单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 8181 - 8200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8181 | 2024-09-23 |
Single-Cell RNA Sequencing: Opportunities and Challenges for Studies on Corneal Biology in Health and Disease
2023-07-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12131808
PMID:37443842
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类角膜生物学研究中的应用，重点讨论了其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 单细胞RNA测序作为一种革命性工具，能够识别角膜组织中的细胞状态 | 目前对角膜中特定细胞类型的各种细胞状态和关键基因的理解尚不充分 | 探讨单细胞RNA测序在角膜生物学研究中的应用及其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 人类角膜的细胞状态和关键基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8182 | 2024-09-23 |
Age-related alterations in meningeal immunity drive impaired CNS lymphatic drainage
2023-07-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221929
PMID:37027179
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研究论文 | 研究揭示了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化如何导致中枢神经系统淋巴引流受损 | 首次证明了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化是导致淋巴引流功能下降的关键因素 | 研究仅在老年小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨年龄相关的小胶质淋巴管功能下降的机制及其潜在治疗策略 | 小胶质淋巴管内皮细胞和免疫细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠的小胶质淋巴管内皮细胞 |
| 8183 | 2024-09-23 |
Drivers of heterogeneity in synovial fibroblasts in rheumatoid arthritis
2023-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01527-9
PMID:37277655
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研究论文 | 研究类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 首次使用配对的单细胞RNA和ATAC测序、多重成像和空间转录组学以及体外细胞外因子信号建模，探讨了类风湿性关节炎患者发炎关节中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 对人类炎症性疾病中移民细胞和常驻细胞类型之间的局部交流理解仍不充分 | 探讨类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 类风湿性关节炎患者发炎关节中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多重成像、空间转录组学 | NA | RNA、ATAC、图像 | NA |
| 8184 | 2024-09-23 |
Efficient Generation of Paired Single-Cell Multiomics Profiles by Deep Learning
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301169
PMID:37114830
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的框架scMOG，用于从实验可用的单细胞RNA-seq数据中生成单细胞转座酶可及染色质（ATAC）数据，反之亦然 | scMOG能够准确地在RNA和ATAC之间进行跨组学生成，并在一种组学实验不可用且超出训练数据集时生成具有生物学意义的配对多组学数据 | NA | 开发一种高效生成配对单细胞多组学数据的方法 | 单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 单细胞RNA和ATAC数据 | NA |
| 8185 | 2024-09-23 |
Inferring Cell-Cell Communications from Spatially Resolved Transcriptomics Data Using a Bayesian Tweedie Model
2023-06-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14071368
PMID:37510272
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研究论文 | 提出了一种基于贝叶斯Tweedie模型的方法，用于从空间分辨转录组数据中推断细胞间通信 | 提出了BATCOM方法，通过广义线性回归模型估计细胞类型间的通信分数，并考虑了它们之间的距离，提供了通信方向和配体受体相互作用的信息 | NA | 推断细胞间通信并理解生物机制 | 细胞间通信 | 生物信息学 | NA | 空间分辨转录组学 | 贝叶斯Tweedie模型 | 转录组数据 | NA |
| 8186 | 2024-09-23 |
Self-formation of concentric zones of telencephalic and ocular tissues and directional retinal ganglion cell axons
2023-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533827
PMID:36993285
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研究论文 | 研究报告了人类端脑-眼类器官的自发形成，这些类器官包含沿着中心-周边轴排列的端脑、视神经、视盘和神经视网膜组织 | 首次展示了人类端脑-眼类器官的自发形成，并揭示了视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制 | NA | 探讨端脑和眼组织在人类中的协调发育，以及视网膜神经节细胞轴突的定向生长 | 人类端脑、视神经、视盘和神经视网膜组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8187 | 2024-09-23 |
Reciprocal interactions between alveolar progenitor dysfunction and aging promote lung fibrosis
2023-06-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85415
PMID:37314162
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研究论文 | 研究探讨了衰老和肺泡祖细胞功能障碍之间的相互作用如何促进肺纤维化 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了衰老和肺损伤对肺泡上皮细胞基因表达程序的协同影响，并发现了与肺纤维化相关的基因表达特征 | 研究主要基于小鼠模型和IPF患者样本，可能无法完全反映人类肺纤维化的复杂性 | 探讨衰老和肺泡祖细胞功能障碍在肺纤维化中的作用机制 | 肺泡上皮细胞（AEC2s）及其在衰老和肺损伤中的基因表达变化 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的肺组织样本，IPF患者和健康捐赠者的肺组织样本 |
| 8188 | 2024-09-23 |
RETROFIT: Reference-free deconvolution of cell-type mixtures in spatial transcriptomics
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.07.544126
PMID:37333291
|
研究论文 | 提出了一种名为RETROFIT的无参考贝叶斯方法，用于空间转录组学数据中细胞类型的去卷积 | RETROFIT无需单细胞转录组参考数据，能够生成稀疏且可解释的解决方案，独立于单细胞转录组参考数据进行细胞类型去卷积 | NA | 开发一种无需参考数据的空间转录组学数据细胞类型去卷积方法 | 空间转录组学数据中的细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 贝叶斯方法 | NA | 转录组数据 | 合成数据和真实数据，包括Slide-seq和Visium平台的数据 |
| 8189 | 2024-09-23 |
Interleukin-21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T Cell-associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2023-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543518
PMID:37333332
|
研究论文 | 研究IL-21在慢性肠道炎症中驱动CD4+ T细胞相关病原性和高代谢状态的作用 | 首次揭示了IL-21通过影响线粒体-内质网接触位点，导致Treg细胞代谢功能障碍，从而加剧炎症反应 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体内验证 | 探讨细胞代谢在Treg细胞相关肠道稳态中的作用 | Treg细胞在慢性肠道炎症中的代谢功能 | NA | 肠道炎症 | 电子显微镜、共聚焦成像、近端连接分析、免疫印迹、质谱流式细胞术、流式细胞术、代谢组学、基因表达分析、实时代谢分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据和基因修饰的Treg细胞在小鼠结肠炎模型中的应用 |
| 8190 | 2024-09-23 |
CAR T-cell design dependent remodeling of the brain tumor immune microenvironment identify macrophages as key players that inhibit or promote anti-tumor activity
2023-Jun-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2972427/v1
PMID:37333156
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研究论文 | 研究了CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响，并识别出巨噬细胞在抑制或促进抗肿瘤活性中的关键作用 | 首次探讨了CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响，并揭示了巨噬细胞在抗肿瘤反应中的双重作用 | 研究仅限于特定的B7-H3 CAR T细胞和免疫功能正常的胶质瘤模型 | 探讨CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响，以开发更有效的T细胞免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在胶质瘤模型中的抗肿瘤活性 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六个不同设计的B7-H3 CAR T细胞 |
| 8191 | 2024-09-23 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543353
PMID:37333273
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研究论文 | 本文探讨了ENPP1作为抗癌cGAMP-STING通路的固有免疫检查点的机制 | 发现ENPP1通过抑制cGAMP-STING介导的抗肿瘤免疫和激活免疫抑制性eADO信号来促进乳腺癌的生长和转移 | NA | 研究ENPP1在乳腺癌中的作用及其作为免疫检查点的机制 | ENPP1在乳腺癌中的表达及其对cGAMP-STING通路的影响 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 乳腺癌患者样本 |
| 8192 | 2024-09-23 |
p38MAPKα Stromal Reprogramming Sensitizes Metastatic Breast Cancer to Immunotherapy
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0907
PMID:36883955
|
研究论文 | 研究通过抑制p38MAPKα来重编程转移性乳腺癌的肿瘤微环境，增强免疫疗法的效果 | 首次展示了p38MAPKα抑制剂与OX40激动剂联合使用在减少转移性生长和提高总体生存率方面的协同作用 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探索通过重编程肿瘤微环境来提高转移性乳腺癌对免疫疗法的敏感性 | 转移性乳腺癌及其肿瘤微环境 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8193 | 2024-09-23 |
Efficient and accurate KIR and HLA genotyping with massively parallel sequencing data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277585.122
PMID:37169596
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研究论文 | 本文介绍了一种名为T1K的新型计算方法，用于从RNA-seq、全基因组测序或全外显子测序数据中高效准确地推断KIR和HLA等位基因 | T1K方法能够联合考虑所有基因型的等位基因，可靠地识别存在的基因并区分同源基因，包括具有挑战性的基因。此外，T1K还能调用新的单核苷酸变异并处理单细胞数据 | NA | 开发一种高效准确的计算方法，用于从大规模并行测序数据中进行KIR和HLA基因分型 | KIR基因和HLA基因 | 基因组学 | NA | 大规模并行测序 | T1K | RNA-seq、全基因组测序、全外显子测序 | NA |
| 8194 | 2024-09-23 |
The expanding vistas of spatial transcriptomics
2023-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01448-2
PMID:36192637
|
研究论文 | 本文探讨了空间转录组学技术的发展及其在组织细胞类型结构、细胞间相互作用和组织成分间分子相互作用研究中的应用 | 介绍了空间转录组学技术的新进展，包括其在敏感性、多重性和通量方面的快速提升 | NA | 探讨空间转录组学技术的发展及其在生物学研究中的应用 | 组织中的基因表达及其在细胞类型结构、细胞间相互作用和分子相互作用中的作用 | 基因组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8195 | 2024-09-23 |
Neuraminidase is a host-directed approach to regulate neutrophil responses in sepsis and COVID-19
2023-06, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.16013
PMID:36526272
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研究论文 | 研究探讨了神经氨酸酶作为宿主导向方法在调节脓毒症和COVID-19中中性粒细胞反应的作用 | 首次提出神经氨酸酶1（NEU1）与基质金属蛋白酶9（MMP-9）的相互作用在脓毒症和COVID-19中引发中性粒细胞过度激活 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 研究神经氨酸酶在严重感染中调节中性粒细胞反应的作用 | 健康捐赠者和COVID-19患者的中性粒细胞，以及感染了MHV-3的小鼠 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康捐赠者和COVID-19患者的呼吸道样本，以及感染了MHV-3的小鼠 |
| 8196 | 2024-09-23 |
Cell type deconvolution of bulk blood RNA-Seq to reveal biological insights of neuropsychiatric disorders
2023-May-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.24.542156
PMID:37293101
|
研究论文 | 本研究通过计算方法从大量血液RNA-Seq数据中推断细胞类型比例，揭示神经精神疾病的生物学机制 | 本研究首次在非脑组织的大规模RNA-Seq数据中应用计算方法，识别与精神疾病和药物相关的细胞类型特异性生物学机制 | 本研究主要依赖于计算推断的细胞类型比例，可能存在一定的误差 | 揭示神经精神疾病的遗传变异与疾病风险之间的因果机制 | 双相情感障碍和精神分裂症患者的血液样本 | 基因组学 | 神经精神疾病 | RNA-Seq | NA | RNA序列 | 1730个样本 |
| 8197 | 2024-09-23 |
The role of CD8+ T-cell clones in immune thrombocytopenia
2023-05-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022018380
PMID:36749920
|
研究论文 | 研究探讨了细胞毒性CD8+ T细胞在免疫性血小板减少症（ITP）中的作用 | 发现了CD8+ T细胞克隆在ITP患者中的扩展，并提出了抗体非依赖性的血小板破坏机制 | NA | 探索CD8+ T细胞在ITP中的作用机制 | ITP患者和年龄匹配的对照组 | 免疫学 | 血液疾病 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序 | NA | 基因序列、RNA序列 | ITP患者和年龄匹配的对照组 |
| 8198 | 2024-09-23 |
Single-cell RNA sequencing data reveals rewiring of transcriptional relationships in Alzheimer's Disease associated with risk variants
2023-May-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.05.15.23289992
PMID:37292975
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序数据揭示了阿尔茨海默病相关风险变异对转录关系的影响 | 提出了通过单细胞RNA测序数据分析基因表达差异相关性来识别潜在因果基因的方法 | NA | 理解遗传风险变异如何影响阿尔茨海默病的病因 | 阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过130万个细胞 |
| 8199 | 2024-09-23 |
Single-cell transcriptomics of a dynamic cell behavior in murine airways
2023-04-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76645
PMID:37083555
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研究论文 | 本文介绍了一种将小鼠组织中细胞的生理行为与其深度分子分析相结合的方法 | 本文建立了一种新的分子特征，用于描述小鼠气道损伤后显著的细胞迁移行为 | NA | 研究细胞在其自然环境中的动态行为分子特征 | 小鼠气道中的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本 |
| 8200 | 2024-09-23 |
CORE CONSERVED TRANSCRIPTIONAL REGULATORY NETWORKS DEFINE THE INVASIVE TROPHOBLAST CELL LINEAGE
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.30.534962
PMID:37066272
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研究论文 | 研究比较了鼠和人类侵袭性滋养层细胞系的保守转录调控网络 | 首次生成了鼠妊娠期15.5天和19.5天的单核ATAC-seq数据，并将其与单细胞RNA-seq数据整合，确定了侵袭性滋养层细胞的染色质可及性特征，并发现了保守的基因调控网络 | 对鼠和人类侵袭性滋养层细胞调控机制的相似性和差异性理解有限 | 研究鼠和人类侵袭性滋养层细胞系的保守转录调控网络 | 鼠和人类侵袭性滋养层细胞系 | NA | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | 鼠妊娠期15.5天和19.5天的子宫-胎盘界面组织 |