗 犬类和人类的自然杀伤细胞,来源于血液、肺、肝、脾和胎盘等组织 单细胞组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 涉及犬类和人类的多组织样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1452 2026-03-06
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
综述 本文讨论了调控和系统基因组学领域的最新进展与挑战,重点关注顺式调控代码的解码及其在人类疾病中的应用 整合了计算基因组学、3D染色质组织分析和序列到功能神经网络,以预测遗传变异对表型的影响,并展望了空间转录组学等新兴技术 存在知识空白、技术限制以及计算方法基准测试的挑战 解码顺式调控代码,预测遗传变异在生物体、细胞和分子水平上对表型的影响 顺式调控元件、3D染色质组织、基因调控网络和人类疾病相关的遗传变异 自然语言处理 NA 基因组学检测、空间转录组学 序列到功能神经网络 序列数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1453 2026-03-06
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了犬和人类肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征,并评估了犬NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 首次在犬类中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析,建立了犬肉瘤浸润NK细胞特征,并将此特征应用于首次犬免疫疗法临床试验的NK细胞变化背景分析 研究样本可能有限,且犬类模型虽与人类相似,但物种间差异仍需谨慎考虑,临床试验的规模和多样性可能不足 改善NK细胞在实体癌症中的疗效,并识别跨物种反应的潜在生物标志物 犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 单细胞转录组学 肉瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 来自犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本,具体数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1454 2026-03-06
Spatially Informed Graph Structure Learning Extracts Insights from Spatial Transcriptomics
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为STAGUE的创新框架,通过图结构学习从空间转录组数据中同时学习细胞图结构和低维嵌入,以提升空间聚类精度并发现新的细胞间相互作用 STAGUE框架首次结合图结构学习和对比学习,参数化并优化细胞图邻接矩阵,克服了传统方法仅依赖空间邻近性定义图结构的局限性 未明确提及具体的数据集规模限制或计算复杂度问题,可能依赖于模拟和真实数据的泛化能力 旨在从空间转录组数据中提取更准确的细胞图结构和嵌入,以改善空间聚类和细胞间相互作用的发现 空间转录组数据集中的细胞,特别是人类乳腺癌组织 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 图结构学习,对比学习 空间转录组数据 86个真实和模拟的空间转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1455 2026-03-06
Gastric Cancer Actively Remodels Mechanical Microenvironment to Promote Chemotherapy Resistance via MSCs-Mediated Mitochondrial Transfer
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了胃癌通过间充质基质细胞介导的线粒体转移主动重塑机械微环境以促进化疗耐药性的机制 首次发现胃癌细胞通过分泌细胞外基质增加肿瘤组织硬度,从而促进间充质基质细胞通过微囊泡向胃癌细胞转移线粒体,导致奥沙利铂耐药 研究主要基于单细胞测序和体外实验,缺乏大规模临床验证,且具体机械信号通路细节需进一步探索 探究胃癌奥沙利铂耐药的机制,特别是细胞外机械信号在其中的作用 胃癌患者肿瘤组织、胃癌细胞、间充质基质细胞 数字病理学 胃癌 单细胞测序 NA 单细胞测序数据、组织样本 奥沙利铂耐药的胃癌患者肿瘤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1456 2026-03-06
Insufficient Mechanical Loading Downregulates Piezo1 in Chondrocytes and Impairs Fracture Healing Through ApoE-Induced Senescence
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了机械负荷不足如何通过下调软骨细胞中的Piezo1表达,并经由ApoE诱导的衰老机制,影响骨折愈合过程 首次揭示了机械负荷不足通过Piezo1-ApoE轴调控软骨细胞衰老,从而影响骨折愈合的新机制,并开发了一种可注射热敏水凝胶用于局部治疗 研究主要基于动物模型,尚未在人体中进行验证;水凝胶的长期安全性和疗效需进一步评估 探究机械负荷不足影响骨折愈合的分子机制,并开发新的治疗策略 骨折愈合过程中的软骨细胞,特别是肥厚性软骨细胞 骨生物学与再生医学 骨折愈合障碍 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1457 2026-03-06
Quantum Dots-caused Retinal Degeneration in Zebrafish Regulated by Ferroptosis and Mitophagy in Retinal Pigment Epithelial Cells through Inhibiting Spliceosome
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了InP/ZnS量子点通过诱导视网膜色素上皮细胞铁死亡和线粒体自噬,导致斑马鱼视网膜变性的机制 首次发现量子点通过抑制剪接因子prpf8,导致gpx4b mRNA未剪接,进而引发铁死亡和线粒体自噬,最终造成视网膜损伤 研究仅在斑马鱼模型中进行,尚未在哺乳动物或人体中验证 阐明典型金属量子点对视网膜的影响及其分子机制 斑马鱼视网膜 单细胞组学 视网膜变性 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 NA RNA测序数据,组织学图像 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1458 2026-03-06
Pericytes Modulate Third-Generation Tyrosine Kinase Inhibitor Sensitivity in EGFR-Mutated Lung Cancer Cells Through IL32-β5-Integrin Paracrine Signaling
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号通路调节EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂敏感性的机制 首次发现周细胞通过分泌IL32激活β5-整合素-Src-Akt通路,从而影响EGFR突变肺癌细胞的TKI敏感性,并揭示了YY1信号在此过程中的调控作用 动物模型中周细胞对TKI疗效的影响独立于血管功能,但人体内血管功能的潜在影响仍需进一步研究 探究EGFR突变肺癌患者对第三代TKI反应受限的机制,特别是周细胞在其中的作用 EGFR突变肺癌细胞、患者来源的周细胞、肿瘤组织样本、动物模型 肿瘤生物学 肺癌 单细胞RNA测序、多重免疫染色、共培养实验、条件培养基实验、动物模型 NA RNA测序数据、免疫染色图像、细胞实验数据、动物实验数据 EGFR突变患者来源的周细胞和肿瘤组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1459 2026-03-06
Hepatocyte-Targeted Lipid Nanoparticle Delivery of HERC2 Plasmid Controls Drug-Induced Hepatotoxicity by Limiting β-Catenin-Regulated CYP2E1 Expression
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了HERC2通过调控β-catenin介导的CYP2E1表达,在药物性肝损伤中发挥保护作用,并开发了靶向肝细胞的脂质纳米颗粒递送HERC2质粒的治疗策略 首次阐明了HERC2在药物性肝损伤中的保护性作用机制,即通过促进β-catenin泛素化来负调控CYP2E1表达,并创新性地采用肝细胞靶向脂质纳米颗粒递送HERC2质粒进行干预 研究主要基于APAP诱导的肝损伤模型,在其他类型DILI中的普适性有待验证;脂质纳米颗粒递送系统的长期安全性和体内稳定性需进一步评估 探究HERC2在药物性肝损伤中的作用机制并开发靶向治疗策略 肝细胞、HERC2基因、β-catenin蛋白、CYP2E1酶 分子生物学与药理学 药物性肝损伤 单细胞RNA测序、脂质纳米颗粒递送、质粒转染 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 肝细胞特异性HERC2缺陷小鼠模型及对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1460 2026-03-06
Exercise Induced Endothelial Mesenchymal Transition (EndMT) Facilitates Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了运动诱导的内皮间质转化(EndMT)在促进半月板纤维软骨再生中的作用,并开发了一种手持式生物打印系统用于术中制造多孔半月板支架 首次证明EndMT在半月板再生中的贡献,并开发了结合术后规律运动刺激的多孔支架移植策略,简化了支架制造过程 研究基于绵羊模型,临床转化效果需进一步验证,且未详细探讨长期安全性和潜在副作用 开发一种有效的半月板再生转化策略,以改善半月板切除后的治疗 半月板纤维软骨组织,绵羊模型中的半月板再生过程 组织工程与再生医学 骨科疾病(半月板损伤) 单细胞RNA测序,免疫荧光共染色分析 NA 基因表达数据,图像数据 绵羊模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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