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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 9521 - 9540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2025-10-05 |
Description of Bacterial RNA Transcripts Detected in Mycobacterium tuberculosis - Infected Cells from Peripheral Human Granulomas using Single Cell RNA Sequencing
2024-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608852
PMID:39229107
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序检测人类结核肉芽肿中结核分枝杆菌的RNA转录本 | 在针对真核mRNA设计的单细胞RNA测序文库中成功捕获并分析了结核分枝杆菌的转录本，揭示了细菌转录本的序列变异模式 | 仅包含经医院病理实验室确认的结核感染患者的细菌序列数据，样本来源有限 | 探索结核分枝杆菌在感染宿主细胞中的转录特征和序列变异 | 来自巴布亚新几内亚莫尔兹比港总医院结核病诊所患者的细针穿刺样本 | 数字病理 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 经抗酸显微镜和/或GeneXpert分析确认的结核感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序转录组学流程，使用poly-T引物在约30微米珠上启动mRNA扩增 |
| 9522 | 2025-10-05 |
Immune disease dialogue of chemokine-based cell communications as revealed by single-cell RNA sequencing meta-analysis
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603936
PMID:39071425
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荟萃分析 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示免疫疾病中基于趋化因子的细胞通讯机制 | 首次通过跨疾病跨组织的单细胞RNA测序荟萃分析系统揭示免疫细胞趋化与外渗模式 | 基于公开数据库的二次分析，受原始数据质量和覆盖范围限制 | 解析免疫疾病中细胞间通讯与免疫细胞迁移机制 | 多种免疫疾病患者组织样本（皮肤、肺、结肠、肾脏） | 生物信息学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 配体-受体相互作用分析 | 单细胞转录组数据 | 多种免疫疾病公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9523 | 2025-10-05 |
Cellular age explains variation in age-related cell-to-cell transcriptome variability
2023-12-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278144.123
PMID:37973195
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠单细胞转录组数据，发现细胞年龄能够解释年龄相关转录组变异的大部分差异 | 提出了一个新颖的启发式模型来解释不同细胞类型衰老速率差异的原因 | 研究仅基于小鼠数据，需要在人类和其他物种中进一步验证 | 理解为什么某些细胞类型的转录组会显示衰老迹象而其他细胞类型不会 | 小鼠多种组织和年龄的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 启发式模型 | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠组织和年龄的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9524 | 2025-10-05 |
An Integrated Map of Cell Type-Specific Gene Expression in Pancreatic Islets
2023-11-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0130
PMID:37582230
|
研究论文 | 本研究构建了胰岛细胞类型特异性基因表达的综合图谱 | 首次创建了包含192,203个细胞的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱，并提供了可视化工具和开放分析流程 | 研究样本主要来自人类供体，可能无法完全代表所有人群特征 | 建立胰岛细胞类型特异性基因表达的标准化参考资源 | 人类胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 192,203个细胞，来自65名供体（包括无糖尿病、1型糖尿病自身抗体阳性、1型糖尿病和2型糖尿病患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9525 | 2025-10-05 |
CIARA: a cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201264
PMID:37294170
|
研究论文 | 开发了一种名为CIARA的聚类独立算法，用于从单细胞测序数据中识别稀有细胞类型的标记基因 | 提出不依赖聚类的方法直接识别稀有细胞类型标记基因，可应用于多种单细胞组学数据类型 | NA | 开发识别稀有细胞类型标记基因的计算工具 | 单细胞测序数据中的稀有细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | CIARA算法 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9526 | 2025-10-05 |
The Genetic Landscape of Familial Pulmonary Fibrosis
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202204-0781OC
PMID:36622818
|
研究论文 | 通过全外显子组测序和遗传分析对569个家族性肺纤维化家系进行综合遗传风险评估 | 定义了已知FPF相关基因中罕见变异的流行率，发现了新的候选基因和通路，并开发了跨家系评估罕见变异基因的工具 | 未能在多个家系中发现共享的新罕见变异基因，表明大多数FPF家系存在遗传异质性 | 探索家族性肺纤维化的遗传风险因素 | 569个家族性肺纤维化家系中的患病个体 | 遗传学 | 肺纤维化 | 全外显子组测序, 候选基因测序, 共分离分析, 基因负荷分析, 单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据 | 569个FPF家系 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9527 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq methods to interrogate virus-host interactions
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00972-2
PMID:36414692
|
综述 | 总结单细胞RNA测序技术及其在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在解析病毒基因组与宿主反应异质性、感染细胞与旁观者细胞差异反应及细胞间通讯网络方面的创新应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序方法在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 病毒与宿主细胞的相互作用机制 | 自然语言处理 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9528 | 2025-10-05 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
|
研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了阿尔茨海默病小鼠模型中斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病不同阶段的转录组重塑 | 首次结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA-seq技术，无预设地识别斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病关键阶段的基因失调网络 | 研究基于小鼠模型，人类验证仅使用死后脑组织样本 | 揭示斑块相关和斑块远离小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同贡献 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 激光捕获显微切割，RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 阿尔茨海默病小鼠模型在疾病早期、中期和晚期阶段的小胶质细胞样本 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 9529 | 2025-10-05 |
Completing spatial transcriptomics data for gene expression prediction benchmarking
2025-Dec, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103754
PMID:40885036
|
研究论文 | 本文介绍了SpaRED标准化数据库和SpaCKLE基因表达补全模型，为空间转录组学数据提供了最全面的基因表达预测基准 | 提出了首个系统性整理的26个公共数据集数据库SpaRED，并开发了基于transformer的SpaCKLE模型，将均方误差降低82.5% | 未明确说明数据集的样本来源多样性及模型在临床环境中的验证情况 | 解决空间转录组学数据获取困难和基因表达数据丢失问题，建立标准化的基因表达预测基准 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，深度学习 | transformer | 图像，基因表达数据 | 26个公共数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 9530 | 2025-10-05 |
Smpd3 regulates odontoblast differentiation through the Shh-Gli1 pathway
2025-Nov, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117587
PMID:40639673
|
研究论文 | 本研究揭示了Smpd3通过Shh-Gli1通路调控成牙本质细胞分化的分子机制 | 首次发现Smpd3在成牙本质细胞分化中的关键作用，并阐明其通过Shh信号通路调控牙本质形成的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类系统中验证 | 探究调控成牙本质细胞分化的分子机制 | 小鼠牙乳头细胞和牙胚 | 发育生物学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA干扰, 体外培养 | NA | 基因表达数据, 组织学图像 | 小鼠磨牙单细胞数据及体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9531 | 2025-10-05 |
Origin, functions, heterogeneity and associated diseases of B-1 cells
2025-Nov, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110561
PMID:40651736
|
综述 | 本文综述了B-1细胞的起源、生物学功能及其在人类疾病中的作用 | 通过单细胞测序分析揭示了B-1细胞在特定病理生理特征下的异质性 | B-1细胞的起源尚未完全明确，存在两种假说 | 探讨B-1细胞的起源、功能和与疾病的关联 | B-1细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病，感染性疾病，炎症性疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9532 | 2025-10-05 |
Large-scale proteomics analysis identifies plasma protein biomarkers and potential therapeutic targets for rheumatoid arthritis: A prospective study in UK Biobank
2025-Nov, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117593
PMID:40669587
|
研究论文 | 通过大规模蛋白质组学分析鉴定类风湿关节炎的血浆蛋白生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合蛋白质组学、全基因组关联研究和单细胞RNA测序数据，系统评估RA风险相关蛋白并识别新型治疗靶点 | 预测模型性能中等(AUC=0.74)，样本量相对有限 | 识别类风湿关节炎的生物标志物和潜在治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学, GWAS, 单细胞RNA测序 | XGBoost | 蛋白质组数据, 基因组数据, 转录组数据 | 706例RA患者和1410例对照 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9533 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing revealed the recurrence causes of ETV6:RUNX1 fusion-positive B-ALL in children
2025-Oct, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102041
PMID:40659095
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术探究ETV6:RUNX1融合阳性儿童B-ALL复发的潜在机制 | 首次在单细胞水平揭示ETV6:RUNX1阳性B-ALL复发样本中免疫细胞组成变化、代谢通路转换和细胞间相互作用机制 | 样本量较小（仅4例患者），需要更大规模研究验证发现 | 揭示ETV6:RUNX1融合阳性B-ALL患儿复发的驱动通路 | ETV6:RUNX1融合阳性B-ALL患儿（包括新诊断和复发病例） | 单细胞组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例B-ALL患者（3例新诊断，1例复发，选自25例患者队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9534 | 2025-10-05 |
Establishment of CRISPR/Cas9 lineage tracking technology for pig embryos
2025-Oct, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102046
PMID:40816522
|
研究论文 | 开发了一种结合分子条形码和单细胞转录组学的猪胚胎谱系追踪技术 | 首次在猪胚胎中建立了结合CRISPR/Cas9分子条形码和单细胞RNA测序的高分辨率谱系追踪系统 | NA | 研究猪组织发育过程并重建细胞谱系树 | 猪胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、piggyBac转座、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9535 | 2025-10-05 |
The PAR-score based on PANoptosis genes predicts the progression of ulcerative colitis and the response to anti-TNF-α treatment
2025-Sep-11, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01675-2
PMID:40932643
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研究论文 | 基于PANoptosis基因开发PAR-score预测溃疡性结肠炎进展及抗TNF-α治疗反应 | 首次将PANoptosis（整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡的协调细胞死亡机制）特征应用于溃疡性结肠炎进展和结肠炎相关结直肠癌风险的预测模型构建 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 阐明PANoptosis在溃疡性结肠炎进展中的作用并开发预测模型 | 溃疡性结肠炎患者、结肠炎相关结直肠癌病例和对照样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 转录组分析、单细胞测序、孟德尔随机化、分子对接 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的UC患者、CAC病例和对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 9536 | 2025-10-05 |
scGraphDap: Integrating Functional State Pseudo-labels and Graph Structure Learning for Robust Cell Type Annotation in Tumor Microenvironments
2025-Sep-10, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3607687
PMID:40928910
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研究论文 | 提出scGraphDap图神经网络框架，通过整合功能状态伪标签和图结构学习改进肿瘤微环境中的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 利用通路活性评分作为伪标签优化细胞-细胞图以捕获功能邻近性，并采用图域适应模块对齐不同患者间的细胞嵌入 | 基于非空间scRNA-seq数据，受限于不完整的配体-受体数据库和嘈杂的细胞类型注释 | 改进肿瘤微环境中细胞类型注释和细胞间通讯推断的准确性 | 肿瘤微环境中的细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) | 单细胞RNA测序数据 | 来自15名患者的38,667个细胞，涵盖三种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9537 | 2025-10-05 |
Interferon-induced senescent CD8+ T cells reduce anti-PD1 immunotherapy efficacy in early triple-negative breast cancer
2025-Sep-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj7808
PMID:40929245
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现干扰素诱导的衰老CD8+ T细胞是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的关键因素 | 首次发现干扰素诱导的CD8+ T细胞衰老是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的驱动因素，并提出了烟酰胺单核苷酸治疗策略 | 样本量相对有限（171例患者），需要在更大队列中验证 | 探索早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的机制并寻找解决方案 | 早期三阴性乳腺癌患者样本、患者来源类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 病理学检测 | NA | 基因表达数据, 病理图像 | 171例早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9538 | 2025-10-05 |
CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions
2025-Sep-09, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00510-24
PMID:40757822
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综述 | 本文综述了基于CRISPR的遗传工具在研究宿主-微生物相互作用中的应用与进展 | 系统总结了CRISPR工具在宿主-微生物互作研究中的创新应用，包括筛选、基因组编辑和记录系统，以及与单细胞RNA测序等新兴技术的结合 | 当前工具仍存在一定局限性，需要进一步发展更先进的遗传工具包 | 研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康和疾病中的作用 | 宿主细胞、微生物细胞和动物模型 | 基因编辑技术 | 与宿主-微生物相互作用相关的疾病 | CRISPR基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9539 | 2025-10-05 |
Targeting annexin A2 enhances anti-PD-1 immunotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Sep-09, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115504
PMID:40929955
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研究论文 | 本研究探讨膜联蛋白A2在胰腺导管腺癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序发现ANXA2表达与PDAC患者预后不良相关，并证实ANXA2抑制可增强抗PD-1免疫疗法效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索ANXA2在PDAC免疫治疗中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 共培养系统, 流式细胞术, 蛋白质印迹法 | 小鼠PDAC模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9540 | 2025-10-05 |
Single-cell MultiOmics and spatial transcriptomics demonstrate neuroblastoma developmental plasticity
2025-Sep-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.013
PMID:40347947
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示了神经母细胞瘤的发育可塑性机制 | 首次结合小鼠自发肿瘤模型的单细胞多组学和人类患者样本的空间转录组学，揭示了神经母细胞瘤发育中间状态及其恶性转化的表观遗传调控机制 | 研究样本数量有限，主要依赖小鼠模型和部分人类样本 | 解析神经母细胞瘤发育可塑性的调控机制 | 神经母细胞瘤小鼠模型和人类患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |