单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 8221 - 8240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8221 | 2024-09-23 |
Microenvironmental regulation of T-cells in pulmonary hypertension
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1223122
PMID:37497214
|
研究论文 | 研究肺动脉高压中肺纤维细胞对T细胞的微环境调节作用 | 首次揭示了肺动脉高压中肺纤维细胞通过分泌细胞因子和趋化因子，激活和极化T细胞，从而促进局部炎症和血管重塑 | 研究主要基于牛和人的样本，可能不完全适用于人类肺动脉高压的病理机制 | 探讨肺动脉高压中肺纤维细胞对T细胞的微环境调节机制 | 肺动脉高压中的肺纤维细胞和T细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、mRNA表达分析、呼吸测定分析 | NA | RNA | 牛和人的肺动脉样本，以及来自肺动脉高压和对照组患者的T细胞 |
| 8222 | 2024-09-23 |
Revisiting transplant immunology through the lens of single-cell technologies
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00958-0
PMID:35980400
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综述 | 本文通过单细胞技术重新审视移植免疫学 | 利用单细胞技术（如CyTOF、成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序）深入表征参与同种异体移植排斥和耐受的致病性免疫群体 | 处理和分析这些大型、高维数据集需要计算生物学技术的专业知识 | 回顾现有文献中关于单细胞技术在实体器官移植中的应用 | 实体器官移植中的同种异体移植排斥和耐受 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 单细胞数据 | NA |
| 8223 | 2024-09-23 |
TNF+ regulatory T cells regulate the stemness of gastric cancer cells through the IL13/STAT3 pathway
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1162938
PMID:37534250
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研究论文 | 研究了TNF+调节性T细胞通过IL13/STAT3途径调控胃癌细胞干性的机制 | 首次揭示了TNF+调节性T细胞在胃癌组织中的招募及其与患者生存期的显著相关性，并阐明了其通过IL13/STAT3途径促进胃癌细胞干性的机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨调节性T细胞与胃癌细胞之间的相互作用及其对胃癌发展的影响 | 胃癌组织及其邻近组织中的调节性T细胞和胃癌细胞 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胃癌及其邻近组织的单细胞RNA测序数据 |
| 8224 | 2024-09-23 |
An image-guided microfluidic system for single-cell lineage tracking
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0288655
PMID:37527253
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图像引导的微流控系统，用于单细胞谱系追踪 | 该系统通过阀门控制的微流控技术，能够追踪单细胞在多代间的谱系决策过程，并结合图像处理自动化细胞加载和生长监测 | NA | 解决生物学中单细胞谱系追踪的长期未解问题 | 单细胞的谱系追踪和决策过程 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | 6C2（鸡红白血病细胞）和T2EC（鸡红细胞原代前体）细胞，追踪两代，细胞存活率超过90% |
| 8225 | 2024-09-23 |
Elevating microglia TREM2 reduces amyloid seeding and suppresses disease-associated microglia
2022-12-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20212479
PMID:36107206
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研究论文 | 研究探讨了在阿尔茨海默病早期阶段通过增强TREM2信号来减少淀粉样蛋白沉积和神经元退化的效果 | 首次展示了TREM2在阿尔茨海默病不同阶段对淀粉样蛋白沉积和疾病相关小胶质细胞的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨TREM2在阿尔茨海默病不同阶段的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 小胶质细胞中的TREM2表达及其对淀粉样蛋白沉积和疾病相关小胶质细胞的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用微胶质细胞特异性诱导的小鼠模型进行研究 |
| 8226 | 2024-09-23 |
Single-cell RNA-sequencing of retrieved human oocytes and eggs in clinical practice and for human ovarian cell atlasing
2022-12, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.23648
PMID:36264989
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类卵巢细胞研究中的应用 | 探讨了单细胞RNA测序技术在人类卵巢细胞图谱构建和体外受精治疗中的应用 | 未提及 | 探讨单细胞RNA测序技术在人类卵巢细胞研究中的应用 | 人类卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未提及 |
| 8227 | 2024-09-23 |
Context-specific regulation and function of mRNA alternative polyadenylation
2022-12, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-022-00507-5
PMID:35798852
|
综述 | 本文综述了mRNA选择性多聚腺苷酸化的特定调控机制及其功能 | 讨论了单细胞RNA测序和CRISPR-Cas技术在解析选择性3' UTR中的最新进展，并介绍了基于APA的RNA疗法 | NA | 探讨APA的动态精细调控机制及其在基因调控程序中的整合作用 | mRNA选择性多聚腺苷酸化及其在细胞响应环境变化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas技术 | NA | RNA | NA |
| 8228 | 2024-09-23 |
RS-FISH: precise, interactive, fast, and scalable FISH spot detection
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01669-y
PMID:36396787
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RS-FISH的软件，用于在二维和三维显微镜图像中进行荧光原位杂交（FISH）点的精确检测 | RS-FISH软件提供了交互式参数调整功能，并能通过分布式处理在台式机、集群或云端上扩展到大型数据集和图像体积 | NA | 开发一种准确、快速且用户友好的软件，用于在显微镜图像中检测FISH点 | FISH点的检测 | 计算机视觉 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | NA |
| 8229 | 2024-09-23 |
Image-seq: spatially resolved single-cell sequencing guided by in situ and in vivo imaging
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01673-2
PMID:36424441
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Image-seq的技术，该技术通过图像引导从特定空间位置分离细胞，并进行单细胞转录组测序，从而保留目标细胞的空间信息 | Image-seq技术结合了空间信息和高度敏感的RNA测序结果，能够记录被分析细胞的时间和动态历史 | NA | 开发一种能够保留细胞空间信息并进行单细胞转录组测序的技术 | 骨髓和白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 图像 | NA |
| 8230 | 2024-09-23 |
Combined MEK and STAT3 Inhibition Uncovers Stromal Plasticity by Enriching for Cancer-Associated Fibroblasts With Mesenchymal Stem Cell-Like Features to Overcome Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer
2022-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.07.076
PMID:35948109
|
研究论文 | 研究探讨了联合使用MEK和STAT3抑制剂在胰腺癌中克服免疫治疗抵抗的作用 | 首次揭示了联合MEK和STAT3抑制剂通过改变癌症相关成纤维细胞的特性，克服胰腺癌的免疫治疗抵抗 | 研究主要基于小鼠模型和单一临床病例，需要更多临床试验验证 | 探讨联合MEK和STAT3抑制剂在胰腺癌中克服免疫治疗抵抗的机制 | 胰腺癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和单一临床病例 |
| 8231 | 2024-09-23 |
Targeted Assessment of Mucosal Immune Gene Expression Predicts Clinical Outcomes in Children with Ulcerative Colitis
2022-Nov-23, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjac075
PMID:35665804
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研究论文 | 本文研究了靶向基因表达面板在预测儿童溃疡性结肠炎临床结果中的应用 | 首次使用靶向基因表达面板预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果，并探讨了预测基因在发病机制中的潜在作用 | 研究样本仅限于新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者，且结果主要基于52周的随访数据 | 确定靶向基因表达面板是否能预测儿童溃疡性结肠炎的临床结果，并探讨预测基因的潜在致病作用 | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 实时PCR微流体阵列，RNA测序 | NA | RNA | 313例新诊断的儿童溃疡性结肠炎患者的直肠RNA样本 |
| 8232 | 2024-09-23 |
Systematic single-cell pathway analysis to characterize early T cell activation
2022-11-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111697
PMID:36417885
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞通路分析的统计框架，并通过scRNA-seq数据展示了其在早期T细胞激活中的应用 | 开发了一种敏感且无分布假设的多样本分布测试统计框架，并将其应用于单细胞通路分析 | NA | 开发和验证一种新的单细胞通路分析工具，并揭示T细胞激活过程中的调控机制 | T细胞及其在早期激活过程中的通路活动 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个组织的T细胞样本 |
| 8233 | 2024-09-23 |
Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4
2022-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007
PMID:36347256
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研究论文 | 本文研究了心脏发育和再生过程中Bmp2和Cxcl12/Cxcr4在心内膜向冠状动脉分化中的顺序作用 | 通过使用小鼠遗传学和单细胞RNA测序，确定了心内膜血管生成调控因子，并精确评估了CXCL12/CXCR4信号通路的作用 | NA | 揭示心内膜血管生成的分子机制，并寻找促进心脏损伤后血管再生的潜在治疗靶点 | 心内膜细胞、冠状动脉内皮细胞、Bmp2和Cxcl12/Cxcr4信号通路 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 8234 | 2024-09-23 |
Ischemic Stroke Impacts the Gut Microbiome, Ileal Epithelial and Immune Homeostasis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105437
PMID:36388972
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研究论文 | 本文研究了缺血性中风对肠道微生物群、回肠上皮细胞和免疫稳态的影响 | 首次揭示了中风通过炎症机制影响回肠上皮细胞的分子和代谢途径 | NA | 探讨缺血性中风对肠道微生物群和回肠上皮细胞的影响及其分子机制 | 肠道微生物群、回肠上皮细胞、免疫细胞 | NA | 中风 | 多组学方法、单细胞RNA测序 | NA | 转录组、代谢组 | NA |
| 8235 | 2024-09-23 |
Transcriptional Profiling of Phagocytic Leukocytes and Microglia Reveals a Critical Role for Reactive Oxygen Species in Biofilm Containment during Staphylococcus aureus Craniotomy Infection
2022-11-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200503
PMID:36426943
|
研究论文 | 研究探讨了在金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中，吞噬性白细胞和微胶质细胞的转录谱，并揭示了活性氧在生物膜控制中的关键作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了吞噬性和非吞噬性细胞的转录特征，并发现活性氧在控制金黄色葡萄球菌生物膜中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中吞噬性白细胞和微胶质细胞的转录特征及其在生物膜控制中的作用 | 吞噬性白细胞、微胶质细胞、金黄色葡萄球菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型，包括NADPH氧化酶2敲除小鼠和野生型小鼠 |
| 8236 | 2024-09-23 |
Monocyte/Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing in Mice
2022-11-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200365
PMID:36426946
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探索小鼠皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和状态转换 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面探索皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和状态转换 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，结果可能不适用于其他物种 | 深入了解皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞的异质性和功能 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的单核细胞/巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2813个高质量细胞 |
| 8237 | 2024-09-23 |
Multiomic analysis reveals conservation of cancer-associated fibroblast phenotypes across species and tissue of origin
2022-11-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.09.015
PMID:36270275
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了癌症相关成纤维细胞表型在不同物种和组织来源中的保守性 | 本文首次通过配对的染色质可及性和转录组分析，综合分析了癌症相关成纤维细胞的亚群，并识别出三种超群：稳态样、机械应答和免疫调节型成纤维细胞 | NA | 研究癌症相关成纤维细胞的异质性及其在不同物种和组织中的保守性 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 转录组、蛋白质组 | 多个组织类型和物种的样本 |
| 8238 | 2024-09-23 |
Cellular and molecular profiles of larval and adult Xenopus corneal epithelia resolved at the single-cell level
2022-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.08.007
PMID:36049533
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了青蛙角膜上皮细胞在幼体和成体阶段的细胞和分子特征 | 揭示了角膜发育和成熟过程中细胞多样性的增加以及转录组、基因调控网络和细胞间通讯动力学的显著变化，并识别出潜在的幼体和成体角膜上皮干细胞 | NA | 探索角膜上皮干细胞及其增殖后代在维持角膜透明度和稳态中的作用 | 青蛙幼体和成体角膜上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 幼体和成体青蛙角膜细胞 |
| 8239 | 2024-09-23 |
Directed differentiation of human pluripotent stem cells into diverse organ-specific mesenchyme of the digestive and respiratory systems
2022-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00733-3
PMID:35978039
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研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的协议 | 利用单细胞转录组学揭示的小鼠前肠器官发生中的信号网络和分子标记，成功将人类多能干细胞分化为多种器官特异性间充质 | 目前主要集中在间充质的生成，尚未涉及复杂人体组织的工程化 | 开发一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的方法 | 人类多能干细胞及其分化产物 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 4-7天的培养时间，不同类型的间充质细胞比例为60-90%纯度的肝隔膜横纹肌样细胞，70-80%纯度的肝样成纤维细胞，以及约35%的呼吸样、胃样或食管样间充质细胞 |
| 8240 | 2024-09-23 |
Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.011
PMID:36228617
|
研究论文 | 研究了非运动驱动蛋白KIF26A缺失导致先天性脑畸形的机制 | 首次揭示了KIF26A在脑发育中的功能，并解释了其在神经元迁移、轴突生长和凋亡中的作用 | NA | 探讨KIF26A缺失对脑发育的影响及其分子机制 | KIF26A基因、先天性脑畸形患者、小鼠和人类iPSC衍生的类器官模型 | NA | 先天性脑畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包含KIF26A功能缺失变异的患者队列、小鼠模型和人类iPSC衍生的类器官模型 |