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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-01-15 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
|
研究论文 | 本文利用成像空间转录组学数据,绘制了人类扁桃体的转录图谱,并比较了其与单细胞RNA测序在细胞组成分析中的优势 | 开发了一个多尺度分析流程,专注于空间数据的组织、相互作用和功能特性,揭示了扁桃体的空间结构和免疫过程 | 数据仍存在分析挑战和标准化不足的问题 | 研究免疫反应在原生组织环境中的空间转录组学应用,并展示其在细胞组成分析中的优势 | 人类扁桃体组织 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 | 约200万个细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1122 | 2026-01-15 |
Co-targeting MRPS7-23 synergistically enhances cisplatin efficacy to suppress nasopharyngeal carcinoma growth and metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115523
PMID:41522354
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了MRPS7和MRPS23通过稳定β-catenin驱动鼻咽癌顺铂耐药的新机制,并发现靶向其上游调控因子USP10可协同增强顺铂疗效 | 首次鉴定出线粒体核糖体蛋白MRPS7和MRPS23是鼻咽癌顺铂耐药的关键驱动因子,并阐明了其通过抑制β-catenin泛素化促进癌症干细胞特性和上皮-间质转化的分子机制,同时发现了USP10作为上游调控因子的新作用 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化效果仍需进一步验证;耐药机制可能涉及其他未被发现的通路 | 阐明鼻咽癌顺铂耐药的分子机制,并寻找逆转耐药的治疗策略 | 鼻咽癌细胞系、动物模型以及相关的分子通路 | 癌症生物学 | 鼻咽癌 | 整合多组学分析、单细胞RNA测序、质谱分析、功能研究 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1123 | 2026-01-15 |
Dual Phosphorylation of STAT1 at Y701/S727 by TNFα Drives AIM2-Mediated PANoptosis of Renal Tubular Epithelial Cells and Fibrotic Progression in Renal Allografts
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.123441
PMID:41522348
|
研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过双重磷酸化STAT1激活AIM2,驱动肾小管上皮细胞发生PANoptosis,进而促进肾移植间质纤维化的分子机制 | 首次阐明了TNF-α/STAT1/AIM2轴在触发PANoptosis及其下游EMT-纤维化级联反应中的作用,为慢性移植肾功能障碍提供了新的治疗靶点 | NA | 探究慢性移植肾功能障碍中肾移植间质纤维化的分子机制 | 肾移植组织、肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 慢性移植肾功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1124 | 2026-01-15 |
Acute anti-Aβ antibody exposure induces microglial changes and significantly alters chemokine signaling
2026 Jan-Mar, Alzheimer's & dementia (New York, N. Y.)
DOI:10.1002/trc2.70201
PMID:41522370
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析,探讨了抗淀粉样蛋白β抗体(3D6)急性暴露对大脑免疫反应的影响,特别是小胶质细胞的变化和趋化因子信号通路的改变 | 首次在急性时间点(3天)通过单细胞测序揭示抗Aβ抗体如何快速改变小胶质细胞亚型和趋化因子信号,特别是CCL通路靶向稳态小胶质细胞而非疾病相关亚型的新发现 | 研究仅基于短期(3天)观察,未评估长期效应;颅内注射模型可能无法完全模拟临床免疫治疗的实际给药方式 | 阐明抗淀粉样蛋白β抗体治疗阿尔茨海默病时大脑的即时免疫反应机制 | 小鼠大脑皮层组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及3D6抗体注射组和IgG对照组的小鼠大脑皮层 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1125 | 2026-01-15 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Deubiquitination Genes as Prognostic Markers in Hepatocellular Carcinoma
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/4893924
PMID:41523581
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了去泛素化基因在肝细胞癌中的预后标志物作用 | 首次在单细胞水平整合分析HCC肿瘤样本,结合TCGA和ICGC大样本队列,构建了基于去泛素化酶基因的预后风险模型 | 需要进一步的实验验证来确认研究结果 | 探究去泛素化在肝细胞癌进展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌肿瘤样本、TCGA和ICGC数据库中的RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | LASSO-Cox机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据、bulk RNA测序数据 | 13个初治HCC肿瘤样本的单细胞数据,374个TCGA样本和243个ICGC样本的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1126 | 2026-01-15 |
Itaconate-Related Gene Signatures as Prognostic Markers in Colon Cancer: Insights From Transcriptomic and Spatial Analysis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7928082
PMID:41523911
|
研究论文 | 本研究首次综合运用批量转录组学、单细胞转录组学和空间转录组学数据,全面分析了衣康酸及其相关通路基因在结肠癌中的表达、生物学作用和预后价值,并构建了一个优于现有模型的预后预测模型 | 首次在结肠癌中系统分析衣康酸相关基因的预后价值,并整合了单细胞和空间转录组学数据来阐明这些基因在肿瘤微环境中的细胞特异性表达和空间分布特征 | 研究主要基于TCGA和GEO的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 | 开发用于结肠癌患者精确预后评估和分层治疗的新型生物标志物和预测模型 | 结肠癌患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 批量转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,组织微阵列 | 弹性网络回归模型 | 转录组数据,空间表达数据,单细胞数据 | 训练集:TCGA数据库中的448例结肠癌患者;验证集:GEO数据库中的7个预后模型,共1473例 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1127 | 2026-01-15 |
Integrated Multiomics Analysis Reveals a Migrasome-Related Signature for Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8778797
PMID:41523912
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,揭示了迁移体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗反应预测价值 | 首次构建了基于迁移体的肺腺癌预后模型,并验证了其在识别免疫治疗受益者方面的临床实用性 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证和前瞻性临床研究确认 | 解析迁移体在肺腺癌中的分子特征及其临床意义 | 肺腺癌患者样本 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析,包括bulk转录组和单细胞RNA-seq | 机器学习框架,包含10种算法,最优模型为Lasso-Cox | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | 541个TCGA/GEO肺腺癌样本,以及GSE156632单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1128 | 2026-01-15 |
Tumor prognostic risk stratification based on pseudo-time analysis of single-cell sequencing for patients with lung adenocarcinoma
2025-Dec-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1581
PMID:41522114
|
研究论文 | 本研究利用单细胞伪时间序列分析识别与肺腺癌发展相关的伪时间差异基因,并构建基于这些基因的预后风险分层模型 | 首次将单细胞伪时间分析应用于肺腺癌预后风险分层,识别出13个与预后高度相关的伪时间差异基因,并构建了有效的风险模型 | 研究主要基于回顾性数据,需要进一步的前瞻性验证;单细胞数据样本量可能有限 | 开发肺腺癌患者的准确预后风险分层方法 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学分析 | Cox回归,LASSO,随机森林 | 单细胞RNA测序数据,多中心转录组数据,免疫组织化学图像 | TCGA-LUAD患者队列及多中心验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1129 | 2026-01-15 |
Dynamic release of extracellular particles after opening of the blood-brain barrier predicts glioblastoma susceptibility to paclitaxel
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65681-4
PMID:41402297
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于捕获胶质母细胞瘤患者循环细胞外囊泡和颗粒的微流控设备,并发现血脑屏障打开后这些颗粒的释放动态可预测患者对紫杉醇的治疗反应 | 首次将血脑屏障打开与循环细胞外颗粒动态释放相结合,开发了基于Annexin-V化学的微流控捕获平台,并将其作为实时替代生物标志物用于评估胶质母细胞瘤治疗反应 | 需要未来前瞻性验证,样本量有限(I期临床试验),且仅针对紫杉醇治疗 | 探索血脑屏障打开后循环细胞外颗粒作为胶质母细胞瘤治疗反应生物标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 微流控技术、蛋白质组学、纳米颗粒追踪分析、Western blot、扫描电镜、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、影像数据 | I期临床试验患者(具体数量未明确说明),直至疾病进展或最多6个周期 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1130 | 2026-01-15 |
Western Diet Inhibits FUT7-Mediated Treg Intestinal Homing to Disrupt the Homeostasis of Intestinal Epithelial Cells in Crohn's Disease
2025-Dec-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509541
PMID:41398516
|
研究论文 | 本研究揭示了西方饮食通过抑制FUT7介导的Treg肠道归巢,从而破坏肠道上皮细胞稳态,进而促进克罗恩病发展的机制 | 首次阐明了西方饮食通过下调Treg中FUT7表达,削弱Treg肠道归巢能力及其与肠道上皮细胞的信号串扰,从而破坏肠道稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据有限;机制研究尚未完全阐明FUT7表达下调的具体上游信号通路 | 探究西方饮食如何破坏肠道上皮细胞稳态并促进克罗恩病发生 | 小鼠模型(2,4,6-三硝基苯磺酸诱导的克罗恩病模型、初始CD4 T细胞过继转移模型)及活动期克罗恩病患者 | 单细胞组学与空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1131 | 2026-01-15 |
Integrating multi-omics data to resolve patterns of ion channel regulation in melanoma and predict tumor treatment response
2025-Dec-05, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01866-x
PMID:41348242
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研究论文 | 本研究整合单细胞空间转录组和多组学数据,解析黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式,并预测肿瘤治疗反应 | 首次在黑色素瘤中系统评估离子通道相关基因的调控模式,结合单细胞空间转录组数据揭示其与肿瘤微环境细胞浸润特征的关联,并构建了ICRG评分系统用于预后评估和治疗靶向策略 | NA | 解析黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式,预测肿瘤治疗反应并评估预后 | 皮肤黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞空间转录组学,多组学数据分析 | NA | 转录组数据,空间转录组数据,多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1132 | 2026-01-15 |
A comparative review of single-cell atlases: mapping cellular diversity across species and tissues
2025-Dec-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05952-x
PMID:41326763
|
综述 | 本文对现有的单细胞图谱进行了深入的比较分析,评估了它们在物种、组织覆盖范围、数据集规模等方面的差异与局限性 | 基于Hrovatin等人提出的更新框架,对当前单细胞图谱进行了系统性比较评估,并提出了未来扩展、整合和标准化单细胞图谱计划的关键建议 | 现有图谱在物种代表性和组织类型覆盖上存在不足,部分物种和组织类型代表性较低 | 系统比较和评估现有单细胞图谱,为未来单细胞图谱计划的发展提供指导 | 人类细胞图谱、小鼠细胞图谱等跨物种和组织的单细胞参考图谱 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1133 | 2026-01-15 |
The intratumor microbiome and cancer immunity: from pathogenesis to therapeutic opportunities through artificial intelligence
2025-Dec, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2602537
PMID:41368873
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组与癌症免疫之间的相互作用,探讨了其在肿瘤发生、发展和治疗中的作用,并评估了人工智能在整合多组学数据以推动精准肿瘤学中的应用潜力 | 系统性地整合了肿瘤内微生物组在癌症免疫调节中的作用,并强调了人工智能技术(包括机器学习和深度学习)在解析微生物空间定位、功能及其与治疗反应关联方面的创新应用 | 面临数据异质性、模型可解释性以及伦理问题等挑战,且需要更标准化的实验协议、高分辨率空间分析以及外部验证数据集来支持结论的稳健性 | 探讨肿瘤内微生物组如何影响癌症免疫,并评估人工智能技术在促进微生物组信息驱动的精准肿瘤学诊断和治疗中的机遇 | 肿瘤内微生物组(包括细菌、真菌和病毒)及其与宿主免疫系统的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 下一代测序、空间转录组学 | 机器学习、深度学习 | 多组学数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1134 | 2026-01-15 |
DAGFormer: A graph-based domain adaptation approach for single-cell cancer drug response prediction
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013832
PMID:41417875
|
研究论文 | 提出一种基于图的域适应方法DAGFormer,用于整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据以预测单细胞癌症药物反应 | 通过构建细胞邻域图并使用图域适应技术,克服了批量效应,并首次考虑了细胞间相互作用在药物反应预测中的作用 | 未明确提及方法在计算效率或可扩展性方面的具体限制 | 开发计算方法来预测单细胞水平的癌症药物反应,以深入理解肿瘤异质性和耐药机制 | 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 基于图的域适应框架(DAGFormer) | RNA测序数据 | 十个独立的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1135 | 2026-01-15 |
IL7-TBRII, a Dual Cytokine Modulator Targeting IL-7 and TGF-β Pathways, Inhibits Tumor Progression and Metastasis
2025-Dec, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e42
PMID:41523140
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为IL7-TBRII的双功能融合蛋白,通过同时靶向IL-7和TGF-β通路,增强CD8 T细胞的抗肿瘤活性,抑制肿瘤进展和转移 | 通过分析scRNA-seq数据发现IL-7治疗后TGF-β信号升高,并据此设计了一种新型双功能融合蛋白IL7-TBRII,首次将IL-7激动剂与TGF-β陷阱结合,以协同调控肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型(MC38、4T1、EMT6),临床转化效果尚需进一步验证;未详细探讨IL7-TBRII在人体内的安全性和药代动力学特性 | 旨在通过同时调节IL-7和TGF-β通路,克服肿瘤免疫抑制微环境,提升免疫治疗效果 | 肿瘤浸润CD8 T细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1136 | 2026-01-15 |
Aging Mediates Inflammatory Transformation of Kidney-Resident Macrophages via Thrombospondin-1 Signaling
2025-Dec, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e39
PMID:41523144
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老肾脏中肾驻留巨噬细胞(KRMs)的表型转变,发现其氧化磷酸化(OXPHOS)增加,并识别出由肾小管来源的血小板反应蛋白-1(THBS1)信号驱动这一转变,导致炎症微环境形成 | 首次在衰老肾脏中系统描述KRMs的表型演化,并阐明THBS1作为关键信号分子通过促进OXPHOS驱动巨噬细胞向炎症表型极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类组织验证样本有限,且具体信号通路机制需进一步深入探究 | 探究衰老肾脏中肾驻留巨噬细胞的表型变化及其对肾脏稳态的影响 | 小鼠肾脏的肾驻留巨噬细胞(KRMs)及人类老年个体肾脏组织 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1137 | 2026-01-15 |
Engineering CCR2/IFN-γ overexpression in enucleated mesenchymal stem cells enhances therapy for rheumatoid arthritis
2025-Nov-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09248-5
PMID:41310172
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,增强其对类风湿关节炎的治疗效果 | 首次生成并应用过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,以解决传统MSCs治疗中肺部滞留和安全性问题,同时增强归巢能力和治疗效果 | 研究仅在雄性大鼠模型中进行,未涉及雌性动物或更复杂的临床前模型,且长期安全性和免疫原性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的基于间充质干细胞的类风湿关节炎治疗方法 | 人间充质干细胞(特别是脐带来源)及其去核改造版本,以及类风湿关节炎雄性大鼠模型 | 细胞治疗与再生医学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1138 | 2026-01-15 |
Systematic evaluation of tools used for single-cell m6A identification
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09246-7
PMID:41275001
|
研究论文 | 本研究系统评估了四种单细胞m6A测序和预测方法,并开发了一个在线可访问的单细胞m6A数据库,用于人类和小鼠物种的修饰定位和水平分析 | 开发了首个单细胞m6A数据库,整合了多种方法的数据,并展示了在癌症单细胞转录组和空间转录组数据中预测和可视化m6A修饰的独特优越性能 | 评估的方法数量有限(仅四种),且存在操作复杂性、灵敏度、分辨率和不同技术间一致性等挑战 | 系统评估单细胞m6A识别工具,并开发相关数据库以促进表观遗传修饰研究 | 单细胞m6A修饰在人类和小鼠物种中的定位和修饰水平 | 表观遗传学 | 癌症(包括UCEC) | 单细胞m6A测序和预测方法 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1139 | 2026-01-15 |
The ANTsX ecosystem for mapping the mouse brain
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66741-5
PMID:41274934
|
研究论文 | 本文介绍了使用ANTsX生态系统开发的小鼠大脑映射流程,用于将多种空间转录组学和形态学数据对齐到共享坐标框架中 | 提出了两种新方法:基于速度场的发育时间点连续插值方法和使用最小标注公开数据的深度学习自动脑区划分框架 | NA | 解决小鼠大脑图谱构建中多样化数据集到共享坐标框架的映射挑战 | 小鼠大脑 | 数字病理学 | NA | MERFISH空间转录组学,fMOST高分辨率形态学,发育MRI,LSFM | 深度学习 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 1140 | 2026-01-15 |
Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis
2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734
PMID:40910702
|
研究论文 | 本研究揭示了环状七肽FZ1通过作为整合素αvβ3激动剂,激活FAK-AKT/ERK1/2信号通路并诱导VEGFC表达,从而促进糖尿病皮肤伤口血管生成和愈合 | 首次发现并鉴定出FZ1是首个靶向整合素αvβ3并具有促进糖尿病伤口愈合作用的肽类激动剂 | NA | 开发有效的治疗剂并深入理解糖尿病伤口愈合的调控机制 | 糖尿病皮肤伤口愈合 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, RNA干扰, 表面等离子体共振, 分子对接 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |