单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-01-18 |
Identifying Crucial Genes Associated with Pyroptosis in Lupus Nephritis
2026-Jan-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02402-5
PMID:41545631
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次结合GEO数据库、WGCNA分析和单细胞RNA测序数据，系统性识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因GBP2和EIF2AK2，并通过细胞实验验证其功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，细胞实验验证在体外进行，缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证 | 识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因，探索其作为治疗靶点的潜力 | 狼疮性肾炎患者的肾小球、肾小管间质和全肾组织样本 | 生物信息学 | 狼疮性肾炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 细胞实验 | LASSO回归模型, 共识聚类, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 基于GEO数据库的狼疮性肾炎患者组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 922 | 2026-01-18 |
Targeting the CCL7-STAT1 axis attenuates microglial neurotoxicity and photoreceptor degeneration in retinitis pigmentosa
2026-Jan-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03692-8
PMID:41545890
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了色素性视网膜炎中CCL7-STAT1轴调控小胶质细胞功能障碍并加速光感受器退化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序在RP模型中鉴定出CCL7hi小胶质细胞亚群，并阐明CCL7-STAT1自放大炎症级联反应的新机制 | 研究主要基于rd10小鼠模型，临床转化效果仍需进一步验证 | 探究色素性视网膜炎中小胶质细胞介导神经炎症的分子机制并寻找治疗靶点 | rd10小鼠模型视网膜小胶质细胞和光感受器 | 单细胞组学 | 色素性视网膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | rd10小鼠视网膜小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 923 | 2026-01-18 |
Neighborhood nonnegative matrix factorization identifies patterns and spatially-variable genes in large-scale spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03846-6
PMID:41546049
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 924 | 2026-01-18 |
Discovery of disease-associated cellular states using ResidPCA in single-cell RNA and ATAC sequencing data
2026-Jan-15, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100538
PMID:41157948
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ResidPCA的稳健方法，用于从单细胞RNA和ATAC测序数据中发现与疾病相关的细胞状态 | ResidPCA通过显式建模细胞类型异质性，在检测跨多种细胞类型表达的状态方面，比传统PCA和非负矩阵分解方法具有更高的准确性 | NA | 推进对单细胞测序数据中疾病相关细胞异质性的理解 | 小鼠视觉皮层细胞和阿尔茨海默病队列的单核数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | ResidPCA | 单细胞RNA测序数据, 单核ATAC测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 925 | 2026-01-18 |
NRF2-COX2-PGE2 axis drives immune cold tumors and predicts resistance to combination immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001677
PMID:41538242
|
研究论文 | 本研究揭示了NRF2-COX2-PGE2轴驱动肝细胞癌免疫冷肿瘤微环境并介导阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗耐药的新机制 | 首次通过整合基因工程小鼠模型、单细胞测序、空间转录组学及大规模临床队列数据，系统性鉴定出NRF2-COX2-PGE2轴是驱动HCC免疫冷微环境和Atez/Bev耐药的关键肿瘤内在机制，并发现血浆PGE2可作为非侵入性生物标志物 | 研究主要基于回顾性临床数据和动物模型，前瞻性临床验证尚需进行；机制研究中对NRF2下游具体调控网络的解析有待深入 | 鉴定驱动肝细胞癌免疫冷肿瘤微环境及对一线免疫联合疗法耐药的肿瘤内在机制 | 肝细胞癌（HCC）患者组织样本、基因工程小鼠模型、临床患者队列数据 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 条形码分析 | 基因工程小鼠模型（通过水动力注射条形码致癌基因文库构建） | RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 小鼠模型；人类队列：549名Atez/Bev治疗患者，199名手术切除HCC患者，247名来自IMbrave150和GO30140试验的患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 926 | 2026-01-18 |
Combining spatial and single-cell transcriptome data to analyze tertiary lymphoid structures in clear cell renal cell carcinoma reveals prognostic biomarkers
2026-Jan-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07713-1
PMID:41540415
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 927 | 2026-01-18 |
Single-cell sequencing-based analysis of CD4 + T-cell and B-cell heterogeneity in patients with lupus nephritis
2026-Jan-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02277-3
PMID:41540405
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 928 | 2026-01-18 |
Immune dysregulation triggered by inflammatory cytokines in patients with severe respiratory infections
2026-Jan-15, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03465-6
PMID:41540425
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了严重呼吸道病毒感染中免疫失调的特征，并探讨了高剂量重组蛋白疫苗的潜在保护作用 | 构建了包含299,527个PBMCs的高分辨率免疫细胞图谱，首次系统描绘了COVID-19不同严重程度患者的免疫特征，并发现CD14+单核细胞中IL-6-JAK-STAT通路的激活与IFN-α通路受损共同驱动过度炎症反应 | 样本量相对较小（17例患者），且主要关注PBMCs，未直接分析肺部组织；研究为观察性设计，因果关系需进一步验证 | 探究严重呼吸道病毒感染中免疫失调的机制，并评估高剂量重组蛋白疫苗对免疫反应的影响 | 17例COVID-19患者（包括中度、重度、危重和康复期病例）的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 呼吸道感染 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 17例COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2026-01-18 |
Activating KRAS mutations mark premalignant cystic structures in congenital pulmonary airway malformations
2026-Jan-15, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03491-4
PMID:41540433
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了先天性肺气道畸形中KRAS突变作为恶性肿瘤风险因子的作用 | 首次在先天性肺气道畸形中利用单细胞RNA测序技术，结合气道类器官模型，揭示了KRAS突变与肺癌转录组相似性及细胞增殖增加 | 样本量较小（n=3），可能限制统计效力，且研究基于类器官模型，需进一步体内验证 | 评估KRAS突变作为先天性肺气道畸形恶性转化风险因子的潜力，以统一无症状患者的治疗策略 | 先天性肺气道畸形患者的切除肺组织，包括病变区域（囊肿）和非病变区域（对照） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | 气道类器官 | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 3名患者（KRAS突变阳性与阴性对比） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 930 | 2026-01-18 |
Unveiling cholesterol metabolism-related gene ACOX2: a multi-omics discovery of a novel biomarker in IgA nephropathy
2026-Jan-15, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-026-00639-0
PMID:41540492
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合框架，揭示了胆固醇代谢相关基因ACOX2作为IgA肾病的新型保护性生物标志物 | 首次结合GWAS、SMR、贝叶斯共定位、scRNA-seq及分子模拟等多组学方法，系统鉴定出ACOX2在IgA肾病中的保护作用及潜在治疗靶点 | 研究主要基于遗传和转录组数据，缺乏体内实验验证ACOX2的功能机制 | 探索胆固醇代谢在IgA肾病中的作用机制并识别关键生物标志物 | IgA肾病患者的遗传和转录组数据 | 生物信息学 | IgA肾病 | GWAS, SMR, 贝叶斯共定位, scRNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | 多组学整合分析框架 | 遗传数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 931 | 2026-01-18 |
Spatiotemporal transcriptomic mapping reveals region-specific glial activation and astrocyte shifts in epileptogenesis beyond the hippocampus
2026-Jan-15, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02224-y
PMID:41540500
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了癫痫发生过程中海马以外区域的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变 | 首次通过空间转录组学全面绘制癫痫发生过程中的转录动态，发现胶质激活和星形胶质细胞亚型转变超出海马范围，涉及丘脑核团和白质束 | 研究基于锂-毛果芸香碱诱导的大鼠模型，可能不完全反映人类颞叶癫痫的复杂性；样本量较小（n=16） | 探究颞叶癫痫发生过程中的分子和细胞机制，特别是海马以外区域的参与 | 锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型的大脑冠状切片 | 空间转录组学 | 颞叶癫痫 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16只大鼠（包括对照组和癫痫模型组） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |
| 932 | 2026-01-18 |
Mapping clinical CAR-T cells: insights from scRNA-seq
2026-Jan-15, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2025.12.006
PMID:41545236
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术分析临床CAR-T细胞的研究，重点关注T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性和细胞因子等方面 | 首次系统性地总结了已发表的利用scRNA-seq分析临床CAR-T细胞的研究，并整合了T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性、细胞因子、激活状态、CD4+/CD8+比例、增殖、调节性T细胞和代谢等多个维度的发现及其与患者反应的相关性 | 作为综述文章，主要依赖现有研究的总结，未提出新的实验数据或分析方法；同时讨论了scRNA-seq技术在CAR-T细胞研究中的局限性 | 总结和整合利用单细胞RNA测序技术分析临床CAR-T细胞的研究成果，为临床医生和研究人员提供关键见解 | 临床CAR-T细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 933 | 2026-01-18 |
Efficient stem cell-derived mouse embryo models for environmental studies
2026-Jan-14, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.004
PMID:40882624
|
研究论文 | 本研究开发了一种模块化方法，通过聚集三种小鼠干细胞类型来高效生成模拟天然囊胚的类囊胚结构，用于环境因素研究 | 提出了一种通过聚集胚胎干细胞、诱导性GATA4表达胚胎干细胞和滋养层干细胞来高效生成具有完整谱系和空腔的类囊胚结构的新方法 | 研究主要基于小鼠干细胞模型，尚未在人类系统中验证；体外培养的形态发生效率约为12%，仍有提升空间 | 开发高效的干细胞衍生胚胎模型，用于研究环境因素对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎干细胞、诱导性GATA4表达胚胎干细胞、滋养层干细胞及其生成的类囊胚结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、体外培养 | 干细胞衍生胚胎模型 | 基因表达数据、形态学数据 | 未明确具体样本数量，但提及生成效率约为80% | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 934 | 2026-01-17 |
Correction to 'inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples'
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag009
PMID:41533593
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 935 | 2026-01-18 |
NNMT inhibition counteracts tubular senescence and fibrosis in early stages of chronic kidney disease
2026-Jan-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116823
PMID:41543936
|
研究论文 | 本文发现NNMT是肾小管衰老和肾纤维化的关键介质，并证明其抑制可减少早期慢性肾病中的衰老和纤维化 | 首次将NNMT鉴定为肾小管衰老和纤维化的关键介质，并通过空间转录组学揭示其在人类活检组织中的表达模式，同时展示选择性NNMT抑制在细胞、类器官和体内模型中的保护作用 | 研究主要基于早期慢性肾病模型，未涉及晚期疾病阶段；体内实验主要在动物模型中进行，人类临床验证有限 | 探索NNMT在慢性肾病肾小管衰老和纤维化中的作用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类慢性肾病微阵列、糖尿病肾病活检组织、小鼠模型、肾小管上皮细胞、肾脏类器官 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 微阵列、空间转录组学、蛋白质分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、空间转录组数据 | 人类活检组织、小鼠模型、细胞和类器官样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 936 | 2026-01-18 |
Myeloid-Driven Inflammation Highlights ADGRE2 as a Biomarker in Prurigo Nodularis: Integrated Multi-Omics Analysis
2026-Jan-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.023
PMID:41544890
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了痒疹结节病（PN）中髓系细胞驱动的炎症特征，并鉴定出ADGRE2作为与临床瘙痒严重程度相关的生物标志物 | 首次在蛋白水平上系统比较PN与特应性皮炎（AD），并整合单细胞RNA测序数据，识别出PN特异的髓系富集分子ADGRE2，其表达与瘙痒严重程度显著相关 | 样本量相对有限，且部分数据依赖公开数据集，需要进一步功能验证和更大规模队列研究 | 阐明痒疹结节病的病理机制，特别是在蛋白水平和与特应性皮炎的对比中，寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 痒疹结节病（PN）、特应性皮炎（AD）患者及健康对照（HC）的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 4D-DIA蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | PN、AD和HC的病变组织样本（具体数量未明确），整合公开数据集如GSE222840 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2026-01-18 |
Mitochondrial pyruvate metabolism in club cells drives airway inflammation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102742
PMID:41418787
|
研究论文 | 本研究揭示了线粒体丙酮酸代谢在气道棒状细胞中如何调控上皮分化和过敏性气道炎症，并发现了一种代谢-免疫交互作用在哮喘发病机制中的作用 | 首次发现棒状细胞中线粒体丙酮酸载体Mpc2（而非Ldha）缺失会通过增加Cxcl17表达，促进与肺泡巨噬细胞的Cxcl17-Cxcr4信号传导，从而抑制CCL17介导的2型炎症，这为哮喘治疗提供了新的代谢靶点 | 研究主要基于OVA诱导的哮喘模型，人类样本的验证仍需进一步深入；且具体代谢通路下游的分子机制有待更详细阐明 | 探究气道棒状细胞中丙酮酸代谢如何调控上皮分化和过敏性气道炎症，以揭示哮喘发病的代谢-免疫机制 | 哮喘患者的气道棒状细胞和杯状细胞，以及OVA诱导的哮喘小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 哮喘患者和OVA诱导哮喘模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 938 | 2026-01-18 |
Electrocorticographic, Astrocytic and Transcriptomic Signatures in the Triple Transgenic Mouse Model of Alzheimer's Disease submitted to Stearoyl-CoA Desaturase Inhibition
2026-Jan-13, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110835
PMID:41539386
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶（SCD）对阿尔茨海默病（AD）三转基因小鼠模型睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢及转录组的影响 | 首次在AD动物模型中结合了脑电图记录、星形胶质细胞标记物分析、脂滴染色和空间转录组学技术，系统评估SCD抑制对睡眠障碍和神经病理的多维度影响 | 研究仅使用了雌性小鼠，未评估性别差异；SCD抑制未能恢复AD小鼠的睡眠时间改变；机制关联性仍需进一步验证 | 探究SCD抑制是否能改善AD模型小鼠的睡眠障碍，并分析其与脂质代谢、星形胶质细胞功能和转录组变化的关系 | 野生型（WT）和三转基因（3xTg-AD）雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 脑电图记录、免疫组织化学染色、空间转录组学 | 三转基因（3xTg-AD）小鼠模型 | 脑电信号、图像数据、转录组数据 | 野生型和3xTg-AD雌性小鼠（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 939 | 2026-01-18 |
Oyster Cellular Architecture and Innate Immune Programs Resolved by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan-13, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111128
PMID:41539414
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了海洋无脊椎动物香港牡蛎的组织解析单细胞图谱，揭示了其细胞类型、免疫程序及细胞间通讯 | 首次在海洋无脊椎动物中生成组织解析的单细胞图谱，定义了20种细胞类型，并揭示了吞噬细胞谱系的多样化终端策略以及神经相关区室在免疫调控中的新角色 | NA | 解析海洋无脊椎动物屏障黏膜组织的细胞架构和先天免疫程序 | 香港牡蛎（Crassostrea hongkongensis） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 940 | 2026-01-18 |
An unbiased molecular characterisation of peripartum cardiomyopathy hearts identifies mast cell chymase as a new diagnostic candidate
2026-Jan-13, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101510
PMID:41539643
|
研究论文 | 本研究通过无偏分子表征方法，分析了围产期心肌病心脏组织，发现肥大细胞糜蛋白酶作为新的诊断候选标志物 | 首次结合深度蛋白质组学、单核转录组学和空间转录组学，全面比较PPCM与NPCM及对照心脏的分子表型，识别出PPCM特异性上调的肥大细胞蛋白糜蛋白酶和羧肽酶A3 | 研究样本来自终末期疾病患者，可能无法反映疾病早期变化；样本量可能有限；未详细探讨肥大细胞激活的具体机制 | 揭示人类围产期心肌病心脏的分子特征，并基于组织变化促进生物标志物发现 | 女性终末期心脏病患者（接受心脏移植或左心室辅助装置植入）的心脏组织，以及无心脏病器官捐赠者的对照心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 深度蛋白质组学, 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及多个队列的患者和对照心脏组织及外周血血清 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |