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当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 1261 - 1280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1261 2026-01-13
Single-cell transcriptomics reveals the landscape of immune phenotypes in pituitary neuroendocrine tumors
2026-Jan-09, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了垂体神经内分泌肿瘤中免疫表型的异质性及细胞间通讯网络 首次在单细胞水平上系统描绘了三种主要PitNET谱系(PIT1、SF1、TPIT)中免疫细胞组成的差异,并鉴定出由CTLA4-CD86通路介导的Treg细胞与巨噬细胞/小胶质细胞之间新的免疫抑制性相互作用 样本量相对有限(22例),且为单中心研究,可能影响结果的普适性 阐明垂体神经内分泌肿瘤的免疫异质性及肿瘤微环境中的细胞间通讯网络 22例来自手术患者的新鲜垂体神经内分泌肿瘤样本 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序,多重免疫组化,流式细胞术,体外共培养实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 22例新鲜PitNET样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1262 2026-01-13
Single-cell transcriptome analysis of patient-derived organoids captures inter- and intratumor heterogeneity and uncovers targetable pathways in high grade serous ovarian cancer
2026-Jan-08, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析患者来源的类器官,揭示了高级别浆液性卵巢癌的肿瘤间和肿瘤内异质性,并识别了可靶向的治疗通路 首次在患者来源的类器官模型中利用单细胞转录组学全面表征高级别浆液性卵巢癌的细胞异质性,并发现化疗耐药性与氧化磷酸化代谢转换的关联,以及化疗诱导的MHC-II上调作为免疫治疗新靶点 研究样本量有限,仅基于类器官模型和少量患者样本,未进行大规模临床验证 表征高级别浆液性卵巢癌患者来源类器官的细胞异质性,并探索化疗耐药性的潜在机制和可靶向脆弱性 高级别浆液性卵巢癌患者来源的类器官、腹水来源的卵巢癌细胞以及独立患者的组织样本 数字病理学 卵巢癌 单细胞转录组学、免疫组织化学分析、化疗处理实验 NA 单细胞转录组数据、组织图像数据 来自铂耐药和铂敏感高级别浆液性卵巢癌患者的活检样本衍生的类器官,以及独立患者的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1263 2026-01-13
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究首次证明通过吸烟或鼻吸方式摄入可卡因的个体存在口腔微生物失调及选择性口腔-血液微生物易位 首次在人体中证实可卡因使用障碍(CUD)通过吸烟或鼻吸方式导致口腔微生物失调及选择性口腔-血液微生物易位,并发现口腔屏障受损(而非可卡因本身)是免疫紊乱的主要驱动因素 样本量较小(10例CUD患者,24例对照),横断面研究设计无法确定因果关系 探究口腔是否为可卡因使用障碍患者循环微生物DNA易位的来源 可卡因使用障碍患者(CUD)及人口统计学匹配的非药物对照组 微生物组学 物质使用障碍 16S rRNA V4区测序,单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 微生物DNA序列,单细胞转录组数据 10例可卡因使用障碍患者,24例非药物对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1264 2026-01-13
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff,用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 通过连续去噪和语义特征整合,Squidiff能够学习瞬时细胞状态并预测高分辨率的转录组景观 NA 预测细胞发育和对扰动的响应,以揭示细胞命运决定的调控原则 细胞分化、基因扰动和药物响应预测,以及血管类器官发育和细胞对中子辐射及生长因子的响应 机器学习 NA 单细胞测序 扩散模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1265 2026-01-13
Lipidomics and single-cell transcriptomics uncover aberrant lipid metabolism in metaplasia lesions during gastric carcinogenesis
2026-Jan, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过脂质组学和单细胞转录组学分析,揭示了胃黏膜肠化生病变中异常的脂质代谢特征,特别是甘油三酯和脂滴的积累,并探索了靶向脂质代谢的治疗潜力 首次结合脂质组学和单细胞转录组学技术,系统揭示了胃黏膜肠化生病变中独特的脂质代谢特征,并利用基因敲除小鼠模型和患者来源的类器官模型验证了靶向脂质代谢通路(如DGAT1)的治疗效果 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本,需要在更大规模的人群队列中验证脂质代谢标志物的临床意义和治疗靶点的有效性 阐明胃黏膜肠化生在胃癌发生过程中的脂质代谢特征,并探索靶向脂质代谢的预防和治疗策略 幽门螺杆菌感染的Ddit4基因敲除小鼠、人类胃黏膜肠化生组织、慢性非萎缩性胃炎组织、患者来源的胃癌类器官 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、脂质组学分析、免疫组织化学、免疫荧光、BODIPY染色 NA 单细胞转录组数据、脂质组学数据、组织图像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型、人类组织样本和类器官模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1266 2026-01-13
Meta single-cell atlas and xQTL post-GWAS analysis revealed the pathogenic features of thyroid cancer for target therapy: A multi-omics study
2026-Jan, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究整合单细胞转录组学、批量转录组学和GWAS数据,通过多组学方法揭示甲状腺癌的致病特征,并构建机器学习模型用于疾病预测 首次结合单细胞图谱、xQTL后GWAS分析和多机器学习建模,系统识别甲状腺癌的致病基因和免疫亚型,并开发交互式网页应用 未明确说明样本来源的种族或地理多样性,可能影响结果的普适性 识别甲状腺癌的致病基因特征和免疫微环境,开发诊断预测模型 甲状腺癌患者样本 数字病理学 甲状腺癌 单细胞转录组学, 批量转录组学, GWAS, 免疫组化 多机器学习建模(包括glmBoost, RF等) 转录组数据, 遗传数据, 图像数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1267 2026-01-13
Lung Microphysiological System Validates Novel Cell Therapy for Acute Respiratory Distress Syndrome
2026-Jan, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究开发了一种新型肺微生理系统来模拟急性呼吸窘迫综合征(ARDS)环境,并评估了人脐带血来源的间充质干细胞(hUCB-pMSCs)作为潜在替代疗法的疗效 开发了一种新型肺微生理系统(MPS)来模拟ARDS环境,并首次将hUCB-pMSCs与地塞米松在该系统中进行比较评估 研究基于体外微生理系统模拟,可能无法完全复制体内复杂的生理环境 评估hUCB-pMSCs作为ARDS替代治疗方法的疗效 人脐带血来源的间充质干细胞(hUCB-pMSCs)和地塞米松在模拟ARDS的肺微生理系统中的治疗效果 数字病理学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序,荧光成像 NA 图像,测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1268 2026-01-13
Single cell transcriptional profiling of monocytes from asthma patients show a predisposition for an inflammatory response
2026-Jan, Cytotherapy IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析比较了哮喘患者和健康对照者血液单核细胞的基因表达差异,并评估了γMSCs输注对哮喘患者单核细胞转录组的影响 首次在单细胞水平上揭示了哮喘患者单核细胞对干扰素反应的增强倾向,并展示了γMSCs输注能显著改变单核细胞的基因表达谱,包括降低HLA I类和干扰素信号通路基因的表达 样本量相对较小,且研究仅基于单次γMSCs输注后的观察,缺乏长期随访数据 比较哮喘患者与健康对照者血液单核细胞的转录组差异,并评估γMSCs治疗对哮喘患者单核细胞转录组的影响 哮喘患者和健康对照者的血液单核细胞 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包括哮喘患者(严重和轻度)和健康对照者的血液单核细胞样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1269 2026-01-13
Scaling Large Language Models for Next-Generation Single-Cell Analysis
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文基于Cell2Sentence框架,通过训练大型语言模型整合单细胞转录组数据与文本信息,以提升单细胞分析的预测和生成能力 首次将大型语言模型扩展至270亿参数规模,用于单细胞分析,实现了转录组与文本数据的统一处理,并支持多细胞上下文信息合成 模型在训练期间未接触的人类细胞模型中的实验验证有限,可能影响泛化能力 开发可扩展的单细胞分析平台,整合转录组和文本数据以支持下一代单细胞研究 单细胞RNA测序数据、生物文本和元数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大型语言模型 文本 超过十亿个转录组数据、生物文本和元数据标记 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1270 2026-01-13
Single-cell transcriptomics reveals dynamics of natural killer cell expansion in a feeder cell-free culture of peripheral blood mononuclear cells-implications for immunotherapy
2026-Jan, Cytotherapy IF:3.7Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析外周血单个核细胞在无饲养细胞培养中自然杀伤细胞扩增的动态变化,为免疫治疗提供新见解 首次在无饲养细胞培养系统中,通过单细胞转录组学揭示NK细胞扩增的早期(培养第3至8天)关键影响因素,并识别出与CCL信号通路相关的潜在生物标志物 研究仅基于三个供体样本,样本量较小,可能限制结果的普遍性 探究影响供体间NK细胞体外扩增变异性的因素,以优化免疫治疗中的NK细胞供应 外周血单个核细胞(PBMCs)及其在体外培养中扩增的自然杀伤细胞 单细胞转录组学 癌症 单细胞转录组测序 轨迹推断和差异基因表达分析 单细胞RNA测序数据 三个供体的外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1271 2026-01-13
Identification of cancer-associated fibroblasts and analysis of the association of origin with endothelial-to-mesenchymal transition in hepatocellular carcinoma
2026-Jan, Scandinavian journal of gastroenterology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过免疫组织化学和空间转录组学技术,探讨了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其与内皮-间质转化的关联 首次结合Visium和Visium HD空间转录组学技术,揭示了内皮细胞通过EndoMT转化为CAFs的潜在机制,并识别了CTGF作为关键分子决定因素 样本量较小(仅57例HCC组织),且研究主要基于相关性分析,缺乏直接的体内功能验证 探究肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的细胞起源和分子决定因素,以期为分子靶向治疗提供依据 肝细胞癌组织中的癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 数字病理学 肝细胞癌 免疫组织化学染色、免疫荧光双染色、空间转录组学 NA 图像、空间转录组数据 57例肝细胞癌组织样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Visium HD Visium和Visium HD空间转录组学平台
1272 2026-01-13
Restoring NR4A3 function in neutrophils alleviates sepsis by limiting NF-κB-dependent NETs formation and organ damage
2026-Jan, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了孤儿核受体NR4A3在脓毒症中通过抑制中性粒细胞NF-κB信号通路,减少NETs形成和器官损伤的保护作用 首次阐明NR4A3通过调控NF-κB信号通路抑制中性粒细胞NETosis在脓毒症中的具体机制,并证明其治疗潜力 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床转化需进一步验证;未深入探讨NR4A3下游具体靶基因 阐明NR4A3在脓毒症中性粒细胞NETosis中的功能及治疗潜力 脓毒症患者外周血单个核细胞、ATRA分化的HL-60中性粒细胞细胞系、CLP诱导的脓毒症小鼠模型 单细胞转录组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、组织病理学数据 来自GEO数据库的GSE175453和GSE167363数据集(脓毒症患者和对照者PBMCs)、细胞实验、小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1273 2026-01-13
LIMPACAT: Multi-omics attention transformer for immune prediction in liver cancer using whole-slide imaging
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为LIMPACAT的深度学习框架,利用全玻片图像预测肝细胞癌中的免疫细胞水平 提出了一种结合多组学注意力的Transformer模型,首次使用全玻片图像直接预测肝癌免疫微环境中的细胞组成 研究依赖于TCGA-LIHC数据集,该数据集缺乏直接的免疫细胞组成数据,需通过反卷积方法推断 开发一个深度学习框架,从组织病理学图像中预测肝癌的免疫细胞水平,以支持预后评估和个性化治疗 肝细胞癌(HCC)的全玻片图像和相关的免疫细胞组成数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,反卷积方法,多重实例学习 注意力Transformer,深度学习 图像,RNA-seq数据 基于TCGA-LIHC数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1274 2026-01-13
Spatial and single-cell transcriptomics landscape of adenomyosis
2025-Dec-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,深入解析了子宫腺肌症的细胞和分子特征,并评估了促性腺激素释放激素激动剂治疗的影响 首次在单细胞和空间转录组学水平上全面描绘了子宫腺肌症的细胞景观,揭示了纤毛上皮细胞和免疫-血管生成互作在疾病发病机制中的关键作用,并阐明了GnRHa治疗的作用机制 样本量相对较小,且主要基于转录组数据,需要进一步的功能实验验证 解析子宫腺肌症的病因和细胞分子机制,并评估GnRHa治疗的效果 子宫腺肌症患者和健康对照者的子宫组织样本 数字病理学 子宫腺肌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 图像数据 15名参与者用于测序分析(11名患者和4名对照),额外13名参与者用于验证(11名患者和2名对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1275 2026-01-13
The Role of Metabolites in Cell-Cell Communication: A Review of Databases and Computational Tools
2025-Dec-26, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了用于识别代谢物介导的细胞间通讯的现有数据库和计算工具,并讨论了当前局限性与未来改进方向 系统总结并批判性评估了基于scRNA-seq数据的代谢物介导细胞间通讯的数据库与计算工具,并提出了结合空间组学和人工智能的未来发展方向 现有数据库因缺乏统一标准而变异性大,计算工具多从通用CCC推断方法改编,未能充分捕捉代谢物与其传感器间复杂的互作机制 总结和评估用于推断代谢物介导细胞间通讯的数据库与计算工具,以促进该领域的方法学发展 代谢物介导的细胞间通讯及其相关数据库与计算工具 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA scRNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1276 2026-01-13
B-cell lymphocytosis and reprogramming due to biallelic CARD11 mutations
2025-Dec-26, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本文报告了一种由新型CARD11突变R331P纯合子引起的BENTA疾病新遗传基础,其特征为B细胞大量扩增并伴有异常转录程序 首次发现由CARD11 R331P纯合突变引起的常染色体隐性遗传BENTA疾病,揭示了B细胞扩增和重编程的新机制 研究基于单个患者样本,需要更多病例验证;突变对B细胞淋巴瘤发生机制的具体影响仍需进一步探索 探究BENTA疾病的遗传基础及其对B细胞增殖和功能的分子机制 携带CARD11 R331P纯合突变的BENTA患者样本及体外表达的T和B细胞 免疫学 B细胞淋巴增殖性疾病 全外显子组测序,流式细胞术,质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,体外细胞功能实验 NA 基因组数据,转录组数据,细胞表型数据 单个患者样本及对照样本 NA 单细胞RNA测序,全外显子组测序 NA NA
1277 2026-01-13
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为STARIT的新方法,它将成像空间转录组学数据转换为图像张量表示,以利用亚细胞异质性识别细胞类型和状态 STARIT创新地将imSRT数据中的转录本转换为图像张量表示,结合深度学习计算机视觉模型,首次实现了基于亚细胞转录定位的细胞状态识别,克服了传统基因计数方法的局限 方法依赖于模拟数据和真实imSRT数据的验证,但未明确说明在更广泛数据集或不同技术平台上的泛化能力,且可能受细胞分割质量的影响 开发一种新方法来利用成像空间转录组学数据中的亚细胞分子异质性,以更精确地识别和表征细胞类型和状态 成像空间转录组学数据中的细胞及其亚细胞转录本分布 计算机视觉 NA 成像空间转录组学 深度学习计算机视觉模型 图像张量 NA NA 成像空间转录组学 NA NA
1278 2026-01-13
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals distinct tumor microenvironment dynamics in cervical adenocarcinoma and squamous cell carcinoma
2025-Dec-19, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了宫颈腺癌和鳞状细胞癌之间不同的肿瘤微环境动态特征 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统比较了宫颈癌两种主要组织学亚型的细胞和空间异质性,并发现了亚型特异性的免疫和基质特征 未明确说明样本的具体数量,且研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 解析宫颈癌不同组织学亚型的肿瘤微环境异质性,为开发亚型特异性治疗策略提供依据 宫颈腺癌和鳞状细胞癌组织 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1279 2026-01-13
AI-driven virtual cell models in preclinical research: technical pathways, validation mechanisms, and clinical translation potential
2025-Dec-11, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
综述 本文综述了AI驱动的虚拟细胞模型在临床前研究中的技术路径、验证机制及临床转化潜力 通过整合多模态组学数据与深度生成模型、图神经网络等先进算法,构建高精度预测药物反应、基因扰动和疾病进展的虚拟细胞模型,并强调从计算评估到CRISPR检测和类器官平台实验验证的闭环工作流程 在监管接受度、数据隐私和模型可解释性方面仍面临挑战 探讨AI驱动的虚拟细胞模型在生命科学研究中的技术路径、验证机制及其在精准医疗和药物发现中的临床转化潜力 虚拟细胞模型及其在药物筛选和疾病建模中的应用 机器学习 NA 单细胞转录组学、蛋白质组学、CRISPR检测 深度生成模型、图神经网络 多模态组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq、单细胞蛋白质组学 NA NA
1280 2026-01-13
AI-based Predictive Signaling Pathway Profiling in Cardiac Fibrosis Suggests a Novel Combinatorial Treatment Strategy
2025-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用人工智能分析心脏纤维化相关文献,结合单细胞RNA测序数据,揭示了JAK-STAT和TGF-β信号通路在急慢性心脏损伤中的动态作用,并提出了一种基于时序的组合治疗策略 首次利用AI模型从大量文献中预测心脏纤维化的关键信号通路,并通过单细胞分析验证了致病性肌成纤维细胞亚群,提出了一种时序差异性的JAK-STAT与TGF-β联合抑制新策略 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,AI模型的预测依赖于历史文献数据,可能无法涵盖所有未知机制,且联合治疗策略的临床转化效果仍需进一步验证 探索心脏纤维化的关键信号通路机制,并开发更有效的治疗策略以减轻病理性纤维化而不影响急性损伤后的代偿性瘢痕形成 小鼠心脏纤维化模型(急性心肌梗死和慢性横向主动脉缩窄)及临床心脏损伤样本 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,动态富集分析,基因敲除技术 AI预测模型 文本(文献数据),基因表达数据 基于过去十年6,528篇心脏纤维化出版物训练的AI模型,以及小鼠模型和临床样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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