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当前共找到 44757 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-10-20 |
Integrated Transcriptomic and Single-Cell Analyses Identify a T Cell-Mediated Tumor Killing Gene Signature for Prognostic Stratification and Immune Characterization in Breast Cancer
2026, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S628386
PMID:42893099
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研究论文 | 该研究整合转录组与单细胞分析，识别了5个与T细胞介导的肿瘤杀伤敏感性相关的基因特征，用于乳腺癌预后分层和免疫特征分析 | 构建了包含5个GSTTK（KCTD5、COL17A1、LRTM2、DOK7、CXCR3）的预后风险模型，并结合scRNA-seq揭示了T细胞通讯网络、分化轨迹及CCL5-CCR1通路在低风险组中的相互作用 | 回顾性设计、依赖公共数据集、缺乏功能验证、免疫组化样本量有限，临床转化前需进一步验证 | 系统阐明调控T细胞介导肿瘤杀伤敏感性的基因在乳腺癌中的预后价值及其对免疫微环境和T细胞动态的影响 | 乳腺癌患者及其基因表达数据、单细胞转录组数据和免疫组化样本 | 数字病理, 机器学习 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO回归, 免疫组化 | LASSO回归, CIBERSORT, TIDE | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 882 | 2026-10-20 |
CD74 as a Potential Adjunctive Tissue Biomarker for Bullous Pemphigoid Lesions: A Retrospective Study Integrating Bioinformatics Analysis and Experimental Validation
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S645596
PMID:42893250
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析与实验验证，鉴定并验证CD74作为大疱性类天疱疮（BP）病变的潜在辅助组织生物标志物 | 首次将CD74鉴定为BP的免疫相关差异表达基因，揭示其在真皮-表皮交界处的特征性线性分布模式，并验证其与MHC-II富集细胞及外周血嗜酸性粒细胞计数的关联 | 回顾性研究设计，样本量有限，需要在更大规模独立队列中进一步验证 | 鉴定并验证BP的潜在辅助组织生物标志物，探索其与免疫相关机制的关系 | 大疱性类天疱疮患者、健康对照者及疾病对照者（包括寻常型天疱疮、银屑病、特应性皮炎和系统性红斑狼疮患者）的皮肤组织 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 转录组分析、免疫组织化学、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 883 | 2026-10-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies a proinflammatory S100a8/a9+ macrophage subset contributing to acute kidney injury
2026-Oct-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02395-3
PMID:42892624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定出小鼠肾脏中一个独特的促炎性S100a8/a9+Ly6chigh巨噬细胞亚群，并揭示其在LPS诱导的急性肾损伤中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出LPS刺激后小鼠肾脏中独特的S100a8/a9+Ly6chigh促炎性巨噬细胞亚群，并证明S100a9缺失可通过减少CD11b+Ly6chigh巨噬细胞浸润和抑制促炎细胞因子产生来减轻急性肾损伤 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；S100a8/a9作为治疗靶点的安全性和有效性仍需进一步临床研究 | 鉴定内毒素血症诱导急性肾损伤中巨噬细胞亚群及其功能角色 | 小鼠肾脏巨噬细胞、LPS诱导或缺血再灌注损伤的急性肾损伤模型、S100a9-/-小鼠及骨髓移植受体小鼠 | 单细胞组学、免疫学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 884 | 2026-10-19 |
CXCL14+ fibroblasts promote development of IBD-associated fibrosis and cancer by interacting with SPP1+ macrophages via collagen IV secretion
2026-Oct-17, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03636-2
PMID:42892644
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研究论文 | 该文通过单核转录组、空间转录组等多组学方法揭示了CXCL14+成纤维细胞通过分泌IV型胶原与SPP1+巨噬细胞互作，促进IBD相关纤维化和癌变的机制 | 首次在单核水平揭示CXCL14+成纤维细胞是微环境中胶原的主要来源，并阐明其通过分泌IV型胶原与SPP1+巨噬细胞互作形成TGF-β1反馈环路驱动IBD相关纤维化和癌变的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究IBD相关癌症发生发展过程中细胞亚型的动态变化和相互作用机制 | IBD相关纤维化和癌变过程中的细胞亚型（CXCL14+成纤维细胞、SPP1+巨噬细胞等） | 数字病理学 | 炎症性肠病相关癌症 | 单核转录组测序，空间转录组学，生态动态建模，多重免疫组化，体外共培养，体内动物实验 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 885 | 2026-10-19 |
Spatial Neighborhood Construction and NICHES Connectomics for Differential Ligand-Receptor Analysis in Fibrotic Human Lung
2026-Oct-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70816
PMID:42891635
|
研究方法 | 本文提出了一种基于成像空间转录组数据的计算流程，在单细胞对分辨率上推断配体-受体信号，并构建空间邻域与NICHES连接组学图，用于纤维化人肺组织的差异配体-受体分析 | 在单个细胞-细胞对分辨率上保留信号推断结果，利用测量的物理距离约束候选相互作用，并将邻域定义、LR数据库和评分函数等所有建模选择作为用户可调参数暴露出来；同时构建C2C、C2N和N2C三种互补表示及邻域组成分析 | 摘要中未明确说明该流程的局限性 | 开发一个可重复、模块化且可调的计算协议，用于研究空间组织的细胞间通讯，并在纤维化肺组织中识别区分纤维化区域与周围组织的差异配体-受体机制 | 纤维化人肺组织 | 空间转录组学, 生物信息学 | 肺纤维化 | 成像空间转录组, 配体-受体分析, 连接组学分析 | NA | 空间转录组图像数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 886 | 2026-10-19 |
Enrichment of Retinal Endothelial Cells and Müller Glia Enable Comprehensive scRNA-Seq Profiling of the Blood-Retinal Barrier
2026-Oct-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/73625
PMID:42891637
|
研究方法论文 | 本文提出一种优化的鼠视网膜细胞分离方法，结合温和酶解与机械吹打并利用FACS富集血管内皮细胞和Müller胶质细胞，实现血视网膜屏障的高质量单细胞RNA测序分析 | 整合温和酶解与机械吹打以保持细胞活性并减少转录伪影，同时采用FACS靶向富集占比不足2%的稀有细胞群，并测试基于抗体的细胞哈希实现样本多重化以提升成本效率 | 摘要未明确说明富集过程可能引入的细胞状态偏差及方法在其他神经组织中的普适性仍需验证 | 建立一种能够保留细胞完整性并选择性富集稀有细胞群的鼠视网膜单细胞悬液制备方法，以支持血视网膜屏障的单细胞分辨率研究 | 鼠视网膜细胞，特别是血管内皮细胞和Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 887 | 2026-10-19 |
Early-life exposure to environmental pollutants and endocrine disruptors: emerging risks and mechanistic insights in maternal, fetal, and child health
2026-Oct-13, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125878
PMID:42869363
|
综述 | 综述早期生命暴露于环境污染物和内分泌干扰物对母体、胎儿和儿童健康的影响及其机制 | 强调生命历程视角和环境正义，整合暴露组学、多组学、单细胞测序、空间生物学和微生物组研究等新方法揭示机制 | 未提及具体研究数据，缺乏原始实验验证，主要基于现有文献总结 | 总结早期生命环境暴露的暴露途径、生物监测方法、胎盘过程、分子和表观遗传修饰及其对神经发育、代谢、内分泌和生殖的影响，并强调暴露评估、预防措施和政策框架的进展 | 孕妇、胎儿和儿童 | 环境健康与暴露组学 | 神经发育障碍, 代谢功能障碍, 内分泌异常, 生殖损伤 | 暴露组学, 高分辨率质谱, 生物监测, 被动采样, 多组学, 单细胞测序, 空间生物学, 微生物组研究 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 888 | 2026-10-19 |
Erratum: DestinyNet: A deep-learning framework for cell-fate analysis from lineage-tracing single-cell RNA sequencing data
2026-Oct-09, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2026.101692
PMID:42890739
|
更正 | 本文是对DestinyNet论文的更正声明 | 无 | 仅作为更正声明，未提供新研究内容 | 更正已发表论文中的错误 | 已发表的DestinyNet论文 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 889 | 2026-10-19 |
Disentangling batch effects and biological signals across conditions in single-cell transcriptome
2026-Oct-09, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2026.101638
PMID:42891284
|
研究论文 | 提出了一种基于变分自编码器的批次校正方法Kanade，通过分离潜在变量来区分批次效应和生物信号，实现选择性校正并保留生物特征 | 利用变分自编码器专门化潜在变量，明确解耦批次效应与生物信号，避免传统方法 indiscriminately 混合数据导致生物信号丢失，支持跨条件比较分析 | 仅在模拟和真实数据集上验证，未提及大规模临床样本或多种平台数据的广泛测试；方法依赖于变分自编码器，可能对复杂批次结构敏感 | 解决单细胞转录组分析中批次效应与生物信号混杂的问题，实现选择性批次校正以支持跨条件比较分析 | 单细胞转录组数据（包括模拟数据和真实数据集） | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | VAE | 文本（基因表达矩阵） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 890 | 2026-10-19 |
Tunable population diversity through a noise-driven differentiation switch
2026-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.20.677552
PMID:42818005
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经祖细胞在40种信号组合下的分化，揭示一种噪声驱动的分化开关可调控细胞群体多样性 | 提出噪声驱动的退火开关机制，在log细胞命运概率空间中实现加性调控，并预测早期双潜能状态 | 摘要未明确说明具体局限性 | 探究组合信号如何通过电路层面机制调控神经祖细胞分化为多样细胞类型群体的比例 | 神经祖细胞（NPCs） | 单细胞转录组学、计算生物学、发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | D-SPIN调控网络模型、分化开关电路模型 | 单细胞转录组数据 | 40种信号条件下的神经祖细胞，具体细胞数未在摘要中说明；另验证小鼠胚胎视觉皮层发育数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 891 | 2026-10-19 |
Comprehensive Molecular and Clinicopathological Profiling of Lymphatic Malformations
2026-Sep-23, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2026.106168
PMID:42772373
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研究论文 | 该研究对34例淋巴管畸形（LM）病例进行综合分子与临床病理分析，探讨PIK3CA突变与临床表现、组织病理特征及分子特征的关系 | 首次结合空间转录组学分析PIK3CA突变型LM中淋巴管内皮细胞区域基因表达，发现NFATC1上调及钙调磷酸酶-NFAT通路可能参与LM发病机制 | 回顾性研究设计且样本量较小（34例），空间转录组仅分析了2例PIK3CA突变型LM病例 | 阐明PIK3CA突变与淋巴管畸形临床表现、组织病理学特征及分子特征之间的关系，探索LM的发病机制 | 34例淋巴管畸形（LM）患者的病变组织 | 数字病理学、分子病理学 | 淋巴管畸形、血管畸形 | 靶向下一代测序（NGS）、免疫组化、空间转录组学 | NA | 基因序列、组织切片图像、空间转录组数据 | 34例LM病例（其中20例PIK3CA突变型，14例非突变型），空间转录组分析2例PIK3CA突变型LM | NA | 靶向NGS、空间转录组学 | 定制基因panel、空间转录组平台 | NA |
| 892 | 2026-10-19 |
Ragomics-Meta: An open-source, scalable, reproducible, and extensible multi-omics analysis workflow
2026-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70121
PMID:42890790
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研究论文 | 本文介绍了一个开源、可扩展、可重复且可扩展的多组学分析工作流Ragomics-Meta，用于以代谢为中心的分析 | 整合了scRNA/snRNA-seq、空间转录组学、scATAC-seq和代谢组学模块，结合多个成熟工具和基于gutMGene的 curated 资源，并加入AI辅助解读 | 摘要中未明确提及局限性 | 提供用户友好的框架，用于整合单细胞和空间多组学分析，系统表征肿瘤代谢程序和宿主-微生物组相互作用 | 肿瘤代谢程序及宿主-微生物组相互作用 | 多组学分析 | 癌症 | scRNA-seq, snRNA-seq, 空间转录组学, scATAC-seq, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞ATAC-seq数据, 代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics, single-cell ATAC-seq, metabolomics | NA | NA |
| 893 | 2026-10-19 |
Gene expression signatures from single-cell transcriptomics predict Sjögren's syndrome
2026-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70106
PMID:42891305
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研究论文 | 该研究通过分析干燥综合征患者外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据，构建了基于12个基因特征的机器学习诊断模型 | 首次基于单细胞转录组数据构建干燥综合征的12基因预测模型，并在临床样本中验证了关键基因 | 样本量有限，模型需要在更大规模人群中验证，单细胞数据仅来自外周血未涉及唾液腺等靶组织 | 绘制干燥综合征单细胞免疫图谱并开发可靠的分子诊断标签 | 干燥综合征患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学、机器学习 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、实时定量PCR | 机器学习 | 单细胞转录组数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 894 | 2026-10-19 |
Renin Is Critical for Renin-Lineage Cell Plasticity, Migration, and Disease Outcome in Experimental Crescentic GN
2026-Aug-24, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001239
PMID:42636057
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研究论文 | 该研究利用tdTomato谱系示踪技术，在野生型和肾素敲除小鼠中追踪肾素谱系细胞在新月体性肾小球肾炎中的迁移与转录程序变化，并结合单细胞RNA测序分析其分子机制 | 首次揭示肾素表达对肾素谱系细胞可塑性、迁移及疾病结局的关键作用，并结合谱系示踪与单细胞转录组学解析肾素缺失导致的干扰素驱动和抗迁移表型 | 肾素谱系细胞消融仅减少巨噬细胞浸润而对整体疾病严重程度影响有限，研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究肾素谱系细胞及其肾素表达在新月体性肾小球肾炎中的作用及机制 | 野生型小鼠和肾素敲除小鼠的肾素谱系细胞及肾小球 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、谱系示踪、组织学定量 | NA | 图像、文本 | 野生型和RenKO小鼠损伤后第10天和第21天分离的tdTomato阳性细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 895 | 2026-10-19 |
scDIVA: semi-supervised integration and fine-grained annotation of tumor-immune single-cell atlases
2026-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.07.743520
PMID:42845344
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研究论文 | 提出了一种半监督深度生成模型scDIVA，用于肿瘤免疫单细胞图谱的精细标签转移与整合，并检测查询集中参考图谱缺失的细胞状态 | 将域不变变分自编码器适配于scRNA-seq，通过三个编码器分离细胞类型、批次和残差变异，细胞类型嵌入天然具有批次不变性；同时改进了Milo差异丰度框架以检测查询集富集群体 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 实现肿瘤免疫微环境单细胞图谱的精细注释与整合，并识别参考图谱中不存在的查询集细胞群体 | 肿瘤免疫微环境单细胞图谱，涵盖五种癌症类型的六个图谱 | 单细胞分析、机器学习 | 肿瘤、肺癌、结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 域不变变分自编码器（Domain Invariant Variational Autoencoder）、深度生成模型 | 基因表达谱数据（单细胞转录组） | 六个肿瘤免疫图谱，涵盖五种癌症类型，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 896 | 2026-10-19 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
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研究论文 | 提出GatorST框架，结合图建模与元学习策略学习空间转录组数据的空间感知表示 | 显式整合局部（邻居级）与全局（组织级）上下文，用两跳子图捕捉细粒度空间上下文，用基因表达聚类生成伪标签提供弱监督，并引入元学习启发的episodic训练策略增强泛化能力，避免依赖易引入噪声的对比学习增强策略 | 摘要中未明确说明 | 有效学习空间转录组数据的空间表示，稳健整合空间信息与转录组信息以支持下游分析 | 空间转录组（ST）数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 图神经网络、对比元学习框架 | 基因表达谱与空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 897 | 2026-10-19 |
SPT6 maintains epidermal homeostasis by inhibiting an NF-κB-positive feedback loop to prevent excessive inflammation
2026-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-026-01410-1
PMID:41922599
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研究论文 | 该文章通过条件性敲除小鼠模型研究SPT6在表皮和免疫稳态中的作用，发现SPT6缺失会导致自发性银屑病样皮肤炎症和伤口愈合延迟，单细胞RNA测序揭示了炎症相关的角质细胞亚群，机制上SPT6通过结合RELA基因增强子抑制NF-κB信号的正反馈环路 | 首次揭示了SPT6作为表皮免疫静息和组织完整性的关键调节因子，提出了皮肤默认状态可能易于发生炎症、需要SPT6等因子主动抑制以维持表皮稳态的新范式 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证SPT6在表皮免疫稳态中的作用 | 探究SPT6在表皮和免疫稳态中的作用及其分子机制 | 条件性敲除小鼠模型（K14-CreERT; Supt6）的表皮基底角质细胞 | 分子生物学、免疫学 | 银屑病、皮肤炎症 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 898 | 2026-10-19 |
Comprehensive analysis of ATF3 as a diagnostic and prognostic biomarker from pan-cancer to clear cell renal cell carcinoma
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05113-x
PMID:42056650
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研究论文 | 该研究通过泛癌分析及肾透明细胞癌（KIRC）的多层次验证，系统评估ATF3作为诊断和预后生物标志物的潜力及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次从泛癌视角系统分析ATF3的诊断和预后价值，并结合单细胞RNA测序揭示ATF3在KIRC中主要表达于AEAs/DVR细胞早期分化阶段 | 摘要未明确说明研究队列的具体样本量及外部验证队列情况，单细胞层面的机制探索仍需进一步功能实验验证 | 系统阐明ATF3在泛癌尤其是肾透明细胞癌中的表达特征、诊断和预后价值及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 多种癌症类型的公共数据库样本及肾透明细胞癌细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 实时定量PCR、Western blot、免疫荧光、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 899 | 2026-10-19 |
GPR124 regulates hyaloid blood vessel regression and is associated with endothelial-mesenchymal transition
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50835-1
PMID:42056280
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研究论文 | 该研究通过内皮特异性Gpr124敲除小鼠模型，揭示GPR124调控玻璃体血管退化并与内皮-间质转化相关 | 首次鉴定GPR124为玻璃体血管退化的关键调控因子，并发现其在玻璃体血管与视网膜血管生成中功能具有高度区室特异性 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证；GPR124下游具体分子机制及EndMT的因果作用仍需进一步探究 | 探究GPR124在玻璃体血管退化过程中的作用及其下游机制 | 内皮特异性他莫昔芬诱导型Gpr124敲除小鼠的玻璃体血管内皮细胞 | 血管生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2026-10-19 |
DestinyNet: A deep-learning framework for cell-fate analysis from lineage-tracing single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101471
PMID:42005385
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研究论文 | 该文提出了DestinyNet，一个用于谱系追踪单细胞RNA测序数据进行细胞命运分析的多任务深度学习框架。 | 提出多任务深度学习框架DestinyNet，通过细胞关系三元组实现端到端细胞表示学习，同时解决命运聚类、命运流和命运预测三个关键挑战，并能适应静态、累积和动态条形码等多种LT-scSeq数据类型。 | 摘要中未明确说明研究的局限性。 | 开发一个准确、鲁棒且可扩展的细胞命运分析框架，以解析细胞发育动态，包括谱系承诺、分化和疾病进展。 | 谱系追踪单细胞RNA测序数据，包括造血分化和成纤维细胞重编程等数据集。 | 单细胞组学、计算生物学、机器学习 | NA | 谱系追踪单细胞RNA测序（LT-scSeq） | 多任务深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 谱系追踪单细胞RNA测序 | NA | NA |