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当前共找到 32155 篇文献，本页显示第 11261 - 11280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11261 | 2025-10-07 |
Inferring cell trajectories of spatial transcriptomics via optimal transport analysis
2025-Feb-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101194
PMID:39904341
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研究论文 | 本研究开发了SpaTrack方法，通过最优传输分析整合空间转录组数据中的基因表达和空间位置信息来推断细胞分化轨迹 | 首次将最优传输理论应用于空间转录组数据分析，能够同时整合基因表达和空间位置信息来重建细胞分化轨迹 | NA | 开发能够从空间转录组数据中推断细胞分化轨迹的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11262 | 2025-10-07 |
Dynamic transcriptomic and regulatory networks underpinning the transition from fetal primordial germ cells to spermatogonia in mice
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13755
PMID:39329203
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠雄性生殖细胞从原始生殖细胞向精原细胞转变过程中的转录动态和调控网络 | 首次系统揭示了PGC向SPG转变过程中的全局超转录特征，鉴定出315个高活性调控因子，并验证了非转录因子TAGLN2在精原干细胞维持和分化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类生殖细胞发育中的适用性需要进一步验证 | 阐明雄性生殖细胞发育过程中从原始生殖细胞向精原细胞转变的分子机制 | 小鼠雄性生殖细胞和性腺细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠雄性生殖细胞发育图谱数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11263 | 2025-10-07 |
Applications and emerging challenges of single-cell RNA sequencing technology in tumor drug discovery
2025-Feb, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2025.104290
PMID:39828052
|
综述 | 概述单细胞RNA测序技术在肿瘤药物发现中的应用及面临的挑战 | 系统总结scRNA-seq技术在肿瘤药物研发各阶段（机制阐明、靶点识别、药物筛选、药效与耐药性研究）的创新应用 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤药物开发中的应用前景与挑战 | 肿瘤药物研发过程 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11264 | 2025-10-07 |
Exosome-based targeted delivery of NF-κB ameliorates age-related neuroinflammation in the aged mouse brain
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01388-8
PMID:39833561
|
研究论文 | 本研究评估了装载不可降解IκB的外泌体通过抑制NF-κB核转位来改善老年小鼠脑部神经炎症的治疗效果 | 首次利用外泌体递送不可降解IκB特异性靶向巨噬细胞和小胶质细胞，并揭示其通过调节免疫细胞互作缓解年龄相关神经炎症的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床应用中验证 | 开发针对年龄相关神经炎症的新型治疗方法 | 老年小鼠脑部组织及免疫细胞（巨噬细胞、小胶质细胞、T细胞、B细胞） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠脑部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11265 | 2025-10-07 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2025-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012747
PMID:39919147
|
研究论文 | 开发了一种无需超参数调整的广义对比主成分分析方法，用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了广义对比主成分分析(gcPCA)，解决了传统cPCA需要超参数调整和不对称处理条件的问题 | 未在论文摘要中明确说明具体局限性 | 开发一种灵活、无需超参数的高维数据对比分析方法 | 高维生物数据集，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 广义对比主成分分析(gcPCA) | 高维数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11266 | 2025-02-23 |
EPB41L4A-AS1 regulates cervical cancer by proliferative cells: mendelian randomization and single-cell transcriptomics analyses
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-949
PMID:39974380
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，探讨了增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 首次揭示了EPB41L4A-AS1通过调控增殖细胞在宫颈癌中的作用 | 研究主要基于单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，未涉及临床试验验证 | 探讨增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 宫颈癌组织中的增殖细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化、MTT、流式细胞术、GSEA、WGCNA | NA | 单细胞转录组数据 | 宫颈癌组织与健康组织的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 11267 | 2025-02-23 |
By integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing, plasma cells signature and tertiary lymphoid structures were verified to contribute to outcome in lung adenocarcinoma
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1746
PMID:39974398
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，验证了浆细胞特征和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，首次系统性地探讨了浆细胞和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的具体作用 | 研究主要依赖于公开数据库的数据，缺乏独立验证队列 | 探讨三级淋巴结构和浆细胞在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 11268 | 2025-10-07 |
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.627873
PMID:39896473
|
研究论文 | 开发了一种名为CMDuo的分子工具平台，用于在单细胞水平上追踪和分析肿瘤细胞群体中的细胞融合事件 | 通过结合报告基因表达和工程化荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码，首次实现了对单个细胞融合事件起源和结果的高通量映射 | NA | 研究细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞 | 单细胞分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | CMDuo | ClonMapper Duo平台，结合报告基因表达和工程化荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码 |
| 11269 | 2025-10-07 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
|
研究论文 | 本研究通过分析头颈癌样本的RNA测序数据，探讨HPV整合对剪接事件和基因表达比例的影响及其与临床预后的关联 | 首次基于RNA特征（HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例）对HPV整合阳性患者进行分类，并发现特定亚组患者临床预后较差 | 主要基于RNA分析而非DNA分析，样本量有限（102例HPV阳性参与者） | 研究HPV整合在头颈癌中的致癌机制及其与临床结局的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 261例HPV相关HNSCC样本（包括bulk和单细胞RNA-seq），其中102例HPV阳性参与者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11270 | 2025-10-07 |
Classifying cell cycle states and a quiescent-like G0 state using single-cell transcriptomics
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.16.589816
PMID:38659838
|
研究论文 | 开发了一种高分辨率细胞周期分类器ccAFv2，用于单细胞转录组数据中细胞周期状态和静止样G0状态的分类 | 能够区分六个细胞周期状态和一个静止样G0状态，并包含可调参数过滤不确定分类，在分类更多状态的同时性能优于或相当于现有方法 | G0、G1和Late G1状态在神经上皮细胞类型中表现良好，但在其他细胞类型中准确性较低 | 开发高精度的细胞周期状态分类工具 | 人类神经干细胞及来自三个胚层的各种细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞周期分类器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11271 | 2025-10-07 |
Piscis: a novel loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578123
PMID:38352551
|
研究论文 | 提出了一种名为Piscis的深度学习算法，通过新型SmoothF1损失函数实现荧光显微镜图像中RNA斑点的自动检测 | 开发了SmoothF1损失函数，可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性，同时保持可微性以用于深度学习训练 | NA | 开发无需手动参数调优的自动斑点检测算法，用于空间转录组学图像分析 | RNA FISH荧光显微镜图像中的转录本斑点 | 计算机视觉 | NA | RNA FISH，空间转录组学，深度学习 | 深度学习算法 | 荧光显微镜图像 | 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 | NA | 空间转录组学，单分子RNA荧光原位杂交 | NA | NA |
| 11272 | 2025-10-07 |
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf002
PMID:39960663
|
研究论文 | 开发了一种名为SpaSNE的空间感知降维方法，用于可视化空间分辨分析数据 | 首次将空间信息整合到t-SNE降维方法中，专门针对空间分辨分析数据设计 | NA | 开发适用于空间分辨分析数据的降维和可视化方法 | 空间分辨分析数据 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨分析技术 | t-SNE, UMAP, SpaSNE | 空间分子数据 | 多个公共数据集，涵盖不同疾病、组织和细胞类型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单分子荧光原位杂交 | Visium, STARmap, MERFISH | 10x Visium空间转录组平台 |
| 11273 | 2025-10-07 |
Exploring the cellular and molecular basis of murine cardiac development through spatiotemporal transcriptome sequencing
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf012
PMID:39960664
|
研究论文 | 利用空间转录组测序技术探索小鼠心脏发育过程并构建早期心脏发育的时空细胞图谱 | 首次构建了小鼠早期心脏发育的全面时空细胞图谱，揭示了心脏细胞谱系的空间组织和关键基因动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 探索小鼠心脏发育的细胞和分子基础 | 小鼠心脏发育过程 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11274 | 2025-02-23 |
The landscape of cell regulatory and communication networks in the human dental follicle
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1535245
PMID:39974190
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙囊的细胞组成和调控网络，揭示了牙囊在发育和生物学功能中的复杂调控机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析了人类牙囊的细胞组成和基因调控网络，揭示了血管和免疫细胞在牙囊生物学活动中的相互作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 揭示人类牙囊的细胞组成和调控机制，以理解其在牙周组织发育和生物学功能中的作用 | 人类牙囊 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11275 | 2025-02-23 |
Research hotspots and frontiers in the tumor microenvironment of colorectal cancer: a bibliometric study from 2014 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1525280
PMID:39975599
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究现状、热点和未来趋势 | 首次对2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究进行文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和未来趋势 | 研究仅基于Web of Science核心合集数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 提供结直肠癌肿瘤微环境领域的当前研究状态、热点和未来趋势的全面图景 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 748篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 11276 | 2025-10-07 |
Failure of metabolic checkpoint control during late-stage granulopoiesis drives neutropenia in reticular dysgenesis
2024-Dec-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024123
PMID:39378586
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析网状发育不全患者样本和CRISPR模型，揭示了线粒体腺苷酸激酶2功能缺失导致中性粒细胞减少症的代谢调控机制 | 首次发现代谢检查点在造血不同阶段的差异调控作用，揭示了AK2缺陷在粒细胞生成晚期导致mTOR信号异常激活和代谢失衡的新机制 | 研究主要基于体外模型和患者样本，缺乏体内功能验证实验 | 探究网状发育不全综合征中代谢检查点调控失常导致中性粒细胞减少的分子机制 | 人类造血干细胞、粒细胞前体细胞、网状发育不全患者样本 | 单细胞生物学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞转录组测序, CRISPR基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 网状发育不全患者样本和原代人类造血干细胞CRISPR模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11277 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
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研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明，体外实验仅针对MCF7细胞系，缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11278 | 2025-10-07 |
Astrocytes Modulate a Specific Paraventricular Thalamus→Prefrontal Cortex Projection to Enhance Consciousness Recovery from Anesthesia
2024-Aug-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1808-23.2024
PMID:38926088
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过调控丘脑室旁核→前额叶皮层特定神经通路促进七氟醚麻醉后意识恢复的新机制 | 首次发现星形胶质细胞Kir4.1通道在麻醉恢复中的关键作用，并鉴定出丘脑室旁核中两种不同的谷氨酸能神经元亚型 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的适用性；机制研究主要集中于PVT-mPFC通路 | 探索星形胶质细胞在麻醉后意识恢复中的调控机制 | 雄性小鼠的丘脑室旁核星形胶质细胞和谷氨酸能神经元 | 神经科学 | 麻醉相关意识障碍 | 单细胞RNA测序,电生理记录,膜片钳技术 | 动物模型 | 基因表达数据,电生理数据 | 雄性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11279 | 2025-10-07 |
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320797
PMID:38695172
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研究论文 | 本研究探讨Trem2激动剂抗体AL002a通过重编程泡沫巨噬细胞功能来促进动脉粥样硬化斑块稳定性 | 首次证明Trem2激动剂治疗可通过改变泡沫巨噬细胞转录组来改善斑块稳定性，而非单纯减少斑块负荷 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中验证；治疗时间相对较短 | 测试Trem2激动剂抗体是否能通过增强巨噬细胞存活和减少坏死核心形成来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 | 动脉粥样硬化易感小鼠(Ldlr-/-)和泡沫巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，体外功能验证 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11280 | 2025-10-07 |
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-Mar-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176390
PMID:38530357
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OTUD4/CD73蛋白水解轴是治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的潜在靶点，并开发了特异性抑制剂ST80 | 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73的机制，开发了特异性抑制剂ST80，并证明其能增强抗PD-L1疗法的效果 | 研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 开发针对免疫抑制性乳腺癌的新型免疫治疗策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析，空间转录组学，实验验证 | NA | 多组学数据，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |