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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-12-07 |
Identification of sepsis pyroptosis-related genes based on single-cell sequencing technology and experimental verification
2025-Dec-05, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00785-6
PMID:41350624
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1022 | 2026-01-17 |
Prognostic significance of somatic mutations in myeloid cells of men with chronic heart failure - interaction between loss of Y chromosome and clonal haematopoiesis
2025-Dec, European journal of heart failure
IF:16.9Q1
DOI:10.1002/ejhf.3778
PMID:40702883
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研究论文 | 本研究探讨了男性慢性心力衰竭患者中体细胞突变(特别是Y染色体丢失和克隆性造血)的预后意义及其相互作用 | 首次在慢性心力衰竭患者中系统评估了Y染色体丢失与克隆性造血驱动突变(如DNMT3A和TET2)的共现及其对死亡率的联合影响,并通过单细胞RNA测序揭示了LOY单核细胞的促纤维化信号增强机制 | 研究主要针对男性患者,未包括女性;样本量相对有限,且验证队列仅针对HFrEF患者;机制研究基于缺血性心力衰竭患者,可能不适用于所有心力衰竭类型 | 评估Y染色体丢失和克隆性造血突变在男性慢性心力衰竭患者中的预后价值及其相互作用 | 781名男性慢性心力衰竭患者,涵盖全谱左心室射血分数,包括HFrEF患者验证队列 | 心血管疾病 | 慢性心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、临床预后数据 | 781名男性慢性心力衰竭患者,外加一个HFrEF患者验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1023 | 2026-01-17 |
METTL3/RBM15 augments the stability of Kdm6b mRNA and promotes STAT1-mediated macrophage activation and atherosclerosis
2025-Dec, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01594-y
PMID:41423554
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了METTL3/RBM15介导的m6A修饰通过增强Kdm6b mRNA稳定性,进而促进STAT1介导的巨噬细胞活化及动脉粥样硬化发展的分子机制 | 首次系统阐明了m6A修饰在巨噬细胞分化与活化过程中的动态调控网络,并发现Kdm6b通过去甲基化Jak1诱导其磷酸化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;METTL3抑制剂STM2457的系统性效应可能涉及其他细胞类型 | 探究m6A修饰在巨噬细胞活化及动脉粥样硬化发展中的调控作用 | 巨噬细胞分化与活化过程、动脉粥样硬化小鼠模型 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | MeRIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blot, qPCR, RIP-qPCR, 共免疫沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 测序数据、蛋白质印迹数据、PCR数据 | 未明确样本数量,使用巨噬细胞特异性Kdm6b敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1024 | 2026-01-17 |
Metastasis-Initiating Osteosarcoma Subpopulations Establish Paracrine Interactions with Lung and Tumor Cells to Create a Metastatic Niche
2025-Nov-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3360
PMID:40882022
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研究论文 | 本研究通过多种模型揭示了骨肉瘤中一个低增殖亚群通过响应肺上皮细胞来源的IL1α,维持促转移细胞因子如IL6和CXCL8的产生,从而启动肺转移,并表明破坏IL1信号可显著减少转移进展 | 识别了骨肉瘤中启动转移的低增殖细胞亚群及其与肺上皮细胞的旁分泌相互作用机制,首次将IL1α-IL6/CXCL8轴确定为转移的关键驱动因素 | 研究主要基于体外模型和动物实验,人类临床样本的直接验证有限,且未全面探讨其他潜在转移机制 | 揭示骨肉瘤肺转移的细胞和分子机制,以开发针对转移的靶向疗法 | 骨肉瘤细胞亚群、肺上皮细胞、小鼠模型和人类异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、体外器官型转移模型、基因组和药理学干扰 | NA | 基因表达数据、细胞培养数据、动物模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1025 | 2026-01-17 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02130-6
PMID:41233852
|
研究论文 | 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序分析,揭示了乳腺癌中机械刺激相关基因的特征,并构建了一个用于预测患者预后的评分模型 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型,并在单细胞分辨率上揭示了机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 | NA | 识别基于机械刺激相关基因的分子亚型并建立预后评分模型,以预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1026 | 2026-01-17 |
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70932
PMID:41160707
|
研究论文 | 本研究比较了四种基于单细胞转录组数据推断拷贝数变异以预测子宫内膜癌细胞的主要工具(SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV)的可靠性 | 首次系统评估了多种单细胞CNV推断工具在子宫内膜癌中的性能,并提出了通过选择富含上皮细胞的亚克隆来减少假阳性的策略 | InferCNV和sciCNV工具不直接预测肿瘤细胞,其CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体,因此无法评估其性能 | 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性,并为研究人员提供改进预测准确性的建议 | 子宫内膜癌细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用公开可用的scRNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1027 | 2026-01-17 |
Identification of Disulfidptosis-Associated Hub Genes in Psoriasis via Integrated Transcriptomic and Experimental Validation Approaches
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70945
PMID:41224720
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,识别了与银屑病相关的二硫化物死亡相关枢纽基因,并探讨了其在疾病发病机制中的作用 | 首次将新发现的细胞死亡途径——二硫化物死亡与银屑病联系起来,并利用整合的转录组学和单细胞RNA测序数据结合机器学习方法识别了相关的枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型验证,需要在人类临床样本中进行进一步的功能验证 | 探究二硫化物死亡相关基因在银屑病发病机制中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 银屑病皮损和非皮损皮肤组织,以及咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组学分析,单细胞RNA测序,Western blotting | LASSO回归,随机森林 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多个数据集(GSE106992,GSE11239,GSE162183)和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1028 | 2026-01-17 |
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500871122
PMID:40663603
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子Foxn3在抑制视网膜非感光神经元中异常纤毛发生中的作用 | 首次揭示了Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其反式激活因子的启动子,来防止非感光神经元形成类似感光细胞的纤毛结构 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类视网膜中的具体作用机制尚需进一步验证 | 探究视网膜细胞类型间纤毛结构差异的建立与维持机制 | 视网膜特异性条件性敲除(Foxn3CKO)小鼠的视网膜神经元,特别是双极细胞和无长突细胞 | 发育生物学 | 纤毛病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质分析、转录测定 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、电生理数据、染色质结合数据 | Foxn3CKO小鼠及其对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1029 | 2026-01-17 |
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2850
PMID:40261963
|
研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源的肿瘤类器官,结合基因组和单细胞分析,揭示了肿瘤异质性、顺铂耐药机制,并识别了潜在治疗靶点 | 利用患者来源的肿瘤类器官模型,结合bulk和单细胞RNA测序,首次在类器官中表征了分子亚型和瘤内转录异质性,并发现了一种与顺铂耐药和不良预后相关的混合上皮-间质转化样程序,识别了amphiregulin作为关键调节因子 | 研究样本量相对较小(31例患者),且主要基于体外类器官模型,其体内生理环境模拟和长期临床验证仍需进一步研究 | 改善头颈部鳞状细胞癌的生物学理解并开发个性化疗法 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其来源的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 患者来源的肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 组织病理学数据 | 31例头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1030 | 2026-01-17 |
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643710
PMID:40166238
|
研究论文 | 本研究阐明了LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调控MHC-I和树突状细胞激活,从而增强头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次揭示了LSD1抑制通过激活H3K4me2并直接与MHC-I相互作用来诱导抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验,在人体内的直接验证尚不充分 | 阐明LSD1在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型、人类头颈鳞状细胞癌细胞、外周血单个核细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型、人类细胞系、TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1031 | 2026-01-17 |
Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis
2025-Jan-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123315
PMID:39675550
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研究论文 | 本研究探讨了平滑肌细胞特异性CD47缺失对动脉粥样硬化的抑制作用 | 首次揭示了TSP1-CD47信号在调节VSMC表型中的作用,并证明SMC特异性Cd47缺失能抑制动脉粥样硬化病变形成 | 未详细探讨CD47缺失对其他细胞类型或全身代谢的长期影响,且主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 研究血管平滑肌细胞TSP1-CD47信号在调节VSMC表型和动脉粥样硬化发展中的作用 | 人类和小鼠的血管平滑肌细胞、动脉粥样硬化组织、SMC特异性Cd47敲除小鼠 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、分子生物学技术、细胞特异性敲除小鼠模型 | NA | 基因表达数据、组织图像、细胞实验数据 | 人类动脉粥样硬化血管组织、小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1032 | 2026-01-17 |
Efficient and accurate detection of viral sequences at single-cell resolution reveals putative novel viruses perturbing host gene expression
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.11.571168
PMID:38168363
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研究论文 | 本文介绍了一种基于高度保守氨基酸域的方法,用于在批量及单细胞转录组学数据中高效、准确地检测病毒序列,并应用于识别恒河猴PBMC数据中的潜在新病毒 | 该方法不依赖参考基因组,能保留单细胞分辨率,通过细胞条形码追踪,覆盖超过10万种RNA病毒物种,实现病毒存在与宿主基因表达的并行分析 | 未明确提及具体样本量或实验验证细节,可能受限于数据质量和病毒保守域的覆盖范围 | 开发一种高效准确的病毒检测方法,以理解病毒感染对人类健康的影响并预测潜在流行病 | 病毒序列(特别是RNA病毒)及宿主基因表达,应用于恒河猴外周血单个核细胞数据 | 生物信息学 | 病毒感染 | 高通量测序,单细胞转录组学 | 基于保守氨基酸域的检测方法 | 转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1033 | 2026-01-17 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了在小鼠骨髓来源巨噬细胞中,存在一个高分泌IL-12p40的树突状细胞亚群 | 首次在M-CSF分化的巨噬细胞培养物中识别出一个转录独特的DC样亚群,该亚群在LPS刺激下表现出典型的DC激活程序 | 研究基于体外小鼠BMDM培养模型,可能无法完全反映体内情况;且该DC样亚群无法通过表面标记物分离 | 探究巨噬细胞与树突状细胞在先天免疫中的异质性和功能重叠 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)及其中的细胞亚群 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,微孔分泌检测 | NA | RNA测序数据,基因表达数据 | 小鼠骨髓来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2026-01-16 |
Unveiling CDKN1A and RELA: Machine learning-driven aging biomarkers for precision diagnosis and therapy in knee osteoarthritis
2026-Mar, Journal of orthopaedics
IF:1.5Q3
DOI:10.1016/j.jor.2025.11.045
PMID:41536554
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和机器学习方法,鉴定出CDKN1A和RELA作为膝骨关节炎中下调的生物标志物,并进行了实验验证 | 首次结合多数据集、多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)和单细胞RNA测序分析,系统性地识别膝骨关节炎中与衰老相关的核心生物标志物,并探索其与免疫细胞浸润、代谢通路及潜在治疗化合物(姜黄素)的关联 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅在动物模型中进行,缺乏大规模临床样本验证;机器学习模型的泛化能力有待进一步在不同队列中验证 | 系统识别膝骨关节炎中与衰老相关的生物标志物,以用于精准诊断和治疗 | 膝骨关节炎(KOA)相关的基因表达数据、衰老相关基因、小鼠KOA模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 基因表达分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、qRT-PCR、Western blotting | LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据(微阵列、RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 | 两个公共基因表达数据集(GSE12021、GSE169077)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE176308),以及小鼠KOA模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1035 | 2026-01-16 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Jan-15, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路导致小鼠视网膜中视锥光感受器选择性死亡的分子机制 | 首次发现CX3CR1缺陷通过激活STAT3/CCL-ACKR1通路介导小胶质细胞神经毒性,并揭示了小胶质细胞-视锥细胞通过CCL-ACKR1相互作用以及小胶质细胞-星形胶质细胞通过Bmp2-Bmpr1a/Bmpr1b对通讯导致视锥选择性丢失的双重机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或临床样本中得到验证 | 探究神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视锥光感受器 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1036 | 2026-01-16 |
Whole genome sequence analysis of pulmonary function and COPD in 44,287 multi-ancestry participants
2026-Jan-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03921-y
PMID:41535900
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研究论文 | 本研究通过对44,287名多族裔参与者进行全基因组序列分析,探索与肺功能和慢性阻塞性肺疾病相关的遗传变异 | 首次在多族裔样本中结合全基因组序列、结构变异和基因基础分析,发现新的遗传位点如LY86、MAGI1,并利用单细胞RNA-seq数据验证基因表达 | 研究依赖于特定人群样本,可能无法完全代表所有族裔群体,且功能验证仅限于部分细胞类型 | 识别与肺功能和慢性阻塞性肺疾病相关的低频率或族裔特异性遗传变异 | 44,287名多族裔参与者,包括肺功能测量和慢性阻塞性肺疾病病例对照状态 | 基因组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 全基因组序列分析,单细胞RNA-seq,CRISPR基因编辑 | NA | 基因组序列数据,基因表达数据 | 44,287名多族裔参与者 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1037 | 2026-01-16 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-15, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
|
研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌(HCC)患者样本的单细胞转录组数据,识别出具有癌症干细胞样特征的细胞群体,并构建了一个12基因特征用于预测患者生存和治疗反应 | 基于单细胞转录组数据识别HCC中的癌症干细胞样细胞,并开发了一个新的癌症干细胞样细胞风险评分(CARS),用于预测患者对索拉非尼和免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏来自患者样本的直接实验验证,且样本量可能有限 | 构建基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因特征,以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌(HCC)患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 基因特征评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1038 | 2026-01-16 |
Biomimetic Liposome Coloaded ES-Cu and PFK15 Amplify Cuproptosis through Inhibition of Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes for Rheumatoid Arthritis Therapy
2026-Jan-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17592
PMID:41457948
|
研究论文 | 本研究开发了一种仿生脂质体,通过共递送铜死亡诱导剂和糖酵解抑制剂,特异性靶向并杀死类风湿关节炎中的成纤维样滑膜细胞,以治疗类风湿关节炎 | 首次通过单细胞RNA测序揭示RAFLS中过度活跃的糖酵解是抵抗铜死亡的关键机制,并提出并验证了抑制糖酵解可放大铜死亡的假设,进而开发了融合RAFLS膜的仿生脂质体实现特异性靶向共递送 | NA | 开发一种通过放大铜死亡来治疗类风湿关节炎的新策略 | 类风湿关节炎中的成纤维样滑膜细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1039 | 2026-01-16 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-Jan-14, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了人类二维单层和三维肝微组织对乙酰氨基酚暴露的细胞反应 | 首次在单细胞分辨率下,系统比较了2D和3D肝细胞培养模型对乙酰氨基酚暴露的转录组反应,揭示了氧气可用性与药物代谢之间的动态相互作用 | 研究仅使用了24小时的药物暴露时间,且2D培养仅测试了低剂量,可能无法完全反映长期或更广泛剂量范围的毒性效应 | 评估和比较不同体外肝模型(2D单层与3D球状体)在预测药物性肝损伤方面的生理相关性和机制洞察 | 由原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的2D单层和3D球状体培养物 | 单细胞转录组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2026-01-16 |
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07676-9
PMID:41535938
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |