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当前共找到 44757 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-10-21 |
SpatialCell AI achieves reference-free single-cell resolution from spot-based spatial transcriptomics through morphology-guided enhancement
2026-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55246-w
PMID:42304094
|
研究论文 | 提出SpatialCell AI框架，通过形态学引导增强从spot级空间转录组数据中实现无需参考的单细胞分辨率表达重建 | 首个同时具备免训练运行、免参考表达整合和单细胞级输出粒度的空间转录组框架，无需外部scRNA-seq参考或配对的亚细胞空间数据 | 摘要中未明确提及研究局限性，初步验证主要基于结直肠癌单一匹配样本 | 解决spot级空间转录组数据中多细胞混合测量的问题，实现无需参考的单细胞分辨率表达谱重建 | 匹配的结直肠癌样本，涵盖Visium（55 μm）、Visium HD（8 μm和16 μm）及Xenium（单细胞真值）数据 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组测序 | 形态学引导的免训练计算框架 | 空间转录组表达数据与组织形态学图像 | 1个匹配的结直肠癌样本，包含Visium、Visium HD（8 μm和16 μm）及Xenium多种平台数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Visium HD, 10x Xenium | 10x Visium（55 μm spot）、10x Visium HD（8 μm和16 μm bin）、10x Xenium（单细胞分辨率真值），验证面板为408基因 |
| 822 | 2026-10-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and intercellular communication of endothelial cells and Schwann cells during keloid formation
2026-06, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.107973
PMID:41864161
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析瘢痕疙瘩与正常瘢痕组织的转录组，揭示内皮细胞和施万细胞的异质性及细胞间通信 | 发现瘢痕疙瘩内皮细胞中存在与皮肤恶性肿瘤内皮细胞转录特征相似的亚群，并鉴定PLPP3为该亚群血管管腔形成的关键调控因子 | 样本量仅为6例（3例瘢痕疙瘩和3例正常瘢痕），研究基于公共数据集GSE163973，缺乏实验验证 | 探究瘢痕疙瘩形成过程中内皮细胞和施万细胞的异质性及细胞间通信 | 瘢痕疙瘩组织和正常瘢痕组织 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 6例样本（3例瘢痕疙瘩和3例正常瘢痕组织） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 823 | 2026-10-21 |
Multi-omics and AI-guided discovery and validation of sisomicin as a COPA-targeting agent for pathological scar inhibition
2026-06, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.108015
PMID:41980581
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和人工智能驱动的机器学习与深度学习，识别病理性瘢痕的分子驱动因素，并通过细胞和动物模型验证了西索米星作为靶向COPA的抗瘢痕药物 | 首次通过多组学和AI方法发现COPA是病理性瘢痕的关键调控因子，并鉴定氨基糖苷类抗生素西索米星作为靶向COPA的潜在抗纤维化药物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 发现和验证病理性瘢痕的分子驱动因素及潜在治疗药物 | 病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩）、人增生性瘢痕来源成纤维细胞（HHFs）、TGF-β1刺激的正常成纤维细胞（NFs）、博来霉素和牵张诱导的小鼠模型 | 多组学与人工智能药物发现 | 病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩） | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、hdWGCNA、机器学习、深度学习、分子对接 | 机器学习、深度学习（具体模型未在摘要中说明） | 基因表达数据（单细胞和批量转录组）、图像（组织学） | 摘要未提供具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 824 | 2026-10-21 |
STORM: spatial transcriptomics optimization by resolution via matrix factorization
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag324
PMID:42328842
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研究论文 | 提出STORM机器学习框架，通过矩阵分解与多模态生物先验正则化优化稀疏空间转录组数据的重建 | 将空间转录组恢复建模为低秩张量分解问题，并整合空间连续性、全切片组织学图像形态学与蛋白互作网络基因互作结构等多模态先验进行正则化 | 仅在不同肺组织样本上验证，未涉及其他组织类型；依赖全切片图像和蛋白互作网络等辅助数据 | 在严重稀疏条件下提升空间转录组数据的保真度并准确重建未观测位置的空间基因表达模式 | 肺组织样本，包括健康与恶性肿瘤样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 低秩张量分解 | 空间基因表达数据, 全切片组织学图像, 蛋白互作网络 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 825 | 2026-10-21 |
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2026-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70020
PMID:41429590
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研究论文 | 该研究通过血浆蛋白质组学分析，鉴定出TAOK3作为活动性类风湿关节炎骨破坏的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次通过数据独立采集质谱技术对活动性RA患者血浆进行蛋白质组学分析，结合Sharp评分和滑膜单细胞RNA测序数据筛选出TAOK3作为骨破坏相关生物标志物，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 样本量有限，需要更大规模的多中心验证；TAOK3作为生物标志物的临床应用价值仍需前瞻性研究证实 | 通过蛋白质组学分析鉴定与活动性类风湿关节炎骨破坏相关的新型生物标志物，为精准监测和靶向治疗提供新策略 | 160例类风湿关节炎患者和40例健康对照者的血浆样本，以及两个独立验证队列（N1=50和N2=10） | 蛋白质组学 | 类风湿关节炎 | 数据独立采集质谱、酶联免疫吸附试验、多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、图像、文本 | 200例血浆样本（160例RA患者和40例健康对照）用于发现阶段，两个验证队列分别50例和10例，以及体外FLS细胞实验和CIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 826 | 2026-10-21 |
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002665
PMID:41457044
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研究论文 | 本研究揭示了脑脊液接触核在脓毒症中通过调节炎症细胞因子发挥保护作用，并可作为神经-免疫互作的新治疗靶点 | 首次证明脑脊液接触核在脓毒症中发挥保护作用，并利用化学遗传学激活和单细胞RNA测序揭示其调控全身炎症的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；脑脊液接触核调控免疫的具体分子通路仍需进一步阐明 | 探究脑脊液接触核在中枢神经系统调控脓毒症免疫反应中的作用及机制 | 脓毒症小鼠模型及脑脊液接触核 | 神经免疫学 | 脓毒症 | 免疫荧光染色、化学遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2026-10-21 |
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194288
PMID:41701649
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研究论文 | 该研究在系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）患者血液中鉴定出一群CD57+细胞毒性CD8+效应记忆T细胞，并证实其与肺纤维化病变相关 | 首次鉴定出CD57+CD8+ Tem细胞亚群在SSc-ILD患者中优先扩增且具有克隆扩增特征，并区别于Temra细胞；发现CD155通过共刺激受体CD226增强其细胞毒性功能，且内皮细胞可能是CD155的来源 | 未明确说明（摘要中未提及） | 探究SSc中驱动肺损伤的免疫病理机制，特别是T细胞在SSc-ILD中的作用 | 系统性硬化症（SSc）患者，包括合并间质性肺病（SSc-ILD）和不合并ILD的患者，以及健康对照个体；另包括独立SSc-ILD患者的肺组织样本和公共ILD队列的肺scRNA-seq数据 | 免疫学、数字病理学 | 系统性硬化症相关间质性肺病、肺纤维化 | 流式细胞术、转录组分析、免疫组化/免疫荧光染色、单细胞RNA-seq（scRNA-seq） | NA | 文本（转录组数据）、图像（肺组织免疫染色）、单细胞转录组数据 | SSc-ILD患者、SSc无ILD患者及对照个体的血液样本；独立SSc-ILD患者的肺组织样本（活检或外植体）；多个公共ILD队列的肺scRNA-seq数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq、bulk转录组分析 | NA | NA |
| 828 | 2026-10-21 |
Single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the potential therapeutic targets for testicular sex cord-stromal cell tumor
2026-Apr-29, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00924-0
PMID:42057139
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序和空间转录组学，揭示睾丸性索间质细胞肿瘤的分子机制、肿瘤微环境和潜在治疗靶点 | 首次联合单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序和空间转录组学解析睾丸性索间质细胞肿瘤；发现免疫冷肿瘤环境、上皮-间质转化程序、空间瘤内异质性及高衰老特征；鉴定AR高表达及APP-CD74配体-受体对介导的M2巨噬细胞极化作为潜在治疗靶点 | 睾丸性索间质细胞肿瘤为罕见肿瘤，样本量有限 | 解析睾丸性索间质细胞肿瘤的分子机制、肿瘤微环境及潜在治疗靶点 | 睾丸性索间质细胞肿瘤（TSCST）的不同肿瘤区域组织 | 数字病理 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 来自不同TSCST肿瘤区域的组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 829 | 2026-10-21 |
Comparative single cell analysis of wound and cancer identifies the metabolic dialogues between tumor initiating stem cells and macrophages
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716187
PMID:41993506
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研究论文 | 通过比较单细胞RNA测序分析皮肤伤口愈合和皮肤鳞状细胞癌进展过程中巨噬细胞的动态细胞状态，揭示肿瘤起始干细胞与巨噬细胞之间的代谢对话 | 发现异常调控的脂质代谢是肿瘤相关巨噬细胞的独特特征，并鉴定SOX2肿瘤起始干细胞是调节肿瘤相关巨噬细胞脂质代谢和细胞状态的关键协调者 | 摘要中未明确说明样本量、具体实验验证范围及临床转化可行性 | 比较伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的分子和功能差异，揭示肿瘤起始干细胞与巨噬细胞之间的代谢互作机制 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的肿瘤相关巨噬细胞及SOX2肿瘤起始干细胞 | 单细胞转录组学、肿瘤免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2026-10-21 |
Dissecting antibody-mediated natural killer cell effects reveals a cytotoxic CX3CR1+KLRC2-CD16hi subset linked to hepatitis B virus outcomes
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.0842
PMID:41414761
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研究论文 | 该研究利用HBV核心抗原特异性TCR样抗体评估慢性HBV感染中抗体介导的NK细胞反应，并通过单细胞RNA测序鉴定出一个与治疗应答和HBsAg清除相关的细胞毒性CX3CR1+KLRC2-CD16hi NK亚群 | 首次系统评估抗体介导的NK细胞效应在HBV感染不同疾病阶段和抗病毒治疗中的动态变化，并发现一个此前未被认识的功能性CX3CR1+KLRC2-CD16hi NK亚群 | 摘要未明确说明样本量、队列规模和随访时间等细节，且主要为观察性关联分析，功能机制验证有限 | 评估抗体介导的NK细胞反应在慢性HBV感染不同疾病阶段及抗病毒治疗过程中的动态变化，并解析不同NK亚群的异质性 | 慢性HBV感染患者（横断面和纵向队列） | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 831 | 2026-10-21 |
Pre-operative risk assessment of hepatocellular carcinoma recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.1069
PMID:41668289
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研究论文 | 本研究通过液体活检对肝细胞癌肝移植受者进行术前复发风险评估，基于cfDNA的拷贝数变异特征开发了ZJU Criteria预测模型 | 开发了基于cfDNA衍生的CNA特征和肿瘤标志物的ZJU Criteria术前风险预测工具，整合了传统临床因素与液体活检多组学数据，并通过单细胞转录组数据追溯复发相关cfDNA至原发肿瘤中的特定恶性细胞亚群 | 研究未明确说明样本量的局限性，且需要进一步在前瞻性队列中验证ZJU Criteria的普适性 | 开发基于液体活检的术前风险分层模型，预测肝细胞癌患者肝移植术后复发风险 | 260例来自三个中心的肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 低深度全基因组测序、全外显子组测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 血浆cfDNA测序数据、临床数据、组织测序数据、图像 | 260例肝细胞癌患者，包括临床数据、血浆cfDNA、匹配的肿瘤和非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 全外显子组测序, 低深度全基因组测序 | NA | NA |
| 832 | 2026-10-21 |
Identification and validation of Kif15 as a potential diagnostic and prognostic biomarker in colon cancer
2026-Mar-23, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-026-04755-z
PMID:41872824
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析、单细胞分析和免疫组化验证，识别并验证KIF15作为结肠癌潜在的诊断和预后生物标志物 | 首次系统性地将KIF15作为结肠癌核心基因进行多维度验证，结合单细胞RNA测序数据揭示其在增殖性T细胞中的高表达及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏大规模前瞻性临床队列验证；免疫组化样本量有限；KIF15调控结肠癌进展的具体分子机制尚未通过功能实验（如敲减/过表达）直接证实 | 系统识别和验证KIF15作为结肠癌潜在诊断和预后生物标志物，并探索其在肿瘤免疫微环境和免疫治疗中的潜在价值 | 结肠癌患者基因表达数据和组织样本 | 数字病理学 | 结肠癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化 | Cox回归, 列线图模型, ROC分析, PPI网络分析 | 基因表达数据, 图像, 文本 | 3个GEO数据集（GSE24550、GSE21815、GSE44076）和TCGA队列，以及免疫组化组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 833 | 2026-10-21 |
The complement system contributes to the immunosuppressive microenvironment of uveal melanoma
2026-03-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07910-y
PMID:41803879
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研究论文 | 本研究探讨补体系统在原发性与转移性葡萄膜黑色素瘤免疫抑制微环境及进展中的作用 | 首次系统研究补体系统在原发性与转移性葡萄膜黑色素瘤中的作用，提出C1S和C3作为潜在治疗靶点，并预测成纤维细胞通过RPS19–C5AR1、C3–ITGAM和C3–C3AR相互作用驱动免疫抑制微环境形成 | 主要基于公共数据与预测性分析，部分结论需进一步实验验证，样本来源与数量有限 | 探究补体系统在葡萄膜黑色素瘤原发与转移过程中的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 原发性葡萄膜黑色素瘤、转移性葡萄膜黑色素瘤、正常眼组织及正常肝组织 | 数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、蛋白质组学、免疫组化、RNA表达分析 | NA | 文本、图像、蛋白质组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 蛋白质组学, 免疫组化 | NA | NA |
| 834 | 2026-10-21 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-Feb-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 该文揭示人类γδ T细胞受体的γ恒定区可独立于可变区抗原识别调控激活强度，并影响胸腺编程与外周功能 | 首次证明TCRγ恒定区（Cγ1与Cγ2）可作为独立于可变区的“调节旋钮”调控γδ T细胞激活强度、胸腺分化编程及外周表型 | 摘要未提及具体样本量及实验验证细节，机制结论主要基于单细胞转录组数据的关联分析 | 探究γδ TCR恒定区对T细胞激活强度及功能分化的调控作用 | 人类γδ T细胞及其TCR（Cγ1与Cγ2使用情况） | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 835 | 2026-10-21 |
Tumor-initiating stem cells fine-tune the plasticity of neutrophils to sculpt a protective niche
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.11.001
PMID:41349542
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研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序、空间转录组学和遗传操作，揭示了肿瘤起始干细胞通过Fads1-AA-PGE通路调节中性粒细胞可塑性，从而在免疫治疗中形成保护性微环境并导致癌症复发 | 首次发现位于肿瘤-基质界面的SOX2+肿瘤起始干细胞通过上调Fads1产生花生四烯酸，增强中性粒细胞中的PGE信号，破坏干扰素反应并抑制中性粒细胞的抗肿瘤功能，从而精细调控中性粒细胞异质性并塑造保护性微环境 | 未在摘要中明确说明 | 探究肿瘤相关中性粒细胞不同细胞状态的出现、演化、分布及其对癌症免疫治疗疗效的影响机制 | 鳞状细胞癌中的肿瘤相关中性粒细胞和SOX2+肿瘤起始干细胞 | 肿瘤免疫学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、遗传操作 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 836 | 2026-10-21 |
Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data to Investigate Tumor Cell Heterogeneity in Uroepithelial Bladder Cancer and Predict Immunotherapy Response
2026, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序数据分析尿路上皮膀胱癌的肿瘤细胞异质性，并基于干性基因预测免疫治疗反应 | 识别了与血管生成和肿瘤转移相关的缺氧相关肿瘤亚群，构建了基于缺氧肿瘤亚群的预后模型，并发现干性基因评分与细胞免疫、免疫治疗反应及药物敏感性相关，采用多种机器学习模型基于干性基因预测ICI反应（AUC>0.7） | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究尿路上皮膀胱癌中癌症干性与肿瘤微环境的相互作用，并预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 尿路上皮膀胱癌（UBC） | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 837 | 2026-10-21 |
LRP1 as a potential diagnostic and immunomodulatory target in endometriosis: evidence from multi-omics and single-cell analyses
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1735221
PMID:42064072
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析，构建了区分异位子宫内膜与在位子宫内膜的诊断模型，并揭示了LRP1在子宫内膜异位症中通过免疫调节和细胞间通讯发挥关键作用 | 首次将多组学整合分析、机器学习、孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合，系统阐明LRP1作为子宫内膜异位症诊断和免疫调节靶点的作用，并揭示其通过MIF信号通路（特别是CD74/CXCR4互作）调控细胞通讯的机制 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 构建区分异位子宫内膜与在位子宫内膜的诊断模型，并阐明LRP1在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜和在位子宫内膜样本 | 多组学分析 | 子宫内膜异位症 | 转录组测序、单细胞RNA测序、WGCNA、机器学习、孟德尔随机化 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 3个GEO数据集（GSE7305、GSE11691、GSE25628） | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2026-10-21 |
Integrative Analysis Reveals BPTF, COL1A1, and COL4A2 as Fibroblast-Related Biomarkers Associated with Immune Infiltration in Ovarian Cancer
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，鉴定出与卵巢癌成纤维细胞相关的关键生物标志物BPTF、COL1A1和COL4A2，并分析其与免疫浸润的关系 | 首次结合hdWGCNA和LASSO方法系统筛选卵巢癌中成纤维细胞相关的关键基因，并揭示T细胞与成纤维细胞间主要通过CD99-CD99和HLAC-KIR2DL3介导细胞通讯 | 关键基因的预后价值及其与免疫治疗反应的关联仍需在独立生存队列和治疗反应数据集中进一步验证 | 鉴定与卵巢癌进展相关的成纤维细胞相关基因，探索其作为生物标志物的潜力及与免疫浸润的关系 | 卵巢癌样本的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据 | 数字病理学、肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序 | LASSO、hdWGCNA、CellChat、CIBERSORT | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 839 | 2026-10-21 |
Integrative multi-omics analysis identifies CCDC69 as a marker associated with germinal center B-cell infiltration in TNBC: development and validation
2026, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2026e15616
PMID:42879643
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研究论文 | 该研究通过整合批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示CCDC69在三阴性乳腺癌中与生发中心B细胞浸润和良好预后相关 | 首次系统阐明CCDC69在TNBC中与B细胞介导的免疫应答及生发中心免疫微环境的关联，并验证其作为免疫激活和预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性临床队列验证和功能实验验证 | 探究CCDC69在三阴性乳腺癌中的表达特征及其与免疫调节和生发中心B细胞浸润的关系 | 三阴性乳腺癌患者及乳腺癌组织样本 | 数字病理学, 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 逻辑回归, ssGSEA, ROC分析 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA TNBC队列和GSE58812独立外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 840 | 2026-10-21 |
Single-Cell and Spatial Multi-Omics in Small-Intestinal Homeostasis and Ischemia/Reperfusion Injury: Current Advances, Applications, and Future Perspectives
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S640336
PMID:42894656
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综述 | 该文综述了单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学和空间多组学技术在小肠稳态及缺血/再灌注损伤研究中的进展、应用与未来展望 | 系统比较了肠道参考图谱与直接II/R研究，并分析了单细胞与空间组学方法如何补充bulk测序和组织学，同时强调了解离偏差、批次效应和空间分辨率等限制对结果解释的影响 | 解离偏差、批次效应、有限的生物学重复、空间分辨率限制以及跨模态整合的不确定性制约了解释；大多数疾病特异性证据仍为临床前研究，推断的细胞相互作用不等同于已证实的治疗机制 | 总结单细胞和空间多组学技术在小肠稳态和缺血/再灌注损伤中的应用现状，并探讨其未来转化方向 | 小肠组织、肠道上皮细胞、免疫细胞、微生物群以及II/R实验模型 | 空间组学、单细胞组学 | 肠道缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学、空间多组学 | NA | 文本综述（综合单细胞和空间组学数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学、空间多组学 | NA | NA |