单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 41796 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-07-10 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究急性损伤大脑皮层中内皮细胞EphA4敲除对星形胶质细胞转录组变化的影响，揭示了内皮-星形胶质细胞相互作用的介导机制 | 首次通过内皮细胞特异性EphA4敲除模型结合单细胞RNA测序，系统解析了创伤性脑损伤后内皮细胞与星形胶质细胞之间的细胞特异性互作机制，并验证了一个新的Sox9+/Mertk+星形胶质细胞簇在凋亡细胞清除和抗炎反应中的介导作用 | 未提及具体局限性，但可能包括实验模型（小鼠）与人类的差异、单细胞测序覆盖深度有限、仅关注急性期变化等 | 探究内皮细胞EphA4受体在调节受损大脑皮层中细胞特异性转录组变化中的作用，特别关注内皮-星形胶质细胞互作 | 实验性创伤性脑损伤小鼠模型中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤（神经系统疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA（未明确样本数量，但涉及小鼠内皮细胞特异性EphA4敲除组与对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 902 | 2026-07-10 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
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研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA测序分析性能 | 首次系统比较Oxford Nanopore Technologies (ONT)和Pacific Biosciences (PacBio)两种第三代测序技术在单细胞RNA测序分析中的性能，并使用NGS作对照评估其在细胞类型鉴定、新异构体识别和等位基因特异性表达方面的表现 | 未明确提及限制 | 系统性评估ONT和PacBio平台在单细胞RNA-seq分析中的性能，为单细胞转录组研究设计测序策略提供指导 | 来自相同单细胞cDNA文库的不同数量细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不同数量细胞的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA测序 | ONT, PacBio | ONT长读长测序平台, PacBio长读长测序平台 |
| 903 | 2026-07-10 |
Life-long microbiome rejuvenation improves intestinal barrier function and inflammaging in mice
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02089-8
PMID:40176137
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研究论文 | 通过长期肠道微生物组年轻化干预，评估其对小鼠肠道屏障功能和炎症老化的改善作用 | 首次在非反刍哺乳动物中证明终生反复粪菌移植（FMT）可延缓衰老相关过程，并利用单细胞RNA测序揭示肠道细胞表型变化机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类转化的可行性尚未验证；未对特定细菌菌株或代谢产物进行因果验证 | 探索终生肠道微生物组年轻化策略是否能够延缓或预防哺乳动物的衰老进程 | 小鼠（年轻供体与同龄受体） | 机器学习, 数字病理学 | 老年疾病 | 粪菌移植（FMT）, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据 | 小鼠，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学 | NA | NA |
| 904 | 2026-07-10 |
Faecalibacterium prausnitzii-derived outer membrane vesicles reprogram gut microbiota metabolism to alleviate Porcine Epidemic Diarrhea Virus infection
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02078-x
PMID:40176190
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研究论文 | 探讨粪杆菌外膜泡通过重编程肠道菌群代谢减轻猪流行性腹泻病毒感染的作用机制 | 首次发现粪杆菌外膜泡是缓解PEDV感染的主要功能成分，并揭示其通过增加磷脂酰胆碱水平、改变肠道细胞组成及抑制坏死性凋亡信号通路的新机制 | 研究仅基于猪仔模型，且未在人体中验证该益生菌及外膜泡的潜在应用 | 探究粪杆菌在减轻猪流行性腹泻病毒感染中的作用及其机制 | 粪杆菌及其外膜泡在PEDV感染猪仔模型中的作用 | 微生物组学 | 猪流行性腹泻 | 蛋白质组学、非靶向代谢组学、小RNA测序、宏基因组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA、DNA序列、单细胞数据 | 猪仔模型，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞测序用于分析肠道细胞相对丰度 |
| 905 | 2026-07-10 |
CellBouncer, A Unified Toolkit for Single-Cell Demultiplexing and Ambient RNA Analysis, Reveals Hominid Mitochondrial Incompatibilities
2025-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.23.644821
PMID:40166335
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研究论文 | 提出CellBouncer工具包用于单细胞测序中的多路分解和背景RNA分析，并揭示人科线粒体不相容性 | 首次统一处理单细胞测序数据中的多路分解与背景RNA分析，并发现跨物种线粒体不相容性 | 可能受限于特定实验设计和细胞融合模型，通用性需进一步验证 | 开发并验证用于合并实验单细胞测序数据的计算工具 | 细胞混合物（多物种、多个体）、线粒体单倍型、脂质偶联条形码、CRISPR sgRNA和四倍体复合细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 10个细胞融合系的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 906 | 2026-07-10 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-03, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞测序，研究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症之间的关系，揭示CD3水平在CD28+ CD4+ T细胞上通过改变人疱疹病毒6型抗体比例影响MS进展 | 首次通过孟德尔随机化结合单细胞测序，发现CD3在特定T细胞上的水平通过调节HHV-6抗体反应影响MS进展的因果关系 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或因果推断的假设限制 | 探究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症之间的因果关系，并识别潜在的感染病原体 | MS患者与对照组的免疫细胞浸润及抗体反应关联 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 907 | 2026-07-10 |
Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria
2025-01-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr0932
PMID:39847624
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研究论文 | 结合1000倍体积膨胀和多重误差鲁棒荧光原位杂交技术，创建细菌MERFISH方法，实现单个细菌内数千个操纵子的高通量空间分辨分析 | 首次将MERFISH技术应用于细菌空间转录组学，通过1000倍体积膨胀克服细菌mRNA高密度难题 | 未明确提及局限性 | 开发细菌高多重空间转录组学方法并研究细菌在复杂环境中的单细胞行为 | 细菌（包括炭疽杆菌和肠道共生菌） | 数字病理学 | NA | MERFISH, 膨胀显微术 | NA | 图像 | 单个细菌水平 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 细菌MERFISH（结合1000倍体积膨胀和多重误差鲁棒荧光原位杂交） |
| 908 | 2026-07-10 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-01-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析33例胶质瘤，在IDH野生型胶质母细胞瘤中鉴定出两种不同的髓源性抑制细胞亚群，并揭示其与肿瘤干细胞的相互作用 | 首次在人类胶质母细胞瘤中鉴定出早期祖细胞型MDSC和单核细胞型MDSC两种亚群，并发现它们与代谢性干细胞样肿瘤细胞在假栅栏区的空间共定位和配体-受体相互作用的分子机制 | 未提及具体局限性 | 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤生长和免疫逃逸中的作用 | 33例胶质瘤的免疫细胞和肿瘤细胞 | 计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 33例胶质瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台，10x Visium空间转录组学平台 |
| 909 | 2026-07-10 |
Single-cell RNA sequencing: an emerging tool revealing dysregulated innate and adaptive immune response at single cell level in Kawasaki disease
2025-01, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2401105
PMID:39230194
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综述 | 本文强调了单细胞RNA测序技术在川崎病中揭示先天性和适应性免疫反应失调的关键作用 | 首次系统综述scRNA-seq在川崎病免疫细胞转录组谱和信号通路表征中的高分辨率应用潜力 | 依赖现有文献数据，缺乏原始实验验证；scRNA-seq技术本身存在成本高、数据分析复杂等局限性 | 探讨scRNA-seq在川崎病诊断、预后和个性化治疗中的诊断和治疗潜力 | 川崎病患者的免疫细胞转录组和信号/反应通路 | 机器学习 | 川崎病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 910 | 2026-07-10 |
Understanding developing kidneys and Wilms tumors one cell at a time
2025, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2024.11.005
PMID:40254343
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综述 | 综述了单细胞测序技术在正常肾脏发育和肾母细胞瘤研究中的应用，讨论了不同技术的优劣及其组合策略 | 系统总结了单细胞测序技术在肾脏发育和肾母细胞瘤领域的应用，并分析了不同技术组合如何最大化生物学理解 | 未提供实验数据验证，仅基于现有文献综述技术现状 | 探讨单细胞测序技术在肾脏发育和肾母细胞瘤研究中的应用及技术选择策略 | 发育中的肾脏和肾母细胞瘤 | 数字病理学 | 肾母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 911 | 2026-07-10 |
Genomic Exploration of Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Gene Expression and Variation in Morbidly Obese Individuals
2025, Journal of obesity
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/jobe/9245699
PMID:40365443
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研究论文 | 利用整合生物信息学分析，包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq，探索非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的差异表达基因及其遗传变异，重点关注肥胖患者中NAFLD的发病机制 | 鉴定了与代谢、免疫和脂质功能相关的新基因（如和），并在肥胖患者肝细胞中过表达，同时发现这些基因的新型致病性变异可能与NAFLD相关 | 研究可能受限于样本代表性、验证范围或致病性变异的直接功能验证不足 | 通过基因表达和遗传变异分析，阐明NAFLD的疾病机制并识别潜在治疗靶点和生物标志物 | 肥胖患者的肝组织及相关基因（如和） | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝病 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，遗传变异数据 | NA | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 912 | 2026-07-10 |
Endoplasmic Reticulum Stress Induces ROS Production and Activates NLRP3 Inflammasome Via the PERK-CHOP Signaling Pathway in Dry Eye Disease
2024-12-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.34
PMID:39699913
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研究论文 | 本研究探讨内质网应激通过PERK-CHOP信号通路诱导ROS产生并激活NLRP3炎症小体在干眼症中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合体内外模型，揭示PERK-CHOP-TXNIP轴在干眼症中连接内质网应激与氧化应激及炎症的关键机制 | 未提及具体限制，如样本量较小或模型与人体差异等 | 研究内质网应激在干眼症发展中的潜在作用及其分子机制 | 干眼症小鼠模型、原代人角膜上皮细胞和永生化人角膜上皮细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、siRNA转染、免疫荧光、Western blotting、实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取干眼小鼠角膜组织scRNA-seq数据，以及东莨菪碱诱导的干眼小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat R程序分析从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 913 | 2026-07-11 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-12, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
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研究论文 | 本研究调查了甘氨酸受体亚基α1、α2、α4和β在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达谱 | 首次系统分析了甘氨酸受体四个亚基在不同性别小鼠中枢神经系统中的单细胞和整体表达模式 | RNAscope检测到Glra4的表达，但qRT-PCR未能检测到，表明低丰度转录本的检测方法存在局限性 | 明确甘氨酸受体亚基在成年小鼠中枢神经系统中的分布和性别差异 | 成年雌性和雄性小鼠的中枢神经系统组织及部分内脏器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNAscope | NA | 转录组表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠多个脑区及脊髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2026-07-10 |
Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50608-2
PMID:39080277
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研究论文 | 开发了一种名为BrainAlign的自监督学习方法，用于人类和小鼠全脑空间转录组学比对 | 提出了一种自监督学习方法，通过异构图形神经网络同时编码空间转录组学中的点和基因，实现跨物种全脑比对，并揭示了保守脑区和同源基因表达模式 | NA | 推动人类和啮齿动物全脑空间转录组学研究方法的跨物种比对 | 人类和小鼠的全脑空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 异构图形神经网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 915 | 2026-07-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
|
研究论文 | 利用CRISPR-CasRx技术靶向Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因，降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次利用CasRx RNA干扰工具结合shH10腺相关病毒，靶向调控房水循环相关基因，实现眼内压降低和视网膜神经节细胞保护，并通过单细胞测序阐明作用机制 | 研究仅限于雌性小鼠，未涉及其他性别或人类模型，且基因敲降效果的长期安全性未评估 | 探索基因治疗降低眼内压和延缓青光眼进展的新方法 | 雌性小鼠 | 基因治疗 | 青光眼 | CRISPR-CasRx, 腺相关病毒载体, 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠，具体数量未指定 | 未指定 | 单细胞测序 | 未指定 | 未指定 |
| 916 | 2026-07-10 |
Mapping the molecular landscape of Lotus japonicus nodule organogenesis through spatiotemporal transcriptomics
2024-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50737-8
PMID:39080318
|
研究论文 | 通过时空转录组学绘制百脉根根瘤器官发生的分子图谱 | 首次利用空间转录组学技术全面解析模式豆科植物百脉根根瘤发育过程中感染区和外围组织的发育轨迹，揭示了共生和物质交换的基因调控网络，并鉴定了转录因子LjNLP3在根瘤从分化到成熟转化中的关键作用 | 未提及具体限制 | 利用空间转录组学揭示百脉根根瘤器官发生的分子机制，为开发共生固氮作物提供数据支持 | 模式豆科植物百脉根（Lotus japonicus）的根瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 917 | 2026-07-10 |
Anoikis and SPP1 in idiopathic pulmonary fibrosis: integrating bioinformatics, cell, and animal studies to explore prognostic biomarkers and PI3K/AKT signaling regulation
2024-06, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2315218
PMID:38318669
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研究论文 | 整合生物信息学、细胞和动物实验，探索失巢凋亡和SPP1在特发性肺纤维化中的预后生物标志物及PI3K/AKT信号调控 | 首次通过失巢凋亡相关基因构建特发性肺纤维化的预后模型，并揭示SPP1通过PI3K/AKT通路调控肺纤维化的新机制 | 未提及具体样本量及外部验证队列 | 探究失巢凋亡在特发性肺纤维化中的相关性，识别相关生物标志物和信号通路 | 特发性肺纤维化患者及小鼠肺成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | Lasso回归、多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 未指定 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 918 | 2026-07-10 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2024-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103932
PMID:38679247
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研究论文 | 研究了蛋白磷酸酶在鸡视网膜中Müller胶质细胞转化为祖细胞过程中的调控作用 | 首次揭示了DUSP1/6和PP2C等蛋白磷酸酶在Müller胶质细胞重编程中的关键调控作用，并发现不同磷酸酶对细胞信号通路具有差异化调节 | 未对磷酸酶抑制在无损伤视网膜中的长期效果及分子机制进行深入探讨 | 探究蛋白磷酸酶对Müller胶质细胞来源祖细胞形成的调控机制 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞及其来源祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 正常和受损鸡视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 919 | 2026-07-10 |
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91060
PMID:38536726
|
研究论文 | 间歇性禁食通过促进3型先天淋巴细胞分泌IL-22从而诱导白色脂肪组织褐变 | 首次揭示肠道3型先天淋巴细胞在间歇性禁食诱导白色脂肪组织褐变中的关键作用，阐明了ILC3/IL-22/IL-22R信号轴参与间歇性禁食代谢益处的机制 | 尚未明确间歇性禁食如何具体调节ILC3细胞的芳香烃受体信号通路，以及树突状细胞和巨噬细胞与ILC3相互作用的详细分子机制 | 探究间歇性禁食促进白色脂肪组织褐变的细胞和分子机制 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及肠道免疫细胞 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对分选的肠道免疫细胞进行单细胞测序 |
| 920 | 2026-07-10 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
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研究论文 | 通过多组学和单细胞测序分析揭示昼夜节律通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次系统性地在泛癌水平上分析昼夜节律相关基因（CRGs）的表达、突变、甲基化及与免疫微环境的关系，并计算昼夜节律通路评分（CRS）以评估其作为免疫治疗标志物的潜力 | 仅依赖TCGA等公共数据库数据，缺乏大规模独立验证；未深入探讨CRGs调控肿瘤微环境的具体分子机制 | 探索昼夜节律相关基因在泛癌中的表达模式、预后价值及作为免疫治疗新靶点的可能性 | 泛癌（包括KIRC等多种肿瘤类型）的肿瘤样本及肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 泛癌（多类型肿瘤） | 多组学分析、单细胞测序、免疫组化（IHC）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据、拷贝数变异、单核苷酸变异、甲基化数据、单细胞测序数据 | 使用TCGA数据库中多个肿瘤类型的大规模样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |