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当前共找到 41796 篇文献,本页显示第 861 - 880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
861 2026-07-10
Multi-omics integration reveals ANXA6-high γδ T cell-endothelial communication as a potential link between periodontitis and MASLD
2026-03-25, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 通过多组学整合策略揭示ANXA6-high γδ T细胞与内皮细胞通讯是牙周炎与代谢功能障碍相关脂肪性肝病共病的潜在联系 首次通过整合多组学数据发现ANXA6-high γδ T细胞-内皮细胞通讯作为牙周炎与MASLD共病的共享免疫特征,并鉴定ANXA6为关键跨疾病候选基因 NA 探究牙周炎与MASLD共病的分子基础,揭示共享的免疫特征和潜在治疗靶点 牙周炎和MASLD患者样本 机器学习和数字病理 牙周炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病 RNA-seq、空间转录组学、单细胞测序、机器学习 加权基因共表达网络分析 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
862 2026-07-10
Pseudomonas plecoglossicida disrupts intestinal homeostasis through manipulation of palmitoleic acid microbial metabolism
2026-03-24, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序、16S rDNA测序和代谢组学技术,揭示了非肠道病原菌斜生假单胞菌通过消耗棕榈油酸破坏斜带石斑鱼肠道稳态并导致厌食的机制 首次发现非肠道病原菌通过操纵宿主肠道微生物代谢产物(棕榈油酸)而非传统细胞因子途径诱导病理性厌食,并验证了外源棕榈油酸补充作为潜在治疗策略 未明确鉴定出与色氨酸衍生代谢物相关的关键细菌,且仅针对鱼类模型,未在哺乳动物中验证 探究非肠道病原菌感染如何通过肠道微生物和代谢稳态失调引起鱼类病理性厌食 斜带石斑鱼感染斜生假单胞菌模型 微生物组学 感染性疾病 单细胞测序, 16S rDNA测序, 代谢组学 NA 基因表达数据, 微生物组成数据, 代谢物数据 感染斜生假单胞菌的斜带石斑鱼肠道样本 NA 单细胞RNA-seq, 16S rRNA测序 NA NA
863 2026-07-10
Identification of Smmhc-expressing mesenchymal cells in orofacial bone at single-cell resolution
2026-03-23, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定口颌骨中表达Smmhc的间充质细胞 发现了一个此前未被识别的口颌骨间充质干细胞亚群Smmhc MSCs,并通过谱系示踪证明了其多能性和在颅面骨稳态中的关键作用 未明确说明,但基于摘要推断可能包括研究仅在小鼠模型中进行,结果向人类转化的有效性需进一步验证 阐明口颌骨间充质干细胞的异质性并鉴定关键亚群 小鼠口颌骨来源的间充质干细胞/基质细胞 数字病理学 颅面骨发育障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠口颌骨组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
864 2026-07-10
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-03-13, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 本研究通过整合基因与轻度创伤性脑损伤的交互作用全基因组关联研究和单细胞RNA测序基因调控网络,揭示神经元和胶质细胞网络如何影响儿童青少年创伤性脑损伤后的认知功能 首次将全基因组关联研究中的基因-创伤性脑损伤交互作用与单细胞RNA测序的基因调控网络相结合,在细胞类型和脑区层面揭示轻度创伤性脑损伤影响神经认知的分子机制 未明确提及研究局限性 阐明轻度创伤性脑损伤影响神经认知的细胞类型特异性关键调控因子和分子机制 来自青少年脑认知发展队列的儿童青少年及其学习记忆相关的神经认知表现 机器学习 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 多基因风险评分模型 基因表达数据, 神经认知数据 基于青少年脑认知发展队列数据,具体样本量未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序基因调控网络分析
865 2026-07-10
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-Mar-02, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 通过整合长读长和短读长测序与Hi-C染色质构象捕获技术,构建了环节动物模式物种Capitella teleta的染色体水平核基因组和线粒体基因组参考组装,并提供了功能基因组资源 首次实现环节动物模式物种的染色体水平基因组组装,揭示了核基因组与线粒体基因组之间高度重排的进化模式,以及基因家族库与染色体进化之间的解耦现象 未提及具体局限性,但可能受限于实验室品系的遗传多样性代表性不足 提供环节动物模式物种C. teleta的最新基因组资源和功能基因组工具,推动进化发育生物学和比较基因组学研究 实验室品系的环节动物Capitella teleta 基因组学 NA 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq NA 基因组序列, 染色质构象, 转录组, 开放染色质, DNA甲基化 单个实验室品系 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq NA NA
866 2026-07-10
A hybrid neighborhood enhanced contrastive learning and self-knowledge distillation method for scRNA-seq data clustering analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出一种结合混合邻域增强对比学习与自知识蒸馏的方法scKD,用于scRNA-seq数据聚类分析 首次将混合邻域增强对比学习与自知识蒸馏策略结合,提升scRNA-seq数据聚类准确性和稀有细胞亚型识别能力 需要依赖公开数据集验证,未涉及该方法在临床样本中的实际应用效果 解决scRNA-seq数据高维度、复杂性和噪声导致的细胞类型分类不准确问题 单细胞转录组测序数据中的细胞亚群 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习模型、自知识蒸馏网络 基因表达数据 多个公开单细胞数据集,具体数量见补充表1 NA 单细胞RNA-seq NA NA
867 2026-07-10
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-Feb-19, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 SCMO是一种结合单细胞分辨率肿瘤微环境生态系统和多组学数据的深度学习模型,用于结直肠癌患者生存预测 整合单细胞转录组图谱与多组学数据构建深度学习预测模型,利用空间转录组数据提高可解释性,并识别了新药物靶点TRAP1及抑制剂柴胡皂苷A 基于公开数据集构建模型,可能受限于数据的异质性和样本量;模型在测试集上长短期预测性能存在差异(如1年AUC为0.639) 提高结直肠癌患者生存预测的准确性并增强模型生物学可解释性 结直肠癌(CRC)患者 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学整合 自归一化神经网络, EcoTyper算法, Integrated Gradients算法 基因表达数据, 基因组数据, 临床数据, 微生物组数据, 空间转录组数据 213个CRC scRNA-seq样本,包含339,060个细胞;TCGA-CRC队列的bulk RNA-seq数据 Xena平台, BIC数据库 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq TCGA数据库 基于公共数据库的多组学数据整合分析
868 2026-07-10
Cerebral Venous Thrombosis in Previously Healthy Patients with Cryptococcal Meningitis
2026-Feb-18, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究调查了既往健康的非HIV隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征 首次在非HIV的免疫正常隐球菌性脑膜炎患者队列中系统分析CVST的发生率、临床特征和潜在机制,并通过单细胞RNA测序探索炎症相关血栓形成基因表达 单中心回顾性研究,样本量较小,且未进行病例对照验证 揭示隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和潜在机制 既往健康的非HIV隐球菌性脑膜炎患者 数字病理学 隐球菌性脑膜炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 89例免疫正常隐球菌性脑膜炎患者 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
869 2026-07-10
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Macaque LGN Neurons Reveals Novel Subpopulations
2026-Feb-18, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 通过对猕猴外侧膝状体(LGN)神经元进行单细胞转录组分析,发现新的神经元亚群 在经典的M、P、K三类LGN神经元分类之外,发现了额外的转录组亚群,揭示了LGN神经元更复杂的异质性 未进行功能性验证,仅基于公开数据库的转录组数据进行分析,缺乏结合转录组与功能评估的综合研究 探索猕猴LGN神经元的细胞异质性,识别新的神经元亚群 猕猴LGN神经元 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 来自公开数据库的猕猴LGN单细胞数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
870 2026-07-10
Estradiol regulates osteoclast sialylation via ST3Gal1 in postmenopausal osteoporosis
2026-02-12, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 研究发现雌激素通过ST3Gal1调节破骨细胞唾液酸化,影响绝经后骨质疏松症中的骨吸收 首次鉴定唾液酸转移酶ST3GAL1作为RANKL诱导破骨细胞生成的关键介质,并揭示雌激素通过ERα竞争TRAF6抑制c-FOS依赖的ST3GAL1转录的分子机制 可能未探讨其他唾液酸转移酶或信号通路的潜在作用,且临床队列样本量有限 阐明雌激素缺乏如何通过分子通路调控破骨细胞活性,进而影响绝经后骨质疏松症的发展 人类骨组织样本、绝经前与绝经后骨质疏松或非骨质疏松女性患者血清、雌激素缺乏小鼠模型 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 包含绝经前和绝经后骨质疏松及非骨质疏松女性的临床队列,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 人类骨组织单细胞RNA测序
871 2026-07-10
Single-Cell Transcriptomics and Integrated Bioinformatic Analysis Reveal Critical Biomarkers and Immune Infiltration Characteristics in Osteoarthritis
2026, Genetics research IF:1.4Q4
研究论文 使用单细胞转录组学和整合生物信息学分析揭示骨关节炎的关键生物标志物和免疫浸润特征 首次通过单细胞RNA测序与整合生物信息学分析结合,识别出骨关节炎中八个不同的软骨细胞亚群,并发现NR4A2、BMP1和AVPR1A等基因具有强诊断潜力,且通过分子对接筛选出贝沙罗汀作为潜在治疗候选药物 基于公开数据集,样本来源有限,未进行实验验证;分子对接结果仅提供初步相互作用证据,需进一步体内外实验确认 探究骨关节炎的细胞异质性和分子机制,识别生物标志物和治疗靶点 骨关节炎患者和正常个体的软骨样本 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 骨关节炎和正常个体软骨样本(数据集GSE220243和GSE114007) NA 单细胞RNA测序 NA NA
872 2026-07-10
JGR-NMF: joint graph-regularized non-negative matrix factorization for spatial domain identification
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 提出联合图正则化非负矩阵分解(JGR-NMF)用于空间域识别,提升准确性和鲁棒性 引入自适应邻域图构建策略,结合kNN图与空间邻接矩阵的联合图正则化框架 未明确说明局限性 提升空间转录组学数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 两个乳腺癌数据集、一个小鼠肾脏数据集和一个小鼠胚胎数据集 机器学习 乳腺癌 空间转录组学 非负矩阵分解(NMF) 空间转录组数据 四个数据集(两个乳腺癌、一个小鼠肾脏、一个小鼠胚胎) NA 空间转录组学 NA NA
873 2026-07-10
The Evolution of Gene Sequencing Technologies: Unveiling Genetic Architecture of Nonsyndromic Orofacial Clefts
2026, Genetics research IF:1.4Q4
综述 综述了随着测序技术从Sanger测序到下一代测序及第三代测序,再到表观基因组学、单细胞测序、空间组学和多组学整合的发展,非综合征性口面裂易感基因和位点识别的关键发现 系统梳理了测序技术演进如何推动非综合征性口面裂遗传学研究从低通量向高通量转变,从常见经典易感基因到新生突变、罕见变异和复杂基因组结构变异的发现,以及细胞分化轨迹的阐明 未来需持续推动测序技术的方法创新、优化研究设计并探索整合多组学方法,以完善基于种族和亚型的遗传数据库 总结测序技术发展不同阶段在识别非综合征性口面裂易感基因和位点方面的关键发现 非综合征性口面裂 自然语言处理 儿科疾病 Sanger测序, 二代测序, 三代测序, 表观基因组学, 单细胞测序, 空间组学, 多组学整合 NA 文本 NA NA NA NA NA
874 2026-07-10
Identification and Validation of Mitophagy-Related Biomarkers in Colorectal Cancer: An Integrated Analysis of Single-Cell Transcriptome and Mendelian Randomization
2026, Genetics research IF:1.4Q4
研究论文 通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,鉴定并验证了结直肠癌中线粒体自噬相关生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,确定了SGCE、ATP8B2和RANGAP1三个具有遗传因果关联的线粒体自噬相关生物标志物 未详细说明样本量和验证队列的多样性,可能限制结果的普适性 探索线粒体自噬在结直肠癌中的作用并识别相关的生物标志物 结直肠癌的基因表达数据和线粒体自噬相关基因 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,机器学习,定量PCR NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
875 2026-07-10
Comprehensive Analysis of Macrophage Dynamics, CCBE1, and Their Implications in Colorectal Cancer Microenvironment: Insights Into Tumor Progression and Therapeutic Opportunities
2026, Genetics research IF:1.4Q4
研究论文 综合分析结直肠癌微环境中巨噬细胞动态变化、CCBE1及其对肿瘤进展和治疗机会的影响 首次揭示CCBE1作为独立预后风险因子,通过促进M2巨噬细胞极化增强肿瘤增殖、迁移和侵袭,为结直肠癌治疗提供新靶点 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏体内验证和更大规模临床样本确认 阐明M2巨噬细胞在结直肠癌中的具体作用及调控分子,探索CCBE1的预后价值和治疗潜力 结直肠癌细胞系及肿瘤微环境中的巨噬细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 Cox回归模型 转录组数据 4个结直肠癌公开数据集(EMTAB8107、GSE139555、GSE146771、GSE166555) NA 单细胞RNA测序 NA NA
876 2026-07-10
HRD-Driven Reprogramming of Macrophage Function and Spatial Architecture in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026, Genetics research IF:1.4Q4
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了高浆液性卵巢癌中HRD驱动的巨噬细胞功能重编程及空间结构变化 首次系统描述了不同HRD亚型(FBI、HRD-Del、HRD-Dup)中巨噬细胞的转录组特征和空间分布差异,并关联了患者生存预后 NA 探究同源重组缺陷对高浆液性卵巢癌免疫微环境中巨噬细胞的影响 高浆液性卵巢癌患者的巨噬细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 166,895个巨噬细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
877 2026-07-10
Single-Cell and Multiomics Characterization of p21 in Cancer Progression and Therapeutic Sensitivity
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞和多组学分析揭示p21在癌症进展和治疗敏感性中的作用 在单细胞分辨率下系统描绘p21在肿瘤微环境中的功能,揭示其作为细胞周期抑制剂之外的免疫调节和治疗敏感性相关表型 功能发现需要进一步的临床验证 研究CDKN1A(编码p21)在肿瘤微环境中的功能,特别是其在单细胞分辨率下的表达模式和功能 p21(CDKN1A)在多种癌症类型中的表达和功能 生物信息学 癌症 NGS, RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 公共数据集中的多种癌症样本 Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq Illumina NovaSeq 公共数据集中使用的单细胞RNA-seq平台
878 2026-07-10
Testicular macrophages: core immune regulators and emerging therapeutic targets in spermatogenic dysfunction
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 系统综述睾丸巨噬细胞在生精功能障碍中的核心免疫调节作用及新兴治疗靶点 首次全面整合睾丸巨噬细胞的发育起源、功能异质性及其在多种男性生精功能障碍中的机制作用,并系统总结了针对睾丸巨噬细胞的治疗策略 现有研究较为分散,缺乏系统性综述与全面整合 综述睾丸巨噬细胞在生精功能障碍中的机制作用及治疗进展 睾丸巨噬细胞及其在生精功能障碍中的功能与机制 机器学 男性不育症 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
879 2026-07-10
Immune activation induced by FOLR2+ decidual macrophage deficiency impairs decidualization and angiogenesis in spontaneous abortion
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和临床验证,发现FOLR2+蜕膜巨噬细胞在复发性流产中减少,导致蜕膜化障碍和血管生成受损,揭示其维持母胎界面免疫耐受和妊娠的关键作用 首次鉴定出FOLR2+蜕膜巨噬细胞具有免疫调节、组织驻留和促血管生成特性,并揭示其与蜕膜基质细胞的互作形成正反馈环路维持妊娠,为复发性流产免疫机制提供新见解 主要基于体外功能实验,缺乏体内动物模型验证 阐明复发性流产中巨噬细胞亚型的异质性和功能机制 人类子宫内膜和蜕膜组织中的FOLR2+巨噬细胞亚群 数字病理学 复发性流产 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类子宫内膜和蜕膜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
880 2026-07-10
B cell-mediated immune reconstitution after lung transplantation: mechanisms, interventions, and prognostic evaluation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 综述了肺移植后B细胞介导的免疫重建机制、干预措施及预后评估 系统总结了B细胞在肺移植不同阶段的特异性扰动,并探讨了单细胞RNA测序和BCR谱分析等新技术用于分层免疫监测和风险预测的潜力 未明确指出局限性,但作为综述,可能受限于现有研究数据的完整性和异质性 总结肺移植中B细胞生物学、阶段特异性扰动,并探索多组学技术如何支持个性化免疫调节和预后评估 肺移植患者中的B细胞动态变化 机器学习 肺移植相关疾病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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