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当前共找到 41796 篇文献,本页显示第 961 - 980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
961 2026-07-08
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Aug, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1
研究论文 提出一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架,用于直接分解多维不规则张量数据(即 ragged tensor) 首次引入二元加权张量模型描述ragged tensor的有效域,利用CP因子行与有效元素间的关联将全局目标解耦为独立、良态的子问题,并设计基于近邻交替最小化的闭式稳定更新算法,理论收敛有保障 未明确说明,需进一步阅读全文 发展能够处理多维不规则索引模式(ragged tensor)的张量分解方法 多光谱、高光谱图像以及空间转录组数据 机器学习 NA 张量分解 CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 图像、空间转录组数据 多个挑战性数据集(具体数量未详述) NA 空间转录组学 NA NA
962 2026-07-08
Fusobacterium nucleatum-Derived Outer Membrane Vesicles Disrupt Epithelial Barrier in Oral Lichen Planus via JNK/c-JUN Mediated Claudin-4 Downregulation
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 本研究揭示具核梭杆菌外膜囊泡通过JNK/c-JUN通路下调Claudin-4破坏口腔扁平苔藓上皮屏障 首次发现具核梭杆菌外膜囊泡通过激活JNK/c-JUN信号通路下调Claudin-4,揭示微生物驱动口腔扁平苔藓上皮屏障破坏的新机制 未开展体内动物模型验证实验,且主要基于体外细胞系研究,临床相关性需进一步验证 探究具核梭杆菌外膜囊泡在口腔扁平苔藓上皮屏障功能障碍中的作用机制 口腔扁平苔藓患者组织样本及HaCaT角质形成细胞 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, RNA测序, qPCR, Western blot NA 基因表达数据, 组织图像 口腔扁平苔藓病变组织样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
963 2026-07-08
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成,揭示其细胞异质性和独特亚群 首次在单细胞水平上比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组谱,发现了此前未表征的前体样亚群(簇9)共表达周细胞标志物和间充质基质细胞标志物,并识别出IGFBP3和IGFBP5在根尖乳头干细胞来源簇中特异性富集 基于培养细胞的转录相似性提出伪时间轨迹假设,而非验证性的谱系关系;需要后续使用NOTCH3+/PDGFRB+的前瞻性分离及体外体内功能验证来确认再生潜力 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成,检测其不同再生行为背后的亚群,并识别有助于未来分离和功能靶向的标志物 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞,培养至第2代 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达谱 3名人类供体的根尖乳头和牙髓组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA 使用Seurat包进行降维和聚类,统一流形逼近与投影可视化
964 2026-07-08
UPR-CEBPB-MIF Signaling Links to Macrophage Polarization and an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Aug, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 该论文整合多组学数据,揭示了UPR-CEBPB-MIF信号轴与透明细胞肾细胞癌中巨噬细胞极化及免疫抑制性肿瘤微环境的关联 利用自编码器结合XGBoost鉴别UPR关键基因,并通过单细胞转录组分析映射UPR活性及免疫极化模式,首次阐明UPR-CEBPB-MIF信号轴在ccRCC免疫微环境中的作用 研究主要依赖公共数据库数据,需进一步实验验证信号轴的功能及临床转化潜力 解析UPR信号通路在ccRCC代谢重编程及免疫调控中的机制,并构建预后模型 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤样本及细胞通信模式 机器学习 肾癌 多组学分析、单细胞转录组分析 自编码器、XGBoost、LASSO-Cox回归 基因表达数据、转录组数据 来自TCGA、GEO和ArrayExpress的多个队列样本 NA NA NA NA
965 2026-07-08
Multi-Omics Integration Reveals the Genetic Mechanisms of Periodontitis and Predicts Therapeutic Drugs
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 该研究通过多组学整合分析揭示了牙周炎的遗传机制,并预测了潜在的治疗药物 首次整合GWAS、单细胞空间转录组学和单细胞RNA测序数据,利用人工智能驱动的药物筛选框架(DrugReflector)预测牙周炎的治疗化合物,并发现GNLY基因作为关键调控靶点 主要依赖公开数据集,药物预测结果需进一步的实验验证,且脑和肾脏组织的遗传富集机制仍需深入探索 系统解析牙周炎的遗传基础和关键调控因子,并预测潜在的治疗药物 牙周炎相关的遗传信号、免疫细胞亚群(单核细胞和自然杀伤细胞)及基因(如GNLY) 数字病理学 牙周炎 GWAS, 单细胞空间转录组学, 单细胞RNA-seq, Mendelian Randomization, 分子对接 NA 基因组数据, 单细胞转录组数据 基于Gene-Lifestyle Interactions in Dental Endpoints和FinnGen R11队列的GWAS摘要统计,以及单细胞空间转录组学和单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞RNA测序和空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序平台
966 2026-07-08
Mitochondrial Metabolic Biomarkers in Periodontitis: Discovery and Clinical Validation
2026-Aug, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 通过综合生物信息学技术鉴定牙周炎中线粒体代谢相关生物标志物,并验证其诊断价值 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据及机器学习方法,鉴定并临床验证了与牙周炎相关的线粒体代谢生物标志物,并构建了高诊断效能的列线图 未明确提及,可能缺乏大规模前瞻性队列验证 识别牙周炎中线粒体代谢相关的关键生物标志物并评估其诊断潜力 牙周炎患者及大鼠模型 机器学习 牙周炎 RNA测序,单细胞RNA测序,反转录定量聚合酶链反应,免疫组织化学,Western blot分析 机器学习模型,列线图 转录组数据,单细胞RNA测序数据 临床样本(未明确数目)及大鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
967 2026-07-08
Multi-Omics Framework Integrating Genetics, Microbiome, Metabolism, and Immunity for Deciphering Ulcerative Colitis Pathogenesis and Diagnostic Biomarker Discovery
2026-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过多组学框架整合遗传、微生物组、代谢和免疫因素,揭示溃疡性结肠炎发病机制并发现诊断生物标志物 首次将孟德尔随机化与单细胞及空间转录组学相结合,系统评估多组学因素与溃疡性结肠炎的因果关联,并发现Neutrophil_IFITM2细胞亚群及其潜在调控轴 孟德尔随机化分析基于GWAS汇总数据,可能存在未测量的混杂因素,且IFITM2敲低实验仅在体外巨噬细胞系中进行,缺乏体内验证 系统评估与溃疡性结肠炎易感性相关的多组学因素并识别可靠的诊断生物标志物 溃疡性结肠炎患者及健康对照的遗传数据、肠道微生物组、循环代谢物、免疫细胞表型及临床组织样本 机器学习, 数字病理学 溃疡性结肠炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, qRT-PCR, siRNA敲低 随机森林 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多个转录组数据集、独立临床组织样本及THP-1来源的巨噬细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
968 2026-07-08
Nav1.5 in the dorsal root ganglion plays a crucial role in mechanical hypersensitivity
2026-Jul-07, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示Nav1.5在背根神经节中主要负责机械敏感性,并影响神经病理性疼痛和内脏痛模型中的机械超敏反应 首次发现传统认为的心脏钠通道Nav1.5在躯体感觉系统中作为机械敏感性的关键决定因子,并证实其在TrkB阳性A纤维神经元中的特异性表达和功能 NA 探究Nav1.5在初级感觉神经元中对机械敏感性和疼痛调控的作用 背根神经节中的TrkB阳性A纤维神经元 神经科学 疼痛相关疾病 单细胞RNA测序, 免疫染色, 条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序分析背根神经节细胞
969 2026-07-08
Dissecting cellular heterogeneity across two ocular melanoma subtypes by single-cell RNA sequencing
2026-Jul-07, Melanoma research IF:1.5Q4
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示两种眼部黑色素瘤亚型的细胞异质性 首次在单细胞水平上对葡萄膜黑色素瘤和结膜黑色素瘤两种眼部黑色素瘤亚型进行全面比较,揭示其肿瘤细胞和免疫微环境的差异 NA 探究两种眼部黑色素瘤亚型在单细胞水平的肿瘤细胞和微环境异质性 28个眼部黑色素瘤样本,包括14个葡萄膜黑色素瘤和14个结膜黑色素瘤样本 NA 眼部黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 28个眼部黑色素瘤样本(14个葡萄膜黑色素瘤,14个结膜黑色素瘤) NA 单细胞RNA测序 NA NA
970 2026-07-08
Multi-layer network biology combined with single-cell evidence reveals core regulatory nodes in atherosclerotic plaques and potential drug-targeting directions
2026-Jul-07, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究整合多层网络生物学与单细胞证据,揭示动脉粥样硬化斑块中的核心调控节点及潜在药物靶向方向 首次将多层网络分析与单细胞RNA测序证据相结合,识别出七个核心枢纽基因(SMAD4、CASP8、PARP1、CRKL、CDK6、VDAC1、KHDRBS1),并发现槲皮素通过多靶点调控这些基因发挥内皮保护作用 研究基于公共数据集,未进行大规模临床样本验证,且体外实验仅使用oxLDL诱导模型,未在动物模型中验证 解析动脉粥样硬化斑块形成中的核心调控网络并识别潜在治疗靶点 动脉粥样硬化患者的斑块组织、单细胞转录组数据及oxLDL诱导的细胞模型 机器学习(如WGCNA、PPI网络分析)与计算机生物学的交叉应用 动脉粥样硬化 NGS(公共数据集:GSE43292、GSE159677) NA 基因表达数据(bulk RNA-seq)、单细胞转录组数据(scRNA-seq) 32名患者的配对斑块组织(包括晚期斑块和早期病变组织) 10x Genomics 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 10x Chromium 10x Chromium单细胞平台用于scRNA-seq数据(GSE159677)的分析
971 2026-07-08
Angiocrine factors in tumor microenvironment: bidirectional crosstalk, mechanistic insights, and therapeutic strategies
2026-Jul-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 综述肿瘤微环境中血管分泌因子的双向串扰、机制见解和治疗策略 系统总结了血管分泌因子在肿瘤进展中的关键功能域,包括Notch和Wnt信号通路及其串扰网络,并强调“一靶多效”治疗策略的潜力 血管分泌因子网络的复杂性和冗余性限制了抗血管治疗的效果,且“一靶多效”策略面临挑战 深入理解血管分泌因子的功能特征和调控机制,为癌症治疗寻找有效靶点 肿瘤微环境中的血管分泌因子及其与肿瘤细胞、内皮细胞的相互作用 NA 肿瘤 NA NA NA NA NA NA NA NA
972 2026-07-08
Integration of bulk RNA-seq and scRNA-seq reveals cell subsets and gene signatures associated with Glaesserella parasuis infection
2026-Jul-07, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示了与副猪嗜血杆菌感染相关的细胞亚群和基因特征 首次在单细胞分辨率下对副猪嗜血杆菌感染中的巨噬细胞异质性进行多组学解析,识别了与疾病严重程度相关的保护性和致病性细胞程序 未明确提及局限性,但研究基于猪肺泡巨噬细胞模型,可能无法完全反映体内复杂免疫环境 理解副猪嗜血杆菌感染中不同临床结果(从无症状携带到致死性疾病)的分子机制 猪肺泡巨噬细胞 机器学习和生物信息学 副猪嗜血杆菌感染 批量RNA-seq和单细胞RNA-seq NA RNA测序数据(bulk和单细胞) 超过98,000个猪肺泡巨噬细胞,来自对照、轻度和严重感染组 NA 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq NA NA
973 2026-07-08
Single-cell and spatial omics in plants: from cellular atlases to regulatory mechanisms
2026-Jul-07, Journal of experimental botany IF:5.6Q1
综述 综述单细胞与空间组学技术在植物研究中的应用,从细胞图谱构建到调控机制解析的进展与挑战 系统总结了植物单细胞研究的技术现状,并提出了未来在木本多年生植物和能源作物中的应用方向 未提及具体实验验证的局限性,主要基于文献综述,可能缺乏对某些新兴技术的深入讨论 概述植物中单细胞与空间组学技术的现状,讨论实验与分析挑战,并展望未来应用 植物(包括草本植物、木本多年生植物和能源作物) 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间组学,染色质可及性分析,蛋白质组学,代谢组学 网络分析与基因调控网络重建框架 单细胞转录组数据,空间组学数据,多组学整合数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序微流控与文库制备平台
974 2026-07-08
Pleural Fluid Cytology Detects Small Cell Carcinoma Transformation in EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma: A Case Report
2026-Jul-07, Diagnostic cytopathology IF:1.0Q4
病例报告 通过胸腔积液细胞学检测发现EGFR突变肺腺癌向小细胞癌转化 首次通过胸腔积液细胞学结合分子分析,以微创方式监测EGFR突变肺腺癌对EGFR-TKIs获得性耐药后的小细胞转化 仅为一例病例,需要更多研究验证 展示胸腔积液细胞学在检测EGFR突变肺腺癌小细胞转化中的应用价值 一名65岁EGFR突变肺腺癌女性患者 数字病理学 肺癌 细胞学, 免疫组织化学, 分子检测, 单细胞测序 NA 图像, 文本 1例患者 NA NA NA NA
975 2026-07-08
Single-cell Transcriptomic Atlas of Ovarian Endometriosis Patient's Follicular Fluid: Unraveling Novel Insights into Abnormal Follicular Development
2026-Jul-07, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序对卵巢子宫内膜异位症患者的卵泡液进行转录组图谱分析,揭示异常卵泡发育的新见解 首次提供卵巢子宫内膜异位症卵泡液的单细胞转录组图谱,发现一种新型TCR+巨噬细胞亚型,并阐明了颗粒细胞发育异常、免疫失调及独特的细胞间相互作用 仅基于单个患者的数据,样本量有限(患侧2793个细胞,对照侧4699个细胞),需要更大规模研究验证 揭示卵巢子宫内膜异位症对卵泡发育的影响,寻找潜在诊断和治疗靶点 卵巢子宫内膜异位症患者的卵泡液中的细胞 单细胞组学 卵巢子宫内膜异位症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1位患者,患侧2793个细胞,对照侧4699个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
976 2026-07-08
Integrated multi-omics analysis reveals key molecular mechanisms underlying fibroproliferation and immune dysregulation in keloids
2026-Jul-07, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 通过整合多组学分析揭示瘢痕疙瘩中纤维增生和免疫失调的关键分子机制 首次整合单细胞RNA测序、hdWGCNA、孟德尔随机化、ATAC-seq和SCENIC分析等多种方法,系统鉴定瘢痕疙瘩相关的关键候选基因(CLEC2B、MGST3、SFRP2)和转录因子(CREB3L1、ZEB1) 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏独立验证队列;孟德尔随机化分析基于日本生物样本库,可能限制结果的普适性 阐明瘢痕疙瘩发病过程中细胞异质性和分子机制 八名瘢痕疙瘩患者的瘢痕组织 数字病理学 皮肤疾病 单细胞RNA测序、ATAC测序 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 8名患者,共73,790个细胞 NA 单细胞RNA-seq、ATAC-seq NA NA
977 2026-07-08
Single-cell and Spatial Transcriptomic Profiling Reveal that LAPTM5-mediated Ferroptosis in Macrophages Induces Fibroblast Dysfunction and Amplifies Periodontal Inflammation
2026-Jul-07, Inflammation IF:4.5Q2
research paper 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示LAPTM5介导的巨噬细胞铁死亡导致成纤维细胞功能障碍并放大牙周炎症 首次系统鉴定铁死亡是牙周炎中主要的程序性细胞死亡通路,并发现LAPTM5驱动的巨噬细胞铁死亡通过半乳糖凝集素和OSM信号通路与成纤维细胞相互作用,导致成纤维细胞功能障碍和慢性炎症 主要基于公开数据集分析,缺乏大规模临床样本验证;功能实验仅限于体外模型,未在体内模型中验证 探究牙周炎中关键的程序性细胞死亡通路及其驱动因子,为恢复牙周免疫平衡提供新的治疗靶点 牙周炎组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 machine learning geriatric disease single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics NA gene expression data 多个公开发表的单细胞RNA测序数据集 NA single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics NA NA
978 2026-07-08
Protocadherin-1 deficiency increases baseline and allergen-induced airway hyperresponsiveness in mice
2026-Jul-07, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 研究发现原钙粘蛋白-1基因敲除小鼠在基线及过敏原刺激下气道高反应性增加,并伴有气道上皮屏障完整性下降和肺顺应性降低 首次构建Pcdh1基因敲除小鼠模型,并揭示其在上皮细胞分化、屏障完整性和气道重塑中的新功能 未完全阐明PCDH1缺失导致气道高反应性的分子机制,且仅在小鼠模型中验证 探究原钙粘蛋白-1在气道高反应性、炎症和重塑中的作用 Pcdh1基因敲除小鼠及野生型对照小鼠 数字病理学 哮喘 基因敲除, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 Pcdh1基因敲除小鼠及野生型同窝对照小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
979 2026-07-08
Single-cell RNA Sequencing Reveals A Tumor-Promoting Role of EGR1+CD4+ T Cells in Papillary Thyroid Cancer
2026-Jul-07, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 基于单细胞RNA测序,揭示了乳头状甲状腺癌中EGR1+CD4+ T细胞促肿瘤作用的新发现 首次识别出EGR1+CD4+ T细胞作为此前未报道的CD4+ T细胞亚群,并发现其通过CD96/TIGIT阻断剂具有增强抗肿瘤免疫的潜力 研究仅在体外细胞系中进行,未涉及体内模型或临床样本验证,且EGR1+CD4+ T细胞的全面功能机制有待进一步探索 探究乳头状甲状腺癌中新型CD4+ T细胞亚群的功能及其在免疫治疗中的潜在靶点 乳头状甲状腺癌组织和细胞系中的T细胞亚群 自然语言处理 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提供样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'基因表达分析平台
980 2026-07-08
The evolutionary transition from alga to parasite in the sister lineage of apicomplexans
2026-Jul-06, Current biology : CB IF:8.1Q1
research paper 描述了在顶复门姐妹谱系中从藻类到寄生虫的进化转变,特别是新发现的寄生性chrompodellid物种Holdonia amygdala 首次发现一种新的外寄生chrompodellid物种Holdonia amygdala,其具有不同于已知寄生方式的生态策略,并通过单细胞转录组学和系统基因组学分析揭示了其独立失去光合作用的进化路径 仅基于四个单细胞进行转录组分析,样本量较小,可能限制了进化推断的全面性 研究从自由生活藻类到专性寄生虫的进化转变过程 新发现的chrompodellid物种Holdonia amygdala及其与其他chrompodellids的进化关系 machine learning NA 单细胞转录组学, 系统基因组学 NA 基因表达数据 四个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA 用于单细胞转录组分析的平台未在标题和摘要中明确说明
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