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当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 1041 - 1060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1041 2026-01-16
Tumor-initiating stem cells fine-tune the plasticity of neutrophils to sculpt a protective niche
2026-Jan-12, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了肿瘤起始干细胞如何通过调节中性粒细胞的塑性,塑造保护性微环境以影响癌症免疫治疗疗效 首次发现SOX2肿瘤起始干细胞通过Fads1-AA-PGE信号通路调节中性粒细胞的塑性,从而影响免疫治疗响应 研究主要聚焦于鳞状细胞癌,其他癌症类型中的类似机制尚未验证 探究肿瘤相关中性粒细胞异质性及其在癌症免疫治疗中的作用机制 肿瘤相关中性粒细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 数字病理学 鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 遗传操作 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1042 2026-01-16
Tumor-infiltrating bacteria disrupt cancer epithelial cell interactions and induce cell-cycle arrest
2026-Jan-12, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本文揭示了肿瘤浸润细菌通过破坏上皮细胞接触诱导细胞周期停滞,从而促进化疗耐药性的机制 首次通过空间成像和单细胞空间转录组学证明胞外细菌在肿瘤微生态位中的定位及其诱导癌细胞静止和免疫逃逸表型的作用 研究主要基于结直肠癌和口腔癌模型,在其他癌症类型中的普适性有待验证,且患者队列规模有限 探究肿瘤浸润细菌如何调节癌症进展和治疗耐药性 结直肠癌和口腔癌中的肿瘤浸润细菌(如具核梭杆菌)及癌细胞 数字病理学 结直肠癌 空间成像、单细胞空间转录组学、活细胞成像、空间分析、小鼠模型、转录组学 NA 图像、转录组数据 52名结直肠癌患者队列及独立直肠癌队列 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
1043 2026-01-16
A standardized approach for the isolation of vascular smooth muscle cells from carotid atherosclerotic plaques
2026-Jan-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文优化了一种从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离高活性血管平滑肌细胞的酶消化方案,并通过单细胞转录组分析验证了其有效性 开发了一种简化的酶消化方案,能够高效分离高活性的血管平滑肌细胞,适用于单细胞研究,并通过单细胞RNA测序验证了细胞身份和表型转换 样本量较小,仅涉及四个颈动脉斑块(两个稳定和两个不稳定),且来自特定患者群体,可能限制结果的普遍性 优化从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离血管平滑肌细胞的方案,以支持下游细胞培养分析和单细胞研究 人类颈动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 Harmony集成分析、伪时间轨迹推断 单细胞转录组数据 四个颈动脉斑块(两个稳定、两个不稳定),来自男性和女性患者,共23,661个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10X Genomics Chromium 10X Genomics Chromium平台用于单细胞RNA测序
1044 2026-01-16
Integrative spatial omics and artificial intelligence: transforming cancer research with omics data and AI
2026-Jan-09, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文综述了空间组学与人工智能在癌症研究中的整合应用,探讨了其在数据分析和临床转化方面的进展与挑战 整合空间转录组学、空间蛋白质组学与AI驱动计算模型,聚焦肿瘤微环境空间动态,推动精准肿瘤学发展 面临高维数据复杂性、计算资源限制、分析流程标准化不足等挑战 探索空间组学与AI在肿瘤研究中的应用,以改善治疗结果和深化对癌症机制的理解 多组学数据(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、表观基因组学、代谢组学)与组织学空间数据 机器学习 癌症 空间条形码、原位测序、数字空间分析 深度学习模型、基于空间图的分析 空间组学数据、高维数据集 NA NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
1045 2026-01-16
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Jan-08, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化,并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 研究仅基于斑马鱼模型,结果外推至哺乳动物或人类需谨慎;未涉及长期暴露后的恢复效应 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 斑马鱼(Danio rerio) 单细胞转录组学 造血功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1046 2026-01-16
Machine learning reveals sex-biased platelet-associated molecular signatures in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-06, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本研究通过机器学习分析系统性红斑狼疮(SLE)患者的转录组数据,揭示了性别差异相关的血小板分子特征 首次整合多个SLE研究的转录组数据,利用机器学习识别出性别特异性候选基因(如GP6),并发现GP6与PTCRA在男性SLE患者中的显著相关性及其与疾病活动指数的关联,揭示了性别依赖的血小板分子表型 研究基于公共数据库的转录组数据,样本量相对有限(338人),且未进行实验验证;分析主要依赖生物信息学工具,可能受数据异质性和批次效应影响 探索系统性红斑狼疮(SLE)中性别差异的分子基础,特别是血小板相关基因的表达模式 338名个体(包括175名正常对照和163名SLE患者)的转录组数据,来自六个公开的SLE研究 机器学习 系统性红斑狼疮 转录组学分析、差异基因表达分析、单细胞RNA-seq(scRNA-seq) 机器学习算法(未指定具体模型) 转录组数据(基因表达数据) 338名个体(175名正常对照,163名SLE患者) NA 单细胞RNA-seq, 转录组学分析 NA NA
1047 2026-01-16
Clonal Hematopoiesis and Lymphoma-Associated Mutations in Hematopoietic Progenitors in B-Cell Non-Hodgkin Lymphoma
2026-01-05, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过多组学测序方法,系统分析了B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的克隆性造血和淋巴瘤相关突变,揭示了疾病起始前体细胞的作用 首次系统性地在B-NHL患者中揭示了克隆性造血突变的B细胞偏向性扩张,并识别了肿瘤促进型和肿瘤浸润型CH克隆的动态差异,为疾病起源提供了新见解 样本量相对较小(43例患者),且主要关注特定亚型的B-NHL,可能限制了结果的普遍适用性 探究克隆性造血和疾病起始前体细胞在B细胞非霍奇金淋巴瘤发生发展中的作用 43例B细胞非霍奇金淋巴瘤患者,包括惰性和侵袭性亚型 数字病理学 淋巴瘤 全外显子组测序、靶向测序、单细胞测序 NA 基因组测序数据、单细胞测序数据 43例B-NHL患者 NA 单细胞测序 NA NA
1048 2026-01-16
Loss of E3 ligase Ube4A Disrupts Colon Homeostasis and Accelerates Experimental Colitis via Altered Lipid Handling
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了E3泛素连接酶Ube4A在维持结肠稳态中的关键作用,其缺失会通过改变脂质处理过程加剧实验性结肠炎 首次阐明了Ube4A在胃肠道中的生理功能,并发现其缺失会导致结肠上皮应激和脂质代谢重编程,从而增加对炎症损伤的敏感性 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析依赖于公开的单细胞RNA测序数据集,需要进一步在人类组织中进行验证 明确Ube4A在结肠中的功能,并确定其缺失如何影响实验性结肠炎的易感性 人类结肠组织(健康个体和IBD患者)、全局Ube4A敲除小鼠 单细胞组学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、组织图像、流式细胞数据 未明确具体样本数量,使用了公开的人类单细胞RNA测序数据集和Ube4A敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1049 2026-01-16
scSurv: a deep generative model for single-cell survival analysis
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为scSurv的深度生成模型,用于单细胞生存分析,旨在量化单个细胞对临床结果的异质性影响 首次将Cox比例风险模型与单细胞转录组深度生成模型结合,在单细胞分辨率下揭示细胞异质性如何影响癌症患者生存 未明确说明模型在更大规模或更复杂疾病类型中的泛化能力限制 开发一种方法以在单细胞水平上分析细胞异质性对患者生存的影响 单细胞转录组数据,涉及癌症(如黑色素瘤、肾细胞癌)和传染病 机器学习 癌症 单细胞转录组测序 深度生成模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1050 2026-01-16
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2026-Jan, The world journal of men's health
研究论文 本研究通过整合单细胞测序数据与孟德尔随机化分析,识别了与前列腺癌细胞相关的基因,特别是TMEM59在疾病进展中的潜在作用 首次结合单细胞测序与孟德尔随机化分析来识别前列腺癌预后相关基因,并验证了TMEM59作为保护性因子的功能 样本量较小(仅6例前列腺癌病例),且依赖于公共数据库数据,可能限制结果的普遍性 研究前列腺癌包膜侵犯相关的预后基因 前列腺癌细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序, 孟德尔随机化分析, 免疫组织化学, 细胞功能实验 hdWGCNA, Seurat, Cox回归 单细胞RNA-seq数据, SNP数据, 临床数据 6例前列腺癌病例的单细胞数据,以及TCGA和GEO的临床与基因表达数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1051 2026-01-16
Cyst-independent oocyte phagocytosis builds the female reproductive reserve in mice
2026-Jan, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究开发了一种高分辨率四维卵巢发生成像系统,揭示了小鼠卵巢中不依赖囊肿的卵母细胞吞噬机制在决定卵母细胞存活中的关键作用 首次发现并描述了不依赖囊肿的卵母细胞吞噬机制,其中优势卵母细胞通过捕获和吸收牺牲卵母细胞的细胞碎片来富集自身细胞质,从而支持其存活 研究主要基于小鼠模型,其机制在人类或其他哺乳动物中的普适性尚未验证 探究哺乳动物卵巢发生过程中卵母细胞命运决定的详细机制 小鼠卵巢中的卵母细胞 发育生物学 NA 高分辨率四维成像系统、单细胞测序 NA 活体成像数据、单细胞测序数据 NA NA NA NA NA
1052 2026-01-16
Type 2 diabetes Reprograms Bone Marrow Hematopoiesis and Dysregulates Immune Signaling in Response to Stroke
2025-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病如何通过重编程骨髓造血功能和失调免疫信号通路来恶化中风后的免疫反应和预后 首次在单细胞水平上揭示了2型糖尿病背景下中风后骨髓造血功能的重编程、细胞间通讯网络的重组以及代谢与免疫信号通路的失调 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待验证;研究主要关注骨髓,未全面评估外周免疫器官的影响 阐明2型糖尿病恶化中风预后的潜在免疫机制 对照(db/+)和糖尿病(db/db)小鼠的骨髓细胞 单细胞组学与免疫学 2型糖尿病与缺血性中风 单细胞RNA测序,GeoMx数字空间谱分析,nCounter分析,流式细胞术 伪时间轨迹分析,CellChat细胞通讯分析,AUCell富集分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,基因表达数据,流式细胞数据 对照和糖尿病小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,数字分子谱分析 GeoMx DSP,nCounter GeoMx数字空间谱分析用于空间基因表达分析,nCounter用于靶向基因表达分析
1053 2026-01-16
A stem cell knockout village reveals lineage rewiring and a non-canonical islet cell fate in monogenic diabetes
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过建立敲除村框架,利用纵向单细胞RNA测序分析79个人类多能干细胞突变系,揭示了单基因糖尿病中细胞命运重连和非经典胰岛细胞命运的形成机制 首次引入敲除村框架进行大规模纵向单细胞RNA测序分析,揭示了单基因糖尿病基因突变导致β细胞向肠嗜铬样细胞命运转变的新机制,并预测验证了ISL1作为关键下游效应因子 研究主要基于体外干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;突变系数量虽多,但仅覆盖30个发育调节因子 探究单基因糖尿病中基因突变如何改变发育轨迹并产生病理细胞状态 79个人类多能干细胞突变系,靶向30个发育调节因子(包括15个糖尿病基因),分化为胰岛细胞 单细胞组学 单基因糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 79个干细胞突变系,覆盖五个胰岛分化阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1054 2026-01-16
Site-specific ERα phosphorylation determines sex-dependent metabolic, reproductive, and body-compositional phenotypes in mice
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过构建ERα特定丝氨酸位点磷酸化缺陷的基因敲入小鼠,揭示了位点特异性ERα磷酸化对小鼠代谢、生殖和身体组成的性别依赖性调控作用 首次在体内系统研究了ERα两个保守磷酸化位点(S171和S216)的生理功能,并发现这些位点对代谢、生殖和骨骼表型具有性别特异性的调控作用 研究仅限于小鼠模型,人类中的相关性尚需验证;机制研究主要基于转录组分析,具体的信号通路和分子机制有待深入 探究雌激素受体α(ERα)特定磷酸化位点在调节代谢、生殖和身体组成中的生理功能 ERα S171A和S216A磷酸化缺陷基因敲入小鼠 分子生物学 代谢性疾病 基因敲入、单细胞空间转录组学、代谢谱分析 NA 转录组数据、代谢数据、骨骼密度数据 基因敲入小鼠模型 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
1055 2026-01-16
CellMentor: cell-type aware dimensionality reduction for single-cell RNA-sequencing data
2025-Dec-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellMentor的全监督降维方法,用于单细胞RNA测序数据分析 CellMentor是一种基于非负矩阵分解的全监督降维方法,首次将细胞类型标签直接整合到优化目标中,以最小化已知群体内的变异并最大化类型间的区分 NA 开发一种改进的单细胞RNA测序数据降维方法,以优化细胞类型识别 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1056 2026-01-16
Emerging technologies in poultry genomics: Unlocking innovation for the future of sustainable production
2025-Dec-10, Poultry science IF:3.8Q1
综述 本文综述了家禽基因组学领域新兴技术,包括功能注释、CRISPR编辑、单细胞RNA测序和整合组学框架,以推动可持续家禽生产 整合FAANG和ChickenGTEx项目提供全面调控图谱,结合CRISPR编辑和单细胞技术实现从统计关联到生物学因果的转变 统计功效不足、组织与发育特异性背景的局限性以及基因组预测的转化挑战 推动可持续家禽生产,通过基因组学技术提升生产效率、抗病性和动物福利 家禽(鸡) 基因组学 NA 单细胞RNA测序、CRISPR编辑、整合组学(基因组学、转录组学、表观基因组学、3D染色质数据) NA 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据、3D染色质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1057 2026-01-16
Aire-dependent interferon signalling shapes thymocyte maturation and central tolerance in mice
2025-Dec-09, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Aire蛋白通过调控胸腺干扰素信号通路,影响胸腺细胞成熟和中枢免疫耐受的机制 首次在单细胞分辨率下系统揭示了Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响胸腺微环境中多种免疫细胞的转录组特征 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究主要基于转录组分析,缺乏功能实验的直接验证 阐明Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响免疫细胞发育和中枢耐受 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结免疫细胞 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1058 2026-01-16
Single-cell sequencing reveals MCAM+ MyCAFs as key pro-angiogenic cells interacting with endothelial cells in solid-type adenoid cystic carcinoma
2025-Dec-08, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了在实体型腺样囊性癌中,MCAM+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞是关键的促血管生成细胞,它们通过转录因子MEF2C上调促血管生成因子的表达,从而促进血管生成和肿瘤生长 首次在实体型腺样囊性癌中鉴定出MCAM+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞作为关键的促血管生成细胞亚群,并揭示了其通过MEF2C转录因子调控促血管生成因子转录的上游机制 研究主要基于体外和体内实验模型,临床样本的直接验证可能有限,且未详细探讨MCAM+ myCAFs与其他肿瘤微环境成分的相互作用 探究实体型腺样囊性癌中癌症相关成纤维细胞与血管生成之间的关系及其分子机制 实体型与非实体型腺样囊性癌中的癌症相关成纤维细胞、内皮细胞以及SACC83细胞系 数字病理学 腺样囊性癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及原代CAFs分离、细胞系实验及体内模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1059 2026-01-16
Intratumoral Collinsella aerofaciens exhibits antitumor activity in endometrial carcinoma through activation of the p53 signaling pathway
2025-Dec-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了子宫内膜癌肿瘤内微生物群的组成,并鉴定出Collinsella aerofaciens通过激活p53信号通路发挥抗肿瘤作用 首次在子宫内膜癌中鉴定出Collinsella aerofaciens作为新型抑菌菌,并通过多组学技术揭示了其通过激活p53通路抑制肿瘤的机制 微生物功能机制仍需进一步体内验证,样本量可能有限 表征子宫内膜癌肿瘤内微生物组,阐明微生物空间定位并鉴定具有肿瘤抑制特性的细菌 子宫内膜癌患者的肿瘤组织、癌旁正常组织、EC细胞系及小鼠模型 微生物组学与肿瘤学 子宫内膜癌 5R 16S rRNA测序, 荧光原位杂交, 空间转录组学, 单细胞RNA测序, RNA测序, 粪便微生物移植 NA 微生物组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 子宫内膜癌患者的肿瘤和癌旁组织样本(具体数量未明确) NA 16S rRNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
1060 2026-01-16
Neutrophil extracellular traps released by CD177+ neutrophils aggravated inflammation and neuronal impairment post-SCI
2025-Dec-07, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在脊髓损伤小鼠模型中鉴定出三个不同的中性粒细胞亚群,并发现CD177+中性粒细胞通过释放中性粒细胞胞外陷阱加剧炎症和神经元损伤 首次在脊髓损伤后鉴定出中性粒细胞亚群,并揭示CD177+中性粒细胞通过PAD4和ROS依赖的NETs形成促进炎症和神经元凋亡的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据,人类样本的验证仍需扩大 探究脊髓损伤后中性粒细胞的功能异质性及其在炎症和神经元损伤中的作用 脊髓损伤小鼠模型和患者样本中的中性粒细胞 单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型和SCI患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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