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当前共找到 35811 篇文献,本页显示第 761 - 780 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
761 2026-01-22
scDGCL: a Dual-level and Graph-constrained Contrastive Learning Method for Single-cell RNA Sequencing Data Clustering
2026-Jan-20, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为scDGCL的新型双层次图约束对比学习方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 提出了一种结合双层次对比学习(DCL)和图约束对比学习(GCL)的新型框架,通过同时考虑细胞和簇级别的相似性与差异性来优化细胞表征,并将学习到的表征与图关系先验对齐 NA 提高单细胞RNA测序数据的聚类性能 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习 基因表达数据 12个真实数据集和8个模拟数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
762 2026-01-22
scSHEFT enables multiomics label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq through dual alignment
2026-Jan-20, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本研究提出了一种名为scSHEFT的新标签转移工具,用于从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据转移多组学标签 scSHEFT通过同时考虑基因表达计数数据、峰值计数数据和基因活性分数作为输入,并采用基于锚点的跨组学对齐和基于对比的策略来保持组学内细胞异质性,从而桥接异质特征之间的差距 NA 开发一种能够有效从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据转移多组学标签的工具,以帮助注释常见细胞类型甚至新型细胞类型 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq) NA 基因表达计数数据,峰值计数数据,基因活性分数 七个数据集 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
763 2026-01-22
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了间歇性禁食通过肠道微生物群介导的甲硫氨酸-m6A调控抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 首次将间歇性禁食的抗肿瘤疗效与胶质母细胞瘤的分子亚型(Tp53 vs Cdkn2a)相关联,并通过多组学测序系统阐明了肠道微生物群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴这一全新作用通路 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类患者中的普适性仍需进一步临床验证;对Cdkn2a亚型胶质瘤响应不佳的机制尚未完全阐明 探究间歇性禁食对不同分子亚型胶质母细胞瘤的治疗效果差异及其作用机制 Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 多组学整合分析 胶质母细胞瘤 空间转录组测序、空间代谢组学、单细胞转录组测序、单细胞RNA甲基化测序、代谢组学、微生物组学 NA 多组学测序数据 胶质母细胞瘤小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化测序, 代谢组学, 微生物组学 NA NA
764 2026-01-22
Identification and verification of SPP1 in anoikis as a prognostic biomarker for intestinal metaplasia and gastric cancer
2026-Jan-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探索了失巢凋亡相关基因SPP1在胃黏膜正常-肠化生-胃癌级联中的多组学特征,并验证其作为预后生物标志物的潜力 首次将SPP1与肠化生和胃癌的进展联系起来,并系统研究了其在肿瘤微环境中的免疫学作用 免疫治疗意义需要进一步研究,体外实验样本量有限 探索SPP1在胃癌发生发展中的生物学功能及其作为预后生物标志物的价值 肠化生和胃癌患者组织样本及胃癌细胞系 生物信息学与肿瘤学 胃癌 转录组分析、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、体外功能实验 加权基因共表达网络分析、竞争性内源RNA网络、Cox比例风险回归模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、实验验证数据 32例人体组织样本(用于RT-qPCR/Western blot验证) NA 单细胞RNA测序 NA NA
765 2026-01-22
Impact and correction of segmentation errors in spatial transcriptomics
2026-Jan-20, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文研究了空间转录组学中细胞分割错误对下游分析的影响,并提出了一种基于矩阵分解的校正方法 首次系统评估了多种组织和平台中分割错误对细胞状态分析的广泛影响,并提出了一种类似单细胞RNA测序中双峰过滤的局部分子邻域矩阵分解校正方法 NA 评估空间转录组学中细胞分割错误的影响并开发校正方法 多种组织和平台的空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 矩阵分解 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
766 2026-01-22
Distinct sympathetic projections to brown fat regulate thermogenesis and glucose tolerance
2026-Jan-20, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本文通过识别小鼠星状神经节中支配肩胛间棕色脂肪组织(iBAT)的不同交感神经元亚群,揭示了这些神经元在调节产热和血糖耐受性方面的独特功能 开发了工具包来解析交感神经元亚类的功能,包括靶向化学遗传学激活iBAT投射和单细胞转录组学结合逆行追踪,首次区分了支配iBAT实质和血管的交感神经元在产热与血糖调节中的独立作用 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类或其他物种,且可能未全面评估所有潜在的交感神经回路或长期效应 探究棕色脂肪组织(BAT)中产热和血糖代谢功能如何通过不同交感神经回路协调 小鼠的肩胛间棕色脂肪组织(iBAT)及其支配的交感神经元亚群 神经生物学与代谢研究 代谢性疾病 靶向化学遗传学激活、单细胞转录组学、逆行追踪 NA 基因表达数据、生理测量数据 小鼠模型 NA NA NA NA
767 2026-01-22
Loss of biomechanical features reveals smooth muscle disruption and disease progression in prostate cancer
2026-Jan-20, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据揭示了生物力学特征丧失与前列腺癌进展的关系,并开发了预后指数MRPX用于风险分层和治疗指导 首次系统性地将生物力学特征与前列腺癌平滑肌破坏及疾病进展联系起来,并构建了基于生物力学调控基因的预后指数MRPX,该指数在预测免疫治疗和化疗反应方面表现出强泛化能力 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床验证;体外机械刺激实验仅使用PC-3细胞系,可能无法完全代表肿瘤异质性 阐明生物力学特征在前列腺癌进展中的作用及机制 前列腺癌患者组织样本和细胞系 生物信息学 前列腺癌 转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、共识聚类、WGCNA、机器学习、免疫浸润分析、药物敏感性分析、共培养模型 机器学习模型(具体类型未指定) 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 1693例前列腺癌患者(来自10个公共队列)和19例前列腺癌样本(单细胞RNA测序) NA 单细胞RNA-seq NA NA
768 2026-01-22
CCL14, identified by multi-omics approach, serves as a novel indicator of disease severity and progression in lymphangioleiomyomatosis
2026-Jan-20, Orphanet journal of rare diseases IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过多组学方法鉴定CCL14作为淋巴管平滑肌瘤病(LAM)疾病严重程度和进展的新型生物标志物 首次结合血浆蛋白质组学和单细胞RNA测序揭示CCL14在LAM中的上调及其在淋巴和血管内皮细胞中的定位,并发现其与疾病进展的临床相关性 样本量相对较小(53名LAM患者和25名对照),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 探索CCL14在淋巴管平滑肌瘤病中的作用及其作为疾病生物标志物的潜力 淋巴管平滑肌瘤病患者和健康对照者的血浆及肺组织样本 生物信息学 淋巴管平滑肌瘤病 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序, ELISA NA 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 53名LAM患者和25名健康对照用于血浆分析;6名LAM患者和5名健康供体的肺组织用于单细胞测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
769 2026-01-22
Integrated Stress Response and Drug-Induced Acute Kidney Injury: Involvement of ATF4-STAT1-GBP2 Signaling
2026-Jan-20, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了ATF4通过STAT1-GBP2信号通路促进药物诱导的急性肾损伤中细胞焦亡的机制 首次发现ATF4作为整合应激反应的关键调控因子,通过STAT1-GBP2信号轴调控NLRP3炎症小体激活和细胞焦亡,在药物诱导的急性肾损伤中发挥核心作用 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限;药物诱导的AKI模型可能无法完全反映其他类型AKI的机制 阐明药物诱导的急性肾损伤中细胞焦亡的调控机制,寻找潜在治疗靶点 肾小管上皮细胞、转基因小鼠模型、人类和小鼠AKI样本 分子生物学 急性肾损伤 单细胞RNA测序、RNA测序、转录组分析、荧光素酶报告基因检测、免疫共沉淀、Western blotting、免疫组织化学、免疫荧光 转基因小鼠模型 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 未明确具体样本数量,包括人类和小鼠AKI模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
770 2026-01-22
Transthyretin-mediated regulation of neuropathic pain and anxiety-like behavior in the lateral parabrachial nucleus
2026-Jan-19, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示了在神经病理性疼痛模型中,外侧臂旁核(LPBN)内转甲状腺素蛋白(TTR)通过结合其受体RAGE并激活NF-κB信号通路,调控疼痛-焦虑共病的关键作用 首次在单细胞水平上发现神经病理性疼痛模型中LPBN的TTR表达上调,并通过双向条件性敲除和过表达实验,证实了LPBN谷氨酸能神经元中的TTR是疼痛-焦虑共病的必要且充分的调节因子 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待进一步验证;TTR-RAGE-NF-κB轴下游的具体效应分子和细胞类型间的相互作用网络尚未完全阐明 探究神经病理性疼痛及其共病焦虑的分子、细胞和环路机制,并寻找潜在的治疗靶点 小鼠的外侧臂旁核(LPBN)神经元,特别是谷氨酸能神经元 神经科学 神经病理性疼痛 单细胞测序,双向条件性基因敲除(cKO),基因过表达 NA 单细胞基因表达数据,行为学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
771 2026-01-22
Upregulation of ZAP70 in CD8+ T cells enhances its anti-tumor function and correlates with a favorable prognosis in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-19, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了ZAP70在CD8+ T细胞中的上调通过增强其抗肿瘤功能与肝细胞癌患者良好预后相关 首次将单细胞RNA测序数据与体外体内实验结合,系统性地证明了ZAP70在CD8+ T细胞中的表达水平是影响肝细胞癌免疫微环境及患者预后的关键因素,并明确了其作为潜在免疫治疗靶点的价值 研究主要基于公共数据库(TCGA, GEO)和实验模型,需要在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证ZAP70的预后预测价值及其作为治疗靶点的有效性 探究肝细胞癌肿瘤免疫微环境中免疫细胞浸润模式及免疫相关基因的表达特征,并阐明其影响预后的机制,以寻找新的免疫治疗靶点 肝细胞癌患者样本(来自TCGA数据库和GEO数据库的单细胞RNA测序数据)、CD8+ T细胞、肝细胞癌细胞系、小鼠异种移植和原位肿瘤模型 生物信息学与肿瘤免疫学 肝细胞癌 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、转录组分析、LASSO-Cox回归分析、单细胞RNA测序、体外共培养实验、体内小鼠模型(异种移植和原位模型) 预后风险特征模型、预后列线图(Nomogram) 基因表达数据(转录组数据)、单细胞RNA测序数据 TCGA-HCC样本(具体数量未在摘要中明确,但被分为3个亚型进行分析)、来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
772 2026-01-22
Succinate-mediated activation of the GPR91/MALT1/NF-κB/CCL2 pathway in macrophages contributes to pulmonary fibrosis
2026-Jan-19, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了琥珀酸通过激活巨噬细胞中的GPR91/MALT1/NF-κB/CCL2通路加剧肺纤维化的分子机制 首次阐明了琥珀酸通过GPR91/MALT1/NF-κB轴促进巨噬细胞CCL2分泌从而驱动肺纤维化的具体信号通路 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;琥珀酸抑制剂的长期安全性未评估 阐明琥珀酸在肺纤维化发展中的具体作用机制 野生型和GPR91敲除小鼠、原代小鼠巨噬细胞和成纤维细胞 分子病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、RNA测序 动物模型(小鼠) 基因表达数据 未明确样本数量的小鼠模型和细胞实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
773 2026-01-22
Single-cell transcriptomic profiling of platelet-adherent circulating tumor cells using a microcavity-gel manipulation platform
2026-Jan-19, Journal of bioscience and bioengineering IF:2.3Q3
研究论文 本研究开发了一种结合微腔阵列和凝胶细胞操作技术的单细胞转录组分析平台,用于分析胰腺癌患者循环肿瘤细胞(CTCs)的转录组特征 开发了一种不依赖标记物的微腔-凝胶操作平台,用于高质量单细胞RNA测序,并首次揭示了胰腺癌CTCs具有血小板驱动的上皮-间质转化(EMT)特征和G1期细胞周期停滞现象 研究样本量有限,仅针对胰腺癌患者,且未验证平台在其他癌症类型中的适用性 开发一种用于循环肿瘤细胞单细胞转录组分析的新平台,并探索胰腺癌转移的生物学机制 转移性胰腺癌患者的循环肿瘤细胞(CTCs) 单细胞测序技术 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 胰腺癌患者来源的CTCs(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq 微腔-凝胶操作平台(研究自建平台) 结合微腔阵列(MCA)和凝胶细胞操作(GCM)技术的单细胞捕获与测序平台
774 2026-01-22
Macrophage-associated immune-stromal crosstalks correlate with the tumor microenvironment in microsatellite-stable mucinous colorectal cancer
2026-Jan-17, Pathology, research and practice
研究论文 本研究通过整合三个公开的单细胞RNA测序数据集,全面描绘了微卫星稳定(MSS)型黏液性结直肠癌的细胞生态系统,揭示了其独特的免疫抑制性肿瘤微环境特征 首次在单细胞水平系统描绘了MSS型黏液性结直肠癌的免疫-基质互作网络,发现了以IL1B-IL1R2和CXCL8-CXCR2信号通路为核心的髓系免疫抑制网络,并构建了具有预后预测价值的黏液性结直肠癌免疫模块(MCIM) 研究基于公开数据库的回顾性分析,缺乏独立的前瞻性队列验证;单细胞数据主要来自肿瘤组织,未涉及转移灶或治疗前后动态变化 阐明微卫星稳定型黏液性结直肠癌的肿瘤微环境特征及其免疫抑制机制 黏液性结直肠癌(MAC)与经典腺癌(AC)的肿瘤微环境细胞组成与互作网络 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合三个公开单细胞RNA测序数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
775 2026-01-22
TNFSF10 drives hyperactive immune responses via NLRP3 inflammasome and endoplasmic reticulum stress in autoimmune and inflammatory diseases
2026-Jan-16, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了TNFSF10在自身免疫和炎症性疾病中通过激活NLRP3炎症小体和内质网应激驱动过度免疫反应的关键作用 首次将TNFSF10与NLRP3炎症小体激活、内质网应激及免疫原性细胞死亡联系起来,并发现其通过增强PPP1R15A表达放大内质网应激 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且疾病模型可能无法完全模拟人类疾病的复杂性 探究TNFSF10在自身免疫和炎症性疾病中的生物学功能及其分子机制 免疫细胞、小鼠模型(包括AA、ER应激、aGVHD、辐射诱导衰老和IBD模型) NA 自身免疫和炎症性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
776 2026-01-22
scII: Dual-Threshold Adaptive Integration of Single-Cell Multiomics Data Driven by Imputation
2026-Jan-15, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为scII的自适应框架,用于整合单细胞RNA测序和染色质可及性数据,以解决现有整合方法在准确性、可解释性和可扩展性方面的挑战 提出了四项关键创新:scRNA-seq引导的信号插补以增强scATAC-seq信息完整性;使用带Maxout激活函数的多层感知器建模复杂非线性关系;动态双阈值自适应选择机制联合评估跨模态特征相似性和分类可靠性;基于贝叶斯信息准则的优化动态确定高斯混合模型组件数量 NA 开发能够高效整合未配对单细胞多组学数据并实现精确细胞类型注释转移的方法 单细胞多组学数据(scRNA-seq和scATAC-seq) 机器学习 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 多层感知器,高斯混合模型 基因表达数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
777 2026-01-22
CBX3 confers ferroptosis resistance during blood-borne metastasis
2026-Jan-15, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了循环肿瘤细胞(CTCs)通过上调CBX3和GPX4抵抗铁死亡,从而促进血行转移的机制 首次在单细胞水平上发现CTCs通过CBX3-EP300轴上调GPX4来抵抗铁死亡,并证实了CBX3与GPX4共表达的CTCs与转移进展的临床关联 研究主要基于肺癌和黑色素瘤患者,其他癌症类型中的普适性有待验证,且体内功能验证的模型数量有限 探究循环肿瘤细胞在血行转移过程中抵抗细胞死亡的生存机制 肺癌和黑色素瘤患者的循环肿瘤细胞及脑转移肿瘤细胞 单细胞组学 肺癌 单细胞RNA测序、全外显子组测序、转录组分析 NA 单细胞转录组数据、基因组数据 肺癌和黑色素瘤患者的前瞻性队列样本 NA 单细胞RNA-seq NA 微流控富集的CTCs单细胞RNA测序
778 2026-01-22
Multi-omic Longitudinal Analysis of Canine Osteosarcoma Identifies Inter-Patient Heterogeneity and Immune Enrichment in Metastatic Lesions
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学纵向分析犬骨肉瘤,揭示了患者间异质性以及转移病灶中的免疫富集特征 首次在犬骨肉瘤中进行了配对原发和转移肿瘤样本的纵向多组学分析,强调了患者特异性基因组变化在肿瘤进展中的作用 样本量相对较小,且研究基于犬模型,可能不完全适用于人类骨肉瘤 理解骨肉瘤在肿瘤进化过程中获得的特征,特别是患者特异性耐药机制 犬自发性骨肉瘤的配对原发和转移肿瘤样本 数字病理学 骨肉瘤 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 基因组数据, 转录组数据 配对原发和转移肿瘤样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
779 2026-01-22
Tumor-associated macrophages educated by IGSF9 exhibit a senescence-associated secretory phenotype to promote tumor immune escape
2026-Jan-14, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了免疫球蛋白超家族成员9(IGSF9)通过结合TMUB1蛋白激活IL-6/STAT3信号通路,诱导肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)发生衰老并呈现衰老相关分泌表型,从而抑制T细胞活性、形成免疫抑制性肿瘤微环境并促进肿瘤免疫逃逸的过程,并证明抗IGSF9抗体治疗可逆转此过程并抑制肿瘤生长 首次发现TMUB1是IGSF9的结合蛋白,并阐明IGSF9通过诱导TAMs衰老和呈现衰老相关分泌表型来促进肿瘤免疫逃逸的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其在人类肿瘤中的普适性及临床转化潜力仍需进一步验证 探究IGSF9如何影响肿瘤相关巨噬细胞的功能及其在肿瘤免疫逃逸中的作用机制 肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、IGSF9蛋白、TMUB1蛋白 肿瘤免疫学 肿瘤 空间转录组学、RNA-seq、流式细胞术、膜系统酵母双杂交筛选、GST pull-down、免疫共沉淀、免疫荧光 NA 空间转录组数据、RNA-seq数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 使用了来自公共数据集GSE189487的空间转录组数据,并进行了小鼠体内实验(C57BL/6、NSG、OT-II等品系) NA 空间转录组学 NA NA
780 2026-01-22
Mutant calreticulin enables potent and selective CAR-T cell therapy in preclinical models of myeloproliferative neoplasms
2026-Jan-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究首次展示了利用靶向突变钙网蛋白(mCALR)的CAR-T细胞治疗骨髓增殖性肿瘤(MPNs)的临床前有效性 首次成功将CAR-T细胞疗法应用于靶向mCALR突变治疗MPNs,并揭示了凋亡抵抗机制及与venetoclax联合治疗的协同策略 研究处于临床前阶段,需进一步临床验证;样本量有限,主要基于细胞系和小鼠模型 开发针对BCR::ABL1阴性MPNs的新型CAR-T细胞疗法 突变钙网蛋白(mCALR)阳性的骨髓增殖性肿瘤细胞 免疫治疗 骨髓增殖性肿瘤 单细胞RNA测序,批量RNA测序 CAR-T细胞 基因表达数据,细胞功能数据 细胞系、患者来源细胞及小鼠异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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