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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2026-03-06 |
GSTP1 as a novel protective target in sepsis: evidence from proteome-wide Mendelian randomization and multi-omics analyses
2026-Feb-02, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12748-2
PMID:41629825
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和多组学分析,系统性地研究了脓毒症的致病蛋白及其调控机制,并识别出GSTP1作为一个新的保护性靶点 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析(包括单细胞RNA测序)来系统识别脓毒症的因果蛋白及其免疫调控机制,并进行了药物预测和分子对接验证 | 研究依赖于公开的遗传和组学数据集,可能存在样本选择偏差,且药物预测结果需要进一步的实验验证 | 识别脓毒症的致病蛋白并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者及相关蛋白质(如GSTP1、SFRP1、IL1RL1、INHBB) | 生物信息学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达谱芯片、甲基化定量性状位点分析、免疫浸润分析、药物预测、分子对接 | 孟德尔随机化模型、ROC分析、中介分析 | 蛋白质组数据、基因表达数据、甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 两个血浆蛋白质组数据集(Decode含4,907个蛋白质,UKB-PPP含2,640个蛋白质)及独立微阵列数据集GSE95233 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1362 | 2026-03-06 |
Single-cell omics in tumor lymph node metastasis: mechanisms and therapeutic implications
2026-Feb-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02585-x
PMID:41629958
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示肿瘤淋巴结转移(LNM)的微环境、免疫抑制机制以及相关免疫治疗研究中的应用与发现 | 从单细胞分辨率层面系统总结了LNM过程中肿瘤细胞和微环境的异质性、细胞间通讯和细胞进化轨迹,并强调了肿瘤引流淋巴结(TDLNs)在免疫治疗中的关键作用及适应性改变 | NA | 探讨肿瘤淋巴结转移的机制及其对免疫治疗的影响 | 肿瘤淋巴结转移(LNM)过程、肿瘤引流淋巴结(TDLNs)、肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1363 | 2026-03-06 |
Short-Chain Fatty Acid Supplementation After Traumatic Brain Injury Attenuates Neurologic Injury Via the Gut-Brain-Microglia Axis
2026-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002706
PMID:40961414
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研究论文 | 本研究探讨了创伤性脑损伤(TBI)后补充短链脂肪酸(SCFAs)如何通过肠-脑-小胶质细胞轴减轻小鼠的神经损伤 | 首次系统性地研究了TBI后补充SCFAs(而非粪菌移植)对神经损伤的保护作用,并揭示了其通过调节肠道微生物组、小胶质细胞转录组和神经炎症发挥作用的机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未探索性别差异;样本量相对有限(n=52);机制研究主要基于相关性观察,直接的因果证据有待加强 | 探究TBI后补充SCFAs是否能够减轻神经损伤并阐明其潜在机制 | 14周龄雄性C57BL/6小鼠 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 16s rRNA基因扩增子测序,单细胞RNA测序(scRNAseq),3D对比增强磁共振成像 | NA | 微生物组测序数据,单细胞转录组数据,磁共振成像数据,行为学数据 | 52只雄性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1364 | 2026-03-06 |
Comprehensive transcriptomics and proteomics analysis of neointima formation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2026-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00653.2025
PMID:41569144
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研究论文 | 本研究通过转录组学和蛋白质组学分析,探讨了人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中新生内膜形成的细胞和分子机制 | 首次在人类隐静脉组织培养模型中结合转录组学、蛋白质组学和空间转录组学,揭示了新生内膜形成的动态分子变化,并识别了性别和体重指数相关的差异以及新的成纤维细胞和平滑肌细胞状态 | 研究基于体外组织培养模型,可能无法完全模拟体内生理环境,且样本量有限(72例患者),需进一步验证 | 探究人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中新生内膜形成的分子机制,以改善静脉移植失败问题 | 人类隐静脉样本,来自冠状动脉搭桥手术患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序,蛋白质组学分析,空间转录组学 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,空间转录组数据 | 72例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1365 | 2026-03-06 |
Large-scale single-cell analysis and in silico perturbation reveal dynamic evolution of HCC: from initiation to therapeutic targeting
2026-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01307-2
PMID:41617928
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间分析数据,系统解析了肝细胞癌(HCC)从起始到治疗靶向的动态演化过程,揭示了肿瘤内异质性、微环境生态系统及潜在治疗靶点 | 整合跨正常肝组织、原发肿瘤、门静脉癌栓和转移淋巴结的单细胞转录组与空间分析,首次系统描绘HCC进展的细胞生态系统;识别了四种具有不同临床轨迹和治疗脆弱性的恶性肝细胞转录元程序;通过空间映射揭示了基质结构与恶性表型的空间关联;利用Geneformer虚拟敲除筛选鉴定出HSP90B1作为关键依赖性靶点 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或表观遗传层面的验证;虚拟筛选结果需进一步实验验证;样本来源和数量可能限制某些亚群的普适性 | 系统解析肝细胞癌(HCC)的肿瘤内异质性和微环境动态演化,识别驱动疾病进展的关键细胞状态和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌(HCC)患者样本,包括正常肝组织、原发肿瘤、门静脉癌栓(PVTT)和转移淋巴结(MLN) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组分析,虚拟敲除筛选 | Geneformer | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 大规模单细胞样本(具体数量未明确说明),涵盖正常肝、原发肿瘤、PVTT和MLN | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1366 | 2026-03-06 |
Mitochondrial complex I subunit NDUFS4 overexpression drives glioma progression by regulating mitochondrial function and COX5B
2026-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01281-9
PMID:41617910
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体蛋白NDUFS4在胶质瘤细胞中的表达、功能意义及潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序定位NDUFS4在胶质瘤细胞中的高表达,并揭示其通过调控线粒体功能和COX5B驱动胶质瘤进展 | NA | 探究NDUFS4在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤细胞、患者组织、胶质瘤异种移植模型 | NA | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, shRNA, 多组学整合 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1367 | 2026-03-06 |
Notch3 regulates pericyte phenotypic plasticity in colorectal cancer
2026-Jan-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09629-4
PMID:41618002
|
研究论文 | 本研究探讨了Notch3信号在结直肠癌中周细胞表型和功能中的作用,揭示了其调控周细胞表型可塑性及影响肿瘤血管生成的机制 | 首次将Notch3信号通路与结直肠癌周细胞的表型可塑性直接关联,并通过单细胞RNA测序揭示了周细胞异质性中Notch3活性的差异 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化潜力需进一步验证 | 阐明Notch3信号在结直肠癌周细胞表型调控中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 小鼠和人类结直肠癌中的周细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、体内基因操作 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和人类结直肠癌样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1368 | 2026-03-06 |
Prostaglandin E2 Reverses Myofibroblast Differentiation in Eosinophilic Esophagitis
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702012
PMID:41659461
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺素E2(PGE2)在嗜酸性粒细胞性食管炎(EoE)中逆转肌成纤维细胞分化的疗效和机制 | 首次探索了通过调节肌成纤维细胞作为EoE纤维狭窄性食管炎的治疗可能性,并揭示了PGE2通过cAMP/YAP/THBS-1通路促进肌成纤维细胞去分化的新机制 | 研究主要基于细胞模型和小鼠模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究PGE2对EoE肌成纤维细胞去分化的疗效和机制,探索EoE纤维狭窄的治疗策略 | 胎儿食管成纤维细胞(FEF3)、患者来源的成纤维细胞、EoE小鼠模型 | NA | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据、组织学数据 | 胎儿食管成纤维细胞系、患者来源细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1369 | 2026-03-06 |
Allergen-specific human IgE isolated through an allergen-agnostic pipeline-understanding immune response and allergen recognition
2026-Jan-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09600-3
PMID:41606257
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研究论文 | 本文介绍了一种从过敏患者免疫库中直接生成重组IgE的流程,用于研究过敏的分子机制 | 开发了一种不依赖特定过敏原的流程,通过单细胞测序技术从IgM B细胞中识别和生成高亲和力IgE抗体 | NA | 研究过敏的分子机制,开发用于过敏研究、诊断和治疗的抗体 | 过敏患者的骨髓和外周血IgM B细胞 | 自然语言处理 | 过敏 | 单细胞测序,高通量转录组测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1370 | 2026-03-06 |
Subclinical fields of BRAF V600E-mutant melanocytes populate human skin and are enriched around melanoma and naevi
2026-01-27, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf412
PMID:41148046
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研究论文 | 本研究揭示了在临床健康皮肤中普遍存在BRAF V600E突变黑色素细胞的亚临床区域,这些区域在黑色素瘤和痣周围富集,挑战了BRAF V600E突变本身具有致癌性的传统观点 | 首次在无可见病变的高风险成人皮肤中系统性识别出BRAF V600E突变黑色素细胞区域,并发现这些细胞处于生长停滞状态,为黑色素瘤起源提供了新视角 | 样本主要来自高风险澳大利亚人群,可能无法完全代表普通人群;研究未长期追踪这些突变细胞的肿瘤转化过程 | 探究BRAF V600E突变黑色素细胞是否普遍存在于高风险黑色素瘤成人的非病变皮肤中 | 97例来自高风险个体的临床健康皮肤样本,包括痣或黑色素瘤邻近皮肤、光损伤皮肤、光保护皮肤及新生儿包皮来源的黑色素母细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 免疫组织化学、液滴数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 组织切片图像、基因表达数据 | 97例皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1371 | 2026-03-06 |
Heterogeneous generation and expansion of epidermal-resident memory T cells in individuals allergic to nickel
2026-01-27, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf427
PMID:41206452
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研究论文 | 本研究探讨了镍过敏个体在反复暴露于镍后,表皮驻留记忆T细胞的异质性生成和扩增机制 | 首次在镍过敏个体中,通过重复斑贴试验结合单细胞RNA测序,揭示了表皮TRM细胞的克隆扩增和分化多样性,并发现了耗竭样T细胞亚群的存在 | 样本量较小(12名参与者),且未发现特定T细胞亚型与临床反应严重程度的相关性 | 研究反复镍暴露如何影响镍过敏个体的临床反应及表皮TRM细胞的积累和分化 | 12名镍过敏参与者 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名镍过敏参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1372 | 2026-03-06 |
Single-cell atlas of human lung aging identifies cell type dyssynchrony and increased transcriptional entropy
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68810-9
PMID:41571679
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,描绘了人类肺部衰老过程中细胞、转录组和基因组的变化图谱,揭示了细胞类型间的不同步衰老现象 | 首次在单细胞水平上系统揭示了人类肺部衰老的细胞类型特异性变化,特别是肺泡上皮细胞和内皮细胞的转录组变化最为显著,并发现衰老与转录熵增加相关,而非传统衰老标志物细胞的增多 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全捕捉到蛋白质水平或表观遗传学的变化,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究人类肺部衰老的细胞和分子机制,识别与年龄相关的关键细胞类型和转录变化 | 人类肺部组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类肺部组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1373 | 2026-03-06 |
SpaceBF: spatial coexpression analysis using Bayesian fused approaches in spatial omics datasets
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag006
PMID:41556565
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于空间组学数据中的空间共表达分析 | SpaceBF通过预定义空间邻接图上的融合马蹄先验,在局部和全局水平估计共表达,允许大边缘特定差异逃逸收缩同时保持整体结构,相比常用方法具有更高特异性和功效 | NA | 开发一种稳健的方法来识别空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达 | 空间转录组学和质谱成像数据中的基因、肽、脂质或N-聚糖 | 空间组学 | 癌症 | 空间转录组学,质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,质谱成像 | NA | NA |
| 1374 | 2026-03-06 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
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综述 | 本文综述了脂肪组织生物学的最新进展,强调了其在人类生理调节中的核心作用及其功能障碍与肥胖相关疾病的关系 | 突出了脂肪组织从惰性组织到动态调节器官的认知转变,以及单细胞RNA测序等技术在揭示脂肪库特异性机制方面的应用潜力 | 作为一篇综述文章,未提出新的原始研究数据或实验验证 | 总结脂肪组织在健康和疾病中的关键作用及生物学研究进展 | 脂肪组织及其细胞,特别是脂肪细胞 | NA | 2型糖尿病、心血管疾病、肝病、多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1375 | 2026-03-06 |
Integrative single cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics uncovers distinct macrophage-fibroblast cross-talk in human hip synovium between patients with femoroacetabular impingement and osteoarthritis
2026-Jan-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70033
PMID:41524472
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了股骨髋臼撞击症(FAI)与髋关节骨关节炎(OA)患者髋关节滑膜中巨噬细胞-成纤维细胞交互的差异 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统比较了FAI和髋OA患者滑膜细胞组成、转录组谱及细胞间相互作用,并识别了EREG+成纤维样滑膜细胞(FLS)及其与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞(MΦ)通过FGF2-SDC4信号通路的独特交互 | 样本量较小(每组6例),且研究仅限于人类髋关节滑膜,未涉及其他关节或动物模型,可能限制结果的普适性 | 探究FAI和髋OA患者髋关节滑膜中细胞组成、转录组变化及细胞间相互作用的差异,以揭示疾病进展机制 | 人类髋关节滑膜样本,来自FAI和髋OA患者 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 12例人类髋关节滑膜样本(FAI和髋OA各6例) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1376 | 2026-03-06 |
Mouse digit AAV gene delivery into fibroblasts regulates regenerative outcome
2026-Jan-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0229
PMID:41499500
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研究论文 | 本研究通过比较小鼠远端和近端指端再生与纤维化的单细胞RNA测序分析,开发了一种AAV基因递送技术,以调控成纤维细胞亚群并验证候选基因对再生结果的影响 | 结合单细胞RNA测序计算分析与新型AAV基因递送技术,首次在小鼠指端成纤维细胞中系统识别并验证了调控纤维化与再生的关键基因 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类或其他哺乳动物中验证;AAV递送技术的长期安全性和效率需进一步评估 | 探究哺乳动物指端再生与纤维化的分子机制,并开发基因干预策略以改善伤口愈合结果 | 小鼠指端(远端再生区域与近端纤维化区域)的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 组织再生障碍与纤维化疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),腺相关病毒(AAV)基因递送 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1377 | 2026-03-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptomic landscape of and potential targets for large and giant congenital melanocytic naevi
2026-01-06, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf360
PMID:40974031
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了大型和巨型先天性黑色素细胞痣的转录组景观,并探索了其潜在治疗靶点 | 首次将单细胞技术应用于L/GCMN研究,识别了TBX2作为核心转录因子,并揭示了异常信号通路激活 | 研究样本量有限,且未建立L/GCMN的治疗指南 | 阐明L/GCMN皮肤微环境中细胞的转录组景观,探索黑色素细胞病理变化的关键分子机制及其与其他细胞的相互作用 | 大型和巨型先天性黑色素细胞痣患者的病变和非病变皮肤样本,以及健康皮肤样本 | 数字病理学 | 黑色素细胞痣 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Western blotting, 定量逆转录聚合酶链反应, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 患者和健康个体的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1378 | 2026-03-06 |
Intrinsic OASL expression governs heterogeneity in interferon induction during influenza A virus infection
2026-Jan-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509560123
PMID:41468430
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研究论文 | 本文通过分析流感A病毒感染细胞的单细胞RNA测序数据,揭示了内在OASL表达在调控干扰素诱导异质性中的关键作用 | 开发了一种分析时间序列单细胞RNA测序数据的方法,首次发现感染前细胞中干扰素刺激基因(ISGs)的表达与感染后干扰素诱导潜力相关,并证实OASL的内在表达对流感A病毒感染期间IFNL的稳健诱导至关重要 | NA | 识别在病毒感染期间,决定细胞在干扰素诱导潜力上异质性的特定宿主因素 | 流感A病毒(IAV)感染的细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1379 | 2026-01-07 |
Unveiling the TBX2-driven molecular landscape of large and giant congenital melanocytic naevi: from single-cell sequencing to targeted therapy
2026-Jan-06, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf415
PMID:41126440
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1380 | 2026-03-06 |
IL-33 blockade attenuates vascular inflammation in a mouse model of Kawasaki disease vasculitis
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxaf086
PMID:41533763
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨了IL-33在川崎病血管炎发病机制中的作用,并评估了其作为治疗靶点的潜力 | 首次在川崎病小鼠模型中系统揭示了IL-33在血管炎症中的关键作用,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术明确了基质细胞是IL-33的主要来源 | 研究基于小鼠模型,结果在人类川崎病中的直接适用性尚需进一步验证 | 阐明IL-33在川崎病血管炎发病机制中的具体作用 | 乳杆菌细胞壁提取物诱导的川崎病小鼠模型 | 免疫学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |