单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 9801 - 9820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9801 | 2024-08-10 |
Classic genetic and hormonal switches during fetal sex development and beyond
2023-Sep, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2023-2036
PMID:38840820
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研究论文 | 本文探讨了人类胎儿性别发育过程中的关键遗传和激素开关，以及这些开关如何决定性腺性别确定和后续的生殖和体细胞性别表型的分化 | 文章指出传统的性别发育模型是不充分的，并介绍了在特定突变情况下，这些开关可能表现出不同的功能，导致基因功能和剂量的连续变化，酶活性，性激素水平和敏感性的变化，从而产生广泛的生物性别发育差异（DSD）和潜在的生殖和体细胞性别表型的多样性 | NA | 探讨人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关的作用 | 人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 9802 | 2024-08-10 |
Hypoxic niches attract and sequester tumor-associated macrophages and cytotoxic T cells and reprogram them for immunosuppression
2023-08-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.06.017
PMID:37451265
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤相关骨髓细胞（TAMs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在低氧微环境中的分布及功能重编程 | 首次揭示了低氧微环境吸引并隔离TAMs和CTLs，并使其向免疫抑制状态重编程的机制 | NA | 探讨胶质母细胞瘤中免疫抑制的机制 | 肿瘤相关骨髓细胞（TAMs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9803 | 2024-08-10 |
Reference-free and cost-effective automated cell type annotation with GPT-4 in single-cell RNA-seq analysis
2023-May-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2824971/v1
PMID:37205379
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研究论文 | 本文展示了GPT-4这一强大的大型语言模型在单细胞RNA测序分析中自动准确地进行细胞类型注释的能力 | GPT-4无需高质量参考数据集和额外开发流程，能利用标准单细胞RNA测序分析流程生成的标记基因信息自动注释细胞类型 | NA | 探索在单细胞RNA测序分析中自动进行细胞类型注释的新方法 | 单细胞RNA测序分析中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 文本 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 9804 | 2024-08-10 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种常用方法在11个真实数据集上的表现进行了评估 | 本文首次全面评估了从批量RNA测序实践中改编的方法以及专门为单细胞RNA测序设计的方法，并提供了选择适当工具的指导 | 难以通过单一性能标准确定全局最佳表现的方法 | 为单细胞RNA测序中的差异表达分析选择合适的工具提供指导 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 9805 | 2024-08-10 |
Transfer learning between preclinical models and human tumors identifies a conserved NK cell activation signature in anti-CTLA-4 responsive tumors
2021-08-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00944-5
PMID:34376232
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研究论文 | 本文通过计算转移学习方法projectR，在鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤中识别出保守的NK细胞激活特征，并探讨了其在转移性黑色素瘤中的临床相关性 | 本文首次应用转移学习方法在临床前模型和人类肿瘤之间识别出保守的NK细胞激活特征，为癌症治疗提供了新的理解 | 目前的方法在临床前模型中识别的治疗机制未能完全转化为人类疾病，限制了转化研究的进展 | 通过转移学习方法识别肿瘤微环境中免疫细胞的保守转录变化，以提高免疫检查点抑制剂的疗效 | 研究对象包括鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤，以及转移性黑色素瘤中的NK细胞激活特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 转移学习 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及鼠和人的肿瘤样本，具体数量未在摘要中提及 |
| 9806 | 2024-08-10 |
Transcriptional profiling of mouse peripheral nerves to the single-cell level to build a sciatic nerve ATlas (SNAT)
2021-04-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58591
PMID:33890853
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研究论文 | 本文通过单细胞水平的转录组分析，构建了小鼠坐骨神经的转录组图谱（SNAT） | 首次结合了发育中的坐骨神经的批量RNA测序和Schwann细胞的批量及单细胞RNA测序，以及全坐骨神经的单细胞转录组分析 | NA | 促进对外周神经基本理解的研究 | 小鼠坐骨神经中的各种细胞类型 | NA | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括发育中的坐骨神经和成年坐骨神经的多个样本 |
| 9807 | 2024-08-10 |
A single-cell genomics pipeline for environmental microbial eukaryotes
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102290
PMID:33870123
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研究论文 | 本文描述了一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 该流程整合了先进的单细胞基因组学工具和优化协议，旨在提高低成本下基因组质量 | NA | 开发和评估一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 环境中低丰度未培养的真核微生物 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 环境样本和早期分化线菌及Chromista/SAR培养物 |
| 9808 | 2024-08-10 |
Applications of brain organoids in neurodevelopment and neurological diseases
2021-Apr-22, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-021-00728-4
PMID:33888112
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综述 | 本文综述了脑类器官在神经发育和神经系统疾病中的应用现状 | 介绍了脑类器官与免疫染色和单细胞测序技术的结合，以及其在模拟早期脑发育和建模人类脑部疾病中的应用 | 讨论了该技术的挑战和未来展望 | 介绍脑类器官分化策略的现状，总结其在医学领域的进展和应用 | 脑类器官及其在神经发育和神经系统疾病中的应用 | NA | 神经系统疾病 | 免疫染色技术，单细胞测序技术 | NA | 组织 | NA |
| 9809 | 2024-08-10 |
The long noncoding RNA lnc-HLX-2-7 is oncogenic in Group 3 medulloblastomas
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa235
PMID:33844835
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研究论文 | 本文报道了一种新的长链非编码RNA lnc-HLX-2-7，作为第三组髓母细胞瘤的潜在分子标记和治疗靶点 | 首次发现lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中高度上调，并证实其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究lnc-HLX-2-7在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中的表达和功能 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | RNA测序（RNA-seq） | CRISPR/Cas9 | RNA | 175名髓母细胞瘤患者 |
| 9810 | 2024-08-10 |
Colorectal Cancer Stem Cell States Uncovered by Simultaneous Single-Cell Analysis of Transcriptome and Telomeres
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004320
PMID:33898197
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研究论文 | 本文通过同时分析单细胞转录组和端粒长度，揭示了结直肠癌干细胞的状态 | 首次实现同时测量单细胞中的端粒长度和转录组，系统评估了结直肠癌干细胞 | NA | 揭示结直肠癌干细胞的特征及其与肿瘤进展和药物抵抗的关系 | 结直肠癌干细胞及其在肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | SMART-seq2, 10 × Genomics | NA | 转录组数据 | NA |
| 9811 | 2024-08-10 |
A fish with no sex: gonadal and adrenal functions partition between zebrafish NR5A1 co-orthologs
2021-02-09, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaa030
PMID:33724412
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研究论文 | 本研究通过敲除斑马鱼中的nr5a1a和nr5a1b基因，探讨NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色。 | 首次揭示了斑马鱼中nr5a1a和nr5a1b基因在性腺和肾上腺功能中的分工，以及这种分工对性发育差异的影响。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探索NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色及其对性发育的影响。 | 斑马鱼的nr5a1a和nr5a1b基因及其在性腺和肾上腺中的功能。 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1天和2天龄的斑马鱼胚胎以及成年斑马鱼。 |
| 9812 | 2024-08-10 |
Lung transplantation for patients with severe COVID-19
2020-12-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe4282
PMID:33257409
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研究论文 | 本文报告了三名患有难治性COVID-19相关呼吸衰竭患者的肺移植结果，并使用单分子荧光原位杂交（smFISH）检测了SARS-CoV-2 RNA，进行了细胞外基质成像和单细胞RNA测序。 | 首次使用smFISH技术检测移植肺组织中的SARS-CoV-2 RNA，并通过机器学习比较了晚期COVID-19患者与肺纤维化患者的单细胞RNA测序数据。 | 研究样本量较小，仅包括三名患者，且未讨论长期移植后的生存率和并发症。 | 探讨肺移植作为难治性COVID-19相关呼吸衰竭患者的一种潜在救命治疗方法的可行性和效果。 | 患有难治性COVID-19相关呼吸衰竭的患者及其移植后的肺组织。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | 机器学习 | RNA测序数据 | 三名接受肺移植的患者和两名因COVID-19相关肺炎死亡的患者 |
| 9813 | 2024-08-10 |
Expression of the SARS-CoV-2 ACE2 Receptor in the Human Airway Epithelium
2020-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0541OC
PMID:32432483
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2病毒受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达情况 | 首次详细分析了ACE2在不同类型气道上皮细胞中的表达模式，并探讨了吸烟对ACE2表达的影响 | 研究样本仅限于非吸烟者和吸烟者，未涵盖所有可能的人群 | 探究SARS-CoV-2病毒受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达及其对病毒感染的影响 | 人类气道上皮细胞中的ACE2表达 | NA | COVID-19 | 微阵列分析，RNA测序，10x单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 包括非吸烟者和吸烟者的气管、大气道和小气道上皮细胞样本 |
| 9814 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial omics: exploring hypothalamic heterogeneity
2025-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00231
PMID:38993130
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综述 | 本文综述了单细胞和空间组学技术在探索下丘脑细胞类型复杂分子遗传多样性中的应用价值 | 单细胞和空间组学技术的发展克服了早期技术挑战，提供了理解下丘脑复杂时空转录多样性和细胞类型特征的机会 | 单细胞/单核RNA测序需要从组织中分离细胞/核，可能导致神经网络空间信息的丢失 | 阐明下丘脑中复杂的动态细胞组织，以理解其在协调基本身体功能中的作用 | 下丘脑的细胞类型和神经网络的复杂组织 | NA | NA | 单细胞和空间组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9815 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in diabetic kidney disease: a literature review
2024-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2024.2387428
PMID:39099183
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在糖尿病肾病研究中的应用 | 探讨了scRNA-seq技术在揭示糖尿病肾病发病机制和分子机制方面的作用 | NA | 阐明糖尿病肾病的发病机制并识别新的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的多种细胞类型和非肾脏因素 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9816 | 2024-08-09 |
New insights gained from cellular landscape changes in myocarditis and inflammatory cardiomyopathy
2024-Sep, Heart failure reviews
IF:4.5Q1
DOI:10.1007/s10741-024-10406-w
PMID:38896377
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研究论文 | 本文综述了心肌炎和炎症性心肌病（ICM）的最新研究，特别是通过单细胞RNA测序揭示的细胞景观变化 | 利用多组学技术，特别是单细胞RNA测序，深入理解心肌炎/ICM过程中的细胞景观变化 | NA | 提供心肌炎/ICM最新研究的全面概述 | 心肌炎和炎症性心肌病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9817 | 2024-08-09 |
Identification of the CD8 + T-cell Related Signature for Predicting the Prognosis of Gastric Cancer Based on Integrated Analysis of Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000528
PMID:38809517
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征 | 首次探索了CD8+ T细胞在胃癌中的作用，并构建了一个新的风险模型 | NA | 旨在识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征，并指导免疫治疗决策 | 胃癌患者的CD8+ T细胞相关基因特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 896个CD8+ T细胞差异基因 |
| 9818 | 2024-08-09 |
Cancer-associated fibroblasts: a versatile mediator in tumor progression, metastasis, and targeted therapy
2024-Sep, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-024-10186-7
PMID:38602594
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research paper | 本文探讨了肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤进展、转移和靶向治疗中的作用 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了CAFs的多种表型，包括已知的肌成纤维细胞CAFs（myCAFs）和炎症性CAFs（iCAFs）以及新发现的亚型如抗原呈递CAFs（apCAFs） | NA | 研究CAFs在肿瘤发生、癌症干细胞性、血管生成、免疫抑制、代谢和转移中的多重功能，并探讨针对肿瘤微环境的靶向治疗 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9819 | 2024-08-09 |
SIRV: spatial inference of RNA velocity at the single-cell resolution
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae100
PMID:39108639
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research paper | 本文介绍了一种名为SIRV的方法，通过结合空间转录组学数据和参考单细胞RNA测序数据中的剪接和未剪接mRNA表达，实现单细胞分辨率下的空间RNA速度推断 | SIRV方法能够揭示仅通过单细胞RNA测序数据无法识别的空间分化模式，并成功应用于小鼠器官发生数据和鸡心脏发育数据 | 空间RNA速度的估计受限于无法在高分辨率空间转录组学中空间捕获剪接和未剪接的mRNA分子 | 研究组织中细胞分化动力学的空间背景 | 小鼠大脑发育中的中脑-后脑边界细胞和皮质边缘及间脑细胞的分化轨迹 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据 | 小鼠大脑、鸡心脏和人类骨肉瘤细胞的数据 |
| 9820 | 2024-08-09 |
Cisplatin resistance-related transcriptome and methylome integration identifies PCDHB4 as a novel prognostic biomarker in small cell lung cancer
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110413
PMID:39108724
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研究论文 | 本研究通过整合小细胞肺癌的转录组和甲基化组数据，发现PCDHB4作为新的预后生物标志物与顺铂化疗耐药相关 | 首次发现PCDHB4在顺铂耐药的小细胞肺癌中的表达与患者生存率相关，并通过单细胞RNA测序进一步验证了其在肿瘤干细胞特性和上皮-间质转化中的作用 | NA | 探索小细胞肺癌中与顺铂化疗耐药相关的新的预后生物标志物 | 小细胞肺癌患者及顺铂化疗耐药机制 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | RNA测序, 甲基化测序 | Cox回归模型 | 转录组数据, 甲基化数据 | NA |