单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 921 - 940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
921 2026-09-02
Hyper-activated low-density neutrophil-derived NGAL predicts fatal SFTS: a multi-cohort and single-cell study
2026-Aug, Infection IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过多队列和单细胞分析,评估血清NGAL对发热伴血小板减少综合征患者死亡风险的预测能力,并揭示其细胞来源。 首次在单细胞水平揭示血清NGAL主要来源于与PBMCs共纯化的低密度中性粒细胞,这些细胞在非幸存者中高度富集并具有高炎症和干扰素刺激特征。 研究为回顾性设计,样本量有限,且未涉及机制验证。 评估血清NGAL对SFTS患者死亡风险的预测价值,并在单细胞水平阐明其细胞来源。 215例SFTS患者及公开的单细胞RNA测序数据。 机器学习 感染性疾病 单细胞RNA测序 NA 临床数据、单细胞转录组数据 215名SFTS患者(训练队列152名,外部验证队列63名)及公开的PBMC单细胞数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
922 2026-09-02
RETROFIT: Reference-free deconvolution of cell-type mixtures in spatial transcriptomics
2026-Jul-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 介绍了一种名为RETROFIT的无参考空间转录组数据解卷积方法,该方法直接基于测序数据进行贝叶斯推断,无需匹配单细胞参考或标记基因,并能有效恢复细胞类型特异性的空间组织。 RETROFIT不需要单细胞参考或标记基因,直接从测序测量中操作,仅在事后注释阶段结合外部信息,并能在接近单细胞分辨率下工作,如Visium HD数据。 文中未明确提及局限性,但可能依赖于测序数据的质量以及事后注释的准确性。 开发一种无参考的空间转录组数据解卷积方法,以解析细胞类型混合信号,从而揭示细胞类型特异性的空间组织和转录程序。 空间转录组数据,包括模拟数据和多种真实数据集,以及Visium HD数据。 生物信息学 NA 空间转录组测序 贝叶斯模型 基因表达数据(空间转录组) 模拟数据和多个真实数据集(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD 10x Visium HD
923 2026-09-02
Spatial transcriptomics reveals distinct cell type dynamics following opioid dependence in female mice with the common human μ-opioid receptor variant Oprm1 A118G
2026-Jul-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示携带常见人类μ-阿片受体变体Oprm1 A118G的雌性小鼠在阿片依赖过程中不同细胞类型的动态变化 首次在空间转录组水平上揭示Oprm1 A118G基因型对阿片依赖中胶质细胞而非神经元转录状态的显著影响,并将基因风险与解剖学组织的胶质、神经元及网络功能变化联系起来 未提供明确的局限性信息 探究Oprm1 A118G变体如何影响阿片依赖的细胞和分子基础 携带Oprm1 A112G突变(对应人类A118G)的雌性小鼠,包括有和无吗啡依赖状态的个体 空间转录组学 阿片使用障碍 单核空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确样本数量 NA 空间转录组学 NA NA
924 2026-09-02
Distinct cell type-specific mechanisms underlie cognitive dysfunction during persistent integrated stress response activation
2026-Jul-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序,构建了小鼠大脑的综合应激反应图谱,揭示了细胞类型特异性机制在认知功能障碍中的作用 首次构建了持久性整合应激反应激活的大脑单细胞图谱,并发现不同神经元亚型依赖不同的ISR效应因子,特别是GABA能神经元中的ATF4缺失会加剧认知衰退 未提及 阐明持久性整合应激反应激活导致认知功能障碍的细胞类型特异性机制 小鼠大脑中的不同细胞类型,特别是GABA能神经元和谷氨酸能神经元 单细胞组学 认知功能障碍(与神经发育和神经退行性疾病相关) 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 基因敲除小鼠模型 单细胞基因表达和染色质可及性数据 小鼠大脑样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA NA
925 2026-09-02
Comprehensive Spatial Transcriptomic Profiling of Cribriform, Intraductal, Atypical Intraductal Proliferation, and Ductal Adenocarcinoma of the Prostate
2026-Jul-17, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
研究论文 利用空间转录组学分析前列腺癌中筛状腺癌、导管内癌、非典型导管内增生及导管腺癌的基因表达特征,揭示其转录组相似性与差异性。 首次对筛状腺癌、导管内癌、非典型导管内增生及导管腺癌进行全面的空间转录组分析,并识别出这些亚型之间的转录组相似性和独特差异。 样本量相对较小(17例前列腺切除术,18个核心样本),主要为高风险患者,且随访时间中位数为47个月,可能限制结果的普遍性。 评估前列腺癌中与不良预后相关的不同组织学亚型的空间转录组表达谱,以探索其生物学差异和潜在治疗靶点。 前列腺癌组织中的筛状腺癌、导管内癌、非典型导管内增生和导管腺癌。 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学 不适用 基因表达数据 18个福尔马林固定石蜡包埋核心样本,来自17例前列腺切除术患者 Bruker 空间转录组学 GeoMx数字空间分析仪 GeoMx数字空间分析仪平台,采用组织微阵列,分析18676个信使RNA的表达
926 2026-09-02
Immunomodulatory role of megakaryocytes in the hematopoietic niche of myeloproliferative neoplasms
2026-07-01, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了巨核细胞在骨髓增生性肿瘤造血微环境中的免疫调节作用,发现JAK2V617F突变和衰老协同重编程巨核细胞为炎症性免疫调节细胞,LINE-1激活可能是慢性骨髓炎症和MPN进展的驱动因素 首次揭示衰老巨核细胞中LINE-1逆转录转座子激活通过cGAS-STING通路驱动MPN微环境炎症,并在人类样本中验证ORF1p表达 研究主要基于小鼠模型,人类样本量较小(13例患者,5例对照),且未深入探讨LINE-1激活的具体分子机制 阐明巨核细胞在MPN骨髓微环境中的免疫调节作用及其与衰老的相互作用 JAK2V617F突变巨核细胞(小鼠模型及人类MPN骨髓样本) 数字病理学 骨髓增生性肿瘤 单细胞RNA测序,免疫组织化学 小鼠模型 基因表达数据,图像 13例MPN患者和5例骨科对照骨髓样本;小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
927 2026-09-02
Characterizing the Discordance between AT-Rich Interacting Domain 1A Protein and Genotype in Endometrioid-Type Endometrial Tumors
2026-Jul, The American journal of pathology
研究论文 本研究探究子宫内膜样肿瘤中ARID1A蛋白表达与基因型不一致的现象及其对转录特征和预后的影响 首次系统评估子宫内膜癌中ARID1A蛋白表达与基因型的不一致性,发现蛋白丢失可独立于基因型发生,并可能通过蛋白酶体降解实现,且空间转录组学揭示基因型和蛋白表达共同塑造独特的转录特征 样本量相对较小,且研究主要聚焦于子宫内膜样肿瘤,可能限制结果的普遍性 阐明ARID1A蛋白表达与基因型在子宫内膜癌中的关联及其对转录特征和患者预后的影响 71例人类子宫内膜样肿瘤组织和16例用于空间转录组学分析的肿瘤样本,以及人类子宫内膜癌细胞模型 数字病理学, 机器学习 子宫内膜癌 空间转录组学, 免疫组化, 基因测序 NA 图像, 基因表达数据 71例人类子宫内膜样肿瘤组织;16例用于空间转录组学;TCGA队列中的子宫内膜样肿瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
928 2026-09-02
Cell migration inducing protein alleviates adverse cardiac remodelling after ischaemia and reperfusion injury by controlling fibroblast activation
2026-06-26, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了细胞迁移诱导蛋白(CEMIP)在心肌缺血再灌注损伤后通过调控成纤维细胞活化来减轻不良心脏重塑的作用 首次揭示CEMIP通过影响整合素介导的TGF-β激活和SMAD3信号通路,控制成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,从而在心脏修复中发挥保护作用 研究仅使用小鼠模型,且未涉及CEMIP在人类心脏疾病中的作用验证 探究CEMIP在心肌梗死后心脏重塑中的功能及其潜在的治疗靶点价值 小鼠心脏成纤维细胞及心肌梗死模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于梗死心脏的单细胞RNA测序
929 2026-09-02
Histone H3 lysine 18 lactylation-mediated SULF1 transcription promotes atherosclerosis by regulating endothelial-to-mesenchymal transition
2026-06-26, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨组蛋白H3赖氨酸18乳酰化介导的SULF1转录通过调控内皮-间质转化促进动脉粥样硬化,并揭示其分子机制。 首次揭示SULF1在氧化应激诱导的内皮-间质转化和动脉粥样硬化中的关键作用,并阐明H3K18la修饰和HDAC3在代谢与表观遗传交互中的新机制。 研究主要在体内外模型中进行,需要更多临床样本验证;单细胞转录组分析可能受样本量和组织异质性影响。 探讨SULF1在氧化应激诱导的EndMT和动脉粥样硬化中的作用及分子机制,为动脉粥样硬化提供新的治疗靶点。 颈动脉粥样硬化核心组织中的细胞,特别是内皮细胞,以及相关动物模型和细胞系。 单细胞转录组学、分子生物学 动脉粥样硬化 单细胞转录组测序、基因敲除/过表达、组蛋白修饰分析 NA 单细胞转录组数据、细胞实验数据、动物模型数据 未提供具体样本数量,但包括人体颈动脉粥样硬化核心组织样本及实验动物和细胞样本。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
930 2026-09-02
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived small extracellular vesicles accelerate diabetic wound healing by reprogramming fibroblast subpopulations and delivering pro-regenerative cargos
2026-05, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1
研究论文 本研究探讨了人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡通过重编程成纤维细胞亚群和递送促再生因子加速糖尿病伤口愈合的机制 首次利用单细胞转录组测序和邻近条码分析技术,揭示hUC-MSC-sEVs通过重编程Trps1+成纤维细胞亚群和递送ITGB1富集的sEV亚群实现双重促再生机制 研究主要基于小鼠模型,且未涉及长期安全性评估 阐明hUC-MSC-sEVs加速糖尿病伤口愈合的分子和细胞机制 人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡及糖尿病小鼠皮肤组织 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序、 bulk RNA测序、邻近条码分析、免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、组织图像 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
931 2026-09-02
Alveolar Type 2 Cell Dysfunction Is Associated with Bile Acid Alterations in Experimental Hepatopulmonary Syndrome
2026-Apr-28, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了实验性肝肺综合征中肺泡2型细胞功能障碍与胆汁酸变化之间的关联 首次结合AT2细胞特异性RiboTag RNA测序、单细胞RNA测序和质谱胆汁酸分析,揭示了胆汁酸水平升高与AT2细胞功能及表面活性物质表达减少的关联,并发现FXR激动剂可恢复AT2细胞功能 研究基于小鼠模型,需进一步在人类样本中验证;具体分子机制尚未完全阐明 探究肝肺综合征中肺泡2型细胞功能障碍及胆汁酸变化的潜在作用 肝肺综合征小鼠模型(胆总管结扎)及MLE12细胞系 分子生物学、生理学 肝肺综合征 RNA-seq(包括RiboTag和单细胞RNA-seq)、质谱分析、免疫荧光 小鼠疾病模型、细胞模型 基因表达数据、蛋白质数据、生理数据 未明确具体数量,使用CBDL小鼠和MLE12细胞 10x Genomics, Illumina, Thermo Fisher 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'端测序,RiboTag RNA-seq
932 2026-09-02
Single-cell transcriptome profiling reveals the heterogeneity of ossification of the posterior longitudinal ligament (OPLL) and its immune microenvironment
2026-04-18, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序揭示了后纵韧带骨化症(OPLL)的细胞异质性及其免疫微环境。 首次绘制了人类OPLL病变的单细胞转录组图谱,识别了软骨细胞谱系的分化轨迹及SPP1-CD44等免疫-基质互作信号。 探索性研究,样本量有限,且未进行功能验证实验。 阐明OPLL的细胞异质性和发病机制,探索潜在的免疫-基质通路作为治疗靶点。 人类颈椎OPLL病变组织中的4,683个细胞。 单细胞转录组学 后纵韧带骨化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 伪时间分析、细胞间通讯分析 单细胞转录组数据 4,683个细胞(来自人类手术切除的颈椎OPLL病变) NA 单细胞RNA测序 NA NA
933 2026-09-02
Revealing an enhanced cytotoxic immune microenvironment at the human maternal-fetal interface in preeclampsia
2026-04-16, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析子痫前期患者蜕膜免疫细胞的组成和功能异质性,揭示了细胞毒性免疫微环境的增强 首次在单细胞水平上全面描绘子痫前期蜕膜免疫细胞图谱,并发现NK细胞向独特组织驻留ITGAECD160亚群分化,增强细胞毒性活性 研究仅基于转录组数据,未验证蛋白质水平的变化,且样本量可能有限 阐明子痫前期蜕膜免疫细胞的功能异常及其机制 子痫前期患者的蜕膜免疫细胞 单细胞转录组学 子痫前期 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
934 2026-09-02
Single-cell RNA sequencing reveals HMGA2 involvement in neoplastic aggressiveness and endothelial cell senescence in chondrosarcoma
2026-04-11, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示HMGA2在软骨肉瘤肿瘤侵袭性和内皮细胞衰老中的作用 首次通过单细胞RNA测序解析不同恶性程度软骨肉瘤与良性软骨肿瘤的细胞异质性,并发现HMGA2通过诱导SPP1分泌促进内皮细胞衰老及肿瘤恶性进展 未提供明确的局限性信息 深入理解软骨肉瘤肿瘤微环境,寻找晚期患者的潜在治疗靶点 高级别和低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤及瘤旁组织的临床标本 单细胞测序 软骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、生物信息学分析、组织学染色、体外和体内实验 NA 单细胞转录组数据、临床组织样本、公共批量数据集 高级别和低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤及瘤旁组织的临床标本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
935 2026-09-02
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨代谢减重手术(垂直袖状胃切除术)对肥胖青少年2型糖尿病患者早期肾损伤的缓解作用及其分子机制 首次利用配对肾活检样本结合单细胞RNA测序,揭示垂直袖状胃切除术后肾脏在细胞层面的分子适应性变化,特别是mTORC1和JAK/STAT信号通路的抑制 样本量较小(5例配对肾活检),且未提供长期随访结果或随机对照设计 探究代谢减重手术(垂直袖状胃切除术)对肥胖青少年2型糖尿病患者肾脏结构和分子变化的改善作用及潜在机制 患有2型糖尿病和严重肥胖的青少年,接受垂直袖状胃切除术治疗的个体 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、循环蛋白质组学、组织学评估、代谢分析 NA 肾活检组织、血液样本、蛋白质组学数据 5名接受垂直袖状胃切除术的青少年(配对肾活检)及独立队列中的64名肥胖青少年 NA 单细胞RNA测序 NA NA
936 2026-09-02
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Apr, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究利用多组学单细胞测序分析人类海马组织,探索成年期、衰老和阿尔茨海默病中的神经发生现象 首次在人类海马中结合单核RNA测序和单核ATAC测序,识别出神经干细胞、神经母细胞和未成熟颗粒神经元,并发现表观遗传改变与神经发生失调相关 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态下的神经发生动态 阐明人类海马神经发生在衰老和阿尔茨海默病中的分子机制及其与认知功能的关系 人类死后海马组织样本,包括年轻成人、老年无认知障碍者、超级老年人、临床前病理和阿尔茨海默病患者 单细胞基因组学, 神经科学 阿尔茨海默病 单核RNA测序, 单核ATAC测序 NA 单细胞转录组和表观遗传数据 355,997个海马细胞核 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Chromium Single Cell ATAC
937 2026-09-02
Impact of OMICS Technologies in Our Understanding of the Pathogenesis of Peri-Implantitis
2026-04, Clinical and experimental dental research IF:1.7Q3
综述 本文评估了OMICS技术对理解种植体周围炎发病机制(从宿主免疫角度)的贡献 整合多种OMICS层面的研究发现种植体周围炎是一个多层次宿主-微生物组分子生态系统,揭示了免疫失调、细胞外基质破坏、组织重塑和宿主-微生物串扰的汇聚通路 未来需要更大样本量和功能验证的研究来支持临床转化 评估OMICS技术对理解种植体周围炎发病机制(从宿主免疫角度)的贡献 种植体周围炎 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等相关领域 种植体周围炎 NA NA 文献资料 NA NA NA NA NA
938 2026-09-02
Transcriptional regulation of the main olfactory epithelium by environmental olfactory exposures
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了环境气味暴露对小鼠主嗅上皮细胞类型特异性转录的影响,并识别了嗅觉感觉神经元、支持细胞和免疫细胞的转录变化 首次在稳态下揭示环境气味暴露对主嗅上皮细胞类型特异性转录的影响,强调了多细胞相互作用在嗅觉上皮调控中的重要性 未提供具体局限性信息 探究环境气味暴露如何影响小鼠主嗅上皮中不同细胞类型的转录反应,以理解该组织在稳态和损伤炎症中的调节机制 小鼠主嗅上皮中的多种细胞类型,包括嗅觉感觉神经元、支持细胞和免疫细胞 单细胞转录组学 嗅觉功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠主嗅上皮样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
939 2026-09-02
Endometrial Hyperplasia Risk Is Increased by High-Fat Diet Via Estrogen-Driven Stromal Fibroblast Reprogramming Toward a Pro-Fibrotic State
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序和组织表型分析,研究高脂饮食如何通过雌激素驱动的基质成纤维细胞重编程为促纤维化状态,从而增加子宫内膜增生风险 首次揭示高脂饮食通过雌激素信号驱动子宫内膜基质成纤维细胞重编程,从促黄体酮受体网络相关表型转向促纤维化表型,并证明基质雌激素受体α是细胞外基质积累的关键驱动因素 研究基于小鼠模型,可能不完全等同于人类子宫内膜增生机制;未进行体内功能验证雌激素信号在人类组织中的直接作用 探究肥胖(高脂饮食)如何改变子宫内膜细胞状态,并阐明其增加子宫内膜增生风险的分子机制 对照饮食和高脂饮食喂养的正常及子宫内膜增生易感小鼠的子宫内膜组织 数字病理学 子宫内膜增生 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠子宫内膜组织样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
940 2026-09-02
Single-cell transcriptome analysis reveals DNMT1+ epithelial cells promote lymphatic metastasis via CXCL17-mediated TAM infiltration
2026-03-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示DNMT1+上皮细胞通过CXCL17介导的肿瘤相关巨噬细胞浸润促进膀胱癌淋巴转移的机制 首次鉴定出DNMT1+上皮细胞亚群在膀胱癌淋巴转移中的促进作用,并揭示其通过CXCL17调控TAM招募和M2型极化的新机制 研究未提供具体局限性信息 阐明膀胱癌淋巴转移的分子机制,特别是肿瘤微环境中上皮细胞与巨噬细胞的相互作用 膀胱癌患者的肿瘤组织样本及细胞,包括上皮细胞和肿瘤相关巨噬细胞 单细胞转录组学 膀胱癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 17例膀胱癌患者,共153,339个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部