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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7581 | 2026-04-14 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
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研究论文 | 本研究通过分析脑脊液免疫细胞,探讨其作为神经病理性疼痛中微胶质细胞激活的替代指标的可能性 | 首次结合FACS、RNA测序和CITE测序技术,系统比较神经病理性与非神经病理性疼痛患者脑脊液免疫细胞的相似性,并挑战了脑脊液作为微胶质功能生物标志物的直接应用 | 样本量较小,且无法明确区分脑脊液蛋白质来源是循环单核细胞还是脊髓实质中的微胶质细胞 | 评估脑脊液是否可作为人类微胶质细胞激活的生物标志物,以研究神经病理性疼痛的病理机制 | 神经病理性疼痛患者(如带状疱疹后神经痛和背部手术失败后神经痛)的脑脊液免疫细胞 | NA | 神经病理性疼痛 | 荧光激活细胞分选(FACS)、RNA测序、CITE测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 包括神经病理性疼痛患者及与已发表单细胞RNA测序数据的比较,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7582 | 2026-04-14 |
Kidney-Targeted Renalase Agonist Prevents Cisplatin-Induced Chronic Kidney Disease by Inhibiting Regulated Necrosis and Inflammation
2022-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021040439
PMID:34921111
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研究论文 | 本研究探讨了通过肾脏靶向递送肾胺酶激动剂RP81-MNP,在顺铂诱导的慢性肾病小鼠模型中预防肾损伤的机制和效果 | 首次使用中尺度纳米颗粒封装肾胺酶激动剂肽RP81进行肾脏靶向递送,通过单细胞RNA测序分析揭示了其在保护肾小管上皮细胞和抑制炎症反应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅涉及血浆肾胺酶水平趋势,未直接验证RP81-MNP在人体中的疗效 | 研究肾胺酶激动剂在预防顺铂诱导的慢性肾病中的作用机制和治疗潜力 | 顺铂诱导的慢性肾病小鼠模型以及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | 小鼠模型及头颈部鳞状细胞癌患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7583 | 2026-04-14 |
Progressive Cellular Senescence Mediates Renal Dysfunction in Ischemic Nephropathy
2021-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020091373
PMID:34135081
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研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老在慢性缺血性肾病中介导肾功能障碍的作用 | 首次揭示了慢性肾缺血中细胞衰老的渐进性模式,并证明了靶向清除衰老细胞(使用INK-ATTAC转基因模型和口服senolytic药物组合)可改善肾功能 | 研究主要基于小鼠模型,人体样本验证有限;立即在RAS诱导后开始治疗未能成功,提示治疗时机的重要性 | 探究细胞衰老是否及如何介导肾动脉狭窄引起的肾功能障碍和组织损伤 | 转基因INK-ATTAC小鼠、野生型C57BL/6小鼠以及人狭窄肾脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、影像数据 | 小鼠模型及人肾脏组织样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7584 | 2026-04-13 |
Tubulointerstitial inflammation in glomerular diseases: mechanistic pathways, prognostic value, and translational therapeutic targets
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2646426
PMID:41876962
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综述 | 本文系统综述了肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后意义及转化医学局限性,并探讨了新兴技术如何推动精准肾脏病学发展 | 提出从以肾小球为中心的框架转向肾小球-间质系统视角的概念性转变,并整合了AI增强数字病理、空间转录组学等新兴技术用于间质免疫-纤维化微环境的精细化空间定量表征 | 肾小管间质炎症的独立预后意义在不同疾病和人群中仍不一致,且现有以肾小球为中心的治疗策略对部分患者无效 | 阐明肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后价值及转化治疗靶点,推动精准肾脏病学发展 | 肾小球疾病中的肾小管间质炎症 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 病理图像、转录组数据、生物标志物、影像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7585 | 2026-04-13 |
IGHG1+ malignant epithelial Cell-myCAF crosstalk via MIF-CD74/APP-CD74 drives early brain metastasis in NSCLC: Delineated via primary tumor-brain metastasis single-cell and spatial transcriptomics
2026-Jun-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218451
PMID:41881335
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,揭示了非小细胞肺癌早期脑转移的机制,并识别了CD74作为潜在治疗靶点 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了IGHG1+恶性上皮细胞与肌成纤维样癌症相关成纤维细胞通过MIF-CD74/APP-CD74轴相互作用,驱动非小细胞肺癌早期脑转移的新机制 | 研究为回顾性分析,样本量相对有限(53例患者),且体外和体内验证仍需进一步扩展 | 探究非小细胞肺癌早期脑转移的机制,开发预测模型并识别潜在治疗靶点 | 53例非小细胞肺癌患者的石蜡样本,包括正常肺组织、原发肿瘤(有/无脑转移)、脑转移灶和正常脑组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, GeoMx DSP, CosMx SMI | Augur, 伪时间分析, 空间通讯分析, ROC分析 | 转录组数据, 空间表达数据 | 53例非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7586 | 2026-04-13 |
Circulating Ly6Chigh monocyte-derived S100A4+ macrophages exacerbate neuroinflammation and impede recovery of traumatic brain injury
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106472
PMID:41605306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了创伤性脑损伤后循环Ly6C单核细胞来源的S100A4+巨噬细胞通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织,加剧神经炎症并阻碍恢复的分子机制 | 首次在TBI模型中识别出源自循环Ly6C单核细胞的S100A4+巨噬细胞亚群,阐明了其通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织、通过SPP1-CD44轴激活小胶质细胞加剧神经炎症的机制,并发现IRF7作为关键转录因子驱动该过程,且FDA批准的药物熊去氧胆酸可作为IRF7拮抗剂改善TBI预后 | 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性需进一步验证;单细胞测序仅针对急性期样本,长期动态变化未涉及;药物干预机制虽被提出,但具体分子靶点及临床转化潜力需深入探索 | 阐明创伤性脑损伤后系统性免疫反应的细胞与分子机制,并探索潜在治疗靶点 | 创伤性脑损伤小鼠的脑组织及外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及TBI小鼠的脑和PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7587 | 2026-04-13 |
Characterizing gene perturbations in single cells via network divergence analysis
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71507-8
PMID:41965857
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研究论文 | 本文介绍了scDNS框架,用于通过测量条件特异性基因相互作用网络配置之间的信息论差异来量化单细胞中基因特异性功能扰动 | 提出了一种新的方法scDNS,专注于通过网络重连而非基因表达变化来推断基因功能扰动,并将其与特定细胞群体关联,这在现有scRNA-seq数据分析中较少涉及 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个工具来推断单细胞中动态基因功能扰动,并识别关键调控因子和受扰动的细胞群体 | 单细胞RNA测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | scRNA-seq | 网络分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7588 | 2026-04-13 |
A machine learning model integrating circulating Temra cell transcriptional profiles to predict immunotherapy efficacy
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101027
PMID:41747737
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研究论文 | 本研究开发了一种基于循环终末分化效应记忆CD8+ T细胞转录组特征的机器学习模型,用于预测免疫治疗疗效 | 整合了13个公开单细胞数据集构建全面的CD8+ T细胞转录组图谱,首次利用循环Temra细胞的转录特征建立预测模型,并在前瞻性多中心队列中验证 | 样本量相对有限(15例配对样本),模型需在更广泛癌种和更大队列中进一步验证 | 开发血液来源的转录组生物标志物以预测免疫检查点抑制剂疗效 | 癌症患者(特别是非小细胞肺癌患者)的循环CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 逻辑回归 | 转录组数据 | 15例配对外周血和肿瘤样本,整合748,082个CD8+ T细胞,前瞻性队列131例晚期NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7589 | 2026-04-13 |
Single-cell profiling of immune reset in patients with refractory generalized myasthenia gravis receiving autologous CD19/BCMA CAR-T cell therapy
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101026
PMID:41747738
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研究论文 | 本研究评估了自体CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法在难治性全身型重症肌无力患者中的安全性、有效性及对系统性免疫的影响 | 首次在难治性全身型重症肌无力患者中应用无需淋巴细胞清除的自体CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法,并通过单细胞测序揭示了疗法诱导的系统性免疫重置机制 | 研究样本量较小(仅6名患者),且为单臂I期试验,缺乏对照组,长期疗效和安全性需更大规模临床试验验证 | 评估CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法在难治性全身型重症肌无力中的安全性、疗效及对免疫系统的影响 | 难治性全身型重症肌无力患者 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7590 | 2026-04-13 |
Dissection of the T cell infiltrate in mouse pancreatic tumors reveals an extensive and diverse tumor-reactive T cell repertoire
2026-Apr-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr6132
PMID:41961941
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和功能性T细胞受体表征,探索了小鼠胰腺癌模型中的T细胞库,揭示了肿瘤反应性T细胞受体克隆型的广泛多样性 | 结合单细胞转录组学和功能性TCR表征,首次在小鼠胰腺癌模型中系统性地揭示了肿瘤反应性TCR克隆型的多样性,并鉴定了三种与人类癌症相关的T细胞表位 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类胰腺癌;样本规模可能有限,未详细说明具体样本数量 | 探索胰腺癌中肿瘤浸润T细胞的T细胞受体库多样性及其抗原特异性,以评估个性化免疫疗法的治疗潜力和安全性 | 小鼠胰腺癌模型中的肿瘤浸润T细胞 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学,免疫肽组分析,T细胞受体表征 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7591 | 2026-04-13 |
Demystifying Plasmodium development within the Anopheles mosquito
2026-Apr-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102751
PMID:41966627
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综述 | 本文总结了显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选等新技术如何革新了对疟原虫在按蚊体内发育阶段的研究 | 整合了最新的显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选技术,以揭示疟原虫在蚊媒中发育的复杂过程 | NA | 提高对疟原虫在按蚊体内发育阶段的理解,以支持新型疟疾传播控制工具的研发 | 疟原虫在按蚊体内的生命周期阶段 | 自然语言处理 | 疟疾 | 显微镜、单细胞RNA测序、遗传筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7592 | 2026-04-13 |
Comprehensive multi-omics analyses reveal small intestinal genetic mechanisms regulating milk protein trait in yak
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28364
PMID:41966396
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研究论文 | 本研究通过构建首个牦牛小肠单细胞转录组图谱,并结合多组学分析,揭示了小肠功能特化及其相关基因调控牦牛乳高蛋白含量的遗传机制 | 首次构建了牦牛小肠的单细胞转录组图谱,并开发了一个整合基因组学和scRNA-seq数据的多策略GWAS框架来鉴定与乳蛋白含量相关的候选基因 | NA | 探究牦牛乳高蛋白含量的生物学基础,特别是小肠的调控机制 | 牦牛、犏牛和奶牛的生乳营养成分、氨基酸组成,以及牦牛小肠细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | 转录组数据,基因组数据 | 从小肠组织中共获得27,026个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7593 | 2026-04-13 |
Spatial metabolomics and transcriptomics reveal the metabolic-immune niche associated with renal fibrosis in hyperuricemia
2026-Apr-06, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究通过整合空间代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了高尿酸血症肾病中与肾纤维化相关的代谢-免疫微环境 | 首次构建了高分辨率多组学图谱,阐明了代谢重塑与细胞间通讯的空间协调关系,并提出了缺氧依赖性成纤维细胞-巨噬细胞串扰的新机制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体样本中得到验证,且机制假设需要进一步实验证实 | 探究高尿酸血症肾病中代谢微环境与免疫-间质细胞相互作用的时空关系 | 高尿酸血症小鼠模型的肾脏组织 | 空间多组学 | 高尿酸血症肾病 | 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化分析 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 高尿酸血症小鼠模型肾脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7594 | 2026-04-13 |
PCSK9 promotes prostate cancer via facilitating intratumoral cholesterol accumulation and enhancing immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Apr-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.020
PMID:41951051
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研究论文 | 本研究揭示了PCSK9通过促进前列腺癌肿瘤内胆固醇积累和塑造免疫抑制微环境来驱动前列腺癌进展的新机制 | 首次阐明了PCSK9在前列腺癌中的促癌作用机制,发现了新的免疫抑制因子(Sig15IM、ABI3、CORO1A、CD53等)在塑造免疫抑制微环境中的关键作用,并证实了抗PCSK9抗体(evolocumab)的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,临床样本验证相对有限;免疫抑制因子在人类前列腺癌中的确切功能需要进一步验证 | 探究PCSK9在前列腺癌进展中的功能及其潜在分子机制 | 前列腺癌干细胞、原发性及转移性前列腺癌组织、基因工程小鼠模型(Pten-/-、TRAMP)、异种移植瘤模型、LNCaP细胞系 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个独立前列腺癌人群(包括转移性和去势抵抗性前列腺癌)、8种其他癌症类型的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7595 | 2026-04-13 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies an EMT-Associated Prognostic Signature for Papillary Thyroid Cancer
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71766
PMID:41957879
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析,识别了与上皮-间质转化相关的八个预后基因,并构建了用于甲状腺乳头状癌预后评估的风险模型 | 首次将单细胞RNA测序与101种机器学习算法组合相结合,系统识别甲状腺乳头状癌中与上皮-间质转化相关的预后基因,并构建了综合性的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内实验和更大规模的前瞻性临床队列验证 | 探究甲状腺乳头状癌中上皮-间质转化的分子机制,并开发预后评估的生物标志物 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本和正常甲状腺组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型和多种机器学习算法组合 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及内部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7596 | 2026-04-13 |
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014008
PMID:41838767
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研究论文 | 本文系统性地比较了半监督与无监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景下的性能 | 首次在真实条件下系统性地基准测试半监督单细胞RNA-seq整合方法,并考虑了多种不完美标签场景 | 研究仅基于六个数据集,且半监督方法在标签质量不确定时优势有限 | 评估半监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景中的性能和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | scANVI, ssSTACAS | 单细胞RNA-seq数据 | 六个多样化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7597 | 2026-04-13 |
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag120
PMID:41808453
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研究论文 | 开发了一个名为BrainConnect的软件,用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据,以进行整合分析并预测连接强度 | 首次提出一个方法,将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下处理,利用LSTM网络从空间转录组学预测连接强度,并识别潜在的重要基因 | 方法目前仅应用于小鼠大脑数据,未在其他物种或更广泛的数据集上验证 | 整合大脑连接数据和空间转录组学数据,以预测和理解大脑连接性及其分子基础 | 小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LSTM | 空间转录组学数据和大脑连接数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7598 | 2026-04-13 |
Utilising Machine Learning and Single-Cell Analysis to Uncover SKCM Metastasis-Related Genes
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70061
PMID:41961982
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习,揭示了皮肤黑色素瘤转移相关的核心基因及其调控机制 | 创新性地构建了结合粒子群优化算法和支持向量机的二元分类模型(PSO-SVM),用于准确预测肿瘤转移,并整合单细胞与转录组数据进行多维度分析 | 未明确说明样本的具体数量及来源,模型在其他癌症中的泛化能力有待进一步验证 | 阐明皮肤黑色素瘤(SKCM)转移的核心分子机制,寻找早期诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤与原发性肿瘤细胞 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | PSO-SVM(粒子群优化-支持向量机) | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7599 | 2026-04-13 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
PMID:41125888
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术,系统解析了疟原虫在按蚊中肠内的发育过程,并发现了PfSIP2转录因子在子孢子感染人肝细胞中的关键作用 | 研究主要基于实验室模型,尽管验证了野外来源的寄生虫,但实际自然环境中的复杂性可能未被完全覆盖 | 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育机制和宿主-寄生虫相互作用,以寻找阻断传播的策略 | 恶性疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫和蚊子细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7600 | 2026-04-13 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程,专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据,以提高RNA生物标志物和细胞间通信研究的准确性和鲁棒性 | EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法,显著提高了单碱基分辨率下的多映射读段分配,并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析,这是现有工具所不具备的功能 | NA | 开发一个标准化的计算工作流程,以应对细胞外囊泡RNA测序数据分析中的挑战,包括低丰度、片段化及污染问题 | 细胞外囊泡RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 总RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |