单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24090 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2024-12-05 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2024-Dec-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
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研究论文 | 本文研究了在小鼠胚胎干细胞中通过敲除Pdzk1基因来实现全能性的建立 | 首次通过敲除单个基因Pdzk1在胚胎干细胞中实现全能性，并展示了其在胚胎发育中的全面潜力 | NA | 研究如何通过基因编辑技术扩展干细胞的分化潜能 | 小鼠胚胎干细胞的全能性 | 发育生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | Pdzk1敲除的胚胎干细胞 |
| 1202 | 2024-12-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals a key regulator ZmEREB14 affecting shoot apex development and yield formation in maize
2024-Dec-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14537
PMID:39630144
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了玉米顶端分生组织发育和产量形成的关键调控因子ZmEREB14 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了玉米顶端分生组织发育的细胞异质性，并鉴定了关键调控因子ZmEREB14 | 研究仅限于5天龄的玉米顶端分生组织，未涵盖更长时间段的发育过程 | 揭示玉米顶端分生组织发育的分子机制及其对产量形成的影响 | 玉米顶端分生组织及其发育过程中的细胞类型和调控网络 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约12,700个细胞 |
| 1203 | 2024-12-05 |
Tumor-Associated Microglia Secrete Extracellular ATP to Support Glioblastoma Progression
2024-Dec-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0018
PMID:39618248
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研究论文 | 研究揭示了肿瘤相关小胶质细胞通过分泌胞外ATP促进胶质母细胞瘤进展的机制 | 首次发现肿瘤相关小胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中通过增加ATP合成酶表达和氧化磷酸化活性，分泌胞外ATP，激活P2X7受体，促进肿瘤细胞增殖和侵袭 | 研究主要基于体外和体内模型，缺乏临床试验验证 | 探讨肿瘤相关小胶质细胞在胶质母细胞瘤进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤患者样本、体外和体内模型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 胶质母细胞瘤患者样本 |
| 1204 | 2024-12-05 |
ATP2A3 in Primary Aldosteronism: Machine Learning-Based Discovery and Functional Validation
2024-Dec-02, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本文利用机器学习方法在原发性醛固酮增多症中发现了ATP2A3基因，并通过功能验证确认其在醛固酮生成中的关键作用 | 首次利用机器学习方法识别出ATP2A3作为原发性醛固酮增多症的关键特征基因，并通过多种实验验证了其在醛固酮生成中的调控作用 | NA | 利用机器学习方法发现原发性醛固酮增多症的新型生物标志物，揭示新的病理生理机制 | 原发性醛固酮增多症中的醛固酮生成腺瘤（APAs）及其相关基因ATP2A3 | 机器学习 | 内分泌疾病 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | APA组织样本、猪肾上腺、人肾上腺皮质细胞系 |
| 1205 | 2024-12-05 |
Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma
2024-Dec-02, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03756-2
PMID:39621240
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研究论文 | 研究了中性粒细胞在肝细胞癌中的RNA甲基化模式及其对肿瘤微环境的影响 | 开发了一种新的中性粒细胞RNA甲基化评分系统（NRM），用于评估肿瘤微环境的异质性和临床特征 | NA | 探讨中性粒细胞在肝细胞癌中的RNA甲基化模式及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞及其RNA甲基化模式 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | LASSO Cox回归 | RNA甲基化数据 | NA |
| 1206 | 2024-12-05 |
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173593
PMID:39621314
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研究论文 | 研究了心脏移植后慢性排斥反应中调节性T细胞（Tregs）和纤维母细胞之间的相互作用 | 首次揭示了IL-33在心脏移植慢性排斥反应中的作用，并发现Treg分泌的Areg促进了纤维母细胞的增殖，从而加剧了慢性排斥反应 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本的验证有限 | 探讨心脏移植后慢性排斥反应的机制 | 心脏移植后的慢性排斥反应、Tregs、纤维母细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和临床样本 |
| 1207 | 2024-12-05 |
Inferring disease progressive stages in single-cell transcriptomics using a weakly-supervised deep learning approach
2024-Dec-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278812.123
PMID:39622637
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scIDST的弱监督深度学习方法，用于推断单细胞转录组学中的疾病进展阶段 | 提出了一种新的深度学习方法scIDST，能够在弱监督框架下推断单细胞的疾病进展水平，并展示了其在多个独立数据资源中的适用性 | NA | 旨在解决单细胞转录组学中细胞异质性问题，推断疾病进展阶段 | 单细胞转录组数据中的疾病进展阶段 | 机器学习 | NA | 单细胞/核基因组测序 | 深度学习 | 转录组数据 | NA |
| 1208 | 2024-12-05 |
Fibroblast Activation Protein-α Expression in Cancer-Associated Fibroblasts Shows the Poor Survival of Colorectal Cancer via Immune-Mediated Pathways : Implications of FAP in Cancer-Associated Fibroblasts Link Immune Dysregulation to Adverse Survival in Colorectal Cancer
2024-Dec-02, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16593-y
PMID:39623187
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研究论文 | 研究探讨了纤维母细胞激活蛋白-α（FAP）在结直肠癌（CRC）相关成纤维细胞中的表达及其对患者生存和肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了FAP表达与CRC患者生存率降低以及肿瘤浸润淋巴细胞分布减少之间的关联，并发现FAP阳性成纤维细胞中与免疫抑制相关的基因表达上调 | 研究样本量较小，且仅限于特定医院的数据，可能影响结果的普适性 | 探讨FAP在CRC相关成纤维细胞中的表达及其对患者生存和肿瘤免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者及其肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色（IHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 病理切片和基因表达数据 | 178名结直肠癌患者和10名未经治疗的CRC患者 |
| 1209 | 2024-12-05 |
Generation and long-term culture of human cerebellar organoids from pluripotent stem cells
2024-Dec-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01093-w
PMID:39623220
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研究论文 | 本文描述了一种从人类多能干细胞生成和长期培养人小脑类器官（hCerO）的协议 | 该协议成功复制了胎儿小脑的细胞多样性和一些独特的细胞结构特征，并能长期培养小脑的主要细胞类型 | NA | 探索小脑发育和疾病 | 人小脑类器官（hCerO） | 发育神经生物学 | NA | 细胞培养 | NA | 细胞 | NA |
| 1210 | 2024-12-05 |
Nicotinamide N-methyltransferase negatively regulates metastasis-promoting property of cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2024-Dec-02, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12633
PMID:39623600
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研究论文 | 研究探讨了尼古丁胺N-甲基转移酶（NNMT）在肺腺癌（LUAD）中对癌症相关成纤维细胞（CAFs）促转移特性的负调控作用 | 首次揭示了NNMT在CAFs中的代谢和表观遗传调控功能，扩展了对LUAD转移调控机制的理解 | NA | 探索LUAD复发和转移的机制，特别是NNMT在其中的作用 | 肺腺癌（LUAD）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序（RNA-seq）、染色质免疫沉淀-PCR（ChIP-PCR）、多重免疫荧光分析 | NA | RNA | NA |
| 1211 | 2024-12-05 |
Exploring the tumor microenvironment of colorectal cancer patients post renal transplantation by single-cell analysis
2024-Dec-02, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16409
PMID:39623744
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肾移植后结直肠癌患者的肿瘤微环境 | 揭示了肾移植后结直肠癌患者肿瘤免疫微环境的显著变化，特别是CD8效应T细胞的细胞毒性和肿瘤新抗原识别能力的下降，以及CD4FOXP3调节性T细胞的免疫抑制潜力增强 | 研究样本量较小，仅包括四名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨肾移植后结直肠癌患者的肿瘤免疫微环境变化及其机制 | 肾移植后结直肠癌患者的肿瘤和正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四名肾移植后结直肠癌患者和23名非移植结直肠癌患者的肿瘤和正常组织 |
| 1212 | 2024-12-05 |
Spatially Aware Domain Adaptation Enables Cell Type Deconvolution from Multi-Modal Spatially Resolved Transcriptomics
2024-Dec-02, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401163
PMID:39623794
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaDA的新型空间感知域适应方法，用于从多模态空间解析转录组学数据中进行细胞类型解卷积 | SpaDA方法结合了多模态数据（转录组学、组织学图像和空间位置），并利用自表达变分自编码器和深度空间分布对齐技术，实现了细胞类型注释信息在两个相似图之间的转移，提高了细胞类型组成的预测准确性 | NA | 开发一种新的方法来解决多模态空间解析转录组学数据中细胞类型解卷积的问题 | 多模态空间解析转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间解析转录组学 | 变分自编码器 | 多模态数据（转录组学、图像、空间位置） | 高分辨率小鼠小脑空间解析转录组学数据 |
| 1213 | 2024-12-05 |
Spatial transcriptomics deciphers the immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer with tumour thrombus
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70112
PMID:39617739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1214 | 2024-12-05 |
Modeling metabolic-associated steatohepatitis with human pluripotent stem cell-derived liver organoids
2024-Dec-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000585
PMID:39621053
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研究论文 | 研究使用人类多能干细胞衍生的肝脏类器官模型来模拟代谢相关脂肪性肝炎（MASH） | 本研究改进了现有的肝脏类器官模型，通过详细分子特征分析和功能验证，提供了一个更精确的MASH疾病模型 | 研究中使用的类器官模型仍需进一步优化，以完全模拟人类MASH的复杂性 | 开发和验证一个改进的肝脏类器官模型，用于研究代谢相关脂肪性肝炎（MASH）的发病机制和治疗方法 | 人类多能干细胞衍生的肝脏类器官，以及MASH的分子和功能特征 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1215 | 2024-12-05 |
Gonadal sex reversal at single-cell resolution in Znrf3-deficient mice
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202707
PMID:39629665
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研究论文 | 研究了Znrf3缺陷小鼠在性决定期单细胞分辨率下的性逆转现象 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了Znrf3缺陷小鼠性逆转的转录组和细胞异质性 | NA | 进一步研究Znrf3缺陷小鼠的性逆转现象 | Znrf3缺陷小鼠的性腺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组 | XY Znrf3缺陷小鼠的性腺细胞 |
| 1216 | 2024-12-05 |
Microarray integrated spatial transcriptomics (MIST) for affordable and robust digital pathology
2024-Nov-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00462-1
PMID:39616155
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研究论文 | 提出了一种名为MIST的新型空间转录组学方法，结合了传统的组织微阵列与Visium技术，通过激光切割和3D打印提高载玻片通量，旨在降低成本并提高数字病理学的鲁棒性 | MIST方法通过结合组织微阵列与Visium技术，利用激光切割和3D打印技术，显著提高了载玻片通量，降低了成本，并提供了独立复制和定制化的能力 | NA | 开发一种成本效益高且鲁棒性强的空间转录组学方法，以解决现有方法高成本和样本使用限制的问题 | 空间转录组学技术及其在数字病理学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、激光切割、3D打印 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1217 | 2024-12-05 |
SenMayo transcriptomic senescence panel highlights glial cells in the ageing mouse and human retina
2024-Nov-30, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00187-9
PMID:39616175
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研究论文 | 研究使用SenMayo转录组衰老面板分析了不同年龄小鼠和人类视网膜中的衰老细胞，特别是胶质细胞 | 首次将SenMayo基因面板应用于视网膜衰老细胞的鉴定，并比较了不同年龄小鼠和人类视网膜胶质细胞的转录组特征 | 研究主要集中在视网膜胶质细胞，未涵盖其他类型的细胞 | 鉴定中枢神经系统和视网膜中的衰老细胞，并分析其转录组特征 | 不同年龄小鼠和人类的视网膜胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同年龄的小鼠和人类视网膜样本 |
| 1218 | 2024-12-05 |
Single-cell transcriptomics reveals over-activated reactive oxygen species pathway in hepatocytes in the development of hepatocellular carcinoma
2024-11-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81481-0
PMID:39616235
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肝细胞中活性氧通路在肝细胞癌发展中的过度激活 | 首次揭示了肝细胞癌中活性氧通路的异常激活及其与能量代谢相关通路的正相关性，并发现了与预后不良相关的GPX4+肝细胞亚群 | 研究基于GSE189175数据集，样本量有限，未来需要更大规模的研究验证 | 探讨活性氧通路在肝细胞癌发展中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织及其邻近组织中的肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GSE189175数据集，具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 1219 | 2024-12-05 |
Identification of the key targets for sepsis-associated acute kidney injury by RNA sequencing combined with bioinformatics methods
2024-Nov-30, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00673-5
PMID:39616313
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研究论文 | 本研究通过RNA测序结合生物信息学方法，识别脓毒症相关急性肾损伤的关键靶点 | 首次通过RNA测序和生物信息学分析，确定了CD74和IL32作为脓毒症相关急性肾损伤的早期诊断和预后评估的生物标志物 | 研究样本量较小，且仅限于脓毒症患者，结果的普适性有待进一步验证 | 提供脓毒症相关肾损伤的早期识别和预后研究的可靠靶点 | 脓毒症患者的肾损伤相关基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 10名健康个体和22名脓毒症患者的外周血样本 |
| 1220 | 2024-12-05 |
CD22 blockade exacerbates neuroinflammation in Neuromyelitis optica spectrum disorder
2024-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03305-2
PMID:39616380
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研究论文 | 研究CD22在视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）中对神经炎症和中枢神经系统损伤的影响 | 揭示了CD22作为调控微胶质细胞和Gr-1+髓系细胞在NMOSD中负面效应的关键分子开关的新角色 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨CD22在NMOSD中的作用及其对微胶质细胞活性和神经炎症的影响 | CD22在NMOSD中的表达、功能及其对微胶质细胞和髓系细胞的影响 | 神经科学 | 神经疾病 | 单细胞测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | 人类样本每组5个，小鼠样本每组8个 |