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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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8121 | 2024-10-05 |
Repurposable drugs for SARS-CoV-2 and influenza sepsis with scRNA-seq data targeting post-transcription modifications
2021-Dec, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbab022
PMID:34993416
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研究论文 | 本文通过整合基因表达扰动数据和单细胞RNA测序数据,识别出可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物 | 本文采用系统生物学方法,结合FDA批准药物和临床前小分子化合物的基因表达扰动数据,以及COVID-19患者的单细胞RNA测序数据,识别出281种可能有效对抗SARS-CoV-2感染的药物,并实验验证了其中两种药物对流感病毒复制和宿主细胞细胞因子及其调节因子转录和翻译的抑制作用 | 本文主要基于现有数据和已批准药物进行筛选,未涉及新药开发 | 识别可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物 | SARS-CoV-2和流感病毒感染及其并发症 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 轻度和重度COVID-19患者的数据(GEO: GSE145926) |
8122 | 2024-10-04 |
Implications of accumulation of clonally expanded and senescent CD4+GNLY+ T cells in immunological non-responders of HIV-1 infection
2024-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2024.2396868
PMID:39239709
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研究论文 | 研究探讨了HIV-1感染免疫无应答者中CD4+GNLY+ T细胞的积累及其与免疫重建的关系 | 首次揭示了CD4GNLY T细胞在HIV-1感染免疫无应答者中的高克隆扩增和衰老特征,并探讨了其与免疫重建的关系 | 研究样本量较小,可能影响结果的普适性 | 阐明CD4GNLY T细胞的特征及其与HIV-1感染免疫无应答者免疫重建的关系 | HIV-1感染免疫无应答者中的CD4GNLY T细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞RNA数据、TCR数据、流式细胞数据、血浆细胞因子数据 | HIV-1感染免疫无应答者的血液样本 |
8123 | 2024-10-04 |
Integrating cellular experiments, single-cell sequencing, and machine learning to identify endoplasmic reticulum stress biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2409352
PMID:39340293
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研究论文 | 本研究整合细胞实验、单细胞测序和机器学习技术,识别特发性肺纤维化中的内质网应激相关生物标志物 | 首次将内质网应激与特发性肺纤维化的生物标志物识别相结合,并开发了具有强预测能力的诊断和预后模型 | NA | 揭示特发性肺纤维化中的内质网应激相关生物标志物 | 特发性肺纤维化患者肺组织中的内质网应激相关基因和细胞类型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个数据集和体外实验样本 |
8124 | 2024-10-04 |
The concept of onychodermis containing onychofibroblasts has histological (microanatomical), immunohistochemical as well as molecular basis
2024-Nov, Journal of cutaneous pathology
IF:1.6Q3
DOI:10.1111/cup.14696
PMID:39044464
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研究论文 | 本文探讨了包含onychofibroblasts的onychodermis的概念,并提供了其组织学、免疫组织化学和分子基础的证据 | 首次通过单细胞RNA测序和原位杂交技术,揭示了onychofibroblasts在onychodermis中表达的关键基因,这些基因与指甲形成和相关疾病有关 | NA | 研究onychodermis和onychofibroblasts在指甲发育和病理中的作用 | onychodermis和onychofibroblasts的组织学、免疫组织化学和分子特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA |
8125 | 2024-10-04 |
Gastroduodenal injury and repair mechanisms
2024-Nov-01, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000001049
PMID:38935320
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综述 | 本文综述了胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 | 重点介绍了黏膜保护的新机制,包括腺病毒疗法、植物提取物和RNA技术在黏膜再生中的应用 | 缺乏对急性浅表性损伤修复机制的深入研究 | 探讨胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 | 胃十二指肠黏膜损伤及其修复机制 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA | NA |
8126 | 2024-10-04 |
Novel Long Noncoding RNA HEAT4 Affects Monocyte Subtypes, Reducing Inflammation and Promoting Vascular Healing
2024-Oct, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究了新型长非编码RNA HEAT4在单核细胞亚型中的作用,减少炎症并促进血管愈合 | 发现了人类特异性的长非编码RNA HEAT4,其在心血管免疫学中的作用机制,包括在单核细胞亚型转换中的作用 | 研究主要集中在体外和动物模型中,需要进一步在人体中验证其效果 | 探讨长非编码RNA在心血管疾病中的免疫调节作用 | 长非编码RNA HEAT4及其在单核细胞亚型转换中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | RNA | 包括心力衰竭、急性心肌梗死和心源性休克患者的血液样本,以及NOD.CB17-Prkdc scid/Rj小鼠的血管损伤模型 |
8127 | 2024-10-04 |
Effector MoSDT1 enhances Magnaporthe oryzae virulence and plays a dual role in regulating rice defense
2024-Oct-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae364
PMID:39046202
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研究论文 | 研究了C2H2锌效应子MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重作用 | 首次揭示了MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重调节作用,并通过RNA-seq、scRNA-seq和ChIP-seq技术深入分析了其调控机制 | 研究主要集中在MoSDT1的过表达和敲除菌株上,未涉及其在自然环境中的表现 | 探讨MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的作用机制 | 稻瘟病菌MoSDT1效应子和水稻防御反应 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 包括MoSDT1过表达菌株和两个敲除菌株 |
8128 | 2024-10-04 |
IRG1/ACOD1 promotes neutrophil reverse migration and alleviates local inflammation
2024-Oct-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae110
PMID:38713770
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研究论文 | 研究探讨了IRG1/ACOD1在多形核中性粒细胞(PMN)反向迁移及其在炎症缓解中的作用 | 首次揭示了IRG1/ACOD1通过调节PMN表面ICAM-1表达,促进PMN从炎症部位反向迁移,从而缓解局部炎症 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究PMN反向迁移的机制及其在炎症中的作用 | 多形核中性粒细胞(PMN)及其在炎症中的反向迁移 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
8129 | 2024-10-04 |
Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia
2024-Oct-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-24-0200
PMID:39099209
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研究论文 | 研究通过使用CD73小分子抑制剂AB-680预防性治疗K-Ras突变型胰腺上皮内瘤变(PanIN),增强免疫监视 | 首次在K-Ras突变型胰腺上皮内瘤变模型中验证了CD73抑制剂AB-680的预防性治疗效果,显著减少PanIN形成并改变免疫微环境 | 研究仅在基因工程小鼠模型中进行,尚未在人体试验中验证 | 探讨CD73抑制剂在预防胰腺导管腺癌(PDAC)前体病变PanIN中的作用 | K-Ras突变型胰腺上皮内瘤变(PanIN)及其免疫微环境 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用KrasG12D; PdxCre1(KC)基因工程小鼠模型,样本量为多只小鼠 |
8130 | 2024-10-04 |
The temporal protein signature analyses of developing human deciduous molar tooth germ
2024-Oct, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300396
PMID:38522031
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研究论文 | 研究分析了人类乳牙牙胚在胚胎阶段的时间依赖性蛋白质组变化 | 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了713种差异表达蛋白及其在牙发育中的五种时间表达模式,并筛选出24种潜在的牙发育驱动蛋白 | NA | 探讨人类乳牙牙胚发育过程中的蛋白质表达变化及其潜在机制 | 人类乳牙牙胚在胚胎阶段的蛋白质表达 | 发育生物学 | NA | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 胚胎阶段的人类乳牙牙胚样本 |
8131 | 2024-10-04 |
Engineered extracellular vesicles enable high-efficient delivery of intracellular therapeutic proteins
2024-Oct-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae015
PMID:38518087
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研究论文 | 本文报道了一种基于外泌体的细胞内递送方法(IDEA),能够高效地包装和递送天然蛋白质,无需使用支架 | IDEA方法避免了传统支架策略对货物稳定性和功能的损害,实现了高效的蛋白质递送 | NA | 开发一种高效的细胞内递送系统,用于扩展基于蛋白质的疗法 | 外泌体作为下一代递送载体,以及cGAS作为免疫传感器 | 生物技术 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 多个同基因肿瘤模型 |
8132 | 2024-10-04 |
Characterization of regeneration initiating cells during Xenopus laevis tail regeneration
2024-Oct-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03396-3
PMID:39350302
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研究论文 | 本文研究了非洲爪蟾尾巴再生过程中再生启动细胞的特征 | 发现了再生启动细胞(RICs),这是一种新发现的短暂细胞状态,参与再生过程的启动 | 主要基于受伤后1天的实验评估 | 揭示再生启动的关键步骤及其在受伤后数小时内发生的现象 | 非洲爪蟾尾巴再生过程中的再生启动细胞 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
8133 | 2024-10-04 |
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-Oct-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3257
PMID:39350665
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研究论文 | 本文研究了一种主要增强疫苗接种方法,通过肌肉注射DNA疫苗和鼻内接种减毒流感疫苗,诱导肺部记忆CD8+ T细胞,从而预防肿瘤肺转移 | 首次发现中心记忆T细胞是疫苗诱导的肺部记忆T细胞的前体,并揭示了鼻内接种减毒流感疫苗通过改变黏膜微环境促进中心记忆T细胞向肺部记忆T细胞分化的机制 | NA | 研究疫苗接种方法对肺部记忆T细胞的诱导及其在预防肿瘤肺转移中的作用 | 肺部记忆CD8+ T细胞及其前体中心记忆T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
8134 | 2024-10-04 |
Dynamic glycolytic reprogramming effects on dendritic cells in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Sep-30, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03192-8
PMID:39343933
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研究论文 | 研究胰腺导管腺癌中葡萄糖和乳酸水平对树突状细胞抗原呈递功能的影响 | 首次阐明葡萄糖和乳酸水平对胰腺导管腺癌中树突状细胞抗原呈递功能的影响及其机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的类器官,可能与人体实际情况存在差异 | 探讨葡萄糖和乳酸水平对胰腺导管腺癌中树突状细胞功能的影响 | 胰腺导管腺癌中的树突状细胞及其抗原呈递功能 | NA | 胰腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用患者来源的类器官和切除标本,以及KPC小鼠的细胞系 |
8135 | 2024-10-02 |
The estrogen response in fibroblasts promotes ovarian metastases of gastric cancer
2024-Sep-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52615-9
PMID:39349474
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研究论文 | 研究揭示了雌激素在胃癌卵巢转移中的作用机制 | 首次发现卵巢成纤维细胞中的雌激素受体和midkine通过ER-MDK-LRP1信号轴促进胃癌的卵巢转移 | 样本量较小,仅涉及18名患者 | 探讨胃癌卵巢转移的分子机制 | 胃癌患者的卵巢转移样本 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 45个肿瘤样本,来自18名胃癌患者 |
8136 | 2024-10-04 |
SPP1+ macrophages in HR+ breast cancer are associated with tumor-infiltrating lymphocytes
2024-Sep-30, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-024-00695-7
PMID:39349495
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研究论文 | 研究探讨了HR+乳腺癌中SPP1+巨噬细胞与肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)之间的关系 | 揭示了SPP1+巨噬细胞在TIL-high HR+乳腺癌中对T细胞的新影响 | 研究样本量较小,仅涉及31名乳腺癌患者 | 探索不同乳腺癌亚型中TIL水平的变化及其对预后的影响 | HR+乳腺癌中的SPP1+巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 |
8137 | 2024-10-04 |
Integrated analysis to identify biological features and molecular markers of poorly cohesive gastric carcinoma (PCC)
2024-09-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73062-y
PMID:39349535
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序和批量数据,揭示了低黏附性胃癌(PCC)的生物学特征和分子标记 | 首次识别出IGFBP7作为深层PCC成分的标记物,并揭示了PCC在深层DGC中的特定免疫抑制特征 | 研究主要基于数据库中的数据,缺乏临床样本的验证 | 揭示低黏附性胃癌(PCC)的分子异质性和生物学特征 | 低黏附性胃癌(PCC)及其在弥漫性胃癌(DGC)中的分布和特征 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自肿瘤免疫单细胞中心、公共基因表达综合数据库和癌症基因组图谱数据库的数据 |
8138 | 2024-10-04 |
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-Sep-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06932-w
PMID:39349819
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏在沙门氏菌感染下的保护作用及其机制 | 首次探讨了低蛋白饮食通过调节mTOR/自噬轴在巨噬细胞中对肝脏的保护作用 | 研究仅限于小鼠模型和人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞,未涉及其他物种或细胞类型 | 探讨低蛋白饮食对肝脏在细菌感染下的免疫反应的影响 | 小鼠肝脏和巨噬细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 |
8139 | 2024-10-04 |
Exploring the interaction between immune cells in the prostate cancer microenvironment combining weighted correlation gene network analysis and single-cell sequencing: An integrated bioinformatics analysis
2024-Sep-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01399-x
PMID:39349877
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研究论文 | 本文通过结合加权相关基因网络分析和单细胞测序技术,研究了前列腺癌微环境中免疫细胞之间的相互作用 | 本文创新性地结合了加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术,识别出九个与前列腺癌进展相关的失调免疫枢纽基因 | 本文主要基于TCGA数据库的高通量基因组数据进行分析,未涉及实验验证 | 研究前列腺癌微环境中免疫细胞之间的相互作用,以期为前列腺癌的精准治疗提供新思路 | 前列腺癌微环境中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因组数据 | 基于TCGA数据库的高通量基因组数据 |
8140 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of preimplantation embryonic development in guinea pigs
2024-Sep-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10815-z
PMID:39350018
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了豚鼠植入前胚胎发育过程中的转录组变化 | 首次系统构建了豚鼠植入前胚胎发育的细胞图谱,并揭示了细胞类型分化和关键基因激活的时间点 | NA | 探究豚鼠植入前胚胎发育的详细过程,并比较其与人类胚胎发育的异同 | 豚鼠植入前胚胎的细胞类型及其转录组特征 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从受精卵到植入前阶段的豚鼠胚胎细胞 |