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当前共找到 41796 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-07-10 |
scRAPID-web: a web server for predicting protein-RNA interactions from single-cell transcriptomics
2026-May-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12870-0
PMID:42129640
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研究论文 | scRAPID-web是一个基于单细胞转录组学预测蛋白质-RNA相互作用的网络服务器 | 将单细胞RNA测序数据与catRAPID预测整合，提供用户友好的网络界面，支持八种模式生物的RBP-RNA和RBP-RBP相互作用预测 | 依赖预先编译的文库和选择的基因调控网络推理算法，可能限制分析的灵活性和适用范围 | 开发可访问的网络工具，基于单细胞转录组数据预测蛋白质-RNA相互作用和调控网络 | 八种模式生物中与RNA结合蛋白和RNA相互作用相关的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 842 | 2026-07-10 |
Multi-omics mapping identifies a C/EBPβ-S100a4⁺ macrophage axis as a therapeutic target in acute spinal cord injury
2026-May-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08239-2
PMID:42135765
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研究论文 | 利用多组学整合方法鉴定急性脊髓损伤中的C/EBPβ-S100a4+巨噬细胞轴作为治疗靶点 | 首次通过高时间分辨率的单细胞RNA测序与系统网络建模，解析出C/EBPβ-S100a4+巨噬细胞轴作为急性神经炎症的主要驱动因子，并发现黄芩素能有效调控该轴 | 未提及明显局限性，但初步研究可能需进一步验证在人体中的适用性 | 阐明急性脊髓损伤后早期免疫细胞状态及其上游调控回路，以识别基于机理的治疗靶点 | 小鼠脊髓损伤模型及激活的巨噬细胞 | 机器学习 | 急性脊髓损伤 | RNA-seq | CNN | 图像 | 小鼠脊髓样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 843 | 2026-07-10 |
Cellular state heterogeneity underlying sex differences in Alzheimer's disease based on single-cell transcriptome
2026-May-14, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-02081-w
PMID:42135783
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研究论文 | 基于单细胞转录组分析阿尔茨海默病中性别差异的细胞状态异质性 | 通过非负矩阵分解识别细胞类型特异性元程序，揭示性别偏向的细胞状态及其在代谢、细胞间通讯和疾病关联中的差异 | 未提及，但潜在包括样本来源的异质性和分析方法的计算偏差 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制，聚焦于细胞状态异质性 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑组织细胞，包括六种主要细胞类型 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞或单核转录组数据 | 603个样本（296个女性，307个男性；339个AD，264个正常）来自10个队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 844 | 2026-07-10 |
Modulation of tumor-derived exosomes and reprogramming of cancer-associated fibroblasts for colorectal cancer therapy
2026-May-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02661-2
PMID:42092888
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧条件下结直肠癌细胞来源外泌体通过HIF1A-AS2/miR-33/HIF-1α轴激活成纤维细胞为癌症相关成纤维细胞的机制，并探索了潜在治疗策略 | 首次发现缺氧诱导的外泌体lncRNA HIF1A-AS2通过海绵吸附miR-33解除对HIF-1α抑制，激活Notch1/ERK信号通路，驱动正常成纤维细胞向癌相关成纤维细胞转化，并利用机器学习和单细胞转录组分析验证其作为预后标志物的潜力 | 研究主要基于体外细胞实验和异种移植模型，尚需临床样本验证及深入机制解析 | 阐明缺氧肿瘤外泌体介导的成纤维细胞重编程在结直肠癌进展中的作用及其分子机制 | 结直肠癌细胞来源外泌体、正常组织相关成纤维细胞、癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 外泌体分离与表征、单细胞RNA测序、机器学习分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多种结直肠癌细胞系及异种移植模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 845 | 2026-07-10 |
Seesaw signatures capture trajectory-like transcriptomic shifts and enable compact tumour cell classification across cancers
2026-May-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10172-5
PMID:42086757
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research paper | 研究发现Seesaw配对能捕捉轨迹样转录组变化，实现跨癌种的紧凑肿瘤细胞分类 | 提出Seesaw配对概念，基于基因表达排名反转来识别恶性转化，仅需三个基因对即可在44个数据集上实现高精度分类 | 未明确说明实验验证或外部独立数据集中的泛化能力，可能受限于单细胞RNA-seq技术本身的数据异质性 | 开发一种简单、可解释的肿瘤细胞识别方法，提高跨癌种分类的准确性和普适性 | 44个单细胞RNA测序数据集，涵盖22种癌症类型 | 单细胞基因组学 | 多种癌症（如肺癌、前列腺癌等） | 单细胞RNA测序 | 基于Seesaw配对的分类器 | 单细胞基因表达数据 | 44个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 846 | 2026-07-10 |
Cross-species comparison of amniote single-cell transcriptomes reveals evolutionary conservation and divergence in the chicken immune system
2026-May-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72642-y
PMID:42086564
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组比较，揭示鸡免疫系统的进化保守性和差异性 | 首次构建包含157万细胞、157种细胞类型的鸡单细胞转录组图谱，并整合龟类和鸭类数据与人类scRNA-seq数据进行比较，发现鸡滤泡树突状细胞起源于髓系而非基质系 | 仅涉及3种龟类、2种鸭类，人类数据为公开数据，可能存在批次效应和物种间比较的偏差 | 通过跨物种单细胞转录组比较，研究鸡免疫系统的进化保守性和差异性 | 鸡、龟、鸭和人类免疫细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 16只鸡（157万细胞，36组织）、3只龟（23万细胞，14组织）、2只鸭（2.2万细胞，3组织）、人类公共数据（96万细胞，32组织） | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | NA |
| 847 | 2026-07-10 |
Single-cell transcriptome sequencing (ScRNA-seq) uncovers the regulatory role of lodicule cells in rice floret opening (FO)
2026-May-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10191-2
PMID:42082742
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示水稻浆片细胞在颖花开放中的调控机制 | 首次利用单细胞转录组测序解析了浆片细胞在颖花开放中的异质性调控网络，特别是韧皮部与浆片细胞的通讯在渗透调节和细胞壁重塑中的作用 | 研究仅关注了两个时间点（开花前和开花期），未涵盖更早或更晚的发育阶段；功能验证实验不足 | 阐明水稻颖花开放中浆片细胞介导的分子调控机制 | 水稻小穗样本中的浆片细胞及相关细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 水稻小穗样本，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 848 | 2026-07-10 |
SCMBench: benchmarking domain-specific and foundation models for single-cell multi-omics data integration
2026-May-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72570-x
PMID:42069651
|
研究论文 | 对域特定模型和基础模型在单细胞多组学数据整合中的表现进行基准测试 | 首次全面评估基础模型与域特定模型在多组学整合任务中的性能，并提出轻量级自适应策略来弥补基础模型的不足 | 未提及与其他数据类型或更大规模数据集的整合评估，可能限制泛化性 | 系统评估域特定模型和基础模型在单细胞多组学数据整合中的准确性、生物标志物检测、轨迹推断和批次校正能力 | 23种单细胞多组学数据整合方法 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 域特定模型和基础模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 849 | 2026-07-10 |
Genetic profile of Lepr+ skeletal stem/progenitor cells in the periodontal ligament and functional compensation during aging and bone repair
2026-05, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.117833
PMID:41692367
|
研究论文 | 通过谱系追踪和单细胞RNA测序，研究了牙周膜中Lepr+骨骼干/祖细胞的遗传特征，揭示了其层级组织、功能特性和在衰老及骨修复中的补偿机制 | 首次揭示Lepr牙周膜细胞中Thy1阳性而Runx2阴性的亚群处于层级顶端，并发现Kitl表达特异性，以及衰老过程中Lepr细胞贡献下降且存在其他细胞群的补偿作用 | Lepr PDLCs对骨修复的贡献有限，且遗传消除后再生骨量未减少，提示需要进一步研究其他SSPC群体的具体作用 | 阐明牙周膜中Lepr阳性骨骼干/祖细胞的层级组织、干性维持及其在衰老和骨修复中的功能 | 小鼠牙周膜中的Lepr阳性骨骼干/祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 850 | 2026-07-10 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-05, Gene therapy
IF:4.6Q2
DOI:10.1038/s41434-026-00600-w
PMID:41813829
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单核RNA测序，揭示rAAV2和rAAV9载体在小鼠肝脏中的转导特征及性别差异 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序相结合，系统绘制rAAV血清型、性别和肝小叶区域分布对转导及转录组变化的影响图谱 | 未明确提及研究局限性 | 探索rAAV血清型、性别和肝脏分区对转导及转录组变化的影响 | 雄性及雌性小鼠肝脏 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 小鼠肝脏样本（具体数量未提） | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 851 | 2026-07-10 |
Blockade of Tumor TAK1 Induces DNA Damage and Immunogenic cGAS-STING Pathway Activation in Pancreatic Cancer
2026-May-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.017
PMID:42070691
|
研究论文 | 研究通过抑制胰腺导管腺癌中的TAK1激酶，激活cGAS-STING通路诱发DNA损伤，增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 首次揭示TAK1通过磷酸化Ephrin受体A2和RAD51维持基因组完整性的机制，并将TAK1抑制与免疫原性细胞死亡和肿瘤微环境重编程联系起来 | 未提及在人体临床试验中的疗效评估及长期安全性数据 | 探索靶向TAK1作为胰腺癌免疫治疗新策略的可能性 | 人类胰腺导管腺癌样本、基因工程小鼠模型及肿瘤-免疫细胞共培养体系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 人类胰腺癌样本（具体数量未说明）、p48-Cre/Trp53f/f/LSL-KrasG12D基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 852 | 2026-07-10 |
A Muribaculaceae-enriched microbiota exacerbates TLR4-dependent Acinetobacter baumannii-induced hyperinflammatory sepsis
2026-Apr-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72435-3
PMID:42062271
|
研究论文 | 本研究揭示了富含Muribaculaceae的肠道菌群通过TLR4依赖性过度炎症加剧鲍曼不动杆菌诱导的高炎症性败血症 | 首次发现特定肠道菌群配置（富含Muribaculaceae）通过TLR4依赖性方式调节宿主对鲍曼不动杆菌感染的炎症反应阈值，而非病原体清除能力，决定败血症结局 | 仅使用雌性C57BL/6小鼠模型，未在其他物种或性别中验证；未明确热稳定低分子量代谢物的具体化学身份 | 探究肠道菌群配置如何影响宿主对鲍曼不动杆菌诱导败血症的易感性及其分子机制 | 雌性C57BL/6小鼠及其肠道菌群，特别是Sangeribacter muris KT1-3菌株 | 机器学习 | 败血症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个雌性C57BL/6小鼠群体 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 853 | 2026-07-10 |
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72284-0
PMID:42056094
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研究论文 | 提出一种名为SpaCNA的计算框架，用于从空间转录组数据中稳健检测拷贝数改变 | 整合多模态信息（基因表达与空间位置），利用隐藏马尔可夫随机场模型实现空间连续的CNA检测，并支持三维重建 | 未提及局限性 | 开发高精度检测空间转录组中拷贝数改变的方法，以分析肿瘤内异质性和空间肿瘤生物学 | 模拟数据及乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌的真实空间转录组数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 隐藏马尔可夫随机场 | 基因表达数据 | 多个模拟数据集及三组真实癌症数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 854 | 2026-07-10 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
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研究论文 | 该研究通过整合空间分析、单细胞RNA测序和多重免疫组化，发现肿瘤细胞衍生的干扰素通过STAT信号诱导肿瘤相关巨噬细胞表达骨桥蛋白，形成免疫抑制性微环境，导致PARP抑制剂耐药 | 首次揭示肿瘤细胞来源的干扰素在空间上重编程骨桥蛋白富集的巨噬细胞微环境，建立干扰素-骨桥蛋白空间轴介导的PARP抑制剂耐药新机制，并证明骨桥蛋白可作为预后生物标志物和治疗靶点 | 未描述具体局限性 | 探究PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中耐药的空间免疫微环境机制 | 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗临床试验中的初治高级别浆液性卵巢癌标本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间分析，单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | 空间蛋白质组学数据，单细胞转录组数据，组织切片图像数据 | 来自前瞻性临床试验的卵巢癌患者标本，具体数量未标出 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析平台 |
| 855 | 2026-07-10 |
A colon mimetic screening approach reveals Lactobacillus fermentum as a microbiome-based therapy for COPD
2026-04-14, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-026-00978-w
PMID:41980958
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研究论文 | 通过结肠模拟个性化药物元分析筛选平台发现发酵乳杆菌作为慢性阻塞性肺疾病的微生物组疗法 | 首次利用结肠模拟个性化药物元分析筛选平台从重度COPD患者粪便样本中筛选出具有治疗潜力的发酵乳杆菌，并通过单细胞转录组学和粪便微生物组分析揭示其作用机制 | 研究仅处于临床前阶段，未进行人体临床试验验证 | 评估发酵乳杆菌对COPD的治疗效果及其作用机制 | 烟雾暴露小鼠模型 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞转录组学 | 个性化药物元分析筛选平台 | 基因表达数据, 微生物组数据 | 重度COPD患者粪便样本用于筛选，烟雾暴露小鼠用于治疗实验，具体样本数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序, 粪便微生物组分析 | NA | NA |
| 856 | 2026-07-10 |
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2026.113070
PMID:41707912
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态变化 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，识别出DDIT4作为骨质疏松症的风险因子，并构建了预测性能良好的诺模图 | 研究样本量有限，标记物的临床验证尚需更大规模队列研究支持 | 揭示骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关基因标志物及其免疫机制，以改善诊断和治疗 | 骨质疏松症患者组织样本及公开数据库中的表达数据 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、qRT-PCR、Western blot | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量，涉及公开数据库及实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 857 | 2026-07-10 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析闭合性轻度脑损伤模型，发现炎症小体接头蛋白ASC在神经炎症和轻度认知障碍中发挥关键作用 | 首次揭示ASC作为主要炎症小体接头蛋白在轻度闭合性脑损伤后持续神经炎症和认知缺陷中的关键作用 | NA | 探究闭合性轻度脑损伤后炎症小体相关基因的细胞表达及其功能意义 | 闭合性轻度脑损伤小鼠模型及其皮质组织 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 858 | 2026-07-10 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
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研究论文 | 本文揭示RETN通过GBP5/NLRP3信号通路介导巨噬细胞焦亡加重脓毒症的作用机制 | 首次证明RETN/GBP5/NLRP3信号轴调控巨噬细胞焦亡加重脓毒症，为脓毒症发病机制研究和临床治疗提供新靶点 | 未提及具体研究局限性 | 探究RETN影响脓毒症病理生理的特异性通路 | 脓毒症患者巨噬细胞及小鼠模型 | 机器学 | 脓毒症 | 单细胞测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 859 | 2026-07-10 |
CPNE1: A novel therapeutic target for myopia progression - from genetic GWAS discovery to functional validation in vitro and vivo
2026-Mar-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08050-z
PMID:41888893
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研究论文 | 通过遗传GWAS发现与功能验证，揭示CPNE1在近视进展中的新型治疗靶点作用 | 首次通过GWAS荟萃分析与SMR方法确定CPNE1为近视相关基因，并在体外和体内实验验证其通过调控巩膜重塑抑制眼轴伸长，提出了CPNE1作为近视治疗新靶点的创新观点 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量限制或动物模型与人类疾病的差异 | 识别与近视相关的关键调控基因并验证CPNE1的治疗潜力 | 近视患者眼组织样本、透镜诱导近视（LIM）小鼠模型、巩膜成纤维细胞 | 基因组学 | 近视 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、腺相关病毒（AAV）介导的基因过表达 | LASSO回归，SMR，贝叶斯共定位分析 | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA数据 | 41,468例近视病例与817,202例对照（来自两个大规模GWAS） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 860 | 2026-07-10 |
Peripheral monocyte ratio as a predictive biomarker for metastasis-directed therapy in prostate cancer: insights from an exploratory study
2026-Mar-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15854-1
PMID:41888707
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研究论文 | 探索性研究发现外周血单核细胞比例可作为前列腺癌转移导向治疗的预测性生物标志物 | 首次提出外周血CD14高表达（经典）与CD14低表达（非经典）单核细胞比例可作为寡转移前列腺癌患者接受转移导向治疗（MDT）前的预测性生物标志物，并发现该比例与生化完全缓解和生化无进展显著相关 | 初步研究结果，样本量较小（26例），需进一步验证；单细胞RNA测序仅针对前列腺癌转移灶，未包含原发灶数据 | 探索寡转移前列腺癌患者在接受转移导向治疗（SBRT联合间歇性雄激素剥夺治疗）前的外周血单核细胞比例能否作为预测疗效的生物标志物 | 26例激素敏感性寡转移前列腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 外周血单核细胞数据、单细胞转录组数据 | 26例激素敏感性寡转移前列腺癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析前列腺癌转移灶 |