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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-07-09 |
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01068-4
PMID:41731121
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现衰老过程中树突状细胞迁移缺陷,并通过口服酵母纳米颗粒增强其功能以改善疫苗效力 | 揭示了衰老中树突状细胞迁移缺陷是免疫衰退的关键机制,并开发了口服酵母纳米颗粒的非侵入性策略来增强树突状细胞功能 | 未明确提及 | 探究树突状细胞在衰老相关疫苗效力下降中的作用及改善策略 | 年轻与老年小鼠的淋巴结、树突状细胞及肠道免疫系统 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻与老年小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 942 | 2026-07-09 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示蝉细胞对艾希体感染的转录动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序解析ISE6蝉细胞系的异质性及其在艾希体感染过程中的时间依赖性转录变化 | 未说明具体局限性 | 探究蝉细胞系对艾希体感染的转录响应机制 | ISE6蝉胚胎细胞系及其感染艾希体后的转录谱 | 机器学习和单细胞转录组学 | 蜱传疾病(艾希体病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序分析(具体样本数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序平台 |
| 943 | 2026-07-09 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
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研究论文 | 本研究开发了一种基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可在无Matrigel条件下产生稳定的空间形态发生素梯度,用于人神经类器官的模式化 | 首次报道一种无Matrigel、基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可稳定建立陡峭的外源空间形态发生素梯度,实现人神经类器官的稳健区域化 | 当前技术难以在神经类器官中生成稳定、界限明确的梯度以实现稳健区域化 | 研究人类大脑区域化过程中单个形态发生素的作用,并建立模拟空间-时间形态发生素动态的类器官模型 | 人神经类器官 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人神经类器官(具体样本量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 944 | 2026-07-09 |
BiGCN Learns B Cell Functional States by Integrating Single-Cell Transcriptomes and BCR Repertoires
2026-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202501919
PMID:41725270
|
研究论文 | 提出BiGCN方法,通过整合单细胞转录组和BCR库数据,学习B细胞功能状态 | 首次在单细胞分辨率下显式整合转录组和BCR数据,利用图卷积网络框架统一嵌入,高保真表征B细胞状态和克隆关系 | NA | 开发能够整合单细胞转录组和BCR库数据的方法,以揭示B细胞的功能多样性 | B细胞 | 机器学习 | 感染性疾病, 自身免疫病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | 图卷积网络 | 转录组数据, BCR序列数据 | 涵盖感染性疾病、自身免疫病和泛癌图谱的多组配对单细胞RNA测序和单细胞BCR测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 945 | 2026-07-09 |
Single-cell transcriptomics reveals phenotypic and functional alterations of erythroid progenitor cells in tuberculosis patients
2026-Mar, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2026.102746
PMID:41734583
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示结核病患者红细胞祖细胞的表型和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了结核病不同阶段(潜伏感染、活动性、播散性)及肺组织中红细胞祖细胞的异质性,发现了疾病特异性亚群及其代谢重编程,并建立了基于EPC标志基因的潜伏结核预测模型 | NA | 探究结核病对红细胞祖细胞动态变化的影响及其与免疫细胞的双向调控机制 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核患者的外周血单个核细胞,以及结核肺组织和邻近未受累区域 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核队列的外周血样本以及结核肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 946 | 2026-07-09 |
Integrating scRNA-seq and snRNA-seq with spatial transcriptomics to unlock the xylem puzzle
2026-Feb-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04007-z
PMID:41724975
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学技术,重建杨树茎发育木质部的完整分化轨迹,揭示次生细胞壁形成和程序性细胞死亡的转录调控机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单核RNA测序数据,克服了传统单细胞RNA测序无法捕获具有次生细胞壁的晚期木质部细胞的局限性,成功构建木质部发育的完整图谱 | 未明确提及局限性 | 通过整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学,解决木质部发育研究中晚期细胞类型难以捕获的问题 | 杨树茎发育木质部细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 激光捕获显微切割转录组, 支持向量机分类 | 支持向量机 | 转录组数据 | 不适用(论文未明确提及样本数量) | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 947 | 2026-07-09 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
|
研究论文 | 通过单细胞免疫表型分析,鉴定出CD8+GZMK+IFNG+ T细胞是皮肤莱姆病中的关键免疫细胞群 | 首次在莱姆病红斑迁移性皮损中鉴定出克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞,并揭示其IFN调节基因的差异表达及炎症潜力 | 未提及明显局限性 | 探究莱姆病皮肤迁延性红斑中T细胞免疫反应的细胞和分子特征 | 红斑迁移性皮损及未受累自身皮肤组织中的T细胞 | 单细胞转录组学、免疫学 | 莱姆病(皮肤感染性疾病) | 单细胞RNA测序、适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、适应性免疫受体序列数据 | 扩大样本量后的红斑迁移性皮损和自身未受累皮肤配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 948 | 2026-07-09 |
HDAC1 modulates sepsis-induced immunosuppression by driving the exhaustion of CD8+ T cells
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197224
PMID:41729078
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭及免疫抑制中的作用 | 首次揭示HDAC1通过与NFAT1直接相互作用促进其核转位,进而驱动CD8+ T细胞耗竭的分子机制,并证明HDAC1抑制可恢复AP-1与NFAT平衡来逆转免疫抑制 | 未提及具体局限性 | 阐明HDAC1在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭中的作用机制,评估其作为免疫抑制治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者外周血淋巴细胞及小鼠脓毒症模型中的CD8+ T细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者外周血样本和小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 949 | 2026-07-09 |
WWP2 underlies ROS-induced granulosa cell apoptosis by promoting ubiquitination of BAK in polycystic ovary syndrome
2026-Feb-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08500-y
PMID:41730845
|
研究论文 | 本研究整合公共单细胞RNA-seq数据与临床颗粒细胞样本验证,揭示了WWP2通过促进BAK泛素化调控氧化应激诱导的颗粒细胞凋亡在多囊卵巢综合征中的作用机制 | 首次报道E3泛素连接酶WWP2在PCOS中的功能,阐明氧化应激通过削弱WWP2与BAK相互作用并下调WWP2表达,抑制BAK Lys113位点泛素化从而促进颗粒细胞凋亡的分子机制 | NA | 阐明活性氧如何通过WWP2介导的BAK泛素化调控PCOS中颗粒细胞凋亡的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者颗粒细胞、KGN细胞系、PCOS小鼠模型 | 分子生物学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序、泛素化分析 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本测序数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集及临床PCOS患者颗粒细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 950 | 2026-07-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
|
研究论文 | 构建家蚕翅芽时空单细胞图谱,揭示20E驱动的发育重编程机制 | 首次构建家蚕翅芽跨10个时间点的时空单细胞图谱,鉴定Wm细胞作为中心祖细胞并建立五阶段基因转变模型 | 研究主要基于家蚕模型,其结论在其它昆虫中的普适性需进一步验证 | 解析昆虫翅芽发育的时空逻辑及激素驱动的细胞命运转变 | 家蚕翅芽 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅芽样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序及空间转录组平台 |
| 951 | 2026-07-09 |
Decoding hepatocellular carcinoma prognosis: a machine learning-derived methylation signature integrating transcriptomic and tumor microenvironment insights
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003942
PMID:41731861
|
研究论文 | 整合转录组、甲基组和临床数据,通过机器学习算法开发并验证了肝细胞癌预后相关的10基因甲基化特征 | 首次系统结合数百种机器学习算法,从甲基化与转录组差异表达基因中构建多维度预后特征,并整合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示肿瘤微环境调控机制 | 未提及明确的局限性 | 开发基于甲基化与转录组整合的肝细胞癌预后生物标志物及风险分层模型 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及癌旁组织样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA测序, 甲基化测序, 定量PCR, 蛋白质印迹法 | 机器学习算法(数百种算法组合) | 转录组数据, 甲基化数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 10对肝细胞癌肿瘤与癌旁组织(用于验证) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 952 | 2026-07-09 |
Screening Biomarkers for Nerve Injury Using Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Machine Learning
2026-Feb, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71279
PMID:41733593
|
研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和机器学习筛选神经损伤生物标志物 | 结合多转录组数据集和机器学习方法识别并验证了神经损伤的新型生物标志物Atf3、Bin2、Fcgr2b和Ucn,并阐明了它们在神经免疫串扰中的双重作用 | 该研究主要基于公开数据集,缺乏体内实验验证,且样本量可能有限 | 识别和验证神经损伤的关键调控基因及其功能机制 | 神经损伤和假手术样本的RNA-seq和单细胞转录组数据 | 机器学 | 神经损伤 | RNA-seq | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)和三种机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的神经损伤和假手术样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 953 | 2026-07-09 |
Microglia heterogeneity and therapeutic strategies in Parkinson's disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739341
PMID:41727462
|
综述 | 系统描述小胶质细胞在帕金森病中的生物学特性、功能异质性及靶向治疗策略 | 结合单细胞转录组学技术揭示小胶质细胞在帕金森病中的功能、空间、遗传和性别相关差异,并总结新兴靶向小胶质细胞的干预治疗策略 | 未详细讨论临床转化中的具体障碍及不同治疗策略的成本效益比较 | 阐明小胶质细胞异质性在帕金森病神经退行性变中的作用机制并指导精准治疗 | 小胶质细胞及帕金森病患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 954 | 2026-07-09 |
Unique chicken B cell development: species-specific mechanisms and contradictory requirements of B cell receptor for post-hatched B cell development
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755331
PMID:41727463
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综述 | 文章记录了鸡B细胞在三个发育阶段(前法氏囊期至法氏囊后阶段)的发育过程,并与人类B细胞发育进行比较 | 揭示了鸡B细胞发育的物种特异性机制,包括法氏囊作为主要B细胞受体依赖性发育器官的同时支持非依赖性早期定殖,以及通过激活诱导胞苷脱氨酶介导的基因转换而非V(D)J重组实现抗体多样化 | 未明确提及具体研究限制 | 探讨鸡B细胞发育的独特机制及其与哺乳动物发育的差异 | 鸡B细胞发育过程 | 基因组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 955 | 2026-07-09 |
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739493
PMID:41727470
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research paper | 该研究通过体外实验系统比较了博纳吐单抗驱动的αβ和γδ T细胞亚群活化效应,揭示了两种T细胞亚群对BLN反应的特异性差异 | 首次在健康供体来源的αβ和γδ T细胞中系统比较BLN驱动的效应功能,并发现唑来膦酸扩增的Vγ9Vδ2 γδ T细胞系在高肿瘤负荷下需要更高BLN浓度,同时γδ T细胞表现出更稳定的效应记忆表型 | 实验仅基于健康供体来源的T细胞,未涉及患者样本;单细胞转录组分析仅使用一个供体,样本量有限 | 阐明博纳吐单抗对αβ和γδ T细胞亚群免疫学机制的差异影响 | 健康成人供体的αβ和γδ T细胞 | machine learning | 急性淋巴细胞白血病 | NA | NA | 流式细胞术数据、单细胞转录组数据 | 健康供体(具体数量未明确);单细胞转录组分析使用1个供体 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 探索性靶向单细胞转录组分析(一个供体) |
| 956 | 2026-07-09 |
Diversity and function of tumor-associated macrophages in brain metastases: mechanisms and therapeutic prospects
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1756299
PMID:41727473
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综述 | 探讨脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞的多样性与功能,概述其在肿瘤进展中的作用机制及治疗前景 | 突破传统M1/M2二元分类,强调单细胞技术揭示的多种功能性亚群(如脂质相关、干扰素应答、促血管生成TAM),并系统梳理其从转移前微环境形成到肿瘤定植的全过程机制 | TAM异质性高且靶向特异性不足,血脑屏障递送障碍仍是主要挑战,未来需结合单细胞测序和空间转录组学开发个性化治疗 | 系统总结脑转移瘤中TAM的生物学特性、调控机制及治疗策略,为开发新型免疫疗法提供依据 | 脑转移瘤中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其亚群 | 数字病理学 | 脑转移瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞测序和空间转录组学用于解码TAM异质性 |
| 957 | 2026-07-09 |
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765095
PMID:41727482
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研究论文 | 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序鉴定与胃癌转移相关的细胞外基质重塑免疫特征和核心蛋白,验证RPS29在转移机制中的作用 | 整合蛋白质组学与单细胞转录组学,首次系统解析细胞外基质重塑在胃癌转移中的分子机制,并鉴定RPS29作为新的转移相关核心蛋白 | 未明确提及局限性,可能包括样本量有限、功能验证仅限体外实验等 | 探索细胞外基质重塑在胃癌转移中的分子机制,鉴定预测标志物和治疗靶点 | 胃癌患者样本、胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 958 | 2026-07-08 |
Identification of novel diagnostic biomarkers and host-directed drug screening for Mycobacterium avium infection: A multi-omics and artificial intelligence study
2026-Sep, SLAS discovery : advancing life sciences R & D
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.slasd.2026.100317
PMID:42276326
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研究论文 | 结合多组学和人工智能识别鸟分枝杆菌感染的新型诊断标志物并进行宿主导向药物筛选 | 首次通过单细胞RNA测序与机器学习整合分析,揭示鸟分枝杆菌感染中髓系细胞重编程的MIF-APP轴机制,并基于113种机器学习算法筛选出高精度诊断模型及潜在免疫调节剂Wogonin | 依赖外周血样本,未验证组织或不同亚群中的免疫特征;临床验证样本量和动物模型数据有限 | 解析鸟分枝杆菌感染中的宿主免疫重塑机制,特别是髓系异质性,并识别精准诊断标志物与治疗靶点 | 鸟分枝杆菌感染患者的外周血样本 | 机器学习 | 鸟分枝杆菌感染 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | Stepglm+GBM | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 959 | 2026-07-08 |
Polystyrene microplastics drive chondrotoxicity in osteoarthritis through inducing ER stress and apoptosis via NFKB1 activation
2026-Sep, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116166
PMID:42162659
|
研究论文 | 本研究结合网络毒理学和转录组学分析,发现聚苯乙烯微塑料通过激活NFKB1诱导内质网应激和细胞凋亡,从而加剧骨关节炎的软骨毒性 | 首次揭示聚苯乙烯微塑料通过NFKB1驱动内质网应激和凋亡通路促进骨关节炎进展的分子机制,并利用机器学习鉴定了六个潜在的早期诊断生物标志物 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序,缺乏体内动物模型验证,且NFKB1的上下游调控网络尚未完全阐明 | 阐明聚苯乙烯微塑料在骨关节炎发病机制中的作用及其分子通路 | 聚苯乙烯微塑料对软骨细胞的影响及骨关节炎相关分子机制 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、分子对接、动态模拟 | 机器学习模型、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本量,涉及网络毒理学分析和体外软骨细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 960 | 2026-07-08 |
Integrated Multiomics Reveals Key Drivers and Immune Cell Phenotypes of Infrapopliteal Atherosclerosis and Calcification
2026-Sep, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2026.05.073
PMID:42176975
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研究论文 | 整合多组学揭示膝下动脉粥样硬化和钙化的关键驱动因子及免疫细胞表型 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化等多组学方法,鉴定出HLA-B是膝下动脉粥样硬化的关键致病基因,并识别出因果相关的免疫细胞表型 | 未提及具体局限性 | 识别驱动膝下动脉粥样硬化和钙化的关键基因和免疫细胞表型,开发靶向治疗策略 | 膝下动脉粥样硬化和钙化患者样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ST, SMR, MR | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |