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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-01-12 |
LncRNA PVT1 drives macrophage polarization and triple-negative breast cancer progression via PPARγ-mediated transcriptional activation
2026-Jan-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02232-8
PMID:41518478
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA PVT1通过招募NOP56和E2F1形成转录复合物,增强E2F1驱动的PPARγ表达,从而驱动巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化,进而促进三阴性乳腺癌进展的分子机制 | 首次阐明了lncRNA PVT1作为表观遗传支架,通过协调NOP56-E2F1-PPARγ信号轴来调控巨噬细胞极化和三阴性乳腺癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系实验,其发现向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探究lncRNA PVT1与PPARγ在驱动巨噬细胞重编程和三阴性乳腺癌进展中的分子相互作用 | 三阴性乳腺癌、巨噬细胞(THP-1/U937细胞系)、乳腺癌细胞(MDA-MB-231和MCF-7细胞系) | 肿瘤生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量测序、RNA/DNA pulldown、荧光素酶报告基因检测、流式细胞术、TUNEL检测 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1302 | 2026-01-12 |
Comprehensive analysis of key palmitoylation-modifying enzymes in clear cell renal cell carcinoma: implications for prognosis and therapy
2026-Jan-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04155-5
PMID:41519750
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,系统鉴定并验证了透明细胞肾细胞癌中关键的棕榈酰化修饰酶,揭示了其在预后和免疫调节中的重要作用 | 首次在ccRCC中系统描绘棕榈酰化修饰图谱,开发PalmScore分层系统,并利用机器学习结合单细胞测序鉴定出ZDHHC11等关键基因 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证和更大规模的临床队列验证 | 系统鉴定透明细胞肾细胞癌中关键的棕榈酰化修饰酶,并探索其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本和细胞系 | 生物信息学与计算生物学 | 肾细胞癌 | 多组学数据分析、机器学习、siRNA敲低、单细胞RNA测序 | 机器学习算法(未指定具体模型) | 基因组、转录组、临床数据 | TCGA-KIRC和GEO数据库中的ccRCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1303 | 2026-01-12 |
Tumor-associated macrophages promote chemoresistance to Paclitaxel via activating NOTCH2-JAG1 juxtacrine signaling
2026-Jan-10, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02546-w
PMID:41519773
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞通过激活NOTCH2-JAG1近分泌信号通路促进卵巢癌细胞对紫杉醇化疗耐药的分子机制 | 首次发现紫杉醇通过细胞质多聚腺苷酸化选择性诱导NOTCH2的翻译上调,并阐明巨噬细胞通过JAG1-NOTCH2轴形成正反馈环路驱动化疗耐药的新机制 | 研究主要聚焦于卵巢癌模型,在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证;临床样本分析规模有限 | 阐明肿瘤微环境中巨噬细胞介导紫杉醇化疗耐药的具体分子机制 | 卵巢癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、小鼠移植瘤模型、患者来源异种移植模型、卵巢癌患者样本 | 肿瘤生物学 | 卵巢癌 | 翻译组分析、活细胞成像、基因敲除/敲低、共培养实验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据、测序数据 | 多种卵巢癌小鼠模型(异种移植、同系移植、PDX模型)及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1304 | 2026-01-12 |
Differential expression analysis for spatially correlated data using smiDE
2026-Jan-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03867-1
PMID:41519776
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间相关数据的差异表达分析方法,以解决空间转录组学数据中的偏差和相关性挑战 | 开发了smiDE方法,专门针对空间转录组学数据中的分割误差和邻近细胞相关性进行校正,减少了假阳性发现 | NA | 改进空间转录组学数据的差异表达分析,以更准确地检测细胞状态对微环境的响应 | 空间转录组学数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1305 | 2026-01-12 |
MHC-II-restricted neoantigen vaccine reverses immune microenvironment and overcomes resistance to immune-checkpoint inhibitors in cold tumors
2026-Jan-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100936
PMID:41308654
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研究论文 | 本研究探讨了MHC-II限制性新抗原疫苗如何重塑冷肿瘤的免疫抑制微环境,并与TIGIT阻断剂联合使用以克服免疫检查点抑制剂耐药性 | 首次证明MHC-II限制性新抗原疫苗可重编程冷肿瘤的免疫抑制微环境,并通过NicheNet分析发现PVR-TIGIT轴是潜在联合治疗靶点,提出疫苗与TIGIT阻断的协同抗肿瘤策略 | 研究基于B16F10小鼠模型,其结论在人类肿瘤中的普适性仍需进一步验证;单细胞RNA测序样本量有限,可能未完全捕获肿瘤微环境的异质性 | 探究MHC-II限制性新抗原疫苗能否逆转冷肿瘤的免疫抑制微环境并克服免疫检查点抑制剂耐药性 | B16F10小鼠黑色素瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,NicheNet分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1306 | 2026-01-12 |
Divergent routes to specialization: Guard cells, myrosin cells, and beyond
2026-Jan-09, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102853
PMID:41518696
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综述 | 本文探讨了植物中保守的bHLH转录因子如何通过调控不同下游靶基因,驱动保卫细胞和芥子酶细胞等不同细胞类型的特化 | 揭示了FAMA转录因子通过调控WSB和SCAP1等不同下游靶基因,在保卫细胞成熟和芥子酶细胞身份建立中的双重作用,并发现了拟南芥根中来源不同的意外芥子酶细胞 | NA | 探讨植物细胞类型多样性的转录调控机制,特别是保守转录因子的重复利用如何驱动新细胞类型的演化 | 植物细胞类型(保卫细胞、芥子酶细胞)、bHLH转录因子(FAMA及其同源物)、下游靶基因(WSB、SCAP1等) | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组深度测序分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1307 | 2026-01-12 |
3D post-implantation co-culture of human embryo and endometrium
2026-Jan-08, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.002
PMID:41443195
|
研究论文 | 本研究开发了一种支持人类胚胎与子宫内膜类器官三维共培养的生理相关平台,用于研究胚胎-母体相互作用 | 首次建立了人类胚胎与子宫内膜类器官完全整合的三维共培养系统,实现了胚胎与母体间的双向通讯 | 未明确说明样本数量及来源的具体细节 | 解析人类围着床期及着床后发育过程 | 人类胚胎与子宫内膜类器官 | 发育生物学 | 生殖医学相关疾病 | 单细胞转录组学、功能实验 | 三维共培养系统 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1308 | 2026-01-12 |
Generation of human pineal gland organoids with melatonin production for disease modeling
2026-Jan-08, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.004
PMID:41475351
|
研究论文 | 本研究开发了人类松果体类器官,用于模拟松果体发育和功能,并应用于疾病建模 | 首次从多能干细胞生成人类松果体类器官,模拟松果体发育和褪黑素生产,并用于Angelman综合征等疾病建模 | 人类组织获取困难,研究依赖于干细胞模型,可能无法完全复制体内复杂性 | 研究松果体发育、昼夜节律调节及其在神经发育和睡眠相关疾病中的破坏 | 人类松果体类器官、Angelman综合征患者来源的iPSCs、松果体切除小鼠 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1309 | 2026-01-12 |
Cumulative environmental exposures adversely impact social behaviour and are associated with dysregulation of genes and proteins involved in epigenetic, ribosomal, and immune regulation in male mice
2026-Jan-08, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02152-y
PMID:41504877
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研究论文 | 本研究通过开发一种新型“三重打击”小鼠模型,探究了累积环境暴露对后代行为和大脑及外周免疫系统中炎症相关分子特征的影响 | 开发了结合孕前社会压力、产前高脂饮食和产后免疫挑战的“三重打击”小鼠模型,并利用单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示了雄性特异性行为缺陷与炎症、核糖体通路改变之间的关联 | 研究结果仅为初步假设,需要独立验证以确认其机制意义,且样本量有限(N=70) | 研究累积环境暴露如何影响后代行为和大脑及外周免疫系统的炎症相关分子特征 | C57Bl/6JAusB小鼠(N=70)及其后代,重点关注雄性三重打击后代 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质丰度数据 | 70只C57Bl/6JAusB小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1310 | 2026-01-12 |
Spatial multi-omics mapping of tumor microanatomy dynamics following radiotherapy combined with targeted-immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-08, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00876-x
PMID:41508252
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研究论文 | 本研究利用空间多组学技术,揭示了靶向-免疫-放疗三联疗法在晚期肝细胞癌中重塑肿瘤微环境的时空动态与细胞机制 | 首次在晚期肝细胞癌中,结合单细胞空间转录组学和空间蛋白质组学,构建了高分辨率的整合多组学图谱,以空间分辨率阐明了三联疗法诱导的肿瘤微环境重塑机制,特别是细胞毒性免疫细胞与抑制性免疫成分的空间分离现象 | 是一项回顾性临床队列研究,样本量有限,且主要针对伴有门静脉癌栓的晚期肝细胞癌患者 | 探究靶向-免疫-放疗三联疗法在晚期肝细胞癌中的疗效及重塑肿瘤微环境的时空与细胞机制 | 晚期肝细胞癌患者,特别是伴有门静脉癌栓的患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 空间多组学数据(转录组、蛋白质组) | NA | NA | 单细胞空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1311 | 2026-01-12 |
Bovine formative embryonic stem cell plasticity in embryonic and extraembryonic differentiation
2026-Jan-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf068
PMID:41129285
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研究论文 | 本文报道了牛形成性胚胎干细胞(bFSCs)的生成,这些细胞在体外和体内均具有多能性,并能高效分化为神经祖细胞和原始生殖细胞样细胞 | 首次生成了具有独特形态和完全分化能力的牛形成性胚胎干细胞,展示了其在胚胎和胚胎外组织中的双重发育可塑性 | 未明确说明bFSCs在长期培养中的稳定性或其在更广泛疾病模型中的应用限制 | 研究牛胚胎干细胞的发育可塑性,以促进对牛胚胎发育的理解及农业生物技术应用 | 牛形成性胚胎干细胞(bFSCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量,但涉及牛和小鼠胚胎的嵌合实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1312 | 2026-01-12 |
The dorsal aortic compartment is a developmental source of brown adipose tissue in mice
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68147-9
PMID:41501080
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠棕色脂肪组织的一个非体节性发育来源,即背主动脉区室的多能间充质祖细胞 | 发现背主动脉区室是肩胛下、外侧、颈部和主动脉周围棕色脂肪组织的部分来源,挑战了传统认为棕色脂肪组织仅来源于体节中胚层的观点 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证,且对背主动脉祖细胞的具体分化机制和调控网络仍需进一步探索 | 探究小鼠棕色脂肪组织的发育起源,特别是非体节性来源 | 小鼠胚胎发育过程中的背主动脉区室细胞及棕色脂肪组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序,遗传谱系追踪 | NA | 单细胞测序数据,遗传谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1313 | 2026-01-12 |
BRRIAR lncRNA alters breast cancer risk by modulating interferon signaling in cis and in trans
2026-Jan-07, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02510-8
PMID:41501810
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研究论文 | 本研究功能性表征了乳腺癌相关长链非编码RNA BRRIAR,揭示了其通过顺式和反式作用调节干扰素信号通路,从而影响乳腺癌风险和治疗潜力 | 首次发现BRRIAR作为3p26乳腺癌风险区域的关键靶基因,通过核内顺式调节BHLHE40表达和胞质内反式结合RIG-I受体,双重机制激活干扰素信号,为lncRNA在肿瘤免疫中的调控作用提供了新见解 | 研究主要基于ER+乳腺癌模型,在其他乳腺癌亚型或实体瘤中的普适性尚未验证;体内实验采用异种移植模型,可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究BRRIAR lncRNA在乳腺癌发生发展中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、乳腺癌异种移植模型、人外周血单个核细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | qPCR、原位杂交、CRISPR干扰、染色质相互作用分析、ChIP测序、CRISPR-Cas9全基因组筛选、RNA测序、RNA pull-down结合质谱分析、流式细胞术、细胞因子谱分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据 | ER+乳腺癌细胞系、乳腺癌异种移植模型、人外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1314 | 2026-01-12 |
Tumor-associated macrophage-specific SERPING1 contributes to M1-phenotype transition and suppress colorectal cancer tumorigenesis via NF-κB pathway
2026-Jan-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150144
PMID:41513188
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研究论文 | 本研究揭示了丝氨酸蛋白酶抑制剂SERPING1通过抑制NF-κB通路,促进肿瘤相关巨噬细胞向M1样表型极化,从而抑制结直肠癌发生发展的机制 | 首次发现SERPING1在肿瘤相关巨噬细胞中特异性低表达,并证实其通过调控NF-κB信号通路促进巨噬细胞向抗肿瘤M1表型转化 | 研究主要基于细胞实验和动物模型,临床样本验证相对有限;具体信号通路的上下游调控机制仍需进一步探索 | 阐明巨噬细胞在结直肠癌发生发展中的作用机制,寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌组织、肿瘤相关巨噬细胞、HCT116细胞系 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了公共scRNA-seq数据集和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1315 | 2026-01-12 |
CellMap: precision mapping of cellular landscape in spatial transcriptomics
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1484
PMID:41505103
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMap的计算工具,用于将空间转录组学数据解析至单细胞分辨率 | 结合种子基因共线性、随机森林模型和线性分配算法,实现单细胞到空间点的最优分配,并在多种平台和组织类型中表现优于现有方法 | NA | 开发一种计算工具以提高空间转录组学数据的解析精度 | 空间转录组学数据中的细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 随机森林模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1316 | 2026-01-12 |
Extracellular vesicles secreted by LRP1+ ligament-derived stem cells promote tendon-bone healing after ACL reconstruction via miR-708-5p/Bambi axis
2026-Jan-03, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究揭示了LRP1阳性韧带源性干细胞分泌的细胞外囊泡通过miR-708-5p/Bambi轴促进前交叉韧带重建后腱骨愈合的机制 | 首次在单细胞水平鉴定了具有更强干性和成软骨分化潜能的LRP1阳性韧带源性干细胞亚群,并发现其分泌的细胞外囊泡通过miR-708-5p靶向抑制Bambi激活BMP信号通路,为腱骨愈合提供了新的无细胞治疗策略 | 研究主要基于大鼠模型,其结论在人体中的有效性有待进一步验证;细胞外囊泡的具体作用机制和最佳递送方案仍需深入探索 | 探究LRP1阳性韧带源性干细胞来源的细胞外囊泡促进前交叉韧带重建后腱骨愈合的分子机制 | 人前交叉韧带残端样本、大鼠前交叉韧带重建模型、LRP1阳性韧带源性干细胞及其分泌的细胞外囊泡 | 单细胞组学 | 运动系统损伤 | 单细胞RNA测序、miRNA测序 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、miRNA表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及人ACL残端样本和大鼠ACLR模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1317 | 2026-01-12 |
The mechanism of Akkermansia muciniphila inhibiting the proliferation of colorectal cancer cells via ferroptosis
2026-Jan, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-03984-0
PMID:40637947
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研究论文 | 本研究探讨了Akkermansia muciniphila通过铁死亡途径抑制结直肠癌细胞增殖的机制 | 首次揭示了Akkermansia muciniphila的代谢物通过诱导铁死亡来抑制结直肠癌细胞增殖的具体机制 | 研究仅使用Caco-2细胞系进行体外实验,未进行动物模型验证 | 阐明Akkermansia muciniphila抑制结直肠癌细胞增殖的分子机制 | Caco-2结直肠癌细胞系 | 细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学分析、流式细胞术、细胞划痕实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1318 | 2026-01-12 |
Interplay between Matrix Viscoelasticity and Integrin Engagement Modulates Cancer-Associated Fibroblast States
2026-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500389
PMID:40726283
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研究论文 | 本研究探讨了基质粘弹性和整合素结合如何调节癌症相关成纤维细胞(CAFs)的状态,首次在体外模型中展示了这些因素对CAF可塑性的影响 | 首次结合基质粘弹性和整合素结合来调控CAF状态,并利用海藻酸水凝胶模型在体外可控地重现CAF异质性 | 研究基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 理解CAF亚群的功能并开发CAF靶向治疗策略 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 患者来源的CAFs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1319 | 2026-01-12 |
Single Cell and Spatial Transcriptomics Define a Proinflammatory and Profibrotic Niche After Kidney Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503691
PMID:41042124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了肾损伤后促炎和促纤维化微环境的形成机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统描绘了肾纤维化过程中的细胞异质性、空间组织和分子相互作用,并明确了TNC在激活巨噬细胞中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;且未深入探讨其他潜在信号通路的影响 | 探究肾损伤后促炎和促纤维化微环境的形成机制及其在肾纤维化中的作用 | 小鼠肾脏组织,特别是单侧缺血再灌注损伤后的正常与纤维化肾脏 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1320 | 2026-01-12 |
T-Cell Immune Dysfunction and Progression to Severe COVID-19 in Asthma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2025.0099
PMID:41253375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了哮喘患者中T细胞免疫功能障碍与进展为重症COVID-19之间的关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术,在哮喘患者中系统性地分析了COVID-19感染期间免疫细胞动态变化,并识别出T细胞比例减少和细胞毒性CD8+ T细胞比例增加与重症COVID-19相关 | 样本量较小(共12名患者),特别是哮喘/重症COVID-19组仅1名患者,可能限制结果的普遍性和统计效力 | 探究哮喘患者中驱动重症COVID-19的免疫信号通路 | 哮喘和非哮喘的COVID-19患者 | 数字病理学 | COVID-19, 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名患者(4名哮喘,8名非哮喘),共155,565个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |