单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-05-17	EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS 2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002529 PMID:39617402	研究论文	通过整合基因组和转录组分析，探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力	首次将BEND7鉴定为脓毒症中参与免疫调节的血小板特异性基因，并揭示了其通过细胞间粘附分子信号通路与免疫细胞（特别是单核细胞和中性粒细胞）的强相互作用	需要进一步实验验证BEND7在脓毒症免疫调节中的具体作用机制	探索脓毒症发病机制中的遗传因素，寻找新的治疗靶点	脓毒症相关基因，特别是BEND7基因	基因组学与转录组学	脓毒症	基于摘要数据的孟德尔随机化方法、全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据	多个基因表达数据集（包括独立验证数据集）
82	2025-05-17	Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03756-2 PMID:39621240	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞中RNA甲基化模式在肝细胞癌（HCC）中的作用及其与肿瘤微环境（TME）的关系	首次在中性粒细胞中识别出高/低RNA甲基化亚型，并开发了新的中性粒细胞RNA甲基化（NRM）评分系统，用于评估TME异质性和临床特征	研究基于单细胞测序数据，样本量可能有限，且需要进一步实验验证TRPM3的功能	探索中性粒细胞RNA甲基化在HCC中的作用及其临床意义	肝细胞癌（HCC）患者的中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序、LASSO Cox回归分析	NRM评分系统	单细胞测序数据、lncRNA数据	未明确提及具体样本数量
83	2025-05-17	Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression 2025-Jun, Toxicology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.tox.2025.154129 PMID:40174762	研究论文	通过生物信息学方法探索苯并[a]芘(BaP)在肝癌进展中的潜在分子机制	首次通过综合数据库分析和分子对接技术，确定了BaP与肝癌相关的核心靶点及其作用通路	研究主要基于数据库分析，缺乏实验验证	探索环境污染物BaP在肝癌进展中的分子机制	苯并[a]芘(BaP)和肝癌相关分子靶点	生物信息学	肝癌	生物信息学分析、分子对接	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	TCGA数据库中的肝癌样本
84	2025-05-17	Biology and Pathophysiology of Placenta Accreta Spectrum Disorder 2025-Jun-01, Obstetrics and gynecology IF:5.7Q1 DOI:10.1097/AOG.0000000000005903 PMID:40209229	review	本文综述了胎盘植入谱系障碍（PAS）的生物学和病理生理学，探讨了其临床挑战和管理策略	整合了单细胞RNA测序和蛋白质组学分析的新兴技术，为PAS的生物标志物和干预途径提供了新见解	未提及具体研究样本量或实验数据，主要基于现有文献综述	理解PAS的病理生理学以指导临床管理和预防策略	胎盘植入谱系障碍（PAS）及其相关的生物学和病理生理学机制	病理生理学	胎盘植入谱系障碍	单细胞RNA测序，蛋白质组学分析	NA	NA	NA
85	2025-05-17	Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia 2025-Jun, Current opinion in pharmacology IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.coph.2025.102524 PMID:40311558	review	本文综述了急性髓系白血病（AML）中CAR T细胞靶点识别的新方法	介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象，以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点	NA	提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用，为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径	急性髓系白血病（AML）	肿瘤免疫治疗	急性髓系白血病	结构表面组学，AI驱动的单细胞RNA测序，细胞表面捕获技术	NA	RNA测序数据，蛋白质构象数据	NA
86	2025-05-17	Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems 2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS IF:1.9Q2 DOI:10.1002/jms.5143 PMID:40360168	research paper	该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用及其潜力	结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供了一种更全面的方法来研究神经系统中的细胞相互作用	样本制备的优化、分子完整性的保持以及跨组学层数据的整合仍面临挑战	通过空间多组学技术增强对神经系统复杂疾病的理解	神经系统中的细胞类型及其相互作用	digital pathology	Alzheimer's disease, autism spectrum disorder	mass spectrometry imaging, transcriptomics, proteomics, metabolomics	NA	image, molecular data	NA
87	2025-05-17	Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution 2025-Jun, Cardiology research IF:1.4Q3 DOI:10.14740/cr2055 PMID:40370624	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压（PAH）内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物	首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物	研究主要基于体外模型和生物信息学分析，需要进一步的体内实验验证	探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用	肺动脉高压患者的内皮细胞	单细胞转录组学	肺动脉高压	scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting)	NA	单细胞RNA测序数据	NA
88	2025-05-17	Antioxidant interventions reduced cytokine-induced pyroptosis of peripheral MAIT cells in patients with HBV-related cirrhosis 2025-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000714 PMID:40377492	研究论文	本研究探讨了HBV相关肝硬化患者中MAIT细胞减少的特征和潜在机制，并发现抗氧化干预可以减少细胞因子诱导的MAIT细胞焦亡	首次揭示了MAIT细胞在HBV相关肝硬化中的焦亡机制，并证明抗氧化剂可以有效减少这一过程	样本量较小（20名健康对照和40名患者），且仅在体外验证了抗氧化剂的效果	研究HBV相关肝硬化患者中MAIT细胞减少的机制	HBV相关肝硬化患者和健康对照者的外周血MAIT细胞	免疫学	HBV相关肝硬化	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光、ELISA	NA	外周血样本	20名健康对照和40名HBV相关肝硬化患者（20名代偿期和20名失代偿期）
89	2025-05-17	Single-cell analyses unravel ecosystem dynamics and intercellular crosstalk during gallbladder cancer malignant transformation 2025-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000697 PMID:40377484	研究论文	通过单细胞RNA测序分析胆囊癌恶性转化过程中的生态系统动态和细胞间通讯	揭示了胆囊癌恶性转化过程中免疫微环境的变化，并鉴定了TOP2A+ Epi和TOP2A+ Macro等关键细胞亚型及其相关基因	样本量相对较小（2个正常组织、2个HGIN和6个GBC样本），可能影响结果的普遍性	理解胆囊癌从正常组织到高级别上皮内瘤变（HGIN）再到侵袭性胆囊癌（GBC）的细胞和分子变化	胆囊癌（GBC）及其前体病变（HGIN）和正常组织	数字病理	胆囊癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、多重免疫荧光染色	10种机器学习方法	RNA测序数据、免疫荧光图像	98,113个细胞（来自2个正常组织、2个HGIN和6个GBC样本）
90	2025-05-17	Anti-BCL2 therapy eliminates giant congenital melanocytic nevus by senolytic and immune induction 2025-May-16, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02247-2 PMID:40374605	研究论文	本研究探讨了抗BCL2疗法通过衰老细胞清除和免疫诱导治疗巨大先天性黑色素细胞痣(GCMN)的效果	首次发现BCL2蛋白在GCMN的衰老和增殖细胞中均有表达，并证明BCL2抑制剂能有效清除GCMN细胞，同时揭示了中性粒细胞在治疗中的关键免疫协同作用	研究主要基于体外实验和动物模型，需要进一步临床试验验证	开发针对巨大先天性黑色素细胞痣(GCMN)的新型治疗方法	巨大先天性黑色素细胞痣(GCMN)患者细胞、异种移植模型和转基因模型	肿瘤治疗	黑色素细胞痣/黑色素瘤	单细胞测序、免疫染色、异种移植模型	患者来源异种移植(PDX)模型、Nras突变和Braf突变转基因模型	基因表达数据、组织学数据	多种基因突变的GCMN患者样本、动物模型
91	2025-05-17	Harnessing Calmodulin-Related Genes to Build a Prognostic Model in Esophageal Squamous Cell Carcinoma for a Comprehensive Analysis of Single-Cell Immune Characteristics and Drug Efficacy 2025-May-16, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997) DOI:10.1097/CJI.0000000000000561 PMID:40375794	研究论文	该研究利用钙调蛋白相关基因构建了一个食管鳞状细胞癌的预后模型，并分析了单细胞免疫特性和药物疗效	首次基于钙调蛋白相关基因构建了食管鳞状细胞癌的预后模型，并验证了特征基因的表达，同时发现了潜在的治疗药物AZD-8055	研究依赖于TCGA数据集，样本来源可能有限，且需要进一步实验验证模型的临床适用性	构建食管鳞状细胞癌的预后模型并探索其免疫特性和潜在治疗药物	食管鳞状细胞癌患者及其相关基因表达数据	数字病理学	食管鳞状细胞癌	qPCR, 单细胞测序, GSEA富集分析, 免疫浸润分析, 突变分析, 药物敏感性分析, 分子对接, CETSA	LASSO Cox回归模型, 多元Cox回归模型	基因表达数据, 单细胞测序数据	TCGA-ESCC数据集中的肿瘤和正常样本
92	2025-05-17	Deficiency of NPR-C triggers high salt-induced thoracic aortic dissection by impairing mitochondrial homeostasis 2025-May-16, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvaf085 PMID:40377018	研究论文	本研究探讨了NPR-C在胸主动脉夹层（TAD）发病中的作用及其分子机制	揭示了NPR-C通过调节线粒体稳态在TAD中的保护作用，并提出了NPR-C激活和亚精胺（SPD）补充作为新的TAD预防和治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究NPR-C在TAD发病中的作用及潜在治疗策略	人类TAD患者和小鼠模型	心血管疾病研究	胸主动脉夹层	RNA测序、单细胞测序	基因敲除小鼠模型	转录组数据、单细胞测序数据	人类TAD患者样本和BAPN处理的小鼠模型
93	2025-05-17	Integrating multi-omics data to identify the role of Aggrephagy-related genes in tumor microenvironment and key tumorigenesis factors of GB from the perspective of single-cell sequencing 2025-May-16, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02431-4 PMID:40377747	研究论文	本研究通过单细胞测序技术探索了聚集自噬相关基因（ARGs）在胶质母细胞瘤（GB）肿瘤微环境（TME）和肿瘤发生中的作用	首次利用单细胞测序技术分析ARGs在GB中的作用，并通过分子对接分析确定了TUBA1C和UBB作为潜在治疗靶点	NA	探索ARGs在GB肿瘤微环境和肿瘤发生中的作用及其预后和治疗潜力	胶质母细胞瘤（GB）及其肿瘤微环境（TME）	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞测序	非负矩阵分解（NMF）	单细胞测序数据	NA
94	2025-05-17	Deciphering the interaction between the expression of LRP2 served as a mitochondrial metabolism-related gene and prognosis in colon cancer integrating multi-omics analysis 2025-May-16, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02568-2 PMID:40377809	研究论文	本研究通过多组学分析探讨了LRP2基因在结肠癌中的表达及其预后价值	首次将LRP2基因作为线粒体代谢相关基因与结肠癌预后关联，并通过单细胞测序和转录组学数据集进行验证	研究样本量有限，且主要依赖公共数据库数据，需要更多实验验证	识别结肠癌的重要生物标志物和治疗靶点	结肠腺癌(COAD)患者和细胞系	癌症研究	结肠癌	单细胞测序、转录组学分析、免疫组化染色(IHC)、CCK-8和流式细胞术	NA	基因表达数据、临床病理数据	TCGA数据库中的肿瘤样本和正常组织，以及GEO数据库中的数据集，具体样本数量未明确说明
95	2025-05-17	Sialyltransferase gene signature as a predictor of prognosis and therapeutic response in kidney renal clear cell carcinoma 2025-May-16, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02566-4 PMID:40377806	研究论文	本研究基于唾液酸转移酶相关基因（SRGs）构建了一个预测肾透明细胞癌（KIRC）患者预后和治疗反应的预后模型	首次基于SRGs构建KIRC预后模型，揭示了唾液酸化在KIRC中的关键作用，并分析了不同分子亚型对药物的敏感性差异	研究主要依赖公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性临床队列验证	开发预测KIRC患者预后和治疗反应的生物标志物模型	肾透明细胞癌（KIRC）患者	生物信息学	肾癌	RNA-Seq, scRNA-seq, 生物信息学分析	Cox回归风险模型	基因表达数据	TCGA和ICGC数据库中的KIRC样本
96	2025-05-17	The critical role of BMP signaling in gastric epithelial cell differentiation revealed by organoids 2025-May-16, Cell regeneration (London, England) DOI:10.1186/s13619-025-00237-x PMID:40377813	研究论文	本研究揭示了BMP信号在胃上皮细胞分化中的关键作用，并通过胃类器官模型阐明了小鼠和人类胃上皮细胞分化的异同	发现BMP4信号促进胃小凹细胞和壁细胞分化，并鉴定Zbtb7b为小凹细胞分化的新型调控因子	研究主要基于体外类器官模型，可能需要进一步体内验证	阐明胃上皮细胞分化的分子机制及其在小鼠和人类中的异同	小鼠和人类胃类器官	细胞生物学	胃部疾病	单细胞RNA测序、类器官培养	胃类器官模型	基因表达数据	未明确说明样本数量的小鼠和人类胃类器官
97	2025-05-17	Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model 2025-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI181775 PMID:40100323	研究论文	本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，发现CTLA4在CD8+ T细胞中的上调与肺纤维化相关，并证明靶向CTLA4的药物ipilimumab可加速肺上皮再生并减少纤维化	首次发现CTLA4在CD8+ T细胞中的表达与肺纤维化的关系，并验证了ipilimumab通过促进衰老细胞清除来加速纤维化消退的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚需进一步验证	探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化中的作用机制及潜在治疗策略	人类特发性肺纤维化患者样本和重复博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型	免疫学与纤维化研究	肺纤维化	空间转录组学、蛋白质组学	人类化CTLA4敲入小鼠模型	转录组数据、蛋白质表达数据	人类特发性肺纤维化患者样本和实验小鼠模型
98	2025-05-17	Acute kidney injury triggers hypoxemia by lung intravascular neutrophil retention that reduces capillary blood flow 2025-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI186705 PMID:40048367	research paper	该研究探讨了急性肾损伤（AKI）如何通过肺血管内中性粒细胞滞留引发低氧血症	揭示了AKI通过激活经典单核细胞释放CXCL2，导致中性粒细胞在肺毛细血管滞留，进而引起低氧血症的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类数据有限	阐明AKI引发低氧血症的细胞机制	急性肾损伤（AKI）患者和小鼠模型	NA	acute kidney injury	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	小鼠模型和有限的人类数据
99	2025-05-17	AI-Assisted Hypothesis Generation to Address Challenges in Cardiotoxicity Research: Simulation Study Using ChatGPT With GPT-4o 2025-May-15, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/66161 PMID:40373295	研究论文	本研究探讨了ChatGPT与GPT-4o在生成创新性研究假设以解决心脏毒性研究中的五大挑战方面的能力	利用ChatGPT与GPT-4o生成创新性假设，并通过专家评估其新颖性和可行性，展示了AI在心脏毒性研究中的潜在应用	实验设计常被认为过于雄心勃勃，需要更多实际考量	探索AI在心脏毒性研究中生成创新性假设的能力	心脏毒性研究的五大挑战	自然语言处理	心血管疾病	单细胞RNA测序、多组学方法、机器学习	GPT-4o	文本	96个生成的假设，其中13个被评为高度新颖，62个为中等新颖
100	2025-05-17	Single-Cell RNA-Seq Reveals Aging-Related Impairment of Microglial Efferocytosis Contributing to Apoptotic Cells Accumulation After Retinal Injury 2025-May-15, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70097 PMID:40374315	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了衰老如何影响小胶质细胞的胞葬功能，进而导致视网膜损伤后凋亡细胞的积累	首次在单细胞水平揭示了衰老视网膜中小胶质细胞胞葬功能受损的分子机制，并验证了AXL-GAS6和MERTK-GAS6等配体-受体互作的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类视网膜衰老的类似机制仍需进一步验证	阐明衰老对小胶质细胞胞葬功能的影响及其在视网膜疾病中的作用	年轻和老年小鼠的视网膜细胞	数字病理学	老年性疾病	sc-RNA-seq	小鼠视网膜缺血/再灌注损伤模型	单细胞转录组数据	74,412个来自年轻和老年小鼠的视网膜细胞