本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-09-03 |
Differential equation modeling of cell population dynamics in skeletal muscle regeneration from single-cell transcriptomic data
2025-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013575
PMID:41071814
|
研究论文 | 利用单细胞转录组数据构建非线性常微分方程模型,研究骨骼肌再生过程中细胞群体的动态变化 | 提出了一个由9个变量和17个参数组成的非线性常微分方程模型,并通过将时间序列的scRNA-seq数据转换为每立方毫米组织细胞数进行拟合,且引入了M2巨噬细胞与卫星细胞之间的新型调控相互作用 | 未提及明显局限性,但可能受限于模型假设和数据校准的准确性 | 通过单细胞转录组数据建模,增强对骨骼肌再生中细胞间通讯如何调控细胞命运决定和群体动态的理解 | 骨骼肌再生过程中的肌源性细胞和免疫细胞类型,包括卫星细胞、M2巨噬细胞等 | 机器学习 | 骨骼肌再生相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 非线性常微分方程模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 842 | 2026-09-03 |
Longitudinal single-cell analysis of glucagon-like peptide-2 treatment in patients with short bowel syndrome
2025-09-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194497
PMID:40773292
|
研究论文 | 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析,探讨了GLP-2类似物治疗短肠综合征患者一年期间的肠道细胞动态变化及其机制 | 首次对短肠综合征患者接受GLP-2类似物治疗进行为期一年的纵向单细胞RNA测序分析,并结合微生物组组成分析,揭示了免疫细胞和上皮细胞的动态变化及其与微生物多样性的关联 | 研究仅纳入五名男性患者,样本量小,可能限制结果的普遍性;未提及性别差异或长期随访的进一步验证 | 阐明GLP-2类似物在短肠综合征患者中增强营养吸收的精确机制,包括肠道上皮细胞和免疫细胞的变化 | 五名诊断为短肠综合征的男性患者,均接受替度鲁肽治疗 | 单细胞转录组学 | 短肠综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和微生物组分析 | NA | 基因表达数据(scRNA-Seq)和微生物组数据 | 5名男性短肠综合征患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 纵向(超过一年)的肠道组织单细胞RNA测序 |
| 843 | 2026-09-03 |
Th17 cells with regulatory phenotype are the main IL-17F and IL-26 producers in palmoplantar pustulosis
2025-09-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193038
PMID:40985896
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示掌跖脓疱病中调节性Th17细胞是IL-17F和IL-26的主要生产者 | 首次在掌跖脓疱病中发现并表征了一种共表达调节性标志物和IL-17F/IL-26的杂合调节性Th17细胞亚群,并揭示了其与IL-36G角质形成细胞的相互作用 | 样本量小,需要进一步验证,且未对候选靶点进行功能实验 | 解析掌跖脓疱病的细胞和空间结构,深入理解IL-17通路参与机制 | 掌跖脓疱病患者的皮损、非皮损和健康肢端皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序及空间转录组分析 | 聚类分析 | 基因表达数据 | PPP患者和健康对照的肢端皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | NA |
| 844 | 2026-09-03 |
Single-cell transcriptome analysis of bronchoalveolar lavage during early SARS-CoV-2 infection
2025-Sep-02, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02715-24
PMID:40742121
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析恒河猴支气管肺泡灌洗液,揭示SARS-CoV-2感染早期(0-3天)的免疫细胞动态变化 | 首次在非人灵长类模型中描绘SARS-CoV-2感染极早期的单细胞转录组图谱,识别出表达干扰素响应基因的巨噬细胞亚群和多种树突状细胞亚群的增加 | 未提供明确的局限性说明,可能仅基于少数动物或时间点,结果需进一步验证 | 探究SARS-CoV-2感染后早期阶段的免疫应答机制,以理解疾病进展和保护性免疫 | 恒河猴感染SARS-CoV-2后0-3天的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 恒河猴支气管肺泡灌洗液样本,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 845 | 2026-09-03 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析,比较了局部消融免疫治疗(LAIT)与免疫检查点抑制剂(ICI)对肿瘤浸润性自然杀伤(TINK)细胞的影响,并评估了其临床相关性 | 首次通过整合比较单细胞RNA测序分析,阐明了LAIT对TINK细胞的转录和功能调控,并揭示了其与ICI共享的抗肿瘤通路,以及构建了基于基因签名的高效预后模型 | 摘要中未提及具体局限性 | 阐明LAIT对肿瘤微环境中TINK细胞的调控作用,并与ICI诱导的NK细胞变化进行比较,以探索协同免疫治疗策略 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤浸润性NK细胞,以及多种癌症类型中的NK细胞和TCGA数据库中的乳腺癌患者数据 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据及临床生存数据 | 未指明具体样本量,涉及小鼠乳腺癌模型和多癌种数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 846 | 2026-09-03 |
Spatial omics enters the microscopic realm: opportunities and challenges
2025-09, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.05.002
PMID:40461389
|
综述 | 这篇综述文章探讨了空间转录组学进入微观分辨率时代带来的机遇与挑战,重点介绍了最新进展、关键问题以及未来的实验和计算解决方案。 | 强调了微观分辨率空间转录组学(μST)在细胞甚至亚细胞尺度上的转录组作图能力,并提出了对无分割、可扩展的分析方法以及人工智能驱动的空间分析的需求。 | 文中指出μST面临的主要挑战,包括转录本稀疏检测、数据碎片化,以及方法可扩展性不足等问题。 | 综合评述微观分辨率空间转录组学的最新突破、挑战和新兴解决方案,以推动其进一步应用。 | 微观分辨率空间转录组学技术及其应用。 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 847 | 2026-09-03 |
Identification of shared pathogenetic mechanisms between endometriosis and RSA based on comprehensive bioinformatics analysis
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03596-1
PMID:40705269
|
研究论文 | 本研究基于综合生物信息学分析,识别子宫内膜异位症与复发性自然流产之间的共享致病机制。 | 首次通过多数据集整合分析和单细胞RNA测序验证,揭示FXYD1作为子宫内膜异位症和复发性自然流产共享关键基因,并关联蜕膜化功能障碍。 | 研究主要基于公开数据集和生物信息学分析,缺乏体外或体内实验验证;样本异质性可能影响结果普适性。 | 探究子宫内膜异位症和复发性自然流产的共享分子机制及潜在关键基因。 | 子宫内膜异位症和复发性自然流产患者组织及单细胞样本。 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症、复发性自然流产 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | WGCNA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 公开数据集GSE7305和GSE165004,以及单细胞RNA测序样本。 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 848 | 2026-09-03 |
Identification of m5C-related genes and subclusters in recurrent pregnancy loss
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03580-9
PMID:40751792
|
研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定复发性流产中的m5C相关基因和亚群,并构建诊断模型 | 创新性地将复发性流产患者分为两个亚群,并分析其免疫微环境差异,为RPL的生物标志物和治疗靶点提供新视角 | 未在摘要中明确提及局限性 | 利用生物信息学方法阐明m5C相关基因与复发性流产发病机制的关系 | 48例子宫内膜组织样本 | 生物信息学 | 复发性流产 | 基因表达分析、机器学习、GSEA、单细胞RNA测序 | 机器学习模型(具体未指明) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 48例子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 849 | 2026-09-03 |
Cytotoxic CX3CR1+ Vδ1 T cells clonally expand in an interplay of CMV, microbiota, and HIV-1 persistence in people on antiretroviral therapy
2025-09, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013489
PMID:40920867
|
研究论文 | 本研究对接受抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者及健康对照者的血液和十二指肠内上皮中的Vδ1 T细胞进行了全面表征,揭示了其在CMV、微生物群和HIV-1持续存在相互作用下的克隆扩增及其细胞毒性特征 | 首次通过单细胞转录组和T细胞受体库分析,结合CMV状态和微生物群变化,阐明HIV-1感染者中Vδ1 T细胞扩增的多重触发因素及其与HIV-1储存库控制的关联 | 样本量较小,且为横断面研究,因果关系需进一步验证 | 探究HIV-1感染者中循环Vδ1 T细胞增加的原因及其在控制HIV-1储存库中的潜在作用 | Vδ1 γδ T细胞(血液和十二指肠内上皮淋巴细胞) | 免疫学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序、T细胞受体库测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列、表型与功能数据、微生物组数据 | 15名接受抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者和15名HIV血清阴性对照者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、T细胞受体库测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA-seq及V(D)J测序 |
| 850 | 2026-09-03 |
Persistent type I interferon signaling within the brain of people with HIV on ART with cognitive impairment
2025-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013411
PMID:40833988
|
研究论文 | 通过分析HIV感染者接受抗逆转录病毒治疗后大脑中的蛋白质和单细胞转录组,发现持续的I型干扰素信号在神经胶质和内皮细胞中激活,可能驱动神经炎症和认知障碍。 | 首次在HIV感染者大脑中结合蛋白质组和单细胞RNA测序,揭示I型干扰素信号在星形胶质细胞、小胶质细胞和内皮细胞中的持续激活,并发现人类内源性逆转录病毒W1包膜蛋白可直接触发该信号,即使ART有效。 | 研究样本量较小,且大脑组织来自快速尸检,可能影响细胞状态;未提供纵向数据或功能性验证。 | 阐明接受ART的HIV感染者大脑中神经炎症的分子机制,特别是I型干扰素信号的作用。 | HIV感染者的大脑组织(包括不同HAND阶段)及对照,以及迷你大脑类器官模型。 | 神经科学、免疫学、单细胞组学 | HIV相关神经认知障碍 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | 未明确 | 蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 27个HIV感染者大脑和9个对照大脑。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序,具体配置未提供。 |
| 851 | 2026-09-03 |
Age-associated immune dysregulation and B cell dysfunction drive severe outcomes in SFTSV infection
2025-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013402
PMID:40794649
|
研究论文 | 利用雪貂模型和多组织单细胞RNA测序,研究年龄相关的免疫失调和B细胞功能障碍如何导致严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)感染的严重结局 | 首次在免疫活性雪貂模型中结合多组织单细胞RNA测序,揭示老年宿主中T-bet阳性年龄相关记忆B细胞和MKI67阳性浆母细胞亚群作为病毒主要储库并驱动系统性传播的机制 | 未明确提及具体局限性 | 阐明年龄依赖性SFTSV发病机制,特别是免疫失调和B细胞功能障碍的作用 | 老年和年轻成年雪貂以及人类致命SFTSV病例样本 | 单细胞转录组学 | 严重发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年雪貂、年轻成年雪貂及人类致命病例,具体样本数未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 852 | 2026-09-03 |
PROFET Predicts Continuous Gene Expression Dynamics from scRNA-seq Data to Elucidate Heterogeneity of Cancer Treatment Responses
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.662030
PMID:40631077
|
研究论文 | 开发了PROFET框架,从稀疏采样的单细胞RNA测序数据重建连续的基因表达轨迹,并应用于揭示乳腺癌对palbociclib治疗反应的异质性。 | 提出基于Lipschitz正则化梯度流的粒子流生成方法和神经力匹配的全局向量场学习,以从静态快照重建连续非线性单细胞表达轨迹。 | 未在摘要中明确提及局限性。 | 从单细胞RNA测序静态数据推断连续基因表达动态,以解析癌症治疗反应的异质性。 | 合成数据、小鼠数据、人类数据、激素受体阳性乳腺癌细胞系及患者来源数据。 | 单细胞转录组学 | 激素受体阳性乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | PROFET(基于粒子流和神经力匹配的生成框架) | 单细胞基因表达数据(合成和真实scRNA-seq) | 未明确样本数量,涉及合成数据、小鼠数据集、人类数据集及患者来源数据集。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 853 | 2026-09-03 |
MORPH Predicts the Single-Cell Outcome of Genetic Perturbations Across Conditions and Data Modalities
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661992
PMID:40631143
|
研究论文 | 提出了MORPH框架,结合差异变分自编码器和注意力机制预测基因扰动后的单细胞反应,适用于转录组和成像数据 | 创新性地结合基于差异的自编码器与注意力机制,实现跨条件、跨数据模态预测未知扰动及组合扰动,并推导基因调控网络及设计信息性扰动 | 未提及 | 开发能够预测遗传扰动下细胞反应的通用模型,支持扰动实验优化与理解细胞程序 | 单细胞响应,关注基因扰动及其组合,涵盖不同细胞类型和条件 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞转录组测序、成像 | 差异变分自编码器(注意机制) | 单细胞转录组数据、成像数据 | 未提及 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 854 | 2026-09-03 |
Identification of potential biomarkers in cardiovascular calcification based on bioinformatics combined with single-cell RNA-seq and multiple machine learning analysis
2025-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111705
PMID:40024421
|
研究论文 | 基于生物信息学、单细胞RNA测序和多种机器学习方法识别心血管钙化的潜在生物标志物 | 结合单细胞RNA测序和多种机器学习分析方法识别出ITGAX和MYD88作为心血管钙化的新诊断生物标志物,并通过分子对接揭示维甲酸与这些标志物的潜在治疗相关性 | 样本量可能有限,且研究主要基于公开数据集和动物模型验证,可能无法完全代表人类疾病的复杂性 | 探究心血管钙化的分子和遗传机制,特别是巨噬细胞中钙化标志物相关基因表达的差异 | 巨噬细胞及血管钙化组织中的基因表达,涉及冠状动脉钙化样本和ApoE-/-小鼠 | 生物信息学、机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 酶联免疫吸附试验, 免疫组织化学 | 机器学习方法(具体模型未提及) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 855 | 2026-09-03 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell dynamics and osteoclast activation in Talaromycosis-related bone destruction
2025-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111708
PMID:40032159
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究马尔尼菲篮状菌感染引起的骨破坏中B细胞动态和破骨细胞活化机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示马尔尼菲篮状菌感染导致的小鼠骨破坏中B细胞亚群变化及其与氧化磷酸化和MAPK信号通路激活的关联 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;具体机制仍需进一步探索(信息未在标题和摘要中明确提及,推断为常见局限) | 探索马尔尼菲篮状菌感染引起的骨破坏变化及其潜在机制 | 小鼠胫骨骨髓中的B细胞和破骨细胞 | 单细胞测序 | 马尔尼菲篮状菌病相关骨破坏 | 单细胞RNA测序、显微CT、流式细胞术、qRT-PCR、Western blot | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠样本(具体数量未在标题和摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 856 | 2026-09-03 |
Therapeutic potential of Da Cheng Qi Decoction and its ingredients in regulating ferroptosis via the NOX2-GPX4 signaling pathway to alleviate and predict severe acute pancreatitis
2025-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111733
PMID:40081545
|
研究论文 | 本研究旨在阐明大承气汤通过靶向胰腺腺泡细胞铁死亡来缓解重症急性胰腺炎的保护作用,并建立用于急性胰腺炎风险评估的预测特征和列线图。 | 首次揭示大承气汤通过NOX2-GPX4信号通路调控铁死亡来减轻重症急性胰腺炎,并开发了结合多重数据的预测性列线图及单细胞分析。 | 摘要未提及实验局限,可能包括样本量小、动物模型与人体差异等因素。 | 探究大承气汤及其成分通过NOX2-GPX4信号通路调节铁死亡来减轻和预测重症急性胰腺炎的治疗潜力。 | 患者样本(32名健康对照和87名AP患者分层)、SAP小鼠模型、NOX2缺陷细胞。 | 机器学习、数字病理学、单细胞分析 | 急性胰腺炎、重症急性胰腺炎 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,HPLC分析,基因敲除技术,机器学习算法。 | LASSO回归、机器学习算法(具体模型未指明)。 | 基因表达数据、图像数据(胰腺组织损伤)、信号通路数据。 | 32名健康对照和87例AP患者,以及若干小鼠和细胞样本。 | NA | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 微阵列和单细胞RNA测序的具体平台未在摘要中说明。 |
| 857 | 2026-09-03 |
OTUB1 promotes glioma progression by stabilizing TRAF4
2025-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111704
PMID:40090557
|
研究论文 | 本研究旨在探讨OTUB1在胶质瘤中的功能作用及其对TRAF4稳定性的影响,寻找潜在的治疗靶点。 | 首次揭示OTUB1通过抑制TRAF4泛素化来稳定TRAF4,从而促进胶质瘤进展的机制。 | 未提及具体局限性。 | 探讨OTUB1在胶质瘤进展中的作用及其对TRAF4稳定性的影响,评估OTUB1作为治疗靶点的潜力。 | 胶质瘤组织和细胞系(包括LN229和U87MG细胞),以及异种移植小鼠模型。 | 癌症研究 | 胶质瘤 | 单细胞测序、Western blot、qPCR、免疫沉淀、泛素化检测、体外细胞实验、异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞测序数据、细胞和分子生物学数据 | 12名胶质瘤患者的20,145个胶质瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 858 | 2026-09-03 |
Targeting FGFR Attenuates Tumor Growth in an Anal Squamous Cell Carcinoma Patient Derived Xenograft Model
2025-07, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23919
PMID:40256931
|
研究论文 | 利用患者来源异种移植模型和单细胞RNA测序,发现FGFR信号通路是肛门鳞状细胞癌的治疗靶点,并验证FGFR抑制剂AZD4547能有效减缓肿瘤生长 | 首次在肛门鳞状细胞癌的PDX模型中使用单细胞RNA测序分析,揭示上皮癌细胞异质性,并识别出高表达FGFR1-2和FGF配体的上皮亚群为潜在治疗靶点 | 研究基于单一转移性样本,可能限制结果的普遍性;FGFR抑制后残留细胞的增殖和凋亡标志物显示持续增殖,提示需要联合治疗策略 | 识别肛门鳞状细胞癌的可操作治疗靶点,评估FGFR抑制剂的抗肿瘤效果 | 肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型 | 数字病理学 | 肛门鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源异种移植模型 | 基因表达数据 | 来自一名转移性肛门鳞状细胞癌患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 859 | 2026-09-03 |
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658502
PMID:40501632
|
研究论文 | 本研究识别并表征了一类位于早期肝芽腹后侧、源自CDX2+FOXA2+内胚层祖细胞的原始肝母细胞,揭示其在早期肝脏发育中的贡献及调控机制 | 首次发现并定义了原始肝母细胞这一新的早期肝母细胞亚群,利用单细胞转录组学、谱系追踪和表观遗传扰动等手段揭示了其受WNT抑制和RA许可调控的起源机制,并通过人多能干细胞分化模型验证其功能 | 摘要未提及研究的局限性,可能包括样本数量有限、动物模型与人类的差异、以及早期发育阶段的动态调控尚未完全阐明 | 阐明早期肝脏发育中肝母细胞的谱系异质性和调控机制,为正常和异常肝脏发育的研究提供新框架 | 小鼠和人类胚胎早期的肝母细胞及其祖细胞,以及人多能干细胞衍生的原始肝母细胞样细胞 | 单细胞转录组学、发育生物学 | 不适用 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传与功能扰动、人多能干细胞分化 | 不适用 | 单细胞转录组数据、表观遗传数据、谱系追踪数据 | 小鼠和人类胚胎样本,具体数量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 860 | 2026-09-03 |
Pdia3 deficiency exacerbates intestinal injury by disrupting goblet and Paneth cell function during ischemia/reperfusion
2025-06, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111682
PMID:39988288
|
研究论文 | 本研究探讨了Pdia3缺乏通过破坏杯状细胞和潘氏细胞功能加剧肠缺血/再灌注损伤的作用机制 | 首次揭示PDIA3在肠道上皮细胞分化及抗菌肽分泌中的关键作用,并证实重组防御素α1可缓解Pdia3缺失引起的肠道损伤 | 摘要中未提及研究局限性 | 阐明PDIA3在肠缺血/再灌注损伤中维持肠道完整性和免疫功能的作用 | 人类和小鼠肠道组织,包括肠上皮细胞、杯状细胞、潘氏细胞及肠道微生物 | 分子生物学 | 肠缺血/再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像、微生物组数据 | 人类患者及Pdia3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |