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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 1141 - 1160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1141 2026-08-31
Spatial transcriptomics identifies SPARC as a prognostic marker in interstitial lung diseases
2025-09, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 利用空间转录组学识别SPARC作为间质性肺疾病的预后标志物 首次将空间转录组学与高维加权基因共表达网络分析相结合,跨疾病识别出与活动性纤维化相关的关键基因模块,并发现SPARC作为潜在预后标志物 研究样本量较小(5例ST分析,71例验证),且未进行功能实验验证SPARC的因果作用 识别不同间质性肺疾病中参与进行性纤维化的关键分子,并评估其预后价值 间质性肺疾病患者的肺部冷冻活检标本 空间转录组学 间质性肺疾病 空间转录组学(Visium)、单细胞RNA测序、免疫组化 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、轨迹分析 空间基因表达数据、单细胞转录组数据、免疫组化图像 5例用于空间转录组分析,71例用于预后验证 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
1142 2026-08-31
T Cells Enhance Tissue Complexity and Function to Study Fibrosis in 3D Skin-Like Tissue Models
2025-07, Tissue engineering. Part C, Methods
研究论文 开发了包含T细胞的三维皮肤样组织模型,通过单细胞RNA测序等技术研究T细胞在纤维化中的作用 首次构建了包含自体或异体T细胞的三维皮肤样组织模型,结合scRNA-seq鉴定出五种T细胞亚群,弥补了单层培养与动物模型之间的差距 未明确提及局限性,可能包括模型复杂度有限及体内验证不足 研究T细胞在组织纤维化发病机制中的作用,建立更预测性的三维模型用于临床前药物筛选和纤维化疾病的机制研究 皮肤样组织中的T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞,以及来自硬皮病患者的细胞 数字病理学 硬皮病 单细胞RNA测序 三维组织模型 单细胞基因表达数据及组织图像 来自硬皮病患者的细胞构建的组织模型,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1143 2026-08-31
Plin2 Coordinates Immune and Metabolic Reprogramming in Lacrimal Gland Aging
2025-06-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过批量转录组和单细胞RNA测序,识别出Plin2作为泪腺衰老的核心调控因子,并揭示其在免疫失衡和代谢功能障碍中的作用 首次将Plin2确定为泪腺衰老中免疫-代谢重编程的主调控因子,并通过机器学习和单细胞测序验证其与促炎和抗炎免疫细胞的相关性 信息未提供,可能存在样本量有限或机制验证不足的限制 识别泪腺衰老的核心分子调控因子并阐明其在免疫失衡及代谢功能障碍中的角色 幼年和老年C57BL/6小鼠的泪腺组织 机器学习 干眼症 批量RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) LASSO回归、支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) 转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1144 2026-08-31
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-06-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 该研究构建了不同发育阶段兔巩膜的单细胞转录组图谱,揭示了成纤维细胞异质性、分化轨迹和细胞间通讯。 首次构建兔巩膜发育的单细胞图谱,揭示了成纤维细胞的异质性及其在基质重塑中的作用,并通过跨物种分析发现保守的分子特征。 未提及 构建兔巩膜发育的单细胞图谱,阐明成纤维细胞异质性、分化轨迹、基质体表达模式和细胞间通讯。 新西兰兔的巩膜组织,来自胚胎第25天和出生后第7、21、180天。 单细胞转录组学 眼部发育相关疾病(如近视) 单细胞RNA测序 Seurat、VIA、CellChat、AUCell、CACIMAR、hdWGCNA 单细胞转录组数据 4个发育阶段的兔巩膜样本(E25、P7、P21、P180) BGI 单细胞RNA测序 BGISEQ-2000 DNBelab C系列试剂盒,BGISEQ-2000平台
1145 2026-08-31
Emerging technologies of single-cell multi-omics
2025-06-01, Haematologica IF:8.2Q1
综述 本文概述了单细胞多组学技术原理、历史发展及其在造血系统异质性研究中的应用,并指导研究者选择合适的平台 系统梳理了单细胞多组学技术的原理和发展历史,并针对造血系统的研究需求提供了平台选择的指导 未详述具体技术细节或实验方案,可能无法覆盖所有最新进展 综述单细胞多组学技术,并指导研究者根据研究问题选择合适平台 正常和恶性造血系统细胞 单细胞组学 血液系统疾病 单细胞多组学技术 NA 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
1146 2026-08-31
Phosphodiesterase 5 inactivation in vascular smooth muscle cells aggravates aortic aneurysm and dissection
2025-06, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型,发现血管平滑肌细胞中磷酸二酯酶5A的失活会加剧主动脉瘤和主动脉夹层的发生 首次揭示了平滑肌细胞特异性PDE5A在主动脉瘤和夹层发病中的因果作用,并阐明了其通过cGMP/PKG通路调节平滑肌收缩性的机制 摘要中未提及研究的局限性 探究平滑肌细胞特异性PDE5A在主动脉瘤和夹层发病机制中的作用 人类和小鼠主动脉组织、平滑肌细胞特异性PDE5A敲除和过表达小鼠 数字病理学 主动脉瘤和主动脉夹层 单细胞RNA测序、西方印迹、免疫荧光、免疫组织化学、体内成像、组织学分析 基因敲除和过表达小鼠模型 图像和基因组数据 未明确样本数量,涉及人类和小鼠主动脉组织及多种小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1147 2026-08-31
Multidimensional analysis of matched primary and recurrent glioblastoma identifies contributors to tumor recurrence influencing time to relapse
2025-01-01, Journal of neuropathology and experimental neurology IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过对匹配的原发性和复发性胶质母细胞瘤样本进行多维度分析,揭示了肿瘤复发中促进因素及其对复发时间的影响 采用多组学方法(转录组、蛋白质组和空间转录组)对同一患者的原发和复发肿瘤进行配对分析,发现了与复发时间相关的基因和蛋白质,并首次揭示了活化的小胶质细胞/巨噬细胞在GBM复发中的作用 样本量可能有限,且研究基于冷冻肿瘤样本,可能无法完全反映肿瘤微环境的复杂性 表征胶质母细胞瘤纵向变化,寻找预防肿瘤复发的潜在可干预靶点 患者匹配的IDH野生型WHO 4级原发性和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本 基因组学、蛋白质组学、空间转录组学 胶质母细胞瘤 转录组测序(RNA-seq)、蛋白质组学分析、空间转录组学 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 来自患者的配对原发和复发肿瘤样本(具体数量未提及) NA 空间转录组学 NA 组织微阵列用于空间转录组分析
1148 2026-08-31
Biallelic Loss-of-Function Variants in UBAP1L and Nonsyndromic Retinal Dystrophies
2024-11-01, JAMA ophthalmology IF:7.8Q1
研究论文 本研究描述6名携带UBAP1L基因双等位基因致病性变体的非综合征性视网膜营养不良患者,并提供了临床和分子特征。 首次将UBAP1L确定为非综合征性视网膜营养不良的新型候选致病基因,并通过小鼠模型和微小基因检测提供了功能证据。 小鼠模型在15个月时未表现出视网膜退化,可能无法完全反映人类疾病表型。 提供携带UBAP1L双等位基因致病性变体的IRD患者的临床和分子特征。 6名来自不同家族的IRD患者。 遗传学, 基因组学, 分子生物学 视网膜营养不良, 视网膜色素变性 外显子组测序, 基因组测序, 单细胞RNA测序, 微小基因测定, 基因敲除小鼠 敲除小鼠模型 基因组数据, 单细胞转录组数据, 临床影像数据 6名患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1149 2026-08-30
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2026-May, The European respiratory journal
研究论文 探索成纤维细胞活化蛋白作为慢性肺同种异体移植功能障碍的早期生物标志物 首次在慢性肺同种异体移植功能障碍中评估FAP表达,并利用单细胞RNA测序和免疫组化相结合的方法,确定了FAP阳性面积的最佳阈值用于早期风险分层 FAP的鉴别能力中等,需要在多中心队列中进行前瞻性验证 评估FAP表达在慢性肺同种异体移植功能障碍中是否升高,并探究其作为早期诊断标志物的潜力 两个小鼠原位肺移植模型和人类肺组织样本(五个对照和五个慢性肺同种异体移植功能障碍患者)及240名肺移植受者的经支气管活检 数字病理学 慢性肺同种异体移植功能障碍 单细胞RNA测序、免疫组化 Cox比例风险模型、Kaplan-Meier分析 基因表达数据、组织图像 小鼠模型两个,人类肺组织十个样本,240名肺移植受者(62例有慢性肺同种异体移植功能障碍,178例无) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1150 2026-08-30
A deep learning-based multiscale integration of spatial omics with tumor morphology
2025-11-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种基于深度学习的多尺度整合方法MISO,将空间转录组学与肿瘤形态学相结合,用于预测基因表达 MISO方法实现了近单细胞分辨率的空间基因表达预测,并在多个数据集上显著优于现有方法 未知 开发一种深度学习方法来整合空间转录组学与肿瘤形态学,以预测基因表达 空间转录组数据与H&E染色组织切片 深度学习 癌症 空间转录组学 深度学习模型 图像和空间转录组数据 72个10X Genomics Visium样本和348个来自MOSAIC联盟的样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Genomics Visium平台
1151 2026-08-30
Extracellular matrix anchored neutrophils drive pulmonary fibrosis in mice
2025-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞外基质蛋白质组学,在矽肺小鼠模型中鉴定出一类反向跨内皮迁移的中性粒细胞亚群,其通过ICAM1介导的与细胞外基质的相互作用被保留在纤维化区域,并促进肺纤维化进展 首次鉴定出肺纤维化中发生反向跨内皮迁移的中性粒细胞亚群,并揭示其通过ICAM1与细胞外基质互作而被滞留,以及巨噬细胞来源的CTSC切割ICAM1为可溶形式进而激活成纤维细胞的机制 所有动物实验均使用雄性小鼠,可能无法完全代表雌性个体的疾病机制;研究仅在矽肺小鼠模型中进行,需进一步验证在其他肺纤维化病因中的适用性 探究中性粒细胞在肺纤维化中的作用机制,特别是反向跨内皮迁移中性粒细胞与细胞外基质的相互作用及其对纤维化的贡献 矽肺小鼠模型中的中性粒细胞、巨噬细胞、细胞外基质及成纤维细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、空间转录组学、细胞外基质蛋白质组学 不适用 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 未明确提及具体数量,涉及矽肺小鼠模型的肺组织样本 不适用 单细胞RNA测序、空间转录组学 不适用 不适用
1152 2026-08-30
Uncovering the immune mechanisms underlying the emergence of immunotherapy-induced pneumonitis in lung cancer patients
2025-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞分析揭示肺癌患者免疫检查点抑制剂相关肺炎的免疫机制 首次结合scRNA-seq和scTCR/BCR-seq全面分析CIP组织及配对的非癌旁组织,揭示CD8⁺组织驻留记忆T细胞扩增、IFNG表达升高及TCR克隆共享增加等新型免疫病理机制 摘要中未提及研究局限性 阐明免疫检查点抑制剂相关肺炎的精确免疫发病机制,为干预提供策略 肺癌患者的CIP组织和匹配的非癌旁组织 单细胞分析 肺癌、免疫检查点抑制剂相关肺炎 scRNA-seq, scTCR/BCR-seq NA 单细胞转录组和免疫受体序列数据 未在摘要中明确样本数量 NA single-cell RNA-seq, single-cell TCR/BCR-seq NA NA
1153 2026-08-30
Evidence from spatial transcriptomics for the mosaic hypothesis and pure cell types in the cortex
2025-Oct-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学数据,通过统计点过程分析框架,为大脑皮层中神经元的镶嵌假说和细胞类型纯度提供了证据 开发了一种统计点过程分析框架,用于空间转录组数据,首次在皮层中跨多种兴奋性和抑制性神经元类型展示空间回避现象,并提出一种评估细胞类型纯度的金标准指标 摘要中未提及具体局限性 验证皮层中神经元的镶嵌假说,并评估细胞类型的纯度 大脑皮层中的兴奋性和抑制性神经元类型 空间转录组学 NA 空间转录组学 统计点过程模型 空间转录组数据 未提及具体样本量 NA 空间转录组学 NA NA
1154 2026-08-30
Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases
2025-Oct-01, Annals of surgery IF:7.5Q1
研究论文 本文介绍了一种结合体外和体内模型研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛活力和免疫调节作用的方法学框架,以期为免疫和外科疾病的精准医学提供新策略 提出将免疫调节和细胞再生策略相结合用于治疗免疫和外科疾病,并聚焦lacritin肽的多重功能,利用单细胞RNA测序和质谱流式等先进技术进行临床前评估 本文为方法学框架介绍,尚未提供完整的实验结果和临床验证数据 评估lacritin肽在免疫调节和细胞再生方面的治疗潜力,推动精准医学在免疫和外科疾病中的应用 lacritin肽对胰腺β细胞、胰岛以及免疫细胞的作用 精准医学 自身免疫性疾病、外科疾病(如1型糖尿病、克罗恩病、心力衰竭等) 单细胞RNA测序, 质谱流式, 成像质谱流式, 体外胰岛测试, 体内移植模型 NA 基因表达数据, 细胞图像 NA NA 单细胞RNA测序, 质谱流式 NA NA
1155 2026-08-30
Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation
2025-Oct, Autophagy IF:14.6Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序与metaTF分析,解析小鼠造血干细胞发育六个连续阶段的转录调控,发现自噬相关转录因子在不同阶段特异性调控干细胞形成 首次结合单细胞RNA测序与metaTF分析,从转录因子活性而非仅表达量角度刻画自噬在造血干细胞发育中的动态调控,并构建阶段特异性自噬相关转录因子-靶基因网络 研究仅基于小鼠模型,且未深入验证转录因子与靶基因间的直接调控关系 阐明自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的阶段特异性调控机制 小鼠造血干细胞发育的六个连续阶段,包括胚胎期AGM区、胎肝及成年骨髓 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序 metaTF 单细胞基因表达数据 小鼠造血干细胞发育六个阶段(E10.5 AGM、E12.5/E14.5胎肝、成年骨髓) 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
1156 2026-08-30
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-10, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过综合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾脏病进展中的作用,并鉴定了潜在的新型诊断生物标志物和治疗靶点。 首次整合GEO数据集分析、PPI网络、ceRNA网络预测、单细胞测序和体外实验,系统验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾脏病中的调控机制,并发现血清CCL2、miR-124-3p和NEAT1可作为疾病分期的诊断标志物。 生物信息学和临床队列的样本量适中,可能限制结果的普遍性。 识别慢性肾脏病的新型诊断生物标志物和治疗靶点,并探索其潜在调控机制。 慢性肾脏病患者及健康对照血清样本、TCMK1细胞(TGF-β1处理的EMT模型)、GEO数据集GSE137570。 生物信息学 慢性肾脏病 (未明确,但涉及)基因表达谱分析、单细胞测序、双荧光素酶报告基因实验、体外细胞实验 NA 基因表达数据、单细胞测序数据、临床样本数据、体外实验数据 64例慢性肾脏病患者,20例健康对照;GEO数据集GSE137570;TCMK1细胞 NA 单细胞测序、基因表达芯片(推测GEO数据集可能使用) NA NA
1157 2026-08-30
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-10-01, Inflammatory bowel diseases IF:4.5Q1
研究论文 本研究描述了一名17岁男性患者因RELA单倍剂量不足而表现为非典型克罗恩病表型的临床、基因组和免疫学特征 首次将RELA单倍剂量不足与克罗恩病样表型、Th1/Th17极化和干扰素驱动的炎症联系起来,并利用多种组学技术(如CyTOF和单细胞RNA测序)进行深入免疫分析 未提及 表征由RELA单倍剂量不足驱动的非典型克罗恩样表型患者的临床、基因组和免疫学特征 一名17岁男性患者,患有全肠克罗恩病、肛周瘘管、慢性黏膜皮肤念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 基因组学、免疫学 克罗恩病 全外显子测序、Sanger测序、蛋白质建模、Western blot、免疫荧光、NF-κB激活实验、质谱流式细胞术(CyTOF)、单细胞RNA测序 NA 基因组和转录组数据、免疫表型数据 1例患者及对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1158 2026-08-30
Glioblastoma exploits ATP from leading-edge astrocytes to fuel its infiltrative growth revealed by spatially resolved chimeric analysis
2025-09-26, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 介绍了一种名为SCAR的计算工具,用于解析空间转录组学中人-鼠嵌合癌症模型中的肿瘤-微环境基因表达,揭示了胶质母细胞瘤浸润性生长依赖星形胶质细胞提供ATP的机制 首次引入空间分辨嵌合分析工具SCAR,能够区分肿瘤细胞与微环境细胞,揭示胶质母细胞瘤浸润前沿的代谢重编程机制,并发现CKB在细胞外催化ATP和肌酸转化为磷酸肌酸的过程 摘要中未提及明显的局限性 开发SCAR工具并利用其解析胶质母细胞瘤与肿瘤微环境的空间相互作用,探索浸润性生长的代谢机制 人-鼠嵌合胶质母细胞瘤模型中的肿瘤细胞和星形胶质细胞 计算生物学、空间转录组学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 计算工具SCAR 空间转录组数据 未明确提及 NA 空间转录组学 NA NA
1159 2026-08-30
A spatial transcriptomics dataset of pancreas sections in normal glucose tolerance and type 2 diabetic donors
2025-09-01, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 报告了来自三名2型糖尿病供体和三名正常葡萄糖耐量供体的胰腺切片空间转录组数据集,并识别和纠正了高表达基因的转录泄漏问题 首次提供了胰腺切片的空间转录组数据集,并引入概率模型对高丰度基因的转录泄漏进行计算校正 样本量较小(仅三名T2D和三名NGT供体),且转录泄漏校正方法可能需要进一步的验证 研究正常和2型糖尿病状态下胰腺基因表达的空间分布,并解决空间转录组数据处理中的技术挑战 人类胰腺组织切片 空间转录组学 2型糖尿病 空间转录组测序 概率模型 基因表达数据 6个胰腺样本(3个T2D供体,3个NGT供体) NA 空间转录组学 NA NA
1160 2026-08-30
Splicing regulatory dynamics for precision analysis and treatment of heterogeneous leukemias
2025-05-07, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 开发了无监督计算流程OncoSplice,从剪接谱中定义肿瘤分子景观,识别白血病亚型并验证PRMT5作为治疗靶点 首次在没有剪接因子突变的条件下,利用剪接谱全面解析白血病遗传亚型,发现新的显性剪接亚型并验证PRMT5抑制剂的治疗潜力 未明确提及,但可能包括计算流程依赖数据质量及验证样本数量有限 从剪接谱中识别驱动遗传学,定义分子亚型,并验证治疗靶点 成人和儿童急性髓系白血病(AML)患者样本及细胞系 计算生物学、基因组学 白血病 长读长单细胞RNA测序 无监督计算流程(OncoSplice),未指定具体深度学习模型 RNA测序数据(短读长和长读长单细胞) 包括成人和儿童AML队列,具体样本数未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA 长读长单细胞RNA测序
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