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当前共找到 35811 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-01-22 |
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606650
PMID:41550933
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童哮喘患者与健康对照的外周血单个核细胞，揭示了免疫相关表达异质性和淋巴细胞发育失调在儿童哮喘中的作用 | 首次在单细胞水平上系统揭示了儿童哮喘中免疫细胞发育轨迹的异常模式，并识别了JUN、SPI1等关键基因及S100A家族蛋白的普遍上调，为理解哮喘的分子机制提供了新视角 | 样本量较小（仅3例患者和4例对照），且未涉及组织特异性分析，可能限制结果的普适性 | 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 | 儿童哮喘患者和健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 802 | 2026-01-22 |
Role of SUV39H2 in shaping the malignant phenotype of triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1679640
PMID:41551146
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研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及功能作用 | 首次系统分析SUV39H2在多种癌症中的表达，并验证其在TNBC中的促癌功能 | 临床实用性需进一步验证，样本量有限 | 阐明SUV39H2在TNBC恶性表型中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系及患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、功能实验 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 5对TNBC患者样本，MDA-MB-231和Hs-578T细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 803 | 2026-01-22 |
Research progress of stem cells in the treatment of atherosclerosis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1722416
PMID:41552013
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综述 | 本文系统综述了干细胞在治疗动脉粥样硬化中的研究进展，包括其作用机制、动物实验与临床试验证据、当前面临的挑战以及未来的优化策略与应用前景 | 聚焦于2023-2025年的最新研究证据，并提出了结合单细胞测序、类器官模型和精准递送系统等前沿技术来推动干细胞临床转化的具体实施路径 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，其分析基于对现有文献的总结 | 总结干细胞治疗动脉粥样硬化的研究进展，分析核心挑战，并探讨促进其临床转化的未来方向 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、内皮祖细胞等用于治疗动脉粥样硬化的干细胞类型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 804 | 2026-01-22 |
Bu-Yi-Xin-Shen formula targets monocytes through PI3K-Akt/NF-κB signaling in post-percutaneous coronary intervention angina
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CMPK4691
PMID:41552316
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的机制 | 结合生物信息学、分子对接、单细胞RNA测序和体内实验，首次系统揭示了补益心肾方通过靶向单核细胞中的PI3K-Akt/NF-κB信号通路发挥治疗作用 | 研究主要基于动物实验和生物信息学预测，缺乏临床样本的直接验证，且活性成分的具体体内药效学需进一步确认 | 探究补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的作用机制 | 单核细胞及相关信号通路（PI3K-Akt、NF-κB） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 805 | 2026-01-22 |
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1719516
PMID:41552665
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研究论文 | 本文提出一个计算框架，用于扩展标准t-SNE图，通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 | 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析，计算嵌入对输入数据的敏感性，并通过雅可比矩阵热图可视化特征影响和结构不稳定区域 | 未明确讨论框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个框架来评估t-SNE嵌入的稳定性和可解释性，以增强生物信息学中的科学结论严谨性 | 高维生物数据，包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 | 机器学习 | NA | t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 | t-SNE | 高维数据 | 三个不同的生物数据集 | NA | bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 806 | 2026-01-22 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组研究中的新兴技术、当前挑战以及未来的发展方向 | 系统性地总结了用于克服肿瘤内微生物低生物量检测挑战的新兴技术，包括改进的污染控制策略、高分辨率检测方法以及人工智能辅助的多组学整合分析，并指出了该领域从描述性研究向机制理解和临床转化发展的趋势 | NA | 探讨肿瘤内微生物组研究领域的技术挑战、最新进展及未来前景，以推动该领域向机制研究和临床转化发展 | 肿瘤内微生物组 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 厌氧培养优化, 基因组解析分析, 酶水平分析, 人工智能辅助分析 | NA | 微生物组数据, 临床数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 807 | 2026-01-22 |
Tumor-like characteristics of vascular smooth muscle cells in atherosclerosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734123
PMID:41552822
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综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表现出的类肿瘤特征，包括DNA损伤、基因组不稳定性、逃避衰老、过度增殖、迁移与侵袭激活、癌症干细胞样特性以及癌症相关信号通路激活 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学技术，揭示了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中表现出高度可塑性和类肿瘤特征，这一发现挑战了传统观点 | NA | 探讨动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的类肿瘤特征，为针对血管平滑肌细胞的新治疗策略提供理论基础 | 血管平滑肌细胞及其衍生细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 808 | 2026-01-22 |
Matrine induces V-ATPase-dependent cytoplasmic vacuolation and inhibits the function of the lysosome in leukemia cells
2024-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2023.100013
PMID:41550167
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研究论文 | 本文研究了苦参碱通过诱导V-ATPase依赖性细胞质空泡化并抑制溶酶体功能来抑制白血病细胞增殖的新分子机制 | 揭示了苦参碱通过质子化激活V-ATPase导致溶酶体功能抑制和空泡形成的新机制 | NA | 探究苦参碱抑制白血病细胞增殖的分子机制 | 白血病细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜, 荧光显微镜, 蛋白质印迹, 流式细胞术 | NA | RNA-seq数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 809 | 2026-01-22 |
Schizophrenia endothelial cells exhibit higher permeability and altered angiogenesis patterns in patient-derived organoids
2024-01-23, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02740-2
PMID:38263175
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研究论文 | 本研究利用精神分裂症患者来源的iPSCs生成3D脑类器官，通过单细胞RNA测序发现其内皮细胞比例增加，并揭示了基因表达、血管结构和通透性的异常变化 | 首次在患者来源的脑类器官模型中系统揭示了精神分裂症内皮细胞的高通透性和血管生成模式改变，为疾病病因提供了新视角 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本量相对有限（23名供体） | 探究精神分裂症中内皮/血管功能障碍对疾病发展的贡献 | 精神分裂症患者和健康对照者来源的诱导多能干细胞生成的3D脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、显微图像数据 | 23名供体（患者与健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 810 | 2026-01-22 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
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研究论文 | 本文介绍了一个前列腺癌患者来源异种移植（PDX）模型的集合，用于加速临床前药物测试和候选疗法的系统评估 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX资源库，覆盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱，并利用单细胞RNA测序揭示了肿瘤异质性 | 样本量相对有限（59个肿瘤来自30名患者），且时间跨度可能影响治疗反应的普遍性 | 建立前列腺癌PDX模型资源，以促进临床前药物测试和有效治疗方案的优先筛选 | 前列腺癌患者来源的肿瘤样本及衍生的PDX模型和类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | PDX模型，类器官模型 | 基因组数据，转录组数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 811 | 2026-01-21 |
Multi-omics profiling of ACOX3 unveils pan-cancer clinical biomarker potential
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析全面评估了ACOX3作为新型泛癌生物标志物的表达异质性、临床相关性、肿瘤-免疫相互作用和治疗潜力 | 首次将ACOX3作为泛癌生物标志物进行系统表征，结合单细胞和空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的富集模式，并通过分子对接和动力学模拟筛选出潜在抑制剂 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于HNSCC细胞系，缺乏体内模型验证和更广泛的癌症类型实验数据 | 评估ACOX3作为泛癌生物标志物的诊断和预后价值，探索其与肿瘤免疫微环境的关联及治疗潜力 | 多种癌症类型（包括KICH、PRAD、THCA、COAD、HNSCC等）的肿瘤样本和HNSCC细胞系 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 多组学分析、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、ROC分析、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 涉及多种癌症类型的公共数据集和HNSCC细胞系 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 812 | 2026-01-21 |
Cellular and molecular determinants of lymph node metastasis in papillary thyroid carcinoma: Integrated multi-omics profiling and machine learning models
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大块转录组数据，系统解析了甲状腺乳头状癌淋巴结转移的细胞和分子决定因素，并构建了基于随机森林的预测模型 | 首次整合多组学数据揭示PTC淋巴结转移的免疫微环境变化、恶性细胞异质性及FN1-SDC4轴的关键调控作用，并开发了17个关键基因的预测签名 | 研究主要基于计算分析和体外实验，缺乏体内模型验证；样本量可能有限，需进一步临床队列验证 | 阐明甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制并开发预测工具 | 甲状腺乳头状癌的原发灶和转移灶组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 大块转录组测序 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 大块转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 813 | 2026-01-21 |
scGImpute: A hybrid BiLayer multi-head graph attention-based imputation framework for zero dropout in single-cell sequencing datasets
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGImpute的混合双层多头图注意力神经网络框架，用于在单细胞测序数据中恢复技术性零值同时保留生物性零值 | 提出了一种新颖的混合双层多头图注意力神经网络框架，专门针对单细胞测序数据中的零值丢失问题，并适用于多种组学数据类型 | NA | 解决单细胞测序数据中高频零读计数或丢失事件的技术挑战，以降低技术噪声并改善下游分析 | 单细胞测序数据集，包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 混合双层多头图注意力神经网络 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 814 | 2026-01-21 |
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502979R
PMID:41555841
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研究论文 | 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序，揭示了VCAN在胃癌相关成纤维细胞中的高表达及其通过特定信号通路促进高干性胃腺癌细胞进展的机制 | 首次结合bulk测序与单细胞测序技术，系统性地鉴定出VCAN主要由癌症相关成纤维细胞（特别是pan-pCAF亚型）分泌，并阐明其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路驱动高干性胃腺癌细胞恶性表型的新机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证；信号通路机制尚未完全阐明，且未涉及VCAN靶向治疗的临床前评估 | 探究versican（VCAN）在胃腺癌（STAD）中的作用机制，寻找新的治疗靶点 | 胃腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | bulk测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 815 | 2026-01-21 |
RUNX1 N6-methyladenosine methylation enhances cytoskeleton remodeling and boosts cardiac fibrosis
2026-Jan-20, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag010
PMID:41555207
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研究论文 | 本研究揭示了YTHDF1通过识别m6A修饰的Runx1 mRNA增强其翻译，进而驱动RUNX1介导的Ctgf转录，从而促进心脏成纤维细胞增殖和纤维化的新表观转录组学通路 | 首次阐明了m6A介导的YTHDF1-RUNX1轴在心脏纤维化中的调控机制，特别是发现了peak_21317位点特异性m6A修饰对于YTHDF1结合和促进Runx1翻译的关键作用 | 当前转录因子结合模型很少整合RNA修饰，且包含这些修饰的最新方法仍然有限，这阻碍了转录因子亲和力的准确分析 | 探究m6A介导的机制在心脏纤维化过程中调控RUNX转录因子的作用 | 人心房颤动组织、心脏成纤维细胞特异性Ythdf1条件性敲除小鼠、ISO/TAC诱导的心脏纤维化模型、TGF-β1刺激的心脏成纤维细胞 | 表观转录组学 | 心血管疾病 | MeRIP-seq, 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq, RNA测序, 组织学和生化分析 | 条件性敲除小鼠模型, AAV9介导的基因敲低模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA-seq数据, ChIP-seq数据, 组织学图像, 生化数据 | 人心房颤动组织样本、多组小鼠模型（包括Ythdf1条件性敲除鼠、Cre对照、野生型对照） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 816 | 2026-01-21 |
Integrated multi-omics identifies MCRS1 as a causal hub linking aging, metabolic syndrome, and breast cancer progression
2026-Jan-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004592
PMID:41556158
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别出MCRS1是连接衰老、代谢综合征和乳腺癌进展的核心因果枢纽 | 首次通过整合乳腺癌、代谢综合征和衰老队列的转录组数据集，结合机器学习、孟德尔随机化和单细胞RNA测序，识别并验证了MCRS1作为连接这些状态的核心因果驱动因子 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要在人类患者中进行进一步验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 817 | 2026-01-21 |
S3RL: Enhancing Spatial Single-Cell Transcriptomics With Separable Representation Learning
2026-Jan-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516178
PMID:41556263
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研究论文 | 本文提出了一种名为S3RL的可分离表示学习框架，用于增强空间单细胞转录组数据的保真度，以解码复杂的组织微环境 | S3RL通过有效去噪稀疏测量和放大生物学相关信号，能够恢复原本会丢失的细粒度空间表达模式和调控关系，在空间域识别和多切片对齐方面实现了高达170%的调整兰德指数改进 | 未在摘要中明确说明 | 增强空间转录组数据的保真度，以更好地解码复杂的组织微环境 | 人类、小鼠和植物等多种组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤免疫交互 | 空间转录组学 | 可分离表示学习框架 | 空间转录组数据 | 多种人类、小鼠和植物组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 818 | 2026-01-21 |
Single-cell characterization of the adult male hippocampus suggests a prominent, and cell-type specific, role for Nrgn and Sgk1 in response to a social stressor
2026-Jan-19, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03417-y
PMID:41554902
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，对成年雄性小鼠海马体在基础状态和急性应激条件下的分子特征进行了全面表征，并利用基因敲除模型探索了糖皮质激素受体和盐皮质激素受体在应激反应中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了成年雄性小鼠海马体对单一延长社交挫败应激的细胞类型特异性分子特征，并鉴定出Nrgn和Sgk1作为应激反应性神经元的关键调控因子 | 研究仅针对成年雄性小鼠，未涵盖雌性或不同年龄阶段的动物，且仅关注了海马体这一特定脑区 | 探究应激相关精神障碍的分子机制，特别是海马体在应激反应中的细胞类型特异性调控网络 | 成年雄性小鼠海马体细胞，包括谷氨酸能神经元、GABA能神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞 | 单细胞组学 | 应激相关精神障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 819 | 2026-01-21 |
Deciphering CD4+ Naive T cell-mediated divergent pathogenic links between type 2 diabetes and pathologic scarring via an integrated multi-omics approach
2026-Jan-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004905
PMID:41556164
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了2型糖尿病通过CD4+初始T细胞介导的免疫微环境调控，对增生性瘢痕和瘢痕疙瘩产生相反因果效应的潜在机制 | 首次采用表型范围孟德尔随机化结合单细胞RNA测序等多组学技术，系统阐明了2型糖尿病与不同病理性瘢痕之间的因果关联及CD4+初始T细胞的介导作用 | 研究主要基于遗传学和转录组学数据，缺乏直接的体内功能验证实验 | 探究糖尿病与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩）之间的因果关系及免疫细胞机制 | 糖尿病（1型和2型）与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩） | 多组学整合分析 | 糖尿病与皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、细胞间通讯推断、代谢通路分析、转录组差异表达分析 | 孟德尔随机化模型、伪时间轨迹分析 | 遗传数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 820 | 2026-01-21 |
scPlantAnnotate: an accurate and robust transformer-based model for plant cell type annotation
2026-Jan-17, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.035
PMID:41554477
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研究论文 | 开发并评估了scPlantAnnotate，一种基于Transformer的植物单细胞RNA测序数据注释框架 | 首次提出针对植物数据的Transformer模型，在标准评估和更严格的留一数据集评估中均优于现有方法，提高了对数据集偏移的鲁棒性 | 模型主要针对特定植物物种（拟南芥、玉米、水稻、大豆），可能未涵盖所有植物类型；在留一数据集评估中，所有方法性能均因批次效应和数据集异质性而下降 | 开发一个植物专用的单细胞RNA测序数据细胞类型注释框架，以支持植物细胞图谱构建和下游生物学发现 | 拟南芥、玉米、水稻和大豆的植物单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞RNA测序数据 | 使用来自拟南芥、玉米、水稻和大豆的精选数据集进行训练 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |