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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7521 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals complex cellular heterogeneity and dysregulated signaling pathways in nasopharyngeal carcinoma
2025-May-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02506-2
PMID:40389670
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研究论文 | 通过单细胞转录组学系统分析鼻咽癌肿瘤微环境中不同细胞类型的转录特征及其在肿瘤发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率层面全面揭示鼻咽癌肿瘤微环境的细胞异质性和信号通路失调 | NA | 系统分析鼻咽癌不同细胞类型的转录特征及其在肿瘤发展中的作用 | 鼻咽癌组织和正常组织样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7522 | 2025-10-06 |
Novel marker genes and small molecule drugs for radiotherapy resistance in cervical cancer identified based on single-cell multi-omics analysis
2025-May-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02532-0
PMID:40389794
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研究论文 | 通过单细胞多组学和机器学习方法识别宫颈癌放疗抵抗的分子标志物和潜在治疗药物 | 整合单细胞多组学数据构建稳健的预后模型,识别与放疗抵抗相关的关键细胞类型和分子标记 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证和前瞻性研究确认 | 探索宫颈癌放疗抵抗的分子机制并开发预后预测模型 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 转录组测序, 甲基化测序 | Cox回归 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞数据 | 43,475个细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
7523 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and bulk RNA profiles to uncover glutamine metabolism's role in prognosis and immune dynamics in multiple myeloma
2025-May-19, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14239-0
PMID:40389878
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤预后和免疫动态中的作用 | 首次系统性地整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗意义 | 基于公共多组学队列数据,需要进一步实验验证 | 识别谷氨酰胺代谢相关基因驱动的肿瘤特征,并建立其作为预后生物标志物和治疗靶点的临床效用 | 多发性骨髓瘤患者样本 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序, bulk RNA测序, 转录组分析, shRNA敲低 | 加权共表达网络分析, Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 多个独立多发性骨髓瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
7524 | 2025-10-06 |
The gene regulatory mechanisms shaping the heterogeneity of venom production in the Cape coral snake
2025-May-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03602-w
PMID:40390047
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研究论文 | 本研究通过基因组测序和单细胞RNA-seq分析揭示了开普珊瑚蛇毒腺中毒素产生的异质性调控机制 | 结合高质量基因组草案和毒腺单细胞RNA-seq数据,首次揭示了毒素表达的精细调控模块和细胞群体内的进一步特化 | 研究仅针对单一物种,结论在其他蛇类中的普适性需要进一步验证 | 探索蛇毒产生的异质性及其调控机制 | 开普珊瑚蛇(Aspidelaps lubricus)及其毒腺组织 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序, 原位杂交 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
7525 | 2025-10-06 |
A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma
2025-May, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01432-0
PMID:39690246
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序分析发现GMPS通过调控PD-L1的糖基化修饰促进肝细胞癌免疫逃逸 | 首次揭示GMPS作为连接Sec61通道复合物和STT3A的附加模块,增强PD-L1与STT3A结合,调控其糖基化修饰的新机制 | 研究主要基于肝细胞癌组织,未涉及其他癌症类型验证 | 探索肝细胞癌中肿瘤快速生长和转移的调控机制 | 晚期肝细胞癌组织 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7526 | 2025-10-06 |
Optimized inner ear organoids for efficient hair cell generation and ototoxicity response modeling
2025-May, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2803-1
PMID:39862345
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研究论文 | 开发了一种优化的小分子诱导内耳类器官系统,用于高效生成毛细胞并模拟耳毒性反应 | 首创一步法自组织内耳类器官系统,无需多步扩增和强制分化程序 | 未提及具体样本量或实验规模限制 | 建立高效的内耳毛细胞生成模型并研究耳毒性保护机制 | 哺乳动物内耳毛细胞和支持细胞 | 器官芯片技术 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7527 | 2025-10-06 |
Quasi-spatial single-cell transcriptome based on physical tissue properties defines early aging associated niche in liver
2025-May, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00857-7
PMID:40325195
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研究论文 | 开发基于组织物理特性的单细胞转录组方法研究肝脏早期衰老相关微环境 | 提出基于组织酶消化抗性的纤维化微环境富集测序方法,实现准空间单细胞分析 | 方法依赖于组织物理特性,可能不适用于所有组织类型;研究仅使用雄性小鼠 | 研究衰老组织中衰老细胞的特征及其对组织微环境的影响 | 年轻和年老雄性小鼠的肝脏组织 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 年轻和年老雄性小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | 纤维化微环境富集测序 |
7528 | 2025-10-06 |
Inactivation of GSK3β by Ser389 phosphorylation prevents thymocyte necroptosis and impacts Tcr repertoire diversity
2025-May, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01441-z
PMID:39779909
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了GSK3β通过Ser389位点磷酸化失活调控胸腺细胞在V(D)J重组期间存活的新机制 | 发现GSK3β通过Ser389磷酸化失活可防止胸腺细胞坏死性凋亡,并鉴定出除G1检查点外的G2/M细胞周期检查点 | 研究仅针对小鼠DN3和DN4胸腺细胞,尚未在人类细胞或其他发育阶段验证 | 探究胸腺细胞在Tcrb和Tcra基因V(D)J重组期间的细胞周期检查点和存活机制 | 小鼠DN3和DN4胸腺细胞 | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单个分选的小鼠DN3和DN4胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7529 | 2025-10-06 |
Comprehensive Multi-Omics Analysis of Copper Metabolism Related Molecular Subtypes and Prognostic Risk Stratification in Colon Adenocarcinoma
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70591
PMID:40391581
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定结肠腺癌中铜代谢相关分子亚型并建立预后风险分层模型 | 首次系统构建结肠腺癌铜代谢相关基因风险模型,结合单细胞测序揭示其在肿瘤微环境中的分布特征,并通过实验验证COX19基因功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅针对单个基因COX19 | 探索铜代谢在结肠腺癌进展中的作用并开发预后预测模型 | 结肠腺癌患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞测序, western blot, PCR, siRNA, 集落形成实验, Transwell实验 | 风险预测模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
7530 | 2025-10-06 |
Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401475R
PMID:40270323
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研究论文 | 本研究探讨脂氧素A4通过FPR2受体激活NRF2通路抑制肺泡上皮细胞铁死亡,从而减轻肺缺血再灌注损伤的机制 | 首次揭示脂氧素A4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性途径调控肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的直接验证尚需进一步研究 | 探究铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用及脂氧素A4的保护机制 | 肺移植患者样本、C57BL/6野生型小鼠、Fpr2和Nrf2基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞 | 生物医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、小鼠肺门结扎模型、小鼠原位肺移植模型、体外细胞实验 | 基因敲除动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、生理指标数据、生化指标数据 | 未明确样本数量,包含患者组织样本、多种基因型小鼠和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7531 | 2025-10-06 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
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综述 | 本文挑战了迷走神经仅传递饱腹信号的传统观点,系统阐述了迷走神经作为整合餐食信息的复杂感觉系统 | 揭示了迷走神经传入神经元具有专门亚群和多样感觉模式,能够主动编码餐食相关信息的多个方面 | 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要基于现有文献整合分析 | 探讨迷走神经感觉通路在肠脑通讯中的多重功能 | 迷走神经传入神经元及其下游脑回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、神经回路映射、功能成像 | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | NA |
7532 | 2025-10-06 |
Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041
PMID:40253074
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综述 | 本文综述单细胞组学技术在生殖健康研究中的应用进展 | 系统整合单细胞测序、空间转录组学和高维蛋白质组成像等多种技术,为生殖医学提供多维视角 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探讨单细胞技术在生殖健康领域的临床应用前景 | 生殖道组织、胎儿发育、妊娠过程和妇科疾病 | 单细胞组学 | 妇科疾病、妊娠并发症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
7533 | 2025-10-06 |
Contribution of germline and somatic mutations to risk of neuromyelitis optica spectrum disorder
2025-Mar-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100776
PMID:39986280
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研究论文 | 本研究通过基因组关联分析和单细胞RNA测序,揭示了种系和体细胞突变在视神经脊髓炎谱系障碍发病机制中的作用 | 首次整合种系变异和体细胞嵌合染色体变异分析,发现CCR6风险变异和21q缺失在NMOSD中的致病机制 | 样本量相对有限(240例患者),主要基于日本人群,可能限制结果的普适性 | 探索视神经脊髓炎谱系障碍的遗传背景和发病机制 | 日本人群中的NMOSD患者和健康对照 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基因组分析:240例患者和50,578例对照;单细胞RNA测序:25例患者和101例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7534 | 2025-10-06 |
EfficientNet-resDDSC: A Hybrid Deep Learning Model Integrating Residual Blocks and Dilated Convolutions for Inferring Gene Causality in Single-Cell Data
2025-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00667-2
PMID:39578307
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研究论文 | 提出一种结合残差块和空洞卷积的混合深度学习模型EfficientNet-resDDSC,用于从单细胞数据推断基因因果关系 | 在EfficientNet-B0基础上引入残差块增强低层特征提取能力,结合深度可分离卷积和空洞卷积扩大感受野而不增加计算量 | NA | 构建基因调控网络以揭示基因间的因果关系 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控关系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | EfficientNet, 残差网络, 空洞卷积, 深度可分离卷积 | 单细胞基因表达数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7535 | 2025-10-06 |
Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011154
PMID:40010773
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研究论文 | 本研究探讨5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌患者免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 首次在临床回顾性研究中证实5α-还原酶抑制剂可通过调节CD8+ T细胞功能增强免疫治疗效果 | 回顾性研究设计存在选择偏倚,样本量相对有限(185例患者) | 评估5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌免疫治疗疗效的影响 | 185例接受免疫检查点抑制剂治疗的转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,Cox比例风险模型 | Cox回归模型 | 临床回顾性数据,单细胞RNA测序数据 | 185例转移性肾细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7536 | 2025-10-06 |
Brain-wide cell-type-specific transcriptomic signatures of healthy ageing in mice
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08350-8
PMID:39743592
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统描绘小鼠大脑在健康衰老过程中细胞类型特异性转录组变化 | 提供了首个涵盖全脑区域、包含约120万个高质量单细胞转录组的衰老数据集,识别了847个细胞簇和14个年龄偏向性胶质细胞簇 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本;主要关注转录组水平变化,缺乏功能验证 | 系统解析健康衰老过程中大脑细胞类型特异性转录组变化 | 年轻和年老雌雄小鼠的大脑细胞,涵盖前脑、中脑和后脑区域 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约120万个高质量单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7537 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses of intestinal epithelium reveal the dysregulation of gut immune microenvironment in systemic lupus erythematosus
2025-Jan-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06147-5
PMID:39871323
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示系统性红斑狼疮中肠道上皮免疫微环境的失调机制 | 首次在狼疮背景下构建肠道上皮的高分辨率单细胞图谱,发现CD8αα+ IELs减少、CD8αβ+ IELs增加以及γδT细胞减少与氧化应激和铁死亡的关联 | 研究主要基于MRL/Lpr小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究系统性红斑狼疮中肠道免疫微环境的失调机制 | MRL/Lpr狼疮小鼠和MRL/Mpj对照小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,qPCR,流式细胞术,体内实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮小鼠和对照小鼠的肠道上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7538 | 2025-05-23 |
Author Correction: Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2025-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55730-9
PMID:39774948
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7539 | 2025-10-06 |
Self and parasite-derived peptides selected upon DERAA-bearing HLA-DRB1 alleles activate CD4+ T cells from Chagas cardiomyopathy patients and are associated with ventricular dysfunction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527115
PMID:40391216
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研究论文 | 本研究揭示了携带DERAA基序的HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病患者中通过呈递宿主和寄生虫来源的肽段激活CD4+ T细胞,并与心室功能障碍相关 | 首次发现特定HLA-DRB1等位基因通过交叉反应性肽段激活致病性CD4+ T细胞,并建立其与心肌纤维化和心室功能障碍的直接关联 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚未完全阐明T细胞活化的具体信号通路 | 探究HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病发病机制中的作用 | 查加斯病患者(包括无症状期和心肌病期患者)的CD4+ T细胞和心脏组织 | 免疫学 | 查加斯心肌病 | 计算分析、体外功能实验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、功能实验数据、临床数据 | 查加斯病患者(包括IND和CCC两组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7540 | 2025-10-06 |
Comprehensive Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Cervical Cancer: Insights Into Tumor Microenvironment and Gene Expression Dynamics
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5027347
PMID:40395456
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌的肿瘤微环境和基因表达动态 | 首次在宫颈癌中应用大规模单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性和基因表达动态 | NA | 探索宫颈癌的肿瘤微环境特征和基因表达动态 | 宫颈癌样本 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、伪时间分析、基因共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |