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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8201 | 2025-10-05 |
shinyUMAP: an online tool for promoting understanding of single cell omics data visualization
2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.27.672621
PMID:40949989
|
研究论文 | 开发了一个在线交互式工具,帮助用户理解单细胞组学数据可视化中UMAP参数对细胞簇分布的影响 | 首个允许用户上传单细胞数据并交互式调整UMAP超参数以观察细胞簇分布变化的在线服务器 | 仅支持2D UMAP可视化,未涉及其他降维方法或更高维度的可视化 | 促进单细胞组学数据可视化的正确理解和应用 | 单细胞组学数据(如scRNA-seq表达数据) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 单细胞表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8202 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Reduced Frequency and Activity of CXCR5+ Atypical Memory B Cells in Islet Xenotransplantation Treated With Clinically Applicable Immunosuppressants Including Belimumab
2025 Sep-Oct, Xenotransplantation
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/xen.70076
PMID:40964768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Belimumab在猪到非人灵长类胰岛异种移植中对B细胞亚群的影响 | 首次在异种移植模型中揭示Belimumab不仅减少CXCR5+非典型记忆B细胞比例,还引起所有B细胞亚群功能受损 | 研究仅限于非人灵长类动物模型,未在人类受试者中验证 | 研究Belimumab在胰岛异种移植中的免疫抑制机制 | 恒河猴的B细胞亚群 | 单细胞测序分析 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 恒河猴治疗前后血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8203 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing study reveals the potential role of the RPS26 gene in attention deficit hyperactivity disorder
2025-Aug-30, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111444
PMID:40653146
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究RPS26基因在注意力缺陷多动障碍中的潜在作用 | 首次应用单细胞RNA测序技术研究ADHD患者白细胞,发现RPS26基因在单核细胞中的差异表达及其对单核细胞发育分化的调控作用 | 样本量较小(仅一对异卵双胞胎),需要更大规模研究验证结果 | 探索ADHD与心血管疾病之间的潜在分子联系 | 异卵双胞胎的白血球样本和单核细胞 | 单细胞测序 | 注意力缺陷多动障碍 | 单细胞RNA测序, qPCR | NA | RNA测序数据 | 一对异卵双胞胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8204 | 2025-10-05 |
Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia
2025-Apr, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10831-2
PMID:39688759
|
研究论文 | 本研究首次描述了LGR5和LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征,并发现它们在子痫前期胎盘中的失调现象 | 首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点,发现这些干细胞标志物在子痫前期和胎儿生长受限胎盘中的表达失调 | 缺氧/促炎细胞因子处理未能显著改变LGR5/LGR4表达,暗示可能存在其他调控机制 | 研究LGR5/LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征及其在子痫前期和胎儿生长受限中的失调机制 | 人类胎盘组织、滋养层干细胞、不同妊娠期胎盘样本 | 生殖医学 | 子痫前期、胎儿生长受限 | 原位杂交、单细胞转录组测序、单核RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 早孕期胎盘11例、早产胎盘9例、足月胎盘11例、早发性子痫前期81例、晚发性子痫前期20例、胎儿生长受限34例及相应对照组 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 8205 | 2025-10-05 |
MFAP4 Deficiency Attenuates Liver Fibrosis by Regulating Hepatic Stellate Cell Fate Through Inhibition of the FAK/PI3K/NFκB Signaling Pathway
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101548
PMID:40449846
|
研究论文 | 本研究揭示了MFAP4通过整合素αvβ3依赖的FAK/PI3K/NFκB信号通路调控肝星状细胞活化和凋亡抵抗的新机制 | 首次阐明MFAP4通过整合素αvβ3激活FAK/PI3K/NFκB信号通路促进肝星状细胞活化的分子机制,并发现MFAP4介导的自维持反馈环路 | 研究主要基于小鼠模型和LX-2细胞系,人类临床样本验证有限 | 探究MFAP4在肝纤维化中的作用机制及其对肝星状细胞命运的调控 | 野生型和Mfap4基因敲除小鼠、LX-2人肝星状细胞系 | 分子病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、组织病理学、双免疫荧光、流式细胞术、Transwell共培养系统、Western blot、定量PCR | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 基因敲除小鼠模型和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8206 | 2025-10-05 |
A Reflux Linked GATA Factor Fulcrum Dictates Lineage Commitment Through GPRC5B During the Esophageal Dysplastic Transition
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101552
PMID:40490196
|
研究论文 | 本研究揭示了GATA转录因子家族在巴雷特食管向食管腺癌转化过程中通过调控GPRC5B影响细胞谱系决定的机制 | 首次发现GATA因子通过GPRC5B形成调控细胞命运平衡的'支点'机制,并利用器官芯片平台验证其在高级别不典型增生中的作用 | 研究主要基于细胞系和器官芯片模型,需要进一步在体实验验证 | 探究GATA转录因子家族在食管腺癌前病变发展过程中的作用机制 | 食管细胞系、病变来源的成体干细胞、癌症基因组图谱数据 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序、shRNA基因沉默、CRISPR基因编辑、空间转录组学、器官芯片 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、临床数据 | 癌症基因组图谱食管腺癌病例、食管细胞系、成体干细胞 | NA | 空间转录组学,器官芯片 | NA | 器官芯片平台 |
| 8207 | 2025-10-05 |
Regulatory TCRαβ+ Double Negative T Cells Suppress γδ T Cells and Alleviate Colitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101553
PMID:40505772
|
研究论文 | 本研究探讨了调节性TCRαβ+双阴性T细胞通过抑制γδ T细胞缓解结肠炎的作用机制 | 首次揭示DNT细胞通过E-cadherin和NKG2D协同作用增强对CD103+ γδ T细胞的细胞毒性,并证明异体DNT细胞移植可缓解结肠炎且不引发移植物抗宿主病 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和安全性仍需进一步验证 | 阐明调节性DNT细胞在结肠炎中的免疫调节作用及其治疗潜力 | 小鼠结肠组织中的免疫细胞,特别是DNT细胞和γδ T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,过继性细胞转移 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8208 | 2025-10-05 |
Hepatocyte Apolipoprotein J Accelerates Injury-induced Liver Fibrosis by Activation Signal Transducer and Activator of Transcription 3 Through Ranbp2 Mediated-SUMOylation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101556
PMID:40545037
|
研究论文 | 本研究揭示肝细胞载脂蛋白J通过Ranbp2介导的STAT3 SUMO化促进损伤诱导的肝纤维化 | 首次阐明ApoJ通过RanBP2介导STAT3在K679位点的SUMO化修饰,促进其核转位激活STAT3通路的新机制 | 主要基于小鼠模型研究,临床转化价值需进一步验证 | 探究肝细胞ApoJ如何通过STAT3通路调控肝星状细胞活化的旁分泌信号 | 肝细胞、肝星状细胞、小鼠模型、肝硬化患者样本 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、基因敲除、基因过表达、细胞培养 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 肝硬化患者和健康对照的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8209 | 2025-10-05 |
Histopathologic Evaluation and Single-cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients With Inflammatory Bowel Disease
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101563
PMID:40571096
|
研究论文 | 本研究通过组织病理学评估和单细胞空间转录组学分析结肠标本,揭示了与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的细胞和分子异常 | 首次结合传统组织病理学特征与单细胞空间转录组学技术,系统分析IPAA失败的风险因素和分子机制 | 回顾性研究设计,样本来自单一医疗中心,可能限制结果的普适性 | 识别与回肠储袋-肛管吻合术失败相关的组织病理学特征和分子机制 | 417名接受IPAA手术的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 组织病理图像,基因表达数据 | 417名患者,部分患者进行空间转录组学分析 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 8210 | 2024-11-22 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00308-w
PMID:39567832
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8211 | 2025-10-05 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.12.618004
PMID:39416197
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了脂肪组织巨噬细胞在衰老过程中的多样性变化,发现神经相关巨噬细胞控制脂肪稳态并抑制年龄相关炎症 | 首次使用血管内标记排除循环髓系细胞,结合单细胞测序和正交验证,定义了寿命周期内驻留脂肪组织巨噬细胞的多样性变化,并发现CD169+神经相关巨噬细胞的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类脂肪组织巨噬细胞的变化模式可能有所不同 | 探究脂肪组织巨噬细胞如何控制年龄相关炎症和脂肪稳态 | 小鼠内脏白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关疾病 | 单细胞测序,血管内标记,正交验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8212 | 2025-10-05 |
Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis
2024-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00813-1
PMID:39289595
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研究论文 | 本研究揭示了器官特异性血管异质性通过调控紧密连接蛋白Claudins的表达决定乳腺癌器官倾向性转移的机制 | 首次阐明血管内皮细胞特异性Claudins蛋白表达差异是决定器官特异性转移的关键因素,独立于癌细胞内在机制 | 研究主要聚焦于肺和肾脏转移的对比,其他器官转移机制尚未完全探索 | 探究乳腺癌器官特异性转移的机制 | 转移性乳腺 carcinoma 模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8213 | 2025-10-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
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研究论文 | 本文介绍了从狼疮易感小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在狼疮易感MRL/lpr小鼠模型中建立调节性B细胞的分离方案并应用于单细胞RNA测序分析 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 深入理解调节性B细胞在健康和疾病状态下的生物学特性 | 狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8214 | 2025-10-05 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-12-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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研究论文 | 本研究探讨了肺间质细胞中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 首次揭示了在淋巴管平滑肌瘤病中,间质细胞通过旁分泌信号传导机制与内皮细胞通讯并驱动血管重塑 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本有限且为终末期肺组织 | 阐明LAM疾病中肺间质细胞与内皮细胞之间的通讯机制及其在肺血管重塑中的作用 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者肺组织和Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠 | 分子病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织形态学数据 | 终末期LAM患者肺组织和不同年龄段的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8215 | 2025-10-05 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
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研究论文 | 通过回顾性药物遗传学研究探索银屑病治疗反应的遗传基础,发现KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的重要作用 | 首次发现rs1991820和rs62264137两个新标记与银屑病治疗反应相关,并证实KLK7表达与抗TNF治疗反应的关联 | 回顾性研究设计,样本量相对有限(1942例患者),自我评估的治疗反应可能存在偏倚 | 探索银屑病治疗药物反应的遗传通路和生物标志物 | 1942例基因分型的银屑病患者 | 药物遗传学 | 银屑病 | 基因分型、线性回归、表观基因组学、转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 线性回归模型 | 基因型数据、表达数据、临床数据 | 1942例银屑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8216 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析评估了三种不同条件诱导的代谢功能障碍相关脂肪性肝病器官模型 | 首次系统评估MASLD器官模型的转化潜力,并通过单细胞分析揭示不同诱导条件对炎症和纤维化的差异化影响 | 研究仅评估了三种诱导条件,可能未涵盖MASLD所有病理生理机制 | 评估人类肝脏器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病研究中的转化潜力 | 人类肝脏器官模型 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | 器官模型 | 单细胞转录组数据 | 三种不同诱导条件的器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8217 | 2025-10-05 |
GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114060
PMID:38009297
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示肝细胞癌进展过程中GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞的免疫抑制和促癌作用 | 首次在单细胞水平识别了肝细胞癌进展中的三个关键肝实质细胞亚群,并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性 | 研究主要基于大鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的临床验证 | 探究肝细胞癌发展中特定细胞群体及其在肿瘤微环境形成中的作用 | 毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大鼠模型和HCC患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8218 | 2025-10-05 |
Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance
2023-12-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174528
PMID:38060331
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内出血通过激活巨噬细胞中NRF2信号通路促进癌症进展和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现出血激活的NRF2在肿瘤相关巨噬细胞中驱动癌症生长、侵袭和免疫治疗抵抗的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性需要进一步验证 | 探索肿瘤内出血如何影响癌症进展和治疗反应 | 肿瘤相关巨噬细胞和MC38结肠腺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 3D细胞培养球体功能分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8219 | 2025-10-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
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研究论文 | 本研究揭示了IL-27在急性疟疾感染期间通过调控CD4+ T细胞反应影响免疫记忆形成的机制 | 首次发现IL-27在急性疟疾感染期间靶向调控特定CD4+T细胞反应窗口,并鉴定出独特的Th1记忆前体细胞亚群 | 研究主要基于小鼠疟疾模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究IL-27在疟疾感染期间对CD4+ T细胞记忆反应的调控作用 | 疟疾感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 疟疾感染小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8220 | 2025-10-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-12-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
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研究论文 | 本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达导致骨折不愈合的分子机制 | 首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制,并证明表观遗传修饰的祖细胞治疗可恢复炎症条件下的骨再生能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和效果需要进一步验证 | 探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略 | 骨折愈合过程中的祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序,遗传动物模型,表观遗传调控 | 转基因小鼠模型(Ikk2ca,Dnmt3b功能缺失和转基因) | 单细胞转录组数据,遗传表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |