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当前共找到 43167 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-08-27 |
Distinct immunometabolic signatures in circulating immune cells define disease outcome in acute-on-chronic liver failure
2025-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000907
PMID:38761406
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析，绘制了急性失代偿性肝硬化（ACLF）患者循环免疫细胞的图谱，并揭示了与疾病恢复或非恢复相关的不同免疫代谢特征 | 首次在单细胞水平上识别出ACLF患者中两种不同的经典单核细胞状态，并阐明恢复与非恢复状态下免疫代谢和功能特征的差异 | 研究样本量可能有限，且未深入探讨这些免疫代谢状态与临床干预的直接关联 | 阐明ACLF患者循环免疫细胞的免疫代谢特征如何与疾病恢复或非恢复相关 | ACLF患者、急性失代偿性肝硬化患者和健康个体的循环免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 急性失代偿性肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据及代谢组和功能验证数据 | ACLF患者、AD肝硬化患者和健康个体的血液样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1302 | 2026-08-27 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.19.604364
PMID:39071335
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研究论文 | 本文介绍了用于长读长测序转录本定量的工具lr-kallisto，并展示了其在ONT数据上的应用。 | 将kallisto的bulk和单细胞RNA-seq定量方法适配到长读长测序技术，实现了快速准确的异构体定量，并发现外显子捕获可改善定量效果。 | 文中未明确提及局限性。 | 实现长读长测序数据的快速准确转录本异构体定量。 | 长读长测序数据（ONT数据）用于转录本定量。 | 生物信息学 | NA | 长读长测序（ONT） | kallisto（基于k-mer的伪比对方法） | 长读长RNA测序数据 | 未明确提及样本数量。 | ONT（Oxford Nanopore Technologies） | 长读长RNA测序 | MinION或PromethION（推测） | 未提供具体配置。 |
| 1303 | 2026-08-27 |
Spatial transcriptomics reveals Inhba/Smad2/E2f4 axis in Lrp2high thecal cell proliferation in androgen-induced PCOS mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1633254
PMID:40831751
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示Lrp2高表达卵泡膜细胞中Inhba/Smad2/E2f4轴在雄激素诱导的PCOS小鼠中的增殖作用 | 首次通过空间转录组学在单细胞分辨率下识别出PCOS小鼠卵巢中Lrp2高表达的卵泡膜细胞亚群，并发现Inhba/Smad2/E2f4信号轴是促进该细胞增殖的关键调控网络 | 研究基于小鼠模型，结果可能在人类PCOS中有所不同；功能验证仅限于体外细胞实验，未进行体内验证 | 探究PCOS中卵泡膜细胞过度增殖的分子机制，特别是Lrp2高表达细胞亚群及其调控网络 | PCOS小鼠模型及培养的卵泡膜细胞 | 空间转录组学 | 多囊卵巢综合征 | 空间转录组学、siRNA敲低、EdU掺入、流式细胞术 | NA | 空间基因表达数据、细胞增殖和细胞周期数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1304 | 2026-08-27 |
Genotype-phenotype profile of global ASPH-associated ectopia lentis and clinical findings from a Chinese cohort
2024-Oct-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148600
PMID:38788814
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研究论文 | 本研究通过靶向下一代测序和单细胞RNA测序，分析了中国队列中与ASPH相关的晶状体异位（Traboulsi综合征）的基因型-表型特征，并发现了新发错义变异和复发性无义变异 | 首次在中国队列中鉴定ASPH基因的新错义变异c.2075G>A (p.G692D)和复发性无义变异c.1126C>G (p.R376*)，并通过单细胞表达图谱和分子建模揭示了ASPH在睫状体上皮中的表达模式及变异对蛋白质结构的影响 | 样本量较小，仅包含两个家系，且未进行功能实验验证变异对蛋白功能的影响 | 探讨ASPH相关晶状体异位的基因型-表型关联，并阐明ASPH在晶状体异位发病机制中的潜在作用 | 中国晶状体异位队列中的两个家系，包含两名5岁男孩及其相关临床样本 | 基因组学, 单细胞转录组学, 生物信息学 | 晶状体异位, Traboulsi综合征 | 靶向下一代测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 分子建模 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 临床表型数据 | 2个家系，2名患者 | Illumina | 靶向测序, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Genomics Chromium | 靶向下一代测序使用Illumina NovaSeq平台，单细胞RNA测序使用10x Genomics Chromium平台 |
| 1305 | 2026-08-27 |
Nova-ST: Nano-patterned ultra-dense platform for spatial transcriptomics
2024-08-19, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100831
PMID:39111312
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研究论文 | 介绍Nova-ST，一种基于纳米图案化超密集平台的空间转录组学技术，利用随机条形码的Illumina测序流动槽，实现低成本、高分辨率的大组织切片空间基因表达分析。 | Nova-ST利用纳米图案化的高密度捕获阵列，显著提高了空间转录组学的灵敏度和分辨率，同时降低了成本，支持大规模组织图谱绘制。 | 摘要中未明确提及局限性。 | 开发一种高密度、低成本、灵活的空间转录组学技术，以提高大组织切片的空间分析性能。 | 小鼠脑组织切片。 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间基因表达数据 | 小鼠脑组织切片（具体数量未提供） | Illumina | 空间转录组学 | Illumina测序流动槽 | 随机条形码的Illumina测序流动槽，用于纳米图案化阵列 |
| 1306 | 2026-08-27 |
Precise detection of cell-type-specific domains in spatial transcriptomics
2024-08-19, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100841
PMID:39127046
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研究论文 | 提出了De-spot方法，用于在空间转录组学中精确检测细胞类型特异性结构域，特别是低比例细胞类型 | 通过集成分割与去卷积生成细胞类型模式，能检测低比例细胞类型特异性结构域，并直观展示这些结构域 | 摘要未提及局限性 | 开发一种计算方法以精确检测空间转录组中的细胞类型特异性结构域 | 空间转录组组织切片中的细胞类型特异性结构域，例如癌症相关成纤维细胞与免疫细胞共定位区域及T细胞特异性结构域 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学（SRT） | 集成方法（分割与去卷积） | 空间转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1307 | 2026-08-27 |
Transition of signal requirement in hematopoietic stem cell development from hemogenic endothelial cells
2024-07-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404193121
PMID:39042698
|
研究论文 | 本研究确定了从生血内皮细胞发展成造血干细胞过程中信号需求的转变，并建立了一种无血清、无饲养层细胞的培养系统。 | 首次证明SCF和TPO足以在无血清、无饲养层条件下从E11.5 pre-HSC-I诱导出可移植的造血干细胞，并揭示了从HEC到HSC发展过程中信号需求的转变。 | 研究主要基于小鼠胚胎，人体内的验证尚不明确，且培养系统可能未完全模拟体内微环境。 | 阐明从生血内皮细胞发展成造血干细胞时所需的最小因子及其信号需求转变。 | 小鼠胚胎的造血干细胞前体（pre-HSC-I和pre-HSC-II）及生血内皮细胞。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | E10.5至E11.5的背主动脉及其周围组织，以及胎肝样本。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1308 | 2026-08-27 |
Tropism for ciliated cells is the dominant driver of influenza viral burst size in the human airway
2024-07-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320303121
PMID:39008691
|
研究论文 | 本研究利用原代人呼吸道培养物，探究流感病毒对纤毛细胞和分泌细胞的嗜性差异及其对病毒复制的贡献，发现纤毛细胞是病毒爆发规模的主要驱动因素。 | 首次揭示在复杂人呼吸道细胞环境中，即使同为流感病毒优先感染的细胞类型，纤毛细胞和分泌细胞对病毒多轮爆发规模的影响截然不同，且可能由不同的干扰素刺激基因特征导致。 | 研究中未明确提及局限性。 | 探究人呼吸道中不同上皮细胞类型对流感病毒嗜性和复制动力学的影响，以及细胞身份对病毒爆发规模的贡献。 | 原代人呼吸道培养物，包含多种上皮细胞类型，来自多个供体和30种不同的分化条件。 | 病毒学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个供体，30种分化条件下的原代培养物 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'文库制备 |
| 1309 | 2026-08-27 |
HEARTSVG: a fast and accurate method for identifying spatially variable genes in large-scale spatial transcriptomics
2024-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49846-1
PMID:38972896
|
研究论文 | 提出了一种名为HEARTSVG的快速准确方法，用于在大规模空间转录组学数据中识别空间可变基因 | 采用无分布假设的基于检验的方法，无需预设空间模式即可高效识别SVGs，具有高准确性、可扩展性和低假阳性率 | 未提及 | 开发一种快速准确的方法来识别大规模空间转录组数据中的空间可变基因，以帮助理解疾病和组织的时空特征 | 空间转录组数据中的基因表达模式，特别是人类结直肠癌数据中的肿瘤空间结构 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 十二个来自不同空间转录组技术的真实数据集 | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1310 | 2026-08-27 |
Multi-omics analysis uncovered systemic lupus erythematosus and COVID-19 crosstalk
2024-06-11, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00851-6
PMID:38862942
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研究论文 | 通过多组学分析揭示系统性红斑狼疮与COVID-19之间的相互作用机制 | 首次利用多组学数据整合分析，阐明SLE与COVID-19共享的hub基因和关键信号通路，并确定单核细胞/巨噬细胞为共同靶细胞 | 未提供明确的局限性信息 | 利用临床信息和多组学数据阐明COVID-19对SLE的影响及两种疾病间的相互作用机制 | 系统性红斑狼疮和COVID-19患者 | 基因组学 | 系统性红斑狼疮, COVID-19 | RNA-seq, 全基因组关联分析, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 基因组关联数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1311 | 2026-08-27 |
IGF2BP3 promotes glutamine metabolism of endometriosis by interacting with UCA1 to enhances the mRNA stability of GLS1
2024-05-17, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00834-7
PMID:38760723
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研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP3通过与UCA1相互作用增强GLS1 mRNA稳定性，进而促进子宫内膜异位症谷氨酰胺代谢的机制。 | 首次揭示了IGF2BP3通过结合UCA1和GLS1 mRNA 3'UTR区域来增强其稳定性，从而促进谷氨酰胺代谢，为子宫内膜异位症的治疗提供了新的潜在靶点。 | 摘要中未提及研究的局限性。 | 阐明IGF2BP3在子宫内膜异位症发生发展中的作用及其分子机制。 | 子宫内膜异位症患者异位内膜组织及正常子宫内膜组织，以及异位子宫内膜间质细胞（eESCs）。 | 分子生物学 | 子宫内膜异位症 | RNA免疫沉淀、RNA pull-down、荧光原位杂交、单细胞空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 组织样本，细胞，转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | Na |
| 1312 | 2026-08-27 |
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00117-6
PMID:38499808
|
研究论文 | 本研究探讨了SorLA蛋白在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞（GAMs）中的功能，揭示其通过限制TNFα释放来塑造支持胶质瘤的脑微环境 | 首次揭示SorLA在胶质瘤微环境中通过调节TNFα分泌影响小胶质细胞的炎症反应，并发现SORL1表达水平与GAMs功能表型相关 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，对人类的验证有限；未明确SorLA调控TNFα释放的具体分子机制 | 探究SorLA对胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能的影响及其在胶质瘤进展中的作用 | 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞（GAMs） | 神经科学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析、体外模型、小鼠胶质瘤模型 | NA | 单细胞转录组数据、实验数据 | 未明确，包括已发表的GBM患者scRNA-seq数据和体外/体内模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1313 | 2026-08-27 |
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-04-10, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.03.002
PMID:38513657
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研究论文 | 通过元分析和单细胞RNA测序数据再分析，探讨老年人肠道微生物组特定肠型对免疫检查点阻断疗法敏感性的增强作用 | 首次揭示老年人肠道微生物组中富集的特定肠型与免疫检查点阻断疗法良好反应相关，并通过粪菌移植实验验证其治疗潜力 | 未明确提及局限性 | 解释老年人对免疫检查点阻断疗法敏感性增强的机制，并探索肠道微生物组在其中的调节作用 | 老年癌症患者及小鼠模型 | 微生物组学、免疫肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、粪菌移植 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床试验数据、小鼠实验数据 | 25项小型至中型临床试验的元分析，以及多项研究的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1314 | 2026-08-27 |
Patterning ganglionic eminences in developing human brain organoids using a morphogen-gradient-inducing device
2024-01-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100689
PMID:38228151
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研究论文 | 本研究开发了一种利用聚二甲基硅氧烷装置产生持续化学梯度的方法，生成模式化脑类器官（MIBOs），以重现神经节隆起中的背腹侧 patterning | 创新点在于开发了一种能够产生持续化学梯度的PDMS装置，用于生成模式化脑类器官（MIBOs），并成功重现胚胎期神经节隆起的背腹侧 patterning | 未提及明显局限性 | 旨在通过模拟形态发生素梯度，改进体外大脑发育模型，用于胚胎发育和疾病建模 | 人类脑类器官 | 类器官与发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 多个类器官样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1315 | 2026-08-27 |
HPV-driven heterogeneity in cervical cancer: study on the role of epithelial cells and myofibroblasts in the tumor progression based on single-cell RNA sequencing analysis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18158
PMID:39346086
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析，探讨HPV状态驱动的宫颈癌肿瘤微环境异质性，重点关注上皮细胞和肌成纤维细胞在肿瘤进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序全面揭示HPV阳性和阴性宫颈癌样本中细胞组成和免疫微环境的差异，并验证TFF3基因沉默对宫颈癌细胞迁移和侵袭的抑制作用 | 样本数据来源仅限于GEO数据库，且细胞功能验证仅限于体外实验，缺乏体内模型支持 | 探索宫颈癌肿瘤微环境的特征，以优化癌症的预防筛查和个性化治疗 | 宫颈癌患者的HPV阳性和阴性样本，来源自GEO数据库 | 单细胞转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12,431个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1316 | 2024-12-01 |
Exploring the feasibility of using mice as a substitute model for investigating microglia in aging and Alzheimer's disease though single cell analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311374
PMID:39591421
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研究论文 | 研究通过单细胞分析探讨小鼠作为衰老和阿尔茨海默病中微胶质细胞替代模型的可行性 | 首次通过单核RNA测序和单细胞RNA测序比较人类和小鼠在衰老和阿尔茨海默病中微胶质细胞的异同 | 小鼠模型无法完全替代人类样本进行阿尔茨海默病和衰老研究 | 探讨小鼠作为研究衰老和阿尔茨海默病中微胶质细胞的替代模型的可行性 | 人类和小鼠的微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 人类数据集GSE198323和GSE127892的小鼠数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1317 | 2026-08-27 |
Evaluating the prognostic potential of telomerase signature in breast cancer through advanced machine learning model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462953
PMID:39669558
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据开发了一种机器学习辅助的端粒酶特征（MLTS），用于评估乳腺癌预后，并验证了其预测准确性及与基因组和细胞特征的相关性 | 创新性地结合多种机器学习算法和端粒酶相关基因，开发了MLTS预测模型，并在多个队列中与66个现有模型进行比较，展示了其优越性能 | 未来需要将MLTS与其他分子特征整合以增强临床应用，本研究未提及具体局限性 | 评估端粒酶特征在乳腺癌预后中的潜力，并开发精准预测模型以指导个性化治疗 | 乳腺癌患者，涉及九个独立乳腺癌数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 多组学数据整合分析，单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法（具体模型未指明） | 多组学数据（包括基因组、转录组等），单细胞RNA测序数据 | 九个独立乳腺癌数据集（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1318 | 2026-08-27 |
The effector function of mucosal associated invariant T cells alters with aging and is regulated by RORγt
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1504806
PMID:39669566
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了肠道MAIT细胞在衰老过程中从MAIT17向MAIT1表型转变，并发现RORγt调控其效应功能，影响结直肠癌预后 | 首次揭示MAIT细胞在衰老过程中从MAIT17向MAIT1的功能转变，并鉴定RORγt作为关键转录因子调控这一过程，且发现其与结直肠癌预后相关 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的比较分析，尚未验证RORγt调控机制在人类中的直接因果作用，且样本量可能有限 | 探究影响MAIT细胞转录组和效应功能的因素，特别是衰老过程中的变化及其调控机制 | 小鼠和人类的肠道MAIT细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 无特定模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类肠道样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1319 | 2026-08-27 |
Integrated immunogenomic analyses of high-grade serous ovarian cancer reveal vulnerability to combination immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1489235
PMID:39669575
|
研究论文 | 通过对高级别浆液性卵巢癌的综合免疫基因组学分析，揭示了其对联合免疫治疗的脆弱性，并开发了预测治疗反应的诊断工具。 | 识别出预测BRCAness的24基因特征，并结合单细胞RNA测序和免疫组化揭示了肿瘤微环境中免疫抑制细胞的作用，开发了基于RNA测序数据的网络应用和R包用于患者分层。 | 研究主要基于已有数据集，可能缺乏前瞻性验证；细胞系实验可能不能完全反映体内情况。 | 探究高级别浆液性卵巢癌对联合免疫治疗的反应机制，并开发预测工具。 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本、卵巢癌细胞系。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、免疫组化、免疫荧光分析 | 机器学习 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、免疫组化图像 | 多个患者队列数据，包括bulk和单细胞RNA测序数据，及细胞系实验 | Illumina（假设，因为RNA测序） | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1320 | 2026-08-27 |
Fibroblast growth factor receptor risk signature predicts patient prognosis and immunotherapy resistance in colorectal cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1493673
PMID:39676867
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和机器学习技术识别了结直肠癌中的成纤维细胞生长因子受体风险特征（FRS），并验证其预测预后和免疫治疗耐药性的潜力，同时发现潜在抑制剂PHA-793887可改善抗肿瘤免疫反应 | 首次通过多组学数据整合和机器学习方法定义了FGFR风险特征（FRS），并揭示了其在肿瘤微环境中的分子异质性及其对免疫治疗耐药性的预测作用，同时识别出新型抑制剂PHA-793887能重塑免疫抑制性微环境 | 研究主要基于公共数据库和体外模型，缺乏大规模临床验证；PHA-793887的治疗效果仅在MC38小鼠模型中验证，需进一步临床试验评估其安全性和有效性 | 探讨FGFR风险特征（FRS）在结直肠癌患者预后和免疫治疗反应中的潜在作用，并寻找可能的靶向抑制剂 | 结直肠癌（CRC）患者及MC38小鼠肿瘤模型 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学习、流式细胞术、基因集富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 未在标题和摘要中明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |