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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2026-10-10 |
GPCR signaling systems facilitate precision interventions for multi-oncology therapy
2026, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2026.1940022
PMID:42840568
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综述 | 本文综述了以GPCR信号系统为核心的精准肿瘤学框架,整合NGS、单细胞转录组学、液体活检和AI驱动的网络建模,用于多种肿瘤的治疗干预 | 提出将GPCR作为精准肿瘤学中未被充分利用的致癌信号轴,结合实时肿瘤监测和AI优化的适应性治疗,实现治疗中重新校准以克服耐药性 | 未涉及具体临床验证数据,缺乏大规模前瞻性临床试验结果支持GPCR靶向治疗的实际疗效 | 探讨GPCR信号系统在精准肿瘤学中的应用,提出以GPCR为中心的精准干预框架用于多种肿瘤治疗 | 实体瘤和血液系统恶性肿瘤中的GPCR信号通路 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, 单细胞转录组学, 液体活检, 循环肿瘤RNA, 外泌体miRNA, 循环肿瘤细胞 | NA | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1202 | 2026-10-10 |
Cardio-oncology-relevant programmes in the cervical cancer tumour microenvironment: an exploratory multi-omics and endothelial-cell study
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1917892
PMID:42845998
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研究论文 | 该研究重新分析了宫颈癌单细胞、空间转录组和TCGA数据,探讨宫颈肿瘤微环境中与心血管肿瘤学相关的血管生成、内皮、炎症、T细胞耗竭及TGF-β/纤维化程序 | 首次从心血管肿瘤学角度系统探索宫颈癌肿瘤微环境中五类相关转录程序,并整合单细胞、空间转录组、TCGA及内皮细胞药理学数据进行多层次分析 | 公共宫颈癌转录组数据集不含心脏组织或判定的心血管毒性结局,肿瘤微环境表达本身无法确立心脏易感性机制;空间转录组每种组织学仅一个样本且无切片坐标,无法进行组水平空间推断;TCGA-CESC无心血管毒性终点;内皮实验仅显示预期通路反应和药理阻断,非治疗诱导的心脏毒性 | 探究宫颈组织是否含有与心血管肿瘤学生物学相关的血管生成、内皮、炎症、T细胞耗竭及TGF-β/纤维化程序 | 宫颈组织样本(包括HPV阴性健康宫颈、HPV阳性组织学正常宫颈、高度鳞状上皮内病变、鳞状细胞癌和腺癌)、TCGA-CESC原发肿瘤、HUVEC和HAEC内皮细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、qRT-PCR | Harmony整合、配体-受体表达乘积评分、模块评分、置换检验 | 图像、文本 | 9个单细胞RNA测序样本共74457个细胞、4个Visium空间转录组样本、304个TCGA-CESC原发肿瘤 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序、10x Visium空间转录组 |
| 1203 | 2026-10-10 |
Integrated bioinformatics and single-cell transcriptomics identify mitochondrial dysfunction-driven biomarkers for preeclampsia diagnosis
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1922190
PMID:42846000
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研究论文 | 本研究结合生物信息学与单细胞转录组学,识别出与线粒体功能障碍相关的先兆子痫诊断生物标志物 | 整合了多种生物信息学方法与单细胞转录组学,首次系统性地识别出线粒体功能障碍驱动的先兆子痫关键基因(SOD1、ACSF2、ABAT、ACSS1、ALDH4A1、PDHA1)并构建诊断模型 | 样本量有限,未来需要在更大规模人群中验证这些基因的临床潜力 | 识别有效的先兆子痫生物标志物和治疗靶点,探索线粒体功能障碍在先兆子痫中的作用 | 先兆子痫患者 | 机器学习 | 先兆子痫 | RT-qPCR,单细胞转录组学,生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据,图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1204 | 2026-10-10 |
Multi-omics integration identifies Acsm2/ACSM2A deficiency as a metabolic driver of ZBP1-mediated PANoptosis in acute kidney injury
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1936504
PMID:42846089
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研究论文 | 该研究通过整合三种小鼠急性肾损伤(AKI)模型的转录组学、单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析和机器学习特征选择,发现Acsm2/ACSM2A缺失是ZBP1介导的PANoptosis的代谢驱动因素。 | 首次通过多组学整合策略将Acsm2/ACSM2A鉴定为AKI中保守的核心抑制基因,并揭示其缺失通过线粒体氧化应激和Z型核酸积累触发ZBP1依赖的PANoptosis,提出ACSM2A-ZBP1轴作为AKI向CKD转化过程的潜在治疗靶点。 | 摘要未明确提及研究局限性,但基于研究设计可推测:研究主要在细胞和小鼠模型中进行,人体临床验证有限;PANoptosis的具体分子机制及ACSM2A-ZBP1轴的上下游调控网络仍需进一步阐明。 | 探究代谢衰竭与炎症性细胞死亡之间的分子联系,阐明Acsm2/ACSM2A在急性肾损伤中调控细胞死亡的具体机制。 | 三种机制不同的小鼠AKI模型、小鼠肾组织近端小管细胞、人HK-2细胞(经氧糖剥夺/复氧处理)。 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 转录组学、单细胞RNA-seq、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、机器学习特征选择 | 机器学习特征选择模型 | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk转录组学 | NA | NA |
| 1205 | 2026-10-10 |
UPF1-dependent glycolysis driven by LINC00887 facilitates macrophage M2 polarization in clear cell renal cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1833383
PMID:42846147
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研究论文 | 该研究发现LINC00887通过抑制UPF1增强糖酵解活性,诱导M2巨噬细胞极化,并削弱CD8+ T细胞的抗肿瘤能力,从而促进透明细胞肾细胞癌的恶性进展 | 首次揭示LINC00887通过抑制UPF1调控有氧糖酵解,进而诱导M2巨噬细胞极化并损害CD8+ T细胞抗肿瘤功能的机制,为ccRCC的免疫代谢调控提供了新视角 | 摘要中未提及具体的样本量信息及研究的局限性 | 探究LINC00887和UPF1在透明细胞肾细胞癌中的表达特征及其与糖酵解活性和M2巨噬细胞浸润的相关性,并阐明其分子机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞、巨噬细胞、CD8+ T细胞及原位肿瘤模型 | 数字病理学, 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫印迹, 流式细胞术, LDH释放实验 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1206 | 2026-10-10 |
CauSTI: causal spatial transcriptomic interaction inference for cell-cell communication
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1943696
PMID:42846353
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研究论文 | 该文提出CauSTI框架,通过因果先验引导的变分图自编码器,从空间转录组数据中推断方向特异性的细胞间通讯 | 将空间邻域结构与配体-受体衍生的因果先验相结合,并通过非对称解码器显式建模有序细胞对之间的发送者-接收者方向性关系 | 仅在seqFISH+、MERSCOPE和Xenium三个空间转录组数据集上进行了验证,未涉及其他平台或更广泛的生物学场景 | 推断空间转录组数据中具有方向特异性的细胞间通讯 | 空间转录组数据中的细胞间通讯 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 变分图自编码器 | 空间转录组数据、图像 | 三个空间转录组数据集(seqFISH+、MERSCOPE和Xenium) | NA | 空间转录组学 | seqFISH+, MERSCOPE, Xenium | seqFISH+、MERSCOPE和Xenium三个空间转录组平台数据集 |
| 1207 | 2026-10-10 |
Integrative Transcriptomic and Genetic Analysis Prioritizes IRF1 as a Candidate Regulatory Gene Associated with Ulcerative Colitis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S625071
PMID:42846532
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研究论文 | 该研究通过整合转录组学和遗传学分析,将IRF1优先确定为与溃疡性结肠炎相关的候选调控基因 | 采用eQTL-based SMR框架整合UC GWAS数据与血液eQTL数据,结合bulk转录组、WGCNA、免疫浸润分析、单细胞RNA测序及DSS诱导小鼠实验,多维度优先筛选并刻画UC候选基因 | 使用了血液来源的eQTL数据,动物实验仅为小样本探索性评估,研究结果属于假设生成性质,仍需进一步功能验证 | 优先筛选与溃疡性结肠炎相关的候选基因,并利用整合转录组与遗传学框架刻画其潜在遗传及免疫相关分子背景 | 溃疡性结肠炎患者转录组数据、UC GWAS数据、血液eQTL数据、DSS诱导结肠炎小鼠 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA-seq, eQTL分析, SMR, GWAS, 单细胞RNA测序 | WGCNA, CIBERSORT, SMR | 转录组数据, 基因组数据, 文本 | 发现队列GSE87466,三个独立转录组队列用于外部验证,以及一个小型DSS诱导结肠炎小鼠实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1208 | 2026-10-10 |
Repurposing Nilotinib as a Selective P38β Inhibitor in Hematopoietic Malignancies: Clinical Evidence and Mechanistic Insights
2025, Journal of clinical haematology
DOI:10.33696/haematology.6.067
PMID:42847058
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研究论文 | 本文通过高通量筛选发现尼洛替尼是一种选择性p38β抑制剂,并研究其在血液恶性肿瘤中的机制及治疗意义 | 首次发现尼洛替尼可作为选择性p38β抑制剂(对p38β的选择性约为p38α的25倍),并揭示其抑制p38β会导致p38γ的代偿性激活,进而驱动上皮-间质转化(EMT)和潜在毒性,提出联合p38γ抑制剂可增强疗效并降低毒性 | 尼洛替尼抑制p38β的同时激活p38γ,可能降低治疗选择性;在Ph+ CML中毒性较高,在非CML癌症中存在脱靶效应 | 识别选择性p38β抑制剂并研究其在血液恶性肿瘤中的机制和治疗意义 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)细胞、白血病细胞、FDA已批准化合物、临床试验及公共数据集 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 高通量筛选、体外激酶实验、Western blot、scRNA-seq、协同实验、质谱分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1209 | 2026-10-09 |
Spatial multi‑omics identifies an SPP1+ macrophage‑driven anti‑apoptotic niche in osteoarthritis synovium via the SPP1‑CD44 axis
2026-11, International journal of molecular medicine
IF:5.7Q1
DOI:10.3892/ijmm.2026.6005
PMID:42825366
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学、单细胞RNA测序和凋亡模型,揭示了骨关节炎滑膜中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动抗凋亡微环境,从而维持持续性滑膜炎 | 首次通过空间多组学揭示了骨关节炎滑膜中TGF-β富集的微环境中SPP1+巨噬细胞在衰老滑膜成纤维细胞旁扩增,并发现SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44信号轴直接抑制炎症性巨噬细胞凋亡,同时通过CCL3分泌招募额外髓系细胞,这与既往报道的促纤维化作用不同 | 研究主要基于小鼠OA模型,人类骨关节炎滑膜中的验证尚不充分,SPP1-CD44轴的具体分子机制及候选化合物的临床转化仍需进一步验证 | 探究骨关节炎滑膜中调控凋亡通路的巨噬细胞功能亚群及其空间微环境,阐明持续性滑膜炎的机制 | 骨关节炎滑膜中的巨噬细胞亚群及其空间微环境 | 空间多组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1210 | 2026-10-09 |
Mitochondrial transcript abundance in breast cancer circulating tumour cells may reflect both blood-derived transcripts and biological heterogeneity
2026-Oct-05, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10430-0
PMID:42831917
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研究论文 | 该研究分析了349个乳腺癌循环肿瘤细胞和129个白细胞的RNA-Seq数据,评估线粒体转录本比例作为单细胞转录组质量指标的可靠性 | 首次系统评估循环肿瘤细胞中线粒体转录本含量的分布特征,揭示其受血液来源转录本污染和肿瘤细胞内在生物学过程双重影响 | 循环肿瘤细胞鉴定标准不统一,不同富集方法间存在显著差异,样本来源和方法学异质性可能影响结论的普适性 | 评估线粒体转录本比例是否可作为循环肿瘤细胞单细胞转录组质量的可靠独立指标 | 乳腺癌循环肿瘤细胞和白细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-Seq | NA | 文本 | 349个乳腺癌循环肿瘤细胞和129个白细胞 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1211 | 2026-10-09 |
Discovery of the TGCB microprotein translated from the lncRNA CHASERR
2026-Oct-05, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.10.008
PMID:42833609
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研究论文 | 该论文发现lncRNA CHASERR并非严格非编码,而是编码一个41个氨基酸的微蛋白TGCB,并通过多种证据支持其活跃翻译和进化保守性 | 首次报道CHASERR编码一个先前未注释的41氨基酸微蛋白TGCB,将CHASERR定位为双功能转录本,并揭示其编码序列位于临床相关的神经发育障碍缺失区域内 | 缺少对TGCB微蛋白功能的直接实验验证(如敲除或过表达功能实验),其与神经发育表型的因果关系尚属推测 | 探究lncRNA CHASERR是否编码功能性微蛋白,并评估其翻译活性、进化保守性及临床相关性 | lncRNA CHASERR及其编码的微蛋白TGCB,以及CHASERR-CHD2调控区域 | 机器学习 | 神经发育障碍 | Ribo-seq, 单细胞转录组, 质谱, 多物种比对 | NA | 文本, 序列 | 47个公开Ribo-seq数据集,以及公开质谱数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1212 | 2026-10-09 |
METTL14-mediated m6A modification of CXCL9 mRNA regulates macrophage CS polarization to suppress OSCC growth and stemness
2026-Oct-02, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02053-1
PMID:42825844
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研究论文 | 本研究揭示了METTL14通过介导CXCL9 mRNA的m6A修饰调控巨噬细胞CS极化,从而抑制口腔鳞状细胞癌生长和干性的新机制 | 首次发现METTL14通过m6A修饰CXCL9 mRNA并由阅读蛋白IGF2BP3识别和稳定,驱动肿瘤相关巨噬细胞向CXCL9⁺表型极化,进而抑制OSCC生长和干性;证实CXCL9/SPP1比值(CS比值)比传统M1/M2分类更可靠的预后生物标志物 | 未在摘要中明确说明 | 阐明METTL14调控肿瘤相关巨噬细胞CS极化并影响OSCC生长和干性的机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)及正常样本、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、巨噬细胞特异性Mettl14敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组学分析、m6A修饰测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像 | 330例患者组织样本(三个独立批量转录组队列)及OSCC单细胞RNA测序样本和正常样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA-seq | NA | NA |
| 1213 | 2026-10-09 |
Bisphenol A Exposure Perturbs the Immune Microenvironment in Alzheimer's Disease: Insights from Network Toxicology and Single-Cell Transcriptomics
2026-Oct-02, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02606-w
PMID:42825974
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研究论文 | 该研究整合网络毒理学、批量转录组学、机器学习、免疫去卷积、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接和分子动力学模拟,探究双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子联系 | 整合了网络毒理学、批量转录组学、机器学习、免疫去卷积、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接及100 ns分子动力学模拟等多种方法,系统性地揭示双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子关联,并识别出GSK3B、BCL2、EGFR、APP和PPARD五个候选基因标志物 | 研究结果主要基于计算分析,属于假设生成性质;模型在验证队列中表现显著下降,提示泛化能力有限且可能存在过拟合;LM22参考矩阵不能直接代表脑内驻留免疫细胞群,免疫浸润结果需谨慎解读;需要实验研究来建立因果关系和机制联系 | 探究双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子联系及其对免疫微环境的影响 | 双酚A暴露相关的阿尔茨海默病分子靶点、免疫微环境及候选基因标志物 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 网络毒理学、批量转录组学、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习 | 基因表达数据、图像(分子结构)、文本 | NA | NA | 单核RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 1214 | 2026-10-09 |
Single-Cell Analysis of Cartilage-Derived Cells Identifies Diverse Populations and a Cholesterol/ER-Stress Chondrocyte Subset in Knee OA
2026-Oct, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70279
PMID:42811796
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膝骨关节炎软骨细胞群体,鉴定出一种与胆固醇代谢和内质网应激相关的新型软骨细胞亚群,并揭示其在骨关节炎发病机制中的作用 | 发现了一种新的应激响应代谢软骨细胞亚群(MetabCs),该亚群与血清总胆固醇水平相关,涉及胆固醇代谢和内质网应激通路;鉴定了新的骨关节炎相关基因HILPDA和AKR1C2;发现磨损软骨细胞呈现混合表型 | 样本量相对有限(共12例患者),未提及多中心验证或更大队列的验证 | 阐明膝骨关节炎发病的细胞和分子机制,分析软骨细胞群体及其空间分布 | 膝骨关节炎患者及非骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 12例患者(9例骨关节炎,3例非骨关节炎),共104,951个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1215 | 2026-10-09 |
Integrative transcriptomic and machine learning analysis identifies candidate biomarkers and immune features in diabetic ulcers
2026-Oct-01, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12862-z
PMID:42821160
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研究论文 | 该研究整合公共转录组数据集与机器学习方法,筛选糖尿病溃疡相关候选生物标志物,并结合免疫分析、单细胞测序和动物模型验证其表达模式与免疫重塑及创面愈合的关系 | 从脂质代谢相关基因集中筛选糖尿病溃疡相关基因,构建包含ANGPTL4、BNIP3、EEF2K、EIF4EBP1、KLHDC1、KLK10、KLK8、NFIX、QSOX1和S100A8的十基因标志物组合,并将其与Th17细胞浸润、白细胞介素受体活性及创面相关细胞亚群定位相关联 | 仍需在更大规模的人类队列中进一步验证后才能应用于临床 | 识别能够区分糖尿病溃疡组织与非溃疡组织的稳健分子标志物,并阐明创面愈合受损的生物学基础 | 糖尿病溃疡患者公共转录组数据集、外部转录组验证队列、链脲佐菌素诱导的C57BL/6小鼠糖尿病创面模型 | 机器学习 | 糖尿病溃疡 | 转录组分析、差异表达分析、随机森林建模、ssGSEA、GSEA、GSVA、药物-基因互作分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、ELISA、western blotting | 随机森林 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像、文本 | 公共转录组数据集和外部转录组验证队列(具体样本数未在摘要中说明)、链脲佐菌素诱导的C57BL/6小鼠糖尿病创面模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1216 | 2026-10-09 |
TGF-β/Smad-Associated Epithelial-Fibroblast Remodeling Underlies Collagen Deposition in Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2026-Oct, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70532
PMID:42836585
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研究论文 | 本研究整合人类单细胞RNA测序数据与组织及蛋白水平验证,揭示CRSwNP中TGF-β/Smad3相关的上皮-成纤维细胞重塑程序驱动胶原沉积 | 整合两个独立人类队列的单细胞RNA测序数据,结合组织学和蛋白水平验证,首次系统刻画了CRSwNP中上皮-成纤维细胞协同重塑程序,并发现GPNMB表达巨噬细胞亚群是TGFB1的潜在来源 | 因果作用仍需空间转录组学和功能实验验证,地塞米松仅部分逆转重塑表型 | 探究EMT、成纤维细胞活化、胶原沉积和TGF-β/Smad信号在CRSwNP鼻黏膜重塑中是否协调作用 | CRSwNP患者的鼻息肉组织及对照鼻黏膜组织,以及OVA/SEB诱导的CRSwNP样小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Masson三色染色、PAS染色、Western blot | CellChat、拟时序分析 | 单细胞转录组数据、图像 | 两个独立人类队列的公开单细胞RNA测序数据集,CRSwNP患者及对照的鼻黏膜组织,以及OVA/SEB诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1217 | 2026-10-09 |
Identification of SORT1 as a Key Regulator of Antigen Presentation in CD16+ Monocytes During Septic Shock via Multi-Omics and In Silico Gene Knockout Analysis
2026-Oct, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70548
PMID:42836580
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研究论文 | 该研究通过整合批量转录组学、机器学习、WGCNA、单细胞转录组学和计算机基因敲除分析,识别出SORT1是脓毒性休克中CD16+单核细胞抗原呈递的关键调控因子 | 首次结合多种组学方法和计算机基因敲除技术,发现SORT1在脓毒性休克CD16+单核细胞中高表达,并通过调控抗原呈递相关基因(如B2M、CD74和MHC II类基因)参与免疫失调,为脓毒性休克的诊断和机制研究提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和计算机模拟,缺乏湿实验验证;单细胞数据仅来自一个数据集(GSE175453),样本量有限;未进行功能实验证实SORT1的具体调控机制 | 通过多组学整合分析和计算机基因敲除,筛选与脓毒性休克相关的核心基因,并深入解析其免疫调控机制 | 脓毒性休克患者 | 机器学习 | 脓毒性休克 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 随机森林, 支持向量机, 混合模型(RF+SVM) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个批量转录组数据集(包括训练队列和独立外部验证队列GSE137340、GSE26440)和单细胞转录组数据集GSE175453 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1218 | 2026-10-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the interaction of TREM2+ macrophages and Tc17 lymphocytes in scalp psoriasis
2026-Sep-29, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-026-09846-3
PMID:42806169
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研究论文 | 该研究对头皮和躯干斑块型银屑病患者的CD45⁺免疫细胞进行单细胞RNA测序,揭示头皮银屑病中TREM2⁺巨噬细胞与Tc17淋巴细胞的相互作用 | 首次揭示头皮银屑病中富集的FATP2⁺ Tc17细胞与TREM2⁺巨噬细胞通过MHC-I介导的相互作用,并发现IL7R⁺ TRM向Tc17细胞转化优先发生于头皮 | 摘要中未明确说明样本量有限等具体局限性 | 表征头皮银屑病的免疫细胞异质性及部位相关细胞间相互作用,重点关注可能导致局部持续炎症的炎性T细胞和髓系细胞程序 | 银屑病患者头皮和躯干斑块病变及健康对照者的CD45⁺免疫细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | 41,438个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1219 | 2026-10-09 |
Integrative analysis of m6A-related genetic variants and single-cell RNA sequencing identifies HLA-DQA1/HLA-DQB1-associated immune signatures in CAR-T-treated diffuse large B-cell lymphoma
2026-Sep-28, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103053
PMID:42805113
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研究论文 | 该研究整合GWAS、m6A-SNP注释、eQTL注释和单细胞RNA测序数据,识别了m6A相关遗传变异及HLA-DQA1/HLA-DQB1相关的免疫特征,这些特征与CAR-T治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的响应相关 | 首次将m6A相关遗传变异、eQTL注释和单细胞RNA测序整合分析,揭示HLA-DQA1/HLA-DQB1为中心的免疫特征与CAR-T治疗DLBCL响应的关联 | 研究为关联水平,需要进一步的机制研究和前瞻性验证 | 探索m6A相关遗传变异、免疫细胞状态与CAR-T治疗DLBCL响应之间的关系 | 接受CAR-T治疗的难治性B细胞淋巴瘤患者,包括响应者(n=15)和非响应者(n=11) | 机器学习, 单细胞分析, 遗传学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | GWAS, 单细胞RNA测序, eQTL分析 | NA | 基因型数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 响应者15例,非响应者11例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1220 | 2026-10-09 |
The inflammatory UPR-IFNG axis reveals LBP as a survival and immunotherapy-response marker in hepatocellular carcinoma
2026-Sep-28, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103039
PMID:42805112
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,识别出LBP作为肝细胞癌中与UPR和IFNG轴相关的预后和免疫治疗反应标志物 | 首次将UPR-IFNG炎症轴与LBP关联,并通过单细胞分辨率映射恶性细胞程序,结合多种机器学习方法筛选预后基因,发现LBP作为肝细胞癌预后和免疫治疗反应分层的新型候选生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证;体外实验仅初步验证LBP对细胞增殖的影响,未深入探讨其分子机制 | 识别与UPR和IFNG信号相关的临床可解释生物标志物,用于肝细胞癌的预后评估和免疫治疗反应分层 | 肝细胞癌(LIHC)患者样本及细胞系 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 随机生存森林, CoxBoost | 基因表达数据, 图像 | 278,337个细胞来自三个单细胞RNA测序数据集,以及多个批量转录组队列(GSE116174, GSE144269, GSE14520) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |