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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10221 | 2025-10-07 |
Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar-20, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11075-6
PMID:40113718
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研究论文 | 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序技术筛选脓毒症治疗核心基因 | 首次将网络药理学与单细胞RNA测序相结合,在细胞水平定位金银花治疗脓毒症的潜在靶点基因 | 需要进一步的实验验证网络药理学预测结果 | 阐明金银花治疗脓毒症的分子机制并筛选核心治疗靶点 | 脓毒症患者血液样本和金银花活性成分 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序,单细胞RNA测序,网络药理学,meta分析 | NA | 基因表达数据 | 22例脓毒症患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
10222 | 2025-10-07 |
The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment
2025-Mar-20, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11086-3
PMID:40113719
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研究论文 | 本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境、预后和治疗中的作用 | 首次通过单细胞分析揭示凝血通路在胶质母细胞瘤内皮细胞中的显著激活,并构建了基于五个凝血相关基因的风险特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索凝血相关基因在胶质母细胞瘤中的作用机制及其临床意义 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, SNP分析, 拷贝数变异分析, 免疫组织化学, CCK8实验, 伤口愈合实验 | LASSO回归, 随机生存森林分析, 无监督聚类 | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | TCGA队列461例GBM患者,CGGA693队列,IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
10223 | 2025-10-07 |
SPARROW reveals microenvironment-zone-specific cell states in healthy and diseased tissues
2025-Mar-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101235
PMID:40112778
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研究论文 | SPARROW是一种计算框架,通过联合学习细胞类型和细胞组织的潜在嵌入和软聚类,实现健康与疾病组织中微环境区域特异性细胞状态的发现 | 将细胞类型推断和细胞邻域识别整合为联合学习过程,在共享潜在空间中整合空间转录组和单细胞RNA测序数据 | 未在摘要中明确说明方法的具体限制 | 开发能够跨尺度、样本和条件全面表征组织特征的计算方法 | 人类和小鼠组织样本,特别是人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 潜在嵌入学习,软聚类 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
10224 | 2025-10-07 |
Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration
2025-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02085-2
PMID:40100436
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中表达下调,并验证其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统评估STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入分析 | 样本量有限,临床样本仅30例,且主要依赖公共数据库数据 | 探究STAT家族在结直肠癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系 | 结直肠癌患者样本(包括TCGA数据库644例、GTEx数据库308例和临床样本30例) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,DNA甲基化分析 | 列线图预测模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据,空间转录组数据 | 总计982个样本(TCGA 644例,GTEx 308例,临床样本30例) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
10225 | 2025-03-22 |
Spatial transcriptomics reveals differential inflammatory pathways in discoid lupus erythematosus and lichen planus
2025-Mar-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10226 | 2025-10-07 |
[Nafamostat Mesylate Alleviates Renal Ischemia-Reperfusion Injury in a Rat Model Through HMGB1 Modulation: An Omics Analysis -Based Study of the Protective Effect and the Mechanisms Involved]
2025-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250160506
PMID:40109453
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研究论文 | 本研究通过组学分析探讨甲磺酸萘莫司他在大鼠肾脏缺血再灌注损伤模型中的保护作用及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和HMGB1调控机制研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用 | 样本量较小(每组7只大鼠),仅观察24小时时间点,机制研究仍需进一步验证 | 研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及分子机制 | 健康雄性Sprague-Dawley大鼠 | NA | 肾脏缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blotting, HE染色, TUNEL染色 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织病理学图像 | 21只SD大鼠(每组7只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序 |
10227 | 2025-10-07 |
Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling
2025-Jan-09, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-024-04326-2
PMID:39789409
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研究论文 | 本研究通过荧光标记技术识别了新生小鼠脑室下区的星形胶质细胞前体细胞亚群,并证明谷氨酸信号调控其迁移过程 | 首次发现tdTomato标记的胶质前体细胞亚群,并证明谷氨酸信号通过离子型谷氨酸受体和谷氨酸转运体调控其向皮层的迁移 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类相关性需进一步验证;体外器官型切片培养可能无法完全模拟体内环境 | 探究星形胶质细胞前体细胞的发育起源和迁移调控机制 | 新生小鼠脑室下区的胶质前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光,器官型切片培养 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 新生小鼠(PND1-PND7)脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10228 | 2025-10-07 |
LKB1 inactivation promotes epigenetic remodeling-induced lineage plasticity and antiandrogen resistance in prostate cancer
2025-Jan, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01025-z
PMID:39743630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LKB1失活在前列腺癌中促进表观遗传重塑诱导的谱系可塑性和抗雄激素耐药性的机制 | 首次发现LKB1失活通过引起全基因组DNA低甲基化驱动AR非依赖性谱系可塑性,并提出靶向DNA低甲基化的治疗策略 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,在人类患者中的临床验证仍需进一步研究 | 探索雄激素受体非依赖性谱系可塑性的分子机制并开发潜在治疗策略 | 人类和小鼠前列腺癌样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,全基因组亚硫酸氢盐测序 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
10229 | 2025-10-07 |
Identification and Evaluation of Lipocalin-2 in Sepsis-Associated Encephalopathy via Machine Learning Approaches
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504390
PMID:40109658
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研究论文 | 通过机器学习方法识别和评估脂质运载蛋白-2在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法系统性地识别LCN2作为中性粒细胞诱导SAE的关键基因 | 研究主要基于动物模型,需要在人类患者中进行进一步验证 | 识别脓毒症相关脑病的关键基因并探索潜在靶向治疗 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 | 机器学习 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 行为测试 | 四种二分类机器学习算法, AddModuleScore算法, CellCall算法 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 行为学数据 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10230 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell analysis reveals the regulatory network of disulfidptosis-related lncRNAs in bladder cancer: constructing a prognostic model and predicting treatment response
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1527036
PMID:40110199
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了膀胱癌中双硫死亡相关lncRNAs的调控网络和预后模型 | 首次将双硫死亡与lncRNAs结合构建膀胱癌预后模型,并揭示其与免疫状态和治疗反应的关系 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡相关lncRNAs作为膀胱癌预后生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, Cox回归 | 预后模型, nomogram | 单细胞测序数据, RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
10231 | 2025-10-07 |
Aspartate beta-hydroxylase is a prognostic factor in gallbladder cancer with the function of promoting tumorigenesis and chemoresistance
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1452345
PMID:40110547
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研究论文 | 本研究探讨天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)在胆囊癌中的促癌作用及化疗耐药机制 | 首次通过孟德尔随机化方法确认ASPH是胆囊癌的致病基因,并发现其通过调控免疫检查点和上皮间质转化促进肿瘤进展 | 研究样本量有限(215例),且主要基于回顾性分析 | 探索胆囊癌的新型生物标志物及其在肿瘤发生和化疗耐药中的作用机制 | 胆囊癌患者组织样本和单细胞测序数据 | 癌症生物学 | 胆囊癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组织化学, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 单细胞测序数据 | 215例胆囊癌患者 | NA | 单细胞测序, RNA测序 | NA | NA |
10232 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82734-8
PMID:39732760
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人脱落乳牙干细胞在免疫调节中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示SHED不同分化状态下的免疫调节功能异质性,并与其他人源MSCs进行功能比较 | 仅进行体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 | 探究人脱落乳牙干细胞的免疫调节功能异质性 | 人脱落乳牙干细胞(SHED) | 单细胞组学 | 炎症性疾病,自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10233 | 2025-10-07 |
Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages
2024-12-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129
PMID:39705337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术鉴定并表征了硬脑膜外窦巨噬细胞这一独特的免疫活性细胞亚群 | 首次发现硬脑膜外窦巨噬细胞在起源、扩增动力学和转录谱方面与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞存在显著差异,并揭示其在自身免疫性神经炎症中执行粒细胞凋亡清除功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类硬脑膜巨噬细胞的特性和功能仍需进一步验证 | 探究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性 | 小鼠硬脑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性神经炎症 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 共聚焦成像, 克隆分析, 转基因小鼠系 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10234 | 2025-10-07 |
New Window Into Hepatitis B in Africa: Liver Sampling Combined With Single-Cell Omics Enables Deep and Longitudinal Assessment of Intrahepatic Immunity in Zambia
2024-Nov-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae054
PMID:38332750
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研究论文 | 通过肝脏细针穿刺活检结合单细胞组学技术,深入评估赞比亚人群肝内免疫特征 | 首次在非洲地区将肝脏细针穿刺活检与单细胞RNA测序技术结合,实现肝内免疫细胞的深度纵向评估 | 样本量有限,仅包含赞比亚特定人群,未涉及其他地区人群 | 探索乙型肝炎病毒免疫学特征,为治愈策略提供依据 | 未经治疗的慢性HBV感染成人患者(包括HIV共感染者)及急性HBV感染者 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 117例入组样本和47例纵向随访样本(1年随访) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10235 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans
2024-07-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20240768
PMID:38904098
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫定位技术对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行全面分析 | 首次结合单细胞RNA测序数据和免疫定位技术,跨物种比较肾脏内皮素系统的表达特征 | 商业抗体在不同物种间效果不一致,RNA表达水平与蛋白质水平并不总是相关 | 表征人类和啮齿类动物肾脏中内皮素系统的表达特征 | 人类、大鼠和小鼠的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫定位 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定位数据 | 多物种肾脏样本(人类活体供者活检组织、大鼠和小鼠肾脏样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10236 | 2025-10-07 |
Heart failure promotes multimorbidity through innate immune memory
2024-05-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade3814
PMID:38787963
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研究论文 | 本研究揭示了心力衰竭通过改变造血干细胞表观基因组驱动多病共存的新机制 | 首次发现心力衰竭通过抑制TGF-β信号通路改变造血干细胞的表观遗传状态,形成天然免疫记忆,从而促进多病共存 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究心力衰竭促进多病共存的分子机制 | 心力衰竭小鼠模型及其造血干细胞 | 基础医学研究 | 心血管疾病 | 骨髓移植、染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10237 | 2025-10-07 |
Gene networks and systems biology in Alzheimer's disease: Insights from multi-omics approaches
2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13790
PMID:38534018
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综述 | 本文综述了多组学方法在阿尔茨海默病基因网络和系统生物学研究中的应用与发现 | 整合单细胞组学和空间组学技术,在单细胞分辨率和空间维度上研究阿尔茨海默病的基因调控网络 | NA | 全面理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病相关的基因网络和分子机制 | 系统生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,空间组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
10238 | 2025-10-07 |
Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment
2024-Mar-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011
PMID:38401539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪耐药克隆在连续治疗过程中的变化,揭示了克隆间基因表达差异导致的不同治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序与克隆条形码技术,系统追踪耐药克隆在连续和长期治疗过程中的命运差异 | 未明确说明研究涉及的癌症类型和具体样本数量 | 探究癌症细胞克隆差异如何影响连续治疗反应,为靶向最侵袭性耐药克隆的优化治疗策略提供依据 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 克隆条形码 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10239 | 2025-10-07 |
Response to tumor-infiltrating lymphocyte adoptive therapy is associated with preexisting CD8+ T-myeloid cell networks in melanoma
2024-02-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg7995
PMID:38306416
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研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤患者接受肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法前后的样本,揭示了治疗反应与预先存在的CD8+T细胞-髓系细胞网络之间的关联 | 首次系统揭示了TIL-ACT治疗反应与基线肿瘤微环境中T细胞-髓系细胞网络的关系,并识别了潜在的生物标志物 | 样本量较小(仅13例患者),且为单中心研究 | 探索肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法治疗反应的生物学机制和预测标志物 | 转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 空间蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质空间分布数据 | 13例转移性黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
10240 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of IL-23 inhibition in cutaneous psoriasis distinguishes clinical response
2024-01-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adi2848
PMID:38277466
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析银屑病患者皮肤免疫细胞,揭示IL-23抑制治疗的临床反应机制 | 首次在单细胞水平建立银屑病IL-23抑制治疗的临床反应图谱,发现治疗抵抗性T17细胞活化和不可逆免疫异常状态 | 样本量有限,未明确不可逆免疫异常的分子机制 | 解析IL-23信号阻断治疗银屑病的临床反应机制 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 银屑病患者皮肤样本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |