单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10241 - 10260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10241 | 2025-10-07 |
Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response
2024-01-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930
PMID:38215193
|
研究论文 | 本研究揭示了簇细胞和成纤维细胞通过激活ILC2介导的2型免疫反应促进胸腺再生的新机制 | 首次发现胸腺簇细胞和成纤维细胞通过产生警报素IL-25和IL-33激活ILC2，进而促进胸腺上皮细胞分化的再生机制 | 研究仅使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型，未验证其他应激模型 | 探究胸腺再生过程中非T细胞的造血细胞如何参与调控机制 | 小鼠胸腺组织中的造血细胞（不包括T细胞），特别是ILC2、簇细胞和成纤维细胞 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 地塞米松诱导胸腺萎缩的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10242 | 2025-10-07 |
Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298133
PMID:38363768
|
研究论文 | 本研究通过敲低clusterin(CLU)基因，探讨其对血管性血友病因子(VWF)在脐静脉内皮细胞中表达和分泌的影响 | 首次基于单细胞RNA测序分析发现CLU作为VWF的潜在调节因子，并通过两种基因敲低方法验证其在VWF调控中的作用 | 研究仅使用脐静脉内皮细胞系，未在更多细胞类型或体内模型中验证 | 探究clusterin在血管性血友病因子调控中的作用机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 细胞生物学 | 血管性血友病 | 单细胞RNA测序, siRNA, CRISPR-Cas9 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10243 | 2025-10-07 |
Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription
2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214900119
PMID:36279426
|
研究论文 | 本研究揭示了鸟氨酸脱羧酶通过调节IL-22转录支持ILC3细胞在感染性和自身免疫性结肠炎中的免疫应答 | 首次发现ILC3细胞具有独特的多胺生物合成代谢特征，并证明ODC1通过正调控IL-22转录影响肠道免疫防御和自身免疫性结肠炎 | 研究主要基于小鼠模型，人类ILC3细胞中多胺代谢的作用仍需验证 | 探究ILC3细胞的代谢特征及其在肠道免疫应答中的作用机制 | 第3组固有淋巴细胞(ILC3s)及其代谢途径 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, 代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 小鼠肠道ILC细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10244 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing-guided engineering of mitochondrial therapies for intervertebral disc degeneration by regulating mtDNA/SPARC-STING signaling
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.036
PMID:40104024
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序指导工程化线粒体疗法治疗椎间盘退变 | 首次利用单细胞RNA测序指导开发针对椎间盘退变的线粒体移植疗法，并工程化具有抗氧化和抗炎活性的多生物活性生物疗法 | 研究主要基于动物模型验证，尚未进行人体临床试验 | 开发针对椎间盘退变的新型线粒体疗法 | 人类髓核组织、髓核细胞和大鼠椎间盘退变模型 | 单细胞测序 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类髓核组织和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10245 | 2025-10-07 |
SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331
PMID:40023001
|
研究论文 | 本研究探讨SPRY1在皮肤衰老中的作用，特别是其对巨噬细胞M1极化的调控及其在黑色素瘤预后中的潜在价值 | 首次揭示SPRY1通过调控巨噬细胞M1极化促进皮肤衰老的机制，并发现其在黑色素瘤预后中的临床意义 | 缺乏体内实验验证，需要进一步研究其调控网络 | 研究SPRY1在皮肤衰老中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 皮肤衰老和黑色素瘤 | 单细胞测序，WGCNA，qRT-PCR，CCK-8检测，ROS和SOD活性测量 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 来自GTEx和GEO数据库的数据集，以及细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10246 | 2025-03-21 |
Marrying mechanics with spatial transcriptomics
2025-Mar-19, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02491-4
PMID:40108447
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10247 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01413-24
PMID:39902863
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的区室化特征 | 首次发现嗅觉上皮细胞和呼吸上皮细胞对I型和III型干扰素的反应存在明显区室化差异 | 研究仅限于小鼠模型，人类中的情况仍需验证 | 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型对I型和III型干扰素的抗病毒反应差异 | 小鼠鼻上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10248 | 2025-10-07 |
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01962-24
PMID:39902963
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较抗体依赖性增强感染与传统感染方式下登革病毒感染人类巨噬细胞的免疫转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示ADE感染与传统感染在转录组层面的差异，发现ADE感染导致干扰素信号抑制和炎症趋化因子转录下调 | 研究仅针对DENV-2血清型，未涵盖所有登革病毒血清型；使用单核细胞来源的巨噬细胞可能不能完全代表体内情况 | 阐明抗体依赖性增强感染在登革病毒致病机制中的细胞内在调控机制 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | 无监督分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10249 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术定位成年果蝇大脑和身体中150种mRNA的空间位置 | 首次将空间转录组学应用于成年果蝇大脑和身体，开发了整合空间转录组学和单细胞数据集的计算工具 | 概念验证研究，仅使用选定基因面板（150种mRNA物种） | 解决单核测序中细胞空间位置信息丢失的问题，定位果蝇细胞图谱中未知细胞簇的空间位置 | 成年果蝇大脑和身体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞数据 | 整个果蝇头部和身体，包括所有主要器官 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10250 | 2025-10-07 |
Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade
2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05642-8
PMID:40095115
|
研究论文 | 本研究探索靶向HIF-2α在胶质母细胞瘤中重塑免疫浸润并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示HIF-2α在胶质母细胞瘤免疫抑制中的关键作用，并证明HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断疗法的协同效应 | 研究基于小鼠GL261胶质母细胞瘤模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究靶向HIF-2α对胶质母细胞瘤免疫微环境的调控作用及其与免疫治疗的协同机制 | GL261小鼠胶质母细胞瘤模型、肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞、调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | GL261小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10251 | 2025-10-07 |
Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
2025-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57911-6
PMID:40097446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索酵母在渗透胁迫适应过程中的转录异质性及其对细胞适应性决策的影响 | 首次系统性地揭示了酵母渗透胁迫响应程序的转录异质性模式，并建立了转录异质性与细胞适应性之间的直接联系 | 研究仅针对酵母模型，结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 阐明转录异质性在酵母应激适应性响应中的分子机制和功能意义 | 酵母细胞及其300多个RNA条形码缺失突变体 | 单细胞生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 300多个RNA条形码缺失突变体 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10252 | 2025-10-07 |
Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93146-7
PMID:40097519
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示子宫内膜异位症和复发性种植失败的共享诊断基因及细胞微环境变化 | 首次整合转录组和单细胞测序数据系统分析EMs和RIF的共享分子机制，并利用机器学习筛选出PDIA4和PGBD5作为新型共享诊断生物标志物 | 研究结果仍需在更大规模队列中验证，治疗潜力有待进一步探索 | 探索子宫内膜异位症和复发性种植失败的共同病理机制和诊断标志物 | 子宫内膜异位症和复发性种植失败患者 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,复发性种植失败 | 转录组测序,单细胞测序,机器学习,基因集富集分析,ceRNA网络分析 | 随机森林,XGBoost | 基因表达数据,单细胞数据 | GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 10253 | 2025-10-07 |
Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93872-y
PMID:40097571
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索系统性红斑狼疮中线粒体和铁死亡相关机制，建立诊断预测模型并筛选潜在治疗药物 | 首次结合线粒体相关基因和铁死亡相关基因评分，通过单细胞多组学分析揭示SLE细胞异质性，并开发高精度诊断预测模型 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制并开发诊断生物标志物和治疗方法 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 分子对接 | 机器学习算法, 高维加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 10254 | 2025-10-07 |
Neutrophil extracellular trap-derived double-stranded RNA aggravates PANoptosis in renal ischemia reperfusion injury
2025-Mar-17, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02145-8
PMID:40098148
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网来源的双链RNA通过TLR3信号通路加剧肾缺血再灌注损伤中近端肾小管上皮细胞的PANoptosis | 首次发现NETs来源的dsRNA通过TLR3信号通路促进肾IRI中的PANoptosis，并鉴定RIPK1-PANoptosomes在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究中性粒细胞胞外诱捕网在肾缺血再灌注损伤中促进PANoptosis的具体机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型中的近端肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 肾缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序，基因敲除，化学抑制剂 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10255 | 2025-10-07 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
|
研究论文 | 本研究通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络和多尺度转录组学数据，首次全面绘制了食管鳞状细胞癌微环境的代谢图谱 | 首次在ESCC微环境中全面绘制代谢图谱，识别了16种代谢状态和4种预后亚型，揭示了细胞解毒过程失活与不良预后的关联 | 研究基于转录组数据推断代谢状态，需要实验验证代谢功能的实际变化 | 探索食管鳞状细胞癌微环境中代谢状态与预后的关系 | 食管鳞状细胞癌患者和肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据，批量样本转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞，两个独立队列（n=79和119） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10256 | 2025-10-07 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示EGFR-Ras和Hh信号通路在防止肿瘤发生中的独立作用机制 | 发现非相互作用的信号通路在转录水平上汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究局限于果蝇滤泡细胞谱系，未在哺乳动物系统中验证 | 探究促增殖信号对上皮稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞谱系 | 单细胞转录组学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10257 | 2025-10-07 |
The trabecular and compact myocardium of adult vertebrate ventricles are transcriptionally similar despite morphological differences
2025-Mar, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15296
PMID:39934982
|
研究论文 | 本研究通过转录组学分析揭示了成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌在转录水平上的相似性 | 首次系统比较了多种脊椎动物胚胎期和成年期心肌的转录组差异，挑战了传统认为致密心肌与小梁心肌存在本质功能差异的观点 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏功能验证实验；物种覆盖范围有限 | 探究脊椎动物心脏进化过程中致密心肌与小梁心肌的转录组差异及其发育动态 | 小鼠、人类、斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心肌组织 | 转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学，单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多种脊椎动物物种的心肌样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10258 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from bronchopulmonary dysplasia
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70276
PMID:40097329
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析支气管肺发育不良患者外周血单个核细胞的免疫特征 | 首次整合单细胞RNA测序与T/B细胞受体分析揭示BPD免疫机制，发现BTLA-TNFRSF14信号轴的关键作用 | 样本量有限，主要发现需在动物模型中验证 | 阐明支气管肺发育不良的免疫学机制 | 早产儿外周血单个核细胞及小鼠BPD模型 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序，T/B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 早产儿BPD患者和健康对照的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10259 | 2025-10-07 |
Intratumoral Heterogeneity and Immune Microenvironment in Hepatoblastoma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70482
PMID:40099956
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝母细胞瘤的瘤内异质性和免疫微环境特征 | 首次提供肝母细胞瘤的全面单细胞图谱，发现不同肿瘤区域具有不同的细胞组成和恶性程度，识别HMGB2作为潜在预后标志物 | 仅基于单个患者的样本，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索肝母细胞瘤的瘤内异质性和肿瘤免疫微环境特征 | 肝母细胞瘤患者三个肿瘤区域和邻近正常组织的细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 43,592个细胞来自一个患者的三个肿瘤区域和邻近正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10260 | 2025-10-07 |
Role of cancer stem cell heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-28, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1286
PMID:40104739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌中癌症干细胞异质性及其对预后的影响 | 首次在单细胞水平系统揭示肝内胆管癌中不同癌症干细胞亚群的异质性特征及其与预后的关联 | 样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要更大规模临床验证 | 研究癌症干细胞异质性对肝内胆管癌预后的影响 | 肝内胆管癌患者样本和公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，生物信息学分析 | AUCell, CellChat, SCENIC, CIBERSORT | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，临床数据 | GSE142784数据集和TCGA数据库中的肝内胆管癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |