单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 42053 篇文献,本页显示第 7561 - 7580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7561 2026-04-14
Engineering scalable vascularized kidney organoids for in vivo glomerular filtration with human endothelial integration
2026, npj biomedical innovations
研究论文 本研究开发了一种可规模化生产血管化肾脏类器官的方法,并验证了其在体内的肾小球滤过功能 开发了一种成本效益高、产量提升超过50倍的大规模生产血管化肾脏类器官的方法,并首次展示了由人内皮细胞血管化的类器官肾小球具有尺寸选择性的滤过功能 NA 开发可规模化生产的血管化肾脏类器官,用于肾脏疾病研究和再生医学应用 由人多能干细胞衍生的肾脏类器官 组织工程与再生医学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7562 2026-04-14
Integrative Multiomics and Single-Cell Analyses Identify FKBP10 as a Predictor of Radiotherapy Outcome in Colorectal Cancer
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学与单细胞分析,鉴定出FKBP10是结直肠癌放疗疗效的预测因子 首次通过整合多组学与单细胞RNA测序分析,将FKBP10鉴定为源自癌症相关成纤维细胞(CAFs)的放疗抵抗生物标志物和治疗靶点 研究样本量相对有限(发现队列200例,验证队列58例),且功能验证主要在细胞系中进行,需进一步体内实验验证 寻找能够预测结直肠癌放疗疗效的生物标志物和治疗靶点 结直肠癌患者样本(多组学数据)和放疗抵抗的结直肠癌细胞系 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,多组学分析,功能缺失实验(增殖、迁移/侵袭、放射敏感性测定) NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 258例结直肠癌患者(发现队列200例,验证队列58例),63,689个单细胞 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
7563 2026-04-14
Integrated Single-Cell Profiling Reveals TL1A as a Biomarker and Driver of Type 2 Inflammation via Macrophage-Dependent Immunoregulation in Asthma
2026, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究通过整合单细胞分析,揭示了TL1A作为哮喘中2型炎症的生物标志物和驱动因子,通过巨噬细胞依赖的免疫调节发挥作用 首次将TL1A鉴定为哮喘中巨噬细胞依赖的免疫调节关键分子,并阐明其通过DR3/CCL8/CCR8信号轴驱动2型炎症的机制,同时验证了抗TL1A抗体干预的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证的临床队列规模未明确说明,且未探讨TL1A在不同哮喘亚型中的特异性表达模式 探究TL1A在哮喘发病机制中的作用,并评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 哮喘患者(痰液和血清样本)、小鼠哮喘模型(包括髓系细胞特异性TL1A敲除小鼠) 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、临床指标数据 未明确说明患者样本数量,包含多种哮喘表型患者及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7564 2026-04-14
Cardiac fibroblast heterogeneity in cardiac fibrosis implication for cell-type-specific treatment
2026, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 本文综述了心脏成纤维细胞在心脏纤维化中的异质性及其对细胞类型特异性治疗的启示 利用谱系追踪和单细胞/空间转录组学揭示了心脏成纤维细胞的异质性及其在疾病中的特定激活轨迹,强调了免疫-成纤维细胞相互作用作为成纤维细胞命运的关键决定因素 NA 探讨心脏成纤维细胞异质性在心脏纤维化中的作用,以推动针对致病亚型的精准抗纤维化策略 心脏成纤维细胞及其在健康和疾病状态下的亚群 数字病理学 心血管疾病 谱系追踪,单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
7565 2026-04-14
Integrative Learning of Disentangled Representations from Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2026, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 提出了一种名为spVIPES的概率框架,用于从未配对、特征不匹配的单细胞RNA测序数据集中分解出共享和私有成分 开发了spVIPES框架,能够处理特征不匹配的未配对单细胞数据集,通过概率潜在变量模型分离数据集特异性与保守的细胞特征,并提供了有监督和无监督两种变体 未在摘要中明确说明 开发一种能够整合未配对、特征不匹配单细胞RNA测序数据集的方法,以分离共享和私有的细胞特征 单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 变分推断,专家乘积模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7566 2026-04-14
Macrophage-associated prognostic modeling uncovers immunotherapy response mechanisms and defines HAGHL as a novel oncogenic driver in breast cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型,用于预测乳腺癌患者的生存和免疫治疗反应,并鉴定HAGHL为新的致癌驱动因子 首次整合多组学数据开发基于巨噬细胞相关基因的预后模型,并发现HAGHL作为乳腺癌的潜在致癌基因 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证部分有限,模型需进一步外部验证 探究巨噬细胞相关基因在乳腺癌中的表达模式、预后价值及与免疫微环境的关系 乳腺癌患者样本及细胞系 生物信息学 乳腺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 预后模型 RNA测序数据 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
7567 2026-04-14
Tumor lactate metabolism shapes immune suppression and therapeutic resistance revealed by integrative multi-omics and digital pathology
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和数字病理学,开发了一种深度学习框架,能够直接从常规H&E全切片图像推断肿瘤乳酸代谢状态 首次开发了基于常规H&E病理切片的深度学习模型来推断肿瘤乳酸代谢状态,为临床提供了一种可扩展且成本低的代谢生物标志物评估方法 研究中使用的乳酸相关基因特征(59个基因)可能无法完全捕获乳酸代谢的复杂性,且模型性能在不同癌症类型间存在差异 开发一种临床可及且低成本的方法来评估肿瘤内乳酸活性,并研究其与肿瘤免疫微环境和治疗抵抗的关系 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者肿瘤样本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,空间分析,计算分析 深度学习框架 图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 TCGA、GEO和单细胞RNA-seq数据集中的多个队列,以及独立的SAZHU-HNSCC真实世界队列 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
7568 2026-04-14
Molecular insights into CRIP1 as an immunometabolic regulator revealed by CRIP1 knockout and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过CRIP1基因敲除小鼠模型和单细胞转录组学分析,首次系统揭示了CRIP1在免疫调节和代谢中的基本功能 首次全面解析CRIP1在非恶性条件下的基本生物学功能,整合了代谢调控和免疫调节的双重视角,并利用单细胞转录组学在人类样本中验证其与炎症基因表达的关系 研究主要基于小鼠模型和体外分析,人类样本验证仅限于单细胞转录组数据分析,缺乏直接的体内功能验证 阐明CRIP1在免疫代谢调控中的基本生物学功能和作用机制 CRIP1基因敲除小鼠、野生型小鼠、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 牙周炎、肝癌、急性髓系白血病、多发性骨髓瘤、黑色素瘤 单细胞RNA测序、转录组分析 基因敲除小鼠模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 CRIP1敲除和野生型小鼠的肝组织、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞单细胞数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7569 2026-04-14
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究探讨了小肠中组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间和时间印记机制 利用空间转录组学、小鼠模型和新型光学编码基因扰动策略,揭示了肠道结构区域化信号支持两种不同T细胞状态,并开发了计算方法来可视化细胞类型和基因表达的空间时间分布 NA 研究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和机制 人类样本和小鼠模型中的病原体特异性CD8 T细胞 空间转录组学 NA 空间转录组学, 单转录本分辨率分析 NA 转录组数据, 空间位置数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
7570 2026-04-14
Cell motility influences microfluidics capturing in scRNA-seq
2025, Open research Europe
研究论文 本研究探讨了微流体捕获方法在单细胞RNA测序中对运动性细胞(如鞭毛寄生虫)的适用性,并提出了一种快速冷却策略以提高封装效率 首次系统研究了微流体系统对运动性细胞的捕获偏差,并开发了一种通过快速冷却至0°C来降低细胞运动性、避免转录组变化的优化方法 研究仅针对鞭毛寄生虫在10x Genomics平台上的应用,未涵盖其他运动性细胞类型或微流体系统,且样本规模可能有限 优化微流体单细胞RNA测序协议,以更准确地捕获和分析运动性细胞,避免因细胞运动性导致的亚群丢失偏差 鞭毛寄生虫(具体物种未在摘要中明确说明) 单细胞测序技术 寄生虫感染(未指定具体疾病) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium(推断,基于平台描述) 10x Genomics微流体单细胞RNA测序平台(具体配置未详细说明)
7571 2026-04-14
The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone
2024-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了骨膜通过形成基质屏障来抵御头颈部鳞状细胞癌骨侵袭的机制 首次证明骨膜反应是抵御癌症骨侵袭的天然防御机制,并发现HIF1α-TIMP1信号轴在此过程中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证相对有限 探究骨膜在癌症骨侵袭过程中的生理功能和分子机制 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的骨侵袭过程 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,组织学分析,基因编辑小鼠模型 基因可调控小鼠模型 单细胞转录组数据,组织图像数据 人类HNSCC病变样本和小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7572 2026-04-14
Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues
2024-Aug, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)的多样性,揭示了不同组织中ILC1亚型的高度可变性 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术系统性地描绘了人类组织中ILC1s的多样性,并识别出肠道上皮中富含成熟的EOMES ILC1s以及其他组织中表达ZNF683的NK细胞,这些发现为理解ILC1-NK谱系在疾病中的表型和功能变化奠定了基础 NA 研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)的多样性和分布 人类组织中的第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)和自然杀伤(NK)细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7573 2026-04-14
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-07-10, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用 首次在单细胞水平上揭示了SCF+G-CSF治疗如何调节小胶质细胞和外周髓系细胞以减轻阿尔茨海默病病理 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小(仅使用APP/PS1小鼠) 探究SCF+G-CSF治疗在老年阿尔茨海默病大脑中的修复机制 28月龄APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 28月龄APP/PS1小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7574 2026-04-14
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-06-27, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的先进计算工具,通过深度学习和数据整合来推断细胞特异性基因调控网络 DeepIMAGER采用监督学习方法,将基因对的共表达模式转化为类图像表示,并整合转录因子结合信息进行模型训练,显著提高了基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 NA 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞特异性基因调控网络的工具 基因调控网络,涉及多种细胞类型,包括多发性骨髓瘤树突状细胞 机器学习 多发性骨髓瘤 scRNA-seq, ChIP-seq 深度学习 图像表示(由基因对共表达模式转化而来) 六种细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7575 2026-04-14
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-06-14, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制,并识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3作为潜在的免疫生物标志物和药物靶点 首次整合bulk组学和单细胞测序验证来系统揭示T2DM与CRC共病的分子机制,识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3,并发现ENTPD3阳性的癌症相关成纤维细胞亚群具有独特的肿瘤抑制特征和免疫治疗预测价值 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制和免疫学基础 2型糖尿病和结直肠癌患者 生物信息学 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Connectivity Map, 分子对接 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
7576 2026-04-14
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞(SSCs)的发育模式 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱,并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 研究样本仅来自沙子岭猪,可能限制了结果的普适性;且未进行功能验证实验 探究沙子岭猪睾丸发育,特别是精原干细胞的发育模式 沙子岭猪睾丸组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据,图像数据 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞,覆盖三个关键出生后发育阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7577 2026-04-14
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-04-03, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 提出一种基于图深度学习的GTADC方法,用于推断癌症组织中细胞的空间分布 利用Silhouette分数精确捕获每种细胞类型内具有显著表达差异的基因,并引入图结构有效整合空间转录组学和单细胞测序数据的空间关系与拓扑结构 未明确说明方法在特定癌症类型或数据规模下的验证局限性 实现癌症组织中不同细胞类型空间组成的精确解析,以支持早期癌症检测与理解 癌症组织中的细胞空间分布与相互作用 数字病理学 癌症 空间转录组学(ST),单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基于图的深度学习方法(GTADC) 空间转录组数据,单细胞基因表达数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
7578 2026-04-14
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-04, The Journal of surgical research IF:1.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素及其受体PLXNB2表达上调,并参与肿瘤-基质细胞通讯 首次在人类结直肠癌组织中,利用单细胞RNA测序数据定量推断细胞间通讯网络,发现CRC相关肌成纤维细胞特异性上调血管生成素和PLXNB2受体表达 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源为公开数据库和独立数据集,但具体样本数量未明确说明 探究血管生成素在人类结直肠癌肿瘤微环境中细胞间通讯的作用 人类正常结肠组织和结直肠癌组织中的细胞,特别是肌成纤维细胞和CRC细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 CellChat 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7579 2026-04-14
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-02-22, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了SPINK1过表达与肝细胞癌治疗耐药性之间的关联 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统阐明了SPINK1在肝细胞癌治疗耐药中的作用机制,并发现其通过上调药物代谢调节因子(如CYP3A4和ABCB1)来促进耐药性 研究主要基于相关性分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证SPINK1作为治疗靶点的直接疗效 探究SPINK1对肝细胞癌治疗耐药性的影响及其分子机制 肝细胞癌(HCC)细胞及患者样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 两个肝细胞癌队列的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
7580 2026-04-14
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-02-14, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术,探讨了原发性肝癌(HCC和ICC)对外周血淋巴细胞(PBLs)的影响,发现NK细胞和CD8+ T细胞数量升高且与复发风险相关,并揭示了硒代谢异常 首次系统评估原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响,结合单细胞测序发现CD8+ T细胞中TGFβ信号下调及硒代谢通路异常,并通过蛋白质组学验证SELENBP1和SEPP1的表达变化 样本来源可能有限,未详细说明具体样本量或患者队列特征,且依赖公共数据库(GEO)数据,可能影响结果普适性 探究原发性肝癌(HCC和ICC)对外周血淋巴细胞组成和功能的影响,并分析其与临床预后的关联 原发性肝癌患者(包括肝细胞癌和肝内胆管癌)及良性肝病患者的外周血淋巴细胞 数字病理学 肝癌 流式细胞术,单细胞RNA测序,生物信息学分析,蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,蛋白质组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞测序技术
回到顶部