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当前共找到 44757 篇文献,本页显示第 1361 - 1380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1361 2026-10-07
Oncogenic Cell Tagging and Single-Cell Transcriptomics Reveal Cell Type-Specific and Time-Resolved Responses to Vhl Inactivation in the Kidney
2024-06-04, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该研究通过将Vhl失活与tdTomato报告基因直接偶联,结合单细胞RNA测序,纵向追踪了肾脏中Vhl失活诱导的细胞类型特异性和时间分辨的响应 开发了致癌细胞标记策略,将Vhl失活直接与单等位基因tdTomato报告基因表达偶联,可在天然组织环境中精确可视化受影响的细胞并进行单细胞RNA测序,揭示了细胞类型特异性响应和具有致癌潜力的近端小管细胞类群 摘要中未明确提及研究的具体局限性 纵向研究肿瘤抑制基因VHL缺失诱导的初始致癌事件和细胞响应,以理解肾细胞癌的发生机制 小鼠肾脏细胞,特别是近端小管细胞和肾间质细胞 单细胞转录组学 肾细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1362 2026-10-07
EML4-ALK fusions drive lung adeno-to-squamous transition through JAK-STAT activation
2024-03-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 该研究发现EML4-ALK融合基因可通过JAK-STAT信号通路的激活驱动肺腺癌向鳞状细胞癌的转分化,并揭示了ALK重排肿瘤的可塑性与耐药机制 首次揭示EML4-ALK通过相分离激活JAK-STAT信号通路驱动肺腺癌向鳞癌转变,鉴定了club细胞为鳞状转变的主要来源细胞,并提出JAK1/2抑制剂联合ALK抑制剂可克服耐药 研究主要基于转基因小鼠模型和类器官体系,人体样本验证仍需进一步扩大,且JAK1/2抑制剂联合治疗的临床有效性尚未在临床试验中验证 探究ALK重排肺腺鳞癌中腺癌向鳞癌转分化的分子机制及潜在治疗策略 人肺腺鳞癌(LUAS)样本、ALK重排肺腺癌(LUAD)患者样本、EML4-ALK转基因小鼠模型、类器官 数字病理学, 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 免疫染色, 类器官培养, 转基因小鼠模型 NA 图像, 文本 人LUAS样本中ALK重排检出率为5.1-7.5%,具体样本量未明确说明 NA single-cell RNA-seq NA NA
1363 2026-10-07
Inositol phosphatase INPP4B sustains ILC1s and intratumoral NK cells through an AKT-driven pathway
2024-03-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序图谱发现肌醇多磷酸酶INPP4B是组织驻留ILC1和肿瘤内NK细胞的标志性特征,并揭示其通过AKT通路维持这些细胞的稳态和抗肿瘤功能 首次将INPP4B鉴定为组织驻留ILC1和肿瘤内NK细胞的标志性特征,并揭示其通过AKT驱动的促生存通路调控组织驻留和抗肿瘤免疫的新机制 摘要中未明确说明研究的具体局限性 探究INPP4B在组织驻留ILC1和NK细胞稳态维持及抗肿瘤免疫中的功能和作用机制 先天淋巴细胞(ILCs),包括1型先天淋巴细胞(ILC1s)和自然杀伤(NK)细胞 单细胞组学,免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1364 2026-10-07
A conserved transcriptional program for MAIT cells across mammalian evolution
2024-02-05, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序技术,跨六种哺乳动物物种分析了MAIT细胞的发育和转录程序,揭示了进化上保守的MAIT细胞特征 首次在跨越1.1亿年进化的六个物种中系统表征MAIT细胞发育,发现ZBTB16诱导是MAIT细胞成熟的保守事件,并揭示了人类、绵羊、牛和负鼠共享的1型/17型转录程序,以及小鼠肠道MAIT细胞独特的成熟程序 研究主要基于转录组数据,缺乏功能验证实验;物种数量有限,可能未完全覆盖MAIT细胞的进化多样性;小鼠肠道MAIT细胞的特殊成熟程序是否适用于其他组织尚不清楚 探究MAIT细胞在哺乳动物进化中的保守功能特征和转录程序 六种哺乳动物(人类、小鼠、绵羊、牛、负鼠等)的MAIT细胞 单细胞转录组学、免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 六种哺乳动物的MAIT细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 物种特异性四聚体结合单细胞RNA测序
1365 2026-10-07
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞转录组与孟德尔随机化分析,发现FCRL3在多发性硬化症中具有保护作用,并可能成为潜在治疗靶点 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析相结合,系统性地识别多发性硬化症的新型治疗靶点,并验证了FCRL3的保护性因果作用 未提及具体验证实验或临床试验数据,依赖于公共数据库(deCODE、GWAS等)的可用性和质量,可能受限于样本群体代表性 发现多发性硬化症的新型治疗靶点,并阐明蛋白质与多发性硬化症之间的因果关系 多发性硬化症患者的外周血细胞及相关的基因组、转录组和蛋白质组数据 机器学习 多发性硬化症 单细胞RNA测序、GWAS、eQTL、pQTL NA 图像、文本 1123个表达变化,来自7种外周细胞类型,涉及97个基因和28种蛋白质 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1366 2026-10-07
Elucidating T cell dynamics and molecular mechanisms in syngeneic and allogeneic islet transplantation through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了同基因和异基因胰岛移植后T细胞亚群的分子机制、基因表达差异、生物学通路改变及细胞间通讯模式 首次通过单细胞RNA测序全面揭示了同基因与异基因胰岛移植后T细胞亚群的分子差异,发现了异基因移植中特定基因上调及不同T细胞亚群中差异性的通路激活模式,为改善移植物耐受提供了潜在靶点 摘要中未明确说明样本量大小及实验动物的具体数量,且未提及研究结果是否在人类临床样本中得到验证 阐明同基因和异基因胰岛移植后T细胞亚群的分子机制、基因表达差异、生物学通路改变及细胞间通讯模式,以增强移植物接受度并更有效地管理糖尿病治疗 同基因和异基因胰岛移植后的T细胞亚群 单细胞组学 糖尿病 单细胞RNA测序 Seurat, t-SNE, GSEA, CellChat 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1367 2026-10-07
Differential modulation of mutant CALR and JAK2 V617F-driven oncogenesis by HLA genotype in myeloproliferative neoplasms
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究探讨了HLA基因型在骨髓增殖性肿瘤中对CALR突变和JAK2 V617F驱动致癌作用的差异性调节 首次通过大规模HLA高分辨率基因分型和meta分析揭示HLA-I基因型对JAK2 V617F和CALR突变驱动致癌作用的差异性限制,解释了两种突变的互斥性和呈递潜伏期差异 样本量有限,仅纳入42例CALR突变阳性患者,需要更大规模队列验证;scRNA-Seq分析仅初步揭示CALR突变阳性造血干祖细胞中HLA基因低表达 研究HLA基因在CALR突变阳性骨髓增殖性肿瘤中的潜在作用及其对致癌作用的调节机制 42例CALR突变阳性MPN患者、158例JAK2 V617F阳性MPN患者和1083例健康对照 免疫遗传学、肿瘤基因组学 骨髓增殖性肿瘤 HLA高分辨率基因分型、scRNA-Seq、meta分析 NA 基因型数据、单细胞转录组数据 42例CALR突变阳性MPN患者、158例JAK2 V617F阳性MPN患者和1083例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1368 2026-10-07
Histamine and Th2 cytokines independently and synergistically upregulate MMP12 expression in human M2 macrophages
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和定量PCR/ELISA,探究了组胺和Th2细胞因子如何独立及协同上调人M2巨噬细胞中MMP12的表达,并分析了度普利尤单抗治疗对AD患者M2巨噬细胞MMP12表达的影响 首次在单细胞水平上鉴定出巨噬细胞是AD皮损中MMP12的主要产生者,并揭示了组胺和Th2细胞因子独立及协同上调M2巨噬细胞MMP12表达的新机制 样本量有限,且未深入探讨MMP12表达调控对AD皮肤屏障功能的具体影响机制 探究组胺和Th2细胞因子对AD患者及健康个体M2巨噬细胞MMP12表达的调控作用 AD患者皮损组织、健康个体及AD患者来源的单核/巨噬细胞、度普利尤单抗治疗的AD患者 单细胞转录组学 特应性皮炎 scRNA-seq, qPCR, ELISA NA 文本, 图像 AD患者皮损组织及健康个体和AD患者的外周血单核细胞来源的M2巨噬细胞(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1369 2026-10-06
Astrocytes and Alcohol Throughout the Lifespan
2026-01-01, Biological psychiatry IF:9.6Q1
综述 本文综述了星形胶质细胞对酒精的反应及其在酒精使用障碍发展中的作用,涵盖单细胞RNA测序研究、星形胶质细胞异质性、反应性、细胞外基质重塑、突触传递调节以及胎儿酒精谱系障碍中的角色 首次系统综述了星形胶质细胞在酒精使用障碍中的新兴证据,特别强调了此前从未被综述过的酒精对星形胶质细胞调节突触传递影响的研究,以及胎儿酒精谱系障碍中星形胶质细胞的作用 知识空白仍然存在,亟需识别对酒精暴露敏感的星形胶质细胞亚群和分子,目前缺乏可作为治疗干预靶点的明确分子靶标 评估现有临床前文献中支持星形胶质细胞参与酒精暴露效应的证据,综述星形胶质细胞对酒精的反应及其在酒精使用障碍发展中的贡献 星形胶质细胞、酒精暴露、酒精使用障碍、胎儿酒精谱系障碍 神经科学 酒精使用障碍、胎儿酒精谱系障碍 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1370 2026-10-06
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过多组学分析揭示了胰腺导管腺癌中导管周围成纤维细胞密度通过CD44依赖的基质检查点决定淋巴细胞排斥的空间机制 首次建立以癌症相关成纤维细胞分层的导管空间架构作为PDAC免疫排斥的基本决定因素,发现胶原-CD44信号轴作为锚定免疫细胞的粘附轴,并提出可靶向的基质检查点概念 研究主要基于治疗初治患者样本的相关性分析,CD44阻断的功能验证仅限于纤维化球体模型,缺乏体内动物模型和临床干预验证 探究胰腺导管腺癌中纤维化对基质-导管架构和免疫细胞定位的影响,确定免疫排斥的空间决定因素及可靶向的基质检查点 胰腺导管腺癌患者的恶性导管上皮区域及肿瘤微环境中的免疫细胞和癌症相关成纤维细胞 数字病理学 胰腺癌 成像质谱流式、多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 配体-受体推断分析、纤维化球体模型 图像、文本 来自三个独立队列的治疗初治患者样本 NA 成像质谱流式、多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA NA
1371 2026-10-06
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems from multiple cancer types reveals convergent and divergent mechanisms of bone colonization
2025-07-09, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 该研究通过对来自八种癌症类型的42个骨转移样本进行单细胞RNA测序,揭示了骨转移生态系统的三种不同原型及其趋同与趋异机制 首次对多种癌症类型的骨转移进行大规模单细胞RNA测序,发现了三种不同的生态系统原型,并揭示了骨转移与原发组织之间仅有适度相关性,即同一癌症类型的骨转移常落入不同原型,而不同癌症类型的骨转移有时趋同于同一原型 摘要中未明确提及研究局限性 探究骨转移的组织学和分子特征多样性,揭示骨定植的趋同与趋异机制 来自八种癌症类型的42个骨转移样本以及来自10种以上癌症类型的158个骨转移样本的bulk RNA测序/微阵列数据 单细胞转录组学 骨转移(多种癌症类型) 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列分析, 免疫染色 NA 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据, 微阵列数据, 图像 42个骨转移样本(单细胞RNA测序)和158个骨转移样本(bulk RNA测序/微阵列数据) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1372 2026-10-06
SpaLinker identifies phenotype-associated spatial tumor microenvironment features by integrating bulk and spatial sequencing data
2025-07-09, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一个名为SpaLinker的创新整合框架,通过整合批量RNA测序数据和空间转录组数据,在分子、细胞和组织结构水平上识别与表型相关的空间肿瘤微环境特征 提出了SpaLinker整合框架,利用表型驱动的计算框架,通过整合积累的批量RNA测序数据来评估空间定义特征的预后意义,解决了空间测序样本临床注释稀缺的问题 摘要中未明确提及研究的具体局限性 开发一个泛癌分析平台,从头识别与表型相关的空间肿瘤微环境特征,增强空间测序技术的临床实用性 多种肿瘤的空间转录组数据集 空间转录组学 泛癌 空间转录组学,批量RNA测序 NA 空间转录组数据,批量RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
1373 2026-10-06
Single-cell meta-analysis of T cells reveals clonal dynamics of response to checkpoint immunotherapy
2025-05-14, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 该研究通过对6种癌症类型、460个样本中767,606个T细胞进行配对的单细胞RNA测序和T细胞受体测序的meta分析,揭示了T细胞克隆动态与免疫检查点抑制剂治疗反应之间的关系 首次大规模跨6种癌症类型的单细胞RNA测序/T细胞受体测序配对分析,基于扩增的CD8克隆建立了可区分应答者与非应答者的稳健反应特征,发现了持续性克隆的转录变化、新发克隆的拟时序状态变化以及与临床结局相关的肿瘤-血液共享克隆 摘要中未明确提及研究局限性 表征T细胞克隆并探究其与免疫检查点抑制剂治疗后临床结局的关联 6种癌症类型中接受免疫检查点抑制剂治疗的患者的T细胞 数字病理学, 机器学习 肺癌, 多种癌症类型 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, 文本 767,606个T细胞,来自460个样本,涵盖6种癌症类型 NA 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA NA
1374 2026-10-06
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2025-03, Pediatric research IF:3.1Q1
综述 本篇综述总结了新生儿出血后脑积水(PHH)的神经炎症通路及新兴治疗靶点的最新分子研究进展 从分子和细胞机制(包括神经炎症通路、免疫介质和调控基因)角度系统阐述PHH的病理生理,并探讨全基因组/外显子测序、蛋白质组学、表观遗传学和单细胞转录组学等先进技术在识别关键分子靶点及基因和干细胞治疗中的应用潜力 新兴疗法在新生儿群体中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未解决,需要进一步研究验证这些方法、提高安全性并改善患儿预后 概述PHH病理生理的最新分子见解,并评估针对其潜在机制的新兴治疗方法 新生儿出血后脑积水(PHH)患者,尤其是早产儿脑室内出血(IVH)后并发PHH的群体 数字病理学 新生儿出血后脑积水 全基因组/外显子测序,蛋白质组学,表观遗传学,单细胞转录组学 NA 文本 NA NA NA NA NA
1375 2026-10-06
scRNA + BCR-seq identifies proportions and characteristics of dual BCR B cells in the peritoneal cavity of mice and peripheral blood of healthy human donors across different ages
2024-Dec-28, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 利用单细胞RNA与BCR联合测序技术,分析了小鼠腹腔和健康人外周血中双BCR B细胞的比例和特征,并探讨其与年龄的关系。 首次在衰老过程中系统研究双BCR B细胞,并发现老年小鼠中双BCR B细胞增加,且主要来源于B1细胞,同时在人类外周血中验证了年龄相关变化。 样本量有限,仅涉及小鼠腹腔和健康人外周血,未深入探究双BCR B细胞的功能机制。 探究双受体B细胞在不同年龄的小鼠腹腔和健康人外周血中的存在情况以及年龄相关差异。 小鼠腹腔B细胞和健康人类志愿者外周血B细胞。 免疫学 NA scRNA-seq, scBCR-seq NA 单细胞转录组和BCR序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR-seq NA NA
1376 2026-10-06
The vascular phenotype of BPD: new basic science insights-new precision medicine approaches
2024-10, Pediatric research IF:3.1Q1
综述 本文综述了支气管肺发育不良(BPD)相关肺高压的血管表型,重点探讨了单细胞RNA测序揭示的内皮祖细胞耗竭、miRNA信号异常以及基于细胞外囊泡和miRNA的治疗策略 整合了胎盘生物学和单细胞水平肺发育研究的新见解,提出BPD的血管表型概念,并强调基于细胞外囊泡和miRNA的精准医学治疗策略 对 disrupted pathways、干预时机和递送方式仍需进一步研究 探讨BPD相关肺高压的血管表型及其精准医学治疗策略 BPD和BPD相关肺高压患者,以及相关内皮祖细胞和细胞外囊泡 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1377 2026-10-06
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 该研究构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据,评估了多种细胞类型去卷积方法在FFPE乳腺组织中的应用,并开发了SCdeconR R包 构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据,系统评估了去卷积方法在FFPE样本中的表现,发现Scaden方法对FFPE伪影具有鲁棒性,并开发了SCdeconR R包用于去卷积评估和下游分析 研究仅针对乳腺组织,去卷积方法在其他组织类型的适用性未知 优化FFPE乳腺组织的细胞类型去卷积策略,以解决bulk RNA-seq中细胞比例变异对生物标志物识别的影响 FFPE乳腺组织样本,包括良性乳腺疾病队列 数字病理学 良性乳腺疾病 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 数字病理学 Scaden(深度学习) 基因表达数据、图像 62个样本 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1378 2026-10-06
Single-cell transcriptome reveals the heterogeneity of malignant ductal cells and the prognostic value of REG4 and SPINK1 in primary pancreatic ductal adenocarcinoma
2024, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 该研究通过对16例原发性胰腺导管腺癌和3例癌旁组织进行单细胞RNA测序分析,揭示了恶性导管细胞的异质性,并鉴定了REG4和SPINK1作为胰腺导管腺癌的预后标志物 全面描绘了胰腺导管腺癌中恶性导管细胞的异质性,将恶性细胞进一步分为五个具有特定免疫和代谢特征的亚群,并通过伪时间轨迹分析揭示了肿瘤进展过程中致癌通路的差异表达,同时发现REG4和SPINK1可作为胰腺导管腺癌的潜在治疗靶点 摘要中未明确提及研究局限性 全面描绘胰腺导管腺癌的异质性并鉴定预后靶点 16例原发性胰腺导管腺癌组织和3例癌旁组织 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 16例原发性胰腺导管腺癌组织和3例癌旁组织,共32,480个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1379 2026-10-06
Multiomics Analysis Reveals Cuproptosis-Related Signature for Evaluating Prognosis and Immunotherapy Efficacy in Colorectal Cancer
2023-Jan-06, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 通过多组学分析揭示结直肠癌中与铜死亡相关的分子亚型和预后模型,用于评估预后和免疫治疗疗效 构建了包含五个基因的铜死亡相关预后模型(CPS评分),发现CPS评分与肿瘤突变负荷、MSI-H比例、免疫检查点阻断及HLA基因表达正相关,可预测免疫治疗反应 未提及 探究铜死亡在结直肠癌肿瘤微环境重塑和抗肿瘤治疗中的作用,并构建预后评估模型 结直肠癌患者 多组学分析 结直肠癌 单细胞测序 Cox比例风险模型 基因表达数据、单细胞测序数据 未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1380 2026-10-06
A single-cell transcriptomic atlas characterizes cell types and their molecular features in yak ovarian cortex
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术构建了牦牛卵巢皮质的细胞图谱,揭示了各种细胞类型的分子特征及其细胞间通讯网络 首次构建了牦牛卵巢皮质的单细胞转录组图谱,鉴定了8种细胞类型及其特征基因,发现了4种卵母细胞亚型,并通过免疫染色验证了FST和TOP2A作为卵母细胞标记基因 摘要中未明确提及研究局限性 构建牦牛卵巢皮质的细胞图谱,阐明各种细胞类型的分子特征,为牦牛雌性生殖生物学提供细胞分子层面的见解 牦牛卵巢皮质 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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