单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 741 - 760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
741 2026-09-04
scAnno: a deconvolution strategy-based automatic cell type annotation tool for single-cell RNA-sequencing data sets
2023-05-19, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
research paper 开发了scAnno,一种基于去卷积策略的自动化细胞类型注释工具,用于单细胞RNA测序数据集,并在多个数据集上验证其高准确性 首次利用去卷积策略进行自动化细胞类型注释,无需先验信息即可准确识别细胞类型特异性基因 未提供具体局限性信息 开发并验证一种准确、稳健的自动化细胞类型注释工具,以支持单细胞RNA测序数据分析 人类和小鼠单细胞RNA测序数据集,包括外周血单个核细胞等 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 逻辑回归 基因表达数据 30种人类细胞类型和50个人类组织,26种小鼠细胞类型和50个小鼠组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
742 2026-09-04
Precursors of human CD4+ cytotoxic T lymphocytes identified by single-cell transcriptome analysis
2018-01-19, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析鉴定人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞的前体细胞。 首次在人类中鉴定出CD4-CTL效应细胞和前体细胞的不同簇,前体细胞高表达白细胞介素-7受体,并与效应细胞共享TCR克隆型。 摘要中未提及局限性。 探究人类CD4-CTL的异质性、转录谱和克隆性,特别是与CD4记忆T细胞亚群的关系。 人类CD4+ T细胞,包括CD4-CTL、中央记忆T细胞(TCM)、效应记忆T细胞(TEM)和效应记忆T细胞(TEMRA)。 单细胞转录组学 病毒感染(登革热) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据和TCR序列数据 超过9000个单细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 单细胞RNA测序和TCR分析
743 2026-09-04
Innate-like functions of natural killer T cell subsets result from highly divergent gene programs
2016-06, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过转录组、表观基因组和单细胞RNA测序分析胸腺自然杀伤T细胞亚群,发现它们具有高度分化的基因表达和表观遗传特征。 首次在转录组和表观基因组水平揭示NKT细胞亚群具有高度分化的基因程序,而不仅仅是基于少数转录因子和表面分子的差异。 研究仅聚焦于胸腺来源的NKT细胞亚群,未涉及外周或肿瘤微环境中的NKT细胞。 阐明胸腺中NKT细胞亚群的功能差异及其分子基础。 胸腺NKT细胞亚群 免疫学 NA RNA-seq、单细胞RNA测序、表观基因组学 NA 转录组数据、表观基因组数据、单细胞转录组数据 未明确说明(小鼠胸腺细胞亚群) NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、表观基因组测序(如ATAC-seq) NA NA
744 2026-09-03
Integrated multi-omics analyses identify an RAS-SLC11A2-associated molecular framework linking iron metabolism with PCOS-related cardiometabolic risk
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 整合多组学分析识别出RAS-SLC11A2分子框架,将铁代谢与多囊卵巢综合征(PCOS)相关的心脏代谢风险联系起来 首次揭示RAS-SLC11A2轴在PCOS合并心脏代谢疾病中的共同分子机制,并提出龙胆苦苷作为潜在治疗药物 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内动物模型和临床试验验证 探讨肾素-血管紧张素系统与铁代谢轴在PCOS相关心脏代谢风险中的作用机制及治疗潜力 PCOS、高血压、非酒精性脂肪肝和2型糖尿病相关分子途径和细胞类型 多组学整合分析、机器学习 多囊卵巢综合征、心血管疾病、代谢性疾病 转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、机器学习、分子对接、细胞功能实验 机器学习模型(具体类型未提及) 转录组数据、单细胞RNA数据、遗传关联数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
745 2026-09-03
PPRC1 is a prognostic biomarker and key regulator of mitochondrial oxidative phosphorylation in multiple myeloma
2026-12, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究旨在探讨多发性骨髓瘤中PPRC1的临床和生物学意义,发现其作为预后生物标志物和线粒体氧化磷酸化的关键调节因子 首次揭示PPRC1在多发性骨髓瘤中作为独立预后因素,并通过功能实验证实其通过维持线粒体氧化磷酸化促进肿瘤生存,提出其作为潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库和本地队列,功能实验局限于体外细胞系,缺乏体内模型验证 评估PPRC1在多发性骨髓瘤中的预后价值及其对肿瘤代谢和生存的影响 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 数字病理学 多发性骨髓瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 Cox回归模型, 列线图 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 未明确样本数量,包含公共数据库和本地队列 NA 转录组测序, 单细胞转录组测序 NA NA
746 2026-09-03
Single-cell RNA sequencing provides further insights into the immunostimulatory action of freeze-dried Lactiplantibacillus plantarum on Penaeus vannamei shrimp
2026-Nov, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨冻干植物乳杆菌对凡纳滨对虾免疫刺激作用的细胞机制。 首次在虾类中应用单细胞RNA测序来揭示益生菌免疫刺激的细胞水平机制,发现转录组变化不仅由基因表达改变驱动,还受细胞群体动态影响。 研究仅针对对虾鳃组织,可能未覆盖其他免疫相关组织;单细胞分析中细胞类型分辨率有限。 通过单细胞RNA测序,深入了解冻干植物乳杆菌喂养如何调节凡纳滨对虾的宿主免疫反应,揭示在批量RNA测序中可能被掩盖的机制。 凡纳滨对虾(Penaeus vannamei)的鳃组织细胞。 单细胞转录组学 对虾疾病(如副溶血性弧菌病和白斑综合征) 单细胞RNA测序 单细胞转录组数据 未明确样本量,但涉及对虾鳃组织样本。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
747 2026-09-03
Dual role of fibroblasts in fibrous scar formation after spinal cord injury: Single-cell sequencing and experimental verification
2026-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
748 2026-09-03
Decoding the spatiotemporal patterns of food spoilage microbial communities: Integrating multi-omics and artificial intelligence to enable precision preservation
2026-Oct-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
749 2026-09-03
Decoding tumor immune microenvironment heterogeneity by single-cell and spatial multi-omics: From immunotherapy resistance to translational biomarkers
2026-Oct, Neoplasia (New York, N.Y.)
综述 本文综述了单细胞和空间多组学技术如何揭示肿瘤免疫微环境在免疫治疗耐药中的异质性,并探讨了新的转化生物标志物 提出免疫治疗生物标志物应从静态单一标记物转向纵向、空间分辨和可解释的多组学模型,以指导精准联合免疫治疗 未提及具体局限性 总结单细胞和空间多组学在免疫治疗耐药中重新定义肿瘤免疫微环境异质性的作用,并讨论用于患者分层的转化生物标志物 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞、基质细胞及其空间生态位 数字病理学 癌症 单细胞组学、空间转录组学、空间蛋白质组学、成像技术 NA 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
750 2026-09-03
Decoding chromosomal instability in neutrophil signature in the pathogenesis of periodontitis: evidence from artificial intelligence-driven multi-omics and in vitro validation
2026-Oct, Cytotechnology IF:2.0Q4
研究论文 利用人工智能驱动的多组学分析和体外验证,解码染色体不稳定性在中性粒细胞特征中对牙周炎发病机制的作用 首次在牙周炎中发现染色体不稳定性相关的共表达模式,并确定TFF3作为与促炎性中性粒细胞状态相关的候选中心基因 未提供明确的局限性信息 探索染色体不稳定性在牙周炎发病机制中的作用,并识别相关的诊断和治疗靶点 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 多组学分析、人工智能、机器学习 牙周炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序、WGCNA、NMF、机器学习、SHAP分析、体外实验 机器学习框架 基因表达数据(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq) 未明确说明样本数量 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
751 2026-09-03
Activation of sigma non-opioid intracellular receptor 1 (S1R) receptor inhibits plexin domain containing 2 (Plxdc2) driven microglial inflammation to ameliorate depressive-like behaviours in mice
2026-Oct, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 本文研究了S1R受体通过抑制Plxdc2驱动的神经炎症来缓解小鼠抑郁样行为的作用机制 首次将机器学习与单细胞转录组学结合,发现Plxdc2为抑郁中微胶质细胞功能异常的关键基因,并揭示S1R激活通过抑制Plxdc2介导的N-连接糖基化通路发挥抗抑郁作用 尚不明确Plxdc2在人类抑郁症中的具体作用,且实验仅在脂多糖模型和BV-2细胞系中进行,需要进一步临床验证 探索S1R受体如何调节抑郁症相关的神经炎症 小鼠抑郁模型、LPS刺激的BV-2细胞以及内侧前额叶皮层微胶质细胞 机器学习、单细胞转录组学、神经科学 抑郁症 单细胞RNA测序、机器学习、基因敲低和过表达技术 机器学习集成模型 单细胞转录组数据、行为学数据 不适用(实验涉及特定动物模型和细胞系) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
752 2026-09-03
Polyamine metabolic reprogramming in ependymal cells promotes endogenous repair after spinal cord injury
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和计算代谢分析,揭示了脊髓损伤后室管膜细胞内多胺代谢重编程促进内源性修复的机制 首次整合单细胞转录组与代谢分析,描绘了损伤反应性室管膜细胞的时间动态代谢重编程,并发现PLP依赖性ODC1介导的多胺代谢作为可操作的内源性脊髓再生靶点 未明确提及限制 阐明脊髓损伤后内源性室管膜细胞激活的代谢机制,并评估靶向多胺代谢促进再生的可行性 小鼠脊髓损伤模型中的室管膜细胞 神经科学、单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA-seq、计算代谢分析、分子对接、分子动力学模拟 轨迹推断模型 单细胞基因表达数据、分子结构数据 小鼠脊髓损伤模型,具体样本数未明确提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
753 2026-09-03
Peripheral pain threshold, glycaemic status, and LAMP3 genetic variation: A community-based analysis
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究基于社区人群,探讨了外周疼痛阈值、血糖状态与LAMP3基因变异之间的关联 首次在社区人群中结合电刺激疼痛阈值测量、GWAS和单细胞RNA测序,揭示LAMP3基因变异与疼痛感知差异及神经免疫相互作用的潜在关联 遗传证据为提示性且机制数据为间接性,结果应视为探索性和假设生成性 探究外周疼痛阈值的临床、代谢和遗传决定因素,特别是LAMP3基因变异的作用 来自Iwaki健康促进项目2017的906名参与者,以及人类皮肤样本 基因组学、单细胞转录组学、神经科学 糖尿病多发性神经病变、疼痛感知异常 基因组关联分析、单细胞RNA测序、皮肤活组织检查 NA 基因型数据、电刺激疼痛阈值数据、单细胞转录组数据、皮肤组织学数据 906名参与者;皮肤样本来自尸检 NA 单细胞RNA测序 NA NA
754 2026-09-03
Single-cell spatial transcriptomics reveals rewiring of RPE and Müller glia signaling toward photoreceptors following outer segment disruption in Prph2C213Y mice
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学揭示了Prph2C213Y小鼠中感光细胞外节破坏后,视网膜色素上皮和Müller胶质细胞信号向感光细胞的重构 首次通过单细胞空间转录组学在Prph2突变小鼠模型中解析了视网膜色素上皮和Müller胶质细胞在感光细胞外节破坏后的信号重连,并识别出候选的治疗靶点 未提供明确的局限性信息 探究PRPH2突变引起的感光细胞外节破坏如何重塑周围视网膜,特别是视网膜色素上皮和Müller胶质细胞的反应 Prph2C213Y杂合小鼠模型的视网膜细胞 数字病理学 遗传性视网膜营养不良 单细胞空间转录组学 NA 基因表达数据 分别在1、3、6个月龄时使用独立年龄和性别匹配的队列 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
755 2026-09-03
Machine learning of sunitinib resistance genes reveals that SP5 regulates angiogenesis and sunitinib resistance in RCC via the VEGFA/AKT axis
2026-Oct, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过机器学习分析肾细胞癌中舒尼替尼耐药相关基因,发现SP5通过VEGFA/AKT轴调控血管生成和耐药性,并鉴定苏拉明为潜在抑制剂。 首次将SP5与肾细胞癌舒尼替尼耐药及血管生成联系起来,利用117种机器学习算法构建预后模型,并通过虚拟筛选发现苏拉明靶向SP5-VEGFA相互作用。 文章未提及局限性。 阐明肾细胞癌中舒尼替尼耐药的分子机制,并寻找潜在的治疗策略。 肾细胞癌患者样本及细胞系,包括GSE172165、GSE173572、GSE216494和GSE156632数据集,以及体外和异种移植模型。 机器学习 肾细胞癌 RNA-seq, 单细胞转录组, CUT&RUN, 分子对接 机器学习算法(包括117种,未指定具体类型) 基因表达数据, 单细胞数据, 影像数据(未明确) 多个独立队列的数据集(具体数量未提供) NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组 NA NA
756 2026-09-03
Rbp-Jκ controls NK cell late maturation and migration via chromatin landscape remodeling
2026-Sep-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究通过条件性敲除小鼠NK细胞中的Rbp-Jκ,结合多组学分析,揭示Rbp-Jκ通过染色质重塑调控NK细胞晚期成熟与组织迁移的功能与机制 首次揭示Rbp-Jκ通过直接结合并激活Klf2启动子,介导染色质重塑,在NK细胞晚期成熟及组织归巢中的关键调控作用,并发现其在NK细胞中的抑制激活与细胞毒功能却促进组织动员的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚需在人类NK细胞中验证其保守性;且未详细阐明Rbp-Jκ如何协调染色质重塑导致基因表达变化的精细分子机制 阐明转录因子Rbp-Jκ在NK细胞成熟和迁移中的内在作用及其分子机制 小鼠自然杀伤细胞(NK细胞)及B16F10肺癌转移模型 免疫学, 分子生物学 肺癌(转移) 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq), 批量ATAC测序(bulk ATAC-seq), CUT&Tag, ChIP-qPCR 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达及染色质开放性数据(单细胞及批量) 小鼠NK细胞(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量ATAC测序 10x Chromium 用于单细胞RNA和ATAC测序,详细信息未在摘要中给出
757 2026-09-03
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Sep-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨母体低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响,发现其通过损害肾单位祖细胞承诺和改变分支形态发生来减少肾单位数量 利用单细胞RNA测序结合断层和共聚焦成像,全面解析低蛋白饮食对肾脏发育过程中细胞和分子过程的影响 未提供明确的局限性信息 阐明母体低蛋白饮食如何影响肾单位形成过程中的细胞和分子机制,从而减少肾单位 endowment 胎儿肾脏发育过程中的肾单位祖细胞、输尿管尖端细胞及肾源性微环境 发育生物学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序、光学投影断层扫描、共聚焦显微镜 NA 图像数据、单细胞转录组数据 胎鼠和成年鼠肾脏样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
758 2026-09-03
Single-Cell and Spatial Omics Uncover Disease-Specific Synovial Landscapes in Rheumatoid and Psoriatic Arthritis
2026-09-01, The Journal of rheumatology IF:3.6Q2
研究论文 该论文通过单细胞和空间组学技术,比较了类风湿关节炎与银屑病关节炎的滑膜免疫微环境,揭示了疾病特异性的细胞网络和免疫病理机制 首次在多组学层面整合单细胞和空间转录组学,揭示类风湿关节炎特有的SPP1+巨噬细胞-CHI3L1+成纤维细胞-iDC3细胞间直接接触网络,以及银屑病关节炎特有的CD8+ T细胞预激活状态 未提及具体局限性 揭示类风湿关节炎和银屑病关节炎滑膜组织中的疾病特异性免疫细胞互作网络和致病机制,为精确治疗提供潜在靶点 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜组织和外周血样本 机器学习, 数字病理 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多重免疫荧光 NA 单细胞转录本数据, 空间转录本数据, 多重免疫荧光图像 未提供具体数量,涉及类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜及外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
759 2026-09-03
Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) signaling in respiratory disease: Mechanisms, neuroimmune crosstalk, and therapeutic implications
2026-Sep, Pulmonary pharmacology & therapeutics IF:3.3Q2
综述 本文综述了脑源性神经营养因子(BDNF)在呼吸系统疾病中的信号传导机制、神经免疫串扰及其治疗意义 通过整合单细胞转录组学等新兴证据,揭示BDNF在肺部不同细胞类型中的异质性作用,并强调其作为神经免疫-上皮串扰中枢介导因子的新角色 未提供具体的实验数据或系统检索方法,可能缺乏对现有证据的定量综合分析 阐明BDNF-TrkB信号在多种呼吸系统疾病(如哮喘、COPD、肺纤维化、急性肺损伤)中的作用机制,为靶向治疗提供理论基础 BDNF及其受体TrkB在肺上皮细胞、气道平滑肌、免疫细胞、成纤维细胞和神经元中的表达与功能 分子生物学,神经免疫学 呼吸系统疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
760 2026-09-03
Tumor cell-released autophagosome (TRAP) programs inflammatory CAFs to drive the immune-excluded TIME through C3a
2026-Sep, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
research paper 本文结合单细胞RNA测序和功能验证,揭示了肿瘤细胞释放的自噬体通过HSP70-TLR4-MyD88-ERK/p38通路介导iCAFs的产生及其C3a分泌,从而促进免疫排斥性肿瘤微环境形成,并降低了免疫检查点抑制剂疗效 首次阐明TRAP通过HSP70-TLR4信号通路编程iCAFs,并揭示C3a-C3aR轴在促进免疫排斥性TIME中的关键作用,为增强免疫治疗疗效提供了新的靶点 未明确提及局限性,且研究主要基于乳腺癌模型,需在其他肿瘤类型中验证结论的普适性 探究肿瘤细胞释放的自噬体如何编程炎症性癌症相关成纤维细胞并促进免疫排斥性肿瘤微环境,以寻找增强免疫检查点抑制剂疗效的潜在靶点 肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(iCAFs)、肿瘤相关巨噬细胞、乳腺癌患者血浆样本 癌症研究、免疫学、单细胞测序 乳腺癌 单细胞RNA测序、功能验证(如基因敲除、药理学抑制) 不适用(未使用特定计算模型,而是基于实验验证) 单细胞RNA测序数据、临床样本数据(基因表达及血浆TRAP和C3a水平) 涉及临床队列的血浆样本和肿瘤组织样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics(推测,用于单细胞RNA测序) 单细胞RNA测序 10x Chromium(推测) 单细胞RNA测序平台,用于表征iCAFs和TAMs的转录状态
回到顶部