单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 43167 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-09-03 |
The transcription factor NF-Y promotes myeloid cell survival and protects from inflammatory vascular disease
2026-Aug-27, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag113
PMID:42600095
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和小鼠髓系特异性NF-YA敲除模型，探讨NF-Y转录因子在髓系细胞生存及炎性血管疾病中的作用。 | 首次揭示NF-Y在髓系细胞中作为存活保障因子，在炎性应激下调节其凋亡和功能，进而影响动脉粥样硬化及内膜增厚的病理进程。 | 摘要中未提及明确的局限性，可能涉及模型和机制的深入验证未知。 | 阐明NF-Y在髓系细胞功能与存活中的转录调控作用及其在慢性炎性血管疾病中的影响。 | 小鼠髓系细胞（巨噬细胞、中性粒细胞）及动脉粥样硬化病变组织。 | 转录组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 782 | 2026-09-03 |
KSTITCH links cellular morphology and gene expression in spatial transcriptomics
2026-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.07.730714
PMID:42327255
|
研究论文 | 提出KSTITCH方法，结合Kendall形状流形上的切线主成分分析，揭示空间转录组学中细胞形态与基因表达之间的协变关系 | 首次在空间转录组学中应用基于Kendall形状流形的可解释形态表示，独立于细胞大小的轮廓形状特征，优于现有的基于深度学习和度量几何的方法 | 未提及明确的局限性 | 开发一种可解释的方法来关联细胞形态与基因表达，以理解组织中的形态-转录组关系 | 角质形成细胞、巨噬细胞、内皮细胞、成纤维细胞、黑色素瘤细胞 | 计算生物学、空间转录组学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学（原位测序） | 切线主成分分析（TPCA） | 图像和基因表达数据 | Xenium数据集和CosMx数据集，包括多个样本（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Xenium, NanoString CosMx | NA |
| 783 | 2026-09-03 |
Somatic mutations in human ontogenesis and their impact on health
2026-Aug-25, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103338
PMID:42641764
|
综述 | 本文综述了人类个体发育过程中体细胞突变的起源、其对健康的影响以及测量方法，并探讨了青春期作为潜在突变加速窗口的可能性。 | 提出了青春期作为体细胞突变加速窗口的新观点，并整合了进化理论（如可丢弃体细胞假说）来解释体细胞与生殖系突变率及寿命的关系。 | 指出当前数据集有限，无法明确证明青春期突变负荷显著增加；缺乏跨个体发育阶段的纵向研究，且致病性阈值尚未建立。 | 探讨体细胞突变在人类个体发育中的积累模式、机制及其对健康和疾病的影响，并识别未来研究方向。 | 人类不同组织中的体细胞突变，包括正常乳腺和前列腺上皮组织。 | 基因组学 | 癌症、神经发育障碍、神经退行性疾病 | 双链测序、单细胞测序 | NA | 基因组序列数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多种人类组织。 | NA | 双链测序、单细胞测序 | NA | NA |
| 784 | 2026-09-03 |
Preclinical evidence and multi-omics insights into the protective effects of epigallocatechin-3-gallate against high-fat diet-induced adverse health outcomes
2026-Aug-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158750
PMID:42679470
|
研究论文 | 本研究整合荟萃分析、机器学习、体内实验、蛋白质组学和公共单细胞RNA测序数据，系统评估了表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）对高脂饮食诱导不良健康结局的保护作用。 | 创新点在于首次将荟萃分析、机器学习、体内实验、蛋白质组学和单细胞测序数据相结合，系统评估EGCG的疗效，并揭示甘油磷脂代谢为肝脏和小肠中的共同保护通路。 | 主要限制在于依赖公共单细胞RNA测序数据进行细胞亚型分析，缺乏针对肝细胞亚型的直接实验验证。 | 系统评估EGCG对高脂饮食诱导的不良健康结局（如血脂异常、非酒精性脂肪肝病和2型糖尿病）的治疗潜力，并阐明其作用机制。 | 研究对象为高脂饮食喂养的C57BL/6小鼠，以及来自79项临床前研究的啮齿动物数据。 | 机器学习、蛋白质组学、单细胞转录组学 | 非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病、血脂异常 | 荟萃分析、机器学习、蛋白质组学、RT-qPCR、免疫荧光、单细胞RNA测序分析 | 机器学习模型（具体类型未提及） | 文本数据（荟萃分析）、蛋白质组数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 79项啮齿动物研究、C57BL/6小鼠（数量未提及）、公共NAFLD scRNA-seq数据 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 785 | 2026-09-03 |
Loss of ABCA4 from photoreceptor discs is associated with glial transcriptomic changes in retinal organoids
2026-Aug-22, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxag045
PMID:42581602
|
研究论文 | 本研究利用携带ABCA4基因外显子24提前终止密码子的人类诱导多能干细胞来源视网膜类器官，评估该突变对mRNA和蛋白水平的影响，并发现感光细胞盘丧失ABCA4蛋白与胶质细胞转录组变化相关 | 首次在人类视网膜类器官模型中证明ABCA4基因突变导致感光细胞外节盘缺乏ABCA4蛋白，并揭示在感光细胞变性前胶质细胞即出现早期应激相关转录组改变 | 未明确说明局限性 | 评估ABCA4基因外显子24提前终止密码子突变对mRNA和蛋白水平的影响，并探索其与Stargardt病发病机制的关联 | 人类诱导多能干细胞来源的视网膜类器官 | 数字病理学 | Stargardt病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 786 | 2026-09-03 |
Single-cell sequencing in pan-cancer research: Decoding heterogeneity, tumor microenvironment, and clinical translation
2026-Aug-19, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2026.152540
PMID:42679437
|
综述 | 本文系统综述了单细胞测序技术在泛癌研究中的进展及其在揭示肿瘤异质性、肿瘤微环境和临床转化中的变革性应用 | 强调单细胞测序在解析肿瘤内异质性和微环境方面的独特优势，并探讨其与空间技术及人工智能融合的未来方向 | 面临标准化和成本方面的挑战，且尚未全面解决 | 总结单细胞测序技术的进展及其在泛癌研究和临床转化中的变革性应用 | 单细胞测序技术在泛癌研究中的应用，涵盖肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 787 | 2026-09-03 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Across Populations With Perianal Fistulizing Crohn's Disease Shows Proinflammatory CD4+ Macrophage Involvement in Disease Progression
2026-Aug-12, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101862
PMID:42586205
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了肛周瘘管性克罗恩病中促炎性CD4+巨噬细胞在疾病进展中的作用，并比较了不同人群间的细胞和分子差异。 | 首次在肛周瘘管性克罗恩病中识别出CD4+CD68+巨噬细胞形成大型细胞聚集体，并改变固有层细胞网络，同时揭示了非洲裔美国人与欧洲裔美国人之间的显著通路差异。 | 未明确说明，但可能受限于样本量、地域差异及组织活检的异质性。 | 定义伴有和不伴有肛周瘘管的直肠克罗恩病在细胞和分子水平上的区别，以深入了解疾病严重程度或进展。 | 直肠黏膜活检样本，包括50名个体的单细胞测序数据、空间转录组数据，以及患者来源的直肠类器官。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 50名个体（262,000个细胞），包括18例瘘管性CD、25例非瘘管性CD、7例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 788 | 2026-09-03 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Conserved Crosstalk and Core Shared Differentially Expressed Genes in Clear Cell Renal Cell Carcinoma and Obesity
2026-Aug-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析透明细胞肾细胞癌与肥胖组织中的细胞组成和转录模式，鉴定共享的核心差异表达基因及其功能，并预测可再利用药物。 | 首次利用单细胞RNA测序揭示透明细胞肾细胞癌与肥胖之间保守的细胞和分子串扰，识别出19个核心跨疾病差异表达基因及潜在的药物再利用策略。 | 摘要未提及具体局限性。 | 阐明肥胖与透明细胞肾细胞癌之间的保守病理机制，识别共同的核心差异表达基因及潜在治疗靶点。 | 透明细胞肾细胞癌组织、正常肾组织、肥胖及消瘦脂肪组织。 | 单细胞转录组学 | 透明细胞肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA-seq数据验证、蛋白质-蛋白质相互作用网络、药物-基因相互作用分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 789 | 2026-09-03 |
EZH2 Inhibition Remodels Cell States and Enhances EGFRi Sensitization in Bladder Cancer
2026-Aug, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2026.05.009
PMID:42209314
|
研究论文 | 本研究通过整合原发肿瘤的单核RNA测序和匹配的患者来源类器官的单细胞RNA测序，探讨了EZH2抑制在膀胱癌中重塑细胞状态并增强EGFR靶向治疗敏感性的作用 | 首次在膀胱癌中通过整合snRNA-seq和PDO的scRNA-seq，结合EZH2抑制与EGFR抑制剂序贯治疗，揭示了EZH2作为细胞状态可塑性调节因子并增强EGFRi敏感性的新机制 | 小队列、离体设计和使用细胞系进行EZH2 ChIP-seq | 探究EZH2抑制是否重塑膀胱癌肿瘤细胞状态并创造治疗脆弱性 | 四个跨越Ta-T3分期的膀胱癌患者的原发肿瘤和匹配的患者来源类器官 | 数字病理学 | 膀胱癌 | snRNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, 基因集富集分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 四个膀胱癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, ChIP-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单核RNA测序 |
| 790 | 2026-09-03 |
Foxe1 deficiency impairs thyroid fate while supporting lung differentiation
2026-08, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00841-1
PMID:42324400
|
研究论文 | 本研究通过小鼠干细胞系、单细胞RNA测序及染色质分析，发现Foxe1基因敲除会破坏甲状腺分化而促进肺上皮分化，揭示了Foxe1在调节Nkx2-1+前肠祖细胞命运决定中的关键作用 | 首次证明Foxe1缺失不仅破坏甲状腺命运承诺，还创造了一个允许Nkx2-1+祖细胞转分化为肺谱系的许可状态，且无需额外的染色质重塑 | 研究主要基于体外模型，体内验证有限 | 阐明Foxe1在甲状腺和肺谱系分化中的基因调控网络及其在谱系决定中的作用 | 小鼠干细胞系、Nkx2-1+前肠祖细胞、甲状腺滤泡样细胞、肺上皮细胞及肺类器官 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、染色质可及性分析 | 基因敲除小鼠干细胞模型 | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 791 | 2026-09-03 |
Single-cell analysis of the progeria arterial wall reveals progerin-induced progressive, cell type-specific dysfunction and somatic mutation accumulation
2026-Jul-31, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01719-6
PMID:42538566
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早衰症小鼠主动脉弓细胞，揭示progerin诱导的细胞类型特异性功能障碍和体细胞突变积累。 | 首次在单细胞水平揭示HGPS中血管平滑肌细胞特有的体细胞突变积累及细胞类型特异性分子动态变化。 | 未提及明确局限性。 | 阐明HGPS中渐进性血管变性的分子机制，并构建可搜索的scRNA-seq数据库。 | LmnaG609G/G609G小鼠主动脉弓细胞（包括血管平滑肌细胞和成纤维细胞）。 | 单细胞转录组学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序（Smart-seq2）、组织学、免疫染色、原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据、形态学图像 | 多年龄段的LmnaG609G/G609G小鼠主动脉弓细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | NA |
| 792 | 2026-09-03 |
Unify learns cellular evolution with universal multimodal embeddings
2026-07-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76230-y
PMID:42669747
|
研究论文 | 提出了一种名为Unify的迁移学习方法，通过整合RNA表达与蛋白质语言模型嵌入，学习通用多模态大基因，实现跨物种单细胞数据整合与细胞进化分析 | 创新性地结合蛋白质语言模型和通用语言模型嵌入，定义功能连贯的多模态大基因，超越了严格的基因同源性依赖，能够跨越巨大进化距离进行跨物种比较 | 摘要未明确提及局限性 | 开发一种能够跨物种整合单细胞RNA测序数据并重建细胞类型进化树的方法 | 跨物种的单细胞RNA测序数据，包括进化距离超过7亿年的物种 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据和蛋白质嵌入 | 涉及多个物种，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2026-09-03 |
LyP vs advanced-stage CTCLs: single-cell profiling reveals markers of self-limited vs aggressive disease behavior
2026-07-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017533
PMID:42085604
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析自限性淋巴瘤样丘疹病（LyP）与晚期皮肤T细胞淋巴瘤（aCTCL）的转录组差异，揭示与疾病自限行为相关的标志物。 | 首次通过单细胞测序比较LyP与多种致命性aCTCL亚型，发现LyP恶性克隆呈现高活化细胞毒性表型及独特的SPP1+巨噬细胞微环境，为理解CTCL谱系中自限与侵袭性行为提供新视角。 | 样本量有限，且研究基于转录组数据，缺乏功能验证实验；未涵盖所有CTCL亚型，结论的普适性需进一步验证。 | 探究LyP自限性消退与aCTCL侵袭性进展的分子机制，寻找潜在生物标志物和治疗靶点。 | 来自LyP（CD4+、CD8+、TCR-γδ+克隆表型）和aCTCL（CD4+蕈样肉芽肿、CD8+原发皮肤侵袭性嗜表皮性CD8+细胞毒性T细胞淋巴瘤、TCR-γδ+蕈样肉芽肿）患者的组织样本。 | 单细胞转录组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖LyP和aCTCL患者样本，具体数量未在摘要中说明。 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 794 | 2026-09-03 |
Postnatal Iron Supplementation Fails to Fully Rescue Brain Metal and Transcriptional Defects Caused by Nutrition-Based Gestational Iron Deficiency
2026-Jul-18, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2026.101730
PMID:42471123
|
研究论文 | 本研究探讨了产后铁补充对妊娠期铁缺乏引起的大脑金属稳态和转录缺陷的修复效果，发现补充不能完全逆转这些缺陷。 | 首次系统评估了产后不同时间点铁补充对妊娠期铁缺乏小鼠大脑金属稳态和长期基因表达的影响，并结合空间转录组学分析。 | 研究主要基于小鼠模型，且样本量有限，可能不完全反映人类情况；未涉及其他营养因素或长期行为学评估。 | 确定产后铁补充的时机如何影响妊娠期铁缺乏后的大脑金属稳态和长期基因表达。 | 妊娠期铁缺乏小鼠模型，包括三个组：营养铁正常对照组、出生时补铁组和出生后第7天补铁组，分析大脑皮层和海马组织。 | 神经科学 | 铁缺乏相关神经系统疾病 | 电感耦合等离子体质谱、空间转录组学 | 线性模型、细胞类型反卷积、基因集富集分析 | 金属浓度数据、转录组数据 | 每组7至19只小鼠，来自至少3窝；空间转录组学每组3只雄性小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 795 | 2026-09-03 |
Macrophage signaling associates with fibrogenic program activation in periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2026-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199226
PMID:42024458
|
研究论文 | 本研究采用多组学方法整合空间转录组学、RNA-Seq和蛋白质组学，表征小儿原发性硬化性胆管炎的纤维化胆管周围区域及其细胞间通讯，发现巨噬细胞亚群与肝星状细胞活化相关 | 首次在小儿原发性硬化性胆管炎中应用多组学整合方法，结合空间转录组学、RNA-Seq和蛋白质组学，揭示巨噬细胞与肝星状细胞之间的潜在相互作用，并识别出17个巨噬细胞纤维化驱动基因和6个肝星状细胞效应基因 | 样本量有限，需要进一步功能验证以确证巨噬细胞亚群对肝星状细胞纤维化激活的因果关系 | 阐明小儿原发性硬化性胆管炎中胆管周围纤维化的细胞间通讯机制 | 小儿原发性硬化性胆管炎的肝脏组织样本，包括巨噬细胞亚群、胆管细胞、淋巴细胞和肝星状细胞 | 空间转录组学、多组学整合 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、RNA-Seq、蛋白质组学、免疫荧光、二次谐波成像 | NA | 空间转录组数据、RNA测序数据、蛋白质组数据、图像数据 | 涉及PSC患者和健康对照的肝脏组织和血浆样本，具体数量未在摘要中提供 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 796 | 2026-09-03 |
Deciphering MFAP5+ Fibroblasts in Pancreatic Cancer Progression via Multi-Regional Single-Cell RNA Sequencing With Experimental Validation
2026-07, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70114
PMID:41995689
|
研究论文 | 通过多区域单细胞RNA测序和实验验证，揭示MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌进展中的作用机制 | 首次利用多区域单细胞RNA测序技术系统解析胰腺癌中MFAP5+成纤维细胞的生物学特性，并结合多色免疫荧光验证其与内皮细胞的促肿瘤相互作用 | 研究主要基于体外和组学数据，缺乏体内功能实验验证；样本量有限，需进一步扩大验证 | 阐明MFAP5+成纤维细胞在胰腺导管腺癌微环境中的功能、空间分布及细胞间通讯机制 | 胰腺导管腺癌组织中的MFAP5+成纤维细胞、FABP4+内皮细胞及VWF+内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、伪时间分析、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 59,829个细胞，整合自有数据集（GSE285264）和公共数据集（GSE277782, GSE155698, GSE212966） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2026-09-03 |
Mining single-cell transcriptomic data reveals distinct T-cell population in pediatric B-ALL and AML at diagnosis
2026-06-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025019565
PMID:41979357
|
研究论文 | 利用单细胞转录组数据，比较了儿童B-ALL和AML诊断时T细胞亚群的差异，并发现了一类富集于B-ALL的稀有T细胞亚群 | 首次综合分析了儿童B-ALL和AML的T细胞单细胞转录组，揭示了疾病特异性T细胞亚群，并识别出一种表达血红蛋白基因的稀有T细胞亚群，其与更好的预后相关 | 依赖现有数据集的整合，可能引入批次效应；样本来源多为诊断时的骨髓，未涵盖治疗过程中或外周血等其他组织的T细胞 | 刻画儿童B-ALL和AML中T细胞的转录和功能异质性，以指导基于T细胞的免疫治疗策略 | 儿童B-ALL和AML患者以及健康供体来源的T细胞 | 单细胞转录组学 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）和急性髓系白血病（AML） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 89例B-ALL患者、26例AML患者和9例健康供体的骨髓样本，共分析47,610个T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 798 | 2026-09-03 |
Development and validation of a four-gene prognostic signature derived from disulfidptosis- and cuproptosis-related genes in oral squamous cell carcinoma
2026-Jun-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05478-z
PMID:42321590
|
研究论文 | 开发并验证了来自二硫下垂体和铜下垂体相关基因的四基因预后特征，用于口腔鳞状细胞癌患者的风险分层。 | 首次在口腔鳞状细胞癌中整合二硫下垂体和铜下垂体相关基因构建四基因预后特征，并结合单细胞RNA-seq揭示恶性细胞和成纤维细胞之间的肿瘤-间质相互作用。 | 未明确说明，可能包括样本量有限、回顾性研究设计以及需要前瞻性验证。 | 开发并验证一个由二硫下垂体和铜下垂体相关基因衍生的预后特征，以改善OSCC患者的风险分层和预后预测。 | 口腔鳞状细胞癌患者，包括TCGA训练集和GEO验证集的肿瘤样本，以及OSCC细胞系（CAL-27和SCC-9）。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, ELISA | LASSO-Cox模型 | 基因表达数据（多种）、单细胞表达数据、临床数据、细胞系数据 | TCGA训练队列268例，GEO验证队列GSE41613 97例、GSE65858 270例、GSE42743 55例，完整案例子队列212例，单细胞RNA-seq数据5902个细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 使用GEO和TCGA公共数据进行bulk RNA-seq分析；使用GSE103322单细胞数据进行单细胞RNA-seq分析 |
| 799 | 2026-09-03 |
A systematic scoping review of the molecular pathogenesis of digestive system cancers (2013-2025)
2026-Jun-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05374-6
PMID:42319629
|
综述 | 本系统综述综合分析了2013年至2025年间发表的57项研究，总结了消化系统癌症的分子发病机制，包括遗传、表观遗传和转录组改变，并指出了不同癌症类型研究的不均衡性 | 该综述首次对多种消化系统癌症的分子发病机制进行了系统综合，整合了遗传、表观遗传和转录组层面的发现，并特别关注了生殖系变异和新兴的单细胞及空间转录组学应用 | 研究覆盖的癌症类型间证据不均衡，对生殖系变异的探索仅限于结直肠癌、胰腺癌和部分肝癌 | 系统总结消化系统癌症的分子发病机制，提供一个跨癌症类型的综合概述 | 消化系统癌症，包括结直肠癌、胃癌、食管癌、胰腺癌、胆囊癌和壶腹癌等 | 分子生物学、基因组学 | 消化系统癌症 | NGS | NA | 文本、基因组数据 | 57项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 800 | 2026-09-03 |
TYRP1 defines a proliferative melanoma cell subpopulation, driving malignant progression and therapy resistance via the GPNMB-Notch1-SOX10/MITF axis
2026-06-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08436-z
PMID:42310652
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了TYRP1阳性黑色素瘤细胞亚群通过GPNMB-Notch1-SOX10/MITF轴驱动肿瘤增殖和治疗抵抗的机制 | 首次将TYRP1定义为黑色素瘤高增殖亚群的标志物，并阐明其通过GPNMB-Notch1-SOX10/MITF正反馈环促进肿瘤进展的机制，同时发现该亚群对免疫检查点抑制剂和dabrafenib的不同敏感性 | 未明确提及局限性 | 表征TYRP1阳性黑色素瘤细胞亚群并阐明其在肿瘤增殖、信号调控和治疗反应中的作用 | 原发性和转移性黑色素瘤样本、患者来源类器官、TYRP1过表达黑色素瘤细胞系(A375, SK-MEL-28)及异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因表达谱分析、siRNA敲除、重组蛋白处理、通路抑制实验 | NA | 基因表达数据、图像（如类器官和小鼠成像数据） | 原发性和转移性黑色素瘤单细胞RNA测序数据；患者来源类器官；TYRP1过表达细胞系（A375, SK-MEL-28）；异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |