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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2026-10-07 |
STAG2 mutations fine-tune the ALK-driven oncogenic program in ALK-positive anaplastic large cell lymphoma
2026-Oct-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032902
PMID:42832421
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研究论文 | 通过配对全外显子测序发现ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤中STAG2突变频率较高,并利用原代T淋巴细胞模型和单细胞RNA测序揭示STAG2缺失加速ALK驱动的淋巴瘤发生并削弱整体ALK+ ALCL转录程序 | 首次在ALK+ ALCL中发现黏连蛋白复合物基因(尤其是STAG2)高频突变;建立了模拟原代T淋巴细胞中NPM1::ALK驱动转化早期步骤的原始淋巴瘤发生模型;揭示STAG2缺失通过促进细胞对NPM1::ALK表达的耐受加速恶性转化,且即使无基因组突变,NPM1::ALK诱导也可内在下调STAG2 | 样本量较小(16例患者肿瘤用于测序,6例检出STAG2突变),ALK+ ALCL本身为罕见疾病限制了队列规模;结论主要基于体外和PDX模型,尚需更大规模临床验证 | 探究ALK+ ALCL中除NPM1::ALK融合外的体细胞变异及其在淋巴瘤发生中的作用 | ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者肿瘤组织、配对正常组织、原代T淋巴细胞转化模型及PDX模型 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 全外显子测序, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 序列数据, 图像, 文本 | 16例ALK+ ALCL患者肿瘤及配对正常组织用于全外显子测序,另有多例患者肿瘤样本用于免疫组化验证,以及PDX模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1262 | 2026-10-07 |
Human CD1c-autoreactive T-cells recognise Mycobacterium tuberculosis-infected antigen-presenting cells and display cytotoxic effector programmes
2026-Oct-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.110341
PMID:42832565
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研究论文 | 该研究利用工程化人类抗原呈递细胞系统和单细胞转录组测序,揭示了CD1c自反应性T细胞能够识别结核分枝杆菌感染的抗原呈递细胞并展现细胞毒性效应程序 | 首次定义了人类CD1c限制性T细胞对结核分枝杆菌感染抗原呈递细胞的应答,发现CD1c自反应性T细胞具有细胞毒性效应记忆程序和抗菌分子表达,并鉴定其为结核病中脂质导向免疫的候选细胞轴 | 研究主要在体外条件下进行,体内保护效果尚未验证,且CD1c自反应性T细胞在人体结核病中的实际保护作用仍需进一步临床研究确认 | 探究CD1c表达抗原呈递细胞和结核分枝杆菌感染如何塑造CD1c自反应性T细胞应答,明确其在人类抗结核免疫中的作用 | 人类CD1c自反应性T细胞、CD1c表达抗原呈递细胞、结核分枝杆菌 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1263 | 2026-10-07 |
PLA1A Inhibition Enhances Chemoimmunotherapy Efficacy by Blocking Immunosuppressive Macrophage Polarization in Colorectal Cancer
2026-Oct-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-26-0955
PMID:42832699
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研究论文 | 通过对结直肠癌患者新辅助化疗前后配对样本进行单细胞RNA测序,揭示PLA1A通过LysoPS-P2ry10轴促进M2样巨噬细胞极化介导免疫抑制,抑制PLA1A可增强化疗免疫治疗疗效 | 首次揭示化疗驱动PLA1A水解磷脂酰丝氨酸生成LysoPS,激活P2ry10受体促进M2样巨噬细胞极化的代谢轴,并提出PLA1A作为克服免疫抑制、改善化疗免疫治疗疗效的靶点 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究新辅助化疗如何重塑结直肠癌免疫微环境,并寻找增强化疗免疫治疗疗效的联合治疗策略 | 结直肠癌患者新辅助化疗前后配对肿瘤样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1264 | 2026-10-07 |
Targeting a Novel AREG+ Dendritic Cell Alleviates Renal Fibrosis Induced by Ischemia-Reperfusion Injury
2026-Oct-05, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70287
PMID:42833284
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研究论文 | 该研究通过建立人类肾缺血再灌注损伤模型,利用单细胞RNA测序发现了一个新的CD11c+AREG+树突状细胞亚群,该亚群通过AREG-EGFR信号轴促进肾小管上皮间质转化和纤维化 | 首次发现并鉴定了一个在肾缺血再灌注损伤后扩增的CD11c+AREG+树突状细胞亚群,揭示了该细胞通过AREG-EGFR信号轴与肾小管上皮细胞通讯,直接驱动上皮间质转化和纤维化的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明肾缺血再灌注损伤中连接早期免疫激活与肾小管上皮间质转化的细胞启动因子,并探索潜在治疗靶点 | 接受根治性肾切除术的患者肾组织样本和缺血再灌注损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1265 | 2026-10-07 |
Temporal assessment of spatial and single-cell transcriptomes identifies CD226-NECTIN2 T cell-cholangiocyte interaction in bile duct inflammation
2026-Oct-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.09.021
PMID:42833310
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研究论文 | 该研究通过空间转录组和单细胞转录组技术,对NOD.c3c4小鼠的肝脏进行时序分析,发现了CD226-NECTIN2 T细胞与胆管细胞之间的相互作用在胆管炎症中的关键作用 | 首次在NOD.c3c4小鼠模型中结合空间转录组和单细胞RNA测序,时序性地鉴定了CD226-NECTIN2 T细胞-胆管细胞相互作用,并在人类PSC和PBC肝脏中验证了这一发现 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仅限于肝移植样本,样本量有限;CD226-NECTIN2作为治疗靶点的安全性和有效性尚需进一步临床前和临床研究验证 | 深入理解原发性硬化性胆管炎(PSC)和原发性胆汁性胆管炎(PBC)等胆管炎症性疾病的发病机制,识别关键的细胞类型、相互作用及时间变化,并寻找潜在的治疗靶点 | 10、20和40周龄雄性NOD.c3c4小鼠的肝脏组织,以及来自PSC、PBC和酒精相关性肝病(ALD)患者的肝移植样本 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 原发性硬化性胆管炎, 原发性胆汁性胆管炎, 酒精相关性肝病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光, 共培养实验, 抗体治疗 | NOD.c3c4小鼠模型 | 转录组数据, 图像数据 | 10、20和40周龄雄性NOD.c3c4小鼠的肝脏组织(每个时间点若干只),以及PSC、PBC和ALD患者的肝移植样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1266 | 2026-10-07 |
All-trans retinoic acid-driven immune remodeling in esophageal squamous cell carcinoma revealed by single-cell transcriptomics
2026-Oct-05, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168491
PMID:42833561
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学等技术揭示全反式维甲酸(ATRA)在食管鳞状细胞癌中驱动免疫重塑的机制。 | 首次整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和OTUD6B基因敲除等手段,系统揭示ATRA通过OTUD6B介导的免疫重塑机制,包括减少调节性T细胞特征、抑制M2样巨噬细胞极化、扩增CD74高表达中性粒细胞状态,并发现OTUD6B在ATRA响应中的关键作用 | 研究主要基于小鼠同源肿瘤模型mEC25和体外细胞实验,缺乏大规模临床患者样本验证;OTUD6B在ATRA响应中的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明ATRA如何重塑食管鳞状细胞癌肿瘤微环境及其与OTUD6B的关联,为基于ATRA的免疫治疗联合方案提供理论依据 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)同源小鼠mEC25肿瘤模型及人类ESCC细胞 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, immunofluorescence, flow cytometry, OTUD6B disruption | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1267 | 2026-10-07 |
Vascular-specific FAM43B inhibits the Wnt pathway by regulating β-catenin ubiquitination and alleviates the progression of atherosclerosis
2026-Oct-05, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124721
PMID:42833574
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研究论文 | 该研究揭示了FAM43B通过调控β-catenin的K63泛素化抑制Wnt信号通路,从而维持血管稳态并缓解动脉粥样硬化进展 | 首次发现FAM43B在血管内皮和平滑肌细胞中特异性表达,并阐明其通过促进β-catenin的保护性K63泛素化抑制经典Wnt/β-catenin信号通路的全新机制,为动脉粥样硬化提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,缺乏临床人体试验验证;FAM43B在人体中的长期安全性和有效性尚需进一步评估 | 阐明FAM43B在血管内皮稳态调控和动脉粥样硬化进展中的作用及分子机制 | 人血管单细胞转录组数据、HUVEC细胞、三种双向小鼠模型(全身敲除、血管条件性敲除、AAV介导的局部过表达) | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, X-Gal染色 | NA | 图像, 文本 | 人血管单细胞转录组数据、三种小鼠模型及HUVEC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1268 | 2026-10-07 |
Integrative multiomics and machine learning identify uridine as a candidate modulator of MMP7-mediated immune cell infiltration in pulmonary fibrosis
2026-Oct-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.10.008
PMID:42833599
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研究论文 | 该研究通过整合多组学数据与机器学习,识别出尿苷是肺纤维化中MMP7介导免疫细胞浸润的候选调节因子 | 首次整合多数据库尿苷靶点预测、批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组学,结合机器学习SHAP解释,发现尿苷与MMP7直接结合并调节肺纤维化免疫微环境 | 研究样本主要来自公共数据库和动物模型,需要进一步临床验证;尿苷调节MMP7免疫浸润的具体信号通路机制尚未完全阐明 | 识别肺纤维化中尿苷相关靶点,确定尿苷是否与MMP7相关的免疫细胞浸润有关 | 特发性肺纤维化患者肺组织样本、博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟, 表面等离子共振 | 机器学习, SHAP | 基因表达数据, 图像 | 531例肺组织转录组样本(来自三个公共ILD队列)、约540000个单细胞、25例空间转录组样本(19例IPF和6例对照)、博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1269 | 2026-10-07 |
Mesenchymal Stromal Cells Fuel Immunometabolic Reprogramming of Type 2 Conventional Dendritic Cells to Alleviate Systemic Sclerosis
2026-Oct-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70359
PMID:42834011
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研究论文 | 该研究通过前瞻性临床试验结合多组学分析,揭示了间充质基质细胞通过修复2型常规树突状细胞的氧化磷酸化缺陷,实现免疫代谢重编程,从而缓解系统性硬化症 | 首次揭示间充质基质细胞通过靶向修复2型常规树突状细胞的内在氧化磷酸化缺陷,实现免疫代谢重编程以恢复免疫稳态,从而缓解系统性硬化症 | 单细胞RNA-seq样本量较小(n=2),且基线疾病相关特征主要依赖公共数据集定义,需要更大规模的验证研究 | 探究间充质基质细胞治疗系统性硬化症的临床疗效及其潜在机制 | 系统性硬化症患者及外周血单个核细胞 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 蛋白质组学, 代谢组学, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 蛋白质组学n=7,代谢组学n=7,批量RNA-seq n=6,单细胞RNA-seq n=2,公共数据集PBMC 21例SSc vs 6例健康供者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 1270 | 2026-10-07 |
CellART: a unified framework for extracting single-cell information from high-resolution spatial transcriptomics
2026-Oct-05, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-01054-1
PMID:42834230
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研究论文 | 该文章提出了CellART,一个从高分辨率空间转录组学数据中提取单细胞信息的统一框架,通过整合深度学习和概率建模,同时实现细胞分割和细胞类型注释 | 第一个能够跨多种高分辨率空间转录组学平台统一提取单细胞信息的框架,通过整合染色图像、空间转录组数据和单细胞RNA测序参考等多模态数据,同时进行细胞分割和细胞类型注释 | 摘要中未明确提及该框架的具体局限性 | 从高分辨率空间转录组学数据中全面提取单细胞信息,解决现有平台转录本计数稀疏或测量基因数量有限的问题 | 高分辨率空间转录组学数据,包括染色图像、空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 深度学习,概率建模 | 图像,文本 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1271 | 2026-10-07 |
Once yearly cell-based therapy for sustained and dose-tunable delivery of monoclonal antibodies
2026-Oct-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aej5440
PMID:42826187
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研究论文 | 本文开发了一种免疫调节、封装式细胞基“生物制品工厂”,通过单次给药即可持续原位生产治疗性单克隆抗体,维持一年以上的稳定血清滴度 | 开发了免疫调节性海藻酸盐生物材料配方,克服了抗体不稳定性、免疫原性及纤维化异物反应,实现了单次给药后长达一年的持续抗体递送,并可整合到可回收宏装置中实现按需终止和剂量比例调节 | 研究主要在小鼠和非人灵长类中进行,尚未开展人体临床试验,长期安全性和有效性仍需进一步验证 | 开发一种可临床转化的细胞基递送平台,以替代频繁注射的单克隆抗体给药方式 | 免疫competent小鼠、非人灵长类动物 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌, 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1272 | 2026-10-07 |
Leptin-sensitive hypothalamic Lepr+/Glp1r+ neurons limit hyperphagia and weight gain in diet-induced obesity
2026-Oct-02, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00914-w
PMID:42827204
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研究论文 | 结合空间转录组学与单核RNA测序,在小鼠饮食诱导肥胖模型中鉴定出一群对瘦素敏感的Lepr+/Glp1r+下丘脑神经元,该神经元群可抑制摄食并限制体重增加 | 首次通过空间转录组学与单核RNA测序联合分析,在饮食诱导肥胖小鼠下丘脑中鉴定出由Glp1r共表达定义的单一Lepr阳性神经元亚群,该亚群在肥胖状态下仍保持对瘦素的强敏感性;并揭示该神经元群通过投射并抑制促食欲的Agrp神经元来限制摄食和体重增加,同时意外发现其可影响下丘脑小胶质细胞激活 | 研究基于小鼠模型,结论是否适用于人类肥胖尚需进一步验证;研究主要聚焦于下丘脑特定神经元群,对其他脑区或外周瘦素敏感机制的探讨有限 | 探究在肥胖状态下仍对瘦素敏感并介导内源性瘦素抑制摄食作用的神经基础 | 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠的下丘脑瘦素受体(Lepr)阳性神经元 | 机器学习, 数字病理学 | 肥胖 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x Chromium | NA |
| 1273 | 2026-10-07 |
Regulatory-prior-guided attention preserves biological structure during unpaired single-cell RNA-ATAC integration
2026-Oct-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag696
PMID:42758136
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研究论文 | 提出 scHPGT,一种基于调控先验引导的 Transformer 模型,用于非配对单细胞 RNA 与 ATAC 数据的整合,在保持生物结构的同时实现模态对齐 | 采用模态特异性编码器、先验引导的跨模态 Transformer 约束基因-峰注意力、以及域对抗目标,在共享隐空间中对齐非配对 RNA 与 ATAC 数据,避免过度对齐生物学上不同的细胞状态 | 摘要中未明确提及局限性 | 解决非配对单细胞 RNA 与 ATAC 数据整合中特征空间、稀疏性和噪声差异带来的挑战,实现调控先验引导的整合并保持生物结构 | PBMC3k、小鼠脾脏、CITE-seq/ASAP-seq PBMC 和 PBMC10k 基准数据集中的单细胞 RNA 与 ATAC 图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞 RNA 测序、单细胞 ATAC 测序 | Transformer | 文本 | 涉及 PBMC3k、小鼠脾脏、CITE-seq/ASAP-seq PBMC 和 PBMC10k 等多个基准数据集 | 10x Genomics | 单细胞 RNA 测序、单细胞 ATAC 测序、CITE-seq、ASAP-seq | NA | NA |
| 1274 | 2026-10-07 |
The heterogeneity and sexual-dimorphism of human TCRαβ+CD4-CD8- double negative T cells
2026-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.04.008
PMID:42009279
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组、TCR库和染色质可及性分析,揭示了健康人外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的异质性和性别二态性 | 首次系统性地结合单细胞转录组、TCR库和染色质可及性多组学手段,全面刻画了人类外周血DNT细胞的异质性,并揭示了其性别二态性特征 | 样本量较小(仅10名健康供体),且对疾病状态下DNT细胞变化的分析依赖于公开数据,缺乏实验验证 | 解析人类外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的分子和功能特征,探讨其在免疫相关疾病中的作用 | 10名健康供体外周血中的TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞 | 单细胞组学 | 溃疡性结肠炎, 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, TCR序列数据 | 10名健康供体的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1275 | 2026-10-07 |
Common γ-chain cytokines induce an epigenomically plastic precursor-like KIT+ ILC2 state linked to immune disease susceptibility
2026-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.05.029
PMID:42309230
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研究论文 | 本文通过多组学分析(转录组和表观基因组)结合体外培养实验,揭示了KIT+ ILC2细胞具有前体样表观基因组,表现出增强的表型可塑性,并与免疫疾病易感性相关 | 首次定义了KIT+ ILC2细胞的分子基础,发现其具有前体样表观基因组特征,整合了表观基因组数据与人类主要免疫疾病的遗传风险变异,并确定了IL-2/IL-7通过STAT5激活诱导和维持KIT+表型的机制 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 定义KIT+ ILC2细胞增强可塑性的分子基础,识别诱导该表型的信号,并探索其与免疫疾病易感性的联系 | 人类KIT+和KITneg ILC2细胞以及多能ILC祖细胞 | 机器学习 | 哮喘、自身免疫性疾病、银屑病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 文本(转录组和表观基因组数据) | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 1276 | 2026-10-07 |
The clinical and molecular landscape of thalamic glioma
2026-Oct-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag146
PMID:42377275
|
研究论文 | 通过整合临床病理和多组学数据,分析106例丘脑胶质瘤的分子特征和手术管理 | 揭示了9p21缺失与H3F3A突变互斥,9p21缺失可作为非DMG的高度特异性辅助标志物;通过因果推断证明microsurgical third ventriculostomy可显著降低术后脑积水风险 | 未明确说明 | 通过整合临床病理和多组学数据,改进丘脑胶质瘤的分子诊断和手术管理 | 106例丘脑胶质瘤患者,包括65例弥漫性中线胶质瘤和41例非弥漫性中线胶质瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因组分析、单细胞RNA测序、正交测定 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 106例丘脑胶质瘤患者 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1277 | 2026-10-07 |
Single-cell multiomics gene regulatory landscape reveals impaired spermatogonial stem cells and macrophage-driven inflammaging during testicular aging
2026-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.005
PMID:42167485
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学,构建年轻与衰老小鼠睾丸的多组学衰老图谱,揭示精原干细胞损伤及巨噬细胞驱动的炎性衰老机制。 | 首次构建小鼠睾丸衰老的单细胞多组学图谱,将染色质可及性变化与转录失调关联,鉴定ZFX为早期生殖细胞中持续下调的转录因子,发现CD206H2-Eb1巨噬细胞通过分泌CXCL13驱动局部炎症并破坏精原干细胞微环境,并通过跨物种分析鉴定保守的衰老相关调控子如BRCA1和E2F1。 | 研究基于小鼠模型,其发现是否完全适用于人类睾丸衰老仍需进一步验证;样本仅涵盖年轻与衰老两个时间点,可能遗漏衰老过程中的动态变化;未进行ZFX和CXCL13的体内功能验证实验。 | 全面理解睾丸衰老的表观遗传驱动因素,揭示精原干细胞损伤和巨噬细胞驱动的炎性衰老机制,为缓解年龄相关生殖衰退提供潜在治疗靶点。 | 年轻和衰老小鼠的睾丸组织 | 单细胞多组学、空间转录组学 | 生殖衰老、男性生殖健康衰退 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞表观遗传数据、空间转录组数据 | 年轻和衰老小鼠的睾丸组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序、10x Chromium单细胞ATAC测序、10x Visium空间转录组学 |
| 1278 | 2026-10-07 |
Spatial biology in cancer epigenetics
2026-Oct, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70310
PMID:42487511
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综述 | 本文综述了空间表观基因组学技术(包括空间ATAC-seq、空间CUT&Tag、空间CUT&RUN、空间DNA甲基化分析及多模态策略)在癌症研究中的应用现状与前景 | 系统性地总结了空间表观基因组学这一新兴领域的技术全景,涵盖染色质可及性、组蛋白修饰和DNA甲基化的空间检测方法,并提出了整合表观遗传、转录和蛋白质组信息的多模态策略 | 空间表观基因组学仍面临技术和计算方面的挑战,尚未完全成熟 | 探讨空间表观基因组学技术在癌症表观遗传学研究中的应用,包括在保留组织结构的前提下研究染色质可及性、组蛋白修饰和DNA甲基化 | 癌症组织及肿瘤微环境 | 空间表观基因组学 | 癌症 | 空间ATAC-seq、空间CUT&Tag、空间CUT&RUN、空间DNA甲基化分析、多模态整合策略 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、空间ATAC-seq、空间CUT&Tag、空间CUT&RUN、空间DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 1279 | 2026-10-07 |
Membrane depolarization drives tumor-suppressive cell competition via hedgehog signaling activation
2026-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.010
PMID:42190941
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研究论文 | 该研究结合果蝇遗传学、单细胞RNA测序和哺乳动物共培养模型,揭示膜去极化通过激活Hedgehog信号驱动肿瘤抑制性细胞竞争 | 首次揭示膜电位去极化通过稳定Smoothened蛋白、异常激活Hedgehog信号来驱动肿瘤抑制性细胞竞争,并发现果蝇与哺乳动物上皮细胞中该机制高度保守 | 研究主要基于果蝇眼上皮和MDCK细胞系模型,缺乏人类原发肿瘤样本或体内哺乳动物模型的直接验证 | 探究质膜电位在肿瘤抑制性细胞竞争中的机制作用及其与Hedgehog信号通路的关联 | 果蝇眼上皮中scribble缺陷的loser克隆以及Scrib敲低的Madin-Darby犬肾细胞 | 细胞生物学、肿瘤生物学 | 泛癌种(癌症预防与监测) | 单细胞RNA测序、果蝇遗传学、哺乳动物细胞共培养 | 果蝇遗传模型、MDCK细胞共培养模型 | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1280 | 2026-10-07 |
Phase I Trial of GPC3-Targeted TCR Fusion Construct, CT0180, in Patients with Advanced Hepatocellular Carcinoma
2026-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-26-1084
PMID:42531433
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研究论文 | 该研究报道了靶向GPC3的TCR融合构建体CT0180在晚期肝细胞癌患者中的I期临床试验结果 | CT0180是一种将GPC3靶向单链可变区片段与CD3ε连接的新型TCR融合构建体,可整合入天然TCR复合物并在GPC3结合后激活完整TCR信号 | 样本量小(仅7例患者),为开放标签、剂量递增的I期试验,缺乏对照组,初步疗效需进一步验证 | 评估CT0180在晚期GPC3阳性肝细胞癌患者中的安全性、初步疗效及细胞药代动力学 | 经标准治疗进展或不耐受的晚期GPC3阳性肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 文本, 图像 | 7例患者,共接受15次输注 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |