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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2026-01-12 |
Comprehensive bulk and single-cell RNA sequencing uncovers senescence-associated biomarkers in therapeutic mesenchymal stem cells
2025-Dec-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30633-x
PMID:41326705
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研究论文 | 本研究通过结合形态学、分子和转录组学分析,深入表征了犬间充质干细胞在衰老过程中的变化,并利用bulk和单细胞RNA测序发现了衰老相关的生物标志物 | 首次在犬模型中系统结合bulk和单细胞RNA测序技术研究间充质干细胞的衰老过程,揭示了衰老亚群的异质性分布并发现了新的潜在衰老标志基因 | 研究仅基于体外传代模型,未在体内验证衰老标志物的临床相关性;样本量相对有限 | 探究间充质干细胞衰老的分子机制并识别衰老相关的生物标志物,以提高细胞治疗的质量控制 | 犬间充质干细胞(早期传代P2和晚期传代P6) | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, SA-β-半乳糖苷酶染色, 细胞周期分析 | NA | RNA测序数据, 形态学数据 | 早期传代(P2)和晚期传代(P6)犬间充质干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1342 | 2026-01-12 |
Single-Cell Sequencing of a Bile Sample From an Acute Cholecystitis Patient
2025-Dec, Cureus
DOI:10.7759/cureus.98748
PMID:41510448
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析急性胆囊炎患者的胆汁样本,探索细菌感染 | 首次应用单细胞扩增基因组测序技术于急性胆囊炎患者的胆汁样本,提供细菌感染的新颖基因组信息 | 单细胞测序的基因组覆盖度较低(9.45-42.88%),与传统全基因组测序相比存在序列缺口 | 评估单细胞测序技术在临床细菌感染样本中的应用潜力 | 急性胆囊炎患者的胆汁样本及其中的细菌 | 微生物基因组学 | 急性胆囊炎 | 单细胞扩增基因组测序,16S宏基因组分析 | NA | 基因组序列数据 | 1例患者的胆汁样本,从中分离出4个细菌菌落 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | NA |
| 1343 | 2026-01-12 |
High expression of Fgr in the left ventricle attenuates myocardial injury in the infarcted region via regulating the phosphorylation level of PI3K/Akt
2025-Oct-13, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20253737
PMID:41004172
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研究论文 | 本研究探讨了Fgr基因在急性心肌梗死中的表达及其通过调节PI3K/Akt磷酸化水平发挥心脏保护作用的机制 | 首次揭示了Fgr在急性心肌梗死中的心脏保护作用,并通过多组学数据分析和体内外实验验证了其通过PI3K/Akt信号通路发挥作用的机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在临床患者中进行验证;Fgr的具体调控机制和下游效应分子仍需进一步探索 | 探究Fgr在急性心肌梗死中的表达变化及其对心肌损伤的保护作用机制 | 大鼠左前降支冠状动脉结扎模型、H9C2心肌细胞、人类空间转录组学和单核RNA测序数据 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组范围关联研究、bulk-RNA测序、空间转录组学、单核RNA测序、siRNA敲低、药理学抑制 | 动物疾病模型、细胞缺氧缺糖模型 | 基因表达数据、测序数据、功能实验数据 | 大鼠模型、H9C2细胞系、人类测序数据集 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1344 | 2026-01-12 |
Biology as vulnerability in follicular lymphoma: genetics, epigenetics, and immunogenetics
2025-Oct-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026020
PMID:40089999
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综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤的遗传学、表观遗传学和免疫遗传学特征,探讨了其生物学脆弱性及潜在治疗策略 | 整合了高通量测序、空间转录组学和成像技术的最新发现,揭示了滤泡性淋巴瘤的遗传、表观遗传和免疫遗传基础,并提出了针对癌症前体细胞的靶向治疗新思路 | 未涉及具体实验数据或临床研究,主要基于现有文献综述,缺乏原创性实证研究 | 深入理解滤泡性淋巴瘤的生物学特性,识别治疗脆弱性,以改善患者预后 | 滤泡性淋巴瘤及其肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 高通量测序、空间转录组学、成像技术 | NA | 遗传、表观遗传、免疫遗传数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1345 | 2026-01-12 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析,揭示了AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征 | 首次在治疗初治的AL淀粉样变性患者中应用5'单细胞RNA测序,系统描述了克隆性浆细胞的转录特征及其骨髓微环境的改变,并识别出与蛋白质稳态相关的基因表达变化 | 研究样本量有限,且为横断面研究,未能评估治疗反应或疾病进展的动态变化 | 阐明AL淀粉样变性中克隆性浆细胞的功能特性及其骨髓微环境的特征 | 新诊断、未治疗的AL淀粉样变性患者及健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5'单细胞RNA测序,定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 新诊断的AL淀粉样变性患者和健康受试者(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5'单细胞RNA测序 |
| 1346 | 2026-01-12 |
Exploring Intratumoral Heterogeneity in Mixed Neuroendocrine-Nonneuroendocrine Neoplasms with Spatial Transcriptomics: Even More Diverse Than Anticipated
2025-Aug-20, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09869-w
PMID:40833530
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和成分特异性测序技术,探索混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤的瘤内异质性,揭示其遗传和转录组特征 | 首次结合空间转录组学和成分特异性测序,在混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤中揭示形态学相似区域内的转录组亚群,并关联化疗反应预测 | 研究仅基于三个病例,样本量有限,且未涉及长期临床随访数据 | 探究混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤的瘤内异质性及其生物学基础 | 三个来自不同解剖部位(回盲部、卵巢、胃)的混合腺癌-神经内分泌癌病例 | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学,成分特异性下一代测序,基因集富集分析 | NA | 空间转录组数据,基因组数据 | 三个病例 | NA | 空间转录组学,下一代测序 | NA | NA |
| 1347 | 2026-01-12 |
Spatial Transcriptomics in Lung Cancer and Pulmonary Diseases: A Comprehensive Review
2025-Jun-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17121912
PMID:40563563
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综述 | 本文全面综述了空间转录组学在肺癌及其他肺部疾病研究中的应用与进展 | 系统总结了空间转录组学如何揭示传统测序方法无法捕获的肺部组织空间基因表达模式、局部免疫微环境、疾病相关转录“热点”以及药物在组织内的作用位点信息 | 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或分析方法,主要基于现有文献进行归纳总结 | 阐述空间转录组学技术在呼吸系统疾病研究中的新兴作用及其临床应用潜力 | 肺癌、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、特发性肺纤维化等肺部疾病 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1348 | 2026-01-12 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序方法,在慢性移植物抗宿主病(cGVHD)小鼠模型中定义了IL-17和CSF-1的基因表达特征,并验证了这些特征在患者中的可检测性 | 利用单细胞测序技术在小鼠血液单核细胞中定义了非直观的IL-17和CSF-1基因表达特征,并首次在cGVHD患者中验证了这些特征的临床相关性 | 研究基于小鼠模型推导特征,在患者中的验证样本量有限,且特征仅在70%诊断时和50%后续发病患者中检测到,可能存在假阴性 | 开发用于识别cGVHD患者中可药物靶向的免疫失调的生物标志物,以指导个体化治疗选择 | 慢性移植物抗宿主病(cGVHD)的小鼠模型和患者样本 | 单细胞测序 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,但涉及小鼠模型和患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1349 | 2026-01-11 |
Insulin production is sustained during DNA damage-mediated senescence in adult human beta cells
2026-Feb, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06603-3
PMID:41231256
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研究论文 | 本研究探讨了DNA损伤介导的衰老对成人人类β细胞胰岛素产生的影响 | 首次研究了衰老是否破坏人类β细胞中的胰岛素产生,并发现胰岛素产生在DNA损伤相关衰老中得以维持 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本,可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究1型糖尿病中残留β细胞胰岛素产生减少的机制,特别是DNA损伤相关衰老的作用 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5人类β细胞模型、胰腺组织样本 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | Western blot、ELISA、流式细胞术、FACS、免疫荧光染色、蛋白质组学分析、单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质表达数据、RNA-seq数据、图像数据 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5细胞系、公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 1350 | 2026-01-11 |
Modelling the effects of human SUR1 R1420H variation on insulin secretory function using isogenic iPSC-derived pancreatic islets
2026-Feb, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06605-1
PMID:41291239
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9技术构建了携带SUR1 R1420H变异的等基因iPSC衍生的胰腺胰岛模型,以探究该变异对胰岛素分泌功能的影响及其与2型糖尿病风险的关联 | 首次利用等基因iPSC衍生的胰腺胰岛模型,系统研究了SUR1 R1420H变异在纯合和杂合状态下对胰岛素分泌的动态影响,并揭示了该变异导致KATP通道功能丧失的机制 | 研究仅基于两个亲本iPSC系衍生的细胞模型,样本量有限,且模型可能无法完全模拟体内胰岛的复杂微环境 | 探究SUR1 R1420H变异是否导致KATP通道功能丧失,并分析该变异在发育不同阶段对胰岛素分泌的时序性影响 | 携带SUR1 R1420H变异的等基因iPSC衍生的胰腺胰岛(SC-islets),包括未成熟(类似胎儿胰岛)和成熟(类似成人胰岛)阶段 | 干细胞与疾病建模 | 2型糖尿病 | CRISPR-Cas9基因编辑,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | iPSC衍生的胰腺胰岛模型 | 基因表达数据,胰岛素分泌功能数据 | 基于两个亲本iPSC系(IS1和IS2)构建的三种基因型(SUR1 1420RR,1420RH,1420HH)的等基因细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1351 | 2026-01-11 |
Mouse digit AAV gene delivery into fibroblasts regulates regenerative outcome
2026-Jan-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0229
PMID:41499500
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研究论文 | 本研究通过比较小鼠再生与非再生趾尖的单细胞RNA测序分析,识别与纤维化和再生相关的成纤维细胞亚群及基因,并利用AAV基因递送技术验证候选基因对伤口愈合结果的影响 | 开发了一种针对趾成纤维细胞的稳健AAV基因递送技术,结合单细胞RNA测序计算分析,为识别哺乳动物趾部纤维化和再生的驱动因素提供了新框架 | NA | 探究小鼠趾尖再生与纤维化的分子机制,并测试候选基因改变伤口愈合结果的能力 | 小鼠趾尖的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 组织再生与纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1352 | 2026-01-11 |
Transcriptomic disruption and hypoactivity in DYT-SGCE medial ganglionic eminence-patterned inhibitory neurons
2026-Jan-08, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf272
PMID:40711998
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研究论文 | 本研究探讨SGCE基因突变对内侧神经节隆起来源的抑制性GABA能神经元的影响,揭示了转录组失调和神经元活动降低的现象 | 首次在患者来源的诱导多能干细胞和基因编辑胚胎干细胞模型中,系统评估SGCE突变对抑制性神经元的影响,结合单细胞RNA测序和功能分析,揭示了神经元结构和功能的异常 | 研究基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经环路环境,且样本量有限 | 探究SGCE基因突变如何导致肌阵挛性肌张力障碍的神经病理机制,特别是抑制性神经元的功能异常 | 内侧神经节隆起来源的抑制性GABA能神经元 | 神经科学 | 肌阵挛性肌张力障碍 | 单细胞RNA测序, Ca2+成像, 多电极阵列, 单细胞膜片钳 | NA | 转录组数据, 电生理数据, 形态学数据 | 使用患者来源的诱导多能干细胞和基因编辑胚胎干细胞系,与同基因野生型对照进行比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1353 | 2026-01-11 |
Modeling human embryo implantation in vitro
2026-Jan-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.10.027
PMID:41443191
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研究论文 | 本文建立了一种体外模型,模拟了人类胚胎植入子宫内膜的过程,并揭示了植入后早期发育的关键特征 | 开发了一种体外模型,能够模拟人类子宫内膜的腔上皮、腺体和基质区室,支持人类胚胎和类囊胚的植入,并首次在单细胞水平上揭示了胚胎-子宫内膜界面的分子相互作用 | 模型可能无法完全复制体内环境的复杂性,且研究仅基于体外实验,长期发育影响未知 | 研究人类胚胎植入子宫内膜的早期阶段,以理解妊娠起始和失败机制 | 人类胚胎、类囊胚和子宫内膜模型 | 发育生物学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序 | 体外模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及人类胚胎和子宫内膜模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1354 | 2026-01-11 |
Role of CD5 signalling for pro-inflammatory Th17 response in multiple sclerosis
2026-Jan-08, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf268
PMID:40853926
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研究论文 | 本研究探讨了表面分子CD5及其细胞内相互作用伙伴酪蛋白激酶2(CK2)在人类Th17效应功能中的作用,以及它们在多发性硬化症中的角色 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析揭示了CD5-CK2-STAT3信号轴在人类Th17细胞炎症反应中的关键作用,并发现CD5表达与多发性硬化症中的炎症免疫谱相关 | 研究主要基于体外实验和相关性分析,未进行体内验证或临床试验 | 理解CD5和CK2在人类Th17细胞效应功能及多发性硬化症中的作用 | 多发性硬化症患者和非炎症性神经系统疾病患者的脑脊液、血清样本,以及分化为Th17极化表型的CD4+记忆T细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、邻近延伸分析(PEA)蛋白质组学、功能研究 | NA | RNA序列数据、蛋白质组数据 | 114名多发性硬化症患者的血清和脑脊液样本,以及脑脊液单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1355 | 2026-01-11 |
The gain-of-function TREM2-T96K mutation increases risk for Alzheimer's disease by impairing microglial function
2026-Jan-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.032
PMID:41109213
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研究论文 | 本文探讨了TREM2-T96K功能获得性突变通过损害小胶质细胞功能增加阿尔茨海默病风险的机制 | 首次揭示TREM2-T96K突变以性别依赖方式损害小胶质细胞功能,并影响其向疾病相关小胶质细胞的转变 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养,人类样本验证有限,且性别差异机制未完全阐明 | 探究TREM2-T96K突变在阿尔茨海默病发病中的作用机制 | TREM2-T96K突变、小胶质细胞、β-淀粉样蛋白斑块、5xFAD小鼠模型、人类小胶质细胞培养物 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 家族性和病例对照样本的全基因组测序数据集、5xFAD小鼠模型、人类小胶质细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1356 | 2026-01-11 |
BST2 expression at astrocyte borders promotes microglial recruitment via the C3/C3aR signaling
2026-Jan-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.038
PMID:41138733
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学,揭示了在脑损伤边界富集的表达BST2的星形胶质细胞通过C3/C3aR信号通路促进小胶质细胞招募,并探讨了其作为卒中后早期脑损伤治疗靶点的潜力 | 首次发现BST2在损伤边界星形胶质细胞中的表达及其通过PKCβII磷酸化增强C3表达,从而调控星形胶质细胞-小胶质细胞相互作用和边界形成 | 未明确BST2在其他中枢神经系统损伤模型中的作用,且治疗性抗体的长期效果和安全性需进一步验证 | 探究脑损伤后星形胶质细胞边界形成的分子机制及其与免疫细胞的相互作用 | 脑损伤模型中的星形胶质细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 卒中 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1357 | 2026-01-11 |
Pathogenic role of IFNγ from activated CD4+ T cells in lupus model mice induced by topical treatment with toll-like receptor agonist imiquimod
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxaf079
PMID:41414870
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研究论文 | 本研究通过局部应用TLR7激动剂咪喹莫特诱导狼疮模型小鼠,揭示了活化的CD4+ T细胞产生的IFNγ在驱动B细胞分化和促进自身抗体产生中的关键致病作用 | 首次在咪喹莫特诱导的狼疮模型中,结合单细胞RNA测序技术,系统阐明了活化的CD4+ T细胞来源的IFNγ通过促进B细胞分化和自身抗体产生而发挥的关键致病作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类系统性红斑狼疮的直接转化需进一步验证 | 阐明活化的CD4+ T细胞在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 野生型和IFNγ缺陷型小鼠 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 野生型和IFNγ缺陷型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1358 | 2026-01-11 |
Microenvironment-aware spatial modeling for accurate inference of cell identity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1477
PMID:41495904
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研究论文 | 本文提出了一种名为MEcell的无参数方法,通过整合空间上下文信息来改进细胞身份推断,并在多个空间转录组学平台和组织类型的数据集上验证了其优越性 | MEcell方法首次明确整合空间微环境信息,自动调整其对细胞身份建模的贡献,弥补了传统单细胞聚类方法仅依赖内在分子特征的不足 | NA | 开发一种能够准确推断细胞身份的空间建模方法,以更好地理解细胞在组织中的空间异质性 | 空间转录组学数据中的细胞身份推断 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | MEcell | 空间转录组学数据 | 90个模拟数据集和7个真实数据集,涵盖多种组织类型 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString, 10x Genomics, Broad Institute, 开放平台 | 空间转录组学 | MERFISH, Xenium, CosMx, Visium HD, Slide-seqV2, open-ST | MERFISH/Vizgen, Xenium, CosMx, Visium HD, Slide-seqV2, open-ST |
| 1359 | 2026-01-11 |
Illustrating the functional heterogeneity of M-MDSCs to predict sepsis outcomes
2026-Jan-03, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.008
PMID:41490841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症中单核髓源性抑制细胞的功能异质性,并识别了新的功能标志物以预测疾病预后 | 首次在脓毒症中基于单细胞RNA测序将M-MDSCs细分为五个功能亚群,并发现VSIG4作为免疫抑制M-MDSCs的新型功能标志物 | 研究样本量有限,且为初步结果,需要更大规模的验证 | 探究脓毒症中单核髓源性抑制细胞的功能异质性及其在疾病预后预测中的作用 | 脓毒症患者的HLA-DRhighCD14+和HLA-DRlowCD14+单核细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及脓毒症患者的单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1360 | 2026-01-11 |
SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf659
PMID:41390915
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SpatialRNA的Python软件包,用于在单分子空间转录组学数据集上轻松应用图神经网络模型 | 开发了一个高度可扩展的工具,能够从组织样本中轻松生成(子)图,并提供了全面的教程,便于在PyG框架下便捷高效地应用GNN模型 | NA | 旨在促进图神经网络模型在单分子空间转录组学数据中的应用,以识别空间域或生态位 | 单分子空间转录组学数据集中的RNA分子图 | 空间转录组学 | NA | 单分子空间转录组学 | 图神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 单分子空间转录组学 | NA | NA |