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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-07-12 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
|
research paper | 本研究揭示了组蛋白乳酸化通过正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌发生的机制 | 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录并形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路促进口腔癌发生,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 | 组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的具体作用机制仍需进一步阐明,且研究主要基于体外和动物模型,临床转化尚需验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及其分子机制 | 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织、细胞系及4NQO诱导的舌癌模型 | digital pathology | lung cancer, prostate cancer, cardiovascular disease, geriatric disease | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR、糖酵解抑制剂、基因沉默 | NA | image, text | 研究涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本,具体数量未在标题和摘要中说明 | 10x Genomics | scRNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 762 | 2026-07-12 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies ALOX5 as a potential therapeutic target for tubulointerstitial inflammation in diabetic kidney disease
2026-Mar-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44445-0
PMID:41857149
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,鉴定ALOX5为糖尿病肾病肾小管间质炎症的潜在治疗靶点 | 首次结合多组学数据、机器学习算法和单细胞测序,系统性鉴定ALOX5在糖尿病肾病肾小管间质炎症中的关键作用,并筛选出天然小分子和厚朴酚作为潜在抑制剂 | 研究主要基于公共数据集和生信分析,缺乏体内外实验验证,且未深入探讨ALOX5抑制剂的临床应用效果 | 识别糖尿病肾病肾小管组织中的关键炎症生物标志物,并阐明其免疫调控机制 | 糖尿病肾病患者的肾小管组织 | 机器学习和多组学分析 | 糖尿病肾病 | 差异表达分析、WGCNA、LASSO、随机森林、单细胞测序拟时序分析、多重免疫组化、分子对接 | LASSO、随机森林 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 多个GEO数据集,具体样本量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 763 | 2026-07-12 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
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综述 | 本文从解剖、生理、遗传和计算多维度综合阐述了泡状细胞在植物干旱适应中的作用 | 提出了整合多组学、系统生物学和AI驱动建模的创新框架,以预测泡状细胞行为并优化作物抗旱性 | 关键知识空白仍然存在,特别是在泡状细胞如何响应复合非生物胁迫以及水分保持与叶片热调节之间的生理权衡方面 | 阐明泡状细胞在植物干旱适应中的核心作用,并探索其作为开发抗逆作物品种的潜在靶点 | 泡状细胞 | 机器学习和计算生物学 | 不适用 | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、数量性状位点定位、高通量成像、机器学习 | AI驱动模型 | 图像、转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 764 | 2026-07-12 |
TimeVault: A molecular time machine for single cells
2026-Mar-19, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.019
PMID:41861790
|
评论 | TimeVault作为一种分子时间机器,使研究者能够在细胞持续分裂和分化时重建过去的转录状态 | TimeVault通过将分子历史保留在完整细胞内,提供了传统单细胞RNA测序(scRNA-seq)的替代方案,传统方法仅捕获终末快照,而TimeVault可追溯细胞历史状态 | 未在摘要中提及具体限制 | 介绍TimeVault方法以重建单细胞过去转录状态 | 单细胞转录状态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2026-07-12 |
Generation of tetraploid organs in mice
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究结合CRISPR/Cas9、Cre-LoxP系统和囊胚互补技术,成功生成小鼠四倍体肝脏、心脏和胰腺组织 | 首次利用四倍体胚胎干细胞(4-ESCs)通过囊胚互补在哺乳动物体内生成功能完整的四倍体器官,并系统分析了四倍体对发育轨迹的影响 | 四倍体器官的质量和体积显著低于二倍体对照,且四倍体对发育程序的改变可能影响器官功能 | 探索基于四倍体胚胎干细胞的囊胚互补技术用于器官再生的可行性 | 小鼠四倍体肝脏、心脏和胰腺组织 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期E18.5的小鼠组织样本,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 766 | 2026-07-12 |
Single-cell atlas of Exopalaemon carinicauda gills provides insights into pillar cell-mediated responses to low-salinity stress in crustaceans
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和超微结构表征,定义了对虾鳃中支柱细胞介导的低盐胁迫反应的细胞机制 | 首次整合超微结构表征与单细胞RNA测序,揭示支柱细胞在低盐胁迫下的形态重塑、离子细胞谱系分化和酸性-碱平衡调节机制 | 未涉及其他组织或长期适应过程;单细胞数据可能受限于样本量和测序深度 | 阐明甲壳动物鳃对低盐胁迫适应的细胞机制,特别是支柱细胞的功能角色 | Exopalaemon carinicauda(脊尾白虾)鳃组织 | 单细胞转录组学 | 甲壳动物生理应激 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 11个转录组不同的细胞群,包括支柱细胞和间隔细胞等 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 767 | 2026-07-12 |
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70159
PMID:41856795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重原位杂交,在小鼠下丘脑室旁核中解析了Alk-Fam150b(augmentor α)的分子表达,并揭示了其对应激的敏感性 | 首次在分子水平上证明Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中共同表达,包括促肾上腺皮质激素释放激素神经元,并发现CRH神经元以互斥方式表达Fam150b或Scgn,以及应激诱导的Fam150b表达上调受糖皮质激素反馈调控 | 未明确Fam150b和Alk在室旁核中的功能作用,以及augmentor α-ALK信号在摄食和体重控制应激诱导变化中的具体机制 | 研究Alk-Fam150b(augmentor α)在小鼠下丘脑室旁核中的表达及其对应激的敏感性 | 成年小鼠下丘脑室旁核中的神经元,特别是促肾上腺皮质激素释放激素神经元 | 分子生物学 | 应激相关疾病 | 单细胞RNA测序, 多重原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 小鼠样品(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 768 | 2026-07-12 |
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-Mar, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70817
PMID:41857481
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research paper | 本文研究了INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的抑癌作用及其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用机制 | 首次揭示PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A进而调控PI3K/Akt信号通路促进垂体肿瘤发生的分子机制 | NA | 探究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及其分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)样本及细胞系 | machine learning | pituitary neuroendocrine tumors(垂体神经内分泌肿瘤) | single-cell sequencing(单细胞测序),免疫荧光染色 | NA | gene expression data(基因表达数据) | 62例PitNETs患者样本 | NA | single-cell RNA-seq(单细胞RNA测序) | NA | NA |
| 769 | 2026-07-12 |
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014051
PMID:41860953
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研究论文 | 提出一种基于先验知识引导的因子分解方法用于单细胞RNA测序数据的可靠填补 | 提出scZN框架,将数据观测建模为RNA两态转录过程与dropout的联合作用,利用非负矩阵分解、先验知识约束和多重正则化,实现可解释的缺失值填补和表达重建 | 论文未明确提及局限性 | 解决scRNA-seq数据中dropout噪声与生物真实零表达的区分问题,提升数据填补的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 多个真实数据集,包括胚胎干细胞、小鼠齿状回和海马体数据,以及阿尔茨海默病数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2026-07-12 |
A single-cell immune atlas of primary and secondary lymphoid organs in pigs
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1704257
PMID:41859083
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建猪初级和次级淋巴器官的免疫细胞图谱 | 首次创建涵盖猪多种淋巴组织(骨髓、胸腺、淋巴结和脾脏)的单细胞免疫图谱,识别出新的胸腺细胞群体,并揭示猪与人之间保守的先天淋巴样细胞亚群 | 未明确提及局限性,但可能包括样本量有限或仅覆盖关键淋巴器官 | 利用单细胞RNA测序构建猪淋巴器官免疫细胞图谱,以促进农业和生物医学研究 | 猪的初级淋巴器官(骨髓、胸腺)和次级淋巴器官(淋巴结、脾脏)中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个猪淋巴组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 771 | 2026-07-12 |
Integrated spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing reveal Lars2-mediated spatiotemporal dynamics of myocardial remodeling in a mouse model of transverse aortic constriction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701776
PMID:41859105
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研究论文 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示小鼠主动脉缩窄模型中Lars2介导的心肌重塑时空动态变化 | 首次利用空间转录组学与单细胞RNA测序的整合分析,高分辨率解析压力超负荷诱导心肌肥厚过程中细胞组成和基因表达的时空动态变化,并鉴定Lars2为疾病进展相关基因 | NA | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序,全面表征压力超负荷诱导心肌重塑的细胞与空间动态变化 | 小鼠心脏组织,取自主动脉缩窄模型的不同疾病阶段(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据(空间转录组和单细胞RNA测序数据) | 不同疾病阶段的小鼠心脏组织样本(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2026-07-12 |
Quantitative profiling of lifespan-dependent cell-cell communication potential reveals dynamic ligand-receptor network shifts across mouse tissues
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345045
PMID:41860844
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据推断小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏)中跨生命周期的细胞间通信动态变化,并开发了一种量化框架来捕捉配体-受体相互作用的变化 | 开发了Shrink and Expand (SE) 评分来量化两个生物学状态之间推断的配体-受体相互作用集的定向变化,并构建了跨器官和生命周期的配体-受体对变化数据集 | 该研究基于转录组推断而非蛋白质水平验证,可能存在假阳性或假阴性结果,且未涵盖所有潜在细胞类型 | 研究细胞间通信随年龄变化的动态模式,并开发可量化的比较方法 | 小鼠的肝脏、肺、心脏和肾脏组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏),涵盖产后发育、成年和衰老三个阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 773 | 2026-07-10 |
Integrated multi-omics analysis identifies prognostic risk genes and constructs a predictive signature in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Dec-31, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2026.2700818
PMID:42420780
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研究论文 | 通过整合多组学分析识别弥漫性大B细胞淋巴瘤的预后风险基因并构建预测模型 | 首次结合eQTL-MR分析、单细胞RNA测序和免疫浸润分析,系统鉴定出15个与DLBCL发病和预后相关的风险基因并构建预测模型 | 未说明具体局限性 | 探索弥漫性大B细胞淋巴瘤的潜在致病基因并构建预后预测模型 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者 | 计算机视觉 | 淋巴瘤 | eQTL-MR分析, 单细胞RNA测序, GO/KEGG富集分析, 免疫浸润分析, 药物敏感性分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-07-10 |
Immune regulatory mechanisms and potential microbiota-associated targets in Kawasaki disease: an integrative multi-omics and network pharmacology study
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2026.2700919
PMID:42422999
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研究论文 | 该研究采用整合多组学策略,系统调查川崎病中肠道微生物群-代谢物相互作用,并识别关键分子靶点 | 首次整合多组学分析、网络药理学和孟德尔随机化,揭示肠道微生物群-代谢物-SELP轴作为川崎病潜在治疗靶点 | 研究仍处于初步阶段,未明确提及具体限制信息 | 探索川崎病中肠道微生物群在免疫调节和炎症反应中的作用机制,并确定潜在干预靶点 | 川崎病患者的肠道微生物群、代谢物及免疫细胞相互作用 | 机器学习 | 川崎病 | 多组学分析、网络药理学、孟德尔随机化、单细胞转录组学、分子对接 | 机器学习模型 | 基因表达数据、微生物组数据、代谢组数据 | 未在标题和摘要中说明 | NA | NA | NA | NA |
| 775 | 2026-07-10 |
Integrative genomic characterization of the FADS1-2-3 mood disorder risk locus: implications for the role of polyunsaturated fatty acids
2026-Nov-01, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2026.122140
PMID:42309192
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研究论文 | 对FADS1-2-3情绪障碍风险位点进行整合基因组特征分析,探讨多不饱和脂肪酸在其中的作用 | 通过整合遗传共定位分析、跨群体变异注释及单细胞RNA-seq数据,优先将FADS1而非FADS2或FADS3确定为最可能的效应基因,并发现TMEM258和MYRF作为替代效应基因涉及N-糖基化和轴突髓鞘化等新型机制 | 未来需要采用正交方法进一步验证该位点中潜在的水平多效性来源 | 解析FADS1-2-3基因簇与情绪障碍(双相情感障碍和重度抑郁症)之间的遗传风险关联及潜在效应基因 | FADS1-2-3情绪障碍风险位点及相关遗传变异 | 自然语言处理 | 情绪障碍(双相情感障碍、重度抑郁症) | 全基因组关联研究、cis-eQTL分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因型数据、表达数量性状位点数据 | 最大样本量达400万人的GWAS摘要统计数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2026-07-10 |
Vesicular QSOX1-MMP2 from inflammatory cancer-associated fibroblasts degrades the extracellular matrix to drive colorectal cancer pulmonary dissemination
2026-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218645
PMID:42217558
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研究论文 | 本研究揭示炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡携带QSOX1-MMP2复合物降解细胞外基质,驱动结直肠癌肺转移 | 首次发现炎性癌相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡中QSOX1选择性富集,并能与MMP2结合促进其分泌和活性,从而重塑转移微环境 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限,且QSOX1抑制剂Ebselen的安全性需进一步评估 | 阐明结直肠癌肺转移中基质细胞介导的转移定植机制,并探索靶向QSOX1的治疗策略 | 结直肠癌肺转移小鼠模型中的炎性癌相关成纤维细胞及其分泌的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 结直肠癌肺转移小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 777 | 2026-07-10 |
A multiperspective evaluation framework of spatial transcriptomics clustering methods
2026-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag075
PMID:42421749
|
研究论文 | 提出一个多视角评估框架,用于系统评价空间转录组聚类方法 | 整合了前沿和传统的标签依赖与标签无关指标,提供统一灵活的评价策略,能够同时评估转录组和空间信息的整合效果 | 依赖合成数据集和现有数据集,可能无法涵盖所有实际应用场景,标签无关指标仍难以完全反映空间聚类方法的全部特征 | 开发统一框架以克服现有评估方法的局限性,实现空间转录组聚类方法的全方位、可重复评估 | 十一种深度学习空间域识别方法,在合成数据集和七种空间转录组技术所生成的十三个数据集上的表现 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 两个合成数据集和十三个来自七种空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 778 | 2026-07-10 |
The rituximab paradox in rheumatoid arthritis: Re-evaluating B-cell depletion depth and the synovial microenvironment
2026-Aug, Autoimmunity reviews
IF:9.2Q1
DOI:10.1016/j.autrev.2026.104089
PMID:42162633
|
research paper | 重新评估类风湿关节炎中B细胞耗竭深度与滑膜微环境,解释利妥昔单抗临床悖论 | 提出类风湿关节炎治疗无需完全系统性B细胞清除,通过单细胞转录组学与纵向数据整合揭示“不完全耗竭”在维持组织免疫安全边际中的作用 | NA | 解释利妥昔单抗在类风湿关节炎中临床疗效与B细胞耗竭深度不一致的悖论,并提出未来治疗范式 | 类风湿关节炎患者及滑膜组织中的致病性B细胞-成纤维细胞相互作用 | machine learning, digital pathology | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、纵向临床数据 | 来自REDO试验的纵向数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2026-07-10 |
FLT3-ITD scaffolds PKCι-STAT1 to drive noncanonical S727 phosphorylation and CD276-driven CD8+ T-cell exhaustion in AML
2026-Jul-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032254
PMID:41878790
|
研究论文 | 本研究揭示FLT3-ITD通过支架PKCι-STAT1复合物驱动非经典S727磷酸化,上调CD276表达,导致AML中CD8+ T细胞耗竭 | 首次发现FLT3-ITD作为一种突变特异性支架蛋白,组装PKCι-STAT1三元复合物,介导STAT1 S727磷酸化而非经典Y701位点,驱动CD276转录,阐明其激酶非依赖性免疫抑制机制 | 研究主要基于体外和异种移植模型,临床样本验证规模有限(104例),且未深入探索其他可能的免疫调节机制 | 阐明FLT3-ITD在急性髓系白血病中激酶非依赖性免疫抑制机制 | FLT3-ITD突变的急性髓系白血病患者样本、CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、免疫共沉淀、染色质免疫沉淀、电泳迁移率变动分析、报告基因实验、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、流式细胞术数据 | 104例原发性患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2026-07-10 |
T cell transfer into immunodeficient mice uncovers a paralytic phenotype beyond colitis
2026-Jul-09, Experimental animals
IF:2.2Q1
DOI:10.1538/expanim.26-0035
PMID:42419956
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研究论文 | 将CD45RB T细胞过继转移至免疫缺陷小鼠后,意外发现部分小鼠出现类似实验性自身免疫性脑脊髓炎的麻痹表型,而非仅结肠炎 | 首次报道T细胞过继转移模型中出现麻痹表型,揭示ex-Th17细胞在结肠炎和中枢神经系统自身免疫中的共同作用,并建立此模型为研究组织特异性自身免疫病理的平台 | 未明确列出,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异、机制研究的深度有限 | 探究T细胞过继转移诱导的结肠炎模型中意外出现的麻痹表型及其与中枢神经系统自身免疫的关联 | 免疫缺陷小鼠(如Rag-/-小鼠)以及克罗恩病和多发性硬化症患者的结肠和脑脊液样本 | 免疫学 | 炎症性肠病、多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞RNA-seq) | 涉及小鼠实验及克罗恩病患者结肠样本、多发性硬化症患者脑脊液样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |