单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 43167 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-09-02 |
A unified developmental timeline of pigmented ocular tissues in the mouse eye
2026-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111178
PMID:42486250
|
研究论文 | 本研究利用基于过氧化氢的温和漂白方法结合免疫组化和单细胞RNA-seq数据，构建了小鼠眼睛中所有色素组织发育的统一时间线 | 首次建立了小鼠眼睛中所有色素组织（包括RPE、脉络膜、睫状体和虹膜）的发育统一图谱，并发现出生后多个眼周组织存在协调的黑色素生成爆发 | 研究仅基于小鼠模型，其结论可能不完全适用于人类眼睛发育；此外，单细胞RNA-seq数据为已有数据集，可能缺乏某些时间点的数据 | 建立小鼠眼睛色素组织发育的统一时间线，为研究眼睛发育和疾病提供框架 | 小鼠眼睛的色素组织，包括视网膜色素上皮、脉络膜、睫状体和虹膜 | 发育生物学 | NA | 免疫组化（IHC），单细胞RNA-seq | NA | 图像，基因表达数据 | 小鼠胚胎日14.5至出生后日14的每日样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 882 | 2026-09-02 |
Opportunities and challenges for the application of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics in ischemic stroke
2026-Oct, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115901
PMID:42402308
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用，涵盖技术原理、平台特点、病理机制发现及临床转化前景。 | 聚焦于揭示缺血后细胞动态演变、梗死核心与半暗带的空间分子异质性，以及人类与小鼠模型的差异，并提出了LGALS9-CD44修复信号轴、OPC移植优化和IS分子分型等关键突破。 | 包括脑细胞捕获效率低、空间分辨率与灵敏度矛盾、人类样本匮乏且标准化不足，以及临床转化障碍。 | 探讨scRNA-seq和ST在缺血性卒中中的核心原理、平台应用及临床转化潜力，以推动精准诊疗。 | 缺血性卒中相关细胞类型，如少突胶质前体细胞，以及梗死核心和半暗带组织。 | 单细胞组学、空间转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 883 | 2026-09-02 |
Treatment of multiple sclerosis with peptide-coupled red blood cells induces antigen-specific T regulatory cells
2026-Sep-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2614908123
PMID:42673466
|
研究论文 | 该研究开发了一种基于自体红细胞偶联髓鞘肽的治疗方法，并在多发性硬化症的Ib期临床试验中评估其安全性和免疫耐受诱导效果 | 首次采用肽偶联红细胞作为耐受性载体在多发性硬化症中进行临床试验，并整合单细胞RNA测序和影像学及临床指标评估 | 开放标签、剂量递增设计可能引入偏倚，且样本量有限 | 评估肽偶联红细胞疗法在多发性硬化症中诱导抗原特异性免疫耐受的安全性和可行性 | 多发性硬化症患者和实验小鼠 | 免疫疗法 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床影像、单细胞转录组数据 | Ib期临床试验涉及患者数量未在摘要中明确，但为小样本剂量递增研究 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组分析 |
| 884 | 2026-09-02 |
Integrated placental microarray and single-cell transcriptomic analysis prioritizes Trp-Kyn-NAD+ axis-related candidate markers in pre-eclampsia
2026-Sep-04, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD26131
PMID:42675787
|
研究论文 | 整合胎盘微阵列和单细胞转录组分析，优先筛选先兆子痫中Trp-Kyn-NAD+轴相关候选标志物 | 首次在先兆子痫胎盘中定位Trp-Kyn-NAD+轴相关基因的细胞类型特异性表达，并优先筛选出AFMID、ENPP1、IDO1和NT5E作为候选标志物 | 外部验证队列较小，四基因模型的判别能力中等，探索性分析结果需在更大队列和实验系统中进一步验证 | 定位先兆子痫胎盘中Trp-Kyn-NAD+轴相关基因的细胞类型表达，并优先筛选候选标志物 | 先兆子痫胎盘的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 微阵列、单细胞RNA测序 | 固定四基因模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | GSE75010（发现队列）、GSE24129（外部验证队列，小规模）、GSE173193（单细胞数据集） | NA | 微阵列、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 885 | 2026-09-02 |
Organ-Specific Cancer-Associated Fibroblast Subtypes Across the Digestive System Linked to Cancer Hallmarks
2026-Sep, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70435
PMID:42222902
|
研究论文 | 该研究整合了14个独立的单细胞RNA测序数据集和18个批量转录组队列，定义了消化系统胃肠道腺癌中八种癌症相关成纤维细胞（CAF）亚型，并探讨其器官特异性分布、功能状态、空间组织及临床预后关联 | 首次跨多个胃肠道癌症类型系统性地识别出八种CAF亚型，并揭示其器官特异性分布；结合机器学习去卷积、空间转录组学等多层次分析，阐明了肌成纤维细胞CAF亚型（myCAF1和myCAF2）与不良预后及免疫抑制微环境的关系，而炎症性CAF亚型（iCAF1）与良好预后和抗肿瘤免疫相关 | 主要基于公共数据集，样本来源可能存在批次效应；功能验证和机制实验不足，未能完全阐明CAF亚型在肿瘤进展中的因果作用；预后关联基于回顾性分析，需前瞻性验证 | 定义胃肠道癌症中CAF的异质性、组织特异性和临床相关性，并探索其功能状态和空间分布对肿瘤进展和患者结局的影响 | 胃肠道腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）亚型及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、空间转录组学 | 机器学习模型（用于去卷积） | 基因表达数据 | 239例胃肠道腺癌样本（来自14个单细胞数据集）和3396例患者（来自18个批量转录组队列） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 886 | 2026-09-02 |
Comparative anti-viral immune strategies in insects and vertebrates: Insights from Bombyx mori
2026-Sep, Developmental and comparative immunology
IF:2.7Q1
DOI:10.1016/j.dci.2026.105695
PMID:42508549
|
综述 | 本文综合比较了家蚕与脊椎动物的抗病毒免疫策略，包括经典信号通路、表观遗传调控和RNA介导的防御机制，并讨论了新兴技术及其转化应用。 | 首次整合信号通路、RNA和表观遗传调控，提出跨物种的网络模型，并强调昆虫特有机制如黑化与脊椎动物干扰素反应的差异。 | 作为综述，未提供新的实验数据，且对具体机制细节的描述可能受限于现有研究。 | 阐明家蚕与脊椎动物抗病毒免疫的保守性和特异性，为机制研究和抗病毒策略开发提供概念框架。 | 家蚕（Bombyx mori）和脊椎动物，及其抗病毒免疫机制。 | 免疫学，比较基因组学 | 病毒性疾病 | NA | NA | 文本，基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 887 | 2026-09-02 |
Spatial Transcriptomics and Bulk RNA-Seq Analysis Revealed Molecular Classification of Invasive Lobular Carcinoma
2026-Sep, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70413
PMID:42166521
|
research paper | 通过空间转录组学和批量RNA测序分析，对浸润性小叶癌进行了分子分型，揭示了其分子异质性和预后相关性 | 首次将空间转录组学应用于浸润性小叶癌的分子分型，发现了三种新的分子亚型（增殖型、免疫反应型和基质丰富型），并展示了分子分型相比传统组织学分类在预后预测上的优势 | 样本量较小（仅4例C-ILC和4例P-ILC），且分子亚型与组织学亚型不完全对应，需要进一步验证 | 明确经典浸润性小叶癌和多形性浸润性小叶癌之间的分子差异，并建立基于分子特征的亚型分类 | 浸润性小叶癌样本，包括经典型和多形型 | digital pathology | breast cancer | spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | gene expression data, spatial transcriptomic data | 8个新鲜冷冻样本（4例C-ILC和4例P-ILC） | NA | spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 888 | 2026-09-02 |
A Phase I and Biodistribution Study of Ifabotuzumab, a Humanized Agonistic EphA3-Targeted Antibody, in Patients with Recurrent Glioblastoma
2026-Sep-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3608
PMID:42268288
|
研究论文 | 一项关于人源化激动性EphA3靶向抗体Ifabotuzumab在复发性胶质母细胞瘤患者中的I期和生物分布研究 | 首次在复发性胶质母细胞瘤患者中进行Ifabotuzumab的I期和生物分布研究，结合89Zr标记抗体的PET成像和空间转录组分析，揭示了EphA3在肿瘤微环境中的表达和调节作用 | 样本量小（12名患者），未观察到客观缓解，长期疗效需进一步验证 | 评估Ifabotuzumab在复发性胶质母细胞瘤患者中的安全性、耐受性、生物分布和初步疗效 | 患有可测量肿瘤的复发性胶质母细胞瘤成人患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 12名患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 889 | 2026-09-02 |
Single-cell RNA sequencing uncovers m6A regulator-defined T-cell subpopulations and YTHDF1-HSP90AB1-MYC therapeutic axis in T-cell acute lymphoblastic leukemia
2026-Sep-01, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004239
PMID:42675534
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，本研究刻画了m6A调节因子定义的T细胞亚群，并揭示了YTHDF1-HSP90AB1-MYC轴在T细胞急性淋巴细胞白血病发生发展中的作用 | 首次在T-ALL中基于m6A调节因子表达定义了T细胞亚群，并阐明了YTHDF1通过稳定HSP90AB1维持MYC信号的新机制 | 研究样本量较小，且YTHDF1的调控机制可能需要在更大队列中进一步验证 | 表征m6A调节因子定义的T细胞亚群，并阐明YTHDF1在T-ALL白血病发生中的作用 | 17例儿童T-ALL患者和3例健康供者的T细胞，以及Jurkat和Molt4细胞系和非肥胖糖尿病/重症联合免疫缺陷小鼠异种移植模型 | 单细胞转录组学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、非负矩阵分解、细胞通讯分析、拟时分析、单细胞调控网络推断和聚类、慢病毒介导的基因敲低、甲基化RNA免疫沉淀定量PCR、RNA免疫沉淀定量PCR、RNA稳定性测定、Western blot | 非负矩阵分解、CellChat、Monocle、单细胞调控网络推断和聚类 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、实验数据 | 17例儿童T-ALL患者和3例健康供者 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 890 | 2026-09-02 |
Elevations of Th17.1 Cells (CXCR3+ CCR6+ T Cells With IL-17A and IFN-γ Production) in Peripheral Blood of Patients With Lung Cancer
2026-Sep-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70197
PMID:42677449
|
研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术和空间转录组学分析，发现肺癌患者外周血中Th17.1细胞显著升高，并证实其与肿瘤微环境重塑相关，提示其可作为非侵入性生物标志物 | 首次在严格年龄和性别匹配的背景下，结合空间转录组学验证了外周血Th17.1细胞升高是肿瘤驱动的真实事件，并关联到三级淋巴结构新生 | 未提及具体局限性信息 | 阐明肺癌患者中由肿瘤驱动的外周T细胞改变，特别是Th17.1细胞的系统性变化 | 肺癌患者外周血T细胞及肿瘤组织中的Th17.1细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 多参数流式细胞术，空间转录组学 | NA | 流式细胞术数据，空间转录组数据 | 121例肺癌患者及年龄、性别匹配的健康对照 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 891 | 2026-09-02 |
Spatial profiling identifies a distinct and topographically-defined tumor microenvironment that emerges during multiple myeloma evolution
2026-Sep-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-26-0080
PMID:42678098
|
研究论文 | 利用空间转录组学和成像质谱流式技术，揭示多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤微环境的空间组织及其对预后的影响 | 首次通过空间转录组学和成像质谱流式技术，在多发性骨髓瘤中识别出空间定义的肿瘤微环境，并发现密集肿瘤结节的形成与疾病进展及不良预后相关 | 摘要未明确提及本研究的局限性 | 探究多发性骨髓瘤进展中肿瘤微环境的空间组织及其与疾病演变和预后的关系 | 多发性骨髓瘤患者骨髓样本中的肿瘤细胞和微环境细胞 | 空间转录组学、数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学、成像质谱流式技术 | NA | 空间转录组数据、成像质谱流式图像 | 未明确说明样本数量，涉及多发性骨髓瘤患者骨髓样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台结合成像质谱流式技术 |
| 892 | 2026-09-02 |
Spatial transcriptomics reveals D2-associated synaptic transcriptional attenuation in the chronically stressed dorsal striatum
2026-Aug-31, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107581
PMID:42628586
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性束缚压力下背侧纹状体D2神经元相关突触转录衰减 | 首次将RNAscope引导的GeoMx空间转录组学应用于慢性应激背侧纹状体，分别比较D1和D2神经元区室的转录变化，发现D2反应更集中于受体转运和突触信号通路 | 摘要未提及局限性 | 探究慢性应激下背侧纹状体D1和D2神经元区室的细胞类型相关转录组织变化 | 慢性束缚应激小鼠的背侧纹状体D1和D2神经元区室 | 空间转录组学 | 应激相关精神疾病 | RNAscope引导的GeoMx空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确提及样本量 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | RNAscope引导的GeoMx空间转录组学平台 |
| 893 | 2026-09-02 |
Differentially expressed genes and pathways in glomeruli in light chain deposition disease - LCDD (monoclonal immunoglobulin deposition disease): opportunities for novel therapeutic interventions
2026-Aug-31, Ultrastructural pathology
IF:1.1Q4
DOI:10.1080/01913123.2026.2721624
PMID:42670688
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析轻链沉积病肾小球不同阶段的差异表达基因和通路，为新型治疗干预提供机会 | 首次使用空间转录组学技术分析轻链沉积病不同肾小球受累阶段的基因表达和细胞通路激活，识别出可药理学靶向的系膜细胞特异性靶点 | 研究局限于肾活检样本，且需进一步通过现有LCDD模型进行实验室验证以证实所提靶向干预的有效性 | 识别轻链沉积病肾小球疾病起始和进展中的特异性靶点，以促进个性化治疗干预的设计 | 轻链沉积病患者的肾活检样本，涵盖不同肾小球受累阶段 | 空间转录组学 | 轻链沉积病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 894 | 2026-09-02 |
Mapping the omics landscape for peri-implant diseases: A scoping review
2026-Aug-31, Periodontology 2000
IF:17.5Q1
DOI:10.1111/prd.70056
PMID:42670778
|
综述 | 本文通过范围综述，系统整理了种植体周围健康、种植体周围黏膜炎和种植体周围炎的组学证据，识别了与诊断、监测和治疗相关的重复分子模式和候选生物标志物信号。 | 首次将种植体周围疾病的组学证据按临床状态和植入物条件化生态位进行整合，提出疾病遵循阶段性、植入物条件化的生物学轨迹，而非简单的二元健康/疾病模型。 | 该综述未提供定量汇总分析，且某些组学领域（如转录组学、蛋白质组学和表观基因组学）在种植体周围黏膜炎中的研究代表性不足。 | 绘制种植体周围健康、种植体周围黏膜炎和种植体周围炎的组学证据图谱，并识别与诊断、监测和治疗相关的候选生物标志物信号。 | 人类种植体周围健康、种植体周围黏膜炎和种植体周围炎状态下的组学数据，包括基因组学、DNA甲基化表观基因组学、转录组学、非编码RNA、蛋白质组学、代谢组学和微生物组谱。 | 口腔医学 | 种植体周围疾病 | 基因组学, DNA甲基化表观基因组学, 转录组学, 非编码RNA分析, 蛋白质组学, 代谢组学, 微生物组分析 | NA | 组学数据 | 78项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 895 | 2026-09-02 |
Integrated pan-cancer analysis reveals a cancer-associated fibroblast oxidative stress response signature predicting immunotherapy response and prognosis
2026-Aug-31, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02424-w
PMID:42671485
|
研究论文 | 通过整合泛癌单细胞RNA测序数据，揭示了肿瘤微环境中氧化应激反应的特征，并开发了成纤维细胞源性氧化应激相关签名（FOSR.Sig）以预测免疫治疗反应和预后 | 首次通过泛癌单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）具有最高的氧化应激反应得分，并据此开发了FOSR.Sig签名，结合机器学习框架实现了对免疫检查点抑制剂（ICI）反应的高精度预测，以及基于TCGA和LASSO回归构建了跨癌种的预后模型，并通过实验验证了关键基因TFG的作用 | 未提及明确局限性 | 开发基于氧化应激反应的签名以预测免疫治疗反应和患者预后，并探索靶向氧化应激的潜在治疗策略 | 肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 机器学习 | 泛癌 | RNA-seq | 机器学习框架，LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据和TCGA泛癌数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2026-09-02 |
A High Density of Impaired Tertiary Lymphoid Structures Is Associated with Higher Tumor Stage and Recurrence in Non-Muscle-Invasive Bladder Cancer
2026-Aug-31, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-26-0104
PMID:42671925
|
研究论文 | 该研究系统地分析了非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）中的三级淋巴结构（TLS），发现其高密度与肿瘤分期较高和复发风险增加相关，且这些TLS在结构和功能上存在损伤 | 首次在NMIBC中利用整块切除的原发诊断标本进行高分辨率空间定位和定量组织学评估，结合单细胞RNA测序，揭示了肿瘤相关TLS的功能损伤和免疫抑制微环境的形成 | 研究仅基于单一中心的数据，且样本量有限（97例患者），可能限制结果的广泛适用性；此外，未进行功能性实验验证TLS的免疫调节作用 | 阐明NMIBC中三级淋巴结构的组织结构和功能状态，评估其作为生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 97例NMIBC患者的原发肿瘤标本以及配对的复发肿瘤和膀胱炎标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织学图像和单细胞转录组数据 | 97例NMIBC患者的原发肿瘤标本，以及配对复发肿瘤和膀胱炎标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 897 | 2026-09-02 |
CD266+ myofibroblasts mediate resistance to immunochemotherapy through ECM stiffness in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Aug-31, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1379
PMID:42671928
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了头颈部鳞状细胞癌患者在免疫化疗前后的样本，发现CD266+肌成纤维细胞通过细胞外基质硬度介导免疫化疗耐药，并揭示了其机制及潜在治疗靶点 | 首次识别出CD266+肌成纤维细胞亚群在头颈部鳞状细胞癌免疫化疗耐药中的关键作用，并阐明其通过Piezo1介导的机械生物学途径调控细胞外基质硬度、形成免疫排斥微环境的新机制，且提出Piezo1抑制与PD-1阻断的协同治疗策略 | 样本量相对较小，且研究主要集中在U/R/M HNSCC患者，其结论是否适用于其他类型或分期的HNSCC尚需进一步验证；体内实验可能未能完全模拟人类肿瘤微环境的复杂性 | 探讨头颈部鳞状细胞癌免疫化疗耐药机制，特别是基质细胞（如肌成纤维细胞）在其中的作用，以寻找改善治疗效果的潜在靶点 | 不可切除/复发/转移性头颈部鳞状细胞癌（U/R/M HNSCC）患者，以及其肿瘤微环境中的细胞（包括CD266+肌成纤维细胞、CD8+ T细胞等）和细胞外基质 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（单细胞转录组） | 42个样本（来自接受免疫化疗的患者，治疗前后） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 898 | 2026-09-02 |
Supermeres containing Discoidin Domain Receptor 1 extracellular domain promote collagen alignment and immune exclusion in microsatellite stable colorectal cancer
2026-Aug-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-26-0105
PMID:42673563
|
research paper | 本研究发现了含有盘状结构域受体1胞外域的超微囊泡促进微卫星稳定结直肠癌中胶原蛋白排列和免疫排斥的机制 | 开发了胶原蛋白排列和空间转录组学分析（CASTA）新方法，并首次揭示了DDR1胞外域通过超微囊泡诱导成纤维细胞收缩促进胶原蛋白排列和CD8+ T细胞排斥的作用机制 | 研究主要基于体外3D共培养模型和患者样本，未进行体内动物实验验证；且DDR1 cECD在超微囊泡中的具体包装和释放机制尚未阐明 | 探索DDR1胞外域在人类结直肠癌中促进胶原蛋白排列和CD8+ T细胞排斥的作用机制，以期为微卫星稳定结直肠癌的治疗提供新的靶点 | 人类结直肠癌细胞系、成纤维细胞、患者样本中的超微囊泡 | digital pathology | colorectal cancer | spatial transcriptomics | NA | image, text | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 899 | 2026-09-02 |
An integrated reference atlas of human skeletal muscle
2026-Aug-31, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106465
PMID:42673766
|
研究论文 | 构建了一个整合的人类骨骼肌参考图谱，包含来自88个健康个体的122,000个细胞和630,000个细胞核，解析了17种主要骨骼肌细胞群体，并提供了基于标记物的细胞类型预测工具 | 构建了首个跨研究整合的人类骨骼肌单细胞和单核转录组参考图谱，开发了组织与模态感知的标记物面板，并通过伪时间建模揭示了肌纤维分化轨迹，发现了NOVA1作为纤维脂肪祖细胞的选择性标记物 | 未在摘要中明确提及局限性 | 建立统一的人类骨骼肌转录组参考框架和一致的细胞类型注释标准，以促进跨研究比较 | 人类骨骼肌的单细胞和单核转录组数据集 | 单细胞转录组学 | 肌肉相关疾病 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序 | 伪时间建模 | 基因表达数据 | 88个健康个体的122,000个细胞和630,000个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 900 | 2026-09-02 |
Genomic and transcriptomic features of HBV integration in treatment-naïve, HBeAg-positive children with chronic HBV infection
2026-Aug-31, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106464
PMID:42673761
|
研究论文 | 本研究通过基因组和空间转录组分析，揭示了慢性HBV感染儿童中HBV整合的基因组和转录组特征，并与成人进行比较 | 首次系统描绘了治疗初治、HBeAg阳性慢性HBV感染儿童中HBV整合的克隆扩增水平和空间转录组特征，并发现儿童与成人对转录活跃病毒整合的局部免疫反应存在差异 | 研究样本量较小，且未涉及与临床结局的直接关联 | 阐明慢性HBV感染儿童中HBV整合的基因组和转录组特征及局部免疫反应 | 18名儿童和28名成人慢性HBV感染患者，其中12名儿童和3名成人（来自公共数据库）进行了空间转录组分析 | 基因组学、空间转录组学 | 慢性乙型肝炎 | 探针捕获测序、空间转录组学 | NA | 基因组测序数据、空间转录组数据 | 18名儿童和28名成人（基因组分析）；12名儿童和3名成人（空间转录组分析） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |