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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-03-13 |
Bi-specific T cell-engaging antibody triggers protective immune memory and glioma microenvironment remodeling in immune-competent preclinical models
2025-Oct-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011714
PMID:41151835
|
研究论文 | 本研究在免疫健全的临床前模型中评估了双特异性T细胞衔接抗体(BTE)对胶质母细胞瘤的治疗机制,发现其能触发保护性免疫记忆并重塑肿瘤微环境 | 在免疫健全的动物模型中首次系统评估BTE的作用机制,揭示了其在直接杀伤、诱导免疫记忆和调节肿瘤微环境方面的综合效应 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探究双特异性T细胞衔接抗体在胶质母细胞瘤治疗中的作用机制 | 表达IL13RA2的胶质母细胞瘤细胞及免疫健全的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫荧光、多参数MRI | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据、影像数据 | 多个临床前胶质母细胞瘤模型中的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1002 | 2026-03-13 |
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文总结了肝脏分区在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 | 利用单细胞基因组学和空间转录组学技术深化了对肝脏分区的理解 | NA | 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老中的作用 | 肝脏细胞,特别是沿门静脉-中央静脉轴的肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组学,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1003 | 2026-03-13 |
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0698
PMID:39918417
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研究论文 | 本研究揭示了接头蛋白Kindlin-2通过重塑造血过程和调节PD-L1表达,在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的关键作用 | 首次阐明Kindlin-2通过系统性调节造血过程(促进髓系细胞扩增)和肿瘤PD-L1表达,驱动三阴性乳腺癌免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;未详细探讨Kindlin-2调控造血和PD-L1表达的具体下游信号通路 | 探究Kindlin-2在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的作用机制,并评估其作为免疫治疗联合靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌肿瘤模型、荷瘤小鼠的造血系统及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确说明具体样本数量,但涉及荷瘤小鼠模型及多种测序分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1004 | 2026-03-13 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542774
PMID:37398280
|
研究论文 | 本研究优化了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系,以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控特征 | 开发了一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境下评估胶质瘤代谢的可行方法,结合人血浆样培养基和稳定同位素示踪技术,揭示了传统培养条件中被抑制的代谢和免疫程序 | 该方法仍为体外模型,可能无法完全模拟体内复杂的生理和免疫相互作用 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 代谢组学 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪技术、空间转录组学 | NA | 代谢数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1005 | 2026-03-13 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脾脏TNF-α信号在巨细胞病毒感染期间促进NK细胞从先天免疫向适应性免疫转变的关键机制 | 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路,分别调控NK细胞的先天效应功能和适应性前体细胞分化 | 研究主要聚焦于巨细胞病毒感染模型,在其他病毒感染或肿瘤微环境中的普适性有待验证 | 探究病毒感染过程中NK细胞在不同组织中的活化机制及其向适应性免疫细胞转变的调控通路 | 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,纵向追踪 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1006 | 2026-03-13 |
[Research progress on the mechanistic role and constituents of hepatic macrophages during the occurrence and development of hepatic fibrosis]
2025-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
|
综述 | 本文综述了肝纤维化发生发展中肝巨噬细胞的机制作用、构成及其亚型,并探讨了单细胞测序技术揭示的新发现以及靶向巨噬细胞治疗的优势 | 总结了单细胞测序技术揭示的肝纤维化过程中巨噬细胞的新亚型和作用模式,并分析了靶向巨噬细胞治疗相较于传统抗纤维化疗法的优势 | NA | 阐明肝巨噬细胞在肝纤维化发生发展中的机制作用和构成,并探讨新的治疗方向 | 肝巨噬细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1007 | 2026-03-13 |
CancerTrace: Multi-stage single-cell analysis of networked cancer evolution for driver and modulator gene identification
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.014
PMID:41322005
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CancerTrace的计算框架,用于从单细胞RNA测序数据中识别癌症驱动基因及其上游调控因子 | 结合转移熵和稀疏条件结构于变分贝叶斯模型中,实现时间感知的动态调控机制重建,无需匹配DNA或外部扰动数据 | 仅基于九个纵向scRNA-seq文库(来自三名肺腺癌患者),样本规模较小,且仅应用于肺腺癌 | 识别患者特异性癌症驱动基因及其上游调控因子,以推进精准肿瘤学 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 变分贝叶斯模型 | 单细胞RNA测序数据 | 九个纵向scRNA-seq文库,来自三名肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1008 | 2026-03-13 |
Comparative single-cell landscape of immune cells in human livers affected HBV and non-viral cirrhosis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708675
PMID:41815278
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了HBV与非病毒性肝硬化患者肝脏中的免疫细胞景观,揭示了疾病进展中的不同免疫机制 | 首次在单细胞水平上系统比较HBV与非病毒性肝硬化中的免疫细胞异质性,并整合空间转录组数据验证细胞共定位 | 样本量有限,主要基于HBV肝硬化患者,未涵盖所有非病毒性肝硬化亚型 | 阐明HBV与非病毒性肝硬化中免疫细胞景观的差异及其在疾病进展中的作用 | HBV肝硬化患者、非病毒性肝硬化患者及健康对照者的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | HBV肝硬化患者与健康对照者的肝脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1009 | 2026-03-13 |
Single-cell sequencing analysis and bulk-seq identify IGFBP6 and TNFAIP6 as novel differential diagnosis markers for postburn pathological scarring
2024-12, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2024.08.021
PMID:39317554
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和批量测序分析,鉴定出IGFBP6和TNFAIP6作为烧伤后病理性瘢痕(如瘢痕疙瘩和增生性瘢痕)的差异诊断标志物 | 首次在细胞水平利用单细胞测序技术结合批量测序,识别出IGFBP6和TNFAIP6作为区分烧伤后瘢痕疙瘩和增生性瘢痕的新型分子诊断标志物 | 研究样本来自单一中心,可能限制结果的普适性;未详细说明单细胞测序平台的具体技术细节 | 识别分子诊断生物标志物以区分烧伤后瘢痕疙瘩和增生性瘢痕 | 烧伤后病理性瘢痕(瘢痕疙瘩和增生性瘢痕)的临床样本 | 数字病理学 | 烧伤后病理性瘢痕 | 单细胞测序, 批量RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 基因集富集分析, 免疫组织化学染色, 定量逆转录PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 批量测序数据 | 未明确指定样本数量,但包括来自研究中心的烧伤后临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1010 | 2026-03-13 |
[Revealing research progress for immunological characteristics of chronic hepatitis B applying single-cell RNA sequencing technology]
2024-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了应用单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎免疫学特征的最新进展 | 系统总结了新兴的单细胞RNA测序技术在揭示慢性乙型肝炎免疫细胞转录组细微变化方面的应用进展 | NA | 探索慢性乙型肝炎的免疫发病机制及潜在治疗靶点 | 慢性乙型肝炎患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1011 | 2026-03-13 |
Dynamically visualizing profibrotic maladaptive repair after acute kidney injury by fibroblast activation protein imaging
2024-11, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.07.015
PMID:39098582
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研究论文 | 本文通过成纤维细胞激活蛋白(FAP)成像技术,动态可视化急性肾损伤后的促纤维化适应性不良修复过程 | 首次将FAP特异性PET/CT成像用于非侵入性动态评估急性肾损伤后的适应性不良修复,并预测肾纤维化 | 研究主要基于动物模型和有限患者样本,临床广泛应用前需进一步验证 | 开发非侵入性工具以评估器官损伤后的促纤维化适应性不良修复过程 | 急性肾损伤(AKI)患者和AKI小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫染色分析、PET/CT扫描 | NA | 图像、序列数据 | 患者活检样本和AKI小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、PET/CT成像 | NA | NA |
| 1012 | 2026-03-13 |
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1459
PMID:38742767
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研究论文 | 本研究揭示了血管周围NOTCH3+干细胞驱动脑膜瘤发生和放疗抵抗的作用机制 | 首次在人、狗和小鼠的脑膜瘤中发现并证实了血管周围NOTCH3+干细胞的保守存在及其在肿瘤发生和放疗抵抗中的关键驱动作用 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和异种移植模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究脑膜瘤发生和放疗抵抗的细胞类型与信号机制 | 脑膜瘤(来自人类、狗和小鼠) | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、成像技术 | 基因工程小鼠模型、异种移植模型 | 转录组数据、图像数据 | 跨物种(人、狗、小鼠)的脑膜瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1013 | 2024-08-07 |
B-cell repertoire and functions in idiopathic nephrotic syndrome: what to learn from single-cell RNA sequencing?
2024-10, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.05.032
PMID:38977075
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1014 | 2026-03-13 |
Integrated Single-Cell RNA-seq and ATAC-seq Reveals Heterogeneous Differentiation of CD4+ Naive T Cell Subsets is Associated with Response to Antidepressant Treatment in Major Depressive Disorder
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308393
PMID:38867657
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序,揭示了CD4+初始T细胞亚群的异质性分化与重度抑郁症患者对抗抑郁治疗反应之间的关联 | 首次结合单细胞RNA-seq和ATAC-seq技术,在MDD患者中识别出与治疗反应相关的特定激活CD4初始T细胞群体,并提出了ETS作为MAPK通路的上游调控因子 | 样本量相对较小(8名健康个体和8名MDD患者),且主要基于外周血单核细胞,可能无法完全反映中枢神经系统的免疫变化 | 探究重度抑郁症患者对抗抑郁治疗反应异质性的分子机制 | 重度抑郁症患者和健康个体的外周血单核细胞,特别是CD4+初始T细胞 | 单细胞组学 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 8名健康个体和8名MDD患者用于单细胞测序,另有一个独立队列包括35名患者和40名健康个体用于流式细胞术验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1015 | 2026-03-13 |
Single-Cell Spatial Transcriptomics Unveils Platelet-Fueled Cycling Macrophages for Kidney Fibrosis
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308505
PMID:38838052
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研究论文 | 本研究揭示了血小板通过THBS1信号调控一种新型“循环M2”巨噬细胞亚群,从而驱动肾脏纤维化的机制 | 首次结合单细胞和空间转录组技术,在肾脏损伤修复过程中鉴定出由血小板信号调控的、兼具M2表型与增殖活性的新型“循环M2”巨噬细胞亚群,并阐明其促纤维化作用 | 研究主要基于小鼠缺血/再灌注损伤模型,在人类肾脏疾病中的普适性仍需进一步验证;血小板THBS1信号下游的具体分子通路尚未完全解析 | 探究血小板在肾脏损伤后修复过程中的具体作用及其促进急性肾损伤向慢性肾病转变的机制 | 小鼠肾脏缺血/再灌注损伤模型中的免疫细胞(重点关注血小板和巨噬细胞) | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1016 | 2026-03-13 |
Deep Batch Integration and Denoise of Single-Cell RNA-Seq Data
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308934
PMID:38778573
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepBID的新型深度学习方法,用于同时进行单细胞RNA测序数据的批次效应校正、非线性降维、嵌入和细胞聚类 | DeepBID采用基于负二项分布的自动编码器,结合双重Kullback-Leibler散度损失函数,在一致的低维潜在空间中对齐不同批次的细胞点,并通过迭代聚类逐步减轻批次效应 | NA | 开发一种高效的单细胞RNA测序数据集成和去噪方法,以消除批次效应,确保数据的准确解释和全面分析 | 单细胞转录组数据集,特别是来自不同实验室或scRNA-seq协议的相同组织或细胞系的数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1017 | 2026-03-13 |
A Cell Cycle-Aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401815
PMID:38887194
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络(CCAN),用于在整合单细胞多组学数据时去除细胞周期效应,同时保留细胞类型特异性变异 | 这是首个研究单细胞多组学数据整合中细胞周期效应的计算模型 | NA | 研究单细胞多组学数据整合中的细胞周期效应,并开发去除该效应的方法 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 细胞周期感知网络(CCAN) | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1018 | 2026-03-13 |
Patient-Derived Tumor Organoids Combined with Function-Associated ScRNA-Seq for Dissecting the Local Immune Response of Lung Cancer
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400185
PMID:38896792
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研究论文 | 本研究开发了一种结合患者来源的肺癌类器官和功能关联单细胞RNA测序的平台,用于解析肺癌局部免疫微环境对免疫治疗的动态响应 | 开发了功能关联单细胞RNA测序平台,可在单个类器官水平同时进行表型评估和scRNA-seq,并利用该平台揭示了患者来源的肺癌类器官保留了亲本肿瘤组织的免疫微环境异质性 | 研究样本量相对较小,仅来自7名患者,且为体外模型研究 | 解析肺癌局部肿瘤免疫微环境对免疫检查点阻断治疗的动态响应 | 患者来源的原发性肺癌类器官及其中的浸润免疫细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自7名患者的171个个体pLCOs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 功能关联单细胞RNA测序平台 |
| 1019 | 2026-03-13 |
Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403095
PMID:38867614
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了宫内生长受限(IUGR)新生仔猪肝脏损伤的性别依赖性模式,并探索了ApoA4作为新型生物标志物的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序创建IUGR仔猪肝脏细胞图谱,揭示了性别依赖性的损伤反应机制,并发现ApoA4在雄性中的保护性作用 | 研究仅使用仔猪模型,结果向人类转化的适用性需进一步验证;样本量可能有限 | 探究IUGR诱导的肝脏损伤的性别依赖性分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 宫内生长受限(IUGR)的新生仔猪 | 单细胞组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自同一胎的仔猪(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1020 | 2026-03-13 |
Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401590
PMID:38864342
|
研究论文 | 本研究通过多时间点肺转移小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术识别并表征了食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)及其特征基因 | 首次在多时间点肺转移小鼠模型中,结合单细胞RNA测序识别了ESCC的转移起始细胞(MICs),并定义了一组7个转移起始特征基因(MIS),包括CD44和TACSTD2,用于预测临床预后 | 研究基于小鼠模型和有限细胞系(KYSE30),可能无法完全反映人类ESCC的异质性;临床样本验证仅限于部分MIS基因 | 探究食管鳞状细胞癌(ESCC)肺转移的早期微环境及转移起始细胞的特性 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞系(KYSE30)及临床样本 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫组化(mIHC) | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组化图像数据 | 小鼠模型中的ESCC细胞及临床ESCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |