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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-01-14 |
A computational framework for mapping isoform landscape and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651907
PMID:40654841
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SPLISOSM的计算框架，用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率的模式 | SPLISOSM利用多元测试来考虑位点和异构体水平的依赖性，在稀疏数据上表现出稳健且理论依据充分的性能 | NA | 研究转录多样性（包括剪接和替代3'端使用）的空间协调机制 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 神经精神疾病，胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 多元统计模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1222 | 2026-01-14 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转录因子HHEX在维持肾上腺糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中的关键作用 | 首次发现HHEX是糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子，并证明其作为雄激素受体靶基因，通过抑制女性转录程序和防止脂质自噬来维持肾上腺性二态性和脂质稳态 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的具体机制仍需进一步验证 | 探究维持肾上腺皮质细胞差异响应能力的分子机制 | 肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞（束状带细胞） | 单细胞转录组学 | 肾上腺功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 使用报告基因小鼠的肾上腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1223 | 2026-01-14 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609718
PMID:40166134
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研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组数据中未观测基因的表达水平，以弥补现有技术的局限性 | VISTA结合变分推断和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组数据，并引入不确定性量化，首次实现针对SST数据的基因表达预测 | 方法依赖于scRNA-seq和SST数据的联合可用性，可能受数据质量和整合难度影响 | 解决空间转录组技术中基因覆盖度有限的问题，提升空间诱导细胞状态和特征的分析能力 | 空间转录组数据和单细胞RNA-seq数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个SST数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1224 | 2026-01-14 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 结合单细胞基因表达和可及染色质谱，识别了激活干细胞在命运决定阶段的转录异质性，并发现了一类静息细胞在损伤前已表观遗传学上准备好激活 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据，可及染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1225 | 2026-01-14 |
HapCNV: A Comprehensive Framework for CNV Detection in Low-input DNA Sequencing Data
2025-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629494
PMID:39763944
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研究论文 | 本文介绍了一个名为HapCNV的综合性统计框架，用于在单倍体或低输入DNA测序数据中进行数据标准化和CNV检测 | HapCNV通过构建新颖的基因组位置特异性伪参考，利用初步细胞聚类方法选择无偏参考，有效保留常见CNV，并在模拟和真实寄生虫数据集中显示出优于现有方法的性能，尤其对短CNV检测更准确 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个针对单倍体或低细胞数DNA测序数据的CNV检测框架，以克服现有方法在单倍体基因组和参考样本选择上的局限性 | 单倍体和二倍体生物的低输入DNA测序数据，包括单细胞或少数细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 低输入DNA测序，包括低细胞和单细胞测序 | 统计框架 | DNA测序数据 | 未在摘要中明确指定 | NA | NA | NA | NA |
| 1226 | 2026-01-14 |
Molecular landscape of the mouse adrenal gland and adjacent adipose tissue by spatial transcriptomics
2025, Folia histochemica et cytobiologica
IF:1.7Q4
DOI:10.5603/fhc.108988
PMID:41311243
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，生成了成年雄性小鼠肾上腺及其邻近脂肪组织的高分辨率分子图谱 | 首次提供了成年雄性小鼠肾上腺的空间分辨转录组参考图谱，揭示了肾上腺分区、更新和区域间相互作用的细胞与分子框架 | 研究仅针对成年雄性CD1 IGS小鼠，未涉及雌性、其他品系或不同发育阶段，可能限制结果的普适性 | 旨在解析肾上腺分区和皮质更新的分子机制，以及肾上腺与周围组织的相互作用 | 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺及其邻近的棕色和白色脂肪组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无监督聚类、差异基因表达分析、通路和基因本体富集、细胞类型反卷积、伪时间轨迹推断 | 空间转录组数据 | 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium CytAssist | 10x Genomics Visium CytAssist平台 |
| 1227 | 2026-01-14 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
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研究论文 | 本文介绍了一种通过共移植人类诱导多能干细胞衍生的神经细胞构建人鼠嵌合脑模型的方法，用于在体内研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用 | 创新性地开发了人鼠嵌合脑模型，通过共移植人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞，首次在体内同时模拟人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的相互作用 | 模型基于小鼠脑环境，可能无法完全复制人类脑的复杂生理条件，且移植细胞的长期行为和功能稳定性需进一步验证 | 研究人类神经胶质细胞与神经元在体内的相互作用机制，以揭示脑功能复杂性并为神经系统疾病治疗提供新见解 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞、原始巨噬细胞祖细胞及其在鼠脑中的共移植模型 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、超分辨率成像、3D重建技术 | 人鼠嵌合脑模型 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1228 | 2026-01-14 |
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-11-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c15013
PMID:39520323
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现Wnt信号通路可促进修复型雪旺细胞转化，并开发了一种负载Wnt3a蛋白的聚合物支架，在大鼠坐骨神经缺损模型中验证了其优异的神经修复效果 | 首次结合单细胞测序技术阐明Wnt通路在周围神经再生中的作用机制，并创新性地将Wnt3a蛋白整合到电纺纤维支架表面 | 研究仅在大鼠动物模型中进行验证，尚未开展临床转化研究 | 探索通过调控雪旺细胞功能促进周围神经再生的新策略 | 雪旺细胞、大鼠坐骨神经缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序、电纺丝技术、动物模型实验 | NA | 测序数据、组织学数据、电生理数据 | 大鼠坐骨神经缺损模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1229 | 2026-01-14 |
Actin Dysregulation Induces Neuroendocrine Plasticity and Immune Evasion: A Vulnerability of Small Cell Lung Cancer
2024-Nov-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528365
PMID:36824957
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研究论文 | 本研究揭示了CRACD作为肿瘤抑制因子，通过调控肌动蛋白聚合来限制小细胞肺癌的神经内分泌可塑性和免疫逃逸，并提出EZH2阻断作为潜在治疗策略 | 首次将CRACD与SCLC的神经内分泌可塑性和免疫逃逸机制联系起来，并通过单细胞转录组学验证了其在患者肿瘤中的临床相关性 | 研究主要基于基因敲除模型和体外实验，临床样本验证和体内治疗效果的长期数据可能有限 | 探究小细胞肺癌中肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的分子机制 | 小细胞肺癌肿瘤细胞、CRACD基因、NOTCH1信号通路、EZH2介导的组蛋白修饰 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、基因敲除、药理学阻断 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1230 | 2026-01-14 |
A prognostic matrix gene expression signature defines functional glioblastoma phenotypes and niches
2024-Jun-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4541464/v1
PMID:38947019
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研究论文 | 本研究通过计算基因组学和蛋白质组学方法，分析胶质母细胞瘤中细胞外核心基质蛋白表达的功能和临床相关性，并开发了一个17基因的基质组表达特征用于患者分层 | 识别了基质蛋白表达特征，将胶质母细胞瘤分为高表达和低表达组，并发现该特征与患者生存、致癌改变、间充质状态及免疫检查点基因表达相关，且比MGMT启动子甲基化状态和经典亚型具有更强的预后价值 | 未明确说明样本量或数据来源的具体限制，可能依赖于现有数据库的覆盖范围和准确性 | 探究胶质母细胞瘤中细胞外核心基质蛋白表达的功能和临床意义，以改善患者分层和治疗策略优化 | 胶质母细胞瘤肿瘤组织 | 计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 计算基因组学，蛋白质组学，单细胞转录组分析，空间解剖分析 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据，单细胞转录组数据，空间解剖数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1231 | 2026-01-14 |
Mapping Somatosensory Afferent Circuitry to Bone Identifies Neurotrophic Signals Required for Fracture Healing
2024-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597786
PMID:38895367
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研究论文 | 本研究通过绘制骨组织的体感传入神经回路，揭示了骨折愈合过程中神经源性营养信号的关键作用 | 首次系统性地绘制了长骨体感传入神经的神经解剖学回路，并发现神经元来源的FGF9是骨折修复的重要调节因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证；单细胞测序样本量相对有限 | 阐明骨骼伤害感受和再生过程中的精确神经解剖学回路及神经源性信号机制 | 小鼠长骨的体感背根神经节（DRG）传入神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆向标记技术，多组织相互作用分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 6,648个DRG神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1232 | 2026-01-14 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康和病变人类椎间盘中的纤维环和髓核细胞，揭示了椎间盘退变过程中共享和特异性的细胞变化 | 首次在单细胞水平上同时比较了纤维环和髓核在椎间盘退变中的细胞变化，并识别出新的疾病相关细胞亚群及其调控网络 | 样本数量有限，且仅基于手术分离的组织，可能无法完全代表早期退变阶段 | 阐明椎间盘退变的细胞机制，为精准治疗提供靶点 | 人类椎间盘的纤维环和髓核组织 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 纤维环：19,978和26,983个细胞；髓核：20,884和24,489个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1233 | 2026-01-14 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和活体成像技术，揭示了骨髓细胞-Mas信号在调节对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞之间致病性串扰的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和长时间活体成像，系统解析了骨髓细胞-Mas信号在AILI微环境中的调控机制，并在患者样本中验证了其临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩大规模；Mas信号的具体下游效应分子机制有待进一步阐明 | 阐明对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中微环境的细胞互作和分子机制 | Mas1缺陷小鼠和对乙酰氨基酚诱导的肝损伤患者样本 | 单细胞组学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 影像数据 | Mas1缺陷小鼠模型和急性肝衰竭患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1234 | 2026-01-14 |
CIRI-Deep Enables Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Circular RNAs with Deep Learning
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308115
PMID:38308181
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIRI-deep的深度学习模型，用于在单细胞和空间转录组数据中全面预测环状RNA的调控 | 开发了首个能够处理单细胞和空间转录组数据的深度学习模型，专门用于环状RNA的全面预测和调控分析 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 解决单细胞和空间转录组技术在环状RNA分析中的效率限制，扩展环状RNA研究的应用范围 | 环状RNA及其在单细胞和空间转录组数据中的调控事件 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度学习 | RNA-seq数据 | 基于2500万个高置信度环状RNA调控事件的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1235 | 2026-01-14 |
Quantifying Landscape-Flux via Single-Cell Transcriptomics Uncovers the Underlying Mechanism of Cell Cycle
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308879
PMID:38353329
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA速度重建细胞周期的连续向量场，量化单细胞全局非平衡动态景观-通量，揭示细胞周期调控机制 | 首次将景观-通量理论与单细胞转录组数据结合，量化细胞周期启动的基本能量成本，并识别维持细胞周期动力学的关键基因 | 方法主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平或其他层面的调控机制 | 理解细胞周期的转录调控机制和驱动力量 | 细胞周期过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 向量场模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1236 | 2026-01-14 |
Distribution-Agnostic Deep Learning Enables Accurate Single-Cell Data Recovery and Transcriptional Regulation Interpretation
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307280
PMID:38380499
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研究论文 | 本文提出了一种名为Bis的分布无关深度学习模型，用于准确恢复单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值 | Bis模型基于最优传输的自编码器架构，无需严格数据假设，能捕获复杂数据分布，并通过批量RNA测序数据引导重建以确保表达一致性 | 未明确提及模型在极端稀疏数据或跨物种应用中的局限性 | 开发一种能准确恢复单细胞RNA测序数据中缺失表达值的深度学习模型，以提升下游分析效果 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟数据集、真实数据集以及头颈鳞状细胞癌微环境中的罕见细胞亚群 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 基于最优传输的自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1237 | 2026-01-14 |
NAMPT-Driven M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages Leads to an Immunosuppressive Microenvironment in Colorectal Cancer
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303177
PMID:38308188
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研究论文 | 本研究探讨了NAMPT在结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示NAMPT在SPP1肿瘤相关巨噬细胞中的高表达，并发现其与预后不良相关，同时通过小鼠模型证明NAMPT缺失可改变巨噬细胞极化状态并增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，人类样本验证有限，且NAMPT靶向治疗策略的临床转化潜力尚未在人体试验中证实 | 探究NAMPT在结直肠癌肿瘤微环境中对巨噬细胞极化和免疫调节的作用机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及小鼠模型和人类结直肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1238 | 2026-01-14 |
Identification of Potent siRNA Delivery Peptides Using Computer Modeling
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308345
PMID:38311577
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于计算机建模和单细胞RNA测序的筛选程序，用于识别有效的siRNA递送肽 | 结合计算机建模和单细胞RNA测序进行多阶段筛选，以识别具有理想组装、递送能力和体内组织安全性的siRNA递送肽 | NA | 开发基于肽的RNA干扰疗法，用于siRNA递送 | siRNA递送肽 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算机建模 | 序列数据 | 包含12个氨基酸的文库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1239 | 2026-01-14 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进巨噬细胞分泌I型干扰素，从而增强放疗诱导的远隔效应 | 首次发现肿瘤来源外泌体携带的circPIK3R3通过调控巨噬细胞IRF7/I-IFN轴介导放疗远隔效应的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究多依赖体外实验 | 探究放疗诱导肿瘤远隔效应的详细分子机制 | 黑色素瘤荷瘤小鼠模型（皮下肿瘤和肺转移灶） | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光素酶报告基因、RNA Pull-down、荧光原位杂交 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、成像数据、流式数据 | 荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1240 | 2026-01-14 |
Spatial Transcriptomic and Metabolomic Landscapes of Oral Submucous Fibrosis-Derived Oral Squamous Cell Carcinoma and its Tumor Microenvironment
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306515
PMID:38229179
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学和空间代谢组学技术，揭示了口腔黏膜下纤维化（OSF）衍生的口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其肿瘤微环境中的细胞空间分布、转录组和代谢组景观 | 首次在OSF衍生的OSCC组织中，利用空间多组学技术揭示了部分癌细胞在原位癌区域经历部分上皮-间质转化（pEMT），获得成纤维细胞样表型并参与胶原沉积，同时发现了异常的聚胺代谢在促进肿瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 | 研究样本可能有限，且空间多组学技术的分辨率或覆盖范围可能存在技术限制，需要进一步验证和扩展研究 | 探究OSF恶性转化为OSCC的具体分子机制，包括细胞表型变化、肿瘤微环境相互作用及代谢重编程 | OSF衍生的OSCC组织样本，包括癌细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 空间多组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学（ST）、空间代谢组学（SM） | NA | 空间转录组数据、空间代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |