单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9261 - 9280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9261 | 2024-08-26 |
Decoding the multicellular ecosystem of vena caval tumor thrombus in clear cell renal cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-03-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02651-9
PMID:35361264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了8名透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的19个手术组织样本，揭示了肿瘤血栓形成的多细胞生态系统及其机制。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肿瘤血栓中的细胞类型和它们之间的相互作用，特别是肿瘤血栓中CD8+ T细胞和巨噬细胞的特征。 | 研究样本量较小，仅包括8名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入了解肿瘤血栓形成的机制，为设计有效的辅助治疗提供依据。 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤血栓组织。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 19个手术组织样本来自8名患者 |
| 9262 | 2024-08-26 |
Hand2 delineates mesothelium progenitors and is reactivated in mesothelioma
2022-03-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29311-7
PMID:35354817
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研究论文 | 本文通过斑马鱼模型追踪了间皮细胞在侧板中胚层（LPM）中的起源，并发现hand2基因在间皮前体细胞中的表达特征，同时探讨了hand2在人和小鼠间皮瘤中的重新激活现象。 | 首次揭示了hand2基因在间皮前体细胞中的表达特征，并证实了其在人和小鼠间皮瘤中的重新激活，为理解间皮病理提供了新的视角。 | 研究主要基于斑马鱼模型，对人类和小鼠的验证尚需进一步的临床数据支持。 | 探究间皮细胞的起源及其在间皮瘤中的作用机制。 | 间皮细胞的前体细胞及其在间皮瘤中的表达特征。 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎和人类及小鼠的间皮瘤组织 |
| 9263 | 2024-08-26 |
The landscape of receptor-mediated precision cancer combination therapy via a single-cell perspective
2022-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29154-2
PMID:35338126
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研究论文 | 本研究利用组合优化技术，通过单细胞转录组学数据分析，探索了癌症精准联合治疗的最佳组合策略 | 首次通过单细胞转录组学数据，利用组合优化技术，确定了针对癌症精准治疗的个性化组合策略 | 研究中使用的组合优化技术可能需要进一步验证其在临床应用中的有效性 | 旨在通过计算方法确定癌症精准治疗所需的靶点和数量 | 研究对象为1269个编码细胞表面受体的基因，这些基因可能是CAR-T、偶联抗体或涂层纳米粒子疗法的靶点 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | 组合优化 | 转录组数据 | 大规模单细胞转录组学数据集 |
| 9264 | 2024-08-26 |
Dynamic single-cell RNA sequencing reveals BCG vaccination curtails SARS-CoV-2 induced disease severity and lung inflammation
2022-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.03.15.484018
PMID:35313583
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨BCG疫苗对COVID-19的影响，发现BCG疫苗能减轻SARS-CoV-2引起的疾病严重性和肺部炎症 | 首次通过单细胞RNA测序揭示BCG疫苗如何通过调节免疫细胞和基因表达来减轻COVID-19的严重性 | 研究仅在叙利亚金仓鼠模型中进行，可能需要进一步的人体试验验证 | 探讨BCG疫苗对COVID-19的影响及其免疫机制 | BCG疫苗对COVID-19的免疫保护作用及其对肺部炎症的影响 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 叙利亚金仓鼠模型 |
| 9265 | 2024-08-26 |
The Power of Single-Cell RNA Sequencing in eQTL Discovery
2022-03-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13030502
PMID:35328055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在表达数量性状位点（eQTL）发现中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够在单细胞水平上评估基因表达的时空变化，揭示了使用传统批量RNA测序方法可能忽略的不同细胞类型、发育阶段和刺激下的eQTL | 文章指出单细胞eQTL研究在实验和分析方面仍需考虑未来的发展 | 探讨单细胞eQTL研究在大型群体遗传学中的应用，以更接近理解疾病的分子机制 | 单细胞RNA测序技术在eQTL发现中的方法学原理、优势、局限性及未来实验和分析考虑 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 9266 | 2024-08-26 |
A Phase II Study of Pembrolizumab in Combination with Capecitabine and Oxaliplatin with Molecular Profiling in Patients with Advanced Biliary Tract Carcinoma
2022-03-11, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyab073
PMID:35274717
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研究论文 | 本研究评估了帕博利珠单抗与卡培他滨和奥沙利铂联合治疗晚期胆道癌的反应率和临床疗效 | 本研究强调了针对个体化胆道癌肿瘤精确表征的设计框架 | NA | 评估帕博利珠单抗与卡培他滨和奥沙利铂联合治疗晚期胆道癌的反应率和临床疗效 | 晚期胆道癌患者 | NA | 胆道癌 | 免疫组织化学（IHC） | NA | 肿瘤活检样本 | 11名患者 |
| 9267 | 2024-08-26 |
Deciphering tissue structure and function using spatial transcriptomics
2022-03-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03175-5
PMID:35273328
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综述 | 本文综述了空间转录组学（ST）数据分析中的关键问题和当前应用的方法，并探讨了未来的发展方向 | NA | NA | 探讨空间转录组学数据分析中的问题和未来发展 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9268 | 2024-08-26 |
Single-cell RNA-seq reveals clonal diversity and prognostic genes of relapsed multiple myeloma
2022-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.757
PMID:35297204
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了复发性多发性骨髓瘤的克隆多样性和预后基因 | 首次通过单细胞RNA测序和可变多样性结合区域靶向测序技术，分析了多发性骨髓瘤细胞的克隆类型，并识别了与疾病进展和复发相关的潜在生物标志物 | 研究样本仅包括18名患者，可能不足以全面代表所有多发性骨髓瘤患者的情况 | 旨在通过单细胞技术解析多发性骨髓瘤的疾病异质性，并识别新的生物标志物以改善患者分层和治疗结果预测 | 新诊断的多发性骨髓瘤和难治性/复发性多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和可变多样性结合区域靶向测序（scVDJ-seq） | CCA算法 | 基因表达数据 | 18名患者，其中12名新诊断的多发性骨髓瘤患者和6名难治性/复发性多发性骨髓瘤患者 |
| 9269 | 2024-08-26 |
Molecular divergence of mammalian astrocyte progenitor cells at early gliogenesis
2022-03-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199985
PMID:35253855
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哺乳动物大脑发育早期星形胶质细胞前体细胞（APCs）的分子分化 | 首次揭示了哺乳动物大脑发育早期APCs的分子分化，并发现了两个分子上不同的APC亚群，分别标记为Sparc和Sparcl1 | NA | 探究哺乳动物大脑发育过程中星形胶质细胞前体细胞的分子分化 | 胚胎小鼠前脑的前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9270 | 2024-08-26 |
Tumor Heterogeneity and Molecular Characteristics of Glioblastoma Revealed by Single-Cell RNA-Seq Data Analysis
2022-02-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13030428
PMID:35327982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了胶质母细胞瘤的肿瘤异质性和分子特征 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了胶质母细胞瘤的异质性，并识别了94个在肿瘤和周边细胞中差异表达的基因，构建了组织特异性的共表达网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 本研究仅分析了四个原发性IDH-WT胶质母细胞瘤患者的3389个细胞，样本量较小 | 理解胶质母细胞瘤的异质性和疾病预后机制 | 胶质母细胞瘤的肿瘤异质性和分子特征 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3389个细胞，来自四个原发性IDH-WT胶质母细胞瘤患者 |
| 9271 | 2024-08-26 |
Diversification of multipotential postmitotic mouse retinal ganglion cell precursors into discrete types
2022-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73809
PMID:35191836
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了新生（后有丝分裂）小鼠视网膜神经节细胞（RGC）前体细胞如何分化成约45种不同类型 | 研究表明RGC转录组类型身份并非在有丝分裂退出时指定，而是通过后有丝分裂多潜能前体细胞的逐步、非同步限制获得 | NA | 研究神经元类内离散类型的分子分化 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞的分化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约45种不同类型的小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 |
| 9272 | 2024-08-26 |
The Transcriptional Cell Atlas of Testis Development in Sheep at Pre-Sexual Maturity
2022-Jan-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb44020033
PMID:35723319
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研究论文 | 本研究使用10× Genomics Chromium单细胞RNA测序技术，对三只三个月大的公羊睾丸发育过程中的12,843个睾丸细胞进行了测序，并鉴定了多种细胞类型及其特定标记基因 | 首次在羊的睾丸发育过程中使用单细胞RNA测序技术，揭示了不同细胞类型及其在不同分化状态下的特定标记基因 | NA | 探索羊睾丸在性成熟前的发育过程及其细胞类型和分化状态 | 羊睾丸中的细胞类型及其在性成熟前的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12,843个睾丸细胞 |
| 9273 | 2024-08-26 |
Basal-Like Cell-Conditioned Medium Exerts Anti-Fibrotic Effects In Vitro and In Vivo
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.844119
PMID:35350187
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研究论文 | 研究证实基底样细胞在特发性肺纤维化中的存在及其对纤维化的抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序和体外实验证实基底样细胞通过旁分泌机制抑制特发性肺纤维化中的纤维化过程 | NA | 验证基底样细胞在特发性肺纤维化中的存在及其对纤维化的影响 | 特发性肺纤维化中的基底样细胞及其对纤维化的影响 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及特发性肺纤维化患者的肺组织样本及受博来霉素损伤的实验鼠 |
| 9274 | 2024-08-26 |
Exploring the Genomic Patterns in Human and Mouse Cerebellums Via Single-Cell Sequencing and Machine Learning Method
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.857851
PMID:35309141
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法探索人鼠小脑的基因组模式 | 使用基因表达谱作为特征，实现了对不同小脑细胞类型的高效分类，揭示了人鼠小脑基因组模式的显著差异 | NA | 识别人鼠小脑四种亚细胞类型之间的转录差异 | 人鼠小脑的四种亚细胞类型：Golgi、颗粒、中间神经元和单极刷细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 分类模型 | 基因表达数据 | 共使用了321,387个单细胞测序数据，包括四种细胞类型：Golgi（5,048个，1.57%）、颗粒（250,307个，77.88%）、中间神经元（60,526个，18.83%）和单极刷细胞（5,506个，1.72%） |
| 9275 | 2024-08-26 |
Definitive hematopoietic stem cells minimally contribute to embryonic hematopoiesis
2021-09-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109703
PMID:34525360
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学和谱系追踪方法，探讨了造血干细胞在胚胎造血中的贡献及其功能特性 | 定义了区分新生造血干细胞与胚胎血祖细胞的基因特征，并发现造血干细胞在胚胎发育阶段的淋巴骨髓贡献显著延迟 | NA | 揭示新生造血干细胞的自更新能力和分化延迟特性，以及造血干细胞独立胚胎祖细胞在发育造血中的作用 | 造血干细胞及其在胚胎造血中的功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9276 | 2024-08-26 |
Chromosomal instability accelerates the evolution of resistance to anti-cancer therapies
2021-09-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.07.009
PMID:34352222
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研究论文 | 研究探讨了染色体不稳定性（CIN）如何促进肿瘤细胞对癌症疗法的抗性发展 | 发现短暂的CIN可以重复性地加速肿瘤细胞对癌症疗法的抗性获取，并揭示了这种抗性发展与特定染色体丢失事件相关 | 研究主要在细胞水平进行，尚未在临床样本中验证这些发现 | 探究染色体不稳定性如何影响肿瘤细胞对癌症疗法的抗性 | 人类肿瘤细胞及其对不同抗癌疗法的反应 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9277 | 2024-08-26 |
The genetic architecture of Parkinson's disease
2020-02, The Lancet. Neurology
DOI:10.1016/S1474-4422(19)30287-X
PMID:31521533
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研究论文 | 本文探讨了帕金森病的遗传结构，包括罕见和常见遗传变异对疾病风险、发作和进展的贡献 | 本文介绍了新兴技术如机器学习、单细胞RNA测序和高通量筛选在研究帕金森病遗传风险中的应用 | 大多数已识别的风险变异是在欧洲血统的患者中发现的，对其他人群的帕金森病遗传学了解较少 | 进一步识别与疾病相关的常见遗传变异，并开始识别罕见风险等位基因 | 帕金森病的遗传结构和风险等位基因的生物学功能 | 遗传学 | 帕金森病 | 机器学习, 单细胞RNA测序, 高通量筛选 | NA | 遗传变异数据 | 90个独立的风险相关变异 |
| 9278 | 2024-08-25 |
A highly neutralizing human monoclonal antibody targeting a novel linear epitope on staphylococcal enterotoxin B
2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2024.2360338
PMID:38857905
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs中鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487，并通过X射线晶体学和功能研究验证了其高效中和SEB的能力 | 本研究首次鉴定出一种针对SEB的新型线性表位的人源单克隆抗体Hm0487，并揭示了其通过别构效应而非竞争受体结合位点来中和SEB的机制 | NA | 研究旨在发现和验证一种新型的人源单克隆抗体，用于中和SEB的毒性及其引起的感染 | SEB毒素及其引起的中毒性休克综合征 | NA | 中毒性休克综合征 | 单细胞测序，X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 从参与五价疫苗临床试验的志愿者中分离的PBMCs |
| 9279 | 2024-08-25 |
Transcriptomic analysis of mouse TRAMP cell lines and tumors provide insights into shared pathways and therapeutic targets
2024-Oct, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2024.100184
PMID:39175940
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研究论文 | 本研究比较了不同小鼠前列腺癌模型的基因表达谱，重点关注TRAMP转基因模型及其衍生细胞系，并扩展到相关的遗传工程小鼠模型和人类前列腺癌数据集 | 本研究通过RNA测序分析，揭示了TRAMP模型中细胞周期调控、免疫反应和有丝分裂过程的上调基因，以及TC2和TC2R细胞在ECM组织、组织发育、细胞因子和运动基因表达上的差异 | NA | 研究旨在通过比较不同前列腺癌小鼠模型的基因表达谱，揭示共同通路和治疗靶点 | TRAMP转基因小鼠模型及其衍生细胞系，以及其他遗传工程小鼠模型和人类前列腺癌数据集 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及TRAMP细胞、TC2细胞、TC2R细胞及其肿瘤，以及人类前列腺癌数据集 |
| 9280 | 2024-08-25 |
Association Between COVID-19 and Neurological Diseases: Evidence from Large-Scale Mendelian Randomization Analysis and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2024-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-03975-2
PMID:38300446
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析，探讨了COVID-19与神经系统疾病之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析，揭示了SARS-CoV-2感染与癫痫和躁狂等神经系统疾病的因果关系 | 研究未观察到COVID-19对其他特征的显著影响 | 评估SARS-CoV-2感染与神经系统疾病之间的因果关系，并分析SARS-CoV-2在细胞水平的潜在入侵途径 | SARS-CoV-2感染与神经系统疾病的关系 | NA | 神经系统疾病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 23种细胞亚型 |