单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 13221 - 13240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13221 | 2024-08-04 |
[Exploring the Role of PCDHGB4 in the Occurrence of Lung Squamous Cell Carcinoma Based on Bioinformatics Analysis]
2024-Mar-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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研究论文 | 本研究探讨了PCDHGB4在肺鳞癌发生中的作用及其潜在的预后价值 | 首次系统分析了PCDHGB4在肺鳞癌中的表达特征及其与肿瘤免疫和预后的关联 | 目前数据主要来源于单一数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究PCDHGB4在肺鳞癌发展中的作用及其预后潜力 | 主要研究对象为肺鳞癌患者中PCDHGB4的表达和相关临床特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 通过TCGA等数据库分析了大量肺鳞癌样本 |
| 13222 | 2024-08-07 |
Advanced patient-specific microglia cell models for pre-clinical studies in Alzheimer's disease
2024-Feb-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03037-3
PMID:38365833
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于Matrigel的三维单层培养和与神经胶质细胞共培养的单核细胞衍生的微胶质样细胞（MDMi）模型，用于阿尔茨海默病（AD）的临床前研究 | 本研究首次开发了一种生理相关且具有AD患者特异性的三维微胶质细胞模型，该模型能够更好地模拟人微胶质的形态和功能 | 本研究仅在体外模型中进行了实验，尚未在动物模型或临床试验中验证其有效性 | 开发一种新型的、生理相关的AD患者特异性微胶质细胞模型，以改进AD个性化药物开发策略 | 单核细胞衍生的微胶质样细胞（MDMi）及其在AD中的应用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 3D细胞培养模型 | 细胞 | 十六名AD患者及匹配的健康对照 |
| 13223 | 2024-08-04 |
Comprehending the cuproptosis and cancer-immunity cycle network: delving into the immune landscape and its predictive role in breast cancer immunotherapy responses and clinical endpoints
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1344023
PMID:38312844
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研究论文 | 本研究探索了cuproptosis与乳腺癌免疫反应和预后结果之间的关系 | 提出了基于cuproptosis-CICs的影响因素，并建立了预测模型以个性化乳腺癌治疗 | 缺乏临床试验结果来进一步验证模型的实际应用效果 | 探讨cuproptosis-CIC网络对乳腺癌患者免疫反应和预后结果的影响 | 使用TCGA、GEO及ICGC数据对乳腺癌患者进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, LASSO-Cox模型 | Cox比例风险回归模型 | 基因组数据 | 研究中使用了TCGA、GEO和ICGC数据，样本数量NA |
| 13224 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms of pancreatic cancer liver metastasis: the role of PAK2
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347683
PMID:38343537
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研究论文 | 本研究深入探讨了胰腺癌肝转移的分子机制，强调了PAK2的作用。 | 发现PAK2作为胰腺癌肝转移的关键基因，并揭示其通过激活TGF-β信号通路促进转移。 | 本研究的局限性在于主要依赖于生物信息学分析，缺乏大规模临床验证。 | 研究胰腺癌肝转移的机制，以为未来治疗方法和药物的发展提供科学依据。 | 研究对象为胰腺癌细胞及其肝转移相关基因。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 批量数据分析, 药物敏感性分析 | 无特定模型 | 基因表达数据 | 多个数据集(GSE155698, GSE154778, GSE71729, GSE19279, TCGA-PAAD) |
| 13225 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics and heterogeneity of lymph node immune cells during acute and chronic viral infections
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1341985
PMID:38352870
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、scTCR-seq和scBCR-seq技术，探讨了急性与慢性病毒感染下淋巴结CD45+免疫细胞的动态变化和异质性 | 首次在单细胞水平上全面比较了急性与慢性病毒感染下淋巴组织免疫细胞的差异 | NA | 探索急性与慢性病毒感染下免疫反应的景观 | 淋巴结CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行急性（LCMV Armstrong）和慢性（LCMV clone 13）病毒感染的研究 |
| 13226 | 2024-08-07 |
Comparison of the single-cell and single-nucleus hepatic myeloid landscape within decompensated cirrhosis patients
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1346520
PMID:38380322
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，对比了失代偿期肝硬化患者经颈静脉肝穿刺（TJB）获取的肝组织中的肝髓系细胞景观。 | 首次通过单核转录组测序技术，有效克服了临床标本采集的复杂性，并能够充分分析所有主要的肝细胞类型，包括所有髓系细胞亚群。 | scRNA-seq平台未能恢复足够的枯否细胞数量，且其他单核细胞/巨噬细胞表现出应激相关参数的高表达。 | 旨在通过比较单细胞和单核RNA测序技术，全面理解失代偿期肝硬化患者的肝髓系细胞景观。 | 失代偿期肝硬化患者的肝组织中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | 3名失代偿期肝硬化患者的肝组织样本 |
| 13227 | 2024-08-07 |
Prognostic stratification of sepsis through DNA damage response based RiskScore system: insights from single-cell RNA-sequencing and transcriptomic profiling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1345321
PMID:38404591
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研究论文 | 本研究通过基于DNA损伤反应（DDR）的风险评分系统，利用单细胞RNA测序和转录组分析，对脓毒症进行预后分层 | 开发了一种基于DNA损伤反应的新型风险评分系统，用于提高脓毒症预后预测的准确性，并可能指导更有效的治疗方案的创建 | NA | 旨在通过基于DNA损伤反应的风险评分系统，提高脓毒症预后预测的准确性，并探索个性化治疗策略 | 脓毒症患者的预后分层和治疗策略 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 转录组数据 | 涉及多种细胞亚型，包括单核细胞、巨核细胞、CD4+ T细胞和中性粒细胞 |
| 13228 | 2024-08-07 |
Multiplexed evaluation of mouse wound tissue using oligonucleotide barcoding with single-cell RNA sequencing
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101946
PMID:36525348
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸条形码标记和混合多个愈合伤口样本的单细胞RNA测序协议 | 提出了使用寡核苷酸条形码技术降低单细胞RNA测序成本的方法 | 目前仅适用于小鼠，但可扩展到其他物种如大鼠、猪和人类 | 开发一种成本效益高的方法来研究复杂组织的单细胞RNA测序 | 愈合伤口组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个样本 |
| 13229 | 2024-08-07 |
Editorial: Spatial single-cell sequencing in studying solid cancer development
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1342989
PMID:38149241
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13230 | 2024-08-07 |
Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100465
PMID:38586548
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research paper | 本文探讨了单细胞技术在解析环境暴露对生殖细胞跨代影响的现状与应用 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学方法，深入理解毒物对生殖细胞功能的影响及其在不同组织和细胞类型中的差异响应 | NA | 探讨单细胞技术在生殖毒理学研究中的应用，并展示其在不同模型生物和环境暴露中的价值 | 生殖细胞及其对环境暴露的响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 13231 | 2024-08-04 |
Ablation of Brg1 in fibroblast/myofibroblast lineages attenuates renal fibrosis in mice with diabetic nephropathy
2024-May-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122578
PMID:38537899
|
研究论文 | 本研究探讨了Brg1在糖尿病肾病小鼠中对肾纤维化的影响 | 提供了Brg1与成纤维细胞-肌成纤维细胞转化之间的新遗传联系 | 尚未明确与Brg1相关的所有表观遗传机制 | 探讨Brg1在糖尿病肾病相关肾纤维化中的作用 | C57B6/j小鼠中的成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 定量PCR和西方印迹 | NA | 基因表达数据 | C57B6/j小鼠的样本数量未明确提及 |
| 13232 | 2024-08-05 |
Role of crosstalk between synovial cells and chondrocytes in osteoarthritis (Review)
2024-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2024.12490
PMID:38590580
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综述 | 本文全面探讨了滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用及其机制 | 本综述更新了单细胞测序技术在研究滑膜与软骨细胞相互作用中的应用 | 未提及特定实验数据或临床试验的应用 | 阐明滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用机制 | 滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 组织学与病理学数据 | NA |
| 13233 | 2024-08-07 |
Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases
2024-May, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106463
PMID:38485095
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq技术分析野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜，揭示了NR2E3基因在调节光感受器细胞分化中的作用。 | 发现了先前未报道的产生混合锥细胞的锥途径，这些混合锥细胞同时表达锥和杆相关基因。 | NA | 解析NR2E3基因在杆和锥转录网络中的精确作用。 | NR2E3基因突变相关的视网膜疾病。 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜样本 |
| 13234 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell RNA sequencing analysis with 101 machine learning combinations reveal neutrophil extracellular trap involvement in hepatic ischemia-reperfusion injury and early allograft dysfunction
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111874
PMID:38493695
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研究论文 | 本研究分析了中性粒细胞外网在肝脏缺血再灌注损伤及早期移植物功能障碍中的作用 | 新发现了两种明显的肝脏缺血再灌注损伤亚型，并建立了一种早期移植物功能障碍预测模型 | 研究主要依赖于公开数据库，可能存在数据选择偏倚的风险 | 综合分析肝脏缺血再灌注损伤中的中性粒细胞外网相关基因表达模式 | 肝脏缺血再灌注损伤相关样本及其基因表达模式 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA-seq | NMF算法 | 基因表达数据 | 101个样本 |
| 13235 | 2024-08-07 |
MGP+ and IDO1+ tumor-associated macrophages facilitate immunoresistance in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111818
PMID:38460300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了31名接受PD-1免疫治疗的乳腺癌患者的肿瘤组织中髓系细胞的变化，揭示了MGP+和IDO1+肿瘤相关巨噬细胞在乳腺癌中的免疫抵抗机制 | 本研究发现了MGP TAMs和IDO1 TAMs在乳腺癌患者中影响免疫治疗效果的新机制，并提供了新的生物标志物以预测治疗反应和克服免疫治疗抵抗 | NA | 探讨乳腺癌患者在接受PD-1免疫治疗后肿瘤相关巨噬细胞的变化及其对免疫治疗效果的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤组织中的髓系细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 |
| 13236 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling of infrapatellar fat pad highlights the role of interstitial inflammatory fibroblasts in osteoarthritis
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111888
PMID:38522139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了髌下脂肪垫（IFP）的细胞异质性，揭示了间质炎症性成纤维细胞（iiFBs）在骨关节炎（OA）中的作用。 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了髌下脂肪垫中间质炎症性成纤维细胞的特性和其在骨关节炎中的作用。 | NA | 探索髌下脂肪垫在骨关节炎发病机制中的作用，并识别潜在的治疗靶点。 | 髌下脂肪垫的细胞异质性及其在骨关节炎中的作用。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞和单核RNA测序 | NA | 转录组 | 10个髌下脂肪垫样本，包括5个来自骨关节炎患者和5个来自健康对照。 |
| 13237 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies FBXO2 as a candidate biomarker associated with chemoresistance in HGSOC
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28490
PMID:38590858
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研究论文 | 这项研究确定了FBXO2作为与HGSOC化疗抗药性相关的潜在生物标志物 | 首次通过结合单细胞RNA测序和整体RNA测序数据集识别出FBXO2在化疗抗药性中的作用 | 在体外验证中可能受限于细胞系的选择，临床适用性还有待进一步研究 | 研究HGSOC中与化疗抗药性相关的生物标志物 | 高等级浆液性卵巢癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 8871个恶性上皮细胞 |
| 13238 | 2024-08-07 |
Gene features of tumor-specific T cells relevant to immunotherapy, targeted therapy and chemotherapy in lung cancer
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28374
PMID:38590880
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序定义了肿瘤特异性T细胞（TSTs）及其特征（TSTGs），并应用LASSO回归筛选出与生存最相关的TSTGs，构建了肿瘤特异性T细胞评分（TSTS），以预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗的反应。 | 本文创新性地通过单细胞RNA测序技术筛选出肿瘤特异性T细胞的特征基因，并构建了一个新的评分系统（TSTS），用于预测肺癌患者对不同治疗方式的反应。 | NA | 研究旨在寻找能够预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗反应的生物标志物，以优化临床治疗选择。 | 肺癌患者的肿瘤特异性T细胞及其特征基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA |
| 13239 | 2024-08-07 |
Identification of fatty acids synthesis and metabolism-related gene signature and prediction of prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024-Apr-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03306-4
PMID:38584256
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研究论文 | 本研究通过分析基因表达综合数据库（GEO）、癌症基因组图谱（TCGA）和国际癌症基因组联盟（ICGC）的数据，识别了与肝细胞癌（HCC）中脂肪酸合成与代谢（FASM）相关的基因特征，并构建了预测预后模型。 | 本研究首次揭示了FASM相关基因特征在HCC中的分子特性、生理功能和临床预后价值，并通过一系列功能实验验证了FASM效应基因在促进肿瘤进展中的作用。 | NA | 旨在理解肝细胞癌中脂肪酸合成与代谢的异质性，并评估其对患者预后和治疗反应的影响。 | 肝细胞癌患者及其脂肪酸合成与代谢相关的基因特征。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 转录组数据 | 涉及来自GEO、TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌患者数据 |
| 13240 | 2024-08-07 |
Locally delivered hydrogels with controlled release of nanoscale exosomes promote cardiac repair after myocardial infarction
2024-Apr, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.02.035
PMID:38417558
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研究论文 | 本文介绍了一种生物工程化的可注射透明质酸水凝胶，用于优化滋养层干细胞衍生外泌体的局部递送效率，以促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 该水凝胶通过精心设计的超支化聚合物交联剂，增强了生物降解性和独特的控释能力，同时保留了纳米级外泌体的生物活性。 | NA | 旨在通过局部递送含有控释纳米级外泌体的水凝胶，促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 研究对象为心肌梗塞后的心脏修复。 | 生物工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |