单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 10181 - 10200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10181 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-Jul-29, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
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研究论文 | 研究揭示了哺乳动物听觉受体中单细胞转录组的拓扑差异 | 首次确定了内毛细胞和外毛细胞的独特分子特征，以及与音调相关的新基因 | 研究主要集中在小鼠模型中，可能不完全适用于人类 | 探索哺乳动物毛细胞的声音频率选择和其分子基础 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了不同位置的内外毛细胞样本 |
| 10182 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法，能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释，尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA |
| 10183 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
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研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达，并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用，并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 10184 | 2024-08-05 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究描述了一种与人类MAP3K1隐性变体相关的耳聋DFNB128，以及其与耳聋小鼠模型的相似性 | 首次识别了与非综合征性耳聋相关的新型隐性变体，并显示了其在小鼠耳蜗的表达 | 仅在一个巴基斯坦家族中进行研究，样本量有限 | 探索与隐性耳聋相关的新变体以及其机制 | 巴基斯坦的一个亲属家族，其中有两个兄弟姐妹出现非综合征性耳聋 | 数字病理学 | 耳聋 | 微阵列和外显子测序 | 基因缺失小鼠模型 | 转录组数据 | 一个家族的多个成员，其中两名兄弟姐妹受到影响 |
| 10185 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能，以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8，并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线，未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 |
| 10186 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达，并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 |
| 10187 | 2024-08-05 |
Revealing Genetic Dynamics: scRNA-seq Unravels Modifications in Human PDL Cells across In Vivo and In Vitro Environments
2024-Apr-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094731
PMID:38731950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析人类牙周韧带(PDL)细胞在体内和体外环境中的遗传变化 | 首次通过scRNA-seq揭示了PDL中不同细胞亚群的独特基因特征及其对培养条件的反应 | 未详细探讨不同捐献者之间的PDL细胞差异及其生物学影响 | 旨在填补对PDL病理生理学的理解空白 | 主要人类PDL样本，涉及7个捐献者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 7个主要人类PDL样本 |
| 10188 | 2024-08-04 |
Spatial co-transcriptomics reveals discrete stages of the arbuscular mycorrhizal symbiosis
2024-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01666-3
PMID:38589485
|
研究论文 | 这篇文章探讨了植物与丛枝菌根真菌的共生相互作用，并揭示了在不同共生阶段植物根细胞的转录组特征。 | 创新点在于结合单细胞和空间转录组学的方法，以分析复杂的生物相互作用，提供了新的视角。 | 研究可能受到单细胞 RNA 测序技术局限性的影响，无法覆盖所有细胞类型的反应。 | 研究植物与丛枝菌根真菌的共生关系及其分子基础。 | 研究对象为白花苜蓿（Medicago truncatula）和不规则根霉（Rhizophagus irregularis）的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个植物根细胞类型的样本 |
| 10189 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507LE
PMID:37934672
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性阻塞性肺疾病中气肿特有的淋巴滤泡B细胞特征的转录组学。 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了在气肿患者中B细胞活化的独特特征和转录网络 | 样本量相对较小，且仅限于特定患者群体 | 研究气肿对慢性阻塞性肺疾病患者淋巴滤泡中B细胞转录组特征的影响 | 研究对象为40名慢性阻塞性肺疾病患者和曾经吸烟者的肺部样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 肺部组织样本 | 40名患者的样本 |
| 10190 | 2024-08-05 |
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0307943
PMID:39074091
|
研究论文 | 本文通过分析差异表达基因揭示了JAG、DLL和NOTCH家族在癌症恶性进展中的功能和临床相关性 | 通过综合差异表达基因和生存分析，提出了JAG、DLL和NOTCH家族的未被探索的调控功能和协同效应 | NA | 阐明JAG、DLL和NOTCH家族的普遍功能及其与各种生物功能的联系 | 15种癌症的差异表达基因 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15种癌症类型的临床数据 |
| 10191 | 2024-08-05 |
Multiomics Analysis of Disulfidptosis Patterns and Integrated Machine Learning to Predict Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡对肺腺癌免疫微环境和免疫治疗的影响 | 本研究引入了一种基于二硫化物死亡基因的预测风险模型，能够有效预测肺腺癌患者的生存率和治疗结果 | 未提及具体局限性 | 研究二硫化物细胞死亡对肺腺癌患者免疫治疗反应的影响 | 聚焦于与二硫化物死亡相关的基因在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组学、机器学习算法 | 预测模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌多组学队列 |
| 10192 | 2024-08-05 |
Nicotinamide phosphoribosyltransferase prompts bleomycin-induced pulmonary fibrosis by driving macrophage M2 polarization in mice
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.94482
PMID:38773984
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研究论文 | 该研究探讨了烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在小鼠中的肺纤维化中驱动巨噬细胞M2极化的作用 | 研究首次揭示了NAMPT在肺纤维化发病机制中的作用，特别是在巨噬细胞M2极化中的创新机制 | 该研究主要基于小鼠模型，未能在临床试验中验证结果 | 研究NAMPT在特发性肺纤维化中的作用及其机制 | 研究对象为肺纤维化患者的临床样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序、Western blot、qRT-PCR、ELISA和免疫组化染色 | 小鼠模型 | 临床样本和小鼠肺纤维化模型数据 | 临床样本和小鼠模型，具体样本数量未说明 |
| 10193 | 2024-08-04 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
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研究论文 | 这篇论文探讨了人类心包生物学在心脏发育和疾病中的原则 | 该研究首次生成了具有自我组织能力的人类多能干细胞衍生的心包内体，揭示了心包和心肌的形态、分子和功能模式 | 该研究未明确提及限制因素 | 了解心包在心脏发育和疾病过程中的功能及其机制 | 研究对象为人类胚胎发育中心包细胞系和心肌细胞类型 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组学 | 自我组织体 | NA | NA |
| 10194 | 2024-08-04 |
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01716-9
PMID:36973557
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研究论文 | 本文提出了一种算法SEACells，用于从单细胞基因组数据推断转录组和表观基因组细胞状态 | SEACells通过克服单细胞数据的稀疏性，识别细胞状态的分类，而保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 | NA | 探索单细胞数据的细胞状态及其在相关疾病研究中的应用 | 单细胞基因组数据中的细胞状态 | 计算生物学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 聚类算法 | 基因组数据 | 分析了多个数据集中的单细胞样本，包括COVID-19患者队列 |
| 10195 | 2024-08-05 |
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01747-2
PMID:37156914
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研究论文 | 本研究生成了人类视网膜类器官发展的多模态时空表型 | 开发了一种工具包，用于可视化前体细胞和神经元的位置以及细胞外和亚细胞组分的空间排列 | 缺乏不同空间尺度和分子模式的定量测量 | 研究人类视网膜类器官的发育和疾病 | 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和主要成年的视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据和空间分割的细胞核数据 | 时间序列数据集和主要成人视网膜组织 |
| 10196 | 2024-08-04 |
IL-33 Expression Is Lower in Current Smokers at both Transcriptomic and Protein Levels
2023-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202210-1881OC
PMID:37708400
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研究论文 | 这项研究探讨吸烟状态对IL-33表达的影响。 | 本研究首次显示吸烟会导致IL-33在转录组和蛋白水平上的减少，特别是在当前吸烟者中。 | 研究主要集中在COPD患者身上，可能不适用于其他疾病。 | 了解吸烟状态如何影响IL-33的表达情况。 | 研究对象为肺气道中的IL-33表达水平和吸烟状态。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq, 西方印迹分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 生物组织样本 | 涉及八个独立的转录组研究和来自COPD患者的肺组织样本 |
| 10197 | 2024-08-05 |
Construction of Prediction Model for Atrial Fibrillation with Valvular Heart Disease Based on Machine Learning
2022-Jul, Reviews in cardiovascular medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.31083/j.rcm2307247
PMID:39076905
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研究论文 | 本研究探讨了瓣膜性心脏病进展的分子机制并提供了房颤-瓣膜性心脏病的候选治疗靶点 | 使用机器学习方法筛选了与AF-VHD相关的核心基因，为房颤的生物标志物和治疗靶点提供了新的见解 | 未提及具体的样本特征和临床数据的多样性 | 探讨瓣膜性心脏病进展的分子机制 | 重点分析与房颤-瓣膜性心脏病相关的核心基因 | 机器学习 | 房颤 | RNA微阵列分析、机器学习、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 819个差异表达基因 |
| 10198 | 2024-08-05 |
The history and advances in cancer immunotherapy: understanding the characteristics of tumor-infiltrating immune cells and their therapeutic implications
2020-08, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-0488-6
PMID:32612154
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评论 | 本文回顾了癌症免疫治疗的历史和最新进展，重点关注肿瘤浸润免疫细胞的特征及其治疗意义 | 本文强调了单细胞技术在全面分析肿瘤微环境中的应用，提供了肿瘤浸润免疫细胞功能多样性的见解 | 肿瘤微环境的高度异质性和动态特性阻碍了对肿瘤内免疫细胞的精确解析 | 阐明肿瘤浸润免疫细胞的特征并探讨其对癌症免疫治疗的影响 | 肿瘤浸润免疫细胞及其在癌症免疫治疗中的作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10199 | 2024-08-05 |
Unveiling functional heterogeneity in breast cancer multicellular tumor spheroids through single-cell RNA-seq
2020-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-69026-7
PMID:32728097
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌多细胞肿瘤球体中的功能异质性 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了不同细胞亚型之间的功能关系及其对肿瘤发展的促进作用 | 研究仅限于MCF7多细胞肿瘤球体模型，可能不适用于所有类型的乳腺癌 | 研究肿瘤细胞亚群间的功能关系及其在肿瘤进展中的作用 | 乳腺癌细胞系MCF7的多细胞肿瘤球体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MCF7多细胞肿瘤球体的单细胞样本，两个时间点的分析 |
| 10200 | 2024-08-05 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
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研究论文 | 本研究识别和功能性表征了基底多细胞生物中的原型节律神经元，阐明了其与微生物之间的相互作用 | 识别了原型节律神经元表达丰富的免疫相关基因，并提出了节律神经元进化起源的新模型 | 对节律神经元及其与微生物相互作用的了解仍然有限 | 旨在探讨节律神经元的进化起源及其与微生物的相互作用 | 基底多细胞生物中的原型ANO/SCN/TRPM离子通道表达的节律细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、免疫化学和功能实验 | NA | NA | NA |