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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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7781 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
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研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型,未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞,来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 |
7782 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较,揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种,且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异,以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 |
7783 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群,并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞(GCB)识别为B细胞特异性预后生物标志物,填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 |
7784 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway
2024-Oct-09, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae051
PMID:39167061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓中与血管化相关的细胞亚群,特别是PDGFRβ+ DPSCs,并探讨了其通过激活PI3K/AKT通路在牙髓再生中的作用 | 本研究首次定义了PDGFRβ+ DPSCs亚群,并揭示了其在牙髓再生中的重要作用和临床转化潜力 | 本研究主要集中在体外和基因编辑小鼠模型中,尚未进行临床试验验证 | 解决牙髓再生治疗中的挑战,特别是不同年龄和条件供体来源的DPSCs异质性问题 | 牙髓中的DPSCs及其亚群PDGFRβ+ DPSCs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基因编辑小鼠模型和体外培养的DPSCs |
7785 | 2024-10-13 |
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-Oct-09, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.08.010
PMID:39243760
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研究论文 | 研究新生儿调节性B细胞产生的抗体如何调节微生物群落 | 首次发现新生儿调节性B细胞通过IL-10负调节IgM的产生,影响早期微生物群落的多样性和合作 | NA | 探讨新生儿调节性B细胞在早期生命中对微生物群落的影响 | 新生儿调节性B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 205个单克隆抗体 |
7786 | 2024-10-13 |
Colorectal cancer-associated bacteria are broadly distributed in global microbiomes and drivers of precancerous change
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70702-1
PMID:39384807
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研究论文 | 研究分析了全球微生物组中与结直肠癌相关的细菌,并探讨了这些细菌在癌前病变中的作用 | 首次通过基因水平聚类方法识别出与结直肠癌或健康相关的细菌基因簇,并验证了这些细菌在癌前病变中的作用 | 研究主要基于已发表的宏基因组数据,缺乏对新样本的验证 | 确定全球人群中与结直肠癌和健康相关的肠道细菌的规模和成员 | 全球微生物组中的肠道细菌及其与结直肠癌的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 宏基因组测序 | NA | 基因数据 | 使用已发表的全球微生物组调查中的超深度宏基因组测序数据 |
7787 | 2024-10-13 |
Single-cell analysis reveals alternations between the aged and young mice prostates
2024-Oct-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00666-x
PMID:39385256
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了老年和年轻小鼠前列腺的细胞类型和基因表达变化 | 首次揭示了老年小鼠前列腺中细胞类型和基因表达的显著变化,包括间充质细胞和免疫细胞比例的增加,以及与细胞衰老、氧化应激和再生相关的基因和通路的改变 | 研究仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类 | 探讨老年和年轻小鼠前列腺的细胞和分子变化 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP算法 | 基因表达数据 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织样本 |
7788 | 2024-10-13 |
Exosomal miR-106a-5p from highly metastatic colorectal cancer cells drives liver metastasis by inducing macrophage M2 polarization in the tumor microenvironment
2024-Oct-09, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03204-7
PMID:39385295
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研究论文 | 研究了高度转移性结直肠癌细胞分泌的外泌体miR-106a-5p如何通过诱导肿瘤微环境中巨噬细胞M2极化来驱动肝转移 | 揭示了外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的新机制,并发现其作为潜在生物标志物的可能性 | NA | 探讨外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、外泌体miR-106a-5p | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、外泌体分离、免疫荧光、qRT-PCR、ELISA、流式细胞术 | NA | RNA | NA |
7789 | 2024-09-07 |
Bridging gaps: a neural network approach for cross-species scRNA-seq analysis in COVID-19
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105324
PMID:39236555
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7790 | 2024-10-13 |
High mortality of Acinetobacter baumannii infection is attributed to macrophage-mediated induction of cytokine storm but preventable by naproxen
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105340
PMID:39303669
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研究论文 | 研究探讨了多药耐药鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制,并发现萘普生可预防由巨噬细胞介导的细胞因子风暴 | 揭示了鲍曼不动杆菌感染中巨噬细胞介导的细胞因子风暴机制,并发现萘普生可有效抑制炎症反应和M1极化,从而保护宿主免受致命感染 | NA | 解析鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制,并探索控制耐药感染的新策略 | 鲍曼不动杆菌感染的免疫反应和细胞因子风暴机制 | 免疫学 | 感染性疾病 | 流式细胞术、RNA测序、qRT-PCR、ELISA和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
7791 | 2024-10-13 |
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105312
PMID:39317638
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研究论文 | 本文利用神经网络辅助的方法,分析了COVID-19仓鼠和人类单细胞转录组数据,揭示了不同疾病严重程度下的跨物种相似性 | 首次使用变分自编码器神经网络量化跨物种和疾病严重程度的转录组相似性,并识别出与疾病相关的关键基因和信号通路 | 仅限于分析仓鼠和人类的数据,未涉及其他动物模型 | 研究COVID-19在仓鼠和人类中的疾病机制,并开发跨物种的精确治疗策略 | COVID-19仓鼠和人类的单细胞转录组数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞转录组测序(scRNAseq) | 变分自编码器(VAE) | 转录组数据 | 来自人类和仓鼠的血液白细胞样本 |
7792 | 2024-10-13 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
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研究论文 | 研究整合了单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据,分析了唐氏综合征胎儿血液中的造血异常 | 首次建立了唐氏综合征胎儿血液的单细胞多组学图谱,揭示了基因表达差异依赖于细胞类型和环境,并发现了造血干细胞在唐氏综合征中的分化倾向 | 研究样本量较小,仅包括3个二体和15个三体胎儿,可能影响结果的普适性 | 理解唐氏综合征中造血异常的分子机制 | 唐氏综合征胎儿的肝脏和骨髓样本 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 3个二体和15个三体胎儿的肝脏和骨髓样本,共110万个细胞 |
7793 | 2024-10-13 |
Revealing a cancer-associated fibroblast-based risk signature for pancreatic adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA-seq analysis
2024-Sep-26, Aging
DOI:10.18632/aging.206043
PMID:39332020
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序分析揭示胰腺腺癌中基于癌症相关成纤维细胞的风险特征 | 首次探索了癌症相关成纤维细胞(CAF)在胰腺腺癌(PAAD)中的预后意义,并构建了一个基于CAF的七基因风险特征 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在数据偏差和样本量不足的问题 | 探索胰腺腺癌中癌症相关成纤维细胞的预后意义,并构建预测模型 | 胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | LASSO回归和诺模图模型 | RNA测序数据和微阵列数据 | TCGA-PAAD队列中的正常和肿瘤样本,以及GSE155698数据集中的单细胞RNA测序数据 |
7794 | 2024-10-13 |
BootCellNet, a resampling-based procedure, promotes unsupervised identification of cell populations via robust inference of gene regulatory networks
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012480
PMID:39348410
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BootCellNet的新方法,通过平滑和重采样技术推断基因调控网络(GRN),并进一步推断最小支配集(MDS),以促进单细胞RNA测序数据的无监督细胞群识别 | BootCellNet通过平滑和重采样技术推断GRN和MDS,提供了一种无监督且可解释的细胞类型识别方法 | NA | 开发一种新的数据分析方法,用于细胞类型识别和基因调控网络推断 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 外周血单核细胞和造血干细胞的scRNA-seq数据,以及COVID-19患者的细胞数据 |
7795 | 2024-10-13 |
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of ischemia/reperfusion injury after lung transplant
2024-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179876
PMID:39172530
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研究论文 | 研究了Mer酪氨酸激酶受体在单核细胞来源的髓系抑制细胞(M-MDSCs)介导的吞噬作用中对肺移植后缺血再灌注损伤(IRI)的缓解作用 | 首次探讨了MerTK在M-MDSCs介导的吞噬作用中对肺移植后IRI的缓解作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的单细胞RNA测序,缺乏大规模临床试验验证 | 探讨MerTK在M-MDSCs介导的吞噬作用中对肺移植后IRI的缓解作用 | 肺移植后缺血再灌注损伤(IRI)和慢性肺移植物功能障碍(CLAD) | NA | 肺移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括肺移植患者和小鼠模型的样本 |
7796 | 2024-10-13 |
Bank1 modulates the differentiation and molecular profile of key B cell populations in autoimmunity
2024-Aug-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179417
PMID:39163122
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研究论文 | 本研究探讨了B细胞适配蛋白BANK1在年龄相关B细胞(ABCs)出现中的作用,特别是在两种系统性红斑狼疮(SLE)小鼠模型中的作用 | 首次揭示了BANK1在ABCs发育中的关键作用,以及其对早期B细胞向ABCs分化的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 定义B细胞适配蛋白BANK1在年龄相关B细胞(ABCs)出现中的作用 | B细胞适配蛋白BANK1在年龄相关B细胞(ABCs)中的作用 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 2种SLE小鼠模型(TLR7.tg6和咪喹莫特诱导的小鼠)与Bank1-/-小鼠杂交 |
7797 | 2024-10-13 |
A single-cell and spatially resolved atlas of human osteosarcomas
2024-Aug-20, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01598-7
PMID:39164791
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研究论文 | 本研究提供了人类骨肉瘤的单细胞和空间分辨转录组学分析,构建了一个细胞元地图,揭示了骨肉瘤组成的详细亚群 | 首次提供了人类骨肉瘤的单细胞和空间分辨转录组学分析,揭示了骨肉瘤的详细细胞组成和组织结构,并探讨了化疗对这些细胞亚群的影响 | NA | 深入理解骨肉瘤的细胞组成和组织结构,为更精准的治疗方法奠定基础 | 人类骨肉瘤的细胞组成和组织结构 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞和空间分辨转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA |
7798 | 2024-10-13 |
Tubular insulin-induced gene 1 deficiency promotes NAD+ consumption and exacerbates kidney fibrosis
2024-Jul, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-024-00081-7
PMID:38806641
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研究论文 | 研究探讨了胰岛素诱导基因1(Insig1)在肾纤维化中的作用及其机制 | 首次发现管状Insig1缺乏会促进NAD+消耗并加剧肾纤维化 | NA | 探究Insig1在肾纤维化中的作用及其潜在治疗价值 | 肾纤维化中的近端小管细胞(PTCs) | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
7799 | 2024-10-13 |
Revealing the association between East Asian oral microbiome and colorectal cancer through Mendelian randomization and multi-omics analysis
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1452392
PMID:39355266
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化(MR)和多组学分析探讨东亚人口口腔微生物群与结直肠癌(CRC)之间的关联 | 首次通过MR分析和多组学整合揭示口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系,并利用单细胞RNA测序和药物预测分析揭示关键通路和潜在治疗药物 | NA | 探索口腔微生物群与结直肠癌之间的因果关系,并揭示其影响细胞代谢和癌症发展的机制 | 口腔微生物群与结直肠癌的关联 | NA | 结直肠癌 | 孟德尔随机化(MR)、全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、基因组数据、单细胞RNA数据 | 2017个舌样本和1915个唾液样本,6692个CRC病例和27178个对照组 |
7800 | 2024-10-13 |
A comprehensive analysis of genes associated with hypoxia and cuproptosis in pulmonary arterial hypertension using machine learning methods and immune infiltration analysis: AHR is a key gene in the cuproptosis process
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1435068
PMID:39391037
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法和免疫浸润分析,全面分析了与低氧和铜死亡相关的基因在肺动脉高压中的作用,并确定AHR是铜死亡过程中的关键基因 | 本研究首次将机器学习方法应用于肺动脉高压中与低氧和铜死亡相关的基因分析,并构建了诊断模型 | 本研究主要基于GEO数据库和genecad的表达谱和单细胞RNA-seq数据,未涵盖所有可能的数据来源 | 探讨肺动脉高压与低氧和铜死亡相关基因之间的关联,并寻找潜在的生物标志物 | 肺动脉高压患者与对照组的基因表达差异,以及免疫细胞浸润情况 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA-seq | LASSO和随机森林 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |