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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8801 2025-10-05
Glycolysis-Driven Immune Evasion in Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: An Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Study
2025, OncoTargets and therapy IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了糖酵解驱动的免疫逃逸机制在微卫星高度不稳定结直肠癌中的作用 首次在微卫星高度不稳定结直肠癌中发现糖酵解富集的肿瘤亚群与免疫抑制微环境的共定位关系,并阐明乳酸分泌促进Treg分化和巨噬细胞极化的分子机制 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要基于相关性分析,缺乏功能性实验验证 探究微卫星高度不稳定结直肠癌中肿瘤细胞功能异质性及其在免疫逃逸中的作用 微卫星高度不稳定结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 非负矩阵分解, 基因集富集分析 基因表达数据, 空间定位数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
8802 2025-10-05
An aberrant immune-epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae
2024-Oct, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过建立小鼠模型揭示了病毒性肺后遗症中异常免疫-上皮祖细胞生态位驱动纤维化的机制 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用通过IFNγ+TNF-IL-1β轴损害肺泡再生并驱动纤维化后遗症 研究主要基于小鼠模型,人类患者样本验证仍需进一步扩展 阐明呼吸道病毒后遗症(PASC)的细胞分子机制 三个呼吸道PASC患者队列和病毒后肺病小鼠模型 空间转录组学 COVID-19后遗症 空间转录组学、成像技术 小鼠疾病模型 空间转录组数据、图像数据 三个患者队列和相应小鼠模型 NA 空间转录组学 NA NA
8803 2025-10-05
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type specific responses in primary human pancreatic islets
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了柯萨奇病毒B感染在人类胰岛不同细胞类型中引发的特异性转录反应 首次在单细胞分辨率上系统揭示了CVB感染对不同胰岛细胞类型的特异性转录响应,并发现β细胞中长链非编码RNA与病毒感染的关系 使用尸体来源的胰岛样本,可能无法完全反映体内真实情况;研究时间点仅限于24和48小时 探究柯萨奇病毒B感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响及其与1型糖尿病的关系 人类尸体来源的胰岛细胞 单细胞生物学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类尸体胰岛样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
8804 2025-10-05
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制 首次发现具有独特形态和转录特征的杆状小胶质细胞亚群,并证明其通过调节兴奋性突触输入来抑制运动皮层过度活跃 研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型,尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证 探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层回路过度兴奋中的调控作用 TDP-43神经退行性疾病小鼠模型(rNLS8)的运动皮层神经元和小胶质细胞 神经科学 肌萎缩侧索硬化症(ALS) 多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序 NA 电生理信号、钙成像数据、转录组数据 rNLS8转基因小鼠模型 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
8805 2025-10-05
Technological innovations promote cancer stem cell-based translational research
2025-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文综述了癌症干细胞研究领域的技术创新及其对转化医学的推动作用 系统整合单细胞测序、功能基因组学、器官芯片和人工智能等前沿技术用于癌症干细胞研究 NA 探讨技术创新如何促进基于癌症干细胞的转化研究 癌症干细胞及其肿瘤微环境 生物医学工程 癌症 单细胞测序, 功能基因组学, 器官芯片, 人工智能 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8806 2025-10-05
Radiotherapy in combination with PD-1 and TIGIT blockade mediate antitumor abscopal effects and immune memory via CD8+ T cells
2025-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨放疗联合抗PD-1和抗TIGIT抗体通过CD8+ T细胞介导抗肿瘤远隔效应和免疫记忆的机制 首次揭示三重疗法通过激活CD8 T细胞和M1巨噬细胞极化增强抗肿瘤远隔效应和长期免疫记忆 研究仅限于小鼠模型,尚未在临床试验中验证 探索放疗联合免疫检查点抑制剂增强抗肿瘤疗效的机制 C57/BL6小鼠的四种皮下肿瘤模型(LLC、CMT-167、B16-F10、MC38) 肿瘤免疫学 癌症 流式细胞术、多色免疫荧光、单细胞转录组学、Luminex细胞因子分析 NA 细胞表型数据、基因表达数据、细胞因子数据 四种小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8807 2025-10-05
Inhibition of ACVR1 in Cancer-Associated Fibroblasts Suppresses Colorectal Cancer Cell Growth
2025-Oct, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析发现ACVR1-BMP7轴是结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的潜在治疗靶点 首次在二维类器官模型中揭示ACVR1-BMP7轴在癌症相关成纤维细胞与癌细胞相互作用中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的分子靶向治疗策略 结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、小鼠模型 癌症研究 结直肠癌 单细胞RNA测序、类器官培养 二维类器官模型、小鼠异种移植模型 基因表达数据、生存数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8808 2025-10-05
Poor Collateralization in T2DM: Role of SLC4A10+ MAIT Cells
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨2型糖尿病患者中黏膜相关恒定T细胞对侧支循环形成的影响机制 首次发现MAIT细胞通过CCL3L1-CCR5轴驱动巨噬细胞向促炎表型极化,从而抑制侧支循环形成 样本量有限,需要更大规模研究验证MAIT细胞作为生物标志物的临床价值 探究2型糖尿病慢性完全闭塞患者免疫细胞动态与侧支循环形成的关系 2型糖尿病慢性完全闭塞患者和糖尿病小鼠模型 免疫学 2型糖尿病 单细胞RNA测序, 共培养实验, 缺血模型 NA 单细胞转录组数据 两组不同侧支循环状态的2型糖尿病患者队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8809 2025-10-05
CXCL4-Induced PBMCs Modulate Vascular Extracellular Matrix via Wnt5a-Dependent Matrix Metalloproteinase-7 and Calcifying Extracellular Vesicle Release
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究揭示了CXCL4诱导的单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴促进基质金属蛋白酶-7和钙化性细胞外囊泡释放,从而驱动血管细胞外基质重塑的新机制 首次发现CXCL4诱导的促炎单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴分泌MMP7+S100A8+钙化性细胞外囊泡,驱动血管钙化的新机制 研究主要基于体外实验和人类颈动脉斑块组织学验证,需要进一步在体实验确认机制 探究CXCL4诱导的单核细胞在血管炎症反应中促进细胞外基质重塑和钙化的分子机制 人类外周血单核细胞、血管平滑肌细胞、人类颈动脉斑块 细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、细胞外囊泡分析、组织学分析 NA 基因表达数据、组织图像数据 人类颈动脉斑块样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8810 2025-10-05
Genomic Insights at the Maternal-Fetal Interface: Preeclampsia Subtypes and Clinical Implications
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
综述 通过单细胞转录组学揭示子痫前期在母胎界面的细胞特异性基因表达变化及其临床亚型 发现胎盘主导型和母体心血管主导型两种子痫前期亚型具有独特的病因学特征 未明确说明研究样本量及具体技术平台细节 探索子痫前期的基因组学机制及临床分型 母胎界面的细胞类型(合体滋养细胞、基质细胞、免疫细胞) 基因组学 子痫前期 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8811 2025-10-05
Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer
2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究评估了LAG-3在小细胞肺癌中的表达及其临床意义 首次系统评估28种免疫检查点分子在小细胞肺癌中的表达,发现LAG-3表达高于其他肺癌亚型和黑色素瘤,并验证其作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 研究基于多个数据集,可能存在样本异质性;需要进一步实验验证LAG-3作为生物标志物的临床实用性 探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的分子标志物 小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织 癌症免疫学 小细胞肺癌 RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 NA 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 多个公共数据集和内部数据集(包括CCLE数据库、IMpower133数据集等) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
8812 2025-10-05
Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling
2025-Sep-25, Nanoscale IF:5.8Q1
综述 本综述全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用 将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米颗粒辅助信号放大技术整合,显著提升了诊断潜力,实现核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞的超灵敏检测 面临反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战 探索RCA技术在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用及未来发展 核酸、蛋白质、细胞外囊泡、单细胞和组织结构中的基因表达 分子诊断 癌症 滚环扩增、CRISPR检测、生物传感器、纳米颗粒辅助信号放大 NA DNA序列、基因表达数据 NA NA 空间转录组学、单细胞多组学 NA NA
8813 2025-10-05
Spatial profiling of human pancreatic ductal adenocarcinoma reveals molecular alterations associated with venous invasion
2025-Sep-24, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过空间转录组学分析揭示胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征 首次系统描绘PDAC静脉侵犯的空间分子图谱,发现静脉侵犯区域表现出与更好预后相关的分子特征 样本量相对有限(8例患者95个样本),需在更大队列中验证 探究胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征及其临床意义 人类胰腺导管腺癌组织样本 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学, 空间蛋白质组学, RNA-seq NA 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 公共RNA-seq数据 95个PDAC组织样本(来自8例初治患者),独立验证队列19例患者 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, bulk RNA-seq NA NA
8814 2025-10-05
HEBP2-governed glutamine competition between tumor and macrophages dictates immunotherapy efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Sep-23, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了HEBP2调控的肿瘤细胞与巨噬细胞间谷氨酰胺竞争决定三阴性乳腺癌免疫治疗疗效的机制 首次发现HEBP2/GSTP1轴调控的肿瘤-巨噬细胞代谢检查点,开创了单细胞水平免疫代谢评估免疫治疗脆弱性的新范式 样本量相对有限(scRNA-seq队列N=27,空间转录组学队列N=88),需要在更大队列中验证 阐明三阴性乳腺癌免疫治疗疗效受限的代谢机制 三阴性乳腺癌患者肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 scRNA-seq队列27例患者,空间转录组学队列88例患者 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
8815 2025-10-05
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过工程化血管系统成功诱导人多能干细胞来源的胰岛类器官实现功能成熟 首次构建了包含血管系统的三维胰岛类器官模型,揭示了血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟的机制 研究中使用的血管系统模型仍需进一步优化以更精确模拟体内生理环境 开发具有血管系统的功能性胰岛类器官用于糖尿病研究和治疗 人多能干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞和成纤维细胞 组织工程 糖尿病 单细胞RNA测序、微流体技术、三维细胞培养 NA 基因表达数据、钙离子成像数据、胰岛素分泌数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8816 2025-10-05
Novel radiation-derived gene blueprint stratifying patients with breast cancer
2025-Sep-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 开发基于辐射相关基因的乳腺癌预后风险模型 首次利用辐射相关基因构建乳腺癌预后预测模型,并揭示其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 需要更多独立队列验证模型的临床适用性 开发乳腺癌预后预测生物标志物和个性化治疗策略 乳腺癌患者 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析 随机森林, LASSO Cox回归, stepAIC 基因表达数据 TCGA-BRCA队列和METABRIC数据集患者 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
8817 2025-10-05
Engineering Spatial and Molecular Features from Cellular Niches to Inform Predictions of Inflammatory Bowel Disease
2025-Sep-12, ArXiv
PMID:40964085
研究论文 本研究开发了一种利用空间转录组学构建可解释机器学习模型来区分炎症性肠病亚型的新计算框架 首次将空间转录组学与可解释机器学习相结合,从细胞生态位中系统提取空间和分子特征用于IBD分类 样本量相对有限,需要更大规模验证 开发基于空间转录组学的IBD亚型分类和诊断方法 健康对照、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的结肠黏膜组织 空间转录组学 炎症性肠病 空间转录组学,非负矩阵分解,多层感知器 MLP 空间转录组数据 健康对照、UC和CD患者的结肠黏膜样本 NA 空间转录组学 NA NA
8818 2025-10-05
NNMT inhibition in cancer-associated fibroblasts restores antitumour immunity
2025-Sep, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过抑制癌症相关成纤维细胞中的NNMT酶活性,恢复抗肿瘤免疫反应 首次揭示NNMT通过诱导H3K27me3低甲基化驱动CAF分泌补体,招募免疫抑制性MDSC的机制,并开发了特异性NNMT抑制剂 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 探索NNMT在肿瘤微环境免疫抑制中的作用及治疗潜力 高级别浆液性卵巢癌、乳腺癌和结肠癌模型 肿瘤免疫学 卵巢癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、高通量筛选 基因敲除小鼠模型、同系肿瘤模型 基因表达数据、表观遗传数据 多个小鼠癌症模型 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
8819 2025-10-05
Genome-wide association study identifies FUT2 rs601338 polymorphism linking intra-pancreatic fat deposition to chronic pancreatitis
2025-Sep, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.] IF:2.8Q2
研究论文 通过全基因组关联研究揭示FUT2基因rs601338多态性通过影响胰腺脂肪沉积与慢性胰腺炎风险的关联机制 首次通过大规模GWAS发现胰腺脂肪沉积的遗传基础,结合单细胞转录组学确认FUT2基因在胰腺外分泌部的特异性表达 研究人群主要为欧洲裔,样本代表性有限;未深入探讨FUT2影响胰腺脂肪沉积的具体分子机制 探索胰腺脂肪沉积的遗传基础及其对胰腺疾病风险的影响 20,040名欧洲裔个体(排除急/慢性胰腺炎和胰腺癌患者) 基因组学 慢性胰腺炎 全基因组关联研究(GWAS), 共定位分析, 转录组关联研究(TWAS), 单细胞转录组学 回归模型, 交互作用分析 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 20,040人 UK Biobank 基因组测序, 单细胞RNA-seq NA NA
8820 2025-10-05
scHSC: enhancing single-cell RNA-seq clustering via hard sample contrastive learning
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种通过困难样本对比学习增强单细胞RNA测序聚类性能的深度学习方法 采用困难样本挖掘和对比学习策略,同时整合基因表达和细胞间拓扑结构信息,通过自适应权重策略将对比学习与ZINB模型相结合 NA 提高单细胞RNA测序数据的聚类准确性和细胞类型注释效果 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习, ZINB模型 基因表达数据 18个单细胞RNA测序真实数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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