单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 7881 - 7900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7881 2025-11-11
CORTADO: Hill Climbing Optimization for Cell-Type Specific Marker Gene Discovery
2024-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于爬山优化算法的计算框架CORTADO,用于高效发现细胞类型特异性标记基因 CORTADO通过优化差异表达、基因表达谱独特性和稀疏性三个关键特性,克服了传统方法仅依赖p值排序的局限性 NA 开发高效发现细胞类型特异性标记基因的计算方法 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群和标记基因 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 爬山优化算法 基因表达数据 多个数据集(包括DLPFC 151507、Zeisel小鼠脑数据集和外周血单核细胞数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
7882 2025-11-10
Exploring the therapeutic role of thiabendazole in lung adenocarcinoma via network pharmacology and single-cell analysis
2025-Dec, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过网络药理学和单细胞分析探索噻苯达唑在肺腺癌中的治疗作用 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究抗寄生虫药物噻苯达唑在肺腺癌中的抗癌机制 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 探索噻苯达唑在肺腺癌治疗中的作用机制 肺腺癌相关基因和免疫细胞 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 网络药理学, 分子对接 LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 基因表达数据, 单细胞数据 多个GEO数据集(GSE136103, GSE10072, GSE19188, GSE19804, GSE30219, GSE40791) NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
7883 2025-11-10
3D-generation of high-purity midbrain dopaminergic progenitors and lineage-guided refinement of grafts supports Parkinson's disease cell therapy
2025-Nov-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 开发了一种三维分化方法SphereDiff,用于生成高纯度中脑多巴胺能祖细胞,并通过谱系引导优化提高帕金森病细胞治疗的安全性和有效性 开发了SphereDiff三维分化方法生成高纯度mDA祖细胞;利用单细胞空间转录组学揭示移植后细胞分布模式;采用交叉移植单细胞分裂条形码技术解析供体细胞克隆谱系命运 研究主要在PD模型小鼠中进行,尚未进行人体临床试验 提高帕金森病细胞治疗中中脑多巴胺能神经元的分化效率和移植后存活率 人类多能干细胞、中脑多巴胺能祖细胞、PD模型小鼠 再生医学 帕金森病 三维分化、单细胞空间转录组学、交叉移植单细胞分裂条形码 NA 转录组数据、空间分布数据 PD模型小鼠 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
7884 2025-11-10
Venetoclax plus gilteritinib is effective in preclinical models of FLT3-mutant BCL11B-a lineage-ambiguous leukemia
2025-Nov-06, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究评估维奈托克联合吉列替尼在BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型中的疗效 首次证明BCL-2抑制剂维奈托克与FLT3抑制剂吉列替尼联合治疗对BCL11B-a谱系不明白血病具有协同作用 研究仅限于临床前模型,尚未进行临床试验验证 探索BCL11B-a谱系不明白血病的靶向治疗策略 BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型 血液肿瘤学 白血病 单细胞RNA测序,BH3分析 临床前疾病模型 基因表达数据 多个临床前模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7885 2025-11-10
Mapping CMV-related immune signatures in blood, aorta and perivascular mediastinal adipose tissue
2025-Nov-06, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
研究论文 本研究通过分析心脏手术患者的血液、主动脉和血管周围纵隔脂肪组织,揭示了巨细胞病毒感染对免疫特征的系统性影响 首次在人类主动脉组织中揭示CMV感染导致HLA-C表达下降和干扰素-α信号通路抑制,同时发现表达CD57、GPR56和CX3CR1的CD8 T细胞在血液中增加 样本量较小(仅11名参与者),属于初步研究,需要更大规模研究验证 探究巨细胞病毒感染如何驱动系统性和组织特异性免疫变化,及其与心血管疾病的潜在关联 心脏手术患者的血液、主动脉组织和血管周围纵隔脂肪组织 免疫学 心血管疾病 流式细胞术、单细胞RNA测序、ELISA、MiloR分析、差异基因表达分析 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血清学数据 11名心脏手术患者(4名CMV阴性,7名CMV阳性) NA 单细胞RNA测序 NA NA
7886 2025-11-10
Molecular profiling of ex vivo prostate cancer CAF models captures stromal heterogeneity and drug vulnerabilities
2025-Nov-06, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 通过对前列腺癌相关成纤维细胞进行多组学分析,揭示其转录异质性并识别药物敏感性靶点 首次对初治前列腺癌患者来源的原代CAFs进行整合性单细胞多组学分析,发现SOX/FOX/STAT3转录因子网络调控促肿瘤CAF状态,并通过高通量药物筛选鉴定出靶向基质细胞的候选药物 仅纳入7例初治患者样本,样本量有限;研究局限于体外模型,未进行体内验证 探索前列腺癌相关成纤维细胞的表型异质性和药物敏感性 7例初治前列腺癌患者来源的原代癌症相关成纤维细胞 单细胞组学 前列腺癌 单细胞RNA测序,高通量药物敏感性检测 NA 单细胞转录组数据,药物筛选数据 7例初治前列腺癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7887 2025-11-10
Integration of Single-cell and bulk RNA sequencing data uncovers lymphatic metastasis-related prognostic genes and a predictive model in bladder cancer
2025-Nov-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了膀胱癌淋巴转移相关的预后基因并建立了预测模型 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别膀胱癌淋巴转移关键基因亚群,并构建了九基因预后模型 NA 识别膀胱癌关键预后基因和免疫微环境因子以提升临床评估能力 膀胱癌患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本 生物信息学 膀胱癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 风险预测模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7888 2025-11-10
Suppression of 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase promotes remyelination in multiple sclerosis
2025-Nov-06, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究揭示6-丙酮酰四氢蝶呤合酶(PTS)通过抑制少突胶质前体细胞增殖阻碍多发性硬化症髓鞘再生 首次发现PTS是少突胶质前体细胞增殖的负调控因子,并阐明其通过胆固醇生物合成途径影响髓鞘再生的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化价值需进一步验证 探究PTS在多发性硬化症髓鞘再生障碍中的作用机制 少突胶质前体细胞和多发性硬化症小鼠模型 神经科学 多发性硬化症 单细胞测序、条件性基因敲除、转录组分析 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 单细胞测序数据、组织染色图像、转录组数据 人类和小鼠少突胶质细胞谱系细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7889 2025-11-10
Research on the expression, prognostic value, and regulatory effects on immune microenvironment of NETO2 in oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-05, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨NETO2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 首次系统研究NETO2在OSCC中的表达特征,结合单细胞RNA测序分析其在免疫细胞中的表达模式,并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 研究主要基于公共数据库分析,实验验证部分有限,需要更多临床样本验证 阐明NETO2在口腔鳞状细胞癌中的生物学功能和临床意义 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 生物信息学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析, 分子对接, 细胞功能实验 列线图预测模型 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 TCGA和GEO队列数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7890 2025-11-10
MaskGraphene: an advanced framework for interpretable joint representation for multi-slice, multi-condition spatial transcriptomics
2025-Nov-05, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出MaskGraphene框架,通过图神经网络和自监督学习实现多切片空间转录组数据的可解释联合表征 结合掩码自监督学习、三元组损失和聚类级局部对齐,通过软链接和硬链接建立跨切片连接,生成具有高几何保真度的联合嵌入 NA 开发能够保持空间几何结构并校正批次效应的空间转录组数据整合方法 多切片、多条件的空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 图神经网络(GNN) 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
7891 2025-11-10
Ascorbic acid attenuates immunosenescence and cognitive decline via MYH9-Mediated CD8⁺ T cell differentiation
2025-Nov-05, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示抗坏血酸通过MYH9介导的CD8⁺ T细胞分化减轻免疫衰老并改善认知功能 首次发现抗坏血酸通过结合MYH9蛋白调节细胞骨架通路,特异性促进CD8⁺ T细胞分化,从而改善年龄相关的免疫衰老和认知衰退 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验验证;MYH9抑制实验使用blebbistatin可能存在脱靶效应 探究抗坏血酸在缓解免疫衰老和认知衰退中的作用机制 16月龄C57BL/6老年小鼠、造血干细胞、外周血单个核细胞、CD8⁺ T细胞 免疫学 老年性疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外分化实验 动物模型 基因表达数据、细胞计数数据、行为学数据 老年C57BL/6小鼠(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
7892 2025-11-10
Prognostic evaluation and experimental validation of cuproptosis-related hub genes identified through weighted gene co-expression network analysis in uveal melanoma
2025-Nov-05, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过加权基因共表达网络分析识别铜死亡相关基因,构建了能够准确预测葡萄膜黑色素瘤预后的CRG_score模型 首次在葡萄膜黑色素瘤中系统研究铜死亡相关基因,构建了具有高预测准确性的预后模型,并验证了铜死亡诱导剂对肿瘤细胞的抑制作用 研究样本量相对有限,需要更多临床样本验证模型的普适性 探索铜死亡相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后评估和治疗中的作用 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤细胞 生物信息学 葡萄膜黑色素瘤 加权基因共表达网络分析,转录组相关性分析,差异分析,LASSO Cox回归,单细胞RNA测序,细胞实验 CRG_score预后模型 转录组数据,单细胞RNA测序数据 221例葡萄膜黑色素瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7893 2025-11-10
Oral Multi-Enzymatic Manganese-Carbon Dots Alleviate Sepsis-Associated Lung Injury via the Gut-Lung Axis
2025-Nov-04, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究开发口服锰掺杂碳点通过调节肠道菌群稳态和靶向肠肺轴缓解脓毒症相关肺损伤 首次设计具有多酶模拟活性的锰掺杂碳点,通过肠肺轴机制调控巨噬细胞胞葬作用和抗炎极化 研究主要基于小鼠模型,人体应用效果尚需验证 探索通过肠肺轴干预脓毒症相关肺损伤的新策略 脓毒症相关肺损伤小鼠模型和巨噬细胞 生物医学工程 脓毒症相关肺损伤 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学,粪便微生物移植 NA 基因组数据,代谢组数据,转录组数据 小鼠模型 NA 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学 NA NA
7894 2025-11-10
Decoding melanoma's cellular mosaic to unlock immunotherapy potential
2025-Nov, Trends in cell biology IF:13.0Q1
综述 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示皮肤黑色素瘤的细胞异质性及其对免疫治疗耐药机制的理解 将单细胞多组学技术应用于解析黑色素瘤的细胞异质性,类比庞贝城马赛克解读来阐释癌症研究的突破性视角 NA 探讨单细胞多组学技术对黑色素瘤生物学特性及免疫治疗耐药机制的研究进展 皮肤黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境 数字病理学 黑色素瘤 单细胞测序, 空间多组学 NA 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
7895 2025-11-10
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架,用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 开发了基于异构图变换器的多组学整合方法,能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 NA 解析细胞分化过程中的基因调控机制 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 机器学习 NA scRNA-seq, scATAC-seq 图变换器, 注意力机制 单细胞多组学数据 三个独立数据集 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
7896 2025-11-10
A comprehensive molecular atlas of the mesenchymal cell types in the mouse liver
2025-Nov, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 通过深度单细胞RNA测序构建了成年小鼠肝脏主要细胞类型的全面分子图谱 首次系统揭示肝脏内皮细胞和间充质细胞的多样性,发现门静脉区具有混合动静脉表型,识别出纤维化疾病中扩张的先前未知的被膜肝星状细胞群 研究仅限于小鼠模型,人类肝脏的适用性需要进一步验证 解析肝脏细胞分子结构,为肝病治疗提供理论基础 成年小鼠肝脏细胞 单细胞组学 肝纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 成年小鼠肝脏细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7897 2025-11-10
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet 结合掩码自编码器和视觉变换器,通过树状图转换利用细胞标记基因信息,并在大量未标记数据上进行预训练 NA 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 掩码自编码器(MAE), 视觉变换器(ViT) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7898 2025-11-10
Circadian clock-gated cell renewal controls time-dependent changes in taste sensitivity
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠舌上皮细胞类型的昼夜节律变化,发现生物钟调控的细胞周期进程驱动味觉细胞群体的时间依赖性变化 首次发现味觉细胞群体存在昼夜节律性变化,并证明这种变化由生物钟调控的细胞周期进程驱动,且影响味觉敏感性的时间依赖性变化 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 探究生物钟如何通过调控细胞更新影响味觉敏感性的时间依赖性变化 小鼠舌上皮细胞,特别是II型味觉细胞和味蕾干细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序,味蕾类器官培养,基因敲低,味觉测试 NA 单细胞RNA测序数据,行为学数据 小鼠舌上皮细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7899 2025-11-10
Single-cell sequencing reveals the response mechanisms of vascular endothelial cells to glucocorticoids in diabetic retinopathy
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞测序技术揭示糖皮质激素在糖尿病视网膜病变中对血管内皮细胞的响应机制 首次在单细胞水平系统分析糖皮质激素活性在糖尿病视网膜病变血管内皮细胞中的变化特征 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 探究糖皮质激素在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用 糖尿病视网膜病变组织中的血管内皮细胞 生物信息学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 伪时间分析、转录因子分析、细胞通讯分析 单细胞RNA测序数据 GEO数据库数据集GSE178121 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7900 2025-11-10
Single-cell transcriptomics in metastatic breast cancer: mapping tumor evolution and therapeutic resistance
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述单细胞转录组学在转移性乳腺癌研究中的应用,重点阐述其在描绘肿瘤进化、揭示治疗抵抗机制方面的作用 采用单细胞转录组学技术高分辨率解析转移性乳腺癌的肿瘤异质性、细胞进化轨迹和治疗抵抗机制,整合空间转录组学和多组学平台提供肿瘤生态系统全景视图 存在技术挑战,临床应用的标准化和推广仍需进一步研究 探讨单细胞转录组学如何重塑对转移性乳腺癌生物学特性的理解并指导精准治疗 转移性乳腺癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和内皮细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞转录组测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 NA NA
回到顶部