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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-01-17 |
GCLSC: Single-cell clustering model based on graph contrastive learning
2026-Jan-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习的单细胞聚类模型GCLSC，用于解决单细胞RNA测序数据的高维、稀疏和技术噪声带来的聚类挑战 | 首次将图Transformer与图注意力网络（GAT）结合，共同建模局部细胞相互作用和全局拓扑依赖关系，并采用四种数据增强策略提升模型鲁棒性 | 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率，也未讨论对特定技术批次效应的专门处理策略 | 开发一种能够有效处理单细胞RNA测序数据高维稀疏特性的鲁棒聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图对比学习模型（结合Graph Transformer和GAT） | 单细胞基因表达数据 | 九个真实世界scRNA-seq数据集（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2026-01-17 |
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jan-09, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养对骨髓和胎盘来源间充质干细胞免疫调节能力的影响，揭示了ICAM-1在球体形成和免疫调节中的双重作用 | 首次通过3D培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异，并识别ICAM-1在球体形成和免疫增强中的关键机制 | 研究主要基于体外实验，体内验证有限；样本来源和数量可能影响结论的普适性 | 评估3D培养对人间充质干细胞免疫调节能力的影响，并阐明其分子机制 | 骨髓来源和胎盘来源的人间充质干细胞 | 细胞生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 两种来源的MSCs（骨髓和胎盘） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1003 | 2026-01-17 |
Curriculum-guided divergence scheduling improves single-cell clustering robustness
2026-Jan-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108592
PMID:41534329
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研究论文 | 本文提出了一种名为DAGCL的动态图嵌入框架，通过课程学习引导的调度机制，提高了单细胞RNA-seq数据聚类的鲁棒性 | 提出动态注意力增强图嵌入框架，将表示学习重构为从粗到细的进化过程，采用课程引导的调度机制动态调节注意力强度和监督严格度 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞RNA-seq数据深度聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 动态图嵌入框架（DAGCL） | 基因表达数据 | 27个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1004 | 2026-01-17 |
Adaptive multi-view information bottleneck for multi-omics data clustering
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf717
PMID:41527852
|
研究论文 | 本文提出了一种基于信息瓶颈原理的自适应多视图聚类框架（scAMVIB），用于解决多组学数据聚类任务 | 利用信息瓶颈原理学习多视图组学表示，同时捕获组学间关联和组学特定模式，并通过自适应权重分配优化聚类性能 | NA | 解决多组学数据聚类中互补信息有效整合与权重分配的挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 自适应多视图信息瓶颈框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 1005 | 2026-01-17 |
CSRefiner: a lightweight framework for fine-tuning cell segmentation models with small datasets
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf718
PMID:41527855
|
研究论文 | 本文提出了一个名为CSRefiner的轻量级框架，用于在小数据集上微调细胞分割模型，以提升全组织单细胞空间表达分析的精度 | CSRefiner是一个轻量级且高效的微调框架，支持微调空间组学领域广泛使用的分割模型，并能在标注数据非常有限的情况下实现高精度，同时兼容多种主流模型 | 未在摘要中明确说明 | 解决现有微调方法通常需要大量重新训练或局限于特定模型架构的问题，为实际应用中的全组织单细胞空间表达分析提供一种实用解决方案 | 细胞分割模型 | 数字病理学 | NA | 空间组学技术 | 深度学习分割模型 | 图像（核或膜染色图像） | 小数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1006 | 2026-01-17 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群，并基于此开发了机器学习预测模型 | 研究样本量有限，验证队列仅64例样本，且未进行实验验证B细胞亚群的功能机制 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用，并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq，批量转录组测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确总样本数，验证队列包含64例样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1007 | 2026-01-17 |
Chronic Alcohol Consumption Enhances the Differentiation Capacity of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells into Osteoclast Precursors
2026-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.06.010
PMID:40683559
|
研究论文 | 本研究探讨了长期酒精摄入如何增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力，揭示了酒精导致骨密度降低和骨骼脆性的机制 | 首次在恒河猴模型中结合谱系流式细胞术和单细胞RNA测序，系统分析了长期酒精摄入对造血干细胞和祖细胞向破骨细胞分化能力的影响，并识别了相关的转录组和表观遗传变化 | 研究基于动物模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明，可能影响统计效力；未探讨长期酒精摄入对其他骨细胞类型的影响 | 探究长期酒精摄入如何通过影响造血干细胞和祖细胞的分化能力，导致骨密度降低和骨骼疾病 | 恒河猴模型中的造血干细胞和祖细胞及其分化的单核细胞/巨噬细胞和破骨细胞前体 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序，谱系流式细胞术，集落形成单位分析，抗酒石酸酸性磷酸酶染色 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1008 | 2026-01-17 |
Decoding innate lymphoid cell heterogeneity and plasticity in colorectal cancer
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70593
PMID:41527493
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了结直肠癌中固有淋巴样细胞的异质性、可塑性及其在肿瘤微环境中的功能 | 揭示了肠道固有淋巴样细胞的两个不同起源，并发现骨髓来源的ILC2s在三级淋巴结构中富集，支持B细胞成熟，与更好的临床预后和免疫治疗反应相关 | NA | 阐明结直肠癌中固有淋巴样细胞的起源、异质性和功能，及其对疾病进展和治疗效果的影响 | 固有淋巴样细胞（ILCs）在结直肠癌中的角色 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 体外共培养, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 免疫荧光图像, 批量RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 来自多个组织（骨髓、血液和肠道）的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1009 | 2026-01-17 |
Network models for bridging denoising and identifying spatial domains of spatially resolved transcriptomics
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013867
PMID:41529048
|
研究论文 | 本文提出了一种名为stACN的集成网络模型，用于联合去噪空间转录组数据并识别空间域 | 首次通过图噪声模型学习干净的双细胞网络，并利用联合张量分解提取兼容的细胞特征，实现了去噪与空间域识别的统一框架 | 未明确说明模型对特定噪声类型或组织复杂度的适应性限制 | 解决空间转录组数据中技术噪声干扰与空间域识别分离处理导致的性能限制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络、张量分解 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1010 | 2026-01-17 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal Lactate Metabolism as a Key Pathway in COVID-19-Induced Pulmonary Fibrosis
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/1049336
PMID:41532065
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序揭示了COVID-19诱导肺纤维化的关键机制，即乳酸代谢通路在肺上皮细胞中的核心作用 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞RNA测序分析，系统性地揭示了COVID-19通过调节肺上皮细胞乳酸代谢促进肺纤维化的新机制，并确定了关键基因SLC16A4和PDGFC-PDGFRA信号轴的作用 | 研究未明确说明样本的具体来源和数量，且主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探究COVID-19诱导肺纤维化的分子机制，寻找潜在的治疗靶点 | COVID-19感染与特发性肺纤维化（IPF）之间的因果关系及其中介通路 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1011 | 2026-01-17 |
Dermatomyositis is characterized by JAK1-mediated monocyte-driven vasculopathy and inflammation
2025-Dec-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea9007
PMID:41442501
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析皮肌炎患者的皮肤和循环免疫细胞，揭示了皮肌炎中由JAK1介导的单核细胞驱动的血管病变和炎症机制 | 首次在单细胞水平上比较了皮肌炎和系统性红斑狼疮的皮肤病变，并识别出皮肌炎特异性的单核细胞亚群及其通过JAK1信号通路介导内皮细胞功能障碍的机制 | 样本量相对较小（罕见疾病），且研究主要基于转录组分析，需要进一步的功能实验验证 | 阐明皮肌炎的免疫发病机制，特别是皮肤血管病变的分子基础 | 皮肌炎患者、系统性红斑狼疮患者和健康对照者的皮肤组织（病变和非病变）及外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病（皮肌炎） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 皮肌炎患者、系统性红斑狼疮患者和健康对照者的皮肤及血液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1012 | 2026-01-17 |
Development and validation of a CAF-related signature for prognosis and therapy response in colorectal cancer: new insights on HSPB1
2025-Dec-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01217-9
PMID:41407838
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，开发并验证了一个基于癌症相关成纤维细胞（CAF）相关基因的预后和治疗反应预测模型（CRPS），用于结直肠癌 | 整合了101种10种机器学习算法的组合，构建了CRPS模型，该模型在预后预测上优于58个现有CRC预后模型，并首次揭示了HSPB1基因在CAF恶性转化和亚型转换中的关键作用 | NA | 开发并验证一个基于CAF相关基因的预后和治疗反应预测模型，以改善结直肠癌的临床管理 | 结直肠癌患者样本，包括大规模公共数据集和内部数据集 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习算法组合 | 转录组数据 | 总计1,541名患者（包括公共和内部数据集），以及478名患者用于免疫治疗疗效预测 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1013 | 2026-01-17 |
Identification and validation of palmitoylation metabolism related biomarkers in osteoarthritis using transcriptomic and single cell RNA sequencing analyses
2025-Dec-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31218-4
PMID:41381790
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序分析，识别并验证了骨关节炎中与棕榈酰化代谢相关的生物标志物BUB1B和KIF15 | 首次将蛋白质棕榈酰化代谢与骨关节炎联系起来，并利用机器学习算法和单细胞测序技术识别出新的生物标志物，揭示了其在特定软骨细胞亚群中的差异表达 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内功能实验验证这些生物标志物的具体作用机制 | 探索骨关节炎中与蛋白质棕榈酰化代谢相关的生物标志物及其诊断和治疗潜力 | 骨关节炎患者的软骨组织和临床样本 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 转录组测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR，分子对接 | 机器学习算法 | RNA测序数据，基因表达数据 | 未明确指定样本数量，使用了临床OA样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1014 | 2026-01-17 |
Machine learning-based identification of kbhb-affected tumor cell subsets as prognostic and therapeutic targets in breast cancer
2025-Dec-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07555-3
PMID:41382084
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，利用机器学习识别受Kbhb影响的乳腺癌细胞亚群，并评估其预后和治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，识别受Kbhb代谢重编程影响的特定肿瘤细胞亚群，并开发基于机器学习的预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证Kbhb机制在更多临床样本中的普适性 | 识别Kbhb影响的乳腺癌细胞亚群，评估其作为预后和治疗靶点的潜力 | 乳腺癌细胞亚群，特别是受Kbhb相关基因影响的肿瘤细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多组学数据整合 | 机器学习模型（基于101种算法组合） | 多组学数据（包括基因表达、单细胞和空间转录数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1015 | 2026-01-17 |
IL-1β-mediated suppression of CIITA attenuates IFN-γ-induced MHC-II expression on Fibroblasts
2025-Dec-10, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02575-4
PMID:41366425
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β通过抑制CIITA表达来减弱IFN-γ诱导的成纤维细胞MHC-II表达，从而调节肿瘤微环境中的免疫抑制 | 首次发现IL-1β作为IFN-γ/STAT1/CIITA轴的有效抑制剂，揭示了CAF介导免疫抑制的新细胞因子调控机制 | 研究主要基于体外实验，体内验证和临床相关性有待进一步探索 | 阐明成纤维细胞中MHC-II表达的上游细胞因子调控机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、转录组分析、qRT-PCR、慢病毒转导、CRISPR/Cas9基因编辑、scRNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq | NA | NA |
| 1016 | 2026-01-17 |
Modelling the metastatic immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2025-Dec-10, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02186-4
PMID:41372751
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研究论文 | 本研究使用4T1.2和67NR乳腺癌细胞系作为三阴性乳腺癌的免疫活性小鼠模型，比较了乳腺脂肪垫原位注射与乳腺导管内注射两种植入方法对肿瘤转移、进展及肿瘤微环境的影响 | 通过比较不同植入方法（乳腺脂肪垫原位注射与导管内注射），揭示了植入方法如何影响肿瘤的固有转移潜力、进展以及肿瘤细胞与微环境的共进化，并发现导管内注射能更好地模拟早期肿瘤发生事件 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全反映人类三阴性乳腺癌的复杂性；样本量未明确说明，可能限制统计效力 | 研究三阴性乳腺癌的转移性免疫微环境，探索不同肿瘤植入方法对肿瘤进展和免疫反应的影响 | 4T1.2和67NR乳腺癌细胞系作为三阴性乳腺癌的免疫活性小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 靶向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2026-01-17 |
A core stemness-associated module reveals PLK1, NUF2, KIF23, CDCA8, TOP2A, CENPF, AURKA, and ASPM as key genes in rectal cancer
2025-Dec-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03649-2
PMID:41373021
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和高维共表达网络分析，识别出一个与直肠癌干细胞相关的八基因核心模块，并验证了其诊断和预后价值 | 首次结合单细胞图谱和高维共表达网络分析，在直肠癌中定义了一个与干细胞特性相关的八基因特征，并揭示了其与G2/M检查点及免疫微环境的关联 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内和临床验证 | 识别直肠癌特异性癌症干细胞生物标志物和治疗靶点 | 直肠癌干细胞样细胞群 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞转录组学, qRT-PCR, 分子对接 | hdWGCNA | 单细胞RNA-seq数据, 批量RNA-seq数据 | 来自GSE199726、TCGA-READ和GEO GSE90627队列的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1018 | 2026-01-17 |
Unveiling the role of angiogenesis-related biomarkers in diabetic nephropathy via transcriptomics
2025-Dec-09, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-025-02044-5
PMID:41366482
|
研究论文 | 本研究通过转录组学分析，结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序，鉴定了糖尿病肾病中与血管生成相关的生物标志物，并探讨了其在疾病中的作用 | 首次整合公共数据库数据、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，系统识别了CD44、HSPG2、LPAR1和PTGES作为糖尿病肾病的新型生物标志物和风险因子，并构建了诊断列线图 | 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证；样本来源和数量可能受限，且机制研究尚需进一步实验证实 | 探索糖尿病肾病中血管生成相关生物标志物，为临床诊断和治疗提供理论依据 | 糖尿病肾病患者的转录组数据及相关生物样本 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 转录组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting | NA | 转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1019 | 2026-01-17 |
Comprehensive profiling of smoke-induced T cells in mice implicates clonal γδT17 cells as a hallmark of COPD
2025-Dec-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67120-w
PMID:41360788
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、TCR测序和流式细胞术验证，全面分析了吸烟诱导的小鼠T细胞变化，揭示了克隆性γδT17细胞作为慢性阻塞性肺疾病（COPD）的标志物及其保护性作用 | 首次在吸烟诱导的COPD模型中，通过单细胞多组学技术系统表征了T细胞的改变，并发现克隆性扩增的γδT17细胞在炎症中具有保护功能，为COPD的早期预防和治疗提供了新靶点 | 研究基于小鼠模型，结果在人类COPD患者中的适用性需进一步验证；单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞亚群或低丰度细胞类型 | 探究吸烟诱导的慢性阻塞性肺疾病（COPD）中T细胞的免疫反应机制，以寻找新的治疗靶点 | 小鼠模型中的T细胞，特别是吸烟暴露后肺组织和循环系统中的γδ T细胞 | 单细胞组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, TCR测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1020 | 2026-01-17 |
Pan-cancer profiling links C1orf50 to DNA repair and immune modulation in ovarian cancer
2025-Dec-08, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01916-8
PMID:41361477
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了C1orf50在卵巢癌中与DNA修复和免疫调节的关联 | 首次将C1orf50与卵巢癌的基因组不稳定性、DNA修复缺陷和免疫抑制微环境联系起来，并利用单细胞RNA测序数据深入分析其免疫调节作用 | 研究主要基于公共数据集，缺乏实验验证，且结论需要前瞻性研究和功能实验进一步确认 | 探究C1orf50在多种癌症特别是卵巢癌中的功能及其在免疫基因组背景下的作用 | 多种癌症类型，重点关注卵巢癌，使用TCGA和单细胞RNA测序公共数据集 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |