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当前共找到 41796 篇文献,本页显示第 1241 - 1260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1241 2026-07-03
Identification and characterization of CXCL13 producers in bone tissue in response to fasting
2026-Jul-01, International immunology IF:4.8Q2
研究论文 本研究鉴定了禁食状态下骨组织中CXCL13的细胞来源及其上游调控信号,揭示了成骨间充质基质细胞通过TGF-β和PPAR信号通路调控幼稚B细胞迁移的机制 首次明确成骨间充质基质细胞是禁食状态下骨组织中CXCL13的主要来源,并发现TGF-β和PPAR信号通路参与调控其表达 未详细阐明TGF-β和PPAR信号通路上下游的具体分子机制,且实验仅在动物模型中进行 阐明禁食状态下骨组织中CXCL13的细胞来源及其表达调控机制 小鼠骨组织及其中的免疫细胞和基质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、免疫荧光成像、药理学干预 NA 基因表达数据、图像 小鼠骨组织样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
1242 2026-07-03
TRIAGE Toolkit: Streamlined Discovery of Regulatory Genes and Elements
2026-Jul, Current protocols
研究论文 TRIAGE工具包提供了一组计算流程,用于从多种输入数据中发现调控基因和元件 将多种TRIAGE方法集成为统一工具包,支持批量与单细胞RNA-seq分析,并提供跨平台的R和Python实现 未明确提及,但仅依赖基因表达和遗传变异数据,可能无法覆盖所有调控机制 简化调控基因和元件的发现过程 调控基因、调控元件、长非编码RNA、功能遗传变异 机器学习 不适用 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析 不适用 基因表达矩阵, 基因列表, 基因组位点 不适用 不适用 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
1243 2026-07-03
Hyperlactataemia in lymphoma-associated haemophagocytic lymphohistiocytosis: Linked to monocytic glycolysis and adverse prognosis
2026-Jul-01, British journal of haematology IF:5.1Q1
研究论文 通过多组学整合分析揭示淋巴瘤相关噬血细胞性淋巴组织细胞增多症中单核细胞糖酵解增强与高乳酸血症及不良预后的关联 首次通过单细胞RNA测序、代谢组学和临床分析多维度整合,发现LAHS中PTTG1单核细胞亚群特异性的糖酵解增强和高乳酸血症作为独立预后标志物,并揭示血小板反应蛋白信号通路与糖酵解的关联 摘要未明确提及研究局限性,可能包括样本量较小(尤其是单细胞测序样本仅9例)和未进行功能验证实验 阐明淋巴瘤相关噬血细胞性淋巴组织细胞增多症与非淋巴瘤相关类型的病理差异及其预后标志物 新诊断淋巴瘤相关HLH患者、非淋巴瘤相关HLH患者和健康对照的外周血样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序、代谢组学分析 NA 基因表达数据、代谢物数据、临床生存数据 单细胞测序组9例(4例LAHS、3例NLAHS、2例NC);代谢组学39例(21例LAHS、11例NLAHS、7例NC);临床预后分析84例 NA 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学 NA NA
1244 2026-07-03
Neutrophils From Aged Individuals Release NETs to Impair Oral Wound Healing Through NLRP3 Activation
2026-Jul-01, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 研究老年个体中性粒细胞胞外陷阱(NETs)通过NLRP3炎症小体激活损害口腔伤口愈合的机制 首次揭示NETs通过激活NLRP3炎症小体抑制成纤维细胞功能从而加重老年口腔伤口愈合延迟 未明确NETs-NLRP3通路在其他组织老化相关损伤中的普适性 探究老年个体口腔伤口愈合受损的机制,重点关注NETs和NLRP3炎症小体的作用 年轻与老年小鼠的口腔黏膜及人单细胞RNA测序数据 数字病理学 老年性疾病 免疫组化、RNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 图像、文本 年轻和老年小鼠群体及人单细胞RNA测序数据样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1245 2026-07-03
LOTR-Seq: A protocol for large-scale simultaneous single-cell long-read genotyping of transcripts
2026-Jul-01, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 提出LOTR-Seq协议,结合短读全转录组分析与长读基因分型,用于大规模同步单细胞长读转录本基因分型 首次将短读与长读测序结合用于单细胞转录组变异检测,实现大规模同步分析 未提及具体局限性,但可能涉及通量或成本限制 开发一种协议,用于单细胞水平上同时进行全转录组分析和突变热点基因分型 人类骨髓造血干细胞 数字病理学 血液疾病 单细胞RNA测序、长读测序、靶向富集 NA RNA序列数据 人类骨髓样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq、长读测序 NA NA
1246 2026-07-03
stDGCN: A dual-augmentation graph convolutional network for identifying spatial domains with attention mechanism
2026-Jul-01, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出一种双增强图卷积网络stDGCN,结合注意力机制和零膨胀负二项解码器,实现空间转录组数据的稳健空间域识别 创新性提出双增强策略,结合空间邻域增强和高斯扰动生成多样化的基因表达视图;采用注意力融合模块自适应整合原始和空间增强嵌入;引入零膨胀负二项解码器处理数据稀疏性和过度离散性 未明确说明局限性,但可能涉及计算复杂度较高、对大规模数据集的适用性需进一步验证 开发稳健的空间域识别方法,以提高空间转录组数据分析的准确性和鲁棒性 空间转录组数据中的空间域区域 机器学习 NA 空间转录组学 图卷积网络(GCN)、注意力机制、零膨胀负二项解码器 基因表达数据、空间坐标数据 6个空间转录组数据集,包括人脑、乳腺癌、小鼠视觉皮层、小鼠脑和胚胎数据 NA 空间转录组学 NA NA
1247 2026-07-03
Hypoxia-driven T cell-macrophage-stromal cross-talk sustains fibrosis in preclinical models of cutaneous chronic graft-versus-host disease
2026-Jul, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究揭示了缺氧驱动的T细胞-巨噬细胞-基质细胞相互串扰在皮肤慢性移植物抗宿主病纤维化中的作用机制 首次在慢性移植物抗宿主病中发现HIF-1α-PI3Kδ-IL-13信号轴介导的缺氧驱动炎症与纤维化程序 未提及具体局限性 阐明皮肤慢性移植物抗宿主病纤维化的缺氧驱动机制并探索治疗靶点 慢性移植物抗宿主病患者的皮肤组织、人类表皮细胞系、诱导多能干细胞衍生皮肤类器官及小鼠模型 数字病理学 慢性移植物抗宿主病 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 NA 图像、文本 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1248 2026-07-03
Endozoicomonas acroporae enhances coral thermal resilience through host-microbe coordination
2026-Jul-01, The ISME journal
研究论文 建立Endozoicomonas acroporae Acr-14T作为珊瑚益生菌,并表征其对造礁珊瑚Stylophora pistillata热耐受性的增强作用及宿主-微生物协调机制 首次在体内证明Endozoicomonas acroporae作为珊瑚益生菌能增强宿主热耐受性,并结合染色体级别基因组和单细胞转录组揭示细胞类型特异性的宿主响应机制 益生菌处理对机会性微生物相对丰度的降低和潜在有益类群的富集仅基于微生物谱分析,具体因果机制仍需进一步验证 阐明益生菌Endozoicomonas acroporae增强珊瑚热胁迫下恢复力的分子机制 造礁珊瑚Stylophora pistillata及其共生细菌Endozoicomonas acroporae Acr-14T 微生物学、生态学 珊瑚热应激 益生菌处理、基因组组装、单细胞转录组学、微生物谱分析 无特定模型 基因组序列、单细胞转录组数据、微生物组数据 Stylophora pistillata珊瑚样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组学用于分析胃皮层细胞的基因表达变化
1249 2026-07-03
Cross-Platform Gene Signature to Predict Survival Outcomes for Nasopharyngeal Carcinoma
2026-Jul, JCO precision oncology IF:5.3Q1
研究论文 基于跨平台基因签名预测鼻咽癌生存预后的研究 首次建立并验证了一个5基因签名(SPP1, IL18BP, PALMD, WDR35和SOCS6),可在不同转录组平台间稳定预测局部晚期鼻咽癌患者预后,且优于已有转移相关模型 作为回顾性研究,样本量有限,可能数据未涵盖所有相关基因签名 开发并验证一个基于基因表达的预后签名,用于局部晚期鼻咽癌的个体化治疗风险分层 局部晚期鼻咽癌患者 机器学习 鼻咽癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO-Cox回归 基因表达数据, 单细胞基因表达数据 发现队列99例(NPC-0501试验),验证队列133例(香港伊利沙伯医院和中山大学肿瘤防治中心) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1250 2026-07-03
A salivary protein panel for detecting malignant transformation of oral leukoplakia
2026-Jul-01, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 本文通过基于质谱的唾液蛋白质组学分析和机器学习,鉴定了一个五蛋白唾液标志物组合,用于检测口腔白斑的恶性转化 首次利用唾液蛋白质组学数据结合XGBoost和LASSO回归,开发出基于MMP1、SUMO4、SMS、TMBIM1和MUC5AC的五蛋白标志物组合,并在多个独立队列和单细胞RNA测序数据中验证其生物学相关性 研究样本量中等,且缺乏对不同阶段OLK恶性转化的纵向跟踪数据,需进一步在更大前瞻性队列中验证标志物的临床实用性 探索唾液蛋白质组学作为非侵入性方法用于检测口腔白斑向口腔鳞状细胞癌的恶性转化 48名口腔白斑患者和83名OLK相关口腔鳞状细胞癌患者的唾液样本 机器学习, 数字病理学 口腔癌, 口腔白斑 质谱, 单细胞RNA测序 XGBoost, LASSO回归 蛋白质组学数据, 单细胞转录组数据 131个唾液样本(48个OLK和83个OLK-OSCC),18个小鼠模型样本,39个独立OSCC组织样本 NA 质谱, 单细胞RNA测序 NA NA
1251 2026-07-03
BulkFormer: A large-scale foundation model for bulk transcriptomes
2026-Jul-01, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 提出了BulkFormer,一个面向批量转录组的大规模基础模型,涵盖20,010个蛋白质编码基因并在581,503个人类批量RNA-seq数据上预训练 首次针对批量转录组模式设计基础模型,使用混合编码器结合图神经网络和Performer模块,在五个下游任务中优于单细胞基础模型且训练成本更低 未提及局限性信息 开发适用于批量转录组分析的基础模型,解决单细胞RNA-seq数据稀疏性导致的转录组建模不足问题 人类批量RNA-seq数据及基因表达关系 机器学习 NA 批量RNA-seq 混合编码器(图神经网络 + Performer) 批量转录组数据 581,503个人类批量RNA-seq样本 NA 批量RNA-seq NA NA
1252 2026-07-03
Ultraviolet B-induced oxidative stress drives stromal remodeling and malignant transformation of actinic keratosis via a podoplanin-C-type lectin-like receptor 2 signaling axis
2026-Jul-01, Free radical biology & medicine
研究论文 通过整合多组学分析揭示紫外线B诱导氧化应激通过PDPN-CLEC-2信号轴驱动光线性角化病恶性转化的机制 首次发现角质形成细胞来源的PDPN通过与成纤维细胞上的CLEC-2相互作用触发基质重塑,建立了氧化应激与光线性角化病恶性转化之间的直接分子联系,并鉴定出以PDPN为中心的12基因诊断和预后特征 未在体内模型中验证PDPN-CLEC-2轴作为药物靶点的临床可行性,且可能遗漏其他非编码RNA或表观遗传调控机制 阐明紫外线B诱导的氧化应激如何通过特定信号通路驱动光线性角化病恶性转变为皮肤鳞状细胞癌的分子机制 光线性角化病患者的皮肤组织样本、角质形成细胞和成纤维细胞 数字病理学 皮肤癌 Bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 六个独立队列,包含正常皮肤、光线性角化病和皮肤鳞状细胞癌样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒和Illumina NovaSeq平台用于测序
1253 2026-07-03
Anti-CCL2-conjugated platelets attenuate early allograft and ischemia-reperfusion injury by inhibiting monocyte infiltration
2026-Jul-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过转录组测序和单细胞测序技术发现趋化因子CCL2是早期同种异体移植功能障碍的关键分子,并开发了一种基于血小板的药物递送系统(PLT-aCCL2)以抑制单核细胞浸润、减轻炎症损伤和急性排斥反应 首次报道血小板可将抗CCL2抗体定向递送至肝脏移植物,打破CCL2-CCR2+单核细胞信号通路驱动的免疫-炎症级联反应,并证明PLT-aCCL2能通过减少髓系细胞与T细胞相互作用来缓解急性细胞排斥反应 研究主要基于临床队列和动物模型,未在大型临床随机对照试验中验证治疗效果;血小板制剂的长期安全性和稳定性有待进一步评估 阐明肝脏移植后早期炎症损伤和排斥反应的关键驱动机制,并开发靶向干预策略 接受肝脏移植的患者及原位肝移植小鼠模型 数字病理学 肝脏疾病 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 基因表达数据 临床队列和原位肝移植小鼠模型 Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq Illumina NovaSeq bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq测序平台
1254 2026-07-03
Anserine restores antibacterial immunity in cirrhosis via a protective CCL5-mediated hepatocyte-CD44+pDC crosstalk
2026-Jul-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 小鼠肝脏单细胞RNA测序发现肝硬化中一种保护性CCL5介导的肝细胞-CD44+浆细胞样树突状细胞串扰被破坏,鹅肌肽通过恢复该轴增强抗菌免疫 首次揭示鹅肌肽-CCL5-pDC-巨噬细胞代谢-免疫轴在肝硬化中受损,并证明鹅肌肽补充可恢复该轴以降低感染风险 研究主要在动物模型中进行,人类数据虽来自多中心队列但样本量有限,且机制验证依赖于多种体外和体内实验,尚未直接评估鹅肌肽在人类中的治疗效果 探究肝硬化患者易感细菌感染的免疫缺陷机制,特别是肝脏内细胞串扰的失调 对照和肝硬化小鼠(有无细菌感染)、肝硬化患者(来自全国多中心前瞻性队列CATCH-LIFE) 数字病理学 肝脏疾病, 肝硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 靶向代谢组学, 质谱, 外体共培养, 体内过继转移, 抗体阻断, 转基因小鼠模型, 人类批量转录组学和单细胞转录组学数据集 NA 基因表达数据, 代谢组学数据, 临床队列数据 对照和肝硬化小鼠多个, 人类多中心前瞻性队列(CATCH-LIFE) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
1255 2026-07-03
Single-cell transcriptomic profiling reveals functional heterogeneity and regulatory programs of neutrophils in experimental autoimmune uveitis
2026-Jul-01, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示实验性自身免疫性葡萄膜炎中嗜中性粒细胞的功能异质性和调控程序 首次系统性地利用单细胞转录组分析揭示实验性自身免疫性葡萄膜炎视网膜中嗜中性粒细胞的功能异质性和两种不同的活化状态(促炎与抗炎/修复状态),并识别出关键转录调控因子及其下游靶基因 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类自身免疫性葡萄膜炎中嗜中性粒细胞的作用;此外,样本量有限,需要进一步在更大规模队列中验证 阐明实验性自身免疫性葡萄膜炎中嗜中性粒细胞的功能异质性和调控机制 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的视网膜样本 数字病理学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA(未在摘要中明确提及具体样本数量) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
1256 2026-07-03
4-1BBL on monocyte lineage cells rather than on classical dendritic cells drives CD8+ T cell accumulation in the respiratory tract and protects from severe respiratory influenza infection
2026-Jul-01, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了在急性流感感染期间,单核细胞谱系细胞而非经典树突状细胞上的4-1BBL驱动CD8+ T细胞在呼吸道的积累,并保护机体免受严重呼吸道流感感染 首次明确区分单核细胞谱系细胞和经典树突状细胞在提供4-1BBL方面的不同作用,发现炎性单核细胞独特地提供4-1BBL以增加CD8 T细胞在肺部的积累,这种分工对于抵御严重流感感染至关重要 研究主要在鼠模型中进行,结果向人类的转化需要进一步验证;未阐明4-1BBL表达调控的分子机制 阐明提供4-1BBL的抗原呈递细胞类型及其在流感感染中驱动CD8 T细胞积累和保护作用中的分工 小鼠的单核细胞谱系细胞、经典树突状细胞、CD8效应T细胞和组织驻留记忆T细胞 免疫学 流感病毒感染 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 混合骨髓嵌合体, Cre重组酶敲除 NA 基因表达数据, 流式细胞术数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1257 2026-07-03
OT-55 reshapes tolerogenic BH3-mimetic-induced apoptosis toward immunogenic cell death in acute myeloid leukemia, potentiating PD-1/Tim-3 blockade
2026-Jul-01, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文揭示了OT-55作为免疫原性佐剂可将BH3模拟物介导的耐受性凋亡转变为免疫原性细胞死亡,从而增强PD-1/Tim-3阻断在急性髓系白血病疗效 首次证明羟基香豆素OT-55与小分子BH3模拟物联合可将耐受性凋亡转化为免疫原性细胞死亡,并增强免疫检查点抑制,且通过多队列转录组分析建立了9基因AML ICD评分模型 暂无明显的局限性描述 评估ICD诱导剂OT-55与Bcl-xL抑制剂联合是否能增强检查点免疫疗法并克服AML免疫逃逸 急性髓系白血病(Bcl-xL依赖性)小鼠模型及来自三个AML患者队列(TARGET-AML、BEAT-AML、GSE37642)的转录组数据 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、CIBERSORTx免疫组成推断 NA 转录组、单细胞RNA测序 三个AML患者队列及AML与健康供体骨髓样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1258 2026-07-03
Single-cell architecture of purinergic signaling in human cord blood hematopoietic stem and progenitor cells
2026-Jul-01, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 应用单细胞RNA测序揭示人脐带血造血干和祖细胞中嘌呤能信号传导的转录组结构 首次在人造血干和祖细胞亚群中描绘嘌呤能信号网络的层级组织,发现原始HSPC具有受限的嘌呤能受体库并耦合胞内核苷酸回收机制,而谱系偏向簇则富集与炎症激活和迁移相关的受体和核苷外酶 该研究仅基于转录组分析,未在蛋白或功能水平验证嘌呤能受体和酶的表达与活性,且样本来源限于脐带血,可能不反映成体骨髓中HSPC的特征 阐明嘌呤能信号在人造血干和祖细胞不同亚群中的转录组织及其在早期造血调控中的作用 人脐带血来源的CD133⁺Lin⁻CD45⁺和CD34⁺Lin⁻CD45⁺富集HSPC细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人脐带血样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1259 2026-07-03
GPNMB-directed CAR T cell therapy against MiT/TFE-family fusion-driven solid tumors
2026-Jul-01, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 开发针对GPNMB的CAR-T细胞疗法GCAR1,用于治疗MiT/TFE家族融合驱动的实体肿瘤,并在临床试验中展示初步疗效 首次鉴定GPNMB作为MiT/TFE家族融合驱动蛋白在ASPS和转位肾细胞癌中高度一致稳定表达,并开发相应的CAR-T细胞产品GCAR1,首次进行人体临床试验评估 临床试验为单臂开放标签,仅纳入一例受试者,样本量极小,且稳定期仅持续3个月,长期疗效和安全性需进一步验证 开发针对GPNMB的CAR-T细胞疗法,为MiT/TFE家族融合驱动实体肿瘤提供治疗新策略 肺泡状软组织肉瘤(ASPS)和转位肾细胞癌(tRCC)患者的肿瘤样本、细胞、类器官及异种移植模型 免疫治疗 肺泡状软组织肉瘤,肾细胞癌 CAR-T细胞疗法,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 1例复发/难治性转移性ASPS患者(临床试验),以及患者匹配的细胞、类器官和异种移植模型 NA 空间转录组学 NA NA
1260 2026-07-03
Microglial tunneling nanotubes: an intercellular transfer facilitating mitochondrial dysfunction and neuroinflammation in experimental cerebral malaria
2026-Jul-01, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 探究微胶质细胞隧道纳米管在实验性脑疟中介导线粒体功能障碍和神经炎症的细胞间传递机制 首次揭示隧道纳米管在脑疟中介导微胶质细胞间线粒体和疟色素转移,并阐明其放大神经炎症的分子机制 主要基于体外和动物模型,缺乏临床样本验证;隧道纳米管抑制剂的长期效果和安全性未评估 阐明隧道纳米管在实验性脑疟微胶质细胞激活和神经炎症中的具体作用机制 实验性恶性疟疾模型小鼠的微胶质细胞 数字病理学 疟疾 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 实验性恶性疟疾模型小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
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