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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2026-10-07 |
Single-cell virtual knockout network perturbation prioritizes candidate regulators of beta-cell functional failure in type 2 diabetes
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1924512
PMID:42835153
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研究论文 | 该研究结合人类胰岛单细胞RNA测序、β细胞功能状态建模、候选基因评分、scTenifoldKnk虚拟敲除网络分析及外部验证,优先筛选与2型糖尿病相关β细胞功能衰竭的调控因子 | 将无先验的全基因组筛选与独立的scTenifoldKnk网络证据分析相结合,并采用匹配表达、检测及网络强度的随机面板进行固定14基因面板的显著性检验,同时系统评估了网络规模和细胞数量对结果稳定性的影响 | 单个候选基因的证据存在差异,且没有任何一个基因在14个基因的多重校正后仍然显著;网络推断结果受细胞数量和网络数量影响较大 | 优先筛选与2型糖尿病相关β细胞功能衰竭的候选调控因子 | 人类胰岛β细胞,涵盖2型糖尿病和正常供体 | 机器学习, 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 虚拟敲除网络分析, 伪批量分析 | scTenifoldKnk, 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 文本 | 48个供体用于伪批量分析;网络规模实验每组网络包含200、500或1,000个细胞,并额外评估了2,000个细胞的设置;GSE221156包含26,164个表达基因,其中17,989个通过伪批量过滤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1342 | 2026-10-07 |
Integrated single-cell and multi-cohort analyses reveal CTCF as a key regulator of chemo-immunotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1922944
PMID:42835157
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序与多队列分析,揭示了CTCF是肺腺癌化疗免疫治疗耐药的关键调控因子,并阐明CTCF-RRM2/CD276轴连接肿瘤内在耐药与免疫逃逸 | 首次通过单细胞分析与多队列整合鉴定出稳定疾病患者中富集的耐药相关恶性上皮细胞亚群,并发现CTCF作为化疗免疫治疗耐药的关键调控因子,揭示CTCF通过直接上调RRM2和CD276分别介导化疗耐药和免疫抑制的新机制 | 未在摘要中明确说明 | 探究非小细胞肺癌化疗免疫治疗耐药的肿瘤细胞状态及分子机制 | 接受化疗免疫治疗的NSCLC患者的单细胞RNA测序数据、公共转录组队列及原位肺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1343 | 2026-10-07 |
AI-guided ethnopharmacology for cardiovascular drug discovery: from biomedical data to experimental validation
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1962508
PMID:42836037
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综述 | 本文综述了支持AI引导民族药理学的心血管药物发现的主要生物医学数据资源、计算方法,并提出了化合物优先和疾病优先两种AI引导发现框架,最后讨论了心血管疾病中的应用前景与挑战 | 提出了两种互补的AI引导发现框架:化合物优先策略预测植物药物的药理活性,疾病优先策略识别能够逆转疾病相关分子和细胞状态的天然产物,并强调AI与单细胞图谱、疾病状态预测、机制研究和实验验证的整合 | 数据标准化不足、模型鲁棒性有限、可解释性欠缺以及缺乏前瞻性验证 | 探讨如何利用AI系统性地研究植物药物,加速心血管植物药物发现,促进民族医药知识向现代精准治疗转化 | 植物药物( botanical drugs)、天然产物、民族医药知识、心血管疾病 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学、单细胞和空间转录组学 | 基础模型迁移学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1344 | 2026-10-07 |
Macrophage Membrane-Camouflaged Mesoporous Polydopamine Nanoparticles for Targeted Delivery of Apigenin in Sepsis-Induced Acute Lung Injury
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S618525
PMID:42836148
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研究论文 | 本研究开发了一种巨噬细胞膜仿生纳米递送系统MEM@MPDA/API,用于靶向递送芹菜素治疗脓毒症诱导的急性肺损伤 | 首次构建了巨噬细胞膜包覆的介孔聚多巴胺纳米颗粒负载芹菜素(MEM@MPDA/API NPs),利用巨噬细胞膜的仿生特性实现主动靶向肺部损伤区域,结合MPDA的ROS清除能力和API的抗炎作用,并通过单细胞转录组学与网络药理学整合分析揭示了线粒体自噬相关通路在ALI进展中的激活 | 摘要中未明确提及该研究的局限性,需要进一步阅读全文了解 | 开发一种巨噬细胞膜仿生纳米递送系统负载介孔聚多巴胺包裹的芹菜素,并研究其在脓毒症诱导急性肺损伤中的治疗潜力 | 脓毒症诱导急性肺损伤(ALI)小鼠模型 | 纳米医学 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学、网络药理学、纳米递送技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1345 | 2026-10-07 |
Prehabilitation during neoadjuvant chemotherapy results in an enhanced immune response in esophageal adenocarcinoma tumors: A randomized controlled trial
2025-12, Journal of sport and health science
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.jshs.2025.101063
PMID:40499717
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研究论文 | 一项随机对照试验研究新辅助化疗期间进行预康复运动训练对食管腺癌肿瘤免疫反应的影响 | 首次通过随机对照试验证明新辅助化疗期间的预康复运动训练可增加肿瘤浸润淋巴细胞频率、促进三级淋巴结构成熟,并增强免疫反应 | 样本量较小(仅22例患者),未观察到临床结局(生存、治疗耐受性、肿瘤降级)的显著差异,需要更大规模研究验证临床意义 | 确定预康复运动训练是否能增加食管癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 22例局部晚期食管癌患者 | 数字病理 | 食管癌 | 多重免疫组化,空间转录组学 | NA | 图像,文本 | 22例局部晚期食管癌患者(预康复组11例,对照组11例) | NanoString | 空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | 高分辨率多重免疫组化(mIHC)和NanoString空间转录组学分析福尔马林固定石蜡包埋肿瘤组织 |
| 1346 | 2026-10-07 |
HMGB3 promotes brain metastasis of lung adenocarcinoma by recruiting SSBP1 for nuclear translocation to remodel mitochondrial metabolism
2025-12, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70075
PMID:41194553
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研究论文 | 本研究揭示了HMGB3通过招募SSBP1进入细胞核、重塑线粒体代谢,从而促进肺腺癌脑转移的分子机制 | 首次发现HMGB3通过招募SSBP1诱导其核转位并重编程线粒体代谢,进而升高细胞质活性氧水平、下调PTEN激活PI3K-Akt通路,最终促进肺腺癌细胞增殖、迁移、侵袭及上皮-间质转化和脑转移 | 摘要中未明确说明本研究的局限性 | 确定高迁移率族蛋白框3(HMGB3)在调控肿瘤细胞代谢以促进肺腺癌进展和脑转移中的作用 | 肺腺癌细胞模型、肺腺癌原发灶和脑转移灶临床队列样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, Western blotting, 共免疫沉淀结合质谱 | NA | 图像, 文本 | 两个回顾性队列:肺腺癌原发灶队列和肺腺癌脑转移队列,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1347 | 2026-10-07 |
SUV39H2 is a vulnerability in glioblastoma stem cells enhanced by co-targeting SUV39H1
2025-12, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2568366
PMID:41047764
|
研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,并评估同时靶向SUV39H2和SUV39H1是否能更有效地破坏胶质母细胞瘤干细胞的维持 | 首次揭示SUV39H2是胶质母细胞瘤干细胞维持的新型调控因子,并提出同时靶向SUV39H2和SUV39H1的双重靶向策略可更有效破坏胶质母细胞瘤干细胞 | 未提及 | 研究SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,评估同时靶向SUV39H2和SUV39H1对胶质母细胞瘤干细胞维持的破坏效果,探索改善胶质母细胞瘤治疗的潜在策略 | 胶质母细胞瘤干细胞及非干性胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 胶质母细胞瘤, 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1348 | 2026-10-07 |
Genetic and Cellular Architecture of Breast Cancer Risk in Multi-Ancestry Studies of 159,297 Cases and 212,102 Controls
2025-Nov-07, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.20.25334075
PMID:40909829
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研究论文 | 该研究通过多祖先全基因组关联分析及单细胞数据整合,揭示了乳腺癌遗传与细胞架构 | 迄今最大规模的多祖先乳腺癌GWAS,整合多个祖先群体和Tabula Sapiens单细胞图谱,发现跨祖先共享的多基因架构和细胞类型关联 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究不同祖先群体中乳腺癌的遗传架构和细胞类型关联 | 非洲、东亚、欧洲和西班牙裔/拉丁裔人群的乳腺癌患者和对照 | 机器学习 | 乳腺癌 | GWAS, scRNA-seq | 稀疏正态混合效应模型 | 基因型数据, 单细胞RNA测序数据 | 159,297例病例和212,102例对照 | NA | bulk GWAS, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1349 | 2026-10-07 |
CD24 is a promising immunotherapeutic target for enhancing efficacy of third-generation EGFR-TKIs on EGFR-mutated lung cancer
2025-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70068
PMID:41084191
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研究论文 | 该研究通过RNA测序、单细胞RNA测序及功能实验,发现CD24在EGFR突变肺腺癌中经三代EGFR-TKI治疗后表达升高,促进肿瘤增殖并逃避巨噬细胞吞噬,靶向CD24(敲除或ATG-031抗体)可显著增强EGFR-TKI疗效 | 首次将CD24确定为增强三代EGFR-TKI疗效的免疫治疗靶点,揭示YY1 S247磷酸化驱动CD24上调及启动子-增强子环形成的分子机制,并验证first-in-class CD24抗体ATG-031的协同抗肿瘤效果 | 摘要未提及具体局限性,可能包括临床样本量有限、动物模型与人体肿瘤微环境差异、ATG-031的临床安全性及有效性尚需进一步验证 | 探究CD24作为转化免疫治疗靶点以增强三代EGFR-TKI对EGFR突变肺癌疗效的可行性及分子机制 | EGFR突变肺癌细胞系(药物响应、药物耐受持续、耐药细胞)、29例肺癌标本的单细胞RNA-seq数据、TKI治疗后临床残余肿瘤样本、异种移植瘤及EGFRL858R·T790M驱动的自发性肺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 免疫组织化学, CRISPR/Cas9, DNA亲和沉淀, ChIP-seq, 荧光素酶报告实验, 免疫共沉淀, 质谱, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 图像, 文本 | 29例肺癌标本的单细胞RNA-seq数据,以及若干细胞系、异种移植瘤和自发性肺癌小鼠模型,临床残余肿瘤样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1350 | 2026-10-07 |
Fat talks first: how adipose tissue sets the pace of aging?
2025-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnaf028
PMID:41089666
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综述 | 本文综述了脂肪组织作为内分泌器官在调控系统性衰老中的关键作用,探讨其随年龄发生的重塑过程及相关治疗机会 | 从单细胞和空间转录组学的新视角,揭示脂肪祖细胞、免疫细胞和衰老细胞在驱动局部功能障碍和系统性衰退中的关键作用,提出脂肪组织既是衰老的早期感受器又是驱动因素的双重角色 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,缺乏对具体分子机制的深入验证 | 探讨脂肪组织如何作为衰老的早期感受器和驱动因素,并讨论靶向脂肪功能障碍以促进健康衰老的治疗机会 | 脂肪组织及其随年龄发生的重塑过程,包括脂肪分布改变、内脏脂肪扩张、产热功能受损和慢性低度炎症 | 机器学习 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1351 | 2026-10-07 |
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70045
PMID:40540648
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研究论文 | 本文研究了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3激活FAK/ERK通路调控胰腺导管腺癌肿瘤进展和免疫微环境的机制 | 首次揭示NAT10在胰腺导管腺癌中通过N4-乙酰化修饰LAMB3 mRNA增强其稳定性,进而激活FAK/ERK通路促进肿瘤进展和免疫抑制微环境形成的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明NAT10在胰腺导管腺癌肿瘤恶性程度和肿瘤微环境中的作用及机制 | 胰腺导管腺癌组织、细胞系及小鼠模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 乙酰化RNA免疫沉淀、定量聚合酶链反应、RNA免疫沉淀、Western blotting、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、流式细胞术、生物信息学分析 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1352 | 2026-10-07 |
Duchenne Muscular Dystrophy Patient iPSCs-Derived Skeletal Muscle Organoids Exhibit a Developmental Delay in Myogenic Progenitor Maturation
2025-07-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14131033
PMID:40643552
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研究论文 | 本研究利用三名DMD患者来源的iPSC构建3D骨骼肌类器官,并通过单细胞RNA测序分析其肌源性祖细胞的发育状态 | 首次使用DMD患者iPSC来源的3D骨骼肌类器官系统研究肌源性祖细胞成熟,结合scRNA-seq和人类肌源性参考图谱揭示DMD类器官肌源性祖细胞发育延迟及FAPs激活 | 样本量有限(仅3个DMD患者iPSC系和2个健康对照),且健康对照为非等基因,可能影响比较的准确性 | 研究DMD患者骨骼肌再生的细胞机制,特别是肌源性祖细胞的成熟和发育状态,并建立体外疾病模型 | DMD患者来源的iPSC系及健康对照iPSC系构建的3D骨骼肌类器官 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本数据 | 3个DMD患者iPSC系和2个健康对照iPSC系的骨骼肌类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1353 | 2026-10-07 |
Immunosuppressive JAG2+ tumor-associated neutrophils hamper PD-1 blockade response in ovarian cancer by mediating the differentiation of effector regulatory T cells
2025-07, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70021
PMID:40120139
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研究论文 | 本研究揭示了JAG2+肿瘤相关中性粒细胞通过Notch信号通路促进效应性调节性T细胞分化,从而导致高级别浆液性卵巢癌免疫抑制和对PD-1阻断治疗耐药的机制 | 首次阐明JAG2+ TANs通过Notch信号通路介导naïve CD4+ T细胞向eTregs分化,从而促进免疫逃逸和抗PD-1治疗耐药的具体机制,并提出靶向Notch信号或JAG2中和抗体可克服耐药 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明JAG2+ TANs在高级别浆液性卵巢癌肿瘤免疫抑制微环境中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本、患者来源肿瘤类器官、荷瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多重免疫组化,流式细胞术,单细胞RNA测序,体外共培养 | NA | 图像,文本 | 274例HGSOC样本(训练队列和验证队列)及30例用于建立PDTOs的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1354 | 2026-10-07 |
Blocking ITGA5 potentiates the efficacy of anti-PD-1 therapy on glioblastoma by remodeling tumor-associated macrophages
2025-06, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70016
PMID:40084746
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研究论文 | 该研究通过分析接受抗PD-1治疗的胶质母细胞瘤组织的单细胞RNA测序和空间转录组数据,揭示了circSDHAF2通过稳定ITGA5蛋白促进MES-GBM细胞和SPP1+巨噬细胞相互作用环路形成,从而驱动抗PD-1治疗耐药的机制,并证明阻断ITGA5可增强抗PD-1治疗效果 | 首次发现circSDHAF2通过N-糖基化稳定ITGA5蛋白促进MES-GBM细胞形成,并通过外泌体将ITGA5递送至髓系来源巨噬细胞诱导SPP1+ MDMs形成,进而通过SPP1-ITGA5通路维持MES-GBM状态并诱导T细胞功能障碍,揭示了MES-GBM细胞、MDMs和T细胞之间的空间特异性适应性免疫抑制微环境环路 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析驱动胶质母细胞瘤抗PD-1治疗耐药的特异性免疫抑制亚群的分子机制,设计更有效的胶质母细胞瘤免疫治疗方案 | 胶质母细胞瘤组织中的MES-GBM细胞、SPP1+髓系来源巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 共免疫沉淀, RNA免疫沉淀, pull-down实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1355 | 2026-10-07 |
Spatial transcriptomics identifies novel Pseudomonas aeruginosa virulence factors
2025-Mar-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100805
PMID:40081336
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研究论文 | 本研究利用双重空间转录组学技术,在小鼠眼部感染模型中同时捕获铜绿假单胞菌基因和宿主转录组的表达,揭示了感染角膜中病原体和宿主特异性基因表达模式,并构建了预测性岭回归模型 | 首次采用双重空间转录组学方法同时捕获细菌和宿主转录组,构建了感染的统一转录图谱;发现了新型毒力介质PA2590;开发了基于感染组织图像的岭回归预测模型,预测细菌载量分布的R值为0.923 | 研究基于小鼠眼部感染模型,结果是否适用于人类感染尚需进一步验证;预测模型的泛化能力有待在更多数据集上评估 | 研究宿主-病原体相互作用,揭示铜绿假单胞菌感染过程中的基因表达模式并发现新型毒力因子 | 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)和小鼠眼部感染模型 | 空间转录组学 | 眼部感染 | 空间转录组学 | 岭回归 | 图像和转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1356 | 2026-10-07 |
E3 ubiquitin ligase RNF128 promotes Lys63-linked polyubiquitination on SRB1 in macrophages and aggravates atherosclerosis
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57404-6
PMID:40038329
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研究论文 | 该研究发现E3泛素连接酶RNF128在巨噬细胞中特异性表达,并通过催化SRB1的Lys63连接多聚泛素化促进泡沫细胞形成和动脉粥样硬化 | 首次揭示RNF128在动脉粥样硬化中的作用,发现RNF128通过催化SRB1的K63连接多聚泛素化(K478位点)促进SRB1从内体循环回细胞膜而非进入溶酶体降解,从而促进泡沫细胞形成 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究RNF128在动脉粥样硬化中的作用及其分子机制 | 巨噬细胞、动脉粥样硬化小鼠模型(ApoE和LDLR缺陷背景) | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1357 | 2026-10-07 |
Radiotherapy-resistant prostate cancer cells escape immune checkpoint blockade through the senescence-related ataxia telangiectasia and Rad3-related protein
2025-03, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12636
PMID:39698847
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析放疗后前列腺癌细胞的衰老状态,揭示胞质ATR通过磷酸化CD86增强其与E3连接酶MARCH1的相互作用,从而逃逸CTLA-4免疫检查点阻断 | 首次发现胞质ATR通过磷酸化CD86胞质域,增强CD86与E3连接酶MARCH1的静电吸引相互作用,介导放疗抵抗性前列腺癌细胞逃逸免疫检查点阻断 | 研究主要基于LNCaP细胞系和异种移植小鼠模型,临床样本验证有限,需进一步在更多临床队列中验证胞质ATR作为治疗靶点的可行性 | 分离和表征放疗后前列腺癌的异质性肿瘤亚群,阐明其抵抗免疫检查点阻断的分子机制 | 放疗后的前列腺癌细胞(LNCaP细胞系)、临床前列腺癌患者样本、异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫共沉淀、突变诱变、Western blotting | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1358 | 2026-10-07 |
The sentinels of coronary artery disease: heterogeneous monocytes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1428978
PMID:40079002
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综述 | 本文综述了冠状动脉疾病中单核细胞异质性的研究进展,重点关注单核细胞亚群数量、比例及功能受体表达的变化及其与临床特征的相关性 | 系统总结了CAD中单核细胞异质性的多样性及复杂性,提出了提高单核细胞异质性临床应用价值的策略,并指出了未来研究方向 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对单核细胞异质性的具体分子机制探讨可能不够深入 | 探讨冠状动脉疾病中单核细胞异质性的特征及其临床意义,提出提高其临床应用价值的策略 | 冠状动脉疾病患者中的异质性单核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 高参数流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1359 | 2026-10-07 |
Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses revealed potential key genes and the role of CCL19/CCL21-CCR7 axis in hidradenitis suppurativa
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322565
PMID:40455785
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研究论文 | 该研究通过整合批量和单细胞RNA测序分析,结合三种机器学习方法,识别了化脓性汗腺炎(HS)的潜在关键基因,并揭示了CCL19/CCL21-CCR7轴在HS发病机制中的作用 | 首次通过整合批量和单细胞RNA测序分析,结合三种机器学习方法识别HS的枢纽基因,并揭示CCL19/CCL21-CCR7轴在HS发病中的潜在作用,特别是CCL19和CCL21可能来源于成纤维细胞和树突状细胞,参与招募CCR7相关免疫细胞(尤其是Treg细胞) | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别化脓性汗腺炎(HS)的关键基因表达模式、枢纽基因,并分析CCL19/CCL21-CCR7轴在HS皮损和外周血中的潜在作用 | 化脓性汗腺炎(HS)患者的皮损组织及外周血样本 | 机器学习 | 化脓性汗腺炎 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(转录组数据) | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1360 | 2026-10-07 |
Rates of evolution differ between cell types identified by single-cell RNAseq in threespine stickleback
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.06.627160
PMID:39713298
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序与进化基因组学,分析三刺鱼不同细胞类型特征基因的进化速率差异 | 首次将scRNAseq与群体基因组数据结合,揭示免疫细胞类型特征基因进化更快 | 仅基于三刺鱼一种物种,细胞类型覆盖可能有限,未验证其他物种的普适性 | 探究不同细胞类型的特征基因是否具有不同的进化速率 | 三刺鱼(threespine stickleback)的多种细胞类型 | 单细胞转录组学、进化基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、群体基因组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、群体基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |