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当前共找到 44757 篇文献,本页显示第 801 - 820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
801 2026-10-21
Utilizing single-cell data for per-cell type eQTL mapping in the human pancreas
2026-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序数据在人类胰腺的多种细胞类型中进行eQTL定位,并结合bulk数据解卷积和GWAS共定位分析,揭示细胞类型特异性的代谢疾病风险关联 首次在单个胰腺细胞类型中进行eQTL发现,鉴定了13个新的单细胞eQTL eGenes和116个解卷积特有的eGenes,并揭示了已知eQTL的细胞类型作用机制 研究统计效力有限,影响eQTL的可发现性,可能遗漏部分低频或效应较小的eQTL 在单个胰腺细胞类型中进行eQTL发现,以揭示细胞类型特异性的基因表达调控效应,并将发现与代谢疾病风险关联 人类胰腺胰岛供体的单细胞RNA测序数据和bulk胰腺RNA测序数据 基因组学 代谢疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, eQTL定位, 解卷积分析, fine-mapping, 共定位分析 NA 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据, 基因型数据, GWAS数据 153018个单细胞来自71个胰腺胰岛供体,bulk数据来自305个GTEx供体 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
802 2026-10-21
Single-Cell and Multi-Omics Profiling of the Multiple Myeloma Immune Niche: From Bone Marrow Architecture and Metabolic Reprogramming to Immunotherapy Response
2026-Sep-29, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文综述了单细胞、空间和多组学技术在多发性骨髓瘤免疫生态位研究中的应用,涵盖骨髓结构、髓外播散、循环肿瘤细胞、代谢重编程、CAR-T细胞及T细胞重定向免疫治疗和干细胞移植 提出应通过整合的空间-时间框架来理解多发性骨髓瘤的进展与复发,将恶性浆细胞可塑性、免疫能力、基质持续存在、代谢适应和残留病灶定位联系起来 作为综述文章,未提供原始实验数据;文中指出目前仍缺乏将骨髓结构、髓外播散、循环肿瘤细胞、代谢重编程、CAR-T及T细胞重定向免疫治疗和干细胞移植进行整合的综合分析 整合单细胞、空间和多组学证据,阐明多发性骨髓瘤骨髓微环境结构、代谢重编程与免疫治疗反应之间的关系 多发性骨髓瘤患者及其骨髓微环境中的恶性浆细胞、免疫细胞、基质细胞、血管结构、循环肿瘤细胞和髓外病灶 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞测序、空间转录组学、多重成像、多组学分析 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
803 2026-10-21
Inflammatory Network Remodeling in AML Is Driven by Neutrophil-Centric Self-Amplifying Circuits
2026-Sep-29, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和Luminex蛋白验证,系统绘制AML骨髓炎症网络重塑,发现以中性粒细胞为核心的自我放大回路,并构建炎症风险评分用于预后分层 从网络层面而非单一细胞因子角度研究AML炎症微环境;提出以中性粒细胞为中心的计算预测自我放大回路(如CXCL8-CXCR2和CCL3-CCR1轴);构建基于CXCL8、CCL2和IL-1A的炎症风险评分,可将ELN2022中危组进一步分层 scRNA-seq队列样本量有限(3例AML患者和6例健康供者),可能限制细胞和网络层面详细发现的普适性;炎症风险评分需前瞻性多中心验证后才能临床应用 系统绘制AML炎症网络重编程图谱,并开发基于网络的预后工具 初诊AML患者和健康供者的骨髓样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序, Luminex多因子检测 LASSO惩罚Cox回归, CellChat配体-受体通讯分析 单细胞转录组数据, 蛋白质定量数据 scRNA-seq队列:3例AML患者和6例健康供者共47525个细胞;Luminex验证队列:46例患者和26例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
804 2026-10-21
Peripheral CXCR3 blockade mitigates T cell infiltration and neurodegeneration in a mouse model of tauopathy
2026-Sep-28, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 该研究揭示了外周CXCR3阻断可减少tauopathy小鼠模型中的T细胞浸润并减轻神经退行性变 首次证明CXCR3依赖的趋化作用是tau介导神经退行性变相关T细胞亚型的关键信号通路,并提出外周CXCR3阻断作为tauopathy的潜在疾病修饰治疗策略 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;CXCR3阻断对其它疾病相关炎症表型的影响需进一步评估 探究CXCR3在tauopathy中的作用及其作为治疗靶点的潜力 tauopathy和神经退行性变小鼠模型 神经科学 tauopathy 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 文本,图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
805 2026-10-21
Uncovering Immune Cell-Specific lncRNAs as Anti-PD-1 Response-Associated Markers in Breast Cancer
2026-Sep-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过分析27例乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据,识别与帕博利珠单抗(抗PD-1)应答相关的免疫细胞特异性lncRNA标志物 首次在免疫细胞亚群水平系统揭示与乳腺癌抗PD-1治疗应答相关的lncRNA特征,并发现管腔型与三阴性乳腺癌存在截然不同的应答相关lncRNA模式(管腔型以巨噬细胞为主,TNBC以淋巴细胞和树突状细胞为主),尤其发现NEAT1在TNBC应答者树突状细胞中特异性上调 样本量较小(仅27例患者),未进行独立队列验证,基于淋巴细胞克隆扩增作为应答标准的替代指标而非真实临床疗效数据 识别与乳腺癌帕博利珠单抗治疗应答相关的免疫细胞特异性lncRNA标志物,以改善患者分层和免疫治疗预后 27例乳腺癌患者(包括管腔型与三阴性乳腺癌亚型)的肿瘤微环境免疫细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 27例乳腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
806 2026-10-21
Deoxythymidylate Kinase (DTYMK)-Driven Pyrimidine Hypermetabolism Is Associated with a Folate-Dependent Macrophage Programme in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Sep-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 该研究整合单细胞、bulk转录组与Xenium空间转录组,结合DTYMK敲低、共培养与叶酸救援实验,揭示三阴性乳腺癌中DTYMK驱动的嘧啶高代谢通过叶酸依赖的巨噬细胞重编程塑造免疫抑制微环境 首次提出DTYMK-叶酸-MAFB轴,将肿瘤内在嘧啶代谢重编程与FOLR2肿瘤相关巨噬细胞的表观遗传重编程及T细胞密度降低的空间共定位联系起来 摘要中未明确说明研究局限性,机制预测(叶酸外排与摄取)主要基于推断,尚需更多体内功能验证 探究三阴性乳腺癌中嘧啶代谢是否塑造免疫微环境及其与巨噬细胞重编程的关系 三阴性乳腺癌肿瘤组织及恶性上皮细胞、FOLR2肿瘤相关巨噬细胞 数字病理, 空间转录组学, 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 空间转录组, 基因敲低, 细胞共培养, 叶酸救援实验 NA 图像, 文本 NA 10x Genomics single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq 10x Xenium Xenium空间转录组平台,结合单细胞与bulk转录组数据
807 2026-10-21
Single-Cell Transcriptomic Landscape of the Gill in Hypoxia-Stressed Tachysurus vachellii (Richardson, 1846): Insights into Cell-Type-Specific Responses of Different Epithelial Cells and Erythrocytes
2026-Sep-24, Cells IF:5.1Q2
研究论文 该研究构建了黄颡鱼鳃的单细胞转录组图谱,并探究了急性低氧胁迫下鳃细胞的响应模式 首次构建了黄颡鱼鳃的单细胞图谱,鉴定了18种细胞类型,揭示了不同上皮细胞和红细胞在低氧及复氧过程中的细胞类型特异性响应,发现非神经元神经递质信号可能调控黏液细胞 摘要中未明确提及研究局限性 构建黄颡鱼鳃的单细胞图谱,探索急性低氧胁迫下鳃细胞的响应模式 黄颡鱼(Tachysurus vachellii)的鳃组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,组织学观察 NA 单细胞转录组数据,图像 37,090个细胞,33个细胞簇,18种细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
808 2026-10-21
SPINT2 Is Associated with Dual-Phenotype Hepatocellular Carcinoma and Aggressive Tumor Features
2026-Sep-24, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 该研究整合多重免疫荧光、CyTOF质谱流式、单细胞RNA测序和功能实验,刻画双表型肝细胞癌(DPHCC)并探究SPINT2与该表型及侵袭性肿瘤特征的关系 首次将SPINT2与双表型肝细胞癌状态相关联,并结合多重免疫荧光、CyTOF和scRNA-seq多维度刻画DPHCC的干性与EMT特征 SPINT2的机制意义和临床意义仍需进一步验证 刻画双表型肝细胞癌(DPHCC)并研究SPINT2在肿瘤进展中的关联及功能相关性 肝细胞癌患者临床队列及MHCC-97H、MHCC-LM3细胞系 数字病理 肝癌 多重免疫荧光、CyTOF质谱流式、单细胞RNA测序、免疫组化、功能实验 NA 图像、文本 临床队列中22.89%的患者被鉴定为DPHCC NA 单细胞RNA测序、CyTOF质谱流式 NA NA
809 2026-10-21
O-GlcNAcylated TCF4 Drives Ferroptosis Resistance and Tumor-Associated Macrophage Infiltration to Promote Colorectal Cancer Liver Metastasis
2026-Sep-24, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 该研究揭示O-GlcNAcylated TCF4通过激活GPX4转录介导铁死亡抵抗并促进CSF1分泌招募TAM,从而驱动结直肠癌肝转移 首次发现OGT介导的TCF4 Ser163位点O-GlcNAcylation修饰促进其核定位和转录活性,并揭示TCF4-GPX4-铁死亡抵抗及TCF4-CSF1-TAM募集/ M2极化的双重调控轴 摘要未提及具体局限性 探究TCF4翻译后修饰在结直肠癌肝转移进展中的作用及机制 结直肠癌肝转移患者样本及结直肠癌细胞 数字病理, 多组学 结直肠癌, 肝转移 单细胞RNA测序, 多组学分析, 功能实验 NA 单细胞转录组数据, 多组学数据, 临床队列数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 多组学 NA NA
810 2026-10-21
A ZIP-Active Tumor Cell State Defines an NRF2-Associated Ferroptosis-Resistant and Immune-Cold Transcriptional Program in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-Sep-24, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 基于单细胞RNA测序和TCGA队列,识别头颈鳞癌中ZIP活跃的上皮肿瘤细胞状态,并揭示其与NRF2相关铁死亡抵抗及免疫冷转录程序的关系 首次在HNSCC中定义以锌转运蛋白SLC39A1和SLC39A6协同上调为特征的ZIP活跃肿瘤细胞状态,并将其与NRF2相关氧化应激适应、谷胱甘肽代谢、铁死亡抑制及免疫冷表型联系起来 研究主要基于转录组数据的生物信息学分析,缺乏实验验证;单细胞数据来源队列规模有限;ZIP活跃状态的机制未通过功能实验证实 识别头颈鳞癌中锌转运蛋白相关的上皮肿瘤细胞状态,并评估其分子特征与临床意义 头颈鳞状细胞癌患者的上皮肿瘤细胞及TCGA-HNSCC队列 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
811 2026-10-21
Berberine Prevents and Reverses Gastric Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia by Modulating M2 Macrophage Polarization
2026-Sep-24, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨小檗碱能否预防和逆转他莫昔芬诱导的小鼠胃解痉多肽表达化生,并阐明其通过调节M2巨噬细胞极化发挥作用的机制 首次在小鼠模型中证明小檗碱既能预防又能逆转胃解痉多肽表达化生,并揭示其通过抑制M2巨噬细胞浸润、调控JAK-STAT/NF-κB通路和S100A6表达发挥作用 研究仅基于他莫昔芬诱导的小鼠模型,缺乏临床人体试验数据;S100A6与M2巨噬细胞浸润的关联仅为推测,未进行功能验证 探究小檗碱对胃解痉多肽表达化生的预防和逆转作用及其分子机制 他莫昔芬诱导的胃解痉多肽表达化生小鼠模型 数字病理 胃癌前病变 单细胞RNA测序,转录组测序,免疫组化,免疫荧光,H&E染色 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA-seq NA NA
812 2026-10-21
B-Cell Immune Responses in Myocarditis: Mechanisms, B-Cell Receptor Repertoire, and Clinical Translation
2026-Sep-23, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了B细胞免疫应答在心肌炎中的作用机制,包括B细胞受体库重塑、自身抗体介导的心肌损伤、B细胞亚群功能异质性及临床转化前景 系统整合了单细胞测序和BCR库测序揭示的B细胞克隆扩增、免疫球蛋白类别转换和功能亚群动态变化,强调了B细胞不仅作为自身抗体来源,还通过抗原呈递、细胞因子分泌和免疫调节交互参与心肌炎发病 BCR库特征和自身抗体谱作为生物标志物的临床效用尚不确定,缺乏标准化检测方法及充分验证的灵敏度、特异性和可重复性 综合当前关于B细胞在心肌炎中免疫应答机制的证据,探讨BCR库重塑、自身抗体介导损伤、B细胞亚群功能异质性及临床转化前景 心肌炎(包括感染性、自身免疫性和免疫检查点抑制剂相关心肌炎)中的B细胞免疫应答 免疫学 心肌炎 单细胞测序,BCR库测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq,BCR库测序 NA NA
813 2026-10-21
UcTCRp: a TCRβ-based framework for identifying and profiling MAIT- and iNKT-associated repertoire signals
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了UcTCRp,一个仅基于TCRβ序列的框架,用于在批量免疫库中检测和分析MAIT细胞和iNKT细胞相关信号 首次实现仅利用TCRβ序列检测MAIT和iNKT细胞信号,结合Transformer预训练表征与监督建模,突破了传统方法依赖恒定TCRα链、抗原负载四聚体或转录组表型的限制,使仅含TCRβ的存档免疫库数据得以重新利用 摘要中未明确提及研究局限性 开发一种仅基于TCRβ序列的框架,在缺乏TCRα链或转录组信息的批量免疫库数据中检测和刻画MAIT细胞与iNKT细胞相关信号 人类和小鼠的MAIT细胞、iNKT细胞及常规T细胞的TCRβ序列 免疫信息学 NA TCRβ测序、scRNA-seq、scTCR-seq Transformer 序列、文本 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 NA NA
814 2026-10-21
Artificial intelligence in spatial transcriptomics: a review of methods, datasets, and directions
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 本文综述了空间转录组学中人工智能方法、数据集和分析流程的应用与进展 以AI为核心视角系统评估统计、机器学习和深度学习方法在空间转录组分析全流程中的应用,涵盖从图像与测序数据预处理到空间分析及LLM辅助解读,并汇总数据集、AI分析框架和流程资源 作为综述文章未开展原始实验验证,且指出当前AI工具在空间组学中仍面临挑战和局限 综述空间转录组学中人工智能相关方法、数据集及未来发展方向 空间转录组学数据及其AI分析方法与数据库资源 空间转录组学 癌症, 神经科学, 生殖生物学, 植物生物学 空间转录组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习, 深度学习, 大语言模型 图像, 文本, 测序数据 NA NA 空间转录组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
815 2026-10-21
Principal Genes: A PCA-based approach to highly variable genes selection for scRNA-Seq analysis
2026-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种基于主成分分析(PCA)的“Principal Genes”方法,用于scRNA-Seq数据的高变基因选择,并评估其在聚类任务中的性能 不依赖均值-方差关系,而是利用PCA的旋转(载荷)计算基因主成分得分(GPS)来评估基因变异性,实现超快速的高变基因选择 仅在六个真实标注的scRNA-Seq数据集上验证,未涉及更广泛的数据类型或生物学场景 开发一种新的高变基因选择方法,以克服基于离散度方法的方差不稳定性和基因数量确定的任意性,并提高下游聚类性能 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据中的基因 机器学习 NA 单细胞RNA测序 PCA 基因表达计数矩阵 六个真实标注的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
816 2026-10-21
A spatial and temporal atlas of tubulin isotype gene expression during vertebrate embryonic development
2026-Aug, Molecular biology of the cell IF:3.1Q3
研究论文 本文构建了鸡胚胎神经嵴EMT及组织分化过程中α-和β-微管蛋白同型基因表达的时空图谱 首次在脊椎动物胚胎发育过程中建立细胞状态分辨的微管蛋白同型基因表达时空图谱,结合单细胞RNA测序和荧光原位杂交链反应(HCR)验证表达模式 转录本表达模式不能直接反映微管蛋白组成,需要进一步研究确定其与微管组成的关联 阐明微管组成在细胞状态转变(如EMT)过程中如何受发育调控 鸡胚胎神经嵴细胞及神经嵴相关细胞类型 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交链反应(HCR) NA 基因表达数据, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
817 2026-10-21
Spatiotemporal multi-omics reveals lineage, spatial and functional heterogeneity of tumor-associated macrophages and therapeutic vulnerabilities in the tumor microenvironment
2026-Jul-25, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
综述 该综述聚焦新兴单细胞与空间多组学技术如何重新定义肿瘤相关巨噬细胞的起源、表型多样性、空间组织及治疗脆弱性 不同于以往主要总结巨噬细胞极化或TAM亚型分类的综述,本文强调单细胞和空间多组学技术对TAM起源、空间异质性和治疗靶点的重新定义,并提出整合AI辅助数字病理和纵向采样的精准肿瘤学框架 作为综述文章,未提供原始实验数据验证;对TAM亚群的可塑性、技术平台的标准化以及临床转化中的样本纵向采集等挑战讨论有限 总结单细胞和空间多组学技术在TAM研究中的应用进展,梳理TAM的谱系起源、空间生态位、功能异质性及治疗脆弱性,并展望TAM靶向治疗策略和精准肿瘤学转化方向 肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的谱系来源、空间分布、功能亚群和与免疫细胞、基质细胞的互作 数字病理 泛癌种 单细胞转录组学、空间转录组学、空间多组学、多重成像、放射组学、命运图谱 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、空间多组学 NA NA
818 2026-10-21
Integrative multi-omics analysis defines a macrophage-associated phospholipid metabolism signature linked to immune remodeling and prognosis in lung adenocarcinoma
2026-Jul-22, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 该文通过整合单细胞RNA测序、批量转录组和临床数据,构建并验证了一个与巨噬细胞相关的磷脂代谢四基因预后特征,用于肺腺癌的风险分层和免疫代谢重塑分析 首次将单细胞分析与hdWGCNA相结合,聚焦巨噬细胞相关的磷脂代谢,构建四基因预后特征,并系统揭示其与免疫微环境重塑、突变景观和药物敏感性的关联 研究主要基于公共队列的回顾性数据,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内动物实验和前瞻性临床验证 识别并验证与巨噬细胞相关的磷脂代谢预后特征,探索其在肺腺癌免疫代谢重塑和预后评估中的作用 肺腺癌患者的肿瘤组织样本、公共队列数据(TCGA和GEO)以及LUAD细胞模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq Cox回归, 机器学习, hdWGCNA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
819 2026-10-21
Dying cells initiate DLL4-Notch signaling to drive tumor repopulation after insufficient thermal ablation of papillary thyroid carcinoma
2026-Jul-22, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了甲状腺乳头状癌热消融不完全后死亡细胞通过DLL4-Notch信号通路驱动肿瘤再增殖的机制 揭示了热诱导死亡细胞通过上调DLL4激活存活细胞Notch信号促进肿瘤再增殖的新机制,并发现HNRNPU作为DLL4转录上游调控因子 缺乏高质量临床证据,机制研究主要基于体外和体内模型 探索热消融后肿瘤再增殖的机制并寻找可能的干预策略 甲状腺乳头状癌(PTC) 数字病理 甲状腺癌 NGS, RNA-seq, 空间转录组学, enChIP-MS, qPCR, WB, IHC, 流式细胞术 NA 图像, 文本 NA 10x Genomics 空间转录组学, 批量RNA-seq 10x Xenium Xenium原位空间转录组学
820 2026-10-21
Transsulfuration links aspartate-asparagine metabolism and redox homeostasis to drive tumor growth: Asparagine-driven transsulfuration bypasses the malate-aspartate shuttle to restore redox balance, revealing a metabolic vulnerability in tumor redox maintenance
2026-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文揭示缺乏GOT1和GOT2的肿瘤细胞通过天冬酰胺驱动的转硫途径绕过苹果酸-天冬氨酸穿梭,恢复胞质氧化还原平衡并维持肿瘤生长 发现天冬酰胺通过丝氨酸和甲硫氨酸依赖的转硫途径生成α-酮丁酸,后者还原再生胞质NAD,从而恢复氧化还原稳态;将天冬酰胺定义为胞质NAD/NADH平衡的调节因子,并揭示转硫途径是肿瘤氧化还原维持的可靶向弱点 未提及 探究GOT1/GOT2缺失的肿瘤细胞如何在经典天冬氨酸合成受损的情况下维持生长,并阐明胞质氧化还原状态与天冬氨酸供应在其中的作用 缺乏GOT1和GOT2的癌细胞及其来源的肿瘤 肿瘤代谢 癌症 单细胞转录组学, 代谢物示踪, CRISPR功能缺失筛选 NA 转录组数据, 代谢物数据, 基因筛选数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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