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当前共找到 44757 篇文献,本页显示第 741 - 760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
741 2026-10-22
Analysis of the expression of genes encoding the endothelin signaling pathway in fetal, heathy, and diseased adult human heart using single-cell transcriptomics
2026-Jan-01, Canadian journal of physiology and pharmacology IF:1.7Q4
研究论文 该研究利用已发表的单细胞/单核RNA测序数据,绘制了内皮素信号通路主要基因在健康胎儿、健康成人及患病成人心脏中的细胞表达图谱 结合多个公共数据库,系统比较了内皮素信号通路基因在三种心脏状态下的细胞类型特异性表达,发现了缺血时壁细胞中EDNRA的上调,揭示了未被开发的药物干预靶点 基于已发表数据的二次分析,样本量受限于原始研究,且可能缺乏实验验证 分析内皮素信号通路基因在胎儿、健康及患病成人心脏中的细胞表达模式 人类心脏组织(健康胎儿、健康成人、患病成人) 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞/单核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
742 2026-10-22
Integrated analysis reveals survival-related genes promoting cholangiocarcinoma progression via G2/M cell cycle, with validation of cyclin B1 in tumor proliferation
2025-11-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 该研究整合bulk转录组和单细胞RNA-seq数据,识别出驱动胆管癌进展的生存相关基因,并验证CCNB1在肿瘤增殖中的核心作用 首次定义了促进胆管癌进展的G2/M期基因模块,并绘制了其单细胞动态图谱,突出CCNB1作为治疗靶点 未提及 识别驱动胆管癌进展的生存相关基因及其调控网络 胆管癌患者样本及HuCCT1/RBE细胞系 数字病理 胆管癌 bulk转录组测序, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 TCGA-CHOL和GEO队列及GSE138709单细胞数据,具体样本量未提及 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
743 2026-10-22
Advantages of cell proliferation and immune regulation in CD146+NESTIN+ HUMSCs: insights from single-cell RNA sequencing
2025-06-24, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序比较不同孕龄人脐带间充质干细胞及公共数据库骨髓间充质干细胞,揭示CD146+NESTIN+亚群在增殖和免疫调节方面的优势 首次提供早产人脐带间充质干细胞的单细胞图谱,并在RNA水平证实CD146+NESTIN+间充质干细胞在细胞增殖、抗菌活性、免疫调节和低分化方面的优势 研究仅基于RNA水平的单细胞转录组数据,缺乏蛋白水平验证和功能实验;公共数据库骨髓间充质干细胞样本量有限 探究人脐带间充质干细胞的异质性,特别是CD146+NESTIN+亚群的生物学功能优势 不同孕龄(22+5周、28周、39周)供体的人脐带间充质干细胞及公共数据库来源的骨髓间充质干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例不同孕龄人脐带间充质干细胞样本及2个公共数据库骨髓间充质干细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
744 2026-10-22
BRAF mutation cancer, colorectal cancer, tumor associated lymph node structure and immune microenvironment study: MAPK protein kinase molecular action and SIRPG-CD47 protein signaling pathway
2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究系统评估BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响,重点关注其对三级淋巴结构(TLS)成熟和功能的作用 揭示了BRAF突变通过MAPK蛋白激酶分子作用和SIRPG-CD47蛋白信号通路影响TLS成熟和免疫微环境重塑,特别是发现CD4+ CXCL13细胞在TLS成熟中的双重作用以及B细胞亚群的功能缺陷 未明确说明样本量大小,未提及是否有体外或体内功能验证实验,未详细说明BRAF突变的具体类型(如V600E) 系统评估BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响,特别是对肿瘤相关淋巴结结构和TLS成熟与功能的作用 结直肠癌患者的临床样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组分析,免疫组化,多重荧光染色 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
745 2026-10-22
Cell-cycle dependence of bursty gene expression: insights from fitting mechanistic models to single-cell RNA-seq data
2025-04-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 通过将基因表达的机制模型拟合到单细胞RNA-seq数据,估计小鼠基因在G1和G2/M期的爆发参数,揭示细胞周期对爆发频率和爆发大小的影响 首次在全转录组水平上系统估计每个等位基因在G1和G2/M细胞周期阶段的爆发参数,发现DNA复制后爆发频率约减半而爆发大小基本不变,并揭示了爆发参数调控的非独立性 研究仅针对小鼠基因,未在人类或其他物种中验证;爆发参数的估计依赖于机制模型假设和细胞周期推断的准确性 研究细胞周期依赖的基因爆发表达特征,估计G1和G2/M期的爆发参数并分析其调控关系 数千个小鼠基因 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 深度学习 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
746 2026-10-22
Benchmarking computational methods for detecting spatial domains and domain-specific spatially variable genes from spatial transcriptomics data
2025-04-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文对19种从空间转录组数据中检测空间域和域特异性空间可变基因的计算方法进行了全面基准测试 首次对19种空间域和域特异性SVG检测方法进行全面基准测试,提出了评估域特异性SVG识别结果的定量策略,并发现整合不同方法的聚类结果可以提高鲁棒性和准确性 没有单一方法在所有数据集上表现最佳,最佳方法取决于数据尤其是SRT平台;基于不同GNN方法识别的空间域进行SVG检测虽然准确率高但一致性低 全面评估现有空间域和域特异性空间可变基因检测方法的性能,为选择合适方法提供实践指南 空间转录组数据中的空间域和域特异性空间可变基因 空间转录组学 NA 空间转录组学 GNN 空间转录组数据 30个真实数据集(涵盖6种SRT技术)和27个合成数据集 NA 空间转录组学 NA 涵盖6种SRT技术
747 2026-10-22
Development of a hypoxia-responsive macrophage prognostic model using single-cell and bulk RNA sequencing in pancreatic cancer
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序数据和TCGA-PAAD数据库,构建并验证了一个基于缺氧相关巨噬细胞亚群的胰腺癌预后模型 结合单细胞RNA测序与bulk RNA测序数据,识别缺氧反应性巨噬细胞亚群及相关基因,构建包含13个关键基因的缺氧相关预后模型,并发现KRTCAP2作为关键生物标志物 摘要中未明确说明研究的局限性 构建缺氧相关预后模型,预测胰腺癌患者的化疗敏感性和总生存期,并探索治疗靶点 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 Cox回归,Lasso回归 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq NA NA
748 2026-10-22
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing identifies and validates T cell-related prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别并验证肝细胞癌中T细胞相关的预后模型 构建了基于T细胞相关基因(PTTG1、LMNB1、SLC38A1、BATF)的预后风险模型,并结合单细胞和批量RNA测序进行验证 外部验证仅使用ICGC数据库,免疫组化验证样本量较小(25例),需进一步多中心验证 构建并验证肝细胞癌T细胞相关预后模型,用于患者风险分层和个性化治疗 肝细胞癌患者及T细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化 LASSO回归 基因表达数据,图像数据(免疫组化) 10例HCC患者的scRNA-seq数据(识别6281个T细胞),批量RNA测序数据来自TCGA和ICGC,25例患者组织样本用于IHC NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组化 NA NA
749 2026-10-22
Leveraging transcriptome-wide association studies identifies the relationship between upper respiratory flora and cell type-specific gene expression in severe respiratory disease
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 该研究利用转录组范围关联研究(TWAS)识别上呼吸道菌群与重症流感样疾病(ILI)中细胞类型特异性基因表达之间的关系 将上呼吸道菌群丰度GWAS数据与基于单细胞RNA测序构建的细胞类型特异性eQTL模型结合,进行TWAS分析,揭示菌群通过调节免疫细胞功能影响ILI进展的机制 摘要中未明确说明研究的具体局限性 探究上呼吸道菌群与重症ILI中免疫细胞的关联,识别贡献于疾病严重程度的特定微生物分类群和免疫应答通路,并阐明菌群如何通过调节免疫细胞功能影响ILI进展 重症流感样疾病(ILI)患者的上呼吸道菌群及免疫细胞 机器学习 呼吸道感染 GWAS、scRNA-seq、TWAS、eQTL分析 NA 基因组数据、单细胞转录组数据 1195个重症ILI相关且上呼吸道菌群可遗传性(h2>0.1)的GWAS汇总数据集;来自onek1k项目的单细胞RNA测序数据(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq、bulk GWAS NA NA
750 2026-10-22
Tumor-associated macrophage-based predictive and prognostic model for hepatocellular carcinoma
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序与bulk测序数据,构建基于肿瘤相关巨噬细胞特征的肝细胞癌预后模型,并分析肿瘤微环境免疫浸润与药物敏感性 整合scRNA-seq与bulk测序数据,基于TAM特征基因构建预后模型,并结合AutoDock模拟探索潜在治疗靶点 需在更大规模的前瞻性研究中验证发现,TAMs在HCC进展中的功能意义尚待进一步研究 探究肿瘤相关巨噬细胞特征在肝细胞癌中的预后意义并构建预测和预后模型 肝细胞癌患者及肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, bulk测序, 生物信息学分析, Cox回归, 逻辑回归, AutoDock分子对接 Cox回归模型, 逻辑回归模型 基因表达数据 多个HCC队列(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
751 2026-10-22
Deciphering the role of Hat1 in spermatogenesis: Chromatin organization and beyond
2025, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究揭示了小鼠精子发生过程中组蛋白乙酰转移酶Hat1的时空表达模式及其在染色质组织中的阶段特异性调控作用 首次系统阐明Hat1在小鼠睾丸精子发生各阶段的动态表达定位,并结合单细胞测序数据鉴定其阶段特异性互作蛋白和染色质组织相关差异表达基因 缺乏功能验证实验,尚未通过敲除或过表达等功能实验直接证明Hat1在精子发生中的因果关系 探究Hat1在小鼠睾丸中的时空表达模式及其在精子发生染色质组织中的调控机制 小鼠睾丸组织及雄性生殖细胞 表观遗传学 NA RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光定位, 生物信息学分析, 单细胞测序数据分析 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像, 单细胞测序数据 3周龄和8周龄小鼠睾丸组织,基于单细胞测序数据集GSE214315 NA 单细胞RNA-seq NA 基于公共单细胞测序数据GSE214315进行生物信息学分析
752 2026-10-22
PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development
2024-06-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞分辨率解析出生后子宫基质发育的动态过程,并揭示PR-SET7通过H4K20me1表观遗传抑制干扰素反应和细胞死亡以调控子宫基质发育的机制 首次在单细胞水平上描绘新生小鼠子宫发育的动态过程,鉴定内外基质亚群;发现PR-SET7-H4K20me1通过直接抑制干扰素刺激基因转录和间接沉默内源性逆转录病毒来限制干扰素反应,从而防止基质细胞死亡,并阐明H4K20me1下降引发病毒模拟反应及ZBP1介导的凋亡和坏死性凋亡 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;未完全阐明内外基质亚群的其他调控机制及PR-SET7在出生后子宫发育其他阶段的潜在作用 探究出生后子宫基质发育的时空动态变化及PR-SET7/H4K20me1在其中的表观遗传调控机制 新生小鼠子宫组织及子宫基质细胞 发育生物学, 表观遗传学, 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序, RNA测序, 表观遗传分析(H4K20me1 ChIP-seq或CUT&Tag) NA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
753 2026-10-22
A single-cell and spatial RNA-seq database for Alzheimer's disease (ssREAD)
2024-06-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一个针对阿尔茨海默病的单细胞和空间RNA-seq数据库ssREAD,整合了1053个样本和381个空间转录组数据集,并提供分析工具 构建了首个专门针对阿尔茨海默病的综合性单细胞和空间转录组数据库,提供优化的分析流程和用户友好的界面 摘要中未明确提及 解决阿尔茨海默病单细胞和空间转录组数据激增但缺乏全面易用存储库的问题 阿尔茨海默病相关的人和小鼠脑组织单细胞RNA-seq、单核RNA-seq和空间转录组数据 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 1053个样本(277个整合数据集)来自67项AD相关scRNA-seq/snRNA-seq研究,共7,332,202个细胞;381个空间转录组数据集来自18项人类和小鼠脑研究 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
754 2026-10-22
The mucosal concept in chronic rhinosinusitis: Focus on the epithelial barrier
2024-05, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
综述 本文综述了慢性鼻窦炎中黏膜概念下上皮细胞的关键作用,重点关注上皮屏障功能障碍及相关机制 强调上皮炎症记忆和神经内分泌功能等新发现,并探讨针对上皮细胞的生物治疗前景 为综述性文章,未提供原始实验数据,相关生物治疗尚在临床试验中 探讨慢性鼻窦炎黏膜概念中上皮细胞的作用,包括上皮稳态失调、屏障损伤、修复异常及与免疫细胞相互作用 慢性鼻窦炎患者的上皮细胞和黏膜组织 医学综述 慢性鼻窦炎 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
755 2026-10-22
A Single-cell and Spatial RNA-seq Database for Alzheimer's Disease (ssREAD)
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个针对阿尔茨海默病的单细胞和空间RNA-seq数据库ssREAD,整合了来自67项研究的1053个样本和381个空间转录组数据集,并提供分析套件 提供了更广泛的AD相关数据集、优化的分析流程和改进的可用性,并整合了单细胞和空间转录组数据 摘要中未明确说明 构建一个全面、用户友好的阿尔茨海默病单细胞和空间RNA-seq数据库 阿尔茨海默病相关的人和小鼠脑组织单细胞和空间转录组数据 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 1053个样本(277个整合数据集)来自67项AD相关scRNA-seq和snRNA-seq研究,共7,332,202个细胞;381个空间转录组数据集来自18项人类和小鼠脑研究 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
756 2026-10-22
scRNA sequencing technology for PitNET studies
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在垂体神经内分泌肿瘤研究中的应用 系统总结了scRNA-seq技术在PitNET研究中的最新进展,强调了单细胞分辨率在揭示肿瘤异质性、行为和调控机制方面的潜力 作为综述文章,未提供原始实验数据,且主要基于已有研究的总结,可能未涵盖所有相关技术细节 探讨单细胞RNA测序技术在垂体神经内分泌肿瘤研究中的应用和潜力 人类垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs) 单细胞测序 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
757 2026-10-22
The significance of CD16+ monocytes in the occurrence and development of chronic thromboembolic pulmonary hypertension: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者中CD16+单核细胞的特征与功能 首次系统研究CTEPH患者单核细胞亚群的分布、基因表达谱和分化轨迹,发现CD16+单核细胞亚群可能迁移至血栓组织并分化为高表达IL-1β的巨噬细胞参与疾病进展 摘要中未明确提及研究局限性 揭示CTEPH患者单核细胞的特征与功能,为CTEPH的诊断和治疗提供新思路 健康对照者、CTEPH患者的外周血单个核细胞及肺动脉内膜剥脱术后组织,以及CTEPH大鼠模型 单细胞转录组学 慢性血栓栓塞性肺动脉高压 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
758 2026-10-22
TP63 transcriptionally regulates SLC7A5 to suppress ferroptosis in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组和bulk转录组分析头颈鳞癌免疫治疗前后的微环境异质性,揭示TP63+ SLC7A5+恶性细胞亚群通过上调SLC7A5抑制铁死亡从而促进肿瘤生长和免疫治疗抵抗的机制 首次在单细胞水平鉴定出TP63+ SLC7A5+头颈鳞癌细胞亚群,并揭示TP63转录上调SLC7A5抑制铁死亡、增强免疫治疗抵抗的新机制,同时构建了基于TP63和SLC7A5的临床预后评分模型 摘要未明确说明 探究头颈鳞癌免疫治疗前后肿瘤微环境异质性,阐明TP63+ SLC7A5+细胞亚群抑制铁死亡及介导免疫治疗抵抗的分子机制,并建立预后评分模型 头颈鳞癌患者及其肿瘤细胞 数字病理, 单细胞转录组学, 肿瘤免疫学 头颈鳞癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 蛋白质印迹, ELISA, 荧光探针 NA 单细胞转录组数据, bulk转录组数据, 实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
759 2026-10-22
The landscape of miRNA-mRNA regulatory network and cellular sources in inflammatory bowel diseases: insights from text mining and single cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该文通过文本挖掘和单细胞RNA测序分析构建了炎症性肠病(IBD)的miRNA-mRNA调控网络,并确定了关键miRNA的细胞来源及功能。 结合文本挖掘与大规模单细胞RNA测序数据,系统构建了IBD、CD和UC特异的miRNA-mRNA调控网络,并首次发现hsa-miR-145在肌成纤维细胞中的特异性表达及其与组织修复和糖脂代谢的关联。 摘要中未明确提及研究局限性。 构建全面的miRNA-mRNA调控网络,确定关键miRNA在IBD发病机制中的细胞来源和功能。 炎症性肠病(IBD),包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)。 机器学习, 单细胞分析 炎症性肠病 文本挖掘, 单细胞RNA测序 NA 文本, 单细胞RNA测序数据 两个大规模单细胞RNA测序数据集(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
760 2026-10-22
Single-cell and spatial transcriptome assays reveal heterogeneity in gliomas through stress responses and pathway alterations
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序和空间转录组技术,揭示氧化应激反应基因在胶质瘤少突胶质前体细胞中的作用,并比较高、低级别胶质瘤中激活的不同通路 首次从空间层面探究氧化应激反应驱动胶质瘤异质性的机制,发现HG胶质瘤中氧化应激诱导代谢从氧化磷酸化向糖酵解转变,并通过SCENIC分析揭示AP1转录因子被激活 摘要未明确说明样本量及具体实验验证,机制结论仍需进一步功能实验证实 探究氧化应激反应在胶质瘤异质性中的作用机制,尤其是从空间层面比较高、低级别胶质瘤的差异 高、低级别胶质瘤中的少突胶质前体细胞(OPCs) 数字病理 脑胶质瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组 SCENIC 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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