单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9741 - 9760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9741 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in diabetic kidney disease: a literature review
2024-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2024.2387428
PMID:39099183
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在糖尿病肾病研究中的应用 | 探讨了scRNA-seq技术在揭示糖尿病肾病发病机制和分子机制方面的作用 | NA | 阐明糖尿病肾病的发病机制并识别新的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的多种细胞类型和非肾脏因素 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9742 | 2024-08-09 |
New insights gained from cellular landscape changes in myocarditis and inflammatory cardiomyopathy
2024-Sep, Heart failure reviews
IF:4.5Q1
DOI:10.1007/s10741-024-10406-w
PMID:38896377
|
研究论文 | 本文综述了心肌炎和炎症性心肌病（ICM）的最新研究，特别是通过单细胞RNA测序揭示的细胞景观变化 | 利用多组学技术，特别是单细胞RNA测序，深入理解心肌炎/ICM过程中的细胞景观变化 | NA | 提供心肌炎/ICM最新研究的全面概述 | 心肌炎和炎症性心肌病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9743 | 2024-08-09 |
Identification of the CD8 + T-cell Related Signature for Predicting the Prognosis of Gastric Cancer Based on Integrated Analysis of Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000528
PMID:38809517
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征 | 首次探索了CD8+ T细胞在胃癌中的作用，并构建了一个新的风险模型 | NA | 旨在识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征，并指导免疫治疗决策 | 胃癌患者的CD8+ T细胞相关基因特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 896个CD8+ T细胞差异基因 |
| 9744 | 2024-08-09 |
Cancer-associated fibroblasts: a versatile mediator in tumor progression, metastasis, and targeted therapy
2024-Sep, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-024-10186-7
PMID:38602594
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research paper | 本文探讨了肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤进展、转移和靶向治疗中的作用 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了CAFs的多种表型，包括已知的肌成纤维细胞CAFs（myCAFs）和炎症性CAFs（iCAFs）以及新发现的亚型如抗原呈递CAFs（apCAFs） | NA | 研究CAFs在肿瘤发生、癌症干细胞性、血管生成、免疫抑制、代谢和转移中的多重功能，并探讨针对肿瘤微环境的靶向治疗 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9745 | 2024-08-09 |
SIRV: spatial inference of RNA velocity at the single-cell resolution
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae100
PMID:39108639
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research paper | 本文介绍了一种名为SIRV的方法，通过结合空间转录组学数据和参考单细胞RNA测序数据中的剪接和未剪接mRNA表达，实现单细胞分辨率下的空间RNA速度推断 | SIRV方法能够揭示仅通过单细胞RNA测序数据无法识别的空间分化模式，并成功应用于小鼠器官发生数据和鸡心脏发育数据 | 空间RNA速度的估计受限于无法在高分辨率空间转录组学中空间捕获剪接和未剪接的mRNA分子 | 研究组织中细胞分化动力学的空间背景 | 小鼠大脑发育中的中脑-后脑边界细胞和皮质边缘及间脑细胞的分化轨迹 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据 | 小鼠大脑、鸡心脏和人类骨肉瘤细胞的数据 |
| 9746 | 2024-08-09 |
Cisplatin resistance-related transcriptome and methylome integration identifies PCDHB4 as a novel prognostic biomarker in small cell lung cancer
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110413
PMID:39108724
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研究论文 | 本研究通过整合小细胞肺癌的转录组和甲基化组数据，发现PCDHB4作为新的预后生物标志物与顺铂化疗耐药相关 | 首次发现PCDHB4在顺铂耐药的小细胞肺癌中的表达与患者生存率相关，并通过单细胞RNA测序进一步验证了其在肿瘤干细胞特性和上皮-间质转化中的作用 | NA | 探索小细胞肺癌中与顺铂化疗耐药相关的新的预后生物标志物 | 小细胞肺癌患者及顺铂化疗耐药机制 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | RNA测序, 甲基化测序 | Cox回归模型 | 转录组数据, 甲基化数据 | NA |
| 9747 | 2024-08-09 |
Sensitive Multiplexed MicroRNA Spatial Profiling and Data Classification Framework Applied to Murine Breast Tumors
2024-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01773
PMID:39044395
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研究论文 | 本文介绍了一种高灵敏度的方法，用于同时定量和空间检测固定在石蜡中的组织切片上的七种微小RNA（miRNA），并展示了该方法在鼠乳腺癌中的应用。 | 本文采用滚动循环扩增（RCA）与双扫描方法结合，在纳升孔阵列中嵌入水凝胶柱，实现了对miRNA的高灵敏度空间检测，具有广泛的动态范围和低检测限。 | NA | 开发一种高灵敏度的方法，用于空间检测和定量miRNA，以提高从样本中获取的信息量。 | 微小RNA（miRNA）在鼠乳腺癌中的空间表达。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 滚动循环扩增（RCA） | NA | 图像 | 固定在石蜡中的组织切片 |
| 9748 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in tuberculosis: Application and future perspectives
2024-Aug-06, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003095
PMID:39111829
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在结核病（TB）研究中的应用及其未来展望 | 强调了scRNA-seq在结核病临床生物标志物探索、宿主导向治疗和精准治疗研究中的潜力 | 讨论了scRNA-seq在结核病相关研究广泛应用中需要克服的瓶颈 | 探讨scRNA-seq在结核病研究中的应用及其未来发展方向 | 结核病及其免疫反应机制 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 大量单个细胞 |
| 9749 | 2024-08-09 |
scPriorGraph: constructing biosemantic cell-cell graphs with prior gene set selection for cell type identification from scRNA-seq data
2024-Aug-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03357-w
PMID:39103856
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPriorGraph的双通道图神经网络，用于整合多层次基因生物语义，以提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | scPriorGraph通过构建生物语义细胞-细胞图并结合先验基因集选择，有效利用了基因间的生物学意义关系，从而提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 9750 | 2024-08-09 |
Machine learning-based biomarker screening for acute myeloid leukemia prognosis and therapy from diverse cell-death patterns
2024-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68755-3
PMID:39090256
|
研究论文 | 本文利用13种程序性细胞死亡途径和73种机器学习组合，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）临床结果和药物反应的6基因指数（PPCDI） | 开发了一种新的6基因指数（PPCDI），该指数通过综合分析多种程序性细胞死亡途径，显示出预测AML患者临床预后和药物敏感性表型的潜力 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测急性髓系白血病的临床预后和药物反应 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 白血病 | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-AML、Tyner和GSE37642-GPL96队列的bulk RNA测序和单细胞RNA测序转录组数据以及匹配的临床病理信息 |
| 9751 | 2024-08-09 |
Metastasis-associated fibroblasts in peritoneal surface malignancies
2024-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02717-4
PMID:38783165
|
研究论文 | 本文探讨了腹膜表面恶性肿瘤（PSMs）中与转移相关的成纤维细胞（MAFs）的作用及其异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫调节性癌相关成纤维细胞（iCAFs）在PSMs中的普遍性，并探讨了其他主要亚型如肌成纤维细胞样CAFs（myCAFs）和基质CAFs（mCAFs）的分布 | NA | 旨在理解腹膜MAFs与肿瘤细胞间的复杂相互作用，以开发针对性和局部治疗策略，改善PSMs患者的治疗效果 | 腹膜表面恶性肿瘤中的转移相关成纤维细胞及其亚型 | NA | 腹膜表面恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9752 | 2024-08-09 |
Dynamic intrauterine crosstalk promotes porcine embryo implantation during early pregnancy
2024-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2557-x
PMID:38748354
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研究论文 | 本文全面分析了猪胚胎植入期胚胎和相应母体子宫内膜的单细胞转录组，识别了胚胎中的四种不同谱系和子宫内膜中的13种细胞类型，并开发了一种新工具ExtraCellTalk来生成母胎交叉对话的动态图谱。 | 本文开发了新工具ExtraCellTalk，并识别了跨物种保守的RBP4/STRA6通路，为胚胎植入过程中的母胎交叉对话提供了新的见解。 | NA | 研究胚胎植入过程中胚胎与母体的动态交叉对话。 | 猪胚胎植入期胚胎和母体子宫内膜的细胞类型及其基因表达。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 猪胚胎植入期胚胎和相应母体子宫内膜的细胞样本 |
| 9753 | 2024-08-09 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
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研究论文 | 本研究旨在探讨脓毒症诱导的心肌病的发病机制，通过分析不同时间点的转录组数据和单细胞测序数据，鉴定了与时间序列相关的差异表达基因，并验证了SPOCK2在脓毒症心肌病中的保护作用 | 通过加权基因共表达网络分析、时间序列分析和差异表达分析，结合单细胞测序数据，鉴定了特定于内皮细胞的差异表达基因 | NA | 探讨脓毒症诱导的心肌病的发病机制 | 内皮细胞在脓毒症诱导的心肌病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用GSE171546数据分析了不同时间点的转录组数据，GSE207363数据用于单细胞测序分析 |
| 9754 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic insights into chemotherapy-induced remodeling of the osteosarcoma tumor microenvironment
2024-Jul-20, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05787-2
PMID:39033089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了化疗前后骨肉瘤患者的肿瘤样本，揭示了化疗对肿瘤微环境的复杂影响 | 研究发现化疗导致骨肉瘤细胞表达更多与干细胞相关的基因，并增强了癌症相关成纤维细胞的能力，同时增加了内皮细胞的数量但降低了其分化能力 | NA | 深入了解化疗如何重塑骨肉瘤的局部环境，以推进骨肉瘤治疗方案的发展 | 骨肉瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化疗前后收集的骨肉瘤患者肿瘤样本 |
| 9755 | 2024-08-09 |
Therapeutic potential of the secreted Kazal-type serine protease inhibitor SPINK4 in colitis
2024-Jul-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50048-y
PMID:38997284
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了炎症性肠病早期黏膜损伤与杯状细胞（GC）耗竭的关系，发现Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂SPINK4在结肠炎肠道中的动态调节与疾病活动平行，并探讨了其在结肠炎治疗中的潜在治疗作用。 | 发现SPINK4在结肠炎中的动态调节，并证实其与现有TNF-α抑制剂infliximab在治疗结肠炎中的协同作用，以及通过Kazal样基序调节EGFR-Wnt/β-catenin和Hippo通路促进GC分化。 | NA | 探讨SPINK4在炎症性肠病中的作用及其作为治疗和诊断标志物的潜力。 | SPINK4在结肠炎中的调节及其治疗潜力。 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞测序 | NA | NA | Spink4条件性敲除小鼠及健康对照 |
| 9756 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-Mar-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01805-23
PMID:38323810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了白斑综合症病毒（WSSV）感染的南美白对虾血细胞的转录组图谱，并与健康血细胞的数据进行对比，揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的异质性响应和功能分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了南美白对虾血细胞在WSSV感染后的异质性响应和功能分化过程 | NA | 探究南美白对虾血细胞在白斑综合症病毒感染后的免疫响应和功能分化 | 南美白对虾的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和WSSV感染的血细胞共16个转录不同的细胞簇 |
| 9757 | 2024-08-09 |
TREX1 is required for microglial cholesterol homeostasis and oligodendrocyte terminal differentiation in human neural assembloids
2024-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02348-w
PMID:38129659
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研究论文 | 研究探讨了TREX1基因在人神经集合体中对小胶质细胞胆固醇稳态和少突胶质细胞终末分化的作用 | 首次揭示了TREX1在人小胶质细胞中的功能，包括影响胆固醇代谢和少突胶质细胞的分化 | NA | 探究TREX1基因在人小胶质细胞生物学中的作用及其对神经发育和疾病的影响 | 人胚胎干细胞衍生的工程化小胶质细胞样细胞、集合体中的小胶质细胞和少突胶质细胞 | NA | Aicardi-Goutières综合征 | 单细胞转录组学、光学和透射电子显微镜 | NA | 转录组数据 | 三个月大的集合体 |
| 9758 | 2024-08-09 |
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241272149
PMID:39079948
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物代谢产物尸胺是否通过组胺H4受体（H4R）和瞬时受体电位香草酸亚型1（TRPV1）介导小鼠的瘙痒反应 | 首次发现尸胺可能作为H4R的内源性配体，并通过H4R/TRPV1信号通路在初级感觉神经元中诱导瘙痒 | NA | 研究尸胺在生理和病理条件下是否调节疼痛或瘙痒 | 尸胺对小鼠瘙痒反应的影响及其分子机制 | NA | NA | 分子对接模拟、scRNA-Seq数据分析、钙成像分析、膜片钳记录 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、电生理数据 | 小鼠模型 |
| 9759 | 2024-08-09 |
Identification of CGNL1 as a diagnostic marker in fibroblasts of diabetic foot ulcers: Insights from single cell RNA sequencing and bulk sequencing data
2024 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320241265945
PMID:39102374
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研究论文 | 本研究旨在探索糖尿病足溃疡（DFUs）中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 通过单细胞RNA测序和批量测序数据，本研究首次确定了CGNL1作为成纤维细胞中的一个独特诊断标志物，并揭示了其在促炎性成纤维细胞中的正相关性 | NA | 探索糖尿病足溃疡中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 糖尿病足溃疡中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 83529个单细胞转录组来自足部样本 |
| 9760 | 2024-08-09 |
Deciphering the immune-metabolic nexus in sepsis: a single-cell sequencing analysis of neutrophil heterogeneity and risk stratification
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398719
PMID:39108261
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了脓毒症中的免疫细胞景观及其与代谢途径的关联，揭示了中性粒细胞在脓毒症代谢紊乱中的作用及其异质性 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，本研究首次揭示了脓毒症中中性粒细胞的复杂交互作用和其在代谢紊乱中的关键角色，并开发了一种新的风险评分模型用于预测脓毒症预后 | NA | 旨在深入理解脓毒症中的免疫代谢相互作用，并开发新的预后和治疗策略 | 脓毒症中的免疫细胞和代谢途径 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |