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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-10-21 |
Hypothesis-Generating Single-Cell Analysis of the Endometrial Cancer Immune Microenvironment With Complementary Multiomics Evidence
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5125648
PMID:42894744
|
研究论文 | 该文利用单一应答者与单一非应答者子宫内膜癌样本的单细胞RNA测序数据描述免疫微环境,并以TCGA-UCEC、肠道菌群队列及RL95-2实验作为补充性多组学证据 | 在同一EC患者配对中联合单细胞转录组、TCGA-UCEC bulk转录组、独立肠道菌群16S数据及RL95-2概念验证实验,提出候选免疫、激素和微生物相关通路 | 每个临床应答组仅有一个样本,所有应答者与非应答者比较均为描述性和假设生成性,无法建立患者层面显著性、因果关系或临床验证的生物标志物 | 描述子宫内膜癌免疫微环境中的免疫细胞状态并生成关于抗PD-1免疫治疗应答相关生物学的假设 | 接受抗PD-1免疫治疗的子宫内膜癌患者单细胞样本、TCGA-UCEC肿瘤与正常样本、肠道菌群队列及RL95-2细胞系 | 数字病理/单细胞组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 16S rRNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据, 微生物16S rRNA序列数据, qRT-PCR表达数据 | 2例EC患者scRNA-seq样本(1例应答者、1例非应答者,质控后保留17,546个细胞);TCGA-UCEC 554例肿瘤和35例正常样本;两个独立肠道菌群16S队列;RL95-2细胞实验 | Illumina | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 842 | 2026-10-21 |
Identification of Diagnostic Biomarkers Related to Oxidative Stress in Rheumatoid Arthritis
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 该研究从GEO数据库获取RA转录组数据,利用ssGSEA计算氧化应激评分,并通过多种机器学习方法筛选出五个氧化应激相关基因(CARS2、VCP、FCGR2A、ITGB2、SETD2),构建了用于RA诊断的逻辑回归模型 | 首次将氧化应激评分与多种机器学习特征筛选方法(SVM-RFE、LASSO、随机森林、XGBoost)结合,识别出五个氧化应激相关基因作为RA诊断标志物,并构建了AUC大于0.9的诊断模型,同时结合单细胞RNA测序和体外实验揭示了这些基因在免疫细胞中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,样本来源和数量有限,体外实验仅使用MH7A和HFLS细胞系验证,缺乏大规模独立临床队列验证,诊断模型的临床适用性仍需进一步评估 | 识别氧化应激相关基因作为类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物,并构建诊断模型 | 类风湿关节炎患者样本及正常对照样本、MH7A细胞和HFLS细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 逻辑回归、SVM-RFE、LASSO、随机森林、XGBoost | 基因表达数据、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 843 | 2026-10-21 |
[Distinguishing relapse from sustained remission in acute myeloid leukemia. Lineage-specific developmental stage distributions]
2026, Arkhiv patologii
DOI:10.17116/patol20268805129
PMID:42885417
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研究论文 | 该研究利用BoneMarrowMap参考图谱将急性髓系白血病患者微小残留病(MRD)样本中的骨髓细胞定位到五个造血谱系的发育阶段,并通过阶段分布特征区分复发与持续缓解 | 提出基于谱系特异性发育阶段分布的新特征,利用公开单细胞图谱作为坐标系,通过不确定性归一化距离和相邻阶段一致性进行患者分类,在多个独立队列中实现高AUC | 研究依赖于公开参考图谱和标准单细胞RNA测序数据,样本量有限(47例患者),需要进一步在前瞻性队列中验证 | 利用单细胞转录组数据刻画急性髓系白血病微小残留病骨髓细胞的发育阶段分布,以区分复发与持续缓解 | 47例来自四个独立队列的急性髓系白血病患者,其中28例复发、19例持续缓解 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 47例患者(28例复发,19例持续缓解),参考图谱包含263,159个细胞、24种主要细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 844 | 2026-10-21 |
Impaired erythroid maturation in murine embryos upon loss of the preeclampsia-associated serine protease prostasin Prostasin loss impairs erythropoiesis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0360958
PMID:42886667
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研究论文 | 该研究揭示了前蛋白转化酶prostasin(由Prss8编码)在小鼠胚胎发育性红细胞生成和血管模式形成中的新作用,其缺失会导致原始红细胞成熟受损和卵黄囊血管重塑异常 | 首次发现prostasin在胚胎发育性红细胞生成中发挥作用,并揭示其通过细胞外机制调控原始红细胞生成,同时将Prss8失调与胎盘病理如子痫前期联系起来 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;prostasin调控红细胞成熟的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究前蛋白转化酶prostasin(Prss8)在胚胎发育性红细胞生成和血管发育中的作用 | Prss8基因敲除小鼠胚胎(E11.5和E12.5)的卵黄囊、胎盘和胎肝 | 发育生物学、血液学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | Prss8-/-小鼠胚胎在E11.5和E12.5的卵黄囊、胎盘和胎肝样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 845 | 2026-10-21 |
Identification of SGK1 as a candidate regulator associated with myeloid cell senescence in ME/CFS: An integrative transcriptomic and experimental study
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0359082
PMID:42886747
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研究论文 | 该研究综合转录组学和实验分析,识别出SGK1是与ME/CFS中髓系细胞衰老相关的候选调控因子 | 首次探索髓系细胞衰老在ME/CFS中的作用,结合bulk转录组、单细胞转录组和体外实验多维度验证SGK1与髓系细胞衰老的关联 | 需要在原代ME/CFS来源的免疫细胞和临床队列中进一步验证SGK1的生物学意义和临床相关性 | 探索髓系细胞衰老在ME/CFS发病机制中的作用,识别与ME/CFS髓系细胞衰老相关的候选调控基因 | ME/CFS患者及D-半乳糖诱导的THP-1细胞衰老模型 | 转录组学 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征 | bulk转录组测序, 单细胞RNA测序, siRNA敲低 | LASSO回归, 随机森林, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 846 | 2026-10-21 |
Hematopoietic EphA4 deficiency alters microglial heterogeneity and improves chronic spatial memory after brain injury
2025-12-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30648-4
PMID:41350381
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研究论文 | 该研究利用造血特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠结合控制性皮层撞击模型,探究外周免疫来源的EphA4信号对脑外伤后小胶质细胞动态及功能恢复的影响 | 首次揭示造血系统来源的EphA4信号可调控小胶质细胞异质性,并负向调节脑外伤后长期神经免疫重塑和空间记忆功能恢复 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;单细胞RNA测序仅针对损伤后90天的海马组织,缺乏对更长时间点及其他脑区的系统分析 | 探究外周免疫来源的EphA4信号在脑外伤后急性和慢性小胶质细胞反应及功能恢复中的作用 | 造血特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠及对照小鼠 | 神经免疫学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为学数据、组织形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 847 | 2026-10-21 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct cancer-associated fibroblast signatures in treatment-refractory esophageal squamous cell carcinoma
2025-12-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28903-9
PMID:41345494
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研究论文 | 该文通过对10例接受新辅助同步放化疗(nCCRT)后手术切除的食管鳞癌(ESCC)患者的肿瘤及癌旁正常组织进行单细胞转录组测序,揭示了与淋巴结浸润状态相关的不同癌症相关成纤维细胞(CAF)和NK细胞特征 | 首次在nCCRT治疗的ESCC中,基于淋巴结浸润状态分层,鉴定出CLEC2BhimyCAF亚型与浸润组相关、F11RhiCD56dim NK亚型与非浸润组相关,并发现治疗相关细胞特征可延伸至放射野内的癌旁正常组织,提示区域组织重编程 | 样本量较小(共10例患者,每组5例),仅基于单细胞转录组测序,缺乏蛋白水平或功能验证,且未进行独立队列验证 | 探究接受nCCRT的ESCC患者中与淋巴结浸润状态相关的肿瘤微环境细胞特征 | 接受nCCRT后手术切除的ESCC患者的肿瘤组织及癌旁正常组织 | 数字病理,单细胞组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例患者的肿瘤及癌旁正常组织,共47,907个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 848 | 2026-10-21 |
Diminished osteoprotegerin production by gingival fibroblasts from periodontitis patients is associated with their reduced ability to suppress osteoclastogenesis
2025-11-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29944-w
PMID:41315835
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研究论文 | 本文研究了健康供体与牙周炎患者牙龈成纤维细胞分泌的介质对破骨细胞形成的影响,并揭示了OPG在其中的核心调控作用 | 首次结合3D器官型重建人牙龈模型与单细胞RNA-seq数据,明确牙龈成纤维细胞是牙龈组织中OPG的主要来源,并证明牙周炎患者牙龈成纤维细胞因OPG产生减少而削弱其抑制破骨细胞生成的能力 | 研究主要基于体外条件培养基实验和公共单细胞数据,缺乏体内功能验证,且未完全阐明炎症微环境长期影响GFs功能的具体分子机制 | 探究牙龈成纤维细胞分泌的介质对破骨细胞生成的调控作用,以及牙周炎患者与健康个体牙龈成纤维细胞在此功能上的差异 | 健康供体与牙周炎患者的牙龈成纤维细胞、RANKL诱导的破骨细胞、3D器官型重建人牙龈模型 | 口腔生物学、骨免疫学 | 牙周炎 | 单细胞RNA-seq、siRNA基因沉默、条件培养基实验、3D器官型培养 | NA | 文本、图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 849 | 2026-10-21 |
Dose-dependent effects of wheat germ oil and vitamin E on apoptosis and gene expression in breast and cervical cancer cell lines with single-cell RNA-seq profiling
2025-11-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25408-3
PMID:41285842
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研究论文 | 研究不同剂量小麦胚芽油和维生素E对乳腺癌和宫颈癌细胞系凋亡及基因表达的影响,并进行单细胞RNA测序分析 | 首次结合单细胞RNA测序技术分析小麦胚芽油和维生素E对宫颈癌细胞的作用,并系统比较不同剂量对凋亡通路基因表达的影响 | 仅使用两种细胞系进行体外实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本数据;单细胞RNA测序仅针对宫颈癌细胞 | 探讨不同剂量小麦胚芽油和α-生育酚对MCF-7乳腺癌和HeLa宫颈癌细胞系的治疗效应及其对凋亡基因表达的影响 | MCF-7乳腺癌细胞系和HeLa宫颈癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌, 宫颈癌 | 流式细胞术, 实时荧光定量PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | MCF-7和HeLa两种细胞系,分别用三种浓度的小麦胚芽油和α-生育酚处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 850 | 2026-10-21 |
M2 macrophages and tumor cells engage in a metabolic feedback loop to drive HCC progression
2025-11-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25673-2
PMID:41286064
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了肝细胞癌中肿瘤细胞与M2巨噬细胞之间的代谢反馈环路,并构建了基于OXPHOS相关基因的预后模型 | 首次提出OXPHOS-核糖体-M2极化轴,揭示了肿瘤细胞高OXPHOS与M2巨噬细胞核糖体活性增强之间的代谢耦合机制 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境中TAM重编程机制及其代谢相互作用 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞(特别是M2极化亚群) | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 预后模型(基于OXPHOS相关基因) | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 851 | 2026-10-21 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-11-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
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研究论文 | 该研究整合公共数据集与自有队列,基于炎症反应相关基因构建免疫相关预后模型,并鉴定LRP12为胃癌预后生物标志物,揭示其通过AKT/mTOR信号通路和M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展 | 首次将LRP12鉴定为炎症反应相关基因相关的差异表达基因和稳健的预后标志物,并揭示其通过激活AKT/mTOR通路及促进M2巨噬细胞浸润介导免疫抑制来推动胃癌进展的双重机制 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 鉴定可预测预后并调节肿瘤免疫微环境的炎症相关生物标志物,重点关注LRP12在胃癌中的作用机制 | 胃癌患者队列及胃癌细胞系 | 数字病理, 机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组测序, 多重免疫荧光, 免疫组织化学, Western blotting, 体外增殖与侵袭实验, 异种移植模型 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 852 | 2026-10-21 |
Osteopontin inhibitor alleviates neuroinflammation after subarachnoid hemorrhage in rats via TLR4/NF-κB pathway
2025-11, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序发现SAH大鼠颞叶组织中SPP1(OPN)显著升高,并验证OPN抑制剂通过TLR4/NF-κB通路减轻神经炎症、改善认知功能 | 首次结合单细胞RNA测序发现OPN在SAH后显著上调,并证明OPN抑制剂可通过TLR4/NF-κB通路改善血脑屏障通透性和神经炎症 | 仅在大鼠模型中进行验证,样本量有限,未涉及临床转化验证 | 探讨OPN抑制剂对蛛网膜下腔出血大鼠的保护作用及其机制 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型 | 神经科学 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 853 | 2026-10-21 |
CD8a + GZMK + T Cells Inhibit Osteoclastogenesis in Postmenopausal Osteoporosis via the p38-MAPK Pathway
2025-07-07, Calcified tissue international
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s00223-025-01402-9
PMID:40622431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示绝经后骨质疏松症(PMOP)小鼠骨髓T细胞异质性,鉴定出CD8a+GZMK+T细胞亚群,并证明其通过分泌GzmK经p38-MAPK通路抑制破骨细胞生成 | 首次鉴定并表征CD8a+GZMK+T细胞亚群,揭示其分泌GzmK通过p38-MAPK通路抑制破骨细胞生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证;GzmK治疗的具体分子机制及安全性仍需进一步研究 | 探究绝经后骨质疏松症中骨髓T细胞的异质性及其对破骨细胞生成的作用和机制 | 绝经后骨质疏松症小鼠的股骨骨髓T细胞及原代骨髓巨噬细胞(BMMs) | 单细胞转录组学、骨免疫学 | 绝经后骨质疏松症 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、TRAP染色、免疫荧光染色、qPCR、RNA测序、Western blot | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 854 | 2026-10-21 |
Dissecting the tumor microenvironment in primary breast angiosarcoma: insights from single-cell RNA sequencing
2025-06-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02022-9
PMID:40474296
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术,对原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境进行解析,并与侵袭性乳腺癌进行对比分析 | 首次系统性地利用单细胞RNA测序技术刻画原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境,揭示其细胞异质性及独特的细胞通讯网络,发现FAT4、KDR、FN1、KIT等基因在血管肉瘤内皮细胞中高表达且与不良预后相关,并鉴定CXCL12-CXCR4轴为关键治疗靶点 | 样本量较小,仅纳入一例双侧原发性乳腺血管肉瘤患者和两例侵袭性乳腺癌患者,缺乏更大规模的验证队列 | 表征原发性乳腺血管肉瘤的细胞异质性和独特肿瘤微环境,鉴定潜在治疗靶点并改善临床预后 | 一例双侧原发性乳腺血管肉瘤患者和两例侵袭性乳腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学、肿瘤微环境研究 | 乳腺癌、血管肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者肿瘤样本,共31771个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 855 | 2026-10-21 |
Progesterone signaling in oviductal epithelial cells modulates the immune response to support preimplantation embryonic development
2025-Apr-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6113
PMID:40249812
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除输卵管上皮细胞中的孕激素受体,揭示了孕激素信号在调节免疫反应和支持植入前胚胎发育中的关键作用 | 首次通过条件性敲除输卵管上皮细胞孕激素受体模型,结合单细胞RNA测序,发现孕激素信号通过抑制促炎基因(如IL-22)表达来维持免疫微环境,从而支持胚胎发育;并证明非甾体抗炎药可挽救胚胎发育迟缓 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;未详细探讨孕激素信号调控IL-22表达的具体分子机制;样本量有限 | 探究孕激素信号在输卵管上皮细胞中对免疫调节和植入前胚胎发育的作用 | 小鼠输卵管上皮细胞及植入前胚胎 | 生殖生物学 | 妊娠失败 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 856 | 2026-10-21 |
Neonatal inflammation impairs developmentally-associated microglia and promotes a highly reactive microglial subset
2025-01, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.09.019
PMID:39322088
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术,研究新生期炎症对小鼠神经发育障碍模型中脑髓系细胞亚群的影响 | 鉴定出表达补体受体C5ar1的特定小胶质细胞亚群,该亚群炎症通路激活最强,来源于最成熟且处于稳态的小胶质细胞,并对炎症表现出超敏反应 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类中验证;仅使用单细胞RNA测序和流式细胞术,缺乏空间信息 | 探究新生期炎症对神经发育障碍中脑髓系细胞亚群发育轨迹和反应性的影响 | 小鼠神经发育障碍模型中的脑髓系细胞(小胶质细胞和边界相关巨噬细胞) | 神经科学、单细胞组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 857 | 2026-10-21 |
Targeting CNS myeloid infiltrates provides neuroprotection in a progressive multiple sclerosis model
2024-11, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.08.032
PMID:39179123
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研究论文 | 该研究在Biozzi小鼠EAE模型中通过脑室内持续给予RARα激动剂,调控CNS髓系细胞的毒性和存活,从而减轻慢性进展性多发性硬化模型中的轴索损伤 | 首次证明在慢性脱髓鞘疾病中直接靶向CNS髓系细胞并调节其毒性可预防不可逆组织损伤,提出了CNS免疫浸润的旁观者神经毒性概念,并发现选择性调节CNS髓系细胞毒性和存活可减少组织损伤 | 研究基于EAE动物模型,尚未在人类MS患者中验证;治疗导致神经炎症浸润 Paradoxically 增加,其长期安全性及临床转化可行性仍需进一步研究 | 探究直接靶向CNS髓系细胞并调节其毒性是否能够预防慢性免疫介导的脱髓鞘疾病中的不可逆组织损伤 | Biozzi小鼠EAE模型(慢性进展性多发性硬化模型)及分离的脊髓CD11b+细胞 | 神经免疫学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 858 | 2026-10-21 |
Single-cell and spatially resolved interactomics of tooth-associated keratinocytes in periodontitis
2024-06-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49037-y
PMID:38876998
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间表型分析,构建了人类牙周组织的细胞图谱,揭示了牙周炎中龈沟和结合上皮角质形成细胞的相互作用组学。 | 整合了单细胞RNA测序、单细胞宏基因组学、荧光原位杂交和高通量多重免疫荧光技术,首次系统解析了牙周炎中角质形成细胞与微生物及免疫细胞的相互作用。 | 需要进一步研究以支持慢性炎症状态下的精准牙周干预。 | 探究牙周炎中牙周生态位细胞类型与微生物的关系,特别是龈沟和结合上皮角质形成细胞的作用。 | 人类牙周组织样本,包括龈沟和结合上皮角质形成细胞。 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,单细胞宏基因组学,荧光原位杂交,多重免疫荧光 | NA | 图像,文本 | 34个样本,105918个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'端测序,10x Visium空间转录组学 |
| 859 | 2026-10-21 |
Single-cell multi-ome and immune profiles of the Inspiration4 crew reveal conserved, cell-type, and sex-specific responses to spaceflight
2024-06-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49211-2
PMID:38862516
|
研究论文 | 该研究通过单细胞多组学、游离RNA、生化和血液学数据分析SpaceX Inspiration4任务宇航员对太空飞行的免疫反应 | 首次对Inspiration4任务全体宇航员进行单细胞多组学分析,识别出太空飞行相关基因表达特征,并在多个独立数据集中验证该特征 | 样本量小(仅4名宇航员),且为短期太空飞行任务,长期效应需进一步研究 | 表征太空飞行对宇航员免疫系统的影响,并探索潜在防护措施 | SpaceX Inspiration4任务的4名宇航员 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞多组学测序、游离RNA测序、空间转录组学、生化检测、血液学分析 | NA | 单细胞多组学数据、游离RNA数据、生化数据、血液学数据、转录组数据 | 4名宇航员,817个小鼠转录组数据集 | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 860 | 2026-10-21 |
DOT: a flexible multi-objective optimization framework for transferring features across single-cell and spatial omics
2024-06-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48868-z
PMID:38862466
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研究论文 | 提出DOT,一种多目标优化框架,用于在单细胞和空间组学数据之间转移细胞特征,整合互补信息 | 利用数据模态共有的基因之外的基因,利用局部空间上下文,转移超越细胞类型信息的空间特征,推断组织位置细胞群体的绝对/相对丰度,结合细胞组成、异质性、技术效应和先验知识整合等实用方面 | 未明确说明 | 桥接单细胞转录组数据与高分辨率和低分辨率空间解析数据,整合互补信息 | 单细胞转录组数据和空间解析数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 多目标优化框架 | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |