单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-05-16	Activated Schwann cells promote tumor growth in colon cancer 2025-May-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217791 PMID:40349909	research paper	该研究揭示了激活的雪旺细胞在结肠癌中的关键作用及其通过c-Jun依赖的机制促进肿瘤生长	首次发现肿瘤相关非髓鞘雪旺细胞在结肠癌中的增加及其与临床不良预后的关联，揭示了c-Jun在雪旺细胞激活和肿瘤促进中的核心作用	未明确雪旺细胞激活的具体上游信号通路，且体内实验模型可能需要进一步验证	探究雪旺细胞在结肠癌进展中的作用机制	结肠癌组织中的雪旺细胞	肿瘤微环境研究	结肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、共培养实验、基因敲除	NA	基因表达数据、临床数据	结肠癌组织样本与正常组织样本的比较
62	2025-05-16	Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients 2025-May-09, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688 PMID:40350141	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，探讨了癫痫患者中颞叶回的空间稳态破坏的细胞和分子机制	结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了癫痫患者中颞叶回的细胞和空间转录组变化，并鉴定了与空间稳态破坏相关的关键基因	样本量较小，且仅针对中颞叶回进行研究，未涵盖其他脑区	阐明癫痫患者中颞叶回的细胞和空间转录组变化及其与癫痫的关系	癫痫患者的中颞叶回组织	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）、空间转移张量（STT）算法	NA	单细胞RNA测序数据、空间转录组数据	癫痫患者和对照组的中颞叶回组织样本
63	2025-05-16	The analysis of X chromosome activity of porcine embryonic stem Cells: Study based on parthenogenetic embryonic stem cells with LCDM medium 2025-May-09, Theriogenology IF:2.4Q1 DOI:10.1016/j.theriogenology.2025.117479 PMID:40367543	研究论文	本研究旨在通过LCDM培养基从猪囊胚期胚胎中建立猪胚胎干细胞系，并从X染色体活性的角度分析其特征	首次在猪孤雌生殖胚胎干细胞中观察到X染色体侵蚀样状态，并发现X染色体活性与干细胞多能性状态密切相关	猪原始态胚胎干细胞系尚未成功建立，且缺乏标准化的表征和评估标准	建立猪胚胎干细胞系并研究X染色体活性与干细胞多能性的关系	猪孤雌生殖胚胎干细胞(ppLCDM)	干细胞生物学	NA	XIST RNA-FISH、免疫荧光染色、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	分子标记数据、表观遗传特征数据	NA
64	2025-05-16	IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.190655 PMID:40131369	research paper	该研究探讨了IFN-γ联合供体白细胞输注(DLI)在异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤中的安全性和初步疗效	首次在临床试验中评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的效果，并使用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析IFN-γ对恶性髓系原始细胞的体内作用	样本量较小(n=7)，需要更大规模的研究来验证疗效	评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效	异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者	血液肿瘤学	急性髓系白血病, 骨髓增生异常综合征	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	临床数据, 单细胞RNA测序数据	7名患者
65	2025-05-16	Genomic evolution reshapes cell-type diversification in the amniote brain 2025-May-08, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.014 PMID:40367951	research paper	该研究通过单细胞分辨率空间转录组学技术，构建了乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴端脑及小脑的全面单细胞图谱，揭示了羊膜动物大脑细胞类型在进化中的保守性和多样性	首次在跨物种水平上系统比较了羊膜动物大脑细胞类型的进化特征，发现了鸟类与哺乳类在兴奋性神经元和小脑细胞类型上的显著差异，并鉴定出鸟类特有的浦肯野细胞亚型	研究仅涵盖部分代表性物种，可能无法完全反映所有羊膜动物的进化特征	探索羊膜动物大脑复杂性和认知功能进化的遗传机制	乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的端脑及小脑细胞	基因组学	NA	单细胞分辨率空间转录组学	NA	单细胞基因表达数据	超过130万个细胞
66	2025-05-16	Subtypes of tumor-associated neutrophils and their roles in cancer immunotherapy 2025-May-05, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104763 PMID:40334802	review	本文综述了肿瘤相关中性粒细胞（TANs）在癌症免疫治疗中的亚型及其作用	总结了单细胞测序揭示的TAN亚型多样性，并探讨了促肿瘤和抗肿瘤亚群的区别与共性	缺乏全面的TAN分类系统	探讨TAN亚群在癌症免疫治疗中的变化及其作用	肿瘤相关中性粒细胞（TANs）	肿瘤免疫学	癌症	单细胞测序	NA	NA	NA
67	2025-05-16	snPATHO-seq: A Detailed Protocol for Single Nucleus RNA Sequencing From FFPE 2025-May-05, Bio-protocol IF:1.0Q3 DOI:10.21769/BioProtoc.5291 PMID:40364991	research paper	介绍了一种名为snPATHO-seq的稳健且适应性强的单核RNA测序方法，用于从FFPE组织中生成高质量的转录组数据	snPATHO-seq通过优化的核分离和10× Genomics Flex检测，有效减少了组织碎片并保持了RNA完整性，优于现有的FFPE工作流程	未明确提及方法的局限性	开发一种能够从FFPE组织中生成高质量单核转录组数据的方法，以推动单细胞组学在转化和临床研究中的应用	FFPE组织样本，包括乳腺癌等疾病组织	单细胞组学	乳腺癌	单核RNA测序（snRNA-seq），10× Genomics Flex检测	NA	转录组数据	多样化的FFPE样本，包括疾病组织
68	2025-05-16	A Cold-Active Protease Tissue Dissociation Protocol for the Preservation of the Tendon Fibroblast Transcriptome 2025-May-05, Bio-protocol IF:1.0Q3 DOI:10.21769/BioProtoc.5293 PMID:40364987	research paper	该研究提出了一种使用冷活性蛋白酶在4°C下解离组织的方案，以保护肌腱成纤维细胞的转录组	使用冷活性蛋白酶在低温下解离组织，减少细胞应激并更好地保留细胞类型特异性转录	研究主要针对斑马鱼的肌腱和韧带，未在其他组织或物种中验证	开发一种能减少转录伪影并提高RNA测序数据质量的组织解离方法	斑马鱼的肌腱和韧带组织	digital pathology	NA	bulk RNA sequencing	NA	RNA-seq数据	斑马鱼肌腱和韧带组织样本
69	2025-05-16	Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of cervical cancer 2025-May-02, Journal of molecular cell biology IF:5.3Q2 DOI:10.1093/jmcb/mjae046 PMID:39402008	综述	本文综述了人乳头瘤病毒（HPV）在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用，重点介绍了筛查和疾病干预的最新进展	整合HPV检测与现有方法（如宫颈细胞学和视觉检查）以提高筛查的敏感性和特异性，以及利用HPV感染相关生物标志物进行个性化干预	未提及具体研究样本量或实验设计的局限性	探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的作用及最新进展	宫颈癌（CC）及HPV感染	医学研究	宫颈癌	单细胞RNA测序分析、类器官模型开发	NA	NA	NA
70	2025-05-16	Intercellular communication after myocardial infarction: Macrophage as the centerpiece 2025-May-02, Ageing research reviews IF:12.5Q1 DOI:10.1016/j.arr.2025.102757 PMID:40320153	review	本文综述了心肌梗死后巨噬细胞亚群的动态变化及其在细胞间通讯中的核心作用，探讨了针对巨噬细胞的靶向治疗策略	揭示了巨噬细胞亚群在心肌梗死后不同时期的动态变化及其功能特性，特别关注了乳酸化修饰在巨噬细胞亚群转化和细胞间通讯中的调控潜力	NA	探讨心肌梗死后巨噬细胞亚群的动态变化及其在细胞间通讯中的核心作用，为心肌梗死的临床治疗提供新思路	心肌梗死后巨噬细胞亚群及其与心肌细胞、中性粒细胞、成纤维细胞、内皮细胞等其他心脏细胞的相互作用	心血管疾病	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达谱	NA
71	2025-05-16	CALB1 and RPL23 Are Essential for Maintaining Oocyte Quality and Function During Aging 2025-May, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14466 PMID:39748132	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序和蛋白质组分析，揭示了衰老卵母细胞中钙离子稳态失调的关键机制，并确定了Calb1和Rpl23两个基因在卵母细胞衰老过程中的重要作用	首次在单细胞分辨率下揭示了衰老卵母细胞中钙离子稳态失调的机制，并确定了Calb1和Rpl23两个关键基因的功能	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类卵母细胞中验证	探究卵母细胞衰老的分子机制	年轻和老年雌性小鼠的卵母细胞	生殖生物学	生殖健康问题	单细胞转录组测序	小鼠模型	转录组数据	年轻和老年雌性小鼠的卵母细胞
72	2025-05-16	Revealing VCAN as a Potential Common Diagnostic Biomarker of Renal Tubules and Glomerulus in Diabetic Kidney Disease Based on Machine Learning, Single-Cell Transcriptome Analysis and Mendelian Randomization 2025-May, Diabetes & metabolism journal IF:6.8Q1 DOI:10.4093/dmj.2024.0233 PMID:39849979	research paper	该研究通过机器学习、单细胞转录组和孟德尔随机化方法，揭示了VCAN作为糖尿病肾病肾小管和肾小球共同诊断生物标志物的潜力	首次将VCAN识别为糖尿病肾病肾小球和肾小管病变的共同诊断标志物，并通过多种方法验证其诊断价值	未提及样本量大小，且仅针对糖尿病肾病进行研究	寻找糖尿病肾病肾小球和肾小管病变的共同诊断生物标志物	糖尿病肾病患者的肾小球和肾小管组织	machine learning	diabetic kidney disease	单细胞转录组分析、孟德尔随机化	NA	基因表达数据	NA
73	2025-05-16	High-Viability Circulating Tumor Cells Sorting From Whole Blood at Single Cell Level Using Laser-Induced Forward Transfer-Assisted Microfiltration 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414195 PMID:39868845	research paper	该研究开发了一种激光诱导前向转移辅助微滤系统（LIFT-AMFS），用于从全血中高效分离和回收高活性的循环肿瘤细胞（CTCs）	采用激光诱导前向转移技术结合双步微滤器设计，实现了高捕获效率和单细胞高存活率	未提及系统在大规模临床应用中的可行性和成本效益	开发高效分离和分子分析循环肿瘤细胞的技术，以促进肿瘤转移研究和个性化治疗	循环肿瘤细胞（CTCs）	生物医学工程	肿瘤	激光诱导前向转移（LIFT）、微滤技术、RNA测序	NA	细胞样本、RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但处理通量高达15.0 mL/min
74	2025-05-16	Dissecting the Spatial and Single-Cell Transcriptomic Architecture of Cancer Stem Cell Niche Driving Tumor Progression in Gastric Cancer 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413019 PMID:39950944	研究论文	本研究通过空间和单细胞RNA测序技术，揭示了胃癌中癌症干细胞（CSC）微环境在驱动肿瘤干性和进展中的作用	首次详细描绘了胃癌CSC微环境的转录组特征，并发现iCAFs分泌的AREG通过上调SOX9表达促进肿瘤干性，以及通过AREG-ERBB2轴导致耐药的新机制	样本量相对较小（32例），且仅针对胃癌进行研究，结果在其他癌症类型中的普适性有待验证	解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录组特征及其在肿瘤进展中的作用机制	人类胃黏膜组织（不同恶性阶段的32例样本）	数字病理学	胃癌	空间RNA测序，单细胞RNA测序	NA	转录组数据	32例人类胃黏膜组织（涵盖不同恶性阶段）
75	2025-05-16	Transcriptional Heterogeneity and Differential Response of Rod Photoreceptor Pathway Uncovered by Single-Cell RNA Sequencing of the Aging Mouse Retina 2025-May, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70001 PMID:39954235	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究小鼠视网膜衰老过程中的转录异质性和视杆细胞通路的差异反应	揭示了视网膜衰老过程中不同细胞类型的转录失调动态，并发现了视杆细胞和双极细胞的转录异质性亚群	研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探究视网膜衰老的分子机制，寻找与衰老相关视力障碍的生物标志物	小鼠视网膜	生物医学	老年性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	3、12、18和24个月大的小鼠视网膜
76	2025-05-16	Spatiotemporal Transcriptomic Profiling Reveals the Dynamic Immunological Landscape of Alveolar Echinococcosis 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405914 PMID:39985260	research paper	该研究通过整合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组技术，揭示了多房棘球蚴感染过程中宿主免疫反应的时空动态机制	首次提供了多房棘球蚴感染病灶的高分辨率空间图谱，并阐明了中性粒细胞、Spp1巨噬细胞和成纤维细胞在疾病进展中的功能作用	研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探索多房棘球蚴感染过程中宿主免疫反应的时空动态机制	感染多房棘球蚴的小鼠肝脏样本	digital pathology	alveolar echinococcosis	bulk RNA-seq, scRNA-seq, spatial transcriptomics	NA	RNA-seq data	感染后多个时间点（最长15个月）的小鼠肝脏样本
77	2025-05-16	CTHRC1 expresses in cancer-associated fibroblasts and is associated with resistance to anti-androgen therapy in prostate cancer 2025-May, Genes & genomics IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s13258-025-01624-z PMID:40009323	research paper	本研究探讨了CTHRC1在前列腺癌中的表达及其对治疗抵抗的影响	首次揭示了CTHRC1在前列腺癌相关成纤维细胞中的表达及其与抗雄激素治疗抵抗的关联	研究主要基于公开数据库数据，缺乏实验验证	探索CTHRC1在前列腺癌中的表达及其对预后和治疗的影响	前列腺癌组织和正常前列腺组织	digital pathology	prostate cancer	RNA-seq, 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法	NA	RNA测序数据, 免疫组织化学数据	1999例前列腺癌病例和531例正常对照，以及来自7个前列腺原发肿瘤的62,995个细胞的单细胞RNA测序数据
78	2025-05-16	Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413253 PMID:40087815	研究论文	本文研究了PAD2通过瓜氨酸化NF-κB p65调控巨噬细胞极化在急性肺损伤中的作用，并开发了一种基于纳米颗粒的靶向治疗策略	发现NF-κB p65的新瓜氨酸化位点R171，并开发了结合PAD2抑制剂AFM41a和ICAM-1抗体的金纳米颗粒靶向治疗策略	研究主要针对PA诱导的急性肺损伤，其他类型的肺损伤是否适用尚不明确	探索PAD2介导的瓜氨酸化在巨噬细胞极化中的作用，并开发针对PA诱导急性肺损伤的治疗方法	巨噬细胞极化和PA诱导的急性肺损伤	生物医学	急性肺损伤	单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学	NA	RNA测序数据、蛋白质组数据	未明确提及具体样本数量
79	2025-05-16	PLXDC1+ Tumor-Associated Pancreatic Stellate Cells Promote Desmoplastic and Immunosuppressive Niche in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415756 PMID:40091495	研究论文	本研究通过RNA测序和ATAC-seq技术，结合单细胞和空间转录组学，揭示了胰腺星状细胞（PSCs）在胰腺导管腺癌（PDAC）中的异质性及其在肿瘤微环境中的作用	首次鉴定了三种常见PSCs和四种肿瘤相关PSCs，并揭示了PLXDC1+ TPSCs在形成促纤维化和免疫抑制微环境中的关键作用	研究主要基于转录组和表观遗传学分析，缺乏直接的机制验证实验	探究胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的功能和临床意义	胰腺星状细胞（PSCs）和胰腺导管腺癌（PDAC）微环境	肿瘤微环境研究	胰腺导管腺癌	RNA测序, ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学	NA	转录组数据, 表观遗传数据	来自正常和PDAC组织的胰腺星状细胞样本
80	2025-05-16	Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status 2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513 PMID:40203764	研究论文	比较单药pembrolizumab与pembrolizumab联合低剂量化疗在非小细胞肺癌（NSCLC）且体能状态较差患者中的疗效	首次在体能状态较差的NSCLC患者中比较了单药免疫治疗与免疫联合低剂量化疗的疗效，并探索了生物标志物对治疗反应的预测作用	样本量较小（43例患者），且生物标志物分析仅基于部分患者的可选血液样本	评估免疫治疗单独或联合低剂量化疗对体能状态较差的晚期NSCLC患者的疗效	晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者	肿瘤学	非小细胞肺癌	流式细胞术、单细胞测序	NA	临床数据、血液样本	43例患者（每组20例可评估疗效）