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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11621 | 2025-10-07 | 
         COL6A3 enhances the osteogenic differentiation potential of BMSCs by promoting mitophagy in the osteoporotic microenvironment 
        
          2024-Jan-25, Molecular biology reports
          
          IF:2.6Q3
          
         
        
          DOI:10.1007/s11033-023-08918-z
          PMID:38270688
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨COL6A3基因通过促进线粒体自噬增强骨髓间充质干细胞在骨质疏松微环境中的成骨分化能力 | 首次发现COL6A3基因可通过促进线粒体自噬改善骨质疏松微环境中BMSCs的成骨分化能力 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索COL6A3基因在骨质疏松微环境中对BMSCs成骨分化的调控机制 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 细胞生物学 | 骨质疏松症 | 慢病毒转染, Western blot, 免疫荧光, TUNEL检测, JC-1染色 | NA | 蛋白质表达数据, 细胞成像数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 11622 | 2025-10-07 | 
         Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis 
        
          2023-02-21, Circulation
          
          IF:35.5Q1
          
         
        
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过靶向Epsins蛋白调控成纤维细胞生长因子信号通路,抑制内皮-间质转化过程从而治疗动脉粥样硬化 | 首次揭示Epsins通过调控FGFR1内化和降解促进TGF-β信号通路的新机制,并开发了靶向治疗肽 | 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验验证 | 探究Epsins在动脉粥样硬化中促进内皮-间质转化的分子机制并评估治疗策略 | Apoe-/-基因敲除小鼠和谱系示踪/PCSK9突变病毒诱导的动脉粥样硬化小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,分子、细胞和生化分析,谱系示踪技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11623 | 2025-10-07 | 
         Colorectal Cancer Metastases in the Liver Establish Immunosuppressive Spatial Networking between Tumor-Associated SPP1+ Macrophages and Fibroblasts 
        
          2023-01-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
          
          IF:10.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2041
          PMID:36239989
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术揭示了结直肠癌肝转移微环境中SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞之间建立免疫抑制空间网络的机制 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与成纤维细胞在肝转移微环境中形成互补的配体-受体对,并通过空间邻近建立免疫抑制网络 | 研究主要针对微卫星稳定型结直肠癌肝转移,样本来源和数量可能有限 | 表征结直肠癌肝转移肿瘤微环境的细胞变化特征 | 结直肠癌肝转移组织、正常肝组织和外周血单核细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重空间成像, 细胞反卷积 | NA | 基因表达数据, 空间成像数据 | 一系列微卫星稳定型结直肠癌肝转移样本及其配对组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 11624 | 2025-02-05 | 
         Hepatic HSD17B6 is dispensable for diet-induced fatty liver disease in mice 
        
          2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
          
          IF:2.3Q3
          
         
        
          DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101924
          PMID:39896111
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了HSD17B6在饮食诱导的脂肪肝疾病中的作用 | 首次揭示了HSD17B6在肝脏中的表达与脂肪肝疾病的相关性,并发现其肝脏特异性缺失不影响脂肪肝疾病的发展 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究HSD17B6在饮食诱导的脂肪肝疾病中的作用 | 小鼠模型 | 代谢疾病研究 | 脂肪肝疾病 | 单细胞RNA测序, AAV8介导的基因编辑 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 11625 | 2025-02-05 | 
         Single-cell RNA sequencing provides new insights into the interaction between astrocytes and neurons after spinal cord injury in mice 
        
          2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
          
          IF:2.3Q3
          
         
        
          DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101917
          PMID:39896108
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了小鼠脊髓损伤后不同阶段及正常组织中星形胶质细胞和神经元亚型的动态变化及其功能,揭示了特定星形胶质细胞亚型在脊髓损伤过程中可能向神经元转化的机制 | 发现了一种特定亚型的星形胶质细胞,其具有独特的基因表达特征,并在脊髓损伤过程中可能转化为神经元,同时揭示了糖酵解途径在这一细胞转化过程中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨脊髓损伤后星形胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在疾病进展中的机制 | 小鼠脊髓损伤模型中的星形胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 小鼠脊髓损伤模型及正常组织样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 11626 | 2025-02-05 | 
         Single-cell transcriptome atlas of male mouse pituitary across postnatal life highlighting its stem cell landscape 
        
          2025-Feb-21, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.isci.2024.111708
          PMID:39898054
         
       | 
      
      研究论文 | 本文构建了雄性小鼠内分泌垂体的单细胞转录组图谱,涵盖了健康与损伤状态下的重要出生后年龄段,重点研究了垂体干细胞及其复杂身份和微环境 | 通过单细胞转录组技术揭示了垂体干细胞的标记物和调控因子,并利用垂体干细胞类器官功能验证了转录组发现,特别是KLF5、AP-1复合物和EGF通路在垂体干细胞调控中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,尽管部分发现可转化至人类,但仍需进一步验证 | 揭示垂体干细胞的生物学特性及其在衰老过程中的变化 | 雄性小鼠的垂体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖健康与损伤状态下的雄性小鼠垂体样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 11627 | 2025-02-05 | 
         Molecular characterization of ovarian mesonephric-like adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing and mitochondrial metabolism 
        
          2025-Feb, Gynecologic oncology reports
          
          IF:1.2Q3
          
         
        
          DOI:10.1016/j.gore.2024.101670
          PMID:39895896
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对卵巢中肾样腺癌(MLA)进行了分子特征分析,并与高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)进行了比较 | 首次使用单细胞RNA测序技术对卵巢MLA进行分子特征分析,揭示了其与HGSOC的差异,并提出了针对MAP激酶和PI3K/AKT/mTOR通路的联合治疗策略 | 需要在更大规模的队列中进行验证以支持临床应用 | 揭示卵巢MLA的分子特征及其与HGSOC的差异,探索潜在的治疗靶点 | 卵巢中肾样腺癌(MLA)和高级别浆液性卵巢癌(HGSOC) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 一个卵巢MLA样本和HGSOC的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 11628 | 2025-02-05 | 
         Bioinformatics combining machine learning and single-cell sequencing analysis to identify common mechanisms and biomarkers of rheumatoid arthritis and ischemic heart failure 
        
          2025-Jan-30, Heliyon
          
          IF:3.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41641
          PMID:39897930
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序分析,旨在识别类风湿性关节炎(RA)和缺血性心力衰竭(IHF)的共同机制和生物标志物 | 通过整合多个RA和IHF数据集的RNA测序数据,识别出177个共同差异表达基因,并通过PPI网络分析和机器学习确定了五个枢纽基因,揭示了炎症免疫反应在RA患者IHF进展中的关键作用 | 研究依赖于现有数据集,可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别RA和IHF的共同机制和生物标志物,为早期诊断、个性化治疗和预防策略提供方向 | 类风湿性关节炎(RA)和缺血性心力衰竭(IHF)患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎, 缺血性心力衰竭 | RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习 | RNA测序数据 | 五个RA和IHF数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 11629 | 2025-02-05 | 
         Multi-omics analysis of core E3 ubiquitin ligase identifies prognostic biomarkers associated with immune infiltration and drug sensitivity in lung adenocarcinoma 
        
          2025, Journal of Cancer
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7150/jca.104837
          PMID:39895786
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过多组学分析核心E3泛素连接酶,识别了与肺腺癌免疫浸润和药物敏感性相关的预后生物标志物 | 首次系统研究了E3泛素连接酶在肺腺癌中的表达、预后、免疫浸润、药物敏感性及潜在分子机制,并发现其与不良预后和特定免疫细胞浸润相关 | 研究主要基于数据库分析和计算机模拟,缺乏实验验证 | 研究E3泛素连接酶在肺腺癌中的调控作用及其作为预后和药物敏感性标志物的潜力 | 肺腺癌(LUAD)患者及肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学分析、免疫荧光分析、免疫组化、单细胞分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 11630 | 2025-02-05 | 
         Integrating of Radiomics and Single-cell Transcriptomics Uncovers the Crucial Role of γδ T Cells in Lung Adenocarcinoma 
        
          2025, Journal of Cancer
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7150/jca.105586
          PMID:39895781
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过整合放射组学和单细胞转录组学,揭示了γδ T细胞在肺腺癌中的关键作用 | 首次结合多组学数据研究γδ T细胞在肺腺癌中的功能,并建立了基于放射组学的预测模型 | γδ T细胞在肿瘤中的双重作用及其对肺腺癌的影响仍存在争议 | 探讨γδ T细胞在肺腺癌中的功能及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 放射组学、单细胞转录组学 | 预测模型 | CT图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 11631 | 2025-02-05 | 
         Integration of Single-Cell and Bulk Transcriptomes to Identify a Poor Prognostic Tumor Subgroup to Predict the Prognosis of Patients with Early-stage Lung Adenocarcinoma 
        
          2025, Journal of Cancer
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7150/jca.105926
          PMID:39895784
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了早期肺腺癌的不良预后肿瘤亚群,并构建了预后模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征,并开发了一个基于KRT8和PERP的新型预后模型 | 研究主要依赖于已发表的文献和数据库中的细胞标记物,可能限制了新细胞类型的发现 | 研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征并开发预后模型 | 早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR),蛋白质印迹(western blot) | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA | 
| 11632 | 2025-02-05 | 
         Integrated Multi-omics Data Analysis and In Vitro Validation Reveal the Crucial Role of Glycogen Metabolism in Gastric Cancer 
        
          2025, Journal of Cancer
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7150/jca.104424
          PMID:39895799
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究旨在探讨胃癌中的糖原代谢,并开发基于糖原的风险评分模型以预测胃癌预后 | 首次整合多组学数据分析和体外验证,揭示了糖原代谢在胃癌中的关键作用,并开发了一个新的糖原风险评分模型 | 研究中使用的数据集主要来自公开数据库,可能缺乏某些特定人群的代表性 | 研究胃癌中的糖原代谢及其对预后的影响 | 胃癌患者及其相关数据 | 生物信息学 | 胃癌 | ssGSEA方法、共识聚类分析、单细胞测序 | 糖原风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 33种肿瘤类型的患者表达谱、4个胃癌批量测序数据集、1个单细胞测序数据集、IMvigor210免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA | 
| 11633 | 2025-02-05 | 
         Crotonylation-Related Prognostic Model of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Based on Transcriptome Analysis and Single-Cell Sequencing Analysis 
        
          2025, International journal of general medicine
          
          IF:2.1Q2
          
         
        
          DOI:10.2147/IJGM.S493800
          PMID:39895826
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探讨了crotonylation相关基因在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的作用,并构建了预后模型 | 首次在ESCC中研究了crotonylation相关基因的作用,并利用单细胞测序分析评估了细胞通讯和伪时间动态 | 研究依赖于公开数据集,未进行实验验证 | 探讨crotonylation相关基因在ESCC中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 转录组分析、单细胞测序分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个ESCC数据集,包含24个crotonylation相关基因 | NA | NA | NA | NA | 
| 11634 | 2025-02-05 | 
         Sonic hedgehog medulloblastoma cells in co-culture with cerebellar organoids converge towards in vivo malignant cell states 
        
          2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
          
          IF:3.7Q2
          
         
        
          DOI:10.1093/noajnl/vdae218
          PMID:39896075
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过将Sonic hedgehog髓母细胞瘤(SHH-MB)细胞与小脑类器官共培养,探讨了非恶性肿瘤微环境对SHH-MB细胞表型特性的影响 | 开发了一种新型的体外SHH-MB模型,揭示了微环境对肿瘤细胞状态的非细胞自主性诱导作用 | 研究仅基于两种SHH-MB细胞系,可能无法完全代表所有SHH-MB亚型的特性 | 识别由非恶性肿瘤微环境驱动的SHH-MB细胞表型特性 | Sonic hedgehog髓母细胞瘤(SHH-MB)细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 两种SHH-MB细胞系与小脑类器官共培养 | NA | NA | NA | NA | 
| 11635 | 2025-02-05 | 
         Single-cell analysis reveals islet autoantigen's immune activation in type 1 diabetes patients 
        
          2025-Jan, Journal of clinical biochemistry and nutrition
          
          IF:2.0Q3
          
         
        
          DOI:10.3164/jcbn.24-86
          PMID:39896168
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术,全面检测了1型糖尿病患者外周血单核细胞在GAD、IA-2和胰岛素抗原重叠肽刺激下的基因表达和T细胞受体库 | 首次在单细胞水平上揭示了1型糖尿病患者胰岛自身抗原的免疫激活机制,并发现了T细胞受体β链在特定配对中的单克隆增加 | 样本量较小,仅包括20名男性患者,且仅对其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | 研究1型糖尿病的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 | 1型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 单细胞测序 | 1型糖尿病 | 单细胞测序,T细胞受体库分析 | NA | 单细胞基因表达数据,T细胞受体序列数据 | 20名男性1型糖尿病患者,其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | NA | NA | NA | NA | 
| 11636 | 2025-02-05 | 
         CLEC11A-Driven Molecular Mechanisms in Intervertebral Disc Degeneration: A Comprehensive Multi-Omics Study 
        
          2025, Journal of inflammation research
          
          IF:4.2Q2
          
         
        
          DOI:10.2147/JIR.S505296
          PMID:39897524
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CLEC11A在椎间盘退变(IVDD)中的分子机制 | 结合MR、转录组测序和单细胞转录组学,首次揭示了CLEC11A通过调控炎症介质ARTN和血清代谢物在IVDD中的关键作用 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内实验验证 | 揭示IVDD的遗传发病机制和关键驱动因素 | 椎间盘退变(IVDD) | 生物信息学 | 椎间盘退变 | MR、转录组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 11637 | 2025-10-07 | 
         Leveraging deep single-soma RNA sequencing to explore the neural basis of human somatosensation 
        
          2024-Dec, Nature neuroscience
          
          IF:21.2Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41593-024-01794-1
          PMID:39496796
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞体深度RNA测序和空间转录组学技术构建人类背根神经节神经元图谱 | 首次在人类DRG神经元中实现单细胞体深度RNA测序,平均检测超过9,000个独特基因,识别出16种神经元类型,并发现可能存在人类特异性神经元类型 | 技术难度导致以往缺乏人类DRG神经元单细胞体转录组数据,研究中可能仍存在某些技术限制 | 探索人类体感系统的神经基础 | 人类背根神经节(DRG)神经元 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNAscope原位杂交, 分子特征引导的微神经图记录 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 电生理记录数据 | 多个个体的人类DRG神经元 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞体深度RNA测序 | 
| 11638 | 2025-02-05 | 
         Development of a deep learning-based 1D convolutional neural network model for cross-species natural killer T cell identification using peripheral blood mononuclear cell single-cell RNA sequencing data 
        
          2024-Dec, Veterinary world
          
          IF:1.7Q2
          
         
        
          DOI:10.14202/vetworld.2024.2846-2857
          PMID:39897371
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究开发了一种基于一维卷积神经网络(1DCNN)的模型,用于跨物种识别自然杀伤T细胞(NKT细胞),并利用外周血单核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序数据进行验证 | 首次应用1DCNN模型进行跨物种NKT细胞识别,并成功识别了人类、犬类和猪类PBMC中的NKT细胞 | 需要进一步研究验证这些发现,并且模型在其他细胞类型识别中的应用尚未验证 | 开发一种用于跨物种NKT细胞识别的深度学习模型 | 人类、犬类和猪类的外周血单核细胞(PBMC) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 1DCNN | RNA测序数据 | 人类、犬类和猪类的PBMC数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 11639 | 2025-10-07 | 
         A single-cell atlas of the Culex tarsalis midgut during West Nile virus infection 
        
          2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2024.07.23.603613
          PMID:39091762
         
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      研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了白纹伊蚊中肠细胞图谱,并研究了西尼罗河病毒感染的细胞特异性动态 | 首次在高效传播媒介白纹伊蚊中建立中肠单细胞图谱,揭示了不同细胞类型对病毒感染的差异性易感性 | 未检测到典型蚊虫抗病毒免疫基因在中肠整体水平上的显著上调 | 研究西尼罗河病毒在蚊虫中肠的感染动态和细胞特异性反应 | 白纹伊蚊中肠细胞 | 单细胞组学 | 西尼罗河病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11640 | 2025-10-07 | 
         Novel insights into the heterogeneity of FOXP3 + Treg cells in drug-induced allergic reactions through single-cell transcriptomics 
        
          2024-10, Immunologic research
          
          IF:3.3Q3
          
         
        
          DOI:10.1007/s12026-024-09509-1
          PMID:39073709
         
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      研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FOXP3+调节性T细胞在药物诱导过敏反应中的异质性及其免疫调节作用 | 首次在药物诱导过敏反应背景下发现FOXP3+Treg细胞的显著转录组异质性,并证实FOXP3过表达可减轻过敏反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探究FOXP3+Treg细胞在药物诱导过敏反应中的异质性和免疫调节功能 | 小鼠模型中的FOXP3+调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,CRISPR/Cas9基因编辑,ELISA,细胞增殖检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |