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当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 1201 - 1220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1201 2026-01-14
Effects of TGFBR1 on Proliferation of Dermal Papilla Cells in Fine-Wool Sheep
2025-Dec-23, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1
研究论文 本研究探讨了TGFBR1基因对细毛羊真皮乳头细胞增殖的影响及其分子机制 首次通过单细胞转录组测序在细毛羊真皮乳头细胞中鉴定出TGFBR1为差异表达基因,并验证其通过调控Wnt/β-catenin、BMP和Notch等多条信号通路抑制细胞增殖 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型的验证,且信号通路调控的具体分子机制有待进一步阐明 探究TGFBR1在细毛羊毛囊发育和周期性生长中的生物学功能及分子机制 细毛羊的真皮乳头细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序、RT-qPCR、EDU染色、CCK-8检测 NA 基因表达数据、细胞增殖数据 未明确说明具体样本数量,但涉及细毛羊真皮乳头细胞的原代分离培养 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1202 2026-01-14
Emerging Technologies for Exploring the Cellular Mechanisms in Vascular Diseases
2025-Dec-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了用于探索血管疾病细胞机制的新兴技术,包括单细胞与空间转录组学、超分辨率成像、微流控器官芯片、CRISPR基因编辑和人工智能等 整合多种前沿技术(如单细胞多组学、器官芯片和人工智能)来系统评估其在血管疾病研究中的转化准备度、局限性和临床应用潜力 现有技术仍需要多中心大规模验证研究、实验协议标准化以及与临床数据和人类样本的进一步整合 评估新兴技术在揭示血管疾病细胞分子机制、促进靶向治疗和精准诊断发展方面的应用 血管疾病(VDs)和心血管疾病(CVDs)的细胞与分子基础 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、超分辨率成像、光声成像、微流控器官芯片、CRISPR/Cas9基因编辑、人工智能 NA 多组学数据、成像数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
1203 2026-01-14
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过感染5xFAD小鼠与野生型小鼠,探讨了小鼠适应型SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学的影响,发现感染未改变Aβ斑块但广泛改变了中枢神经系统细胞类型的基因表达 首次在小鼠模型中结合bulk RNA测序和空间转录组学技术,系统评估了SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病模型小鼠神经病理和基因表达的影响,揭示了感染虽不改变Aβ斑块但引起广泛基因表达变化的新机制 研究仅使用小鼠模型,可能无法完全模拟人类疾病;未检测长期感染效应;病毒RNA未在中枢神经系统检测到,限制了直接神经病理影响的评估 探究SARS-CoV-2感染如何影响阿尔茨海默病神经病理学的潜在机制 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型C57BL/6小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 bulk RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据 10-14月龄的5xFAD和野生型C57BL/6小鼠 NA bulk RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1204 2026-01-14
scANMF: Prior Knowledge and Graph-Regularized NMF for Accurate Cell Type Annotation in scRNA-seq
2025-Dec-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文介绍了一种名为scANMF的细胞类型注释框架,它通过整合先验知识和图正则化非负矩阵分解来提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 scANMF创新性地将标记基因信息、部分标签监督和局部流形结构整合到一个统一的注释模型中,解决了现有工具依赖单一先验知识的局限性 方法在高质量先验知识受限的应用中表现突出,但未明确讨论其在完全无先验知识情况下的性能 开发一个准确且稳健的单细胞RNA测序数据细胞类型注释框架 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达数据 多个真实scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1205 2026-01-14
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Reveal Shared Biomarkers in Type 2 Diabetes and Atherosclerosis
2025-Dec-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了2型糖尿病与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和分子机制 结合多组学分析、机器学习算法(包括人工神经网络)和单细胞RNA测序数据,识别了IL1B、MMP9和P2RY13作为共享枢纽基因,并强调了巨噬细胞极化失衡在两种疾病中的核心作用 研究结果具有初步性,受限于现有数据和方法,需要进一步的实验和临床研究来验证其有效性 阐明2型糖尿病与动脉粥样硬化之间的共享分子机制,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 基因表达谱数据,包括来自GEO数据库的动脉粥样硬化和2型糖尿病相关基因表达数据,以及单细胞RNA测序数据 机器学习 心血管疾病 基因表达分析,功能富集分析(GO/KEGG),蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,机器学习方法,单细胞RNA测序 人工神经网络(ANN) 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1206 2026-01-14
From Genes to Malformations: Molecular Mechanisms Driving the Pathogenesis of Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了先天性肾脏和尿路畸形(CAKUT)的分子机制,包括基因变异、信号通路、纤毛功能及细胞外基质异常在疾病发生中的作用 整合了全外显子组和全基因组测序、拷贝数变异分析的最新发现,并强调了人类肾脏类器官、基因编辑及单细胞或空间转录组学等新兴工具在机制探索中的应用 CAKUT具有高度异质性,其临床表现受遗传背景、表观遗传调控及环境因素(如母体糖尿病和胎儿缺氧)的复杂影响,机制尚未完全阐明 阐明CAKUT的分子发病机制,以改善诊断、加深生物学理解并支持靶向治疗策略的开发 先天性肾脏和尿路畸形(CAKUT) 数字病理学 肾脏疾病 全外显子组测序、全基因组测序、拷贝数变异分析、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
1207 2026-01-14
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型和转录组学分析,揭示了APOBEC3家族在膀胱尿路上皮癌中促进鳞状分化的机制 首次建立了结合Pten和Trp53条件性敲除及小鼠Apobec3过表达的UPPA小鼠模型,并发现APOBEC3通过IL-1α/AP-1信号通路促进鳞状分化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未深入探讨APOBEC3A在其他癌症类型中的作用 探究APOBEC3在膀胱尿路上皮癌中的功能作用及其促进鳞状分化的分子机制 膀胱尿路上皮癌(UC) 癌症生物学 膀胱癌 基因工程小鼠模型、bulk RNA-seq、单细胞转录组学、空间转录组学 UPPA小鼠模型(条件性敲除Pten和Trp53并过表达小鼠Apobec3) RNA-seq数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 UPPA小鼠膀胱肿瘤样本及人类UC样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
1208 2026-01-14
Hematopoietic EphA4 deficiency alters microglial heterogeneity and improves chronic spatial memory after brain injury
2025-Dec-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了造血细胞特异性EphA4缺失如何通过影响小胶质细胞异质性和神经免疫重塑,改善创伤性脑损伤后的慢性空间记忆功能 首次揭示了外周免疫来源的EphA4信号在调控小胶质细胞异质性及长期神经功能恢复中的关键作用,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了特定的小胶质细胞亚群 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性有待验证;且未深入探讨EphA4信号影响小胶质细胞功能的具体分子机制 探究外周免疫细胞来源的EphA4信号在创伤性脑损伤后小胶质细胞动态变化及神经功能恢复中的作用 造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠及创伤性脑损伤模型 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明具体样本数量,使用骨髓嵌合小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1209 2026-01-14
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Nov-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过分析头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的HPV整合事件,揭示了其与致癌基因网络、临床预后的关联,并提出了基于RNA特征的生物标志物 首次基于大规模HNSCC元队列,通过RNA分析(而非DNA)揭示HPV整合的致癌机制,并利用剪接的HPV-人类融合转录本和HPV基因表达比率作为风险分层生物标志物 研究基于多个队列的样本,可能存在异质性;HPV整合与临床结局的关联仍需进一步验证 探讨HPV整合在头颈部鳞状细胞癌中的致癌机制及其与临床预后的关系 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者样本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 RNA-seq NA RNA-seq数据 261个HPV相关HNSCC样本(包括批量RNA-seq和单细胞RNA-seq),以及102名HPV阳性HNSCC参与者的DNA HPV整合事件数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1210 2026-01-14
From Single-Cell Atlas to Functional Validation: Critical Next Steps for Understanding Tip Cell-Mediated Communication in the Injured Spinal Cord
2025-Nov, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
评论 本文对Zeng等人(2025年)利用单细胞RNA测序研究脊髓损伤中内皮尖端细胞与星形胶质细胞和巨噬细胞通讯作用的发现进行了前瞻性展望和批判性审视 强调了对计算预测的旁分泌网络(如Angptl4-Sdc4轴)进行体内功能验证的必要性,并探讨了靶向尖端细胞在治疗中的平衡困境 当前数据缺乏时间和空间分辨率,无法解析相互作用的动态过程,且预测的通讯网络需要因果性验证 推动脊髓损伤中内皮尖端细胞介导的通讯机制从描述性见解向机制理解和治疗策略转化 脊髓损伤中的内皮尖端细胞、星形胶质细胞和巨噬细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1211 2026-01-14
The SPI1/LILRB2 axis modulates macrophage tolerance via crosstalk with TLR8 signaling: implications for sepsis immunotherapy
2025-Oct-27, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 本研究揭示了转录因子SPI1通过上调抑制性受体LILRB2来抑制TLR8信号通路,从而调控巨噬细胞LPS耐受的新分子机制 首次发现SPI1/LILRB2轴通过抑制TLR8介导的MyD88/NF-κB信号来增强免疫抑制表型,为脓毒症免疫治疗提供了新靶点 SPI1作用的特异性需进一步确认,LILRB2抑制TLR8的配体特异性和背景需阐明,TLR8在LPS耐受中的主导作用需更多验证 探究巨噬细胞LPS耐受的分子机制及其在脓毒症免疫治疗中的应用潜力 巨噬细胞 分子免疫学 脓毒症 分子生物学技术 NA NA NA NA NA NA NA
1212 2026-01-14
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
研究论文 本文提出了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平,以解决现有技术基因覆盖有限的限制 VISTA结合变分推断和几何深度学习,联合建模单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,并引入不确定性量化,能够高效预测未观测基因表达 NA 旨在通过预测未观测基因表达,增强空间转录组学数据的分析能力,以揭示空间诱导的细胞状态和特征 空间转录组学数据,特别是亚细胞分辨率空间转录组学(SST)数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq(scRNA-seq),空间转录组学(SST) 几何深度学习,变分推断 基因表达数据,空间数据 四个SST数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1213 2026-01-14
Single-cell transcriptomics showed that maternal polychlorinated biphenyl exposure dysregulated cell type-specific metabolic responses in the livers of female mouse offsprings
2025-Sep-25, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,揭示了母体多氯联苯暴露对雌性小鼠后代肝脏细胞类型特异性代谢反应的调控作用 首次在单细胞分辨率下,系统性地展示了发育期多氯联苯暴露如何导致肝脏中不同细胞类型的转录组重编程,并影响代谢和免疫功能 研究仅针对雌性小鼠后代,且样本量有限,未探讨长期暴露效应或雄性个体的反应 探究母体多氯联苯暴露对雌性后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 雌性小鼠后代的肝脏组织 单细胞转录组学 代谢紊乱 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 产后第28天的雌性小鼠肝脏组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1214 2026-01-14
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为SIGEL的上下文感知基因组表示学习框架,用于从空间转录组数据中生成具有空间信息的基因表示 开发了一种成本效益高的框架,通过利用空间基因组上下文从ST数据中推导基因流形,生成的基因表示具有上下文感知、生物学意义明确且跨样本稳健的特点 NA 为空间基因组分析开发一种能够生成具有空间信息的基因表示的计算框架 空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 表示学习框架 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1215 2026-01-14
Population analysis and immunologic landscape of melanoma in people living with HIV
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过分析电子健康记录、空间免疫转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了HIV感染者(PLWH)黑色素瘤的临床特征和免疫抑制性肿瘤微环境 首次结合大规模人群队列分析与空间转录组学技术,系统揭示了HIV感染者黑色素瘤的免疫抑制性肿瘤微环境特征及其与临床预后差的相关性 样本量相对较小(空间转录组学n=11,多重免疫荧光n=29),且为回顾性研究,可能存在选择偏倚 剖析HIV感染者黑色素瘤的临床和免疫学特征,以解释其比HIV阴性患者更差的临床结局 HIV感染者(PLWH)和HIV阴性者(PLw/oH)的黑色素瘤患者 数字病理学 黑色素瘤 空间免疫转录组学,多重免疫荧光 NA 电子健康记录,空间转录组数据,免疫荧光图像 电子健康记录:1,019名PLWH和373,121名PLw/oH;空间转录组学:11个黑色素瘤样本;多重免疫荧光:15名PLWH和14名PLw/oH样本 NA 空间转录组学 NA NA
1216 2026-01-14
Taurine Transporter SLC6A6 Expression Promotes Mesenchymal Stromal Cell Function
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了牛磺酸转运蛋白SLC6A6在间充质基质细胞功能和成骨分化中的关键作用 首次发现SLC6A6表达在MSCs中富集,并证明牛磺酸摄取通过Wnt/β-catenin信号通路和氧化磷酸化调节MSC的维持和成骨命运决定 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类MSCs数据有限,且未深入探讨牛磺酸在其他细胞类型中的间接效应 探究牛磺酸转运蛋白SLC6A6在间充质基质细胞功能和骨组织发育中的作用机制 小鼠和人类原代间充质基质细胞,以及TauT基因敲除小鼠模型 单细胞转录组学 骨骼疾病 单细胞RNA测序,RNA测序,shRNA敲低 遗传功能丧失模型 单细胞RNA测序数据,RNA测序数据 小鼠非免疫骨和骨髓单细胞RNA测序数据集,原代人类MSCs NA 单细胞RNA测序 NA NA
1217 2026-01-14
Single-cell transcriptomics showed that maternal PCB exposure dysregulated ER stress-mediated cell type-specific responses in the liver of female offspring
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了母体多氯联苯暴露通过内质网应激途径,对雌性后代肝脏造成细胞类型特异性的代谢与免疫功能损伤 首次在单细胞分辨率下系统揭示了环境相关多氯联苯混合物对发育期肝脏的细胞类型特异性转录重编程效应,并明确了内质网应激通路的关键介导作用 研究仅针对雌性后代且观察时间点为出生后28天,未评估长期效应及性别差异;机制验证主要依赖转录组数据 探究母体多氯联苯暴露对雌性后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 围产期暴露于多氯联苯的雌性小鼠肝脏组织 单细胞组学 代谢紊乱 单细胞RNA测序,RT-qPCR NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 出生后28天雌性小鼠肝脏组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1218 2026-01-14
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过标准化PBMCs样本,全面比较了多种商业单细胞RNA测序技术的性能,包括细胞回收率、测序效率、灵敏度、细胞注释和差异基因表达等指标 首次对七种全转录组mRNA测序试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒进行标准化比较,强调实验约束对细胞亚型分辨能力的影响 研究仅使用PBMCs样本,可能无法完全代表其他组织或细胞类型的性能差异 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 来自不同供者的标准化外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 多个供者的PBMCs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1219 2026-01-14
Transcriptomic Signature-Guided Depletion of Intermediate Alveolar Epithelial Cells Ameliorates Pulmonary Fibrosis in Mice
2025-May-21, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别了肺纤维化中关键的中间肺泡上皮细胞状态,并开发了一种基于RNA感知的蛋白质翻译技术,选择性靶向并消除这些细胞,从而在小鼠模型中减轻肺纤维化 引入了一种新型的RNA感知依赖性蛋白质翻译技术,用于选择性靶向和功能研究中间肺泡上皮细胞,并首次利用Sprr1a作为特异性标记物来区分这些细胞 研究主要基于小鼠模型,人类应用仍需进一步验证;技术特异性可能受限于标记物表达水平 探究中间肺泡上皮细胞在肺纤维化发生中的具体作用,并开发靶向治疗策略 小鼠模型中的Krt8+ ADI细胞和人类KRT5-/KRT17+异常基底样细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RNA感知依赖性蛋白质翻译技术 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1220 2026-01-14
DRUG AND SINGLE-CELL GENE EXPRESSION INTEGRATION IDENTIFIES SENSITIVE AND RESISTANT GLIOBLASTOMA CELL POPULATIONS
2025-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个名为ISOSCELES的新框架,通过整合单细胞基因表达数据和药物反应签名,量化胶质母细胞瘤细胞对药物的敏感性和耐药性景观 ISOSCELES框架首次整合单细胞RNA测序数据和L1000表达签名,以预测不同细胞状态对药物的差异反应,并识别出OLIG2抑制剂与Depatux-M的新型组合疗法 研究未明确说明样本量大小或验证实验的详细范围,可能限制结果的普适性 开发一个预测胶质母细胞瘤不同细胞状态对药物敏感性和耐药性的平台,以促进治疗开发 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤的单细胞RNA测序数据 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 ISOSCELES框架 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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