单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 8341 - 8360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8341 | 2024-09-19 |
Preclinical development of a novel CCR8/CTLA-4 bispecific antibody for cancer treatment by disrupting CTLA-4 signaling on CD8 T cells and specifically depleting tumor-resident Tregs
2024-Aug-09, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03794-3
PMID:39123089
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研究论文 | 开发了一种新型CCR8/CTLA-4双特异性抗体，用于癌症治疗，通过破坏CD8 T细胞上的CTLA-4信号并特异性清除肿瘤内Tregs | 提出了一种新型双特异性抗体，能够同时靶向CCR8和CTLA-4，增强T细胞激活并特异性清除肿瘤内Tregs | NA | 开发新一代CTLA-4治疗药物，平衡调节性T细胞（Tregs）的清除和CD8 T细胞的激活 | CCR8和CTLA-4双特异性抗体及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了hCCR8或hCTLA-4人源化小鼠模型和hCCR8/hCTLA-4双敲入小鼠模型，以及食蟹猴模型 |
| 8342 | 2024-09-19 |
Deciphering the interplay of HPV infection, MHC-II expression, and CXCL13+ CD4+ T cell activation in oropharyngeal cancer: implications for immunotherapy
2024-Aug-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03789-0
PMID:39105803
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研究论文 | 研究HPV感染、MHC-II表达和CXCL13+ CD4+ T细胞激活在口咽癌中的相互作用及其对免疫治疗的启示 | 揭示了HPV阳性口咽鳞状细胞癌（OPSCC）肿瘤细胞与肿瘤微环境（TME）之间的独特相互作用，特别是HPV+ OPSCC肿瘤细胞通过增强干扰素反应和MHC-II表达来增强肿瘤识别和免疫反应，并发现CXCL13+CD4+ T细胞在HPV+ OPSCC中的重要作用 | 研究仅基于6个样本（3个HPV+ OPSCC肿瘤、3个HPV- OPSCC肿瘤和1个正常扁桃体组织），样本量较小可能影响结果的普适性 | 探讨HPV感染、MHC-II表达和CXCL13+ CD4+ T细胞激活在口咽癌中的相互作用，为口咽癌的免疫治疗提供新的策略 | HPV阳性（HPV+）和HPV阴性（HPV-）口咽鳞状细胞癌（OPSCC）肿瘤细胞及其与肿瘤微环境（TME）的相互作用 | 数字病理学 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本（3个HPV+ OPSCC肿瘤、3个HPV- OPSCC肿瘤和1个正常扁桃体组织） |
| 8343 | 2024-09-19 |
Highlighting immune features of the tumor ecosystem and prognostic value of Tfh and Th17 cell infiltration in head and neck squamous cell carcinoma by single-cell RNA-seq
2024-Aug-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03767-6
PMID:39093451
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并评估了Tfh和Th17细胞浸润的预后价值 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并发现了Tfh和Th17细胞浸润与患者预后的显著相关性 | 研究样本量有限，且仅限于头颈部鳞状细胞癌，可能限制了结果的普适性 | 深入了解头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并评估特定免疫细胞浸润的预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26,496个细胞样本和502名头颈部鳞状细胞癌患者 |
| 8344 | 2024-09-19 |
Expression of L1 Cell Adhesion Molecule, a Nephronal Principal Cell Marker, in Nephrogenic Adenoma
2024-Aug, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100540
PMID:38901674
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研究论文 | 本文研究了L1细胞粘附分子在肾源性腺瘤中的表达，并探讨了其在诊断中的潜在价值 | 利用单细胞RNA测序技术提名L1细胞粘附分子作为肾源性腺瘤的潜在生物标志物，并通过免疫组化验证其在所有35例患者样本中的阳性表达 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的病理类型 | 探讨L1细胞粘附分子在肾源性腺瘤诊断中的应用 | 肾源性腺瘤及其相关病理类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 35例肾源性腺瘤患者样本 |
| 8345 | 2024-09-19 |
A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine
2024-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07793-3
PMID:39112711
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研究论文 | 本文利用空间转录组学、空间蛋白质组学和单分子荧光原位杂交技术，构建了成人近端小肠的综合空间表达图谱 | 首次揭示了成人小肠中存在的空间异质性，并描述了上皮细胞、间充质细胞和免疫细胞类型的区域表达和细胞类型分布 | NA | 探究成人小肠中的空间基因表达异质性 | 成人近端小肠的基因表达和蛋白质表达 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单分子荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 成人近端小肠样本 |
| 8346 | 2024-09-19 |
LncRNAs in the Dlk1-Dio3 Domain Are Essential for Mid-Embryonic Heart Development
2024-Jul-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25158184
PMID:39125754
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研究论文 | 研究了Dlk1-Dio3域中的长非编码RNA（lncRNA）在胚胎中期心脏发育中的关键作用 | 构建了转录终止模型，并通过插入终止序列阐明了Dlk1-Dio3域中lncRNA表达缺失导致母系插入突变体（MKI）和纯合突变体（HOMO）小鼠从E13.5开始死亡 | 未详细描述研究中使用的具体lncRNA种类及其在心脏发育中的具体机制 | 探讨Dlk1-Dio3域中的lncRNA在胚胎中期心脏发育中的作用 | Dlk1-Dio3域中的lncRNA及其在心脏发育中的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）、原位杂交（IHC） | NA | RNA | 母系插入突变体（MKI）、纯合突变体（HOMO）和亲本插入突变体（PKI）小鼠 |
| 8347 | 2024-09-19 |
Single-cell transcriptome analysis profiling lymphatic invasion-related TME in colorectal cancer
2024-04-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59656-6
PMID:38632387
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了结直肠癌中淋巴管侵袭相关的肿瘤微环境特征 | 首次建立了基于14个淋巴管侵袭相关特征的LIRS模型，并验证了其在预测预后方面的准确性 | 研究数据主要来自TCGA和GEO数据库，可能存在样本偏倚 | 探讨结直肠癌中淋巴管侵袭的细胞和分子机制，寻找新的治疗靶点和诊断标志物 | 结直肠癌患者的淋巴管侵袭相关肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | LIRS模型 | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的结肠腺癌患者数据和来自GEO数据库的三组结直肠癌患者单细胞RNA测序数据 |
| 8348 | 2024-09-19 |
The Web-Based Portal SpatialTME Integrates Histological Images with Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Explore the Tumor Microenvironment
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2650
PMID:38315776
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SpatialTME的网络平台，该平台整合了组织学图像与单细胞和空间转录组学数据，以探索肿瘤微环境 | 开发了一个综合的交互式分析资源，专门用于表征空间肿瘤微环境，并提供了一个用户友好的数据库SpatialTME | NA | 探索肿瘤微环境中的细胞间相互作用及其对肿瘤发展和治疗反应的影响 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 296个空间转录组学切片，涵盖19种癌症类型 |
| 8349 | 2024-09-19 |
Tumor Cell-Intrinsic p38 MAPK Signaling Promotes IL1α-Mediated Stromal Inflammation and Therapeutic Resistance in Pancreatic Cancer
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1200
PMID:38285896
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研究论文 | 研究探讨了p38 MAPK信号通路在胰腺癌中通过IL1α介导的基质炎症和治疗抗性中的作用 | 首次揭示了肿瘤细胞内在的p38-p65/Sp1-IL1α信号机制，该机制维持基质炎症和CAF激活 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床验证 | 揭示胰腺癌中p38 MAPK信号通路对IL1α表达的调控机制及其在治疗抗性中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的p38 MAPK信号通路和IL1α表达 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 转录组分析、染色质免疫共沉淀、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高度纤维化的PDAC小鼠模型PKT进行单细胞RNA测序 |
| 8350 | 2024-09-19 |
Th17 Cells Secrete TWEAK to Trigger Epithelial-Mesenchymal Transition and Promote Colorectal Cancer Liver Metastasis
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2123
PMID:38335276
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研究论文 | 研究揭示了Th17细胞通过分泌TWEAK促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次揭示了Th17细胞通过分泌TWEAK促进肿瘤细胞的上皮-间质转化（EMT），从而促进结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型和部分患者样本，需要进一步在更大规模的人类样本中验证 | 探讨免疫细胞与肿瘤细胞上皮-间质转化在结直肠癌肝转移中的相互作用 | Th17细胞、TWEAK、Fn14受体、肿瘤细胞 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、CRISPR基因编辑、脂质纳米颗粒封装siRNA | NA | RNA | 130个样本，来自18名同时患有结直肠癌肝转移的患者 |
| 8351 | 2024-09-19 |
Big data analytics for MerTK genomics reveals its double-edged sword functions in human diseases
2024-04, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103061
PMID:38341954
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研究论文 | 本文利用大数据分析技术研究了MerTK基因在人类细胞、组织和疾病中的双重作用 | 首次通过大数据分析揭示了MerTK基因在多种人类疾病中的双重作用，并探讨了其在性别差异中的影响 | 研究主要基于现有数据，缺乏对MerTK基因在不同疾病中具体机制的深入实验验证 | 探索MerTK基因在人类细胞、组织和疾病中的生物学功能及其潜在的治疗应用 | MerTK基因在人类细胞、组织和疾病中的表达及其在不同疾病中的作用 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42,700个样本 |
| 8352 | 2024-09-19 |
Macrophage Tim-3 maintains intestinal homeostasis in DSS-induced colitis by suppressing neutrophil necroptosis
2024-04, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103072
PMID:38330550
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞Tim-3在DSS诱导的结肠炎中通过抑制中性粒细胞坏死维持肠道稳态的作用 | 首次揭示了巨噬细胞Tim-3通过抑制中性粒细胞坏死在肠道炎症中的保护作用 | 研究主要集中在小鼠模型和体外实验，缺乏人体临床数据 | 探究巨噬细胞Tim-3在肠道炎症中的保护机制 | 巨噬细胞Tim-3、中性粒细胞坏死、肠道稳态 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 包括炎症性肠病患者和健康对照者的结肠组织样本，以及Tim-3敲除小鼠 |
| 8353 | 2024-09-19 |
Single-cell and whole-transcriptome sequencing of lymph node metastasis-related gene signature: A large-scale pan-cancer cohort, machine learning and experimental study
2024-Feb-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001144
PMID:38385962
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研究论文 | 研究通过单细胞和全转录组测序，结合机器学习和实验方法，构建了一个基于淋巴结转移相关基因的评分模型，用于预测癌症患者的生存和药物敏感性 | 首次通过综合分析淋巴结转移相关基因，构建了一个新的评分模型，能够准确预测患者的生存和药物敏感性，并揭示了淋巴结转移的机制 | NA | 构建一个基于淋巴结转移相关基因的评分模型，用于预测癌症患者的生存和药物敏感性，并揭示淋巴结转移的机制 | 淋巴结转移相关基因、癌症患者的生存和药物敏感性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全转录组测序、机器学习、Cox回归分析 | 评分模型 | 基因测序数据 | 33种癌症类型的数据，包括10,071例原发患者和5,036例测试患者 |
| 8354 | 2024-09-19 |
Research and experimental verification on the mechanisms of cellular senescence in triple-negative breast cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16935
PMID:38435998
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研究论文 | 研究了三阴性乳腺癌中细胞衰老的机制，并通过实验验证了相关特征 | 首次系统地分析了三阴性乳腺癌中细胞衰老相关通路，并构建了风险模型 | 实验验证仅限于体外细胞系，缺乏临床样本的验证 | 探讨三阴性乳腺癌中细胞衰老的机制及其对预后的影响 | 三阴性乳腺癌患者及其细胞衰老相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据集的三阴性乳腺癌患者样本，并进行了体外细胞系实验 |
| 8355 | 2024-09-19 |
Integrin-associated transcriptional characteristics of circulating tumor cells in breast cancer patients
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16678
PMID:38250718
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研究论文 | 研究了乳腺癌患者循环肿瘤细胞中整合素相关转录特征 | 首次探讨了不同整合素亚单位表达的循环肿瘤细胞的转录谱与其功能活性及转移潜能之间的关系 | 研究仅限于乳腺癌患者，且样本量较小 | 探讨循环肿瘤细胞中整合素表达与转录特征及其对转移潜能的影响 | 乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 乳腺癌患者的CD45阴性细胞 |
| 8356 | 2024-09-19 |
The burgeoning spatial multi-omics in human gastrointestinal cancers
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17860
PMID:39285924
|
综述 | 本文综述了空间多组学技术在人类消化系统癌症中的应用 | 介绍了空间多组学技术如何保留组织样本中的空间信息，从而增强对个体发育和疾病病理的理解 | NA | 促进空间多组学技术在消化系统肿瘤疾病研究中的应用 | 食管癌、胃癌和结直肠癌 | 数字病理学 | 消化系统癌症 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组数据 | NA |
| 8357 | 2024-09-19 |
Comprehensive analysis of splicing factor SRs-related gene characteristics: predicting osteosarcoma prognosis and immune regulation status
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1456986
PMID:39286028
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研究论文 | 研究了剪接因子SRs相关基因对骨肉瘤患者总体生存和预后的影响，并通过单细胞RNA测序数据分析了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 | 构建了基于SRs的预后模型，并揭示了SRs在骨肉瘤免疫细胞中的致癌途径 | NA | 探讨SRs相关基因对骨肉瘤患者预后和免疫调节状态的影响 | 骨肉瘤患者的总体生存和预后，以及SRs在免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | Lasso回归 | RNA | NA |
| 8358 | 2024-09-19 |
Multi-omics landscape of Interferon-stimulated gene OASL reveals a potential biomarker in pan-cancer: from prognosis to tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1402951
PMID:39286258
|
研究论文 | 本文通过多组学分析探讨了OASL在泛癌中的潜在生物标志物作用，从预后到肿瘤微环境的影响 | 首次系统性地研究了OASL在33种肿瘤中的表达及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨OASL在泛癌中的预后和免疫学作用 | OASL在33种肿瘤中的表达及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | COX和Log-Rank回归分析 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤 |
| 8359 | 2024-09-19 |
Novel insights from human induced pluripotent stem cells on origins and roles of fibro/adipogenic progenitors as heterotopic ossification precursors
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1457344
PMID:39286484
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综述 | 本文综述了成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）的起源和功能，并探讨了其在异位骨化中的作用 | 利用患者来源的诱导多能干细胞和异位骨化的小鼠模型，提供了关于FAPs起源和功能的新见解 | NA | 探讨FAPs的起源和功能，并研究其在异位骨化中的作用 | 成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）及其在肌肉组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 8360 | 2024-09-19 |
A cheminformatics and network pharmacology approach to elucidate the mechanism of action of Mycobacterium tuberculosis γ-carbonic anhydrase inhibitors
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1457012
PMID:39286631
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研究论文 | 本研究采用化学信息学和网络药理学方法，揭示结核分枝杆菌γ-碳酸酐酶抑制剂的作用机制 | 本研究首次通过同源建模和虚拟筛选方法，识别出与Cas9蛋白具有高结合亲和力的化合物，并分析了这些化合物在免疫反应和肺组织完整性相关通路中的作用 | 研究结果仍需实验验证以证明候选化合物在结核分枝杆菌感染中的疗效 | 探索结核分枝杆菌发病机制的生物学联系，并研究靶向Cas9蛋白的抗结核化合物的作用机制 | 结核分枝杆菌的γ-碳酸酐酶及其抑制剂 | 生物信息学 | 结核病 | 同源建模、虚拟筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |