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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-10-21 |
Spatially resolved multiomics on the neuronal effects induced by spaceflight in mice
2024-06-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48916-8
PMID:38862479
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研究论文 | 该研究整合单细胞多组学(转录组和染色质可及性)与空间转录组学,揭示太空飞行对雌性小鼠大脑的影响 | 创新性地将单细胞多组学与空间转录组学结合,在个体脑区和细胞类型水平解析太空飞行对中枢神经系统的影响,并发现与神经退行性疾病的相似性 | 研究仅基于雌性小鼠,样本量有限,未进行长期追踪或功能验证实验 | 阐明太空飞行对小鼠大脑的影响,为未来太空飞行研究提供基础 | 雌性小鼠 | 空间多组学 | 神经系统疾病 | 单细胞多组学(转录组和染色质可及性)、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 862 | 2026-10-21 |
SARS-CoV-2 infection modifies the transcriptome of the megakaryocytes in the bone marrow
2024-06-11, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023012367
PMID:38522092
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研究论文 | 利用空间转录组学和小鼠模型研究SARS-CoV-2感染对骨髓巨核细胞转录组的影响 | 首次使用空间转录组学区分骨髓血窦邻近的巨核细胞亚群,并结合机器学习分析SARS-CoV-2感染不同阶段巨核细胞转录组变化 | 研究基于小鼠模型,未在人类样本中验证;未检测到骨髓中SARS-CoV-2 RNA,机制尚不明确 | 探究SARS-CoV-2感染是否影响骨髓巨核细胞的转录组 | 小鼠骨髓巨核细胞 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学 | 机器学习 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 863 | 2026-10-21 |
Hidden syndinian and perkinsid infections in dinoflagellate hosts revealed by single-cell transcriptomics
2024-01-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae188
PMID:39325969
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序技术,在自由生活的甲藻宿主中发现了隐藏的syndinian和perkinsid寄生虫感染,并构建了系统发育树以揭示其进化关系和宿主关联 | 首次对感染甲藻的syndinian和perkinsid寄生虫进行单细胞转录组测序,获得了寄生虫及其宿主的转录组数据,并基于192个基因构建了稳健的系统发育树,发现了一个与perkinsids姐妹群的新谱系 | 仅对14个感染宿主细胞进行了单细胞转录组测序,样本量较小;大多数寄生虫物种仍难以直接观察或培养,环境18S rRNA基因序列数据有限 | 揭示自由生活甲藻宿主中隐藏的寄生虫感染情况,并利用单细胞转录组测序深入了解这些单细胞寄生虫的进化历史和宿主关系 | 自由生活的甲藻宿主细胞及其感染的syndinian和perkinsid寄生虫 | 单细胞转录组学、进化生物学、海洋微生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、图像 | 14个感染宿主细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 864 | 2026-10-21 |
Regulation of Bacteroides acidifaciens by the aryl hydrocarbon receptor in IL-22-producing immune cells has sex-dependent consequential impact on colitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444045
PMID:39229279
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研究论文 | 本研究通过结肠炎诱导模型结合scRNA-seq和16S rRNA测序,揭示AhR在产IL-22免疫细胞中调控Bacteroides acidifaciens并性别依赖性影响结肠炎 | 首次证明AhR在Rorc表达免疫细胞中对I3C介导的结肠炎保护作用至关重要,且该调控具有细胞特异性(ILC3而非Th22)和性别依赖性(雌性B. acidifaciens加剧结肠炎而雄性不加剧) | 摘要中未明确说明样本量及具体机制细节,性别差异的分子机制尚未完全阐明 | 探究AhR在产IL-22免疫细胞中对结肠炎及肠道菌群失调的调控作用及性别差异 | 野生型小鼠、AhR ΔRorc条件敲除小鼠及其同窝对照小鼠的结肠炎模型 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 865 | 2026-10-21 |
Cluster of differentiation-44 as a novel biomarker of lupus nephritis and its role in kidney inflammation and fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1443153
PMID:39411720
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研究论文 | 本研究探讨了CD44在狼疮性肾炎肾脏炎症和纤维化中的作用,并评估了血清CD44作为狼疮性肾炎生物标志物的临床价值 | 首次系统性地将CD44作为狼疮性肾炎的新型生物标志物,揭示了其在肾脏炎症和纤维化中的致病作用,并证明血清CD44可在临床肾脏复发前4.5个月预测疾病活动 | 研究的动物模型仅使用了NZB/W F1小鼠,样本量有限,且需要进一步的多中心大样本验证来确认CD44作为临床生物标志物的适用性 | 研究CD44在狼疮性肾炎肾脏炎症和纤维化中的作用,并评估血清CD44水平与临床病理特征的关联 | NZB/W F1小鼠和经活检证实的III/IV±V型狼疮性肾炎患者 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | ELISA,单细胞RNA测序 | NA | 图像,文本 | NZB/W F1小鼠队列及狼疮性肾炎患者血清样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 866 | 2026-10-21 |
Spatial transcriptomics: a new frontier in accurate localization of breast cancer diagnosis and treatment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483595
PMID:39439806
|
综述 | 总结空间转录组学在乳腺癌诊断和治疗中的最新发现,重点关注肿瘤微环境、肿瘤异质性、免疫治疗及其与临床结果的相关性 | 从空间转录组学视角系统综述乳腺癌精准治疗,涵盖肿瘤微环境揭示、新治疗靶点识别、诊断准确性提升、肿瘤进展转移理解、药物反应评估、高分辨率肿瘤细胞图谱构建及临床决策支持 | 摘要未明确说明该综述的局限性 | 总结空间转录组学在乳腺癌诊断和治疗中的最新研究进展,探讨其在精准治疗中的应用价值 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 867 | 2026-10-21 |
Integrating anoikis and ErbB signaling insights with machine learning and single-cell analysis for predicting prognosis and immune-targeted therapy outcomes in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446961
PMID:39464883
|
研究论文 | 该研究整合失巢凋亡和ErbB信号通路的见解,利用机器学习和单细胞分析构建预后特征,用于预测肝细胞癌的预后和免疫靶向治疗结果 | 开发了基于失巢凋亡和ErbB信号通路的预后特征AERS,并利用167种机器学习模型和单细胞分析揭示NOTCH信号通路激活和巨噬细胞浸润减少与索拉非尼和免疫检查点抑制剂耐药相关 | 需要进一步的前瞻性验证和更大的队列来确认AERS的临床适用性 | 评估失巢凋亡和ErbB信号通路在肝细胞癌中的预后意义,并预测免疫靶向治疗结果 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, RSF, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个队列包括TCGA、ICGC、三个独立验证队列和一个内部队列,具体样本量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 868 | 2026-10-21 |
Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
PMID:39478860
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研究论文 | 该研究通过整合TCGA和多个GEO数据集,结合空间转录组学和单细胞RNA测序,分析胃腺癌中乳酸化相关基因集和线粒体功能的预后意义,并构建预后模型和分子分型 | 首次系统整合乳酸化相关基因集与线粒体功能进行胃腺癌分子分型,利用空间转录组学和单细胞RNA测序解析肿瘤微环境异质性,构建的预后模型优于现有模型 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探索乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后价值,建立分子分型并开发预后模型,为靶向治疗和免疫治疗策略提供依据 | 胃腺癌(STAD)患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,图像 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 869 | 2026-10-21 |
Humanized CXCL12 antibody delays onset and modulates immune response in alopecia areata mice: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444777
PMID:39483478
|
研究论文 | 该研究制备了人源化CXCL12抗体用于治疗斑秃,并通过单细胞RNA测序揭示了其延缓小鼠斑秃发病和调节免疫应答的分子机制 | 首次制备人源化CXCL12抗体用于斑秃治疗,并结合单细胞RNA测序和伪批量RNA测序系统揭示其通过调节T细胞和树突状细胞/巨噬细胞以及Jak/Stat通路发挥免疫调节作用的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;样本量有限;对CXCL12抗体长期安全性和具体分子调控网络仍需进一步研究 | 探究人源化CXCL12抗体治疗斑秃的分子机制及其对免疫应答的调节作用 | 斑秃小鼠模型(背部皮肤组织) | 单细胞组学、免疫学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序、伪批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 870 | 2026-10-21 |
mRNA-seq-based analysis predicts: AEG-1 is a therapeutic target and immunotherapy biomarker for pan-cancer, including OSCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484226
PMID:39483471
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研究论文 | 本文通过多数据库分析和mRNA-seq,揭示AEG-1在泛癌(包括口腔鳞状细胞癌)中的表达、预后及免疫浸润相关性,并探讨其作为治疗靶点和免疫治疗生物标志物的潜力 | 首次综合多数据库和单细胞RNA-seq数据系统分析AEG-1在泛癌中的表达与免疫浸润关系,并结合体外过表达细胞系和mRNA-seq验证AEG-1在OSCC中调控Th1/Th2免疫稳态、促进糖原积累和肿瘤纤维化的作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究AEG-1在泛癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系,并验证其作为OSCC治疗靶点和免疫治疗生物标志物的潜力 | 泛癌(多种肿瘤类型)及口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔癌 | mRNA-seq、单细胞RNA-seq、RT-PCR、免疫组化 | NA | 文本、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 871 | 2026-10-21 |
Tertiary lymphoid structure-related score as a predictor for survival prognosis and immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483497
PMID:39493749
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研究论文 | 该研究构建了一个基于23个三级淋巴结构相关基因的TLSscore评分系统,用于预测头颈鳞癌患者的生存预后和免疫治疗反应,并鉴定出TLS内具有抗肿瘤功能的PD1+CXCL13+CD8+T细胞亚型 | 构建了TLSscore评分模型并验证其与TLS空间位置的一致性;首次鉴定出TLS内特定的PD1+CXCL13+CD8+T细胞亚型,并通过体内外实验证实其抗肿瘤功能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 评估TLS在头颈鳞癌中的预测价值,构建TLS相关评分系统以预测生存预后和免疫治疗反应,并探究TLS内特定免疫细胞亚型的抗肿瘤机制 | 头颈鳞癌患者及TLS相关基因、T细胞亚型 | 数字病理, 肿瘤免疫学, 生物信息学 | 头颈鳞癌 | RNA-seq, 单细胞测序, 流式细胞术分选, 生物信息学分析 | TLSscore评分模型 | RNA测序数据, 单细胞测序数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 872 | 2026-10-21 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis based on bioinformatics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460431
PMID:39497821
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研究论文 | 该研究基于GEO数据库的基因表达数据,通过生物信息学分析和机器学习方法识别并验证了与胞葬作用相关的MASH诊断生物标志物 | 首次系统性地将胞葬作用相关基因与MASH诊断相结合,利用两种机器学习模型筛选出五个候选诊断标志物,并通过外部验证和动物实验证实了TREM2和TIMD4的诊断价值(AUC均超过0.9) | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,样本量有限;仅通过动物实验验证了TREM2和TIMD4的表达变化,未在更大规模临床队列中验证;五个候选标志物中仅两个得到实验验证 | 识别和验证胞葬作用相关的MASH诊断生物标志物,构建临床预测模型,并探索MASH的潜在治疗靶点和发病机制 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)患者样本和对照样本的基因表达数据,以及相关动物实验样本 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 转录组测序、生物信息学分析、机器学习、免疫浸润分析、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 873 | 2026-10-21 |
Possible involvement of Toll-like receptor 8-positive monocytes/macrophages in the pathogenesis of Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1480675
PMID:39544932
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研究论文 | 本研究通过DNA微阵列、实时PCR、单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色,探讨了Toll样受体8阳性单核/巨噬细胞在干燥综合征发病机制中的可能作用 | 首次结合单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色,发现TLR8在干燥综合征唾液腺病变的单核/巨噬细胞中高表达,并可能通过促进B7分子表达增强适应性免疫反应 | 样本量有限,单细胞RNA测序分析整合了公开数据,需要进一步功能实验验证TLR8在干燥综合征发病中的因果作用 | 探索识别DNA和RNA免疫复合物的Toll样受体在干燥综合征中的表达和功能 | 干燥综合征患者的唾液腺组织和外周血单核细胞 | 自身免疫疾病、单细胞组学 | 干燥综合征 | DNA微阵列、实时PCR、单细胞RNA测序、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、图像 | DNA微阵列6例干燥综合征患者唾液腺组织,实时PCR n=32,多色免疫荧光染色n=19,单细胞RNA测序使用组织病变样本并整合公开数据 | NA | 单细胞RNA测序、bulk DNA微阵列、实时PCR、免疫荧光染色 | NA | NA |
| 874 | 2026-10-21 |
NFIL3/Tim3 axis regulates effector Th1 inflammation in COPD mice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1482213
PMID:39555065
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序、流式细胞术和基因敲除小鼠,揭示了NFIL3/Tim3轴通过抑制Th1分化调控COPD小鼠效应Th1炎症的机制 | 首次发现Tim3(Havcr2)作为调控COPD相关Th1细胞的关键基因,并揭示其上游调控因子NFIL3与Tim3构成的轴在COPD肺内Th1失衡中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类COPD患者中验证NFIL3/Tim3轴的临床相关性;机制探讨仍较初步,未深入阐明NFIL3调控Tim3的具体分子通路 | 探究COPD相关Th1细胞的影响因素及其炎症调控机制,为靶向干预提供依据 | COPD小鼠模型、CD4+ T细胞、Th1细胞、基因敲除小鼠 | 免疫学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、流式细胞术、基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 875 | 2026-10-21 |
Matters arising: Insufficient evidence that pancreatic β cells are derived from adult ductal Neurog3-expressing progenitors
2023-04-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.003
PMID:37028408
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评论 | 本文对Gribben等人关于成人胰腺导管细胞可作为内分泌祖细胞分化为β细胞的研究提出质疑,认为其证据不足 | 指出Gribben等人使用的两种Cre品系直接标记了成人胰岛生长抑素-producing δ细胞,而非导管细胞,且许多标记的δ细胞因未使用胰岛素-生长抑素共免疫定位而被误分类为β细胞 | 基于对现有数据的重新分析,未提供新的实验数据来直接证明β细胞不来源于导管细胞,主要依赖于对他人研究方法的批评 | 重新评估成人胰腺β细胞的起源,特别是导管细胞是否作为内分泌祖细胞 | 成人胰腺导管细胞、胰岛β细胞、δ细胞、Neurog3表达祖细胞 | 糖尿病研究、细胞谱系追踪 | 糖尿病 | 谱系追踪、单细胞RNA测序、免疫定位 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 876 | 2026-10-21 |
Optimizing the design of spatial genomic studies
2023-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.29.526115
PMID:36778332
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研究论文 | 该论文形式化了空间基因组学实验设计问题,并提出优化方法以选择最具信息量的组织切片 | 首次将空间基因组学实验设计形式化为一个通用问题类别,并针对构建空间图谱和定位感兴趣区域两类研究提出优化设计方法 | 实验仍昂贵且劳动密集,方法仅在多个空间基因组数据集上验证,未涉及所有平台 | 优化空间基因组学实验设计,选择最大信息量的组织切片 | 空间基因组学实验中的组织切片(二维平面) | 空间基因组学 | 肿瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间基因组数据 | 多个空间基因组数据集 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 877 | 2026-10-20 |
Inhibition of BMP-Smad1/5 signaling with DMH1 attenuates joint degeneration in a rat model of cuff tear arthropathy
2026-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2026.100884
PMID:42892935
|
研究论文 | 该研究通过改良大鼠肩袖撕裂关节病模型,结合单细胞RNA测序和DMH1药物干预,探讨BMP-Smad1/5信号在关节退变中的作用 | 首次在改良大鼠肩袖撕裂关节病模型中系统表征BMP信号通路在软骨、软骨下骨和滑膜中的激活,并证明DMH1抑制BMP I型受体可减轻关节病理改变 | 仅在大鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;DMH1的全身给药可能存在脱靶效应;未评估长期疗效和安全性 | 表征肩袖撕裂关节病中的BMP信号通路,并确定抑制DMH1敏感型BMP I型受体信号是否能减轻肩袖撕裂关节病病理 | 改良大鼠肩袖撕裂关节病模型(mCTA)及DMH1干预的大鼠 | 骨关节疾病研究 | 肩袖撕裂关节病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RT-qPCR, 免疫染色 | 动物模型(大鼠mCTA模型) | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 878 | 2026-10-20 |
Single-cell atlas of neuroma-induced DRG remodeling reveals intervention-specific glial and immune programs
2026-Oct-19, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.053052
PMID:42894959
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建神经瘤形成损伤后背根神经节(DRG)重塑的图谱,并比较近端神经挤压与神经切除两种干预手段的差异 | 首次在单细胞水平系统解析神经瘤诱导的DRG重塑,并揭示不同干预方式(近端挤压 vs 神经切除)下胶质细胞、神经元和免疫细胞的干预特异性转录程序 | 摘要中未明确说明样本量、具体分子机制验证及长期功能恢复数据 | 探究神经瘤形成损伤后DRG的转录重塑机制,并比较近端神经挤压与神经切除两种干预对再生与持续性损伤状态的影响 | 神经瘤形成损伤后的背根神经节(DRG)组织,包括感觉神经元、卫星胶质细胞、施万细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学、神经生物学 | 神经病理性疼痛、周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 879 | 2026-10-20 |
HPV16 E7-Containing Exosomes May Contribute to PD-L1 Expression in Tumor-Infiltrating Lymphocytes of Cervical Cancer
2026-Oct-19, Balkan medical journal
IF:1.9Q2
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研究论文 | 该研究探讨了HPV16 E7蛋白在宫颈癌组织及血浆外泌体中的存在情况,以及其与肿瘤浸润淋巴细胞中PD-L1表达的关系 | 首次揭示了外泌体携带的HPV16 E7蛋白与肿瘤浸润淋巴细胞中PD-L1表达之间的关联,并发现外泌体E7水平与患者预后不良相关 | 研究未直接证明E7蛋白直接介导PD-L1上调,其功能及临床意义仍需进一步研究验证 | 探究宫颈癌来源外泌体中HPV16 E7蛋白的存在及其与肿瘤浸润淋巴细胞PD-L1表达的关系 | HPV16阳性宫颈癌患者血液和病理样本、宫颈癌细胞系C33A和SiHa培养液 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光、qRT-PCR、蛋白质印迹 | NA | 图像、文本 | 30例HPV16阳性宫颈癌患者队列、104例组织芯片队列、3个宫颈癌单细胞RNA测序数据集、C33A和SiHa细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 880 | 2026-10-20 |
Sequential TPRX1 and HERVL activation delineates a progression toward the totipotent-like state
2026-Oct-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.118163
PMID:42893511
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研究论文 | 该文通过构建TPRX1-EGFP/HERVL-tdTomato双报告hPSC细胞系,解析了从hPSC向8细胞样细胞(8CLC)诱导过程中TPRX1与HERVL顺序激活的逐步转变轨迹 | 构建了TPRX1-EGFP/HERVL-tdTomato双报告hPSC细胞系,首次在活细胞层面按时间分辨解析了TPRX1激活先于HERVL激活的顺序性轨迹,并结合单细胞转录组与时间分辨流式细胞术定义了从primed状态经TPRX1中间态到HERVL+ 8CLC态的连续转变,同时通过CRISPRi和RNA导向扰动验证了HERVL元件及HERVL来源RNA的功能贡献 | HERVL元件及HERVL来源RNA发挥功能的具体位点依赖性机制尚未阐明 | 研究人8细胞样细胞(8CLC)体外诱导过程中的细胞动态,揭示全能样状态获得及合子基因组激活(ZGA)的调控规律 | 人多能干细胞(hPSC)及其体外诱导产生的8细胞样细胞(8CLC) | 干细胞生物学、发育生物学、单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序、时间分辨流式细胞术、CRISPRi、RNA导向扰动、双荧光报告基因系统 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、荧光报告数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |