单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
8541	2024-09-23	Targeted Suppression of miRNA-33 Using pHLIP Improves Atherosclerosis Regression 2022-06-24, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320296 PMID:35534923	研究论文	研究使用pHLIP递送系统靶向抑制miRNA-33，以改善动脉粥样硬化的消退	首次使用pHLIP递送系统靶向抑制miRNA-33，避免了传统方法的副作用，并有效改善了动脉粥样硬化的消退	研究仅在特定细胞和组织中验证了效果，尚未在大规模临床试验中验证	开发一种新的靶向递送系统，用于治疗与动脉粥样硬化相关的心血管疾病	miRNA-33在动脉粥样硬化斑块中的作用及pHLIP递送系统的有效性	心血管疾病	动脉粥样硬化	pH低插入肽（pHLIP）	NA	单细胞RNA转录组	动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞
8542	2024-09-23	Transcriptional and functional motifs defining renal function revealed by single-nucleus RNA sequencing 2022-06-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2203179119 PMID:35696569	研究论文	本研究通过单核RNA测序技术揭示了果蝇肾脏系统的转录和功能基序	首次通过单核RNA测序技术对果蝇肾脏系统进行全面分析，识别出多种细胞类型及其特异性转录因子，并提供了跨物种的细胞类型匹配	研究仅限于果蝇肾脏系统，未涉及其他物种或疾病模型	揭示果蝇肾脏系统的细胞多样性、谱系和功能	果蝇肾脏系统的Malpighian管和肾细胞	数字病理学	NA	单核RNA测序	NA	RNA	包含11个不同细胞群的成年果蝇肾脏系统样本
8543	2024-09-23	Memory-like NK cells armed with a neoepitope-specific CAR exhibit potent activity against NPM1 mutated acute myeloid leukemia 2022-06-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2122379119 PMID:35696582	研究论文	研究展示了通过使用新表位特异性CAR武装的CIML NK细胞对NPM1突变型急性髓系白血病具有强大的抗肿瘤活性	首次展示了使用新表位特异性CAR武装的CIML NK细胞能够显著增强对NPM1突变型AML的抗肿瘤反应，同时避免脱靶毒性	研究结果基于体外和异种移植模型，需要在临床试验中进一步验证	探索使用新表位特异性CAR武装的CIML NK细胞对NPM1突变型急性髓系白血病的治疗潜力	NPM1突变型急性髓系白血病细胞和患者来源的白血病细胞	免疫学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序和质谱流式细胞术	NA	细胞	体外实验涉及AML细胞系和患者来源的白血病细胞，体内实验涉及异种移植模型
8544	2024-09-23	Single-cell RNA sequencing reveals immunological rewiring at the maternal-fetal interface following asymptomatic/mild SARS-CoV-2 infection 2022-06-14, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110938 PMID:35662411	研究论文	研究了无症状/轻度SARS-CoV-2感染对妊娠期母胎界面免疫重塑的影响	首次揭示了无症状/轻度SARS-CoV-2感染对妊娠期母胎界面免疫反应的影响，包括抗原呈递和I型干扰素信号通路的减弱、组织驻留的蜕膜巨噬细胞的丢失以及细胞因子/趋化因子信号的增强	研究仅限于血液和足月蜕膜样本，未涵盖其他妊娠阶段或组织类型	探讨无症状/轻度SARS-CoV-2感染对妊娠期母胎界面免疫反应的影响	妊娠期无症状/轻度SARS-CoV-2感染的孕妇及其血液和足月蜕膜样本	数字病理学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	血液和足月蜕膜样本
8545	2024-09-23	Association of pyroptosis and severeness of COVID-19 as revealed by integrated single-cell transcriptome data analysis 2022-Jun, Immunoinformatics (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1016/j.immuno.2022.100013 PMID:35434695	研究论文	本文通过整合单细胞转录组数据分析，探讨了细胞焦亡与COVID-19严重程度之间的关联	首次揭示了细胞焦亡在SARS-CoV-2诱导的细胞因子风暴中的关键作用，并开发了一种评估单细胞焦亡状态的评分方法	研究仅基于四个研究的单细胞转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	探讨细胞焦亡与COVID-19严重程度之间的关系，并开发新的评估方法	COVID-19患者的免疫细胞，包括巨噬细胞、中性粒细胞、T细胞和B细胞	NA	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	37,607个免疫细胞，来自四个研究的COVID-19患者
8546	2024-09-23	Myeloid LXR (Liver X Receptor) Deficiency Induces Inflammatory Gene Expression in Foamy Macrophages and Accelerates Atherosclerosis 2022-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.122.317583 PMID:35477277	研究论文	研究探讨了髓系LXR（肝X受体）缺乏对泡沫巨噬细胞炎症基因表达和动脉粥样硬化的影响	首次揭示了髓系LXR在促进Trem2基因表达程序和抑制动脉粥样硬化斑块中泡沫细胞炎症中的关键作用	NA	探讨LXR在动脉粥样硬化斑块中泡沫细胞的抗炎作用	髓系LXR缺乏对泡沫巨噬细胞和动脉粥样硬化的影响	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	高胆固醇血症小鼠的斑块细胞
8547	2024-09-23	Expansion, persistence, and efficacy of donor memory-like NK cells infused for posttransplant relapse 2022-06-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI154334 PMID:35349491	研究论文	研究了供体记忆样NK细胞在移植后复发中的扩展、持久性和疗效	采用细胞因子诱导的记忆样NK细胞（CIML NK细胞）进行治疗，显示出快速扩展和长期持久性	研究样本量较小，需要进一步研究其独特的体内生物学特性和与T细胞及肿瘤目标的相互作用	评估CIML NK细胞在移植后复发中的治疗潜力	移植后复发的骨髓恶性肿瘤患者	NA	血液肿瘤	质谱流式细胞术和单细胞RNA测序	NA	细胞	6名患者
8548	2024-09-23	Molecular Characterization of Membranous Nephropathy 2022-06, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2021060784 PMID:35477557	研究论文	研究利用机器学习框架预测基于基因表达的膜性肾病诊断，并识别膜性肾病特异性基因模块	首次通过机器学习方法识别膜性肾病的特异性基因表达特征，并发现这些基因在肾小球功能网络中的功能富集	研究仅基于NEPTUNE和ERCB两个队列的数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	揭示膜性肾病的分子特征，为疾病分类和靶向治疗提供依据	膜性肾病与其他肾小球疾病的基因表达差异	机器学习	肾病	单细胞测序	机器学习框架	基因表达数据	NEPTUNE和ERCB两个队列的参与者，以及参考肾切除组织的单细胞测序数据
8549	2024-09-23	Regulation of developmental hierarchy in Drosophila neural stem cell tumors by COMPASS and Polycomb complexes 2022-05-13, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abi4529 PMID:35544555	研究论文	研究了COMPASS和Polycomb复合物在果蝇神经干细胞肿瘤中对发育层次的调控作用	揭示了COMPASS和Polycomb复合物在肿瘤发育层次中的协同作用，以及它们对癌症干细胞（CSC）可塑性和异质性的影响	NA	探讨COMPASS和Polycomb复合物在肿瘤细胞层次结构、组成和生长中的作用	果蝇神经干细胞肿瘤中的COMPASS和Polycomb复合物	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
8550	2024-09-23	MYC drives aggressive prostate cancer by disrupting transcriptional pause release at androgen receptor targets 2022-05-13, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-30257-z PMID:35562350	研究论文	研究探讨了MYC在前列腺癌中的作用及其对雄激素受体转录程序的影响	首次揭示了MYC过表达通过干扰转录暂停释放来对抗雄激素受体转录程序，从而促进前列腺癌的发展	NA	探讨MYC在前列腺癌中的作用及其对雄激素受体转录程序的影响	前列腺癌细胞及临床样本	数字病理学	前列腺癌	单细胞转录组学和ChIP-seq	NA	转录组数据	临床样本和前列腺癌细胞
8551	2024-09-23	Acquisition of NOTCH dependence is a hallmark of human intestinal stem cell maturation 2022-05-10, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2022.03.007 PMID:35395175	研究论文	研究了NOTCH信号在人类肠道干细胞成熟过程中的作用	首次通过单细胞转录组学观察到OLFM4基因在人类发育过程中表达的变化，并验证了NOTCH信号依赖性随发育增加的假设	仅限于体外实验，未涉及体内验证	探讨NOTCH信号在人类肠道干细胞成熟过程中的作用	人类肠道干细胞及其在不同发育阶段的依赖性	NA	NA	单细胞转录组学、RNA测序	NA	转录组数据	不同发育阶段的肠道组织样本
8552	2024-09-23	Single-cell analysis of human testis aging and correlation with elevated body mass index 2022-05-09, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.004 PMID:35504286	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年男性睾丸细胞的基因表达变化，并探讨了这些变化与身体质量指数的关系	首次在单细胞水平上系统分析了人类睾丸衰老的分子和基因组变化，并发现这些变化与身体质量指数相关	研究样本仅包括年轻和老年男性，未涵盖其他年龄段；研究结果可能受样本量限制	探讨人类睾丸衰老的分子机制及其与身体质量指数的关系	年轻和老年男性的睾丸细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	44,000个细胞，来自年轻和老年男性
8553	2024-09-23	An activation to memory differentiation trajectory of tumor-infiltrating lymphocytes informs metastatic melanoma outcomes 2022-05-09, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2022.04.005 PMID:35537413	研究论文	本文应用先进的基因组学技术研究了肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）在黑色素瘤转移中的作用	首次通过单细胞测序分析了TILs的激活到记忆分化轨迹，揭示了记忆/驻留记忆TILs在抗PD-1治疗中的重要作用	研究仅限于黑色素瘤，且样本量相对较小，可能影响结果的普适性	探讨肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤转移中的作用及其对治疗反应的影响	肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）及其在黑色素瘤中的分化轨迹	基因组学	黑色素瘤	单细胞测序	NA	基因组数据	9000个人类肿瘤样本和多个单细胞测序数据集
8554	2024-09-23	Stem-cell-derived trophoblast organoids model human placental development and susceptibility to emerging pathogens 2022-05-05, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2022.04.004 PMID:35523141	研究论文	本文报道了从人类多能干细胞（hPSCs）中分离的滋养层干细胞可以高效自组织成3D的干细胞衍生滋养层类器官（SC-TOs），模拟人类胎盘发育及其对新兴病原体的易感性	首次展示了从hPSCs中分离的滋养层干细胞可以形成具有绒毛结构的3D类器官，并揭示了其对SARS-CoV-2和Zika病毒的易感性	需要进一步研究以验证SC-TOs在模拟胎盘发育和病原体易感性方面的准确性和全面性	开发一种可访问的3D模型系统，用于研究人类胎盘发育及其对新兴病原体的易感性	从hPSCs中分离的滋养层干细胞及其形成的3D类器官	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	多个滋养层干细胞及其形成的类器官
8555	2024-09-23	Monocytes transition to macrophages within the inflamed vasculature via monocyte CCR2 and endothelial TNFR2 2022-05-02, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20210562 PMID:35404389	研究论文	研究揭示了单核细胞在炎症血管中转变为巨噬细胞的分子信号机制	首次阐明了CCR2和TNFR2在单核细胞向巨噬细胞转变过程中的关键作用，并提出了CCR2介导的自分泌正反馈循环可能加剧肾炎症	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序，缺乏体内实验验证	探讨单核细胞在炎症环境下转变为巨噬细胞的分子机制及其在疾病中的作用	单核细胞、巨噬细胞、炎症血管、肾小球肾炎患者	NA	肾小球肾炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	体外实验中使用了单核细胞与TNF-TNFR2激活的内皮细胞共培养，单细胞RNA测序分析了共培养细胞
8556	2024-09-23	Trans-Seq maps a selective mammalian retinotectal synapse instructed by Nephronectin 2022-05, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-022-01068-8 PMID:35524141	研究论文	本研究开发了一种名为Trans-Seq的综合方法，用于绘制从小鼠视网膜神经节细胞（RGC）到上丘（SC）的电路连接图	首次使用Trans-Seq方法结合荧光顺行跨突触示踪剂和单细胞RNA测序，绘制了RGC到SC的电路连接图，并验证了αRGC与Nephronectin阳性广域神经元（NPWFs）之间的连接	NA	理解哺乳动物视觉系统的电路连接	小鼠视网膜神经节细胞（RGC）和上丘（SC）神经元	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
8557	2024-09-23	Oncogenic Vav1-Myo1f induces therapeutically targetable macrophage-rich tumor microenvironment in peripheral T cell lymphoma 2022-04-19, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110695 PMID:35443168	研究论文	研究了Vav1-Myo1f融合基因在周围T细胞淋巴瘤中的致癌作用及其对肿瘤微环境的影响	首次揭示了Vav1-Myo1f融合基因在周围T细胞淋巴瘤中的致癌机制，并发现肿瘤相关巨噬细胞是潜在的治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证	探讨Vav1-Myo1f融合基因在周围T细胞淋巴瘤中的作用及其对肿瘤微环境的影响	周围T细胞淋巴瘤中的Vav1-Myo1f融合基因及其诱导的肿瘤微环境	数字病理学	淋巴瘤	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	小鼠Vav1-Myo1f淋巴瘤模型
8558	2024-09-23	Combined noncanonical NF-κB agonism and targeted BET bromodomain inhibition reverse HIV latency ex vivo 2022-04-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI157281 PMID:35426377	研究论文	研究了通过非经典NF-κB激动剂和靶向BET溴结构域抑制剂联合使用逆转HIV潜伏期的方法	首次展示了IAP拮抗剂与BET抑制剂联合使用在体外逆转HIV潜伏期的协同效应	IAPi+BETi治疗未能显著提高病毒输出频率	探索逆转HIV潜伏期的组合策略	HIV潜伏期逆转及BET蛋白在其中的作用	NA	HIV感染	CRISPR-CAS9, 单细胞RNA测序	NA	RNA	来自抗逆转录病毒治疗抑制的供体的CD4+ T细胞
8559	2024-09-23	Classification of human chronic inflammatory skin disease based on single-cell immune profiling 2022-04-15, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abl9165 PMID:35427179	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术对31名患者的皮肤样本进行免疫细胞转录组分析，以分类慢性炎症性皮肤病	首次通过单细胞RNA测序揭示了人类皮疹中T细胞和Trm成分的活跃增殖扩张以及T细胞的普遍耗竭，并开发了一个名为RashX的网络界面，供科学家和临床医生使用	样本量相对较小，且未涵盖所有类型的慢性炎症性皮肤病	通过单细胞免疫分析技术，对慢性炎症性皮肤病进行分子水平上的分类	31名患者的皮肤样本中的CD45免疫细胞	数字病理学	皮肤病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	31名患者（包括7名特应性皮炎、8名寻常型银屑病、2名扁平苔藓、1名大疱性类天疱疮、6名临床/组织病理学不确定的皮疹患者和7名健康对照）
8560	2024-09-23	lincRNA-Cox2 Functions to Regulate Inflammation in Alveolar Macrophages during Acute Lung Injury 2022-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2100743 PMID:35365562	研究论文	研究了lincRNA-Cox2在急性肺损伤期间对肺泡巨噬细胞炎症反应的调控作用	首次揭示了lincRNA-Cox2在急性肺损伤期间对肺泡巨噬细胞炎症反应的调控机制	NA	探讨lincRNA-Cox2在急性肺损伤中的作用及其对炎症反应的调控机制	lincRNA-Cox2在急性肺损伤期间对肺泡巨噬细胞的调控作用	NA	急性肺损伤	bulk RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA	NA